L’objectif de ces travaux de thèse est la reconnaissance automatique des espèces d’arbres à partir de scans laser terrestres, information indispensable en inventaire forestier. Pour y répondre, nous proposons différentes méthodes de reconnaissance d’espèce basées sur la texture géométrique 3D des écorces.Ces différentes méthodes utilisent la séquence de traitement suivante : une étape de prétraitement, une étape de segmentation, une étape d’extraction des caractéristiques et une dernière étape de classification. Elles sont fondées sur les données 3D ou bien sur des images de profondeur extraites à partir des nuages de points 3D des troncs d’arbres en utilisant une surface de référence.Nous avons étudié et testé différentes approches de segmentation sur des images de profondeur représentant la texture géométrique de l'écorce. Ces approches posent des problèmes de sur-Segmentation et d'introduction de bruit. Pour cette raison, nous proposons une nouvelle approche de segmentation des nuages de points 3D : « Burst Wind Segmentation », inspirée des lignes de partage des eaux. Cette dernière réussit, dans la majorité des cas, à extraire des cicatrices caractéristiques qui sont ensuite comparées à un dictionnaire des cicatrices (« ScarBook ») pour discriminer les espèces d’arbres.Une grande variété de caractéristiques est extraite à partir des régions segmentées par les différentes méthodes proposées. Ces caractéristiques représentent le niveau de rugosité, la forme globale des régions segmentées, la saillance et la courbure du contour, la distribution des points de contour, la distribution de la forme selon différents angles,...Enfin, pour la classification des caractéristiques visuelles, les forêts aléatoires (Random Forest) de Leo Breiman et Adèle Cutler sont utilisées dans une approche à deux étapes : sélection des variables importantes, puis classification croisée avec les variables retenues, seulement.L’écorce de l’arbre change avec l'accroissement en diamètre ; nous avons donc étudié différents critères de variabilité naturelle et nous avons testé nos approches sur une base qui présente cette variabilité. Le taux de bonne classification dépasse 96% dans toutes les approches de segmentation proposées mais les meilleurs résultats sont atteints avec la nouvelle approche de segmentation « Burst Wind Segmentation » étant donné que cette approche réussit mieux à extraire les cicatrices, utilise un dictionnaire de cicatrices et a été évaluée sur une plus grande variété de caractéristiques de forme, de courbure, de saillance et de rugosité. / The objective of the thesis is the automatic recognition of tree species from Terrestrial LiDAR data. This information is essential for forest inventory. As an answer, we propose different recognition methods based on the 3D geometric texture of the bark.These methods use the following processing steps: a preprocessing step, a segmentation step, a feature extraction step and a final classification step. They are based on the 3D data or on depth images built from 3D point clouds of tree trunks using a reference surface.We have investigated and tested several segmentation approaches on depth images representing the geometric texture of the bark. These approaches have the disadvantages of over segmentation and are quite sensitive to noises. For this reason, we propose a new 3D point cloud segmentation approach inspired by the watershed technique that we have called «Burst Wind Segmentation». Our approach succeed in extracting in most cases the characteristic scars that are next compared to those stored in a dictionary («ScarBook») in order to determine the tree species.A large variety of characteristics is extracted from the regions segmented by the different methods proposed. These characteristics are the roughness, the global shape of the segmented regions, the saliency and the curvature of the contour, the distribution of the contour points, the distribution of the shape according to the different orientations.Finally, for the classification of the visual characteristics, the Random Forest method by Leo Breiman and Adèle Cutler is used in a two steps approach: selection of the most important variables and cross classification with the selected variables.The bark of the tree changes with the trunk diameter. We have thus studied different natural variability criteria and we have tested our approaches on a test set that includes this variability. The accuracy rate is over 96% for all the proposed segmentation approaches but the best result is obtained with the «Burst Wind Segmentation» one due to the fact that this approach can better extract the scars, it uses a dictionary of scars for recognition, and it has been evaluated on a greater variety of shapes, curvatures, saliency and roughness.

Le relevé et la reconstruction 3D de scènes sous-marine deviennent chaque jour plus incontournable devant notre intérêt grandissant pour l’étude des fonds sous-marins. La majorité des travaux existants dans ce domaine sont fondés sur l’utilisation de capteurs acoustiques l’image n’étant souvent qu’illustrative.L’objectif de cette thèse consiste à développer des techniques permettant la fusion de données hétérogènes issues d’un système photogrammétrique et d’un système acoustique.Les travaux présentés dans ce mémoire sont organisés en trois parties. La première est consacrée au traitement des données 2D afin d’améliorer les couleurs des images sous-marines pour augmenter la répétabilité des descripteurs en chaque point 2D. Puis, nous proposons un système de visualisation de scène en 2D sous forme de mosaïque.Dans la deuxième partie, une méthode de reconstruction 3D à partir d’un ensemble non ordonné de plusieurs images a été proposée. Les données 3D ainsi calculées seront fusionnées avec les données provenant du système acoustique dans le but de reconstituer le site sous-marin.Dans la dernière partie de ce travail de thèse, nous proposons une méthode de recalage 3D originale qui se distingue par la nature du descripteur extrait en chaque point. Le descripteur que nous proposons est invariant aux transformations isométriques (rotation, transformation) et permet de s’affranchir du problème de la multi-résolution. Nous validons à l’aide d’une étude effectuée sur des données synthétiques et réelles où nous montrons les limites des méthodes de recalages existantes dans la littérature. Au final, nous proposons une application de notre méthode à la reconnaissance d’objets 3D. / The survey and the 3D reconstruction of underwater become indispensable for our growing interest in the study of the seabed. Most of the existing works in this area are based on the use of acoustic sensors image.The objective of this thesis is to develop techniques for the fusion of heterogeneous data from a photogrammetric system and an acoustic system.The presented work is organized in three parts. The first is devoted to the processing of 2D data to improve the colors of the underwater images, in order to increase the repeatability of the feature descriptors. Then, we propose a system for creating mosaics, in order to visualize the scene.In the second part, a 3D reconstruction method from an unordered set of several images was proposed. The calculated 3D data will be merged with data from the acoustic system in order to reconstruct the underwater scene.In the last part of this thesis, we propose an original method of 3D registration in terms of the nature of the descriptor extracted at each point. The descriptor that we propose is invariant to isometric transformations (rotation, transformation) and addresses the problem of multi-resolution. We validate our approach with a study on synthetic and real data, where we show the limits of the existing methods of registration in the literature. Finally, we propose an application of our method to the recognition of 3D objects.