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Marcadores microssatélites no MHC de ovinos : estudos de associação e diversidade genética na raça Santa Inês

Leguiza, César Daniel Petroli 07 1900 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2007. / Submitted by Luis Felipe Souza (luis_felas@globo.com) on 2008-11-25T19:05:36Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao_2007_CesarLeguiza.pdf: 549428 bytes, checksum: 669413d56afa5a2d8687e32ee7c0f8f2 (MD5) / Approved for entry into archive by Georgia Fernandes(georgia@bce.unb.br) on 2009-01-15T13:15:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertacao_2007_CesarLeguiza.pdf: 549428 bytes, checksum: 669413d56afa5a2d8687e32ee7c0f8f2 (MD5) / Made available in DSpace on 2009-01-15T13:15:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao_2007_CesarLeguiza.pdf: 549428 bytes, checksum: 669413d56afa5a2d8687e32ee7c0f8f2 (MD5) / O objetivo deste trabalho foi verificar a existência de associações significativas entre alelos de locos pertencentes ao MHC (Major Histocompatibility Complex) de ovinos (OLA - ovine leucocyte antigen) com características de desempenho, carcaça e resistência às parasitas gastrintestinais em ovelhas puras e cruzadas das raças Santa Inês, Bergamácia, Texel e Ile de France oriundas de diferentes localidades. Também foi avaliada a diversidade genética desta região genômica em populações de ovinos da raça Sana Inês pertencente a três localidades diferentes do Centro-Oeste Brasileiro e no rebanho da UnB num período de três anos. Foram utilizados 13 locos microssatélites localizados no cromossomo 20 de ovinos. Os marcadores utilizados demonstraram ter uma alta variabilidade genética entre os indivíduos. Foi observada uma associação significativa (p<0,05) entre características de carcaça e OPG nestes marcadores presentes no MHC ovino. Foi observada uma diminuição da variabilidade genética nas populações analisadas, de maneira que algumas estavam significativamente estruturadas. Estes resultados necessitam de maior amostragem e confirmação em outras populações para os estudos de associação, mas demonstraram o poder do uso da região do MHC para estudos de manejo de rebanhos. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The objective of this study was to verify the existence of significant associations between alleles of the ovine MHC (OLA - ovine leucocyte antigen) with characteristics of performance, carcass and resistance to gastrointestinal parasites in purebred Santa Inês sheep and their crosses with Bergamasca, Texel and Ile de France sires from different localities. The genetic diversity of this genomic region in populations of Santa Inês sheep from three different farms in the Brazilian Center-West and that of the University of Brasilia. Thirteen microsatellite loci, located on chromosome 20, were used. The markers studied showed high genetic variability between individuals. A significant association (p<0,05) between carcass characteristics and OPG was observed in the ovine MHC. The studied genomic region was shown to be highly polymorphic, coinciding with the consulted bibliography. The populations analysed showed a reduction in genetic variability, causing subdivision of the same. The association results should be verified by larger sampling and confirmation in other populations, as well the MHC region was suitable to studies of herd management.
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Caracterização zoométrica do remanescente da raça eqüina Nordestina nos Estados de Pernambuco e Piauí

MELO, Jânio Benevides de 28 February 2011 (has links)
Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-04-27T13:33:13Z No. of bitstreams: 1 Janio Benevides de Melo.pdf: 845976 bytes, checksum: 55b3b13a3bb41e12d05e1264797fff7c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-27T13:33:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Janio Benevides de Melo.pdf: 845976 bytes, checksum: 55b3b13a3bb41e12d05e1264797fff7c (MD5) Previous issue date: 2011-02-28 / The zoometric measures of the adult Nordestina horse breed from Pernambuco and Piauí states were the objective of this study. The same measurer have taken 48 body measures, which resulted in 9 zoometric indices (in a total of 57 quantitative traits) on 238 animals, among males, females and geldings. The qualitative traits were evaluated according to coat color, bridge of nose profile, position of lips, neck shape, slope of croup, hooves color and size. The quantitative traits were evaluated by analysis of variance, descriptive statistics and principal components analysis, whereas the qualitative traits by frequency distribution. The principal components analysis reduced 50 body measures to 9 components for males and females and 7 components for geldings. The number of variables for males, females and geldings was shortened to 21, 20 and 18, respectively, using the principal component analysis, in which 15 measures were in common for males, females and geldings (withers height, back height, height from sternum to ground, croup height, forelimb height, hind-limb height, insertion of tail height, fore-pastern length, back-loin length 1, hind-pastern length, fore-cannon perimeter, fore-fetlock perimeter, fore-pastern perimeter, fore-fetlock perimeter and hind-pastern perimeter). These measures can be used for further studies, regardless of animal sex. The withers height had strong correlation with the other heights and the perimeters were strongly correlated among them according to the anatomical region of the members. In general, all animals from Pernambuco and Piauí states were small-sized and classified as hypometric due to the weights (estimated weight and body weight) and as mediolineous (balance body) by body index, within a range between strength and speed (saddle and light traction).Conformation and compactness indices had classified them as more able to saddle than draft. The dactyl-thoracic index classified the animals as heavy draft horses, except for females from Pernambuco state (intermediate ability). The wok indices 1 and 2 shows that animals from Pernambuco can support greater weight at a trot or gallop. The ethnological profile study detected a prevalence of gray coat color, black and small hooves, subconvex bridge of nose, pyramidal neck, firm and juxtaposed lips. Just the male animals from Pernambuco had a croup classified as lightly inclined. Sexual dimorphism and origin effect on most measures and indices were detected, indicating the existence of two ecotypes. / Objetivou-se com este estudo a caracterização zoométrica do remanescente do cavalo Nordestino nos estados de Pernambuco e Piauí. Foram tomadas 48 medidas zoométricas, por um único mensurador, e obtidos 9 índices zoométricos, totalizando 57 variáveis quantitativas em 238 animais machos, fêmeas e machos castrados. Foram avaliadas também características qualitativas: coloração da pelagem, perfil de chanfro, justaposição dos lábios, forma do pescoço, inclinação de garupa, coloração e tamanho dos cascos. Para as variáveis quantitativas foi realizada análise de variância, estatística descritiva e análise de componentes principais e, para as variáveis qualitativas foi feito distribuição de frequência. Com auxílio da técnica de componentes principais foi possível reduzir as 50 variáveis estudadas em 9 componentes para os machos e fêmeas e 7 componentes para os machos castrados. Foi possível ainda selecionar dentro das componentes as variáveis de maior peso, reduzindo o número de variáveis para 21, 20 e 18, respectivamente, para machos, fêmeas e machos castrados. Desse total, 15 medidas foram igualmente importantes nos 3 grupos estudados (altura na cernelha, altura no dorso, altura do vazio subesternal, altura na garupa, altura do membro anterior, altura do membro posterior, altura na inserção de cauda, comprimento da quartela anterior, comprimento de dorso-lombo 1, comprimento de quartela posterior, perímetro de canela anterior, perímetro de boleto anterior, perímetro de quartela posterior, perímetro de boleto posterior e perímetro de quartela posterior), que poderão ser usadas em estudos futuros, independentemente do sexo do animal. De maneira geral, para todas as classes estudadas, a altura na cernelha demonstrou forte correlação com as demais alturas; os perímetros referentes a região anatômica dos membros também foram fortemente correlacionados entre si. O estudo permitiu classificar os animais como de porte pequeno e de boa proporção entre a altura na cernelha, na garupa e no comprimento do corpo, com exceção das fêmeas do estado de Pernambuco, e como hipométricos quanto aos pesos e ao índice corporal como mediolíneos, com aptidão intermediária para velocidade e força, ou seja, sela e tração ligeira. Os índices de compacidade e conformação indicam que são animais com aptidão mais para sela que tração. O índice dáctilo-torácico indica que são animais com aptidão para tração pesada com exceção das fêmeas do estado de Pernambuco com aptidão intermediária. Os índices de carga 1 e 2 indicaram maior capacidade de suporte de peso sobre o dorso a trote ou a galope e a passo, aos animais do estado de Pernambuco. Em relação ao perfil morfológico e faneróptico, verificou-se predominância de pelagem tordilha, cascos escuros ou pretos e pequenos, perfil de chanfro subconvexo e pescoço com forma piramidal, lábios firmes e justapostos e garupa ligeiramente inclinada. Ocorreu dimorfismo sexual e efeito de local sobre a maioria das medidas e dos índices avaliados, indicando a existência de dois ecótipos.

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