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Fatores que influenciam métricas topológicas de redes de interação entre plantas e visitantes florais: uma abordagem metodológica / Factors influencing topological metrics of plant-flower visitors networks: a methodological approachVianna, Maria Rodrigues 23 August 2010 (has links)
Vários são os fatores que influenciam as interações entre plantas e visitantes florais, como variações abióticas, bióticas e a forma e intensidade de amostragem. Através de análises de redes, alguns padrões têm sido reconhecidos nessas comunidades interativas, como a estrutura aninhada, a baixa conectância da rede, o maior grau de conectividade de plantas em relação aos visitantes florais e a forma de distribuição desses graus. Neste trabalho, procurou-se avaliar a estabilidade das métricas das redes de interação entre plantas e visitantes florais com relação às variações de esforço amostral, ao aumento da área amostrada, e influência de fitofisionomias do cerrado (campo cerrado e campo sujo). Também foi avaliada se a forma de obtenção de dados para construção das matrizes de interação (se a partir de observação de campo C, a partir de análises palinológicas P, ou junção de ambas as formas - CP) altera essas métricas. Para isso, foram analisadas matrizes de interação entre plantas e visitantes obtidas em 6 parcelas de tamanhos diferentes (100, 400, 900 m2), sendo três em cada fitofisionomia, na Estação Ecológica de Itirapina, Itirapina, SP. Os resultados indicam que, embora as métricas riqueza de espécies de plantas, de visitantes Apoidea, riqueza de interações observadas e possíveis, sejam sensíveis ao tamanho da área amostrada e ao esforço amostral, a generalização das redes (medida por conectância), das espécies de plantas e visitantes (medidas pela média de interações em cada rede) e os graus de aninhamento (NODF) são bastante robustos. A fitofisionomia não influenciou em nenhuma dessas métricas. A forma de obtenção dos dados, por sua vez, indica que há um forte viés com relação à forma de obtenção dos dados no número de espécies de plantas (C<[P=CP] ), número de interações possíveis ([C=P]<CP); interações observadas ([C=P]< CP ); conectância ([C=CP] < P ); grau médio de interações das espécies de plantas (P<[C=CP]); dos visitantes ([P=CP] < C); e grau de aninhamento medido por NODF ([C=CP] < P). Não houve influência da forma de obtenção dos dados na centralização das redes. Estes resultados indicam que embora algumas dessas métricas sejam robustas com relação ao esforço amostral e tamanho da área amostrada, há um forte viés ligado à forma de obtenção dos dados para a construção das matrizes de dados, que pode ser balanceado com a adição de informações palinológicas obtidas através dos visitantes coletados, pois elas ajudam a identificar interações efetuadas por eles antes da sua captura. / Several factors can influence plant-visitors interactions, such as abiotic and biotic changes, and type and intensity of sampling. Through network analysis, some patterns have been recognized in these interactive communities, as nested structure, low connectance network, the greater degree of connectivity of plants in relation to flower visitors and the distribution of these degrees. In this study, we sought to evaluate the stability of the networks topology metrics with respect to variations in sampling effort, increase of the sampling area, and the influence of cerrado phytophysiognomies (campo cerrado and campo sujo). We also assessed if the way of obtaining data for constructing the interaction matrices (up from field observations - C, from pollen analysis - P, or joining both ways - CP) alters these metrics. For this we analysed matrices of interaction between plants and visitors obtained in six plots of different sizes (100, 400, 900 m2), three in each vegetation type at the Ecological Station Itirapina Itirapina, SP. The results indicate that while the metrics of plant species richness, Apoidea visitors, richness of observed and possible interactions, are sensitive to the size of the sampled area and sampling effort, networks generalization (measured by connectance), plant and visitors species generalization (as measured by the average of interactions in each network) and nestedness degree (NODF) are quite robust. Phytophysiognomy did not influence in any of these metrics. The way data were obtained, in turn, indicates that there is a strong bias with respect to the number of plant species (C <[P = CP]), number of possible interactions ([C = P ] < CP), number of observed interactions ([C = P] <CP), connectance ([C = CP] < P), average degree of plant species (P <[C = CP]) and visitors ([ P = CP] <C) interactions and nestedness degree, measured by NODF ([C = CP] < P). There was no influence of the means of acquiring data in network centralization. These results indicate that although some of these metrics are robust with respect to sampling effort and size of sampled area, there is a strong bias linked to how data were obtained for the construction of the data matrices that can be balanced with the addition of pollen information obtained from the visitors collected, because they help identify interactions made by them before their capture.
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Fatores que influenciam métricas topológicas de redes de interação entre plantas e visitantes florais: uma abordagem metodológica / Factors influencing topological metrics of plant-flower visitors networks: a methodological approachMaria Rodrigues Vianna 23 August 2010 (has links)
Vários são os fatores que influenciam as interações entre plantas e visitantes florais, como variações abióticas, bióticas e a forma e intensidade de amostragem. Através de análises de redes, alguns padrões têm sido reconhecidos nessas comunidades interativas, como a estrutura aninhada, a baixa conectância da rede, o maior grau de conectividade de plantas em relação aos visitantes florais e a forma de distribuição desses graus. Neste trabalho, procurou-se avaliar a estabilidade das métricas das redes de interação entre plantas e visitantes florais com relação às variações de esforço amostral, ao aumento da área amostrada, e influência de fitofisionomias do cerrado (campo cerrado e campo sujo). Também foi avaliada se a forma de obtenção de dados para construção das matrizes de interação (se a partir de observação de campo C, a partir de análises palinológicas P, ou junção de ambas as formas - CP) altera essas métricas. Para isso, foram analisadas matrizes de interação entre plantas e visitantes obtidas em 6 parcelas de tamanhos diferentes (100, 400, 900 m2), sendo três em cada fitofisionomia, na Estação Ecológica de Itirapina, Itirapina, SP. Os resultados indicam que, embora as métricas riqueza de espécies de plantas, de visitantes Apoidea, riqueza de interações observadas e possíveis, sejam sensíveis ao tamanho da área amostrada e ao esforço amostral, a generalização das redes (medida por conectância), das espécies de plantas e visitantes (medidas pela média de interações em cada rede) e os graus de aninhamento (NODF) são bastante robustos. A fitofisionomia não influenciou em nenhuma dessas métricas. A forma de obtenção dos dados, por sua vez, indica que há um forte viés com relação à forma de obtenção dos dados no número de espécies de plantas (C<[P=CP] ), número de interações possíveis ([C=P]<CP); interações observadas ([C=P]< CP ); conectância ([C=CP] < P ); grau médio de interações das espécies de plantas (P<[C=CP]); dos visitantes ([P=CP] < C); e grau de aninhamento medido por NODF ([C=CP] < P). Não houve influência da forma de obtenção dos dados na centralização das redes. Estes resultados indicam que embora algumas dessas métricas sejam robustas com relação ao esforço amostral e tamanho da área amostrada, há um forte viés ligado à forma de obtenção dos dados para a construção das matrizes de dados, que pode ser balanceado com a adição de informações palinológicas obtidas através dos visitantes coletados, pois elas ajudam a identificar interações efetuadas por eles antes da sua captura. / Several factors can influence plant-visitors interactions, such as abiotic and biotic changes, and type and intensity of sampling. Through network analysis, some patterns have been recognized in these interactive communities, as nested structure, low connectance network, the greater degree of connectivity of plants in relation to flower visitors and the distribution of these degrees. In this study, we sought to evaluate the stability of the networks topology metrics with respect to variations in sampling effort, increase of the sampling area, and the influence of cerrado phytophysiognomies (campo cerrado and campo sujo). We also assessed if the way of obtaining data for constructing the interaction matrices (up from field observations - C, from pollen analysis - P, or joining both ways - CP) alters these metrics. For this we analysed matrices of interaction between plants and visitors obtained in six plots of different sizes (100, 400, 900 m2), three in each vegetation type at the Ecological Station Itirapina Itirapina, SP. The results indicate that while the metrics of plant species richness, Apoidea visitors, richness of observed and possible interactions, are sensitive to the size of the sampled area and sampling effort, networks generalization (measured by connectance), plant and visitors species generalization (as measured by the average of interactions in each network) and nestedness degree (NODF) are quite robust. Phytophysiognomy did not influence in any of these metrics. The way data were obtained, in turn, indicates that there is a strong bias with respect to the number of plant species (C <[P = CP]), number of possible interactions ([C = P ] < CP), number of observed interactions ([C = P] <CP), connectance ([C = CP] < P), average degree of plant species (P <[C = CP]) and visitors ([ P = CP] <C) interactions and nestedness degree, measured by NODF ([C = CP] < P). There was no influence of the means of acquiring data in network centralization. These results indicate that although some of these metrics are robust with respect to sampling effort and size of sampled area, there is a strong bias linked to how data were obtained for the construction of the data matrices that can be balanced with the addition of pollen information obtained from the visitors collected, because they help identify interactions made by them before their capture.
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Uma ferramenta para análise de redes de interações polinizador-planta aplicada ao portal IABIN-PTN. / A tool for analysis of plant-pollinator interactions networks applied the portal IABIN-PTN.Lopes, Paulo Venancio 13 April 2012 (has links)
O planeta está perdendo rapidamente sua biodiversidade, e isto se dá em boa medida pelo crescimento da população humana. Com ela cresceu a demanda por alimentos e matérias primas, e por conseqüência, aumentou a quantidade de terras usadas para sua produção. Esta demanda por terras aráveis e a busca por minérios fez com que a natureza entrasse em crise e a perda dos polinizadores, principalmente as abelhas, sem dúvida merece destaque. Isto por que estas espécies são responsáveis por um importante serviço de ecossistemas, a polinização, tanto para produção de alimentos quanto nas áreas naturais. Para encontrar soluções para o declínio dos polinizadores, os pesquisadores coletam dados sobre as ocorrências de espécies que auxiliem na conservação e no uso sustentado da biodiversidade. A manipulação da grande quantidade de dados coletados demanda o apoio da computação e ensejou a criação de uma nova área denominada informática para biodiversidade (biodiversity informatics), que se dedica à pesquisa e desenvolvimento de ferramentas que cobrem desde a digitalização até a análise dos dados. Uma categoria importante de dados de biodiversidade é a dos dados sobre as interações entre as espécies, pois permite entender as inter-relações e dependências. Nos últimos anos essa abordagem sobre interações vem se intensificando, principalmente sob a forma de redes de interações e desta forma a construção de novas ferramentas com esta abordagem se faz necessária para auxiliar as análises. Este trabalho apresenta uma ferramenta para análise de redes de interações desenvolvida para operar sobre a base de dados de interações do portal da Rede Temática de Polinizadores da Rede Interamericana de Informação sobre Biodiversidade IABIN-PTN. Ela se baseia em conceitos computacionais como teoria dos grafos e sistemas complexos para realizar cálculos e apresentar gráficos para análise de redes de interações biológicas, como os índices de tamanho da rede, quantidade de espécies, número total de ligações, conectância, grau médio de espécies, grau presença-ausência, grau quantitativo, coeficiente de agregação e força da espécie. Para visualização da topologia da rede são disponíveis com cinco tipos de gráficos: Balão, Circular, Orgânico, Cíclico Hierárquico e Radial, além dos gráficos da matriz adjacência, matriz presença, grafo bipartido, interações, coeficiente de agregação, distribuição e probabilidade. A ferramenta permite analisar os dados diretamente a partir do portal de dados, dispensando a exportação para outras ferramentas, aumentando o valor da Rede Temática de Polinizadores e contribuindo para o trabalho os pesquisadores. / The planet is rapidly losing its biodiversity, and this is due to mankind demographic expansion. With an increased population, the demand for food has also increased and, consequently, an increase in land used for agriculture also occurred. This demand for tillable land and the search for minerals have disrupted nature and the loss of pollinators, particularly bees, is undoubtedly the most damaging of all. This is because these species generate high value in their ecological services, in the process of pollination for food production and the maintenance of natural areas. To find solutions, researchers are collecting information on the occurrences of species that can assist in the conservation and sustainable use of biodiversity in their search for answers. But with all this information, its treatment has become very slow, expensive and difficult to manipulate. Hence, biodiversity informatics, a branch of computer science, came to solve these and other issues, storing this information in databases and creating computational tools to analyze all that information. In recent years, the approach to interactions has intensified, especially in interaction networks and thus the construction of new tools with this approach is required. This work proposes a tool for analyzing interaction networks to be connected to IABIN-PTN portal interaction database. This tool will perform calculations and graphics for analyzing the biological interactions network and calculations are presented as indices of network size, number of species, total number of links, connectance, average degree of species, presence-absence degree, quantitative degree, aggregation coefficient, and species strength. Visualization will show the topology network with five types: Ballon, Circular, Organic, Hierarchical Cyclic and Radial, and graphics for adjacency matrix, presence matrix, bipartite graph, interactions, aggregation coefficient, distribution and probability. The tool allows analyzing the data directly from the IABIN PTN portal without the need to export the data to other tools, increasing the value of IABIN-PTN and contributing to the work of the researchers.
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Uma ferramenta para análise de redes de interações polinizador-planta aplicada ao portal IABIN-PTN. / A tool for analysis of plant-pollinator interactions networks applied the portal IABIN-PTN.Paulo Venancio Lopes 13 April 2012 (has links)
O planeta está perdendo rapidamente sua biodiversidade, e isto se dá em boa medida pelo crescimento da população humana. Com ela cresceu a demanda por alimentos e matérias primas, e por conseqüência, aumentou a quantidade de terras usadas para sua produção. Esta demanda por terras aráveis e a busca por minérios fez com que a natureza entrasse em crise e a perda dos polinizadores, principalmente as abelhas, sem dúvida merece destaque. Isto por que estas espécies são responsáveis por um importante serviço de ecossistemas, a polinização, tanto para produção de alimentos quanto nas áreas naturais. Para encontrar soluções para o declínio dos polinizadores, os pesquisadores coletam dados sobre as ocorrências de espécies que auxiliem na conservação e no uso sustentado da biodiversidade. A manipulação da grande quantidade de dados coletados demanda o apoio da computação e ensejou a criação de uma nova área denominada informática para biodiversidade (biodiversity informatics), que se dedica à pesquisa e desenvolvimento de ferramentas que cobrem desde a digitalização até a análise dos dados. Uma categoria importante de dados de biodiversidade é a dos dados sobre as interações entre as espécies, pois permite entender as inter-relações e dependências. Nos últimos anos essa abordagem sobre interações vem se intensificando, principalmente sob a forma de redes de interações e desta forma a construção de novas ferramentas com esta abordagem se faz necessária para auxiliar as análises. Este trabalho apresenta uma ferramenta para análise de redes de interações desenvolvida para operar sobre a base de dados de interações do portal da Rede Temática de Polinizadores da Rede Interamericana de Informação sobre Biodiversidade IABIN-PTN. Ela se baseia em conceitos computacionais como teoria dos grafos e sistemas complexos para realizar cálculos e apresentar gráficos para análise de redes de interações biológicas, como os índices de tamanho da rede, quantidade de espécies, número total de ligações, conectância, grau médio de espécies, grau presença-ausência, grau quantitativo, coeficiente de agregação e força da espécie. Para visualização da topologia da rede são disponíveis com cinco tipos de gráficos: Balão, Circular, Orgânico, Cíclico Hierárquico e Radial, além dos gráficos da matriz adjacência, matriz presença, grafo bipartido, interações, coeficiente de agregação, distribuição e probabilidade. A ferramenta permite analisar os dados diretamente a partir do portal de dados, dispensando a exportação para outras ferramentas, aumentando o valor da Rede Temática de Polinizadores e contribuindo para o trabalho os pesquisadores. / The planet is rapidly losing its biodiversity, and this is due to mankind demographic expansion. With an increased population, the demand for food has also increased and, consequently, an increase in land used for agriculture also occurred. This demand for tillable land and the search for minerals have disrupted nature and the loss of pollinators, particularly bees, is undoubtedly the most damaging of all. This is because these species generate high value in their ecological services, in the process of pollination for food production and the maintenance of natural areas. To find solutions, researchers are collecting information on the occurrences of species that can assist in the conservation and sustainable use of biodiversity in their search for answers. But with all this information, its treatment has become very slow, expensive and difficult to manipulate. Hence, biodiversity informatics, a branch of computer science, came to solve these and other issues, storing this information in databases and creating computational tools to analyze all that information. In recent years, the approach to interactions has intensified, especially in interaction networks and thus the construction of new tools with this approach is required. This work proposes a tool for analyzing interaction networks to be connected to IABIN-PTN portal interaction database. This tool will perform calculations and graphics for analyzing the biological interactions network and calculations are presented as indices of network size, number of species, total number of links, connectance, average degree of species, presence-absence degree, quantitative degree, aggregation coefficient, and species strength. Visualization will show the topology network with five types: Ballon, Circular, Organic, Hierarchical Cyclic and Radial, and graphics for adjacency matrix, presence matrix, bipartite graph, interactions, aggregation coefficient, distribution and probability. The tool allows analyzing the data directly from the IABIN PTN portal without the need to export the data to other tools, increasing the value of IABIN-PTN and contributing to the work of the researchers.
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Eficiência da revegetação para manutenção de aves em áreas de restinga no nordeste brasileiro: testes com translocação e interação frugívoros-plantasVieira-filho, Arnaldo Honorato 29 July 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-07-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / In this study two hypothesis related to the non-colonization of a 20 years old post mining reforested restinga area by the native avifauna from natural restinga forests were tested: (1) the distance between natural restinga forests and the reforested area does not allow colonization by 13 -common birds species tested; (2) the reforested area does not present the necessary structural organization to support the interactions between frugivorous birds-plants. To test the distance hypothesis, experimental translocations with 60% of 13 birds species individuals were performed between June/2008 and April/2010, and monitored until September/2011. From all the 125 individuals translocated to the reforested area, 58 were recaptured in the natural area and only one was recaptured in the reforested area, indicating that many individuals returned to their original area and remained in it. This result shows that the distance of 500 m between both areas does not constitute a barrier for colonization of the reforested area by the studied species, due to their capability of transposing open areas between patches. Therefore, the non-colonization of the reforested area by these species must be related to other causes. To test the hypothesis related to vegetation structure and composition frugivory events were recorded through direct observations and monthly capture of birds during one sampling year. Thus, it was possible to examine the dietary composition of frugivorous birds species and to construct interaction networks between frugivorous birds and plant species, calculating the importance index from plant species to frugivorous birds and vice-versa. The results showed a bigger compartmentalization at the reforested interactions network when compared to the natural area's one and also a replacement of the main species, both birds and plants, included in the interactions networks. This can be explained by the difference in composition of bird and plant species in the studied areas and by the lower plant richness and density in the reforested one. We can conclude that the studied reforested area does not present plant structure and composition able to support the interactions network between frugivorous birds-plants yet. So, the introduction of seedlings of those key plant species found in the natural area interactions network in the reforested area is suggested in order to provide a greater fruit availability and the maintenance of the frugivorous avifauna in the recovery area. / No presente trabalho foram testadas duas hipóteses relacionadas a não colonização de uma área de restinga reflorestada pós-lavra há cerca de 20 anos por parte da avifauna presente em áreas de restinga nativa: (1) a distância entre a restinga nativa e a área reflorestada não permite a colonização de 13 espécies de aves comuns à região; (2) a área reflorestada não apresenta a organização estrutural necessária para suportar as interações entre aves frugívoras-plantas. Para testar a hipótese de distância, foram realizadas translocações experimentais de cerca de 60% dos indivíduos de 13 espécies de aves estudadas entre junho de 2008 e abril de 2010, seguidas de monitoramento até setembro de 2011. Dos 125 indivíduos translocados para a área reflorestada, 58 foram recapturados na área de restinga nativa e apenas um foi recapturado na área reflorestada, indicando que parte dos indivíduos retornaram à área original e permaneceram na mesma. Esse resultado mostra que a distância mínima de 500 m entre as áreas não se caracteriza como uma barreira para a colonização do reflorestamento pelas espécies estudadas, evidenciando sua capacidade de transpor áreas abertas entre os remanescentes de restinga. Portanto, a não colonização da área reflorestada por estas espécies deve estar associada à outra causa. Para testar a hipótese relacionada à estrutura e composição da vegetação foram registrados eventos de frugivoria através observações diretas e da captura mensal de aves durante um ano de amostragem. Dessa forma foi possível verificar a composição da dieta de espécies de aves frugívoras e construir as redes de interação entre as espécies de aves frugívoras e plantas, verificando-se o índice de importância das espécies vegetais para as aves frugívoras e vice-versa. Os resultados demonstram uma maior compartimentalização da rede de interações no reflorestamento em comparação com a rede da área nativa, além de uma substituição das principais espécies, tanto de aves como de plantas, envolvidas nas redes de interações observadas nas áreas amostradas. Isso pode ser explicado pela diferença na composição das espécies de aves e de plantas na área de estudo e as menores riqueza e densidade vegetais encontradas na área reflorestada. Face ao exposto, conclui-se que o reflorestamento estudado ainda não apresenta estrutura e composição vegetal capazes de suportar a rede de interações entre aves frugívoras-plantas. Assim sugere-se o plantio de mudas das espécies vegetais chave na área reflorestada a fim de proporcionar uma maior disponibilidade de frutos e a manutenção da avifauna frugívora na área em recuperação.
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