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Integração de saberes na formação continuada de professores

Reginatto, Vanessa Paula 05 August 2011 (has links)
Submitted by Ana Paula Lisboa Monteiro (monteiro@univates.br) on 2011-09-23T17:45:30Z No. of bitstreams: 1 VanessaReginatto.pdf: 1156300 bytes, checksum: 098b240ca119129b05cca4c6e5e73baf (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Lisboa Monteiro(monteiro@univates.br) on 2011-10-11T14:10:52Z (GMT) No. of bitstreams: 1 VanessaReginatto.pdf: 1156300 bytes, checksum: 098b240ca119129b05cca4c6e5e73baf (MD5) / Made available in DSpace on 2011-10-11T14:11:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 VanessaReginatto.pdf: 1156300 bytes, checksum: 098b240ca119129b05cca4c6e5e73baf (MD5) / A presente dissertação é fruto de uma pesquisa desenvolvida com um grupo de quinze professores da Educação Básica do Vale do Taquari do curso de formação continuada, realizado no Universidade do Vale do Taquari UNIVATES. A formação continuada de professores pode contribuir no construir e reconstruir dos conhecimentos com seus estudantes e também proporcionar discussões de idéias e socialização de experiências entre os mesmos. Dentro deste contexto, buscou-se responder a questão: Como evolui o perfil de professores com relação à interdisciplinaridade ao participar de um processo de formação continuada? Com o intuito de estimular os professores no repensar de sua prática docente foi proposto à elaboração e o desenvolvimento de Unidades Didáticas temáticas e contextualizadas de forma coletiva. Para que eles pudessem participar do curso de formação continuada, também foi necessária a criação de espaço e tempo de estudo, planejamento, análise e socialização das experiências. Os participantes foram distribuídos em dois grupos, que consistiu de professores integrantes da mesma escola, de diferentes áreas do conhecimento e que trabalharam com a mesma turma. Nos encontros, os professores planejaram, discutiram e elaboraram as unidades didáticas para desenvolverem nas suas escolas. Eles escolheram os seguintes temas: “A rota do DNA, um olhar sobre a multiculturalidade brasileira” e “Impactos ambientais e preservação dos recursos naturais”. Houve momentos de socialização entre os grupos onde abordaram as dificuldades e a importância de se trabalhar com um coletivo de professores. Este curso possibilitou aos professores o planejamento de suas aulas em formação, objetivando a integração de saberes. Além disso, tendo em vista o excesso de carga horária e as condições de trabalho a que estão submetidos, facilitou seu dia-a-dia, pois estes elaboraram as atividades interdisciplinares nos encontros e puderam desenvolvê-las com os estudantes. Quanto ao perfil destes professores pode-se considerar que houve uma mudança em relação à metodologia utilizada e as interações ocorridas durante os encontros, no entanto, ao analisar as idéias frente às concepções metodológicas e interações, ao término do curso, percebeu-se que eles retornavam ao seu perfil inicial. Acredita- se que para haver a possibilidade de evolução ou mudança dos perfis dos professores em sua prática docente, num repensar contínuo no planejamento didático, talvez seja necessária uma formação continuada durante todo o ano letivo, com apoio do grupo e assim eles poderão dar continuidade as suas atividades.
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Estudo sobre a relação da pessoa com Síndrome de Asperger e seu ambiente social de desenvolvimento

Moura, Camila Hernandez de 10 1900 (has links)
Submitted by Haia Cristina Rebouças de Almeida (haia.almeida@uniceub.br) on 2015-05-06T11:43:51Z No. of bitstreams: 1 61200789.pdf: 537532 bytes, checksum: b3444b803ecd806f30f9aa0fc005833a (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-06T11:43:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 61200789.pdf: 537532 bytes, checksum: b3444b803ecd806f30f9aa0fc005833a (MD5) / O presente estudo buscou examinar a relação da pessoa com Síndrome de Asperger e seu ambiente social de desenvolvimento, adentrando na compreensão de como ela avalia a sua própria situação social. Inicialmente, questionou-se se reação do outro, talvez envolta em preconceitos, contribuiria para o déficit de interação social estabelecido pelos manuais de classificação como um dos indícios da síndrome. Uma vez que a interação social envolve no mínimo duas pessoas, que se influenciam reciprocamente, pensar sobre a interação social de pessoas com Síndrome de Asperger, focalizando apenas um lado da díade, parece não fazer sentido. Assim, para investigar tal problemática, foram realizadas entrevistas semi-estruturadas com três jovens diagnosticados com a síndrome e, posteriormente, com seus respectivos pais. Por meio do relato verbal dos entrevistados, foi possível verificar que ao falarem sobre a temática socialização, tanto os jovens quanto seus pais se remetiam a situações escolares. A escola, que é considerada em nossa sociedade como o principal espaço de socialização fora do ambiente familiar, e que, portanto, deveria proporcionar a vivência acadêmica e social em uma sociedade plural, passa, porém, a ser palco de perseguições, de descasos e de desentendimentos. O reconhecimento de infinitas possibilidades de existência humana permite ser viável o desenvolvimento de qualquer pessoa, na convivência colaborativa e cooperativa, em diferentes espaços sociais e culturais. No entanto, o caminho escolhido pela escola, que é regida pela racionalidade médica e não pela racionalidade educacional que lhe é própria, tornou mais difícil o acesso aos diferentes. Isso permite que essa instituição perca seu caráter humanizador, tendo como consequência a negação da convivência. Sem dúvida, existe um comportamento intencional das pessoas com Síndrome de Asperger que demonstra resistência à interação. Contudo, isso não parece ser um transtorno intrínseco à síndrome e unilateralmente moldado. Pode-se considerar que essa resistência seja decorrente de uma interação marcada historicamente por uma sociedade que lida com dificuldade com a diversidade. Desse modo, o problema interativo da pessoa com Síndrome de Asperger não deve ser buscado exclusivamente nela, mas no exame minucioso das relações sociais em que se envolve. O presente trabalho é uma contribuição para a reflexão sobre as peculiaridades interativas da pessoa que apresenta Síndrome de Asperger, visando à busca de caminhos para a promoção de seu desenvolvimento, bem-estar e pertencimento, bem como para amparar práticas clínicas, educativas e familiares dos que convivem com ela.
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Metodologia para a construção do léxico de gestos

Silva, Lucineide Rodrigues da January 2013 (has links)
Resumo: A pesquisa descrita neste trabalho destina-se a criação de uma interface de gestos para um museu virtual 3D desenvolvido por um grupo de pesquisa em Processamento de Imagem. A fim de assegurar a adequabilidade dos resultados no tocantes à Interação Humano Computador e, em particular ao caráter genuinamente natural do vocabulário a ser proposto, o grupo se juntou a um grupo Interação Humano Computador que trabalhou durante sete anos com foco na inclusão social e no desenvolvimento de comunidades surdas. Neste contexto , a pesquisa investigou o estado da arte na pesquisa sobre interação natural e criação de vocabulário de gestos em literatura relacionada e propôs o estudo de caso em uma escola bilíngue (Língua Brasileira de Sinais e escrita Português) para crianças surdas. O trabalho relata os resultados de alguns trabalhos especialmente relevantes da literatura e descreve o processo de desenvolvimento e validação do vocabulário de gestos. Como principais contribuições da pesquisa, a adição de um estado anterior - a observação de potenciais usuários interagindo com o cenário físico que motiva usos virtuais inovadores - para o processo de um conhecido autor e a exemplificação de uma forma alternativa de trazer potenciais usuários para o fase de definir os gestos certos para o vocabulário. Finalmente, são estabelecidas as limitações dos resultados e propostas futuras pesquisas.
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O conceito de interação segundo a teoria sistêmica na psicologia

Fonseca, Nysia Vieira da 22 August 1986 (has links)
Submitted by Beatriz_ Estagiaria (marcianb@ig.com.br) on 2012-04-02T18:31:25Z No. of bitstreams: 1 000049139.pdf: 3296841 bytes, checksum: f1072f9ef88af3fca5c750c0b6948598 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-04-02T18:31:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000049139.pdf: 3296841 bytes, checksum: f1072f9ef88af3fca5c750c0b6948598 (MD5) / Neste trabalho aborda-se o conceito de interação como fator de relevante importância para o desenvolvimento da psicologia. Para tanto, analisou-se a evolução da ciência ocidental desde suas raízes na Grécia Antiga até aos dias atuais, ressaltando as revoluções científicas que trouxeram alguma modificação ao pensamento científico. Esse enfoque permitiu verificar-se que duas características marcantes predominaram na ciência: o dualismo e o mecanicismo que a Revolução Científica do século XVII acentuou graças à filosofia de Descartes e à física de Newton. Segundo o paradigma cartesiano-newtoniano, interação, em psicologia nada mais é que a atuação de alguma coisa sobre outra e vice-versa; em outros termos, o ser humano é o resultante de forças, quer sejam internas, quer sejam externas, que atuam sobre ele e as quais ele reage. Logo, interação revela uma conotação mecanicista linear de causa e efeito. A visão fisicalista e reducionista impediu, de certa forma, o desenvolvimento da psicologia que sofre, como toda a ciência em geral, uma transformação e consequente reformulação e criação de conceitos. Assim concluiu-se que, neste novo quadro, a psicologia considerando o homem como um sistema, isto é, um conjunto cujas partes, todas relevantes, integram numa luta permanente de ser e não ser, de ordem e desordem em constante reorganização, salienta-se o conceito de interação como um fator de conhecimento maior, mais completo do homem, um ser tão paradoxal e contraditório segundo metodologias inadequadas para sua investigação. / The interaction concept is approached in this paper as a factor of significant importance to psychology development. To this effect, the evolution of western science has been analyzed from ancient Greece to our days, emphasizing the scientific revolutions that brought some modification to scientific thought. This focalization permitted to discern two marking characteristics predominating in science: dualism and mechanism, which the XVII Century Scientific Revolution accentuated thanks to Descartes philosophy and Newton's physics. According to the paradigm Cartesian-Newtonian, interaction, in psychology, is nothing else than the actuation of something over another thing, and vice-versa; in other words, the human being is the resultant of forces, whether internal or external, which actuate over him and to which he reacts. Thus, the interaction reveals a linear mechanist connotation of cause and effect. The physicist and reductive view impeded some how the development of psychology which is suffering, as any other science in general, a transformation and a consequent reformulation and creation of concepts. So, it has been inferred that within this new frame, psychology considering man as a system, that is, as an assemblance of parts which, being all relevant, interact in permanent struggle of to be or not to be, of order and disorder in a constant reorganization, becomes salient the concept of interaction as a factor of a larger and more complete knowledge of man, a being so paradoxical and contradictory as per methodologies inadequate to the investigation of him.
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Sistemas nacionais de inovação: formulações de políticas no âmbito da OCDE e do Brasil.

Karine Zingler 18 May 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-29T11:12:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_4314_Dissertação definitiva.pdf: 1823181 bytes, checksum: cde64720bda1e7d2244644108e8c6ee1 (MD5) Previous issue date: 2012-05-18 / RESUMO Esta dissertação tem o objetivo de avaliar como o Brasil tem colocado em sua agenda as políticas de ciência, tecnologia e inovação em uma abordagem sistêmica e interativa. Utiliza-se da abordagem teórica de sistemas nacionais de inovação, na tradição de Aalborg, a qual ressalta: políticas sistêmicas conduzidas pelo Estado-Nação, processos de aprendizagem advindos de interações entre agentes, e é pautado em capacidades de aprendizagem idiossincráticas às diferentes nações. Esta abordagem encontrou espaço para se desenvolver teórica e empiricamente na Organização de Cooperação e Desenvolvimento Econômico (OCDE), a partir das décadas de 1980/90, que atualmente é referência de pesquisa no tema. Nesta dissertação, demonstra-se como o Brasil, ao longo de seu processo de desenvolvimento econômico baseado na industrialização, 1930 a 2000, tem deixado de lado políticas que priorizam a interação entre agentes em um sistema nacional de ciência, tecnologia, inovação e aprendizagem, o que foge das orientações fornecidas pela OCDE. Também se avalia os atuais planos, os quais tentam se engajar com as orientações de tal organismo internacional.
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Informaçao de auxílio ao usuário no paradigma de auto-publicaçao em arquivos abertos

Souza, Lucelia de 12 March 2012 (has links)
RESUMO Repositórios de dados eletrônicos que operam via OAI (Open Archives Initiative) são atualmente uma alternativa para a disseminação do conhecimento na sociedade, pois descentralizam o poder que as editoras tradicionais detinham sobre os documentos publicados, transferindo os direitos autorais para o próprio pesquisador. A OAI incentiva a auto-publicação por parte dos pesquisadores e visa a recuperação da informação por meio dos provedores de serviços que fazem a "colheita" nos repositórios de dados. Com o intuito de facilitar a auto-publicação, o presente trabalho apresenta a informação de auxílio ao usuário baseado no software Dspace, que é institucional, trabalha com todo tipo de objeto digital, utiliza o padrão Dublin Core com Qualificadores e possui um workflow passível de adaptação para avaliação das submissões. Utilizou-se para a especificação da informação de auxílio ao usuário a metáfora da Interação Humano-Computador (IHC) por conversação da Engenharia Semiótica e, mas especificamente a linguagem Molic, que considera que a interação entre humanos via computador pode ser alcançada por meio de conversação, tratando exceções não só como algo que esporadicamente pode acontecer, mas como parte da interação. Com o objetivo de verificar possíveis breakdowns comunicativos, foi feita uma análise no processo de submissão do Dspace, identificando os breakdowns no processo de submissão, na interface, na interação em geral e no preenchimento de metadados que após uma análise exaustiva foram categorizados em semânticos, sobre campos específicos e de requisitos de entrada; e breakdowns no processo de avaliação, contribuindo para formar os tipos de mensagens de tratamento/prevenção de erros. A adoção do Molic mostrou-se oportuna no problema em questão, pois a entrada de dados leva a muitas situações de corte que podem ser evitadas e/ou tratadas. Como resultados, é possível propor novas expressões de comunicabilidade associadas a situações de entrada de dados e sistemas de workflow cooperativos. A expectativa é de que qualquer pessoa sem maiores conhecimentos sobre catalogação seja capaz de submeter seus documentos, tornando as publicações mais visíveis pelos motores de busca e sistemas de recuperação, contribuindo para o progresso científico. Apesar de o presente trabalho endereçar o problema da auto-publicação eletrônica, a maioria de seus resultados são passíveis de aplicação em sistemas que envolvam entradas de dados por pessoas leigas num domínio qualquer, assim como a sistemas de workflow cooperativo.
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Síntese e avaliação farmacológica de novos ligantes PPAR planejados a partir do cardanol / Synthesis and pharmacological evaluation of new PPAR ligands designed from cardanol

Ferreira, Thais de Araujo Marques 08 August 2014 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Ciências Farmacêuticas, 2014. / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2015-01-29T16:43:20Z No. of bitstreams: 1 2014_ThaisdeAraujoMarquesFerreira_Parcial.pdf: 174500 bytes, checksum: 0c77117bd850dd9e41e82853dd3fb3e6 (MD5) / Approved for entry into archive by Patrícia Nunes da Silva(patricia@bce.unb.br) on 2015-02-03T12:11:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_ThaisdeAraujoMarquesFerreira_Parcial.pdf: 174500 bytes, checksum: 0c77117bd850dd9e41e82853dd3fb3e6 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-02-03T12:11:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_ThaisdeAraujoMarquesFerreira_Parcial.pdf: 174500 bytes, checksum: 0c77117bd850dd9e41e82853dd3fb3e6 (MD5) / Os receptores ativados por proliferadores peroxissomais, PPARα e PPARγ, atuam como fatores de transcrição, regulando processos metabólicos envolvidos na dislipidemia e diabetes. Uma vez que as atuais terapias medicamentosas destinadas a este fim apresentam limitações, a busca por novos ligantes PPAR tem sido alvo de intensas pesquisas. No âmbito de uma linha de pesquisa que visa a utilização de lipídeos fenólicos do LCC no planejamento racional de novos ligantes, descrevemos o planejamento, a síntese e a avaliação farmacológica de novos ligantes PPAR obtidos a partir do cardanol. A estratégia sintética levou à obtenção de dois intermediários e dezenove derivados em rendimentos que variaram de 62% a 99%. Os resultados farmacológicos referentes à ativação de PPARα, PPARβ/δ e PPARγ evidenciaram a capacidade dos ligantes atuarem como ativadores de transcrição, com EC50 variando de 0,20 μM a 42,70 μM. Os ésteres derivados, LDT15 (24, EC50 3,45 μM ) e LDT480 (32, 3,90 μM), apresentaram melhor perfil transcricional em PPARα com atividade de agonistas parciais. Considerando a atividade como agonistas totais frente à PPARγ destacaram-se os derivados β-oxácido LDT477 (34, EC50 14,0 μM) e o diéster LDT480 (32, 21,0 μM). LDT480 (32) também foi considerado o composto mais ativo para PPARβ/δ, sendo caracterizado como um “pan-agonista”. Os referidos derivados levaram à expressão de genes relacionados à captação (FABP1 e CD36) e oxidação (FgF1, PDK4 e CPT1) de ácidos graxos em hepatócitos primários, e foram considerados indutores de adipogênese em células 3T3-L1. Estudos em osteoblastos, sobre a cascata inflamatória, bem como na modulação de secretases e avaliação farmacológica in vivo dos melhores compostos compreendem às perspectivas deste trabalho para validação do planejamento estrutural visando a obtenção de agonistas duais PPARα/γ. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The peroxisome proliferator activated receptors, PPARα and PPAR gamma, act as transcription factors, regulating metabolic processes involved in dyslipidemia and diabetes. Once the current drug therapies have limitations, the search for new PPAR ligands has been the subject of intense research. In the scope of a research program aiming to use the CNSL phenolic lipids, we describe the design, synthesis and pharmacological evaluation of novel PPAR ligands obtained from cardanol. The synthetic strategy led to obtaining two intermediate nineteen derivatives in yields ranging from 62% to 99%. The pharmacological results concerning the activation of PPARα, PPARβ / δ and PPAR showed the ability of the ligands to acting as activators of transcription, with EC50 ranging from 0.20 μM to 42.70 μM. The ester derivatives, LDT15 (24, EC50 3.45 μM) and LDT480 (32, EC50 3.90 μM), showed better PPARα transcriptional profile with partial agonist activity. Considering the activity as full agonists front PPAR highlights were derived β-oxyacid LDT477 (34, EC50 14,0 μM) and the diester LDT480 (32, 21,0 μM). LDT480 (32) was also considered the most active compound for PPARβ / δ, being characterized as a "pan-agonist." The derivatives led to the expression of genes related to uptake (FABP1 and CD36) and oxidation (FgF1, PDK4 e CPT1) of fatty acids in primary hepatocytes, and were considered inducers of adipogenesis in 3T3-L1 cells. Studies in osteoblasts on the inflammatory cascade, as well as the modulation of secretases, and in vivo pharmacological evaluation of lead compounds are the perspectives of this work to validate the structural design aimed to obtaining dual agonists of PPARα/γ.
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Expectativas de professoras sobre o aluno e as situações de ensino de produção de textos escritos: relações e sentidos

Maria Ribeiro de Oliveira, Christiane 31 January 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T17:19:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo248_1.pdf: 1748073 bytes, checksum: f43217fdfe9c2126dc904f8faf0f9a03 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2010 / Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Pernambuco / Esta pesquisa teve por objetivo analisar a relação entre as expectativas das professoras sobre o desempenho do aluno em produção de textos e as concepções e situações de ensino de produção textual dessas docentes. Foram objetivos específicos da pesquisa: identificar e analisar as expectativas das professoras subjacentes no seu discurso; identificar e analisar os tipos de intervenção das professoras nas atividades de produção textual; analisar as interações discursivas entre professoras e alunos. Partimos da perspectiva do sociointeracionismo da atividade de produção de textos escritos, que dá especial ênfase a interação social. Assim, apoiados nessa concepção e considerando a complexidade dos aspectos que envolvem o contexto escolar de produção de textos, assumimos as expectativas como um fenômeno que permeia as relações interpessoais, e que, portanto, também permeiam as interações estabelecidas em sala de aula. Participaram da pesquisa três professoras do 2° ano do 2° ciclo do Ensino Fundamental e seus respectivos alunos da Rede Municipal de Ensino do Recife. Utilizamos, como procedimentos de coleta, a entrevista semi-estruturada, a observação e a videografia. Para o tratamento dos dados, utilizamos, como procedimentos de análise, a Análise de Conteúdo e a análise microgenética. Os resultados mostraram, dentre outras questões, dois tipos de expectativas elaboradas pelas professoras em relação ao desempenho de seus alunos no final do ano letivo em produção de textos: positivas e negativas. As expectativas positivas se apresentaram de duas formas, nomeadas de expectativas positivas tipo A e expectativas positivas tipo B . Em relação às expectativas negativas, uma das docentes, não apresentou expectativas negativas em relação a nenhum de seus alunos. As expectativas positivas tipo A foram aquelas que a professora acredita que o aluno vai terminar bem em produção de textos, sem dificuldades. Foram consideradas expectativas positivas tipo B quando a professora acredita que o aluno vai terminar melhor, apesar de ainda apresentar dificuldades. E, por fim, encontramos as expectativas negativas , quando a professora acredita que o aluno não vai terminar bem em produção de textos. Os resultados evidenciaram, ainda, uma forte correlação entre as expectativas elaboradas pelas professoras e as concepções e situações de ensino de produção de textos desenvolvidas por estas docentes
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Crianças consideradas fracas , por suas professoras, no processo da alfabetização , diante da escrita e da leitura

Rosálie Nascimento Silva, Orlane January 2003 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T17:22:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo5862_1.pdf: 424460 bytes, checksum: df62aefb1d2b00104a2182d5fb7ea789 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2003 / No enfoque construtivista e sócio-histórico, concebe-se a alfabetização como uma aquisição da criança num espaço discursivo. Ensinar a ler e a escrever não corresponde a levá-la, apenas, ao domínio do código escrito, mas, à exploração da linguagem como constitutiva de seu pensamento e meio de comunicação, de modo que a aquisição da leitura e da escrita seja entendida por ela como uma ferramenta cultural necessária ao seu crescimento social e pessoal. O presente estudo teve como objetivo identificar como crianças consideradas fracas por suas professoras, no processo de alfabetização, se posicionam enquanto leitoras e escritoras diante do objeto social escrita e de atividades de leitura e de escrita. Para a realização do objetivo proposto foram escolhidas quinze crianças pertencentes à turma de 1a série da rede pública estadual de ensino, consideradas fracas por suas professoras, obtendo-se essa informação por meio de uma entrevista prévia feita com elas. Foram planejadas dezoito sessões de observação, videogravadas, em que eram propostas, às crianças, diversas atividades de leitura e de escrita. Várias dessas atividades foram selecionadas para análise, privilegiando-se situações interacionais nas quais havia evidências de seu posicionamento diante da escrita e da atividade de ler e de escrever. Embora muitas crianças já apresentem algum conhecimento sobre ler e escrever, o que foi confirmado nas atividades dirigidas e nos momentos de diálogo que se estabeleceram na sala de aula; quando sãocobradas a ler e a escrever, elas ainda não se sentem autorizadas para tal. Foram realçados, também, alguns indicadores que denotavam motivação para o objeto escrito; e a indisciplina foi discutida como uma dificuldade das crianças se incluírem no processo de alfabetização. Esses resultados foram confrontados com a concepção das professoras das crianças investigadas e a maneira como elas conduziam o processo de ensiná-las a ler e a escrever
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Inferência de polimorfismos de nucleotídeo único utilizando algoritmos baseados em Relevance Learning Vector Quantization

ARAÚJO, Flávia Roberta Barbosa de 21 February 2017 (has links)
Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-06-25T20:59:33Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Flávia Roberta Barbosa de Araújo.pdf: 2622290 bytes, checksum: c1614ba289657ed54f8b6d463f91bfca (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-25T20:59:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Flávia Roberta Barbosa de Araújo.pdf: 2622290 bytes, checksum: c1614ba289657ed54f8b6d463f91bfca (MD5) Previous issue date: 2017-02-21 / FACEPE / Embora duas pessoas compartilhem mais de 99% do DNA, as variações são extremamente relevantes para determinar as variações fenotípicas. Dentre essas variações, os polimorfismos de nucleotídeo único(SNP) são alterações pontuais mais conhecidas por influenciar no aumento no risco de doenças. Os SNPs podem atuar individualmente ou através de interações com outros SNPs (interaçõe sepistáticas). A inferência das interações epistáticas é um problema que vem sendo amplamente estudado, sendo utilizados dados genômicos de estudos de associação ampla do genoma (GWAS) com pacientes casos e controles. Diversas abordagens computacionais foram propostas, utilizando diferentes estratégias para lidar com os desafios de inferir as interações mais relevantes. O primeiro desafio encontrado neste estudo, esta relacionado à grande quantidade de dados (cerca de 500 a 900 mil SNPs). O segundo desafio esta associado ao número de possíveis interações entre SNPs, o que leva a um problema combinatorial. E o terceiro desafio, relaciona-se com o baixo poder estatístico das interações, sendo mais custoso identificá-las. A combinação desses desafios, tornam este um problema difícil de ser tratado. Nesta tese, são utilizadas diferentes metodologias, selecionadas para verificar suas capacidades em lidar com o problema da inferência da interações epistáticas. Dentre estas, são avaliadas técnicas de seleção de características e abordagens computacionais na detecção das interações entre SNPs, assim como algoritmos de aprendizagem de máquina baseados em Relevance Learning Vector Quantization (RLVQ). Nos experimentos realizados, os algoritmos baseados em RLVQ apresentaram resultados satisfatórios ao identificar as interações relevantes entre SNPs em dados com até 5 interações, utilizando requisitos computacionais relativamente baixos quando comparados a outras abordagens descritas na literatura. Um estudo mais extenso foi realizado, com o objetivo de identificar um ajuste ideal dos parâmetros e verificar as capacidades e limitações de cada algoritmo. Com os resultados obtidos através desse ajuste de parâmetros, foi possível levantar hipóteses referente a influência da quantidade de interações entre SNPs e da dimensionalidade dos dados em função dos parâmetros utilizados nos algoritmos. Considerando essas análises, foi possível propor uma nova metodologia denominada iGRLVQ-SNPi, baseada em algoritmos de RLVQ, para lidar de forma mais eficiente com o problema da inferência das interações entre os SNPs. Como iGRLVQ-SNPi, foi possível avaliar interações de ordem n, sem que para isso, fosse necessário informar o número de interações que se deseja avaliar. Nos experimentos realizados, o iGRLVQ-SNPi obteve uma excelente acurácia nos diferentes conjuntos de dados testados, e sendo comparativamente melhor ou tão eficiente quanto outras abordagens de inferência epistáticas avaliadas, utilizando um menor custo computacional. / Although two people share more than 99% of DNA, variations are extremely relevant for determining phenotypic variations. Among these variations, single nucleotide polymorphisms (SNPs) are punctual changes known to influence the increased risk of disease. SNPs can act individually or through interactions with other SNPs (epistatic interactions). The inference of epistatic interactions is a problem that has been extensively studied, using genomic data from genome wide associationstudies(GWAS) with cases and controls patients. Several computational approaches were proposed, using different strategies to deal with the challenges of inferring the most relevant interactions. The first challenge found in this study is related to the large amount of data (about 500 to 900 thousand SNPs). The second challenge is the number of possible interactions between SNPs, which leads to a combinatorial problem. And the third challenge is related to the low statistical power of the interactions, being more difficult to identify them. The combination of these challenges makes this a hard problem to address. In this thesis, different methodologies were used, they were selected to verify their abilities in dealing with the problem of inference of the epistatic interactions. Among these, we evaluate techniques of feature selection and computational approaches in the detection of interactions between SNPs, as well as machine learning algorithms based on Relevance Learning Vector Quantization(RLVQ). In the experiments performed, the RLVQ-based algorithms presented satisfactory results by identifying the relevant interactions between SNPs in data with up to 5 interactions, using relatively low computational requirements when compared to other approaches described in the literature. Amore extensive study was carried out with the objective of identify in ganoptimal adjustment of the parameters and verifying the capacities and limitationsofeachalgorithm. With the results obtained through this adjustment of parameters, it was possible to raise hypotheses regarding the influence of the amount of interactions between SNPs and the dimensionality of the data as a function of the parameters used in the algorithms. Considering these analyzes, it was possible to propose a new methodology called iGRLVQ-SNPi, based on RLVQ algorithms, to deal more efficiently with the problem of inference of the interactions between the SNPs. With iGRLVQ-SNPi, it was possible to evaluate n-order interactions, without it being necessary to inform the number of interactions to be evaluated. In the experiments performed, iGRLVQ-SNPi obtained an excellent accuracy in the different data sets tested, and was comparatively better or as efficient as other evaluated epistatic inference approaches, using a lower computational cost.

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