Submitted by Ana Maria Fiscina Sampaio (fiscina@bahia.fiocruz.br) on 2014-09-18T13:33:05Z No. of bitstreams: 1 Márcio de Oliveira Silva. Avaliação da prevalência... 2014.pdf: 5895290 bytes, checksum: 23d36b43222147ccb7ea4d91986a1c34 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-09-18T13:33:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Márcio de Oliveira Silva. Avaliação da prevalência... 2014.pdf: 5895290 bytes, checksum: 23d36b43222147ccb7ea4d91986a1c34 (MD5) Previous issue date: 2014 / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Avaliar a prevalência de resistência transmitida aos antirretrovirais em indivíduos infectados pelo HIV-1 em acompanhamento clínico e laboratorial na cidade de Salvador-Bahia. Estudo descritivo de corte transversal com amostragem de conveniência composto por 121 pacientes infectados pelo HIV-1, com 18 anos de idade ou mais, virgens de tratamento antirretrovial e que fazem coletas de exame para quantificação das Subpopulações Linfocitárias e da carga viral sérica do HIV-1 no Laboratório de Retrovírus do Hospital Universitário Professor Edgard Santos ou no Centro Especializado em Diagnóstico, Assistência e Pesquisa (CEDAP). Os pacientes foram entrevistados para preenchimento de um questionário epidémiologico e consentiram na utilização do excedente de sangue para realização do sequenciamento do gene pol do HIV-1 contendo parte da Transcriptase e da Protease para análise das mutações de resistência aos antirretrovirais e a caracterização genotípica, análise de recombinações e estudo da história evolutiva viral. Entre os 103 pacientes 66% são do sexo masculino, a mediana de idade e do tempo estimado do diagnóstico do HIV-1 são respectivamente de 35 anos e 29 meses. A principal categoria de exposição relatada foi a sexual com 88,3%, seguida por 3% com acidentes com perfurocortantes e 1% uso de drogas intravenosas. A mediana da contagem dos Linfócitos TCD4+ foi de 438 cel/mm3 e de 4,4 log10. Na análise de Mutação de Resistência à Fármacos (DRM) atráves da ferramenta de Calibração da População com Resistência (CPR) observamos uma prevalência global de 6,8%, 3 (2,9%) amostras com DRM aos Inibidores da Transcriptase nãoanálogos aos nucleos(t)ídeos (ITRNN), 2 (1,9%) aos Inibidores da Transcriptase análogos aos nucleos(t)ídeos (ITRN) e 2 (1,9%) aos IP. Entre as 104 sequências, cinco foram excluídas da análise de filogenética devido a problemas na qualidade. A prevalência dos subtipos seguiram as seguintes distribuições: 71,8% subtipo B, 15,1% F, 9,1% formas recombinantes e 4% C. Entre as amostras classificadas como recombinantes uma não foi possível classificar e todas as demais apresentaram padrões de recombinação do tipo BF sendo 5 semelhantes à CRF28/29_BF, 2 à CRF12_BF e 1 à CRF39_BF. O presente estudo evidencia valores intermédiarios de DRM na cidade de Salvador segundo a metodologia CPR. Os achados filogenéticos assemelham-se aos previamentes descritos na literatura em Salvador / To evaluate the prevalence of transmitted resistance to antiretroviral drugs in patients infected with HIV- 1 assisted in the city of Salvador, Bahia. A descriptive crosssectional study with 121 patients with 18 years of age or older, chronic or recent diagnosis of HIV -1, antirretrovial naïve and make collections for examination and quantification of lymphocyte subpopulations serum viral load of HIV -1 in the Retrovirus Laboratory, Hospital Universitário Professor Edgard Santos or in Centro Especializado em Diagnóstico, Assistência e Pesquisa (CEDAP). Patients were interviewed to fill an epidemiological questionnaire and consented to the use of drawed blood to be sequenced of the transcriptase and protease region of the pol gene of HIV - 1 for analysis of antiretroviral resistance mutations and subtype viral. Of the 121 patients, 104 sequences for phylogenetic analysis and transmitted resistance were obtained, 18 individuals were excluded due quality or amplification problems. Among 103 patients 66% were male, the median age and the estimated time of diagnosis of HIV -1 were respectively 35 and 29 months. The main category of reported exposure was sexual with 88.3%, followed by 3% with Occupational Exposure and 1% use of Intravenous Drugs. The median CD4 + lymphocyte count was 438 cells/mm3 and 4.4 log10. The analysis of Drug Resistance Mutation (DRM) by Calibrating Population Resistance tool (CPR) has a global prevalence of 6.8%, distributed: 2.9% for Non-nucleoside reverse-transcriptase inhibitors (NNRTIs), 1.9% Nucleoside analog reverse-transcriptase inhibitors (NRTIs) and 1.9% to Protease Inhibitors. Among the 104 sequences, five were excluded from the phylogenetic analysis due to quality problems. The prevalence of subtypes followed these distributions: 71.8% subtype B, 15.1% F, 9.1% recombinant forms and 4% C. Among the samples classified as recombinant, one was not possible to classify and all others showed the BF patterns of recombination, 5 CRF28/29_BF likes, 2 CRF12_BF likes and 1 CRF39_BF likes. The prevalence of subtypes was very similar from previously described in Salvador.

Made available in DSpace on 2015-07-22T20:50:38Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-09-28 / A seleção de mutações de resistência aos medicamentos antirretrovirais pós-falha terapêutica representam um grande desafio para a tomada de decisão de novos esquemas de tratamento na pandemia global. A elevada variabilidade genética do HIV-1 e a seleção de mutações de resistência transmitida a pacientes infectados cronicamente, sem que tenham participado de qualquer esquema terapêutico, tem sido objeto de vários estudos no mundo. Os padrões de resistência são estudados principalmente em países da Europa e Estados Unidos, que apresentam prevalência majoritária do subtipo B. Contudo, estudos que direcionam a seleção de mutações transmitidas aos medicamentos antirretrovirais e em subtipos não-B, assim como em suas formas recombinantes, tem aumentado significativamente em várias regiões do mundo. No Brasil, esses estudos são realizados esporadicamente e em regiões distintas do país e, principalmente, em pacientes recém-infectados. A alta variabilidade genética do HIV-1 no nosso país é representada de forma diversificada, com a presença do subtipo B, seguida do F, e especificamente na região Sul a importante prevalência do subtipo C. O objetivo principal deste estudo está embasado nas características de mutações de resistência transmitida aos medicamentos antirretrovirais pelo HIV-1 no gene pol, frações da transcriptase reversa e protease, com análise do perfil mutacional por grupos populacionais de pacientes cronicamente infectados pelo HIV-1 e não tratados, porém com indicação de início imediato de tratamento. Foram avaliados os pacientes representados nas regiões demográficas do Brasil. A prevalência nacional, resultou em 12,1% de mutações de resistência transmitida aos antirretrovirais pelo HIV-1 (grau intermediário de 5 a 15%) e 70,8% de subtipo B; 15,5% C; 6,4% F; 4,0% BF e 3,0% BC na classificação dos subtipos do HIV-1. Além disso, foram classificadas as prevalências de mutações transmitidas, dos subtipos do HIV-1 e características sociodemográficas, laboratoriais e os dados comportamentais na população HIV positiva pré-terapia por cidade nas cinco regiões brasileiras. / The selection of resistance mutations to antiretroviral drugs after failure of antiretroviral therapy represents a major challenge for decision-making of new therapeutic regimens in the global pandemic. The high genetic variability of HIV- 1and the selection of resistance mutations trasmitted to patients chronically infected without having participated in the regimen has been the subject of several studies in the world. Resistance patterns are studied mainly in European countries and the United States, wich have majority prevalence of subtype B. However, studies that guide the selection of transmitted mutants to antiretroviral drugs and non-B subtypes, and in their recombinant forms, has increased significantly in the several regions of the world. In Brazil, these studies are conducted sporadically and in different regions of the country and specially in newly infected patients. The high genetic variability of HIV-1 is represented in our country so diverse, with the presence of subtype B, followed by F, and specifically in the South region, the prevalence of subtype C. In addition, coexist the prevalence of recombinant forms, where the principal is the subtype BF, followed by BC. The main objective of this study estimate the characteristics of transmitted resistance mutations to antiretroviral drugs in HIV-1 ol gene, fractions of reverse transcriptase and protease, with mutational analysis of the profile by a population patients chronically infected with HIV-1 and not treated, but with indication of immediate initiation of treatment. We evaluated the patients represented in the demographic regions of Brazil. The national prevalence resulted in 12.1% of transmitted resistance mutations to antiretroviral (intermediate grade 5% to 15%) and 70.8%, 15.5% C, 6.4% F, 4.0% BF and 3.0% BC in the classification of subtypes of HIV-1. In addition, the prevalence of transmitted mutations, the subtypes of HIV-1 and sociodemographic characteristics, laboratory parameters and behavior data in population HIV-1 positive pre-treatment were classified by the cities in five Brazilian regions. / TEDE / BV UNIFESP: Teses e dissertações