PINHEIRO, M. S. Interação entre genótipos e estirpes de rizóbio em feijão-caupi. 2014. 39 F. Dissertação (Mestrado em Agronomia/Fitotecnia) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências Agrárias, Fortaleza, 2014. / Submitted by José Jairo Viana de Sousa (jairo@ufc.br) on 2015-05-14T17:29:39Z No. of bitstreams: 1 dis_2014_mspinheiro.pdf: 2002750 bytes, checksum: a84a4a61ea9abb533d601640ea1d30f6 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa(jairo@ufc.br) on 2015-10-19T23:49:25Z (GMT) No. of bitstreams: 1 dis_2014_mspinheiro.pdf: 2002750 bytes, checksum: a84a4a61ea9abb533d601640ea1d30f6 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-10-19T23:49:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dis_2014_mspinheiro.pdf: 2002750 bytes, checksum: a84a4a61ea9abb533d601640ea1d30f6 (MD5) Previous issue date: 2014 / Cowpea is a crop widely produced in the North and Northeast of Brazil, and quite adapted to adverse environmental conditions. However, the cowpea is still a culture with low productivity, mainly by low technological level employee. In this respect Biological Nitrogen Fixation (BNF) is a viable option for the supply of nitrogen on the cheap alternative, but it is important to select cowpea varieties most efficient and adapted to the FBN process. The objective of this work was to test the ability of strains of rhizobia and semiarid regions, generating gains in the production of cowpea, able to match the fertilized crop and verify the existence of interaction between cowpea and rhizobia. 21 genotypes obtained from the germplasm bank of the UFC and four strains of native rhizobia obtained semiarid from the culture collection of the laboratory of environmental microbiology at UFC were tested. Four experiments were conducted in a randomized block design in a factorial 6X8 being six genotypes of cowpea, eight sources of nitrogen and three replications. The nitrogen sources were composed of four native strains plus two standard strains and fertilized witness over the uninoculated control (without fertilizer and without rhizobia). The CE-930 genotype was repeated for all trials. The experiments were conducted in a greenhouse of the UFC and genotypes was sown in pots such as "Leonard", with sterile and inert substrate composed of sand and vermiculite. After 35-40 days of planting was carried out collect data for analysis. No significant interaction was found between genotypes and strains of rhizobia. There was no response variation for total nitrogen between any of the genotypes in the four experiments, all were statistically equal, but as the other variables there were very different values in some cases. When we analyzed the sources of nitrogen in the four tests all strains except LAMAB-8 generated increased production almost always similar nitrogen witness. The genotypes of cowpea did not influence the responses of strains of rhizobia, not being revealed interaction between them. The LAMAB-40, LAMAB-48 and LAMAB-65 strains expressed ability to fix nitrogen assimilated form already strains recommended for culture and when chemically fertilized. / O feijão-caupi é uma cultura amplamente produzida nas regiões norte e nordeste do Brasil, e bastante adaptada à condições edafoclimáticas adversas. Entretanto, o feijão-caupi ainda é uma cultura com baixa produtividade, principalmente pelo baixo nível tecnológico empregado. Nesse aspecto a Fixação Biológica de Nitrogênio (FBN) é uma alternativa viável para o fornecimento de nitrogênio de forma barata, porém é importante selecionar variedades de feijão-caupi mais eficientes e adaptadas ao processo de FBN. Objetivou-se com esse trabalho, testar a capacidade de estirpes de rizóbios nativos de regiões semiáridas, em gerar ganhos na produção do feijão-caupi, capazes de se equiparar a cultura adubada e verificar a existência de interação entre o feijão-caupi e os rizóbios. Foram testados 21 genótipos obtidos do banco de germoplasma da UFC e quatro estirpes de rizóbios nativas do semiárido obtidas da coleção de culturas do laboratório de microbiologia ambiental da UFC. Foram realizados quatro experimentos em delineamento de blocos ao acaso no esquema fatorial 6X8 sendo seis genótipos de feijão-caupi, oito fontes de nitrogênio e três repetições. As fontes de nitrogênio foram compostas por quatro estirpes nativas mais duas estirpes padrões e a testemunha adubada mais o controle sem inoculação (sem adubo e sem rizóbio). O genótipo CE-930 foi repetido em todos ensaios. Os experimentos foram realizados em casa de vegetação da UFC e os genótipos semeados em vasos do tipo “Leonard”, com substrato estéril e inerte composto por areia e vermiculita. Após 35 a 40 dias do plantio realizou-se a coleta de dados para análise. Não foi encontrada interação significativa entre os genótipos e as estirpes de rizóbios. Não houve variação de resposta quanto ao nitrogênio total entre nenhum dos genótipos avaliados nos quatro experimentos, todos foram estatisticamente iguais, porém quanto as demais variáveis houveram valores bem diferentes em alguns casos. Quando se analisou as fontes de nitrogênio, nos quatro ensaios todas as estirpes com exceção da LAMAB-8 geraram aumento de produção quase sempre similar a testemunha nitrogenada. Os genótipos de feijão-caupi não influenciaram as respostas das estirpes de rizóbios, não sendo revelada interação entre ambos. As estirpes LAMAB-40, LAMAB-48 e LAMAB-65 expressaram capacidade de fixar nitrogênio de forma equiparada as estirpes já recomendadas para a cultura e quando adubada quimicamente.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:50:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1535_1.pdf: 1353342 bytes, checksum: 298a530e1ac716f2d34a38105cb26b4b (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2008 / Faculdade de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco / Os biopolímeros polissacarídicos de origem microbiana, sintetizados por bactérias, fungos e leveduras são também conhecidos como goma devido a sua capacidade de formar soluções viscosas e géis em meio aquoso. A produção de exopolissacarídeos (EPS) microbianos tem sido objeto de intensa pesquisa, tendo em vista seu elevado potencial de aplicação em diferentes setores. No entanto os polissacarídeos sintetizados por bactérias do grupo Rhizobium, tem sido estudados na tentativa de melhor compreender sua participação na simbiose leguminosa X Rhizobium, uma vez que estes biopolímeros parecem ser determinantes da especificidade simbiótica, entretanto a precisa função destas moléculas ainda está sendo investigada. No processo de produção e viscosidade de polissacarídeo a ser obtido, deve-se considerar desde o microrganismo em estudo até a determinação dos parâmetros de agitação, tempo de incubação, excesso ou ausência de carboidratos e volume de inoculo, onde se destaca o meio de produção e sua influência na síntese, no rendimento e na composição dos EPS. O objetivo deste trabalho foi avaliar a produção e viscosidade de biopolímeros obtidos de 8 isolados de Rhizobium sp. comparados com a estirpe padrão Rhizobium tropici (CIAT 899) em diferentes tempos de cultivo. O biopolímero foi obtido através de agitação, em incubador agitador. As condições foram: 28 °C, 200 rpm por 96 e 168 horas em meio YM modificado. Foram avaliados: a produção, pela massa seca da solução aquosa dos biopolímeros a 2,5 % (v/v) através da técnica da massa seca e após a secagem do produto foi realizada em dissecador à temperatura de 30 °C, até massa constante. Para medidas de viscosidade, as amostras foram determinadas em viscosímetro rotacional Brookfield (modelo RVT, Spindle 1) a 20 °C, a diferentes taxas de cisalhamento. Os resultados mostraram que os isolados no tempo de fermentação de 168 horas apresentou maior produção de EPS. Com o aumento do tempo também houve um aumento da viscosidade para todos os isolados

Made available in DSpace on 2014-06-12T23:14:45Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo2694_1.pdf: 940327 bytes, checksum: 393ae0a0c91b93eaaf3828848a3b30de (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2010 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / As leguminosas constituem uma das mais importantes famílias da caatinga. Uma característica de grande importância ecológica apresentada por algumas espécies desta família é a fixação biológica do nitrogênio (FBN), realizada através da simbiose com bactérias radiculares genericamente denominadas de rizóbios. No presente trabalho, foi avaliada a capacidade de nodulação de leguminosas nativas da caatinga, isolados e caracterizados morfologicamente rizóbios associadas aos nódulos destas leguminosas, determinada a abundância natural de 15N em campo das mesmas e avaliada a diversidade de rizóbios nativos de três fragmentos preservados da caatinga. Amorosa, jurema branca, jurema preta, mulungu, sabiá, unha de gato, angico, canafístula, cumaru, mororó e espinheiro foram cultivados por 120 dias em vasos contendo solos coletados nos municípios de Remígio e Santa Teresinha, na Paraíba, e Serra Talhada, em Pernambuco, para observação da nodulação natural. As leguminosas que se revelaram nodulantes foram: amorosa, angico, jurema branca, jurema preta, mulungu, sabiá e unha de gato. As não nodulantes foram: canafístula, cumaru, espinheiro e mororó. Os resultados de nodulação foram confirmados pelos sinais de 15N. Foram selecionados os vintes maiores nódulos, de cada planta nodulante (exceto angico), que gerou uma coleção de 264 isolados de rizóbios, que foram caracterizados fenotipicamente em meio de cultura YMA (Yeast Mannitol Agar). Com os dados foram construídos uma matriz e um dendrograma, utilizando o algoritmo UPGMA, o Coeficiente de Jaccard e o programa estatístico NTSYS-PC. Foram gerados 36 grupos fenotípicos com 70% de similaridade entre isolados. Índices de diversidades foram usados para avaliar a variabilidade e equabilidade dos rizóbios nas três áreas amostradas e identificar possíveis gradientes de diversidade. Os índices para Serra Talhada, Remígio e Santa Teresinha foram, respectivamente: Shannon-Wiener - 4,39, 3,25 e 3,69; Margalef - 5,85, 3,25 e 4,77; Simpson - 0,06, 0,12 e 0,11; e Pielou - 3,03, 2,57 e 2,71. Os maiores valores de Serra Talhada indicam maior diversidade e representatividade de grupos fenotípicos. Os mesmos índices foram aplicados as seis leguminosas, verificando-se que jurema preta e mulungu apresentaram as maiores 8 diversidades e representatividades de grupos fenotípicos. Por outro lado, unha de gato foi a menos representativa e Sabiá apresentou baixa uniformidade na distribuição dos grupos

Este trabalho teve como objetivo principal realizar um estudo proteômico diferencial aplicado à amostra Bradyrizobium elkanii (SEMIA 587). Isso se fez através da identificação de proteínas diferencialmente expressas nesta importante bactéria fixadora de nitrogênio quando cultivada em laboratório (in vitro) e quando inoculada em plantas de soja (in vivo). A caracterização das proteínas foi feita com a poderosa técnica de espectrometria de massas, e a análise proteômica com expressão diferencial foi comparada por meio de duas estratégias diferentes: MudPIT e Maldi-QToF. A avaliação das imagens dos géis bidimensionais permitiu verificar que a amostra de bactéria apresentou um número maior de proteínas expressas em relação ao bacterióide. Se comparada ao microrganismo na condição in vitro (bactéria), a espécie fixadora de nitrogênio (bacterióide) apresentou 19 proteínas induzidas e 230 reprimidas. O aumento de expressão observado para as proteínas do bacterióide foi pelo menos duas vezes maior do que o volume normalizado para 17 proteínas e, caiu pela metade (ou mais), para outras 26 proteinas em relação a bactéria. Através de ambas as técnicas (Maldi-QToF e ESI-QToF) empregadas na identificação das proteínas observou-se, comprovando a complementariedade existente entre as metodologias, que os padrões metabólicos tanto em bactéria como bacterióide foram mantidos. Ou seja, bactérias cultivadas em meio YML apresentaram um metabolismo voltado para a síntese celular, denotada pela produção de macromoléculas e metabolismo energético, ao passo que bacterióides, endosimbiontes isolados de nódulos de plantas de soja, apresentaram um metabolismo especialmente dedicado à fixação simbiótica do nitrogênio. / The main goal of this project was to perform a differential proteomic analysis of Bradyrizobium elkanii (SEMIA 587). It was made by the identification of differentially expressed proteins in this important nitrogen fixing bacteria grown under different conditions: in laboratory culture (in vitro) and symbiotically associated with soybean plants (in vivo). The characterization of proteins differentially expressed was done by the powerful technique of mass spectrometry, applying two different strategies: MudPIT and Maldi-QToF. It was possible, after computerized image analysis of 2D gels, to verify that bacteria had more expressed proteins than bacteroids. In vivo bacteria showed 19 proteins induced and 230 suppressed. The increase in expression observed for bacteroids macromolecules was at least two times greater than normalized volume for 17 proteins of the bacteria and two times smaller than 26 bacteria proteins. It was also observed, through Maldi-QToF and ESI-QToF techniques applied to protein identification, that bacteria and bacteroid main metabolic activities were maintained. This fact confirms that the techniques were complementary. The data showed that bacteria cultivated in YML medium had a metabolism direct to cellular synthesis, characterized by production of macromolecules and energetic metabolism. Endosimbiont bacteroids isolated from soyabean nodules showed a metabolism specially dedicated to nitrogen fixation. The results were in agreement with the ambient that each microorganism was originated. The fact that the identified proteins in bacteria were related to translation and aminoacids biosynthesis shows the need that heterotrophic microorganisms have to synthesize its own proteins and enzymes useful for their metabolism. On other hand, since the bacteroids are symbiotically associated with soybean reducing atmospheric nitrogen in an extremely energy-intense process, it is expected that its proteins should be mainly related to biological nitrogen fixation and energetic metabolism.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-06-05T17:08:36Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 384107 bytes, checksum: f7efd9f5b0c82417e3f4a40af943b9d6 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-05T17:08:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 384107 bytes, checksum: f7efd9f5b0c82417e3f4a40af943b9d6 (MD5) Previous issue date: 2004-02-25 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O plantio, no Brasil, da soja geneticamente modificada, resistente ao glyphosate, permite a utilização desse herbicida também em pós-emergência nessa cultura. Em regiões dos Estados Unidos, aonde esta prática já vem sendo realizada, foi relatado o efeito tóxico do glyphosate a microrganismos, dentre eles o rizóbio, microssimbionte da soja. Decorrente disso, o presente trabalho teve como objetivo avaliar o efeito in vitro do glyphosate sobre estirpes de Bradyrhizobium, recomendadas, nacionalmente, para inoculação em sementes de soja. Foram realizados quatro experimentos em laboratório com as estirpes de Bradyrhizobium elkanii: SEMIA 587 e SEMIA 5019, e Bradyrhizobium japonicum: SEMIA 5079 e SEMIA 5080. No primeiro experimento avaliou-se o efeito de concentrações crescentes do glyphosate, variando de 0,0 a 43,2 μg L-1. No segundo experimento, as estirpes foram submetidas ao glyphosate puro ou em mistura ao herbicida carfentrazone-ethyl e, também, aos herbicidas fomesafen e imazethapyr. As concentrações dos herbicidas foram: 12,9; 3,6; 1,4; e 1,8 μg L-1, respectivamente, de glyphosate-K, fomesafen, imazethapyr e carfentrazone-ethyl. No terceiro experimento, testaram-se as principais formulações comerciais de glyphosate e, por fim, avaliou-se o crescimento das estirpes sob ação do glyphosate em meio de cultura enriquecido de aminoácidos aromáticos. Com base nos resultados, verificou-se que o glyphosate reduziu o crescimento das estirpes de Bradyrhizobium em todas as concentrações testadas, sendo esta redução tanto maior, quanto maior a concentração do herbicida no meio de cultura. As estirpes de Bradyrhizobium apresentaram sensibilidade diferencial às menores concentrações do glyphosate, sendo SEMIA 587, a mais sensível. Contudo, na maior concentração do glyphosate todas as estirpes tiveram seu crescimento reduzido, em média, 60%. Na comparação entre os herbicidas, observou-se que carfentrazone-ethyl, além de ter proporcionado menor inibição no crescimento de todas as estirpes, reduziu a toxicidade do glyphosate quando em mistura. Os herbicidas que se mostraram mais tóxicos foram fomesafen e imazethapyr. Dentre as marcas comerciais testadas, foi verificado o efeito tóxico dos aditivos presentes nas mesmas, uma vez que o glyphosate puro apresentou toxidez menor, comparado aos produtos formulados. A formulação Zapp Qi® apresentou a menor toxidez e Roundup Transorb®, a maior, causando inibição total do crescimento das estirpes. A suplementação do meio de cultura com aminoácidos aromáticos diminuiu a ação tóxica do glyphosate puro e da formulação comercial Zapp Qi®, sobre o Bradyrhizobium, entretanto, foi indiferente para Roundup Transorb®, o qual inibiu quase que totalmente o crescimento de três das quatro estirpes testadas independente do enriquecimento do meio. / In Brazil, soybean genetically modified plantation, resistant to glyphosate, will also allow this herbicide use in post emergence in that culture. In the United States areas, where this practice has already being accomplished, it was told the glyphosate toxicant effect to microorganisms, among them the soybean rhizobium microsymbiont. Due to that, this work aimed to evaluate the in vitro glyphosate effect on Bradyrhizobium strains, nationally recommended, for soybean seeds inoculation. Four experiments were accomplished in laboratory with Bradyrhizobium elkanii strains SEMIA 587 and SEMIA 5019 and Bradyrhizobium japonicum SEMIA 5079 and SEMIA 5080. In the first experiment the glyphosate growing concentrations effect was evaluated, varying from 0.0 to 43.2 μg L-1. In the second one, the strains were submitted to the pure glyphosate and in mixture to the herbicide carfentrazone-ethyl and also to the herbicides fomesafen and imazethapyr. In the third experiment, it was tested the main commercial formulations of glyphosate and, finally, the strains growth was evaluated under glyphosate action in medium enriched by aromatic amino acids. Based in these results, it was verified that the Bradyrhizobium strains growth was reduced by the glyphosate in all the tested concentrations, being so much this reduction larger, as larger is the concentration of herbicide in the medium. The Bradyrhizobium strains presented differential sensibility to the glyphosate smallest concentrations, being SEMIA 587, the most sensitive. However, in the largest glyphosate concentration, all the strains had its growth reduced, on the average, 60%. Comparison the herbicides, it was observed that carfentrazone-ethyl, besides having provided smaller inhibition in all strains growth, reduced the glyphosate toxicity when in mixture. The treatments with fomesafen and imazethapyr were the ones that showed more toxins. Among the tested commercial marks, toxicant effect of its addictive was verified in them, once the pure glyphosate presented smaller toxicity, compared to the formulated products. The formulation Zapp Qi ® presented the smallest toxicity and Roundup Transorb ®, the largest, causing total inhibition of strains growth. The supplementation of the medium with aromatic amino acids decreased the toxicant action of the pure glyphosate and of the commercial formulation Zapp Qi®, on Bradyrhizobium, however, it was indifferent for Roundup Transorb ®, which totally inhibited the growth of three of the four tested strains, not depending of the enrichment medium.

Este trabalho teve como objetivo principal realizar um estudo proteômico diferencial aplicado à amostra Bradyrizobium elkanii (SEMIA 587). Isso se fez através da identificação de proteínas diferencialmente expressas nesta importante bactéria fixadora de nitrogênio quando cultivada em laboratório (in vitro) e quando inoculada em plantas de soja (in vivo). A caracterização das proteínas foi feita com a poderosa técnica de espectrometria de massas, e a análise proteômica com expressão diferencial foi comparada por meio de duas estratégias diferentes: MudPIT e Maldi-QToF. A avaliação das imagens dos géis bidimensionais permitiu verificar que a amostra de bactéria apresentou um número maior de proteínas expressas em relação ao bacterióide. Se comparada ao microrganismo na condição in vitro (bactéria), a espécie fixadora de nitrogênio (bacterióide) apresentou 19 proteínas induzidas e 230 reprimidas. O aumento de expressão observado para as proteínas do bacterióide foi pelo menos duas vezes maior do que o volume normalizado para 17 proteínas e, caiu pela metade (ou mais), para outras 26 proteinas em relação a bactéria. Através de ambas as técnicas (Maldi-QToF e ESI-QToF) empregadas na identificação das proteínas observou-se, comprovando a complementariedade existente entre as metodologias, que os padrões metabólicos tanto em bactéria como bacterióide foram mantidos. Ou seja, bactérias cultivadas em meio YML apresentaram um metabolismo voltado para a síntese celular, denotada pela produção de macromoléculas e metabolismo energético, ao passo que bacterióides, endosimbiontes isolados de nódulos de plantas de soja, apresentaram um metabolismo especialmente dedicado à fixação simbiótica do nitrogênio. / The main goal of this project was to perform a differential proteomic analysis of Bradyrizobium elkanii (SEMIA 587). It was made by the identification of differentially expressed proteins in this important nitrogen fixing bacteria grown under different conditions: in laboratory culture (in vitro) and symbiotically associated with soybean plants (in vivo). The characterization of proteins differentially expressed was done by the powerful technique of mass spectrometry, applying two different strategies: MudPIT and Maldi-QToF. It was possible, after computerized image analysis of 2D gels, to verify that bacteria had more expressed proteins than bacteroids. In vivo bacteria showed 19 proteins induced and 230 suppressed. The increase in expression observed for bacteroids macromolecules was at least two times greater than normalized volume for 17 proteins of the bacteria and two times smaller than 26 bacteria proteins. It was also observed, through Maldi-QToF and ESI-QToF techniques applied to protein identification, that bacteria and bacteroid main metabolic activities were maintained. This fact confirms that the techniques were complementary. The data showed that bacteria cultivated in YML medium had a metabolism direct to cellular synthesis, characterized by production of macromolecules and energetic metabolism. Endosimbiont bacteroids isolated from soyabean nodules showed a metabolism specially dedicated to nitrogen fixation. The results were in agreement with the ambient that each microorganism was originated. The fact that the identified proteins in bacteria were related to translation and aminoacids biosynthesis shows the need that heterotrophic microorganisms have to synthesize its own proteins and enzymes useful for their metabolism. On other hand, since the bacteroids are symbiotically associated with soybean reducing atmospheric nitrogen in an extremely energy-intense process, it is expected that its proteins should be mainly related to biological nitrogen fixation and energetic metabolism.

Submitted by RUTH HELENA GIANSANTE null (ruthhgster@gmail.com) on 2018-04-03T13:04:19Z No. of bitstreams: 1 RUTH_GIANSANTE_DISS_versão final (20DEZ2017) (5)6.pdf: 858614 bytes, checksum: 2838c4b704bfcc265b052ef9b29dcb67 (MD5) / Approved for entry into archive by Alexandra Maria Donadon Lusser Segali null (alexmar@fcav.unesp.br) on 2018-04-03T18:23:48Z (GMT) No. of bitstreams: 1 giansante_rh_me_jabo.pdf: 858614 bytes, checksum: 2838c4b704bfcc265b052ef9b29dcb67 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-03T18:23:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 giansante_rh_me_jabo.pdf: 858614 bytes, checksum: 2838c4b704bfcc265b052ef9b29dcb67 (MD5) Previous issue date: 2017-11-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Rizobactérias são excelentes candidatas à aplicação em processos de bioacumulação de elementos potencialmente tóxicos, pois desenvolveram mecanismos para a incorporação intracelular de uma ampla gama de íons. A sensibilidade e a capacidade de remoção de cádmio (Cd2+) de duas espécies de rizobactérias: Rizobium tropici (LBMP-C01) e Ensifer meliloti (LBMPC02), foram estudadas. A concentração mínima inibitória (CMI) das bactérias foi determinada pelo cultivo em meio contendo CdCl2.2H2O (0,025 a 4 mmol L-1). Foram realizados testes de viabilidade das células das duas estirpes na CMI e ensaios de bioacumulação com suspensões de células bacterianas nas doses de 10, 20 e 30 %(v/v) em solução contendo 100 mg L-1 de Cd2+. As estirpes LBMP-C01 e LBMP-C02 foram sensíveis a concentrações de Cd2+ superiores a 1,0 e 0,05 mmol L-1, respectivamente. As células de LBMP-C01 e LBMP-C02 apresentaram-se viáveis nas CMI 1,0 e 0,05 mmol L-1 Cd2+, respectivamente. A estirpe LBMP-C01 não removeu Cd2+ nos ensaios de bioacumulação e a estirpe LBMP-C02 foi capaz de remover 80 % deste íon em solução contendo 100 mg L-1 Cd2+, após 72 h de contato e 30 %(v/v) do bioacumulador. Os espectros de absorção molecular na região do infravermelho, de ambas as espécies estudadas praticamente não indicaram diferenças nos grupos funcionais presentes nas moléculas da biomassa celular. A observação por microscopia eletrônica de transmissão mostrou a presença de maior número de grânulos eletrodensos no citoplasma da estirpe de LBMP-C02 em relação à LBMP-C01 quando estas foram cultivadas com Cd2+. A estirpe LBMP-C02 foi a mais eficiente na remoção de Cd2+. A resistência a metais dessas duas bactérias envolve mecanismos diferentes. / Rhizobacteria are excellent candidates for use in the processes of bioaccumulation of potentially toxic elements because they have developed mechanisms for the intracellular uptake of a wide range of ions. Here, the sensitivity and capacity to remove cadmium (Cd2+) of two species of rhizobacteria, Rhizobium tropici (LBMP-C01) and Ensifer meliloti (LBMP-C02), were studied. The minimum inhibitory concentration (MIC) of the bacteria was determined by culturing them in medium containing CdCl2·2H2O (0.025 to 4 mmol L-1 ). Cell viability tests of the two strains were performed at MIC, and bioaccumulation assays were performed with 10, 20, and 30 %(v/v) bacterial cell suspensions in a Cd2+ solution 100 mg L-1 . Strains LBMP-C01 and LBMP-C02 were sensitive to Cd2+ concentrations above 1.0 and 0.05 mmol L-1 , respectively. LBMP-C01 and LBMP-C02 cells were viable at the MICs of Cd2+ solution 1.0 and 0.05 mmol L-1 , respectively. LBMP-C01 did not remove Cd2+ in the bioaccumulation assays, whereas LBMP-C02 removed 80 % of this ion in Cd2+ solution 100 mg L-1 , after 72 h of contact and 30 %(v/v) of the bioaccumulator. The infrared absorption spectra of both species did not indicate differences in the functional groups present in the molecules of the cell biomass. Transmission electron microscopy showed the presence of a larger number of electron-dense granules in the cytoplasm of LBMP-C02 compared to LBMP-C01 when they were cultured with Cd2+. The LBMP-C02 strain was the most efficient in the Cd2+ removal. The metal resistance of these two bacteria involves different mechanisms.

Submitted by Claudia Rocha (claudia.rocha@udesc.br) on 2018-03-07T12:57:02Z No. of bitstreams: 1 PGCS14MA146.pdf: 911298 bytes, checksum: 15d2a151b2d75b3012172eac62b96c08 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-07T12:57:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGCS14MA146.pdf: 911298 bytes, checksum: 15d2a151b2d75b3012172eac62b96c08 (MD5) Previous issue date: 2014-08-29 / The present study aimed to evaluate the influence and residual effect of using the dregs, the residue of pulp industry and dolomitic limestone on nodulation, nitrogen accumulation and dry matter of shoot for beans. The study was conducted in a greenhouse in CAV / UDESC campus in Lages SC, using alítico Haplumbrept, taken from an area where in 2004 were applied superficially in an experimental design in randomized blocks, four replications of dimensions 8 m x 8 m . Two separate experiments, one experiment appointed without any fertilization and the second experiment, where there was a fertilizer of potassium chloride (KCl) and triple superphosphate (STF) were implanted. The soil was collected from 0-20 cm in treatments with lime at a dose of 10.5 mg ha-1 (a full dose of corrective recommended by SMP), dregs at a dose of 13 mg ha-1 (a full dose corrective recommended by SMP) and the control treatment without application of corrective. In addition to these treatments were tested two levels of inoculation factor, namely rhizobia inoculation and treatment without inoculation. The experiments were conducted in a 3 x 2 factorial (three levels of correction factor and two levels of soil inoculation), with 4 replicates, for a total of 6 treatments and 24 sampling units in a completely randomized design. The plants were harvested 40 days after emergence and variable dry matter of shoot (DMS), total nitrogen accumulated per plant (Total N), number of nodules per plant (NNP) and dry weight of nodules per plant (DWNP). Data were subjected to analysis of variance, and when significant, were compared by Tukey test at 5% probability. The use of rhizobia did not result in accumulation of nitrogen in the shoot. The application of corrective as dregs of soil acidity had a beneficial residual effect on dry weight of shoots of bean / O presente estudo visou avaliar a influência e efeito residual do uso do dregs, resíduo da indústria de celulose e do calcário dolomítico, sobre a nodulação, acúmulo de nitrogênio e massa seca da parte aérea em feijoeiro. O estudo foi conduzido em casa de vegetação no campus CAV/UDESC em Lages SC, utilizando Cambissolo Húmico alítico, retirado de uma área onde em 2004 foram aplicados superficialmente em um delineamento experimental em blocos ao acaso, quatro repetições e parcelas de dimensões 8 m x 8 m. Foram implantados dois experimentos distintos, nomeados experimento 1, sem qualquer tipo de adubação e o experimento 2, onde houve a adubação de cloreto de potássio (KCl) e superfosfato triplo (STF). O solo foi coletado da camada 0-20 cm nos tratamentos que receberam calcário na dose de 10,5 mg ha-1 (uma dose completa de corretivo recomendada pelo índice SMP), dregs na dose de 13 mg ha-1 (uma dose completa de corretivo recomendada pelo índice SMP) e o tratamento testemunha sem aplicação de corretivo. Adicionalmente a estes tratamentos testaram-se dois níveis do fator inoculação, a saber, inoculação com rizóbio e a testemunha sem inoculação. Os experimentos foram instalados em um fatorial 3 x 2 (três níveis do fator correção de solo e dois níveis de inoculação), com 4 repetições, perfazendo um total de 6 tratamentos e 24 unidades amostrais, em delineamento experimental inteiramente casualizado. As plantas foram coletadas 40 dias após a emergência e foram avaliadas as variáveis matéria seca de parte aérea (MSPA), nitrogênio total acumulado por planta (NTotal), número de nódulos por planta (NNP) e massa seca de nódulos por planta (MSNP). Os dados foram submetidos à análise de variância, e quando significativos, foram comparados pelo Teste de Tukey ao nível de 5% de probabilidade. O uso do rizóbio não resultou em acúmulo de nitrogênio na parte aérea. A aplicação do dregs como corretivo da acidez do solo apresentou efeito residual benéfico na massa seca da parte aérea do feijoeiro

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-05-22T13:26:07Z No. of bitstreams: 1 Antunes Romeu Lima do Nascimento.pdf: 1176079 bytes, checksum: 3965be55696a10d228bab8c7064bc386 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-22T13:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Antunes Romeu Lima do Nascimento.pdf: 1176079 bytes, checksum: 3965be55696a10d228bab8c7064bc386 (MD5) Previous issue date: 2014-02-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The lima bean is a legume producer of edible grains with high protein value, cultivated worldwide, having in Brazil, the Northeast region as the main producer. In this region, the production is made with low use of technology, resulting in low yields. Among the technologies used to increase the production of legume, we can highlight the inoculation of seed with diazotrophic bacterias, with the objective of replace or reduce nitrogen fertilization. The aim of this study was to evaluate the diversity of rhizobia in symbiosis with the lima bean adapted to semiarid conditions. To obtain the isolated was used 02 accessions of lima bean (one of indeterminate growth and other of determinate growth) and 12 composite samples of soil from different mesoregions the states of Paraíba and Pernambuco. Plants were cultived in a protected area with transparent canvas, in design completely randomized in factorial of 12 (soil) x two (accessions) in Leonard pots adapted with plastic bottle containing 1.3 L of sand and 100 mL soil, with three replicates, for 55 days. The variables analyzed were: number of nodules (NN), fresh mass of nodules (MFN), specifies biomass of nodules (BEN), dry mass of the part aerial (MSPA) and dry mass of root (MSR). Data were analyzed using the F test and the means compared by the Scott- Knott test. Of the collected nodules were isolated bacteria and determined their morphological and physiological characteristics in culture medium, in the laboratory of Soil Microbiology of UFRPE (Recife-PE). With the characteristics of the isolates was calculated the coefficient J and was performed the grouping of the bacteria. The soil of Alagoa Grande-PB showed the highest values for NN and MFN, however when analyzing the specific biomass of nodules no detectable differences. For MSR obtained only difference between accessions. And for MSPA differences were observed for both factors, emphasizing the soil of Alagoa Grande-PB, and two soils of native vegetation, Areia-PB and Garanhuns-PE, these being a possible source of efficient strains. The grouping of the bacteria showed that accession of growth determined formed 13 groups, while the other accession, 24. And analyzing all bacteria in one dendrogram were formed groups with bacteria of each separate accession and also united. Accessions differ in groups of rhizobia able to form symbiosis. / O feijão-fava é uma leguminosa produtora de grãos comestíveis com alto valor protéico, cultivada mundialmente, tendo no Brasil, a região Nordeste como principal produtora. Nessa região, a produção é feita com baixa utilização de tecnologia, o que resulta em baixos rendimentos. Entre as tecnologias utilizadas para aumentar a produção de leguminosas, pode-se destacar a inoculação das sementes com bactérias diazotróficas, com o objetivo de substituir ou reduzir a adubação nitrogenada. O objetivo do presente estudo foi avaliar a diversidade de rizóbios em simbiose com o feijão-fava adaptados às condições do Semiárido. Para a obtenção dos isolados foram utilizados dois acessos de feijão-fava (um de crescimento indeterminado e outro de crescimento determinado) e 12 amostras compostas de solo de diferentes mesorregiões dos estados da Paraíba e Pernambuco. As plantas foram cultivadas em uma área protegida com lona transparente, em delineamento experimental inteiramente casualizado em esquema fatorial de 12 (solos) x dois (acessos) em vasos de Leonard adaptados com garrafas PET contendo 1,3 L de areia e 100 mL de solo, com três repetições, por 55 dias. As variáveis analisadas foram: número de nódulos (NN), massa fresca de nódulos (MFN), biomassa especifica dos nódulos (BEN), massa seca da parte aérea (MSPA) e da raiz (MSR). Os dados foram submetidos ao teste F e as médias comparadas pelo teste de Scott-Knott. Dos nódulos coletados foram isoladas bactérias e determinadas suas características morfofisiológicas em meio de cultura, no laboratório de Microbiologia do Solo da UFRPE (Recife-PE). Com as características dos isolados calculou-se o coeficiente J e realizou o agrupamento das bactérias. O solo de Alagoa Grande-PB foi o que apresentou os maiores valores de NN e MFN, entretanto quando analisada a biomassa especifica dos nódulos não se evidenciou diferenças. Para MSR obteve-se diferença apenas entre os acessos. Para MSPA foram observadas diferenças para ambos os fatores, destacando-se o solo de Alagoa Grande-PB, e dois solos de vegetação nativa, Areia-PB e Garanhuns-PE, sendo estes uma possível fonte de estirpes eficientes. O agrupamento das bactérias revelou que o acesso de crescimento determinado formou 13 grupos, enquanto o outro acesso, 24. Analisando-se todas as bactérias em um único dendrograma observou-se a formação de grupos com as bactérias de cada acesso separados e também unidos. Os acessos diferem quanto aos grupos de rizóbios capazes de formar simbiose.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-07-11T14:02:37Z No. of bitstreams: 1 Vinicius Santos Gomes da Silva.pdf: 2230881 bytes, checksum: 58a0650e29afb4164aaa3c0006c00025 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-11T14:02:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Vinicius Santos Gomes da Silva.pdf: 2230881 bytes, checksum: 58a0650e29afb4164aaa3c0006c00025 (MD5) Previous issue date: 2017-08-08 / The inoculation of tree legumes with nitrogen fixing bacteria can contribute to increase as N2 fixed amounts, being a practice of importance for input of nitrogen in places where entry of technology is reduced, such as those verified in the Brazilian Semiarid region. In addition to this, the use of efficient and competitive native rhizobia represents an important strategy for lands reclamation of the Caatinga biome. The aim of this study was to isolate, characterize, evaluate a diversity and select efficient and competitive native rhizobia to the Brazilian Semiarid region. For this, were carried out expeditions in Brazilian Semiarid region for collect soil samples (Luvisol and Ultisol) under different land use systems: native vegetation (caatinga) and areas with different agricultural systems (such as monoculture and consortium and several species). The soil samples were used for cultivation of tree two legumes in pots. Sabia (Mimosa caesalpiniifolia Benth.) and leucena (Leucaena leucocephala (Lam.) de Wit), were used as trap–plant to obtain nodules and served to evaluate the ability of native rhizobia to promote growth and natural nodulation. Was verified the existence of populations of bacteria naturally established with ability to nodulate the tree legumes in all land use systems evaluated. Verified a greater nodulation in the plants cultivated in the Ultisol. From nodules obtained, were isolated in YMA medium, 213 bacteria of leucena and 160 of sabia. All isolates were evaluated by ability to nitrogen fixation and form nodules, through the symbiotic genes fragments amplification (nifH and nodC). Were selected the isolates which amplified the symbiotic genes (104 isolates of sabiá and 144 of leucena), in the sequence were characterized phenotypically. Based on characteristics, the isolates were grouped and evaluated by diversity. Was verified that land use systems did not influence diversity indices. Were formed 20 groups of isolates of sabiá and 19 of leucena, representatives of the groups had the 16S rRNA gene partially sequenced to determine the taxonomic positioning. Was evidenced more promiscuity of the leucena, since it nodulated with representatives of the genus Rhizobium, Ensifer, Mesorhizobium and Burkholderia, while sabia were nodulated only by Burkholderia. The 104 isolates of sabiá and 144 of leucena were evaluated to symbiotic effectiveness in greenhouse experiments in cropping on sterile substrate, containing a mixture of sand and vermiculite. The isolates more efficient were selected and evaluated for their symbiotic effectiveness in three soils (Oxisol, Ultisol and Luvisol). The isolates 36F and 43K for leucena, 1E and 4D for sabia showed very promising for BNF. / A inoculação de leguminosas arbóreas com bactérias fixadoras de nitrogênio, pode contribuir para elevar as quantidades de N2 fixado, sendo uma prática de suma importância para aquisição de nitrogênio em locais onde o aporte de tecnologia é baixo, como os verificados no Semiárido brasileiro. Além disso, o uso de rizóbios nativos eficientes e competitivos representam uma importante estratégia para a recuperação de áreas degradadas do bioma Caatinga. Objetivou-se com este trabalho isolar, caracterizar, avaliar a diversidade e selecionar rizóbios eficientes e competitivos nativos do Semiárido brasileiro. Para isso, foram realizadas expedições no Semiárido de Pernambuco para coleta de amostras de solos (Luvissolo e Argissolo) sob diferentes sistemas de uso da terra: vegetação nativa (caatinga) e áreas com diferentes sistemas agrícolas (monocultivo e consórcio com várias espécies), as quais foram usadas para o cultivo em vaso de duas leguminosas arbóreas, sabiá (Mimosa caesalpiniifolia Benth.) e leucena (Leucaena leucocephala (Lam.) de Wit.), usadas como planta-isca para obtenção de nódulos e que serviram para avaliar a habilidade dos rizóbios nativos em promover crescimento e nodulação. Foi constatada a existência de populações de bactérias naturalmente estabelecidas com capacidade de nodular as leguminosas arbóreas nos sistemas de uso avaliados, sendo verificada uma maior nodulação nas plantas cultivadas no Argissolo. Dos nódulos obtidos, foram isoladas em meio YMA 213 bactérias de leucena e 160 de sabiá. Todos os isolados foram avaliados quanto a habilidade de fixar nitrogênio e formar nódulos por meio da amplificação de fragmentos de genes simbióticos nifH e nodC, os que apresentaram amplificação de pelo menos um gene simbiótico (104 isolados de sabiá e 144 de leucena) foram selecionados e na sequência foram caracterizados fenotipicamente, com base nas características, foram agrupados, e avaliados quanto a sua diversidade. Constatou-se que os sistemas de uso da terra não influenciaram nos índices de diversidade. Com o agrupamento por espécie, foram formados 20 grupos de isolados de sabiá e 19 de leucena. Representantes dos grupos tiveram o gene 16S do rRNA parcialmente sequenciado para determinar o posicionamento taxonômico. Ficou evidenciado maior promiscuidade da leucena, uma vez que a mesma nodulou com representantes dos gêneros Rhizobium, Ensifer, Mesorhizobium e Burkholderia, enquanto o sabiá nodulou somente com bactérias do gênero Burkholderia. Os 104 isolados de sabiá e 144 de leucena foram avaliados quanto a eficiência simbiótica em experimentos em casa de vegetação e cultivados em substrato estéril contendo uma mistura de areia e vermiculita, os mais eficientes foram selecionados e avaliados quanto a sua eficiência simbiótica em três solos (Latossolo, Argissolo e Luvissolo). Os isolados 36F e 45G para leucena e 1E e 4D de sabiá mostraram-se bem promissores quanto à FBN.