Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-07-27T13:55:50Z No. of bitstreams: 1 Rerisson Jose Cipriano dos Santos.pdf: 1866070 bytes, checksum: f49bbe45ed1fce76610e48a6777a26ef (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-27T13:55:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rerisson Jose Cipriano dos Santos.pdf: 1866070 bytes, checksum: f49bbe45ed1fce76610e48a6777a26ef (MD5) Previous issue date: 2014-02-18 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The Northeast is formed by a large proportion of semiarid region, with the Caatinga as predominant native vegetation. In this region, people survive mainly by means of economic activities mostly related to agriculture and livestock. The genus Macroptilium spp. includes 20 species from tropical and subtropical America, with seven species occurring in the Brazilian semiarid region. This study aimed to identify the occurrence of plants of the genus Macroptilium spp. present in eleven counties in the semiarid region of Pernambuco State. And also an experiment was conducted to study of Macroptillium lathyiroides rhizobium diversity in the semiarid of Pernambuco State. Descriptive analyses of the samples were used for the explanation of the rhizobium occurrence. Correlations of chi-square test and decision tree were also used. Variables that most influenced the occurrence of Macroptilium spp. accesses were rainfall and average temperature, with much accessions collected in silty sandy soils. It was observed that the municipalities of Sertânia and Parnamirim were those who had higher plants Macroptilium with plants of Bom Jardim, Caetes and Tupanatinga shown higher survival rates. For assess the diversity of rhizobium in Entisols located in the semiarid of Pernambuco State, an experiment aiming to study rhizobium diversity was carried out using random blocks, with four replications. Treatments consisted of seven “Entisols Lithicc soils” (inoculum) collected from the municipalities of Santa Cruz do Capibaribe, Tupanatinga, Jataúba, Caetés, Santa Cruz, Petrolina, and Floresta. Two additional treatments, with and without nitrogen, were used as the control, totaling nine treatments. Analysis of shoot and root, relative efficiency, dry matter accumulation, weight and number of nodules were performed. Morphological characteristics of bacterial isolates were also assessed. It was observed that the soils of the counties of Santa Cruz do Capibaribe, Tupanatinga, and Jataúba were the bacterial isolates with higher nodule weight, nodule number, and relative efficiency. It was also observed that most bacterial isolates were fast growing. / O Nordeste do Brasil tem uma grande proporção de áreas semiáridas, tendo a Caatinga como vegetação nativa predominante. Nesta região, as pessoas sobrevivem principalmente de atividades econômicas ligadas à agricultura e à pecuária. O gênero Macroptilium spp. engloba 20 espécies da América tropical e subtropical, com sete espécies que ocorrem na região Semiárida brasileira. Objetivou-se identificar a ocorrência de plantas do gênero Macroptilium spp. em onze municípios do semiárido de Pernambuco; além de verificar a diversidade Rizobiana de Macroptillium lathyroides no Semiárido no Pernambucano. Para a explicação da ocorrência foi utilizado análise descritiva dos dados das coletas, correlações, teste de quidrado e árvore de decisão. Foi observado que, para ocorrência dos acessos de Macroptilium spp. As variáveis que mais influenciaram para melhor caracterização da ocorrência foram precipitação e temperatura média com muito acesso coletados em solos Arenosos siltosos. Observou-se que os municípios de Sertânia e Parnamirim foram os que apresentaram maior ocorrência de plantas de Macroptilium tendo as plantas das cidades de Bom Jardim, Caetes e Tupanatinga apresentado maiores taxas de sobrevivência. Para avaliação da diversidade rizobiana em solos Neossolos Litólicos de municípios do Agreste e Sertão do Estado Pernambuco foi realizado um experimento de diversidade rizobiana em blocos casualizados com quatro repetições. Os tratamentos consistiram de sete solos Neossolos Litolicos (inóculos) dos municípios de Santa Cruz Capibaribe, Tupanatinga, Jataúba, Caetés, Santa Cruz, Petrolina e Floresta, mais dois tratamentos adicionais, testemunhas com e sem nitrogênio, sendo um total de nove tratamentos. Foram realizadas análises da parte aérea, raiz, eficiência relativa, acúmulo de matéria, peso e número de nódulos. Além das características morfológicas de isolados bacterianos. Foi observado que os solos dos municípios de Santa Cruz Capibaribe, Tupanatinga e Jataúba foram os isolados bacterianos com maior peso do nódulo, número de nódulos e eficiência relativa, sendo que a maioria dos isolados bacterianos foi de crescimento rápido.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-07-11T14:02:37Z No. of bitstreams: 1 Vinicius Santos Gomes da Silva.pdf: 2230881 bytes, checksum: 58a0650e29afb4164aaa3c0006c00025 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-11T14:02:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Vinicius Santos Gomes da Silva.pdf: 2230881 bytes, checksum: 58a0650e29afb4164aaa3c0006c00025 (MD5) Previous issue date: 2017-08-08 / The inoculation of tree legumes with nitrogen fixing bacteria can contribute to increase as N2 fixed amounts, being a practice of importance for input of nitrogen in places where entry of technology is reduced, such as those verified in the Brazilian Semiarid region. In addition to this, the use of efficient and competitive native rhizobia represents an important strategy for lands reclamation of the Caatinga biome. The aim of this study was to isolate, characterize, evaluate a diversity and select efficient and competitive native rhizobia to the Brazilian Semiarid region. For this, were carried out expeditions in Brazilian Semiarid region for collect soil samples (Luvisol and Ultisol) under different land use systems: native vegetation (caatinga) and areas with different agricultural systems (such as monoculture and consortium and several species). The soil samples were used for cultivation of tree two legumes in pots. Sabia (Mimosa caesalpiniifolia Benth.) and leucena (Leucaena leucocephala (Lam.) de Wit), were used as trap–plant to obtain nodules and served to evaluate the ability of native rhizobia to promote growth and natural nodulation. Was verified the existence of populations of bacteria naturally established with ability to nodulate the tree legumes in all land use systems evaluated. Verified a greater nodulation in the plants cultivated in the Ultisol. From nodules obtained, were isolated in YMA medium, 213 bacteria of leucena and 160 of sabia. All isolates were evaluated by ability to nitrogen fixation and form nodules, through the symbiotic genes fragments amplification (nifH and nodC). Were selected the isolates which amplified the symbiotic genes (104 isolates of sabiá and 144 of leucena), in the sequence were characterized phenotypically. Based on characteristics, the isolates were grouped and evaluated by diversity. Was verified that land use systems did not influence diversity indices. Were formed 20 groups of isolates of sabiá and 19 of leucena, representatives of the groups had the 16S rRNA gene partially sequenced to determine the taxonomic positioning. Was evidenced more promiscuity of the leucena, since it nodulated with representatives of the genus Rhizobium, Ensifer, Mesorhizobium and Burkholderia, while sabia were nodulated only by Burkholderia. The 104 isolates of sabiá and 144 of leucena were evaluated to symbiotic effectiveness in greenhouse experiments in cropping on sterile substrate, containing a mixture of sand and vermiculite. The isolates more efficient were selected and evaluated for their symbiotic effectiveness in three soils (Oxisol, Ultisol and Luvisol). The isolates 36F and 43K for leucena, 1E and 4D for sabia showed very promising for BNF. / A inoculação de leguminosas arbóreas com bactérias fixadoras de nitrogênio, pode contribuir para elevar as quantidades de N2 fixado, sendo uma prática de suma importância para aquisição de nitrogênio em locais onde o aporte de tecnologia é baixo, como os verificados no Semiárido brasileiro. Além disso, o uso de rizóbios nativos eficientes e competitivos representam uma importante estratégia para a recuperação de áreas degradadas do bioma Caatinga. Objetivou-se com este trabalho isolar, caracterizar, avaliar a diversidade e selecionar rizóbios eficientes e competitivos nativos do Semiárido brasileiro. Para isso, foram realizadas expedições no Semiárido de Pernambuco para coleta de amostras de solos (Luvissolo e Argissolo) sob diferentes sistemas de uso da terra: vegetação nativa (caatinga) e áreas com diferentes sistemas agrícolas (monocultivo e consórcio com várias espécies), as quais foram usadas para o cultivo em vaso de duas leguminosas arbóreas, sabiá (Mimosa caesalpiniifolia Benth.) e leucena (Leucaena leucocephala (Lam.) de Wit.), usadas como planta-isca para obtenção de nódulos e que serviram para avaliar a habilidade dos rizóbios nativos em promover crescimento e nodulação. Foi constatada a existência de populações de bactérias naturalmente estabelecidas com capacidade de nodular as leguminosas arbóreas nos sistemas de uso avaliados, sendo verificada uma maior nodulação nas plantas cultivadas no Argissolo. Dos nódulos obtidos, foram isoladas em meio YMA 213 bactérias de leucena e 160 de sabiá. Todos os isolados foram avaliados quanto a habilidade de fixar nitrogênio e formar nódulos por meio da amplificação de fragmentos de genes simbióticos nifH e nodC, os que apresentaram amplificação de pelo menos um gene simbiótico (104 isolados de sabiá e 144 de leucena) foram selecionados e na sequência foram caracterizados fenotipicamente, com base nas características, foram agrupados, e avaliados quanto a sua diversidade. Constatou-se que os sistemas de uso da terra não influenciaram nos índices de diversidade. Com o agrupamento por espécie, foram formados 20 grupos de isolados de sabiá e 19 de leucena. Representantes dos grupos tiveram o gene 16S do rRNA parcialmente sequenciado para determinar o posicionamento taxonômico. Ficou evidenciado maior promiscuidade da leucena, uma vez que a mesma nodulou com representantes dos gêneros Rhizobium, Ensifer, Mesorhizobium e Burkholderia, enquanto o sabiá nodulou somente com bactérias do gênero Burkholderia. Os 104 isolados de sabiá e 144 de leucena foram avaliados quanto a eficiência simbiótica em experimentos em casa de vegetação e cultivados em substrato estéril contendo uma mistura de areia e vermiculita, os mais eficientes foram selecionados e avaliados quanto a sua eficiência simbiótica em três solos (Latossolo, Argissolo e Luvissolo). Os isolados 36F e 45G para leucena e 1E e 4D de sabiá mostraram-se bem promissores quanto à FBN.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2016-07-05T14:16:15Z No. of bitstreams: 1 Altanys Silva Calheiros.pdf: 1294352 bytes, checksum: b00286aab295bb03c3b8fce7507f2eaf (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-05T14:16:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Altanys Silva Calheiros.pdf: 1294352 bytes, checksum: b00286aab295bb03c3b8fce7507f2eaf (MD5) Previous issue date: 2012-07-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Biological nitrogen fixation by the legume-rhizobia symbiosis is one of the most important mechanisms of nitrogen supply to plants, and depends on the symbiotic efficiency of the rhizobial strain. We now know that legumes associate with 98 species from 18 different genera of rhizobia and native rhizobia biodiversity is fundamental for the selection of new, more efficient strains for biological nitrogen fixation. To this end, the present work aims to evaluate the effect of different vegetation covers in a single soil on diversity and symbiotic efficiency of calopo rhizobial isolates. Soil samples were collected at the 0-0,2 m deep layer, in areas with Brachiaria decumbens pastures, “sabiá” (Mimosa caesalpiniifolia) woodlots and Atlantic forest, with three separate areas for each cover, all in the same soil. Calopo plantlets were pre-germinated in Petri dishes with paper towel for three days, transplanted to Leonard jars, inoculated with 10 g of soil and harvested after 50 days. Four to five nodules were sampled per plant, used to rhizobial isolation in YMA media and later morphologically characterized. 1575 isolates were obtained, which were distributed in 398 groups. Authentication was conducted for a single isolate from each group, in randomized blocks with two replicates, in bags with 0.5 kg of sand:vermiculte (1:1) autoclaved mixture, and received Hoagland solution without N daily. Inoculation was done with 1 mL per plant of a bacterial broth with population estimated in 108 cells.mL-1. Plants were harvested 45 days after inoculation and separated in shoot, root and nodules, dried in oven until constant mass and weighted. The symbiotic efficiency test was conducted in randomized blocks, with four replicates, in polyethylene bags with 1.5 kg of the sand:vermiculite 1:1 autoclaved mixture. Treatments were 122 isolates selected after authentication, based on shoot dry mass, five uninoculated controls with 0, 50, 100, 150 and 200 kg.ha-1 of N, and a control inoculated with SEMIA 6152, recommended for the culture. The experiment was conducted as the earlier phase. Shoot dry matter was ground and nitrogen content was measured. 25 isolates were considered efficient and selected for the next phase. An experiment was conducted in randomized blocks, with four replicates, in polyethylene bags with 2.5 kg of soil. Treatments were the 25 selected isolates, five uninoculated treatments with 0, 30, 60, 90 and 120 kg.ha-1 of N, and a treatment inoculated with the SEMIA 6152 strain. Inoculations was done as per the authentication phase. The first cut was 45 days after inoculation, with the remaining cuts 45 days after the previous one. Shoot dry matter was ground and N contents were determined for the first cut. Data was submitted to analysis of variance, and the Scott-Knott means comparison test, and variables were correlated. Over 98% of the isolates have fast growth in culture media, although the recommended strain is B radyrhizobium japonicum¸ considered to have slow growth. After grouping, 163, 257 and 77 groups were found for the pasture, sabiá woodlots and Atlantic Forest areas, respectively, showing high diversity amongst the isolates. Vegetation cover did not affect rhizobial diversity. Mean shoot dry matter for the plants inoculated with the most efficient strains did not differ from the treatment receiving 150 kg. ha-1 of N. Shoot dry matter correlated positively with all evaluated variables. The highest proportion of efficient isolates was from sabiá woodlots, indicating that symbiotic efficiency may be affected by vegetation cover. There was high variability in nodule dry mass, as well as in N content and accumulation, indicating large differences in symbiotic capability among the isolates. Shoot dry matter was affected by N supply in both cuts. There was an increase in shoot dry matter in the second cut for all treatments, when compared to the first cut. There was no significant effect of vegetation cover in the evaluated variables for both cuts. Higher responses to the isolates were found in the second cut, and some isolates allowed shoot dry matter similar to those of the highest N fertilization treatments. / A fixação biológica do nitrogênio é um dos mais importantes mecanismos de disponibilização de nitrogênio para as plantas e sabe-se que as leguminosas se associam com 98 espécies de 18 gêneros diferentes e estudos de diversidade de rizóbios nativos do solo são primordiais para a seleção de novas estirpes mais eficientes na fixação biológica do nitrogênio. Objetivou-se avaliar o efeito de diferentes coberturas vegetais em um mesmo solo na diversidade e eficiência simbiótica de isolados rizobianos de calopogônio. As amostras de solo foram coletadas na camada de 0 - 0,2 m de profundidade em áreas de pastagens de capim Brachiaria decumbens, bosques de sabiá (Mimosa caesalpiniifolia), e em áreas de Mata Atlântica, com três áreas diferentes sob cada cobertura. Plântulas de calopogônio foram pré-germinadas em placas de Petri com papel toalha por três dias e transplantadas para copos descartáveis de prolipropilento de 300 mL, sendo inoculadas com 10,0 g de solo e colhidas aos 50 dias. Foram amostrados quatro a cinco nódulos por planta, usados para isolamento em meio YMA e, posteriormente, realizou-se a caracterização morfológica. A autenticação dos isolados foi realizada em blocos casualizados com duas repetições, com apenas um isolado aleatoriamente escolhido de cada grupo em experimento contendo 0,5 kg da mistura areia:vermiculita autoclavada (1:1), recebendo diariamente solução nutritiva de Hoagland sem N e inoculadas com um mL por planta de caldo bacteriano com população estimada de 108 células rizobianas mL-1. Aos 45 dias após a inoculação, as plantas foram colhidas e separadas em parte aérea, raízes e nódulos, que foram secos em estufa até massa constante e em seguida foram pesados. O teste de eficiência simbiótica foi montado em blocos casualizados, com quatro repetições, em sacos de polietileno contendo 1,5 kg da mistura areia:vermiculita autoclavada (1:1). Os tratamentos foram compostos por 122 isolados selecionados em fase anterior, utilizando-se como critério a biomassa seca da parte aérea, cinco tratamentos controles (0; 50; 100; 150 e 200 kg ha-1 de N), além de um tratamento inoculado com a estirpe SEMIA 6152. O experimento foi conduzido da mesma forma que o da fase anterior. A matéria seca da parte aérea das plantas, após secagem, foi moída, sendo quantificados os teores de nitrogênio. Foram obtidos 1.575 isolados, dos quais 544 de solo com pastagem de Brachiaria decumbens, 666 de bosques de sabiá e 365 isolados de Mata Atlântica. Dos isolados obtidos, 98,5% apresentaram crescimento rápido em meio de cultura apesar da estirpe atualmente recopmendada para a cultura ser Bradyrhizobium japonicum, considerada de crescimento lento. Após agrupamento foram formados 163, 257 e 77 grupos para os isolados de áreas de pastagem, bosque de sabiá e Mata Atlântica, respectivamente, o que demonstra uma elevada diversidade entre os isolados. As coberturas vegetais influenciaram a diversidade rizobiana obtida no presente estudo. Houve diferença significativa entre os tratamentos para todas as variáveis analisadas. A produção média das plantas inoculadas com os isolados com melhor desempenho não diferiu estatisticamente do tratamento adubado com a dose equivalente a 150 kg ha-1 de N na forma de nitrato de amônio. A matéria seca da parte aérea das plantas se correlacionou positivamente com todas as variáveis analisadas, exceto com a matéria seca do sistema radicular. A maior proporção de isolados eficientes foi obtida com os isolados provenientes de bosques de sabiá, mostrando que a diferença na eficiência simbiótica desses isolados pode ser explicada pela cobertura vegetal. Houve grande variação nos valores de matéria seca de nódulos, bem como na concentração e acúmulo de nitrogênio na parte aérea das plantas, evidenciando uma grande diferença na capacidade simbiótica entre os isolados. Verificou-se aumento no acúmulo de matéria seca da parte aérea para a maioria dos tratamentos no segundo corte. No entanto esse comportamento foi menos expressivo no terceiro corte.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-07-04T15:15:17Z No. of bitstreams: 1 Adriana Bezerra dos Santos.pdf: 1516698 bytes, checksum: f7e4e555a81df4c8b56334a3925f34c3 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-04T15:15:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Adriana Bezerra dos Santos.pdf: 1516698 bytes, checksum: f7e4e555a81df4c8b56334a3925f34c3 (MD5) Previous issue date: 2017-08-07 / The presence of legumes can influence the diversity and size of the native rhizobial community of the soil. In this context, the objective of this study was to evaluate the effect of the legume and its distance in relation to the rhizobia diversity, in pasture soil of Brachiaria decumbens Stapf. Under silvopastoral system. The soil was collected in an Itambé-PE experiment, with 3 treatments, consisting of 1 ha each, being: Gliricidia + braquiária, Sabiá + braquiária and, in monoculture, with 3 replicates. In the intercropped plots, sampling was done by dividing the same in transects in the direction of the longest length, along which points were scored to obtain the composite sample of soil between the double row of the legume (0 m), and from that plot Point, every four meters (4m, 8m), the latter coinciding in the center of the brachiaria. Already in the parcels with brachiaria in monoculture, the collection was carried out in three random points. The number of soil rhizobia was estimated using the most probable number method in plants, with three replications, in the greenhouse and using the cowpea (Vigna unguiculata (L.) Walp) as bait plant. Germinated seeds were inoculated with 1.0 ml of soil samples after serial dilution (10 -1 to 10 -8) and collected at 35 days. Twenty nodules per treatment were used for isolation and phenotypic characterization. Grouping with groups of 100% similarity was carried out. Random representatives were selected to evaluate the symbiotic capacity together with strains recommended for cowpea, with nitrogen and absolute control. The dry mass of dry nodules (MSN), number of nodules (NN), and relative efficiency (ER) were analyzed. For the sequencing, the amplified DNA of the isolates that showed relative efficiency, similar to or greater than the reference control, was used. Rhizobian populations were found for cowpea in all combinations of legumes and distances, as well as in single brachiaria pasture. The morphological diversity of diazotrophic bacterial communities was high. Significant differences were found for number of nodules, root dry mass, shoot dry mass and relative efficiency. 51% of the isolates showed similar or higher relative efficiency than the positive controls. Most of the isolates presented genetic similarity ranging from 77% to 99% with Bradyrhizobium strains. Therefore, it is concluded that the presence of the tree legumes Gliricídia and Sabiá under silvipastoral system in pastures of B. decumbens Stapf. Do not influence the density and diversity of noduliferous bacteria in cowpea. And that native populations of noduliferous bacteria in cowpea are efficient at fixing nitrogen and can be recommended for tests of agronomic efficiency. / A presença de leguminosas pode influenciar na diversidade e no tamanho da comunidade rizobiana nativa do solo. Nesse contexto, o objetivo deste estudo foi avaliar o efeito da leguminosa e sua distância em relação a diversidade rizobiana, em solo de pastagem de Brachiaria decumbens Stapf. sob sistema silvipastoril. O solo foi coletado em experimento instalado em Itambé-PE, com 3 tratamentos, constituídos por parcelas de 1 ha cada, sendo eles: Gliricidia + braquiária, Sabiá + braquiária e, braquiária em monocultivo, com 3 repetições. Nas parcelas com consórcio a amostragem foi feita dividindo-se a mesma em transectos no sentido do maior comprimento, ao longo do qual foram marcados pontos para obtenção da amostra composta de solo entre a fila dupla da leguminosa (0 m), e a partir desse ponto, a cada quatro metros (4m, 8m), coincidindo este último no centro da faixa de braquiária. Já nas parcelas com braquiária em monocultivo, a coleta foi realizada em três pontos aleatórios. A estimativa do número de rizóbios do solo, foi realizada pelo método de número mais provável em plantas, com três repetições, em casa-de-vegetação e utilizando o feijão-caupi (Vigna unguiculata (L.) Walp) como planta isca. Sementes germinadas foram inoculadas com 1,0 ml das amostras de solo, após diluição serial (de 10 -1 a 10 -8) e coletadas aos 35 dias. Foram utilizados 20 nódulos por tratamento para isolamento e caracterização fenotípica. Foi realizado agrupamento, com formação de grupos com 100% de similaridade, dos quais representantes aleatórios foram selecionados para avaliação da capacidade simbiótica conjuntamente com estirpes recomendadas para feijão-caupi, com um controle nitrogenado e outro absoluto. Foram analisadas as variáveis: massa seca da parte aérea (MSPA), massa seca de raiz (MSR), massa seca de nódulos secos (MSN), número de nódulo (NN), e eficiência relativa (ER). Para o sequenciamento foi utilizado o DNA amplificado dos isolados que apresentaram eficiência relativa, semelhante ou maior que as do controle referência. Foram encontradas populações rizobianas para caupi em todas as combinações de leguminosas e distâncias, bem como na pastagem de braquiária solteira. A diversidade morfológica das comunidades bacterianas diazotróficas mostrou-se alta. Foram encontradas diferenças significativas para número de nódulos, massa seca de raiz, massa seca de parte aérea e eficiência relativa. 51% dos isolados apresentaram eficiência relativa semelhantes, ou superiores aos controles positivos. A maioria dos isolados apresentou similaridade genética alcançando de 77% a 99% com linhagens de Bradyrhizobium. Portanto, conclui-se que a presença das leguminosas arbóreas Gliricídia e Sabiá sob sistema silvipastoril em pastagens de B. decumbens Stapf. não influenciam a densidade e diversidade de bactérias nodulíferas em feijão-caupi. E que as populações nativas de bactérias nodulíferas em feijão-caupi são eficientes em fixar nitrogênio e podem ser recomendadas para testes de eficiência agronômica.