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Investigação genética de duas novas doenças neurodegenerativas: síndrome de Spoan (Spastic Paraglegia with Optic Atrophy and Neuropathy) e SPG34 / Genetic research of two new neurodegenerative dieases; Spoan Syndrome (Spastic Paraglegia with Optic Atrophy and Neuropathy) and SPG34

Souza, Lúcia Inês Macedo de 22 August 2008 (has links)
Estudamos duas grandes famílias com manifestações de doenças neurodegenerativas. Uma delas é originária do alto oeste do estado do Rio Grande do Norte e a outra, da região de São José do Rio Preto, SP. A primeira, uma extensa família com tradição de casamentos consangüíneos, apresenta 68 indivíduos afetados pela síndrome a qual nomeamos Spoan (Spastic Paraplegia, Optic Atrophy, Neuropathy). A mesma é uma doença neurodegenerativa de herança autossômica recessiva, caracterizada por atrofia óptica congênita, espasticidade, polineuropatia periférica axonal sensitivo-motora, sobressaltos à estimulação sonora, deformidades articulares e da coluna e disartria. Estes resultados foram publicados em 2005 no Ann Neurol. 57(5):730-7. Dando continuidade ao estudo, selecionamos 23 genes que tiveram todos os exons seqüenciados. Nenhuma mutação foi observada. Amostras de 65 afetados e seus parentes foram estudados para seis marcadores de microsatélite, totalizando 149 indivíduos genotipados. Cinqüenta SNPs foram investigados, o que nos permitiu reduzir a região candidata de 4.8 para 2.3Mb em 11q13, entre o SNP rs1939212 e o microssatélite D11S987. Para o marcador D11S1889, com alelos em homozigose para todo os pacientes, foi obtido um lod score máximo de 27 em .=0.0. Os resultados deste estudo se encontram em fase de submissão. A segunda família foi estudada pela equipe da Dra. Mayana Zatz há alguns anos. Nela, investigamos 12 indivíduos afetados e 12 normais. Dentre estes, sete, com idades entre 30 e 60 anos, foram clinicamente avaliados. A idade de início foi a partir da terceira década de vida, sendo a paraplegia espástica o único sintoma. Para o marcador DXS8057 localizado em Xq25 foi obtido um lod score máximo de 4.13 em .=0.0. Com o estudo de marcadores moleculares, delimitamos uma região candidata entre os marcadores DXS1001 e DXS8033, de cerca de 14Mb, e demonstramos a existência de um novo loco gênico no cromossomo X, por nós denominado SPG34. Os resultados deste estudo estão publicados no Neurogenet on line em 08/05/200 / We studied two large families with expressions of neurodegenerative diseases. One is from the high west of the state of Rio Grande do Norte and the other from São José do Rio Preto region, in São Paulo. The first, an extended family with a tradition of consanguineous marriages, has 68 individuals affected by the syndrome named by us Spoan (Spastic Paraplegia, Optic Atrophy, Neuropathy). The Spoan syndrome is a neurodegenerative disease, autosomal recessive, characterized by congenital Optic Atrophy, spasticity, axonal polyNeuropathy peripheral sensory-motor, shocks to the sound stimuli, joint and spine deformities, and dysarthria. These results were published in 2005 in Ann Neurol. 57 (5):730-7. Latter we analyzed 23 genes that were entirely sequenced. No mutation was observed. Samples of 65 affected and their relatives were studied for six microsatellite markers, totaling 149 individuals genotiped. Fifty single nucleotide polymorphisms (SNPs), located in the critical region, were also investigated, which allowed us to reduce the region for the SPOAN gene from 4.8 to 2.3 Mb, between the SNP rs1939212 and microsatellite D11S987 in 11q13. All patients are homozygous only at D11S1889, which two-point lod score with a Zmax of 27 at .=0.0 was obtained. The results of this study are being submitted. The second family was studied by Dr. Mayana Zatz group a few years ago. We investigated 12 affected and 12 normal relatives. Among these, seven patients, aged between 30 and 60 years, were clinically evaluated. The age of onset was from the third decade of life and disease showed behaviour very uniform, all affected showed Spastic Paraplegia as the only symptom. For the marker DXS8057, in Xq25, was obtained a maximum lod score of 4.13 at .=0.0. The candidate region was maped between the markers DXS1001 and DXS8033, about 14Mb and demonstrate the existence of a new gene locus on chromosome X, named by us SPG34. The results of this study were published in Neurogenet on line on may.08.2008.
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Investigação genética de duas novas doenças neurodegenerativas: síndrome de Spoan (Spastic Paraglegia with Optic Atrophy and Neuropathy) e SPG34 / Genetic research of two new neurodegenerative dieases; Spoan Syndrome (Spastic Paraglegia with Optic Atrophy and Neuropathy) and SPG34

Lúcia Inês Macedo de Souza 22 August 2008 (has links)
Estudamos duas grandes famílias com manifestações de doenças neurodegenerativas. Uma delas é originária do alto oeste do estado do Rio Grande do Norte e a outra, da região de São José do Rio Preto, SP. A primeira, uma extensa família com tradição de casamentos consangüíneos, apresenta 68 indivíduos afetados pela síndrome a qual nomeamos Spoan (Spastic Paraplegia, Optic Atrophy, Neuropathy). A mesma é uma doença neurodegenerativa de herança autossômica recessiva, caracterizada por atrofia óptica congênita, espasticidade, polineuropatia periférica axonal sensitivo-motora, sobressaltos à estimulação sonora, deformidades articulares e da coluna e disartria. Estes resultados foram publicados em 2005 no Ann Neurol. 57(5):730-7. Dando continuidade ao estudo, selecionamos 23 genes que tiveram todos os exons seqüenciados. Nenhuma mutação foi observada. Amostras de 65 afetados e seus parentes foram estudados para seis marcadores de microsatélite, totalizando 149 indivíduos genotipados. Cinqüenta SNPs foram investigados, o que nos permitiu reduzir a região candidata de 4.8 para 2.3Mb em 11q13, entre o SNP rs1939212 e o microssatélite D11S987. Para o marcador D11S1889, com alelos em homozigose para todo os pacientes, foi obtido um lod score máximo de 27 em .=0.0. Os resultados deste estudo se encontram em fase de submissão. A segunda família foi estudada pela equipe da Dra. Mayana Zatz há alguns anos. Nela, investigamos 12 indivíduos afetados e 12 normais. Dentre estes, sete, com idades entre 30 e 60 anos, foram clinicamente avaliados. A idade de início foi a partir da terceira década de vida, sendo a paraplegia espástica o único sintoma. Para o marcador DXS8057 localizado em Xq25 foi obtido um lod score máximo de 4.13 em .=0.0. Com o estudo de marcadores moleculares, delimitamos uma região candidata entre os marcadores DXS1001 e DXS8033, de cerca de 14Mb, e demonstramos a existência de um novo loco gênico no cromossomo X, por nós denominado SPG34. Os resultados deste estudo estão publicados no Neurogenet on line em 08/05/200 / We studied two large families with expressions of neurodegenerative diseases. One is from the high west of the state of Rio Grande do Norte and the other from São José do Rio Preto region, in São Paulo. The first, an extended family with a tradition of consanguineous marriages, has 68 individuals affected by the syndrome named by us Spoan (Spastic Paraplegia, Optic Atrophy, Neuropathy). The Spoan syndrome is a neurodegenerative disease, autosomal recessive, characterized by congenital Optic Atrophy, spasticity, axonal polyNeuropathy peripheral sensory-motor, shocks to the sound stimuli, joint and spine deformities, and dysarthria. These results were published in 2005 in Ann Neurol. 57 (5):730-7. Latter we analyzed 23 genes that were entirely sequenced. No mutation was observed. Samples of 65 affected and their relatives were studied for six microsatellite markers, totaling 149 individuals genotiped. Fifty single nucleotide polymorphisms (SNPs), located in the critical region, were also investigated, which allowed us to reduce the region for the SPOAN gene from 4.8 to 2.3 Mb, between the SNP rs1939212 and microsatellite D11S987 in 11q13. All patients are homozygous only at D11S1889, which two-point lod score with a Zmax of 27 at .=0.0 was obtained. The results of this study are being submitted. The second family was studied by Dr. Mayana Zatz group a few years ago. We investigated 12 affected and 12 normal relatives. Among these, seven patients, aged between 30 and 60 years, were clinically evaluated. The age of onset was from the third decade of life and disease showed behaviour very uniform, all affected showed Spastic Paraplegia as the only symptom. For the marker DXS8057, in Xq25, was obtained a maximum lod score of 4.13 at .=0.0. The candidate region was maped between the markers DXS1001 and DXS8033, about 14Mb and demonstrate the existence of a new gene locus on chromosome X, named by us SPG34. The results of this study were published in Neurogenet on line on may.08.2008.
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Desvendando as bases moleculares da síndrome SPOAN: deleção em homozigose em região regulatória leva à superexpressão do gene KLC2 / Unraveling the molecular basis of SPOAN syndrome: deletion in homozygosis inregulatory region leads to KLC2 gene overexpression

Melo, Uirá Souto 19 August 2016 (has links)
A síndrome SPOAN (acrônimo do inglês spastic paraplegia, optic atrophy and neuropathy) é uma doença neurodegenerativa de herança autossômica recessiva que tem como achados clínicos a atrofia ótica congênita não progressiva, paraplegia espástica e neuropatia ambas progressivas. Ela havia sido mapeada na região cromossômica 11q13, porém a variante patogênica e o gene associados à síndrome não haviam sido identificados. Após execução do sequenciamento do genoma completo de um paciente foi detectada a deleção de 216-pb (chr11.hg19:g.66,024,557_66,024,773del) em homozigose localizada em região regulatória upstream do gene KLC2. Surpreendentemente, essa deleção causa superexpressão do KLC2, detectada em estudos de Real-Time Quantitative Reverse Transcription PCR (qRT-PCR) utilizando fibroblastos e neurônios motores de pacientes comparados com controles. Ensaios utilizando o Danio rerio como modelo in vivo mostraram que tanto o knockdown quanto a superexpressão do klc2 em embriões de zebrafish causa o fenótipo de cauda curvada (leve ou grave); fenótipo esse associado às doenças neurodegenerativas e HSPs. Superexpressão de um gene causada por uma pequena deleção em região regulatória é um novo mecanismo que até então não havia sido descrito na condição autossômica recessiva. Estudos funcionais por meio de gene reporter de LacZ avaliando o padrão de expressão espaço-temporal da região regulatória wild-type e com a deleção de 216-pb foram realizados nesse trabalho em modelo de camundongo, porém, não foi possível identificar um padrão de expressão reprodutível do gene reporter nesse modelo. Por fim, camundongos transgênicos para a superexpresão do KLC2 humano foram gerados, no entanto não foram realizados testes físicos e comportamentais para validar o transgênico como modelo para síndrome SPOAN / SPOAN (the acronym of its clinical symptoms) syndrome is a neurodegenerative disorder mainly characterized by a progressive spastic paraplegia, congenital non-progressive optic atrophy and progressive neuropathy. A potential causative gene was mapped at 11q13, but so far no gene and mutation were identified. Whole-genome sequencing allowed to detect a homozygous 216-bp deletion (chr11.hg19:g.66,024,557_66,024,773del) located at the regulatory upstream region of the KLC2 gene. Surprisingly, this deletion causes KLC2 overexpression detected by Real-Time Quantitative Reverse Transcription PCR (qRT-PCR) using fibroblasts and motor-neurons from patients compared with controls. Assays using Danio rerio as in vivo model showed that the klc2 knockdown either its overexpression in zebrafish embryos causes mild to severe curly-tail phenotype; phenotype that is already well defined as suggestive of a neurodegenerative disorder and HSP. Overexpression of a gene caused by a small deletion in the regulatory region is a novel mechanism, which to the best of our knowledge, was never reported before in a recessive condition. Functional studies using LacZ reporter assay evaluating the spatiotemporal expression pattern of wild-type regulatory region and with the deletion of 216-bp were performed in this work using mouse, but was not possible to identify an especific gene reporter expression pattern in this animal model. As a last experiment, transgenic mice for human KLC2 overexpression were generated, though behavioral tests were not performed to validate this transgenic animal as a model for SPOAN syndrome
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Desvendando as bases moleculares da síndrome SPOAN: deleção em homozigose em região regulatória leva à superexpressão do gene KLC2 / Unraveling the molecular basis of SPOAN syndrome: deletion in homozygosis inregulatory region leads to KLC2 gene overexpression

Uirá Souto Melo 19 August 2016 (has links)
A síndrome SPOAN (acrônimo do inglês spastic paraplegia, optic atrophy and neuropathy) é uma doença neurodegenerativa de herança autossômica recessiva que tem como achados clínicos a atrofia ótica congênita não progressiva, paraplegia espástica e neuropatia ambas progressivas. Ela havia sido mapeada na região cromossômica 11q13, porém a variante patogênica e o gene associados à síndrome não haviam sido identificados. Após execução do sequenciamento do genoma completo de um paciente foi detectada a deleção de 216-pb (chr11.hg19:g.66,024,557_66,024,773del) em homozigose localizada em região regulatória upstream do gene KLC2. Surpreendentemente, essa deleção causa superexpressão do KLC2, detectada em estudos de Real-Time Quantitative Reverse Transcription PCR (qRT-PCR) utilizando fibroblastos e neurônios motores de pacientes comparados com controles. Ensaios utilizando o Danio rerio como modelo in vivo mostraram que tanto o knockdown quanto a superexpressão do klc2 em embriões de zebrafish causa o fenótipo de cauda curvada (leve ou grave); fenótipo esse associado às doenças neurodegenerativas e HSPs. Superexpressão de um gene causada por uma pequena deleção em região regulatória é um novo mecanismo que até então não havia sido descrito na condição autossômica recessiva. Estudos funcionais por meio de gene reporter de LacZ avaliando o padrão de expressão espaço-temporal da região regulatória wild-type e com a deleção de 216-pb foram realizados nesse trabalho em modelo de camundongo, porém, não foi possível identificar um padrão de expressão reprodutível do gene reporter nesse modelo. Por fim, camundongos transgênicos para a superexpresão do KLC2 humano foram gerados, no entanto não foram realizados testes físicos e comportamentais para validar o transgênico como modelo para síndrome SPOAN / SPOAN (the acronym of its clinical symptoms) syndrome is a neurodegenerative disorder mainly characterized by a progressive spastic paraplegia, congenital non-progressive optic atrophy and progressive neuropathy. A potential causative gene was mapped at 11q13, but so far no gene and mutation were identified. Whole-genome sequencing allowed to detect a homozygous 216-bp deletion (chr11.hg19:g.66,024,557_66,024,773del) located at the regulatory upstream region of the KLC2 gene. Surprisingly, this deletion causes KLC2 overexpression detected by Real-Time Quantitative Reverse Transcription PCR (qRT-PCR) using fibroblasts and motor-neurons from patients compared with controls. Assays using Danio rerio as in vivo model showed that the klc2 knockdown either its overexpression in zebrafish embryos causes mild to severe curly-tail phenotype; phenotype that is already well defined as suggestive of a neurodegenerative disorder and HSP. Overexpression of a gene caused by a small deletion in the regulatory region is a novel mechanism, which to the best of our knowledge, was never reported before in a recessive condition. Functional studies using LacZ reporter assay evaluating the spatiotemporal expression pattern of wild-type regulatory region and with the deletion of 216-bp were performed in this work using mouse, but was not possible to identify an especific gene reporter expression pattern in this animal model. As a last experiment, transgenic mice for human KLC2 overexpression were generated, though behavioral tests were not performed to validate this transgenic animal as a model for SPOAN syndrome

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