Hemolytic uremic syndrome (HUS) induced by Shiga toxin-producing E. coli (STEC) is the most common causes of acute kidney injury in children. The therapy of the disease is symptomatic and the main factors leading to the development of severe course of a STEC-HUS are still unknown. In our study, we dealt with factors leading to development of a severe course of STEC-HUS in pediatric patients on both the host and pathogen side. Using retrospective analysis of the courses in children in the Czech Republic, we found that the most common cause of STEC-HUS was serotype O26 and HUS most often affected children under 3 years of age. 63,8 % required dialysis and mortality was 8.62 %. On the host side we focused on the relationship between the activation of the alternative complement pathway and the severity of the course of HUS. We found a significant difference in the level of the C3 part of complement in patients who required dialysis and patients for whom dialysis was not necessary. We also a cut-off value for the C3 part of complement and its reduction below 0.825 g / l was associated with the need for dialysis treatment and a higher incidence of extrarenal complications. Based not only on our results, it can be assumed that the therapeutic effect of complement could affect the severity of the disease....

This study focuses on emerging E. coil serotypes and has developed methods for the isolation and identification of non-0157 STEC and EPEC. A basal medium for the isolation of these pathogens was developed as well as a serogroup specific PCR assay for the detection of the 02 serogroup. These culture and molecular based techniques have proven to be valuable in the detection, identification, and epidemiological investigation of these groups of emerging pathogens. These methods were applied to 1) a farm study, whereby samples (faecal and soil) and 2) an abattoir study, whereby samples (hide and carcass) were analysed for the presence of non-0157 STEC and EPEC. Isolates were subsequently characterised in terms of serotype/serogroup and virulence markers. The data generated by this work has illustrated the extent of non-0157 STEC and EPEC contamination in the farm and abattoir environments, thus providing scientific background upon which control strategies may be based.

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:07:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 rosangela.pdf: 1093995 bytes, checksum: 8b8d62975e344cdccd0d1777e48758b1 (MD5) Previous issue date: 2009-08-31 / Escherichia coli O157:H7 is a serotype that belongs to Shiga toxin-producing Escherichia coli group and it has been incriminated in outbreaks of food poisoning and also as cause of sporadic cases of hemorrhagic colitis and hemolytic uremic syndrome in many countries. In Brazil, there is no data available about outbreaks caused by E. coli O157:H7, but this pathogen has been found often in cattle feces. Taking into consideration the high susceptibility of Minas Frescal cheese to the contamination by E. coli O157:H7 and also considering that milk is frequently associated with outbreaks, the aim of this research was to determinate the occurrence of the pathogen in Minas Frescal cheese, and also to compare techniques for this bacterium detection, such as PCR (Polymerase Chain Reaction) and VIDAS ECO O157® (bioMérieux, Lyon, France) test. Thirty cheese samples were collected from open-air markets in Goiânia and thirty samples were collected from establishments under Federal Inspection located in Goiás that trade their products in supermarkets in Goiânia. The MPN (More probable number) of Thermo-tolerant Coliforms and MPN of E. coli were also determined from the samples. From those samples collected in open air markets, E. coli O157:H7 was detected in 6,67% and 23,33% when the technique used was VIDAS ECO O157® and PCR, respectively. From those samples collected in establishments under Federal Inspection, the bacterium was not detected. There was no significant difference (p>0,05) between VIDAS ECO O157® and PCR for pathogen detection in samples from open air market and establishments under Federal Inspection. No significant difference (p> 0,05) was observed in samples collected from open air market and industries under Federal Inspection when VIDAS ECO O157® was used to E.coli O157:H7 detection. When PCR technique was applied, there was significant difference (p< 0,05) between samples origin. In 86,67% of samples collected from open air markets, Thermo-tolerant Coliforms were detected over the level established in Brazilian legislation, but in samples collected from industries under Federal Inspection, this value was 10%. The Minas Frescal cheese samples collected from open air market were more contaminated by E.coli than those collected from establishments under Federal Inspection and commercialized in supermarkets. / Escherichia coli O157:H7 é um sorotipo de E.coli pertencente ao grupo STEC - E.coli produtora de toxina Shiga - que tem sido incriminado em surtos de toxinfecção alimentar bem como em casos esporádicos de colite hemorrágica e síndrome urêmica hemolítica em vários países. No Brasil não há dados sobre possíveis surtos causados por E. coli O157:H7, mas este patógeno vem sendo frequentemente encontrado em fezes bovinas. Tendo-se em vista a suscetibilidade do queijo Minas Frescal à contaminação por E.coli O157:H7 e que o leite é um dos alimentos mais envolvidos em surtos, objetivou com o presente trabalho determinar a ocorrência deste microrganismo em queijos Minas Frescal, além de comparar as técnicas de reação em cadeia da polimerase (PCR) e teste VIDAS ECO O157®(bioMérieux, Lyon, France) na detecção do patógeno. Para tanto, analisou-se 30 amostras oriundas de feiras livres de Goiânia e 30 de estabelecimentos sob Inspeção Federal localizados em Goiás e que comercializam seus produtos em supermercados de Goiânia. Também foram determinados o Número Mais Provável (NMP) de Coliformes Termotolerantes e NMP de E. coli nestas amostras. Nas amostras oriundas de feiras livres detectouse E.coli O157:H7 em 6,67% e 23,33% quando utilizou-se o VIDAS ECO O157® e PCR, espectivamente. Nas amostras provenientes de estabelecimentos sob Inspeção Federal o microrganismo não foi detectado. Não houve diferença significativa (p>0,05) entre VIDAS ECO O157® e PCR na detecção do patógeno em amostras oriundas de feiras livres e estabelecimentos sob Inspeção Federal. Não observou-se diferença significativa (p> 0,05) entre amostras oriundas de feiras livres e indústrias sob Inspeção Federal quando utilizou-se o VIDAS ECO O157® na detecção de E.coli O157:H7. Quando empregou-se a técnica de PCR, constatou-se diferença (p< 0,05) entre as origens das amostras. Em 86,67% das amostras oriundas de feiras livres detectou-se a presença de Coliformes Termotolerantes acima do nível estabelecido pela legislação enquanto que, nas amostras provenientes de estabelecimentos sob Inspeção Federal esse percentual foi de 10%. As amostras de queijo Minas Frescal provenientes de feiras livres revelaram-se mais contaminadas por E.coli do que as oriundas de estabelecimentos sob Inspeção Federal e comercializadas em supermercados.

The research within this thesis sought to determine the ability of various animal derived fats and plant derived oils to support the survival of several pathogenic cocktails over a multitude of storage times. The Salmonella study explored the survival rate of a four strain Salmonella cocktail in beef tallow, pig lard, duck fat, coconut oil, and extra virgin olive oil over seven days at 26˚C and 37˚C storage. The animal fats and the coconut oil supported the survival of the bacteria until the conclusion of the study. The Shiga-toxin producing Escherichia coli study explored the survival rate of a five strain STECs cocktail in extra virgin olive oil over seven days at 26˚C and 37˚C storage. The two Listeria studies explored the survival rate of a four strain Listeria monocytogenes cocktail in extra virgin olive oil over several time periods with different frequencies of sample mixing. In vitro, all genuses showed a 2.5-log cfu/mL to ≥ 7-log cfu/mL reduction in the extra virgin olive oil by the conclusion of the experiments. Extra virgin olive oil was then applied to cooked pork tenderloin, cheddar cheese snack squares, and turkey lunchmeat in hopes of inhibiting the L. monocytogenes cocktail. No reduction was observed.

Shiga toxin-producing E. coli (STEC) are globally relevant bacterial pathogens responsible for epidemic outbreaks of hemorrhagic diarrhea with variable progression to potentially fatal systemic Shiga toxicosis. Predictive clinical biomarkers and targeted therapeutic interventions for systemic Shiga toxicosis in diagnosed STEC patients are not available, and the impact of Shiga toxin production on STEC colonization and survival remain unclear. Improved murine models of STEC infection are needed to address knowledge gaps surrounding the gastrointestinal effects of Shiga toxins, as previously published models utilize ablation of host defense responses or microbiota depletion to facilitate colonization and are poorly suited for study of the effects of Shiga toxins on host responses. Dextran sulfate sodium (DSS) colitis in rodents has been associated with outgrowths of commensal E. coli in the literature, suggesting that DSS colitis could open a gastrointestinal niche usable by pathogenic STEC. This DSS colitis-based approach successfully induced susceptibility to robust colonization by two clinical isolate STEC strains in standard C57BL/6 mice. Studies using a Shiga-like toxin 2 (STX2)-producing clinical isolate STEC strain and its paired isogenic STX2 deletion strain (STEC(ΔSTX2)) revealed that STX2 was associated with delayed gastrointestinal clearance of STEC and concurrent reduction in colonic interleukin 23 (IL-23) axis transcripts known to be critical for pathogen clearance in other gastrointestinal pathogen models. In vivo reductions in IL-23 axis transcripts in the DSS+STEC model were supported by decreased IL-23 protein secretion by human macrophage-like cells during Shiga intoxication in vitro. Increased morbidity during STX2-producing STEC infection was associated with renal injury consistent with murine systemic Shiga toxicosis characterized by elevations in renal transcripts of molecular injury markers and histologically apparent renal tubular injury in a subset of mice. The dissertation research establishes a novel model of DSS colitis-facilitated murine STEC infection that recapitulates progression to systemic Shiga toxicosis in a subset of infected mice and demonstrates a clear STEC survival benefit associated with STX2 production. Shiga toxin-induced suppression of IL-23 axis signaling is a novel finding facilitated by the DSS+STEC model, demonstrating its utility for future delineation of the impacts of Shiga toxins on gastrointestinal host responses to STEC.

Shiga producing E. coli (STEC) O157 is a zoonotic pathogen. In humans STEC O157 causes bloody diarrhoea and potentially fatal renal failure. Cattle are the major reservoir, where bacteria are limited to the intestinal tract and do not cause clinical signs of disease. Previous studies indicate that shiga toxins produced by STEC O157, suppress STEC-specific cellular immune responses in vivo. This study aimed to initially examine the humoral immune response in cattle following natural challenge and the effects of a toxoid vaccination on this humoral STEC specific-immune response. We determined a statistically significant suppression in Tir specific IgA in STEC O157 positive cattle compared to O157 negative cattle but not in super shedding cattle. Following toxoid vaccination we determined a significant increase in flagellin specific IgG1 antibody levels in toxoid vaccinated animals despite lower numbers of positive faecal samples compared to placebo vaccinated controls. These results suggest that shiga toxins produced by STEC O157 are actively suppressing the STEC specific immune response in natural colonisation. To clarify this suppression further calves were orally challenged with STEC O157 (either a PT21/28 Stx2c+, PT32 Stx2c+ or PT21/28 Stx2a+Stx2c+ strain) and their STEC specific immune responses monitored. STEC specific systemic antibody responses were variable and weak in some cases. STEC specific local antibody responses were only significantly increased following challenge with the PT21/28 Stx2a+Stx2c+ challenge. Transcripts for genes associated with immune responses, and in particular B cell activation, at the terminal rectum were analysed by reverse transcriptase quantitative PCR. Suppression of IL2RA transcripts was observed in calves challenged with PT21/28 Stx2a+Stx2c+ compared to control calves but not with the other two STEC O157 strains tested. This study also aimed to determine the effects of cattle colonisation with STEC O157 on the immune response to a non-bacterial T-cell dependent antigen, ovalbumin (OVA). Cattle were orally challenged with either a PT21/28 Stx2c+, PT32 Stx2c+ or PT21/28 Stx2a+Stx2c+ strain or unchallenged. Calves were subcutaneously immunised with OVA five days post challenge, on two separate occasions with a two week interval. Lymphocytes from lymph nodes local to the immunisation site demonstrated significantly increased OVA-specific proliferation and OVA-specific activation of CD4+ and CD8+ cells in calves that were challenged with the PT21/28 Stx2c+ strain (but not with the other two challenge strains), compared to unchallenged controls. These results indicate that colonisation with STEC O157 can alter local adaptive immune responses to non-bacterial antigens in a strain dependent manner, unexpectedly enhancing the immune response rather than suppressing it. Circulating T cell responses were unaffected. In conclusion this study provides some further evidence of adaption of the host immune response by STEC O157, which is strain dependent, and variable. It seems unlikely from the data in this study that STEC O157 colonisation is having a major impact on the responses of cattle to other vaccines or infections in the field.

No description available.

Le travail de thèse a eu pour but de contribuer à une meilleure connaissance de la dangerosité pour l'homme des souches STEC d'origine bovine, en explorant la corrélation pouvant exister entre la présence du gène stx chez de telles souches et la réalité de son expression. La quantification de l'expression du gène stx2 présent chez 46 souches STEC bovines a été réalisée à l'aide d'un test ELISA commercial détectant spécifiquement les shiga toxines, le test ProSpecT® Shiga toxin (OXOID). L'ensemble des résultats de validation préalable obtenus pour ce test a permis de considérer qu'il pouvait être valablement appliqué à l'étude du panel de souches d'E. coli O157 :H7 bovines collectées au laboratoire, tout en déterminant les limites méthodologiques, et donc d'interprétation. Utilisé comme outil de quantification de la production de Stx2 par les souches du panel choisi, et dans deux conditions expérimentales différentes (présence ou absence d'induction par l'enrofloxacine), ce test a permis de mettre en évidence que seulement 15,2% des souches d'E.coli O157:H7/H- étudiés produisent des quantités significatives de Stx2 détectables sans induction, et ce à des niveaux variables. En revanche, la majorité de ces isolats, bien que n'exprimant pas la protéine Stx2 de manière constitutive, produit des quantités significatives de Stx2 en présence de concentrations subinhibitrices d'enrofloxacine, antibiotique de la famille des fluoroquinolones et utilisé en médecine vétérinaire. Enfin, des mutants résistants à l'enrofloxacine sélectionnés à partir de certaines souches d'E. coli O157:H7, produisent, après induction par l'enrofloxacine, 3 fois plus de toxine Stx2 que les souches sauvages. Les mutants sont également inductibles en utilisant des doses d'enrofloxacine 100 fois supérieures à celles utilisables pour les souches sauvages. L'ensemble de ces résultats montre (i) la corrélation, ou non, qui peut exister entre la présence du gène stx2 et son expression, (ii) que la proportion inductible des souches STEC bovines est potentiellement importante, (iii) que l'enrofloxacine induit fortement l'expression du gène stx2 chez les souches STEC bovines et que (iv) l'induction par l'enrofloxacine conduit à des taux d'expression du gène stx2 supérieurs chez des souches résistantes aux fluoroquinolones que chez les souches sensibles. Au final, cette étude contribue à documenter la variabilité des niveaux d'expression des gènes stx et illustre le risque que des STEC issus de bovins puissent devenir plus fréquemment pathogènes pour l'homme suite à l'usage croissant des fluoroquinolones vétérinaires.

Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) has been recognized as an important foodborne pathogen. Of this group, O91 is one of the common serogroups frequently isolated from patients and food in some countries, with O91:H21 being previously implicated in hemolytic uremic syndrome (HUS). Cattle are principle reservoirs for STEC, and studies examining STEC shedding in cattle often include experimental inoculation of strains of interest using antibiotic resistance markers for identifiable recovery. However, indigenous fecal microbes exhibiting similar resistance patterns can confound such studies. Such was the case in a study by our group when attempting to characterize shedding patterns of O91:H21 in calves, leading us to seek other, more effective, markers. Among our strategies was the development of a chromosomally integrated bioluminescence marker via transposon mutagenesis using a luxCDABE cassette from Photorhabdus luminescens and a plasmid borne GFP marker via transformation of the pGFP vector. The luxCDABE marker was inserted on host chromosome at a site that was 27 nucleotides before the stop codon of gene yihL and confirmed to have little impact on important virulence genes and growth rate with a very high stability. In contrast, plasmid borne GFP marker showed poor stability without the application of appropriate antibiotic selection pressure. For calves receiving luxCDABE-marked O91:H21, the fecal counts of the organismranged from 1.2 x 10 3 to 1.3 x 10 4CFU/g at two days post inoculation and decreased to 5.8 to 8.7 x 10 2 CFU/g or undetectable level after two weeks.Intestinal contents sampled from various positions at day 14 post inoculation indicated that cecum and descending colon may be the primary localization sites of this O91:H21 strain. Compared to antibiotic resistance markers, the use of bioluminescence markers does not require the restricted pre-inoculation screening of animals. The enumeration of luxCDABE-marked O91:H21 from feces and intestinal contents was easily accomplished and confirmed reliable by M-PCR analysis under the presence of indigenous bacteria which cannot be eliminated by antibiotic-supplemented selective plates. Therefore, the chromosomal integrated luxCDABE marker may be a better model for the study of STEC colonization and shedding in cattle.

DESCRIPTION DU SUJET ABORDE Certains Escherichia coli producteurs de shigatoxines (STEC) ou Escherichia coli entérohémorragiques (EHEC) sont responsables de toxi-infections dorigine alimentaire qui se traduisent par des diarrhées mais aussi par des syndromes plus graves pour lhomme comme le syndrome hémolytique urémique pouvant provoquer la mort. Ils apparaissent comme un problème important de santé publique. La souche de STEC du sérotype O157:H7 est responsable dépidémies dans le monde causant des milliers de malades et des dizaines de morts. Le réservoir principal est le bovin et les autres ruminants. Les principaux modes de transmission des infections à STEC à lhomme sont la consommation daliments contaminés, la transmission de personne à personne, lingestion deau contaminée et le contact avec des animaux (notamment les bovins) et leur environnement. Les facteurs de virulence des Escherichia coli producteurs de Shigatoxines (STEC) sont principalement les protéines codées par un îlot de pathogénicité, le LEE Locus of Enterocyte Effacement, impliquées dans la formation de la lésion dattachement et deffacement et de la diarrhée et les toxines de Shiga codées par des bactériophages et impliquées dans les syndromes extra- intestinaux. A partir des années nonante, le nombre croissant dépidémies liées à STEC, en Amérique du Nord et en Europe, ont interpellé les professionnels du secteur qui ont concentré leurs efforts pour mettre au point des moyens de recherche, didentification, de maîtrise et de prévention du danger. Le premier objectif de ce travail était donc dapprocher le plus précisément possible la situation en Belgique dans les principales filières de production de denrées alimentaires dorigine animale (DAOA). Pour ce faire, les études suivantes ont été entreprises: i) une étude préliminaire de la contamination par les STEC O157 des carcasses de buf et de porc (étude I) ; ii) une étude visant à la détermination du taux de contamination des viandes hachées de buf par les STEC O157 et autres sérotypes ; iii) des études extensives basées sur des plans annuels de surveillance couvant toute la production nationale visant à établir le taux de prévalence et lévolution temporelle de la contamination par les STEC O157 dans les principales DAOA mais surtout dans la filière de la viande de buf. Les plans de recherche de ces pathogènes ont été couplés à la détermination du nombre dE. coli totaux pour juger du niveau de maîtrise de la contamination fécale dans les établissements afin dapporter des éléments quantitatifs pour une évaluation du risque lié aux STEC. Le second objectif visait à déterminer le taux de contamination par les STEC et les STEC O157 dans deux abattoirs algériens, lun de buf, lautre de moutons afin de savoir si ces pathogènes posaient des problèmes de santé publique en Algérie. Le niveau de contamination fécale a aussi été étudié afin de juger de la maîtrise de lhygiène de labattage. RESULTATS En Belgique Evaluation du taux de contamination par les STEC de sérotype O157 de carcasses de buf et de porcs dans 9 abattoirs en 1996 Dans le cadre de limplémentation du système HACCP (directive 93/43/CE), trois cent dix carcasses de buf et 245 carcasses de porcs ont été soumises à un écouvillonnage en surface au niveau de sites spécifiques. La méthode de recherche était basée sur les étapes i) un enrichissement non sélectif, ii) une méthode de séparation immuno-magnétique, iii) une détection immuno-enzymatique (VIDAS ECO, BioMérieux), iv) un isolement sur milieu Mac Conkey au sorbitol. Cette étude a permis de standardiser la méthode déchantillonnage et a révélé, pour la première fois en Belgique, la présence dune souche STEC O157 :H- (stx1+, stx2+, eae+) potentiellement pathogène sur des carcasses bovines. Prévalence des Escherichia coli producteurs de shigatoxines dans les viandes hachées en 1997 Aucune souche de STEC O157 (eae stx) na été isolée à été isolée à partir des 627 échantillons de viande hachées analysées. La PCR a permis de détecter le gène stx dans 5,1 % des échantillons positifs (n=45). Seulement 7 souches ont été isolées par une méthode dhybridation ADN/ADN sur colonies basée sur les principaux gènes des facteurs de virulence des STEC : Deux E. coli de sérotype O91 (stx2+, eae-), deux des E. coli entéropathogènes de sérotype O128 et trois de sérotypes non identifiés. La qualité bactériologique des viandes hachées testées était satisfaisante puisque plus de 80 % des échantillons avaient un taux dE. coli inférieur à 50 unités formant colonies (ufc) par gramme donc au critère légal de m=50 ufc/gramme (Arrêté Royal du 4 juillet 1996) Surveillance du taux de contamination des denrées alimentaires dorigine animale par des souches dEscherichia coli du sérotype O157 de 1998 à 2004 Cette étude répond aux exigences des directives (92/117/CEE et 2003/99/CEE) et présente les plans de surveillance des STEC O157 dans les denrées alimentaires. Aucune souche de STEC O157 na été isolée à partir des 1025 échantillons (matrices issues de bovins, porcs, volailles, lapins) testés en 1997. En 1998, une modification de la méthode analytique (méthode SP-VG M001) a permis disoler neuf souches dE. coli de sérotype O157 (stx+) à partir de surfaces de 6010 carcasses regroupées en pools de 5 carcasses par échantillon. Quatre vingt pourcents des souches STEC O157 sont stx2 eae et ehxA et 90 % portaient lantigène H7. Une majorité de firmes nont pas satisfait aux critères microbiologiques pour les E. coli (arrêté royal du 20 Août 2002). Cependant, aucune relation statistiquement significative entre les niveaux de contamination par les E. coli totaux et la présence dE. coli O157 na pu être établie. Les années 1999 à 2004 ont été marquées par une surveillance des STEC O157 sur un plus grand nombre dentreprises, un plus grand nombre déchantillons (filière bovine, porcine, poulet, poule et poissons), une plus grande surface de carcasses écouvillonnées (décision 2001/471/CE) et des recherches au stade du consommateur. La méthode de recherche des STEC O157 a été la méthode SP-VG M001. Le dénombrement des E. coli a été réalisé selon la méthode validée par lAFNOR, SDP-07/1-07/93. Des prévalences de STEC O157 égales à 1,3 % (n=1984) en 1999, 0,4 % (n=1501) en 2000, 1,08 % (n=1388) en 2001, 1,07% (n=1225) en 2002, 0,82 % (n=1497) en 2003 et à 1,35 % (n=1337) en 2004 ont été mises en évidence sur les surfaces de carcasses de buf, ce qui correspond à une moyenne pondérée de 0,95 %. En ce qui concerne les viandes hachées, la prévalence des STEC O157 est faible soit 0,1 % (1/974) en 1999, 0,4 % (1/487) en 2000, 1,68 % (5/298) en 2003 et aucun STEC O157 en 2001, 2002 et 2004 pour une moyenne pondérée de 0,27 %. La présence de souches dans du haché de buf prélevé en grandes surfaces montre que des souches pathogènes se retrouvent parfois au stade de la distribution. Entre 1999 et 2004, Deux souches STEC O157 ont été isolées en 2003 et deux autres en 2004 à partir de 764 viandes de découpe de buf analysées soit une prévalence de 0,52 %. Les matrices de porcs, de poules, poulets et de poissons ne semblent pas présenter un danger à lheure actuelle puisque aucun STEC O157 ny a été mis en évidence à ce jour en Belgique. Une amélioration de la contamination par les Escherichia coli a pu être observée au cours des années dans les firmes échantillonnées. Les 106 souches de STEC O157 isolées à partir des matrices de bovins sont en majorité des E.coli O157 :H7, stx2, eae et ehxA, fréquemment impliqué dans les formes graves des infections. En Algérie Evaluation du taux de contamination des carcasses bovines par les Escherichia coli entérohémorragiques du sérotype O157 et dautres Escherichia coli pathogènes Une méthode simplifiée de la recherche des STEC O157 a permis de révéler la présence de 18 souches (7,8 %) STEC O157 à partir de 230 carcasses de buf échantillonnées. Septante huit pourcents dentre elles sont stx2, eae et ehxA. De même, 66 colonies possédant au moins un des gènes de virulence recherchés, ont été isolées à partir de trente carcasses positives à lhybridation ADN/ADN sur colonies. Quarante (60,6 %) sont des E. coli entéropathogénes (eae+, stx-), 23 (34,8 %) sont (stx+, eae-) et trois (4,5 %) sont (eae+, stx+). Aucune des trois nappartient aux sérotypes STEC les plus fréquents (O26, O111, O128, O103, O91, O145). Plus de 65 % des carcasses avaient des niveaux dE. coli supérieurs à la limite dacceptabilité (M) définie par le critère microbiologique belge (20 ufc/cm2). Evaluation du taux de contamination par les Escherichia coli producteurs de shigatoxines sur les carcasses ovines et dans les matières fécales. Cette étude a permis de mettre en évidence, la présence de STEC O157:H7 sur 2,5 % des 160 carcasses écouvillonnées (décision 2001/471/CE). Le pathotype principal était stx2 eae et ehxA. Parmi les neuf souches STEC O157 stx2 isolées et testées par PCR pour les sous-types c, d, e, f, seulement trois sont stx2d. Létude du portage des STEC dans les matières fécales dovins a montré la présence du gène stx dans 25,4% des prélèvements (n=106). Le pathotype principal identifié sur un échantillon composite était stx1 (50 %) suivi du pathotype stx1, eae (46, 4%). Lovin est donc aussi un réservoir potentiel de STEC pathogènes et une source de contamination pour lhomme CONCLUSIONS ET PERSPECTIVES, Lexistence de souches STEC O157 potentiellement pathogènes a été confirmée dans la filière bovine. La prévalence de ces agents pathogènes observée sur les carcasses bovines en Belgique (en moyenne de 0,95%) est proche des valeurs enregistrées dans dautres pays : 0,7 % au Danemark, (EC, 2001), 1 % en Tchécoslovaquie (Lukasova, 2004) et 1,4 % en Grande Bretagne (Chapman, 2001). La prévalence des STEC O157 enregistrée en Algérie (7,8 % dans cette étude) est significativement supérieure aux prévalences observées en Belgique. Des prévalences du même ordre de grandeur ont été rapportées dans la littérature soit 17,1% aux USA (Elder et al., 2000), 12% en Italie (Bonardi etal., 2001), 11% en Irlande (Mc Evroy et al., 2003). La prévalence des STEC O157 dans les viandes hachées est faible, en général inférieure à 1 %. Elle est de 0,27 % en Belgique (cette étude). De plus, la présence de souches dans du haché de buf prélevé en grandes surfaces a montré que des souches pathogènes se retrouvent parfois au stade de la distribution et constituent un danger direct pour le consommateur. Des résultats similaires ont été enregistrés 0,15 % en Angleterre (Chapman, 2001), 0,11 % en France (AFSSA, 2003). Les matrices de porcs, de poules, poulets et de poissons ne semblent pas présenter un danger à lheure actuelle puisque aucun STEC O157 ny a été mis en évidence à ce jour en Belgique. Comme lont mentionné la plupart des études relatives à la prévalence des STEC O157, il est difficile de comparer les résultats obtenus à cause des différences constatées au niveau de la taille des échantillons, des méthodes de prélèvements et de détection de ces agents pathogènes. La standardisation de la méthode de détection des Escherichia coli O157 (norme ISO16654) ainsi que lapplication de la directive de la commission européenne (2001/471/ CE) définissant les quatre sites découvillonnage au niveau des carcasses de buf et dovins ont permis dasseoir une méthodologie de recherche performante. La majorité des souches STEC O157 isolées en Belgique et en Algérie présentent le pathotype stx2 eae ehxA considéré comme le plus dangereux pour la santé publique Aucune association directe entre les taux élevés dE. coli totaux et la présence de STEC O157 na pu être établie. E. coli ne semble pas être un indicateur pour la présence de cet agent pathogène mais, bien sûr, le niveau de contamination par les souches pathogènes doit diminuer en parallèle à la charge en E. coli totaux et que, donc, globalement le risque quelles présentent doit diminuer. En ce qui concerne lespèce ovine, Une prévalence égale à 0,7 % a été mise en évidence dans une autre étude en Grande Bretagne (Chapman et al., 2001). les résultats obtenus concernant le portage des STEC obtenus sont proches des résultats dune étude en Suisse qui a révélé la présence de STEC sans préciser le sérotype dans 29,9 % des matières fécales (Zweifel et al., 2004). Les taux élevés de contamination fécale observés en Algérie laissent supposer que, si les animaux sont porteurs de STEC O157, le niveau de contamination des carcasses devrait être plus important quen Belgique. En perspectives, au niveau belge, les plans de surveillance doivent être maintenus surtout au niveau des matrices bovines: carcasses, viandes hachées, découpes afin dévaluer les évolutions. Ces études devraient être couplées en amont avec des études de prévalence au niveau des exploitations agricoles et en aval avec les données en pathologie humaine. Une plus grande coordination devrait sopérer entre le secteur vétérinaire et la santé publique. En Belgique, le laboratoire de référence pour les EHEC est le même dans les deux cas (UZ-Brussel) ce qui signifie que les méthodes de typage appliquées aux souches des deux origines sont les mêmes. Les critères microbiologiques européens du Règlement (CE) N°2073/2005 vont encore accentuer les efforts des industriels pour la maîtrise des agents pathogènes dans les filières à risque, même si les STEC O157 ne sont pas encore repris dans les critères de sécurité de ce Règlement. Le développement de méthodes efficaces pour la recherche des autres sérotypes devrait permettre détendre la surveillance aux STEC non O157 les plus importants. Les données collectées au cours des plans de surveillance vont permettre de compléter les données disponibles pour une analyse du risque STEC O157 dans les filières à risque et particulièrement la filière bovine. En Algérie, une application des plans HACCP au niveau des entreprises agroalimentaires et une surveillance des agents zoonotiques sont nécessaires. Des études complémentaires et approfondies grâce à la mise en place de moyens de diagnostic doivent être menées aussi bien au niveau humain quau niveau vétérinaire. Les résultats de ces études devront être considérés par la Direction des Services Vétérinaires du Ministère de lAgriculture en Algérie. REMERCIEMENTS Cette étude a été menée grâce au soutien financier de lInstitut dExpertise Vétérinaire(IEV) puis de lAgence Fédérale pour la sécurité de la Chaine Alimentaire (AFSCA) par le laboratoire de microbiologie des denrées alimentaires de la Faculté de Médecine Vétérinaire de lUniversité de Liège (ULg) et la collaboration du laboratoire Vakgroep Diergeneeskundig Toezicht op Eetwaren, Diergeneeskunde Faculteit, Universiteit Gent (U Gent); le laboratoire de microbiologie alimentaire de lInstitut Scientifique de la Santé Publique : Louis Pasteur (ISP-LP) et deux laboratoires de lAFSCA qui ont participé aux analyses à partir de 2003 et le laboratoire de.(UZ-Brussel) Les études en Algérie ont été réalisées grâce au soutien du Ministère de lEnseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique et de lEcole Nationale Vétérinaire dAlger avec la collaboration du laboratoire national de référence de microbiologie alimentaire de la faculté de médecine vétérinaire de lULg.