Chile es uno de los mayores productores de salmones y truchas a nivel mundial, para aumentar la competitividad en este mercado es imprescindible generar tecnologías (biotecnologías) que permitan mantener su posicionamiento global. El desarrollo de estas tecnologías en otras especies de importancia agronómica, se sustenta en el desarrollo de marcadores moleculares y mapas genéticos, que han permitido identificar los genes, regiones genómicas o QTL (“Quantitative Trait Loci”), que afectan los caracteres de importancia económica. Para salmones la ausencia de mapas genéticos saturados con marcadores ha impedido la eficiente identificación de QTL, por lo que se requieren otras aproximaciones para desarrollar esta tarea. En este trabajo se utilizó marcadores anónimos (RAPD) y grupos extremos para el valor de cría de la tasa de crecimiento, buscando identificar QTL asociados a este rasgo. La aproximación fue aplicada en un genoma conocido de un pez modelo como cebra (Danio rerio), y de ser eficiente podrá ser aplicable a especies de salmones. Para predecir los valores de cría se realizó un análisis de exclusión de paternidad/maternidad con cinco marcadores microsatélites polimórficos (Z4951, Z1197, Z5058, Z4009, Z5294), logrando una probabilidad de exclusión de un 80%. Con las relaciones de parentesco conocidas de dos generaciones se estimó la heredabilidad para la tasa de crecimiento utilizando un modelo animal y un algoritmo derivativo libre de máxima verosimilitud restringida (DFREML). El valor de heredabilidad fue alto (h² = 0,42± 0,10), y concuerda con lo publicado para la especie. Para identificar marcadores moleculares asociados a los QTL que determinan la tasa de crecimiento, se realizaron análisis RAPD entre muestras conjuntas de ADN de los individuos más extremos para valor de cría utilizando 300 partidores aleatorios. Se detectó un marcador polimórfico (amplificado con el partidor UBC 179) cuya presencia se asocia significativamente con bajo valor de cría para tasa de crecimiento en la población evaluada (χ 2 = 17,368; 1 g.l.; Prob. Fisher = 0,0001). Este marcador está disponible para la construcción de marcadores de locus único o SCAR.