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Estimación de heredabilidad e identificación de marcadores RAPD asociados a tasa de crecimiento en zebrafish (Danto rerio)Accini Muñoz, Gina Paola January 2009 (has links)
Chile es uno de los mayores productores de salmones y truchas a nivel mundial, para
aumentar la competitividad en este mercado es imprescindible generar tecnologías
(biotecnologías) que permitan mantener su posicionamiento global. El desarrollo de estas
tecnologías en otras especies de importancia agronómica, se sustenta en el desarrollo de
marcadores moleculares y mapas genéticos, que han permitido identificar los genes,
regiones genómicas o QTL (“Quantitative Trait Loci”), que afectan los caracteres de
importancia económica.
Para salmones la ausencia de mapas genéticos saturados con marcadores ha impedido la
eficiente identificación de QTL, por lo que se requieren otras aproximaciones para
desarrollar esta tarea. En este trabajo se utilizó marcadores anónimos (RAPD) y grupos
extremos para el valor de cría de la tasa de crecimiento, buscando identificar QTL
asociados a este rasgo. La aproximación fue aplicada en un genoma conocido de un pez
modelo como cebra (Danio rerio), y de ser eficiente podrá ser aplicable a especies de
salmones.
Para predecir los valores de cría se realizó un análisis de exclusión de
paternidad/maternidad con cinco marcadores microsatélites polimórficos (Z4951, Z1197,
Z5058, Z4009, Z5294), logrando una probabilidad de exclusión de un 80%. Con las
relaciones de parentesco conocidas de dos generaciones se estimó la heredabilidad para la
tasa de crecimiento utilizando un modelo animal y un algoritmo derivativo libre de máxima
verosimilitud restringida (DFREML). El valor de heredabilidad fue alto (h² = 0,42± 0,10),
y concuerda con lo publicado para la especie.
Para identificar marcadores moleculares asociados a los QTL que determinan la tasa de
crecimiento, se realizaron análisis RAPD entre muestras conjuntas de ADN de los
individuos más extremos para valor de cría utilizando 300 partidores aleatorios. Se detectó
un marcador polimórfico (amplificado con el partidor UBC 179) cuya presencia se asocia
significativamente con bajo valor de cría para tasa de crecimiento en la población evaluada
(χ
2 = 17,368; 1 g.l.; Prob. Fisher = 0,0001). Este marcador está disponible para la
construcción de marcadores de locus único o SCAR.
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