The inter-firm cooperation between partner companies is a central element of most business models in an open innovation perspective. A closed innovation approach cannot be effective anymore, and most of the companies have been trying to embrace open innovation concepts by developing various types of interorganizational ties with a diverse range of partner companies. Building a solid cooperative model with partner companies is becoming vital success factor in an increasingly competitive global market. Companies are required to build teams with other partner companies in order to develop or internalize new technologies, and commercialize new products, and to remain technologically competitive. In this context, this research focuses to develop a structured framework of organizational challenges and challenge management model in collaborative innovation projects in inter-organizational relationship. In order to achieve these goals, the key organizational challenges in cooperate with partner companies and root causes of them are defined and analysed. Furthermore, challenged management programs are analysed based on the framework developed in this research. The result of this study support for readers to gain a comprehensive understanding on organizational challenges in open innovation. Furthermore, it also provides managerial implications in terms of challenge management in a collaborative innovation project. / Samverkan mellan partnerföretag är ett centralt element i de flesta affärsmodeller sett från ett öppet innovationsperspektiv. En sluten innovationsprocess är inte längre effektiv och de flesta företag, framförallt företag i högteknologisk industri, har anammat en öppen innovationsprocess genom att utveckla olika typer av samarbeten med ett brett urval av partnerföretag. Att bygga en solid samarbetsmodell med partnerföretag är en vital framgångsfaktor i en alltmer konkurrensutsatt global marknad. Företag bör bygga team med andra partnerföretag för att utveckla eller internalisera nya teknologier samt kommersialisera nya produkter för att förbli tekniskt konkurrenskraftiga. Denna studie ämnar utveckla en strukturerad modell för hantering av organisatoriska utmaningar i innovationsprojekt mellan företag. Genom en fallstudie på Samsung Electronics, definieras och analyseras de viktigaste utmaningarna i samarbetsprojekt samt dess bakomliggande orsaker. Vidare analyseras etablerade teorier för hantering av utmaningar inom öppen innovation baserat på modellen som utvecklats i studien.