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Déterminants génétiques constitutionnels et acquis de la sévérité de l’anémie falciforme : études de l’impact des variants germinaux sur les traits sanguins et de l’hématopoïèse clonalePincez, Thomas 04 1900 (has links)
L’anémie falciforme (AF) est une maladie monogénique dans laquelle la polymérisation d’une
hémoglobine anormale (hémoglobine S, Hb S) entraine la déformation et la destruction du
globule rouge. L’AF est associée à de nombreuses complications cliniques avec une très grande
hétérogénéité dans son expression. En dehors de l’impact important de l’hémoglobine fœtale (Hb
F), cette variabilité est mal comprise et peu d’outils sont disponibles afin d’identifier les patients
à risque de complications. Nous avons utilisé différentes approches afin d’étudier les
déterminants génétiques constitutionnels et somatiques de l’expression de l’AF ainsi que leur
utilité dans la prise en charge des patients. Dans un premier temps, nous avons montré que les
scores polygéniques pour les traits sanguins étaient moins performants chez les individus avec AF
que sans. Nous avons montré que cette différence était en partie liée au poids d’autres
déterminants génétiques et identifié un effet épistatique entre l’AF et le variant nul Duffy qui
avait un effet très réduit en présence d’AF. Nous avons ensuite montré qu’un score polygénique
simple pour l’Hb F expliquait une grande partie de sa variance et permettait d’améliorer la
modélisation des crises de douleurs. Pour finir, à partir d’une réanalyse de la plus grande cohorte
de patients avec AF ainsi que par randomisation mendélienne, nous avons montré l’effet causal
protecteur de l’Hb F sur les accidents vasculaires cérébraux. Dans un second temps, nous avons
analysé un crible génétique ciblé sur la densité du globule rouge, paramètre influençant la
polymérisation de l’Hb S. Nous avons identifié de nombreux variants ayant un effet causal sur la
densité à des fins de validation fonctionnelle. Pour finir, nous avons montré que l’AF influençait
l’apparition d’une hématopoïèse clonale. Cette dernière était en effet détectée chez des patients
plus jeunes et avait une prévalence plus élevée chez les individus avec AF que sans. En résumé,
ce travail apporte un éclairage nouveau sur les conséquences de l’AF en montrant son influence
sur l’expression de déterminants génétiques constitutionnels et somatiques. Ces déterminants
représentent des outils pouvant permettre d’améliorer la prise en charge des patients avec AF. / Sickle cell disease (SCD) is a monogenic disorder leading to the polymerization of an abnormal
hemoglobin (hemoglobin S, Hb S), that deforms the red cell, eventually leading to its destruction.
SCD is associated with numerous complications with a great heterogeneity in its expression.
Beside the important impact of fetal hemoglobin (Hb F), this variability is poorly understood, and
few tools are available in the clinic to identify patients at high risk of complications. We used
several approaches to study constitutional and somatic genetic determinants of SCD expression
and their utility in patients’ management. First, we showed that polygenic scores for
hematological traits were less performant in individuals with SCD than without. We showed that
this difference was partly due to other genetic determinants and identified an epistatic effect
between SCD and the Duffy antigen/chemokine receptor (DARC) null variant, which had a
markedly reduced effect in SCD. We then showed that a simple polygenic score for Hb F explained
a large part of the variance and improved modeling of pain crises. Based on the largest SCD cohort
reanalysis and using Mendelian randomization, we showed that Hb F had a causal protective
effect against stroke. Second, we analyzed a CRISPR-Cas9 targeted screening for red cell density,
which influences Hb S polymerization. We identified many variants that influenced density as
candidate to functional validations. Finally, we showed that SCD influenced the occurrence of
clonal hematopoiesis. Clonal hematopoiesis was detected in younger patients and had an
increased prevalence in individuals with SCD than without. In sum, this work shed light on a new
category of consequences of SCD by showing its influence on the expression of constitutional and
somatic determinants. These determinants are tools that can be used to improve the
management of patients with SCD.
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