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Contribution à la compréhension du phénomène de surdominance polaire au locus callipyge du mouton / Contribution to the knowledge of polar overdominance in sheep callipyge locusCaiment, Florian 03 December 2010 (has links)
THÈME DE RECHERCHE :
Le phénotype callipyge est une hypertrophie musculaire généralisée post-natale décrite chez le mouton (introduit dans le Chapitre 1). Son mode de transmission non mendélien, qualifié de surdominance polaire, est unique : seuls les hétérozygotes ayant reçu la mutation callipyge (CLPG) de leur père expriment le phénotype. La mutation CLPG, localisée dans un domaine soumis à l'empreinte parentale, est une mutation ponctuelle (SNP) détruisant un élément qui contrôle, en cis, le taux dexpression musculaire des gènes voisins. L'hypertrophie musculaire, sans doute causée par l'expression ectopique de la protéine DLK1 chez les animaux +mat/Cpat, n'est pas observée chez les animaux Cmat/Cpat dont l'allèle maternel apparaît trans-inactiver la traduction du messager DLK1. Cette thèse a pour objectif d'approfondir notre compréhension de la surdominance polaire, aussi bien au travers de l'étude des mécanismes impliqués dans l'effet de contrôle à longue distance en cis de la mutation que de la caractérisation des inhibitions en trans induites par les transcrits maternels sur les messagers paternels.
RÉSULTATS :
L'étude de l'effet en cis (Chapitre 2) a démontré que la mutation CLPG se différenciait de l'allèle sauvage par au moins trois marques épigénétiques distinctes : (i) l'hypométhylation de l'ADN à proximité du SNPCLPG, (ii) la création d'un site d'hypersensibilité à la DNase, et (iii) l'activation de la transcription bidirectionnelle de la région autour de la mutation. En démontrant que la mutation inactivait bel et bien un élément de contrôle à longue distance, ces données nous ont permis d'élaborer un modèle plus précis de la surdominance polaire.
L'étude de la trans-inhibition des transcrits protéiques à expression paternelle par les transcrits non codants maternels (Chapitres 3 et 4) se fondait sur l'hypothèse d'une implication des nombreux microARNs (miRNAs) du domaine DLK1-GTL2. Nous avons ainsi pu montrer que les cinq miRNAs abrités par anti-PEG11 étaient capables, par leur parfaite complémentarité de séquence, de cliver le messager PEG11 (Chapitre 3). Bien que le rôle de la protéine PEG11 dans le phénotype callipyge soit inconnu, cette étude a néanmoins démontré l'existence d'une trans-inhibition entre les deux allèles du locus, tout en identifiant le premier cas de dégradation miRNA/cible impliquant des gènes soumis à l'empreinte chez les mammifères.
L'étude de la trans-inhibition appliquée au messager DLK1 (Chapitre 4) a quant à elle nécessité la génération par séquençage haut débit d'un catalogue exhaustif des miRNAs du muscle squelettique ovin. Ce travail nous a permis de démontrer que les miRNAs du domaine DLK1-GTL2 étaient bien exprimés maternellement et eux aussi soumis à l'effet en cis de la mutation. Si aucun miRNA capable d'inhiber le messager DLK1 n'a été identifié sans ambiguïté, nos analyses d'affinité ont toutefois révélé un effet significatif de miR-376c sur sa 3'UTR, ainsi que de l'ensemble des miRNAs du locus DLK1-GTL2 sur sa région codante. Notons que nous avons également considéré comme potentiels candidats à la trans-inhibition les snoRNAs du locus, de même que les miRNAs du locus soumis à l'édition ARN.
CONCLUSIONS ET PERSPECTIVES :
À l'issue de cette thèse, nous avons donc contribué à la compréhension du phénomène de surdominance polaire au locus DLK1-GTL2 du mouton callipyge. Si de nombreuses questions restent en suspend, elles devraient néanmoins trouver réponse grâce aux nouveaux outils d'analyse en cours de développement. Ainsi, deux lignées de souris transgéniques développées dans notre laboratoire, respectivement porteuses de la mutation CLPG ou surexprimant PEG11 dans le muscle, éclaireront les mécanismes moléculaires de l'effet en cis de la mutation ainsi que le rôle de PEG11 dans l'établissement du phénotype callipyge. Par ailleurs, pour confirmer in vivo l'effet inhibiteur sur DLK1 des miRNAs identifiés dans notre étude, les progrès apportés par le séquençage haut débit (notamment le HITS-CLIP) et la transfection en modèle cellulaire se révéleront sans doute d'une grande aide. / RESEARCH OVERVIEW:
The callipyge phenotype is a generalized muscular hypertrophy described in sheep (see Chapter 1). It features a non-mendelian mode of inheritance termed polar overdominance: only heterozygous animals having inherited the mutation from their father display the phenotype. The callipyge mutation (CLPG), which falls in an imprinted domain, is a single-nucleotide polymorphism (SNP) that disrupts a putative long-range control element affecting, in cis, the expression level of neighboring imprinted genes in skeletal muscle. The callipyge phenotype is thought to be caused by ectopic expression of DLK1 protein in +mat/Cpat animals. In contrast, Cmat/Cpat animals exhibit a wild-type phenotype that is certainly due to a trans-inhibition from the maternal allele on DLK1 translation. The objective of our thesis was to improve our knowledge of polar overdominance, both by studying mechanisms of long-range cis regulation and by characterizing the trans effect of maternal noncoding transcripts on the paternally-expressed messenger RNAs.
RESULTS:
Our study of the cis effect (Chapter 2) showed that the CLPG mutation differs from the wild-type allele by at least three distinct epigenetic marks: (i) DNA hypomethylation in the vicinity of the SNPCLPG, (ii) creation of a DNase-hypersensitive site, and (iii) activation of a bidirectional transcription start site centered on the mutation. Altogether, our data provided strong evidence for the SNPCLPG inactivating a long-range control element and allowed us to refine our model of polar overdominance.
Our working hypothesis for the trans-inhibition of paternally-expressed genes by maternal noncoding transcripts (Chapters 3 and 4) involved microRNAs (miRNAs) from the DLK1-GTL2 domain. In this respect, we showed that five miRNAs from anti-PEG11 were able to cleave PEG11 transcript, owing to perfect sequence complementarity (Chapter 3). This study was the first demonstration of miRNA-mediated RNAi involving imprinted genes in mammals. Furthermore, it allowed us to confirm the existence of a trans-inhibition between both alleles in the domain, albeit the role of PEG11 protein in the callipyge phenotype is still unknown.
To study the trans-inhibition of DLK1 messenger (Chapter 4), we used high-throughput sequencing to build an exhaustive catalogue of skeletal muscle-specific miRNAs in sheep. Our analyses showed that miRNAs from the DLK1-GTL2 domain are maternally expressed and affected by the cis effect of the CLPG mutation. Even if we could not find miRNAs unambiguously able to repress DLK1 transcript, affinity analyses revealed a significant effect on its 3' UTR for miR-376c, as well as on its coding region for all miRNAs considered as team. Of note, we also investigated snoRNAs and miRNAs subjected to RNA editing in the DLK1-GTL2 locus.
CONCLUSIONS AND PERSPECTIVES:
During the course of this research, we contributed to improve the understanding of polar overdominance in the sheep DLK1-GTL2 locus. Although many questions remain, most will eventually be answered thanks to upcoming analysis tools. Hence, our lab has already generated two transgenic mouse lines, either carrying the CLPG mutation or over-expressing PEG11 in skeletal muscle. These mice should respectively shed light on the molecular mechanisms underlying the cis effect of the CLPG mutation and on the role of PEG11 in the callipyge phenotype. Finally, to confirm inhibiting effects of miRNAs identified in our study, technological improvements granted by high-throughput sequencing (such as HITS-CLIP) and miRNAs transfection in cell model systems will both prove to be very useful.
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Cartographie génomique par analyse de signature ADN sur molécule unique issue de molécules en épingle à cheveux micro-manipulées par pinces magnétiques / Genomic mapping by DNA fingerprinting analysis using single molecule from hairpin shaped molecule and magnetic tweezers micromanipulationLyonnet Culinas du Moutier, François-Xavier 18 December 2018 (has links)
Les techniques de micromanipulation de molécules d’ADN uniques offrent des perspectives nouvelles pour lire et exploiter l’information contenue dans les génomes. Cela inclut le séquençage, la cartographie, le dénombrement de molécules et l'identification de modifications chimiques de l'ADN. Dans ce contexte, l'Équipe ABCDLab de l'ENS a développé une méthode utilisant l’ouverture et la fermeture mécanique répétée d’une molécule d’ADN en épingle à cheveux par pince magnétique. Cet outil permet de déterminer la position d'hybridation de petits oligonucléotides ainsi que celle d'anticorps révélant la position de marques épigénétiques. Un avantage de cette approche est de pouvoir travailler sur la même molécule pour d’une part identifier les marques épigénétiques et d'autre part réaliser une cartographie de sa position dans le génome. Mon travail de thèse consiste à développer un ensemble de méthodes bio-informatique visant à réaliser cette étape de cartographie. Le signal expérimental consiste en lecture des positions d’hybridation d’un, ou de plusieurs petits oligonucléotides sur la molécule étudiée. Cette mesure permet de construire une signature spécifique de la molécule que l’on peut rechercher dans le génome d’origine. Dans ce travail de thèse, j'ai réalisé des expériences avec sur pinces magnétiques pour acquérir des signatures moléculaires sur des molécules sélectionnées en aveugle dans E. coli. J'ai développé un logiciel capable de faire la recherche de ces signatures dans un génome et ensuite effectué l’ensemble du traitement des données pour tester le logiciel. Après plusieurs étapes d’optimisation, j’ai pu retrouver la position génomique des molécules étudiées, établissant ainsi une preuve de concept de cette stratégie de cartographie. Le travail a concerné l'ensemble de la chaîne de mesure : (1) le choix des sondes utilisées pour constituer la signature d’une molécule observée en optimisant un ensemble de critères liés aux conditions expérimentales et à la combinatoire des motifs de séquence. (2) la mise au point d’algorithmes de cartographie adaptés aux caractéristiques expérimentales des mesures. Enfin, j'ai testé ces algorithmes, à la fois sur des données simulées in silico et in vitro sur de l'ADN d'origine bactérienne. Je discuterais en quoi les performances des solutions de cartographie développées ici sont influencées par, d’une part les limites du montage expérimental actuel, et d’autre part les limites des approches bioinformatiques. Je présenterais les voies d’amélioration possibles de ces dernières. Mes travaux établissent qu'identifier des molécules d’ADN uniques par pinces magnétiques est possible dans le contexte d’application épigénétique et en génomique. / Single molecule micromanipulations technic offer new perspectives to read and unravel genome information. This includes sequencing, mapping, molecule counting and identification of DNA modifications. In this respect, ABCDLab team has developed a cutting edge method using repeated mechanical opening and closing of a DNA molecule with a hairpin shape using magnetic tweezers. This tool allows measuring along the DNA molecule the hybridization positions of oligonucleotides a few bases long and also to locate specific antibodies transiently bound to epigenetic markers. With this approach we can identify with the single molecule level epigenetics markers and localized them on the genome. My PhD work consisted of developing a set of bioinformatics methods to perform DNA mapping using magnetics tweezer signal consisting of hybridization positions along the studied molecule. This measurement may be viewed as a fingerprint of the molecule which can be searched on the reference genome. During my thesis, I have realized an experimental test using magnetic tweezers to acquire a set fingerprint data on a set of blinded selected molecules in the E. coli genome. I have developed a software performing a rapid search of these fingerprints inside the genome. Then I have performed the whole data treatment to check the software on the selected molecules. After several rounds of optimization, I have recovered the genetic position of the studied molecules, establishing a proof of concept of this cartography strategy. The work has addressed the whole measuring chain; (1) by choosing the oligonucleotides best adapted to obtain the molecular signature by optimizing the set of experimental constrains and combinatorial motifs of the sequence. (2) by tuning the cartography algorithm to adapt to the experimental measurement constrains. Finally, I have tested these algorithms, both on simulated data in silico and on experimental fingerprint in vitro. I shall discuss how the performances of these cartography solutions that have been developed here are impacted by the experimental limitations of the present technique, and by the bioinformatics limits. I shall present possible improvements to these methods. My studies constitute a proof of concept for genomic and epigenetic applications.
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Caractérisation de toxines peptidiques par spectrométrie de masse à haute résolution.Quinton, Loïc 28 September 2006 (has links) (PDF)
PARMI LES DIFFERENTES SOURCES NATURELLES DE COMPOSES BIOLOGIQUEMENT ACTIFS, LES VENINS REPRESENTENT, DE PAR LA GRANDE VARIETE DE LEURS CONSTITUANTS, UNE CIBLE DE CHOIX POUR LA RECHERCHE MEDICALE. LES TOXINES QU'ILS CONTIENNENT SONT VARIEES ET COMPRENDRE LEUR MODE D'ACTION DANS LE BUT DE SYNTHETISER DES ANALOGUES D'INTERET PHARMACOLOGIQUE PASSE PAR UNE DETERMINATION PRECISE DE LEUR STRUCTURE CHIMIQUE AVEC LA CONTRAINTE QUE LA FAIBLE QUANTITE DE MATERIEL GENERALEMENT DISPONIBLE REND L'ENSEMBLE DES PROCESSUS DE SEPARATION ET DE CARACTERISATION TRES DELICAT. C'EST DANS CE CONTEXTE QUE SE SITUE CETTE THESE DONT L'OBJECTIF A ETE DE METTRE AU POINT DE NOUVELLES STRATEGIES D'ANALYSE PAR SPECTROMETRIE DE MASSE A HAUTE RESOLUTION DE NOUVELLES TOXINES PEPTIDIQUES. CETTE THESE A PARTICULIEREMENT CIBLE L'ETUDE DE TOXINES PEPTIDIQUES DE CONES (MOLLUSQUES UTILISANT UN HARPON VENIMEUX POUR ATTEINDRE ET PARALYSE! R LEUR PROIE) ET DE SERPENTS. AU FINAL, LA SPECTROMETRIE DE MASSE A HAUTE RESOLUTION S'EST REVELEE COMME UN OUTIL TRES PUISSANT POUR LA CARACTERISATION DE PETITES TOXINES MODIFIEES PAR SES GRANDES CAPACITES EN TERMES DE PRECISION SUR LA MESURE DE MASSE MAIS AUSSI DANS L'ETUDE DE PLUS GROSSES TOXINES POUR LESQUELLES LA RECENTE TECHNIQUE DE DISSOCIATION PAR CAPTURE D'ELECTRON S'EST MONTREE DES PLUS PERFORMANTES.
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Caractérisation des beta-lactamases et leur inhibition par les extraits de plantes médicinales/beta-lactamase characterization and their inhibition by medicinal plants extractGangoué Pieboji, Joseph 09 November 2007 (has links)
Les bactéries productrices de β-lactamase à spectre élargi (BLSE) ont été rapportées dans plusieurs pays, mais aucune information nest disponible sur les différents types de BLSE produits par les Entérobactéries au Cameroun. On distingue plus de 290 types de β-lactamases divisés en 4 classes (A, B, C, et D) et jusquaujourdhui il nexiste pas des inhibiteurs capables dinhibés toutes les classes de β-lactamase.
Un total de 267 souches dEntérobactéries a été isolé entre 1995-1998 (259 souches) et 2002 (8 souches) des produits pathologiques (urines, pus et sang) des patients hospitalisés dans divers services de lHôpital Central de Yaoundé. Létude de la sensibilité in vitro de ces bactéries à 12 antibiotiques (amoxicilline, amoxicilline/acide clavulanique, pipéracilline, imipénème, céfazoline, céfoxitine, céfotaxime, ceftazidime, aztréonam, gentamicine, ofloxacine et triméthoprime/sulfaméthoxazole) par la méthode des disques a permis de noter un certains nombre de faits : limipénème, lofloxacine et la ceftazidime sont les antibiotiques les plus actifs sur les différentes Entérobactéries avec respectivement 100%, 91% et 88% de bactéries sensibles ; les différentes souches présentent un niveau de résistance élevé à lamoxicilline (90%), à la pipéracilline (79%), à la céfazoline (75%) et au triméthoprime/sulfaméthoxazole (74%).
En vue de détecter les espèces bactériennes productrices de BLSE, 69 souches résistantes à au moins une céphalosporine de 3ème génération ou au monobactame ont été soumises au test de double synergie. Trente-huit (31 entre 1995-1998 ; 7 en 2002) souches ont montré un test positif. La prévalence des souches productrices de BLSE est de 12% (31/259). Ces souches présentant un phénotype BLSE sont observées chez toutes les espèces dEntérobactéries étudiées avec une prévalence de 18,8% (Klebsiella spp.), de 17,6% (Citrobacter spp.), de 14,3% (E. coli) et de 1,8% (Proteus spp.).
Parmi les 38 souches potentiellement productrices de BLSE, 18 (47,4%) ont transféré le gène de résistance des oxyimino-céphalosporines aux souches E. coli HK 225, K12 et DH5α. Seize de ces gènes ont été transférés par conjugaison et deux par transformation. Le transfert de gène de BLSE a été co-transféré avec le gène de résistance à la gentamicine et/ou au triméthoprime/sulfaméthoxazole. Toutes les souches transconjugantes et transformantes ont présenté un phénotype BLSE et ont été toutes sensibles à la céfoxitine et à limipénème.
Les extraits enzymatiques bruts obtenus par sonication des souches transconjugantes, transformantes et cliniques ont été capable de réduire les diamètres dinhibition autour des disques de pénicillines, céphalosporines 1ère à la 3ème génération ou monobactame en utilisant une souche dE. coli complètement sensible aux antibiotiques, mais nont pas eu deffet sur ces zones autour des disques dimipénème, de céfoxitine et damoxicilline/acide clavulanique. La détermination des points isoélectriques (pIs) des différentes souches après transfert du gène de résistance par la technique disoélectrofocalisation a montré que les souches transconjugantes et transformantes produisent des β-lactamases dont les pIs varient de 5,4 à 8,8. En effet, 12 souches produisent les BLSE de pI 8,2 ; deux souches en plus de cette BLSE produisent deux autres enzymes de pIs 5,4 et 8,5. Les souches de phénotypes CTX-M produisent soit une enzyme (pI 8,4 ; une souche) soit deux (pIs 7,3, 8,8 ; 2 souches) ou alors 3 types (pIs 5,4 ; 7,3 et 8,8 ; une souche).
Les extraits dADN de 19 souches (16 transconjugantes, 2 transformantes et 1 souche clinique) soumis à la technique de PCR, PCR/NheI, en utilisant les amorces spécifiques des gènes blaSHV, blaCTX-M, blaTEM et blaOXA ont montré que les différents extraits contiennent les gènes des b-lactamases du type SHV (sulfhydryl variable), CTX-M (cefotaximase), TEM (Temoniera) et OXA (aoxacillinase). Lanalyse de la séquence des différents produits de PCR a permis de montrer que : 14 souches produisent la BLSE SHV-12, cinq la BLSE CTX-M (CTX-M-1, une souche ; CTX-M-15, 4 souches) ; quatre souches produisent en association avec les BLSE les β-lactamases TEM-1 (SHV-12, 2 souches ; CTX-M-15, 2 souches) OXA-30 (CTX-M-15, 4 souches). Lanalyse des profils de digestion des plasmides portant les gènes blaCTX-M par les enzymes de restriction, dhybridation et des profils génotypiques des souches cliniques productrice de ces enzymes par ERIC-PCR a montré que la dissémination de la BLSE CTX-M peut se faire soit par transfert de plasmide (on retrouve le même plasmide chez deux souches différentes, E. coli YC-14 et K. pneumoniae YC-17) soit par la même souche dun patient à un autre (E. coli YC-5 = E. coli YC-2). Létude de lenvironnement génétique de ce gène (blaCTX-M-15) par lanalyse des séquences a montré que CTX-M-15 est codée par deux plasmides multirésistants différents, parmi lesquels un (pYC-5b) porte lélément ISEcp1-blaCTX-M-15 flanqué par un site de réplication constituée de 5 paires de bases et inséré dans le transposon Tn2. Une forme tronquée de cet élément a été identifiée chez lautre plasmide (pYC-14). Les BLSE SHV-12, CTX-M-1 et CTX-M-15 sont décrites pour la première fois au Cameroun.
Dans le but de rechercher de nouveaux inhibiteurs des β-lactamases plus actifs, nous avons étudié deux plantes médicinales, Garcinia lucida (Clusiaceae) et Bridelia micrantha (Euphorbiceae) en vue dévaluer leur activité anti- β-lactamase. Les concentrations inhibant 50 % de l'activité de l'enzyme (CI50) des extraits de G. lucida et B. micrantha sont respectivement de 0,01 mg/ml (β-lactamase P99) et de 0,019 mg/ml (β-lactamase OXA-10) indiquant ainsi une bonne inhibition des β-lactamases par les extraits de ces plantes. Le produit 4 issu de la purification par chromatographie haute performance de lextrait de G. lucida est très actif sur la β-lactamase P99 (CI50 = 0,038 mg/ml) alors que les produits 2' et 3' provenant de lextrait de B. micrantha sont actifs sur lenzyme OXA-10 (CI50 de 0,09 mg/ml et 0,11 mg/ml respectivement). La détermination de la structure des composés actifs de ces deux plantes pourrait être une voie importante dans le développement des inhibiteurs des β-lactamases.
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Bacteria producing extended-spectrum β-lactamase (ESBL) have been reported in many countries, but there is no information on different type of ESBL-producing enterobacteria in Cameroon. More than 290 β-lactamases have been described and divided into four classes (A, B, C and D) and up to now, there is no good inhibitor which can inhibite all classes of β-lactamases.
A total of 267 strains of Enterobacteriaceaae were isolated between 1995-1998 (259 isolates) and 2002 (eight isolates) from pathological products (urines, pus and blood) of patients at the Yaounde Central Hospital. The susceptibility of the isolates to 12 antibiotics (amoxicillin, amoxicillin/clavulanate, piperacillin, imipenem, cefazolin, cefoxitin, cefotaxime, ceftazidime, aztreonam, gentamicin, ofloxacin and trimethoprim/sulfamethoxazole) was determined using the agar diffusion disk method. Imipenem, ofloxacin and ceftazidime were the most active antibiotics against overall enterobacteria with susceptibility rates of 100%, 91% and 88% respectively. High resistance rates were observed to amoxicillin (90%), piperacillin (79%), cefazolin (75%) and trimethoprim/sulfamethoxazole (73%).
Enterobacteria isolates (69) resistant to oxyimino-cephalosporin or monobactam were screened for ESBL production by the double disk (DD) synergy test. Thirty-eight (31 from 1995-1998; seven in 2002) were proved positive to the DD synergy test, suggesting the presence of ESBL. The prevalence of ESBL was 12% (31/259) and ESBL-producing strains were Klebsiella spp. (18.8%), Citrobacter spp. (17.6%), Escherichia coli (14.3%) and Proteus spp. (1.8%).
Of the 38 ESBL-producing strains, 18 (47.4%) were transferred resistance to oxyimino-cephalosporins to E. coli HK 225, K12 and DH5α. Sixteen of these strains were transferred ESBL gene by conjugation and two by transformation. Resistance to gentamicin and/or trimethoprim/sulfamethoxazole was co-transferred. All transconjugant and transformant strains exhibited ESBL phenotype but remained susceptible to cefoxitin and imipenem.
Crude extracts of β-lactamase-producing transconjugants, transformants and clinical strains were able to reduce the diameters of inhibition zones around disks containing penicillins, 1st to 3rd generation cephalosporins or monobactam when tested against a fully susceptible E. coli strains, but had no effect on such zones around cefoxitin-, imipenem- and amoxicillin/clavulanate disks. The determination of isoelectric points (pIs) of the various strains after transfer of resistance determinant showed that transconjugants and transformants strains produced β-lactamases with pIs 5.4 to 8.8. In fact, 12 strains produced β-lactamase with pI 8.2, 2 strains in addition to the above enzyme produced two others enzymes with pIs 5.4 and 8.5. Strains with CTX-M- phenotype produced enzyme (pI 8.4, 1 strain), two (pIs 7.3, 8.8; 2 strains) or three types pIs (5.4, 7.3, 8.8; 1 strain).
PCR, PCR/NheI was performed using total or plasmid DNA from 19 strains as templates, and the primers specific to blaSHV, blaCTX-M, blaTEM and blaOXA. Direct sequencing of PCR products revealed that: 14 strains produced SHV-12 ESBL, 5 CTX-M- ESBL (CTX-M-1, one strain; CTX-M-15, 4 strains); four other strains shared non-ESBL TEM-1 (2 producing-SHV-12 strains and 2 producing-CTX-M-strains) and OXA-30 (4 producing CTX-M-15 strains).
Analysis of restriction patterns of plasmid carrying blaCTX-M gene, hybridization, and genotyping patterns of CTX-M-clinical strains by ERIC-PCR showed that dissemination of blaCTX-M gene could be done by plasmid transfer (same plasmid in different strains, E. coli YC-14 and K. pneumoniae YC-17) or by strains from patient to patient (same strain, E. coli YC-2=E. coli YC-5). Sequence analysis of genetic environment of blaCTX-M-15 revealed that CTXM-15 was encoded by two different multiresistant plasmids, of which one (pYC-5b) carried an ISEcp1-blaCTX-m-15 element flanked by five bp target site duplication and inserted within a Tn2-derived sequence. A truncated form of this element in the second plasmid (pYC-14) was identified. ESBLs SHV-12, CTX-M-1, CTX-M-15 are described for the first time in Cameroon.
In our effort to find new active β-lactamase inhibitors, we investigated two medicinal plants, Garcinia lucida (Clusiaceae) and Bridelia micrantha (Euphorbiaceae) for anti- β-lactamase activity. The extracts from G. lucida and B. micrantha exhibited good inhibition of β-lactamase P99 (IC50, 0.01 mg/ml) and OXA-10 (IC50, 0.02 mg/ml) respectively. Purified products from these plants by high performance liquid chromatography showed that, product 4 from G. lucida is very active on β-lactamase P99 (IC50, 0.03 mg/ml) whereas products 2 and 3 from B. micrantha are active on OXA-10 (IC50, 0.09 mg/ml; 0.11 mg/ml respectively). The structural elucidation of the active constituents of these plants will provide useful leads in the development of β-lactamase inhibitors.
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