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Development of nanohole-based sensors for early detection of ovarian cancerChou, Yu-Wei Andrew 26 June 2013 (has links)
Ovarian cancer has very high mortality because it is hard to diagnosis in early stages. Many ovarian cancer biomarkers (such as HE4, CA 125) are available and had been suggested as potential tools for early cancer detection. However, early cancer detection using serological markers will only become widely used if a new generation of sensors that can be handled in a clinical setting can be developed. A detection technology that is promising for miniaturization and integration in biomedical sensing devices is based on the phenomenon of the extraordinary light transmission (EOT) through arrays of nanoholes on metal films. EOT is an increase in light transmission observed at certain wavelengths that satisfy the surface plasmon resonance (SPR) condition of the nanostructure. The position of this resonance is affected by surface adsorption phenomenon, which is the basis for the biosensor. In this dissertation, the detection of the HE4 biomarker was demonstrated using EOT. The EOT-based detection was compared to two state-of-the-art analytical methods (ELISA and commercial SPR). Based on our experiments, it was found that ELISA has lowest detection limit, around 0.5 ng/mL for that particular protein (HE4). The detection limits for the commercial SPR, around 0.13 μg/mL was comparable to the nanohole-based detection limit, around 1.76 μg/mL. In contrast to ELISA, the SPR-based methods were label free, more time efficient, and more environmental friendly. An extra advantage of the nanohole scheme was that multiple samples could be analyzed simultaneously and in real time. Adsorption kinetic experiments were also performed to evaluate the rate constants of the HE4 binding to a surface coated with anti-HE4. The adsorption equilibrium constant for the HE4 – anti-HE4 system was determined to be (4.3 ± 2.1) x 107 M-1. / Graduate / 0487
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Pesquisa de anticorpos contra estruturas citoplasmáticas do neutrófilo (ANCA) e contra o Saccharomyces cerevisiae (ASCA) na doença inflamatória intestinal / Evaluation of Antineutrophil cytoplasmic autoantibodies (ANCA) and Anti-Saccharomyces cerevisiae antibodies (ASCA) in inflammatory bowel diseaseSchappo, Fernando 14 May 2007 (has links)
A determinação dos marcadores sorológicos P-ANCA (anticorpo perinuclear contra estruturas citoplasmáticas do neutrófilo) e ASCA (anticorpo anti-Saccharomyces cerevisiae) auxilia de forma menos invasiva no diagnóstico da doença inflamatória intestinal (DII). O padrão de associação mais relacionado à retocolite ulceratica inespecífica (RCUI) ocorre com ASCA- (negativo) e P-ANCA + (positivo). Na doença de Crohn (DC) ocorre o contrário, ou seja, ASCA+ e P-ANCA-. O P-ANCA é determinado por imunofluorescência indireta usando neutrófilos fixados em etanol, e o ASCA através de ELISA. De forma geral, a prevalência do P-ANCA em pacientes com RCUI tem variado entre 50 e 80% e em pacientes com DC entre 10 e 30%. Controles sadios têm revelado prevalência menor que 4% e controles patológicos em torno de 8%. Alguns trabalhos mostraram ampla variação nos resultados, sugerindo além de variação genéticas, variações metodológicas de acordo com a população estudada. Foram realizadas análises no soro de 200 pacientes para pesquisa de P-ANCA e ASCA, sendo 98 com RCUI e 102 com DC. O grupo controle foi representado por 54 indivíduos sadios. Os pacientes com DII foram oriundos do ambulatório de Gastroenterologia ? Grupo de Intestino do Hospital das Clínicas Faculdade da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (HCFMUSP). A prevalência encontrada do P-ANCA na RCUI, DC e grupo controle correspondeu a 61,2%, 16,7% e 5,6% respectivamente, enquanto que a do ASCA para a DC, RCUI e grupo controle correspondeu a 52,9%, 27,6% e 5,6% respectivamente. A sensibilidade e especificidade encontrada com o padrão ASCA+/P-ANCA- para DC foi de 45,1% e 89,% respectivamente, enquanto que para o padrão P-ANCA+/ASCA- para RCUI foi de 43,9% e 91,2% respectivamente. No que diz respeito às características clínicas e demográficas, nenhuma associação com a presença dos anticorpos foi estabelecida no presente estudo, exceto quando avaliado o uso de drogas imunossupressoras e infliximab em pacientes com DC e ASCA+ , a qual se mostrou aumentada (p=0,008). Assim sendo, a determinação dos anticorpos P-ANCA e ASCA na DII possui baixa sensibilidade, mas níveis elevados de especificidade como demonstrado em outros estudos publicados. A correlação dos anticorpos P-ANCA e ASCA com características clínicas ainda permanece controversa. / The determination of serologic markers P-ANCA (perinuclear antineutrophil cytoplasmic autoantibodies) and ASCA (anti-Saccharomyces cerevisiae mannan antibodies) assists as non-invasive way on the inflammatory bowel disease (IBD) diagnosis. The most associated pattern to ulcerative colitis (UC) occurs with ASCA- (negative) and P-ANCA + (positive). In the Crohns disease (CD) is the opposite, that is, ASCA+ and P-ANCA-. Determination of P-ANCA is performed by an indirect immunofluorescence assay, using ethanol-fixed neutrophil slides and ASCA is measured by ELISA. Usually, the prevalence of P-ANCA in patients with UC has varied between 50 and 80% and in patients with CD between 10 and 30%. Healthy controls have disclosed lesser prevalence than 4% and pathological controls around 8%. Some studies had shown a wide variation in the results, suggesting both genetic and methodologic variations, according to the studied population. Serum samples were obtained from 200 patients for analysis of P-ANCA and ASCA, being 98 with UC and 102 with CD. The control group was represented by 54 healthy individuals. Patients with IBD were selected from the Department of Gastroenterology - Intestine Group of the Hospital das Clínicas of the University of São Paulo (HCFMUSP). P-ANCA prevalence found in UC, CD and control group were 61,2%, 16,7% e 5,6%, respectively, but ASCA prevalence in UC, CD and control group were 52,9%, 27,6% e 5,6%, respectively. Sensitivity and specificity achieved using ASCA+/P-ANCA- pattern for CD were 45,1% e 89,%, respectively, but P-ANCA+/ASCA- pattern for UC were 43,9% e 91,2% respectively. In this study, the current data did not support a relationship between the serological markers and clinical and demographic characteristics, except when evaluated the use of immunosuppresive drugs and infliximab in patients with CD and ASCA+, which were increased (p=0,008). Thus, the determination of antibodies P-ANCA and ASCA in the IBD gets low sensitivity, but high levels of especificity as demonstrated in other published reports. The correlation of antibodies P-ANCA and ASCA with clinical characteristics appears to be limited.
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Estudo de doadores de sangue com sorologia reagente para hepatites B e C, HIV e sífilis no Hemocentro de Ribeirão Preto / Study of blood donors with serology reactive to hepatitis B and C,HIV and syphilis at Blood Center of Ribeirao Preto.Oranice Ferreira 27 April 2007 (has links)
Uma das maiores preocupações relacionadas a segurança transfusional é a possibilidade de transmissão de doenças infecciosas atraves de sangue transfundido, entre as quais se encontram as hepatites B e C, o HIV e a sífilis. Este trabalho teve como objetivo estudar doadores que passaram pelo processo de seleção pré-doação no Hemocentro de Ribeirão Preto e apresentaram resultados de testes sorológicos positivos para essas doenças/infecções.Estudou-se a frequencia dos resultados positivos entre os individuos que doaram sangue no hemocentro de Ribeirão Preto ou em seu posto de Coleta Central,de 1o.de julho de 2005 a 31 de julho de 2006. Os indivíduos com resultados sorológicos positivos confirmados em um segundo teste foram caracterizados segundo algumas variáveis demográficas e socioeconomicas, tendo sido identificados seus fatores de risco e as causas determinantes de sua não-detecção na triagem clínica (TC). Estudaram-se também o comportamento de doadores em relação a auto-exclusão confidencial (AEC) e os fatores determinantes desse comportamento. Participaram da pesquisa 106 doadores, predominantemente do sexo masculino e casados, com menos de 40 anos de idade e baixa escolaridade. Eram principalmente doadores de primeira vez, procedentes de Ribeirão Preto e da região de Ribeirão Preto e pertencentes aos estratos econômicos C e D. As frequencias de marcadores sorologicos positivos encontradas foram: 0,07% para o HBsAg; 0,03% para o anti-HIV; 0,13% para o VDRL; 0,21 para o anti-HCV. Cerca de 40% dos participantes assumiram ter omitido fatores de risco na TC. Os motivos mencionados foram: não se sentir a vontade para falar ou não achar relevante fazê-lo; confiar totalmente nos exames; ter como objetivo conhecer sua condição sorológica; encontrar problemas relacionados a entrevista/triador; não confiar no sigilo das informações; sentir constrangimento diante de acompanhantes. Apenas 1,9% dos participantes utilizaram a AEC, e as justificativas alegadas foram: estar se sentindo bem e, por isso, não julgar necessário; não se considerar de risco;não achar que tivesse mentido na entrevista. Os achados indicam a necessidade de mudar a abordagem dos doadores na TC, de rever os procedimentos de captação de doadores e de reavaliar profundamente os procedimentos de orientação/conscientização dos candidatos a doação, procurando tornar esses procedimentos mais eficazes. / One of the main concerns related to the safety of transfusion is the possibility of diseases/infections transmitted through blood transfusion,amongst which we may include B and C hepatitis, HIV and syphilis.This paper aimed at studying the donors who have undergone the pre-donation selection at Blood Center of Ribeirao Preto and have presented positive serological results for theses diseases/infections.We have studied the frequency of positive results amongst the individuals who have donate blood at Blood Center of Ribeirao Preto and at the Central Collection Unit, from July 1st 2005 to July 31st 2006. The individuals who have had their positive serological results confirmed at a second test were classified according to demographic and socioeconomic variables, the risk factors present amongst them were identified, as well as the determinant causes for detection failure at the clinical screening. A study on the donors\' behavior towards the confidential self-exclusion process and the determinant factors that caused such behavior was also carried out. The research reached 106 donors, most of whom were males, married, under 40 and with low level of education. Most of them were first-time donors from the City of Ribeirão Preto and surrounding towns, belonging to the C and D economic classes. The frequencies of the serological markers were: 0,07% to HbsAg; 0,03% to anti-HIV; 0,13% to VDRL; 0,21 to anti-HCV. Around 40% of the participants affirmed having omitted risk factors at the clinical screening (CS). The reasons mentioned were the following: feeling unease to talk about it or not finding it relevant; relying completely on test results; having the aim of being aware of their real serological condition; issues related to the interview or screener; lack of trust in the confidentiality of the information he/she would give; feeling constrained in the presence of their companions. Only 1.9% of the participants used the confidential self-exclusion process, and the reasons given as justifications were: being feeling well and therefore not finding it necessary; not considering himself/herself a risk; not agreeing that he/she had lied during the interview. The findings indicate the necessity of changes as to the approach to donors at the CS, the need of a review of the procedures carried out to motivate people to become donors, and a deep revaluation of the procedures for orientation/awareness by candidates as to donation, aiming at turning them more effective.
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Estudo de doadores de sangue com sorologia reagente para hepatites B e C, HIV e sífilis no Hemocentro de Ribeirão Preto / Study of blood donors with serology reactive to hepatitis B and C,HIV and syphilis at Blood Center of Ribeirao Preto.Ferreira, Oranice 27 April 2007 (has links)
Uma das maiores preocupações relacionadas a segurança transfusional é a possibilidade de transmissão de doenças infecciosas atraves de sangue transfundido, entre as quais se encontram as hepatites B e C, o HIV e a sífilis. Este trabalho teve como objetivo estudar doadores que passaram pelo processo de seleção pré-doação no Hemocentro de Ribeirão Preto e apresentaram resultados de testes sorológicos positivos para essas doenças/infecções.Estudou-se a frequencia dos resultados positivos entre os individuos que doaram sangue no hemocentro de Ribeirão Preto ou em seu posto de Coleta Central,de 1o.de julho de 2005 a 31 de julho de 2006. Os indivíduos com resultados sorológicos positivos confirmados em um segundo teste foram caracterizados segundo algumas variáveis demográficas e socioeconomicas, tendo sido identificados seus fatores de risco e as causas determinantes de sua não-detecção na triagem clínica (TC). Estudaram-se também o comportamento de doadores em relação a auto-exclusão confidencial (AEC) e os fatores determinantes desse comportamento. Participaram da pesquisa 106 doadores, predominantemente do sexo masculino e casados, com menos de 40 anos de idade e baixa escolaridade. Eram principalmente doadores de primeira vez, procedentes de Ribeirão Preto e da região de Ribeirão Preto e pertencentes aos estratos econômicos C e D. As frequencias de marcadores sorologicos positivos encontradas foram: 0,07% para o HBsAg; 0,03% para o anti-HIV; 0,13% para o VDRL; 0,21 para o anti-HCV. Cerca de 40% dos participantes assumiram ter omitido fatores de risco na TC. Os motivos mencionados foram: não se sentir a vontade para falar ou não achar relevante fazê-lo; confiar totalmente nos exames; ter como objetivo conhecer sua condição sorológica; encontrar problemas relacionados a entrevista/triador; não confiar no sigilo das informações; sentir constrangimento diante de acompanhantes. Apenas 1,9% dos participantes utilizaram a AEC, e as justificativas alegadas foram: estar se sentindo bem e, por isso, não julgar necessário; não se considerar de risco;não achar que tivesse mentido na entrevista. Os achados indicam a necessidade de mudar a abordagem dos doadores na TC, de rever os procedimentos de captação de doadores e de reavaliar profundamente os procedimentos de orientação/conscientização dos candidatos a doação, procurando tornar esses procedimentos mais eficazes. / One of the main concerns related to the safety of transfusion is the possibility of diseases/infections transmitted through blood transfusion,amongst which we may include B and C hepatitis, HIV and syphilis.This paper aimed at studying the donors who have undergone the pre-donation selection at Blood Center of Ribeirao Preto and have presented positive serological results for theses diseases/infections.We have studied the frequency of positive results amongst the individuals who have donate blood at Blood Center of Ribeirao Preto and at the Central Collection Unit, from July 1st 2005 to July 31st 2006. The individuals who have had their positive serological results confirmed at a second test were classified according to demographic and socioeconomic variables, the risk factors present amongst them were identified, as well as the determinant causes for detection failure at the clinical screening. A study on the donors\' behavior towards the confidential self-exclusion process and the determinant factors that caused such behavior was also carried out. The research reached 106 donors, most of whom were males, married, under 40 and with low level of education. Most of them were first-time donors from the City of Ribeirão Preto and surrounding towns, belonging to the C and D economic classes. The frequencies of the serological markers were: 0,07% to HbsAg; 0,03% to anti-HIV; 0,13% to VDRL; 0,21 to anti-HCV. Around 40% of the participants affirmed having omitted risk factors at the clinical screening (CS). The reasons mentioned were the following: feeling unease to talk about it or not finding it relevant; relying completely on test results; having the aim of being aware of their real serological condition; issues related to the interview or screener; lack of trust in the confidentiality of the information he/she would give; feeling constrained in the presence of their companions. Only 1.9% of the participants used the confidential self-exclusion process, and the reasons given as justifications were: being feeling well and therefore not finding it necessary; not considering himself/herself a risk; not agreeing that he/she had lied during the interview. The findings indicate the necessity of changes as to the approach to donors at the CS, the need of a review of the procedures carried out to motivate people to become donors, and a deep revaluation of the procedures for orientation/awareness by candidates as to donation, aiming at turning them more effective.
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Pesquisa de anticorpos contra estruturas citoplasmáticas do neutrófilo (ANCA) e contra o Saccharomyces cerevisiae (ASCA) na doença inflamatória intestinal / Evaluation of Antineutrophil cytoplasmic autoantibodies (ANCA) and Anti-Saccharomyces cerevisiae antibodies (ASCA) in inflammatory bowel diseaseFernando Schappo 14 May 2007 (has links)
A determinação dos marcadores sorológicos P-ANCA (anticorpo perinuclear contra estruturas citoplasmáticas do neutrófilo) e ASCA (anticorpo anti-Saccharomyces cerevisiae) auxilia de forma menos invasiva no diagnóstico da doença inflamatória intestinal (DII). O padrão de associação mais relacionado à retocolite ulceratica inespecífica (RCUI) ocorre com ASCA- (negativo) e P-ANCA + (positivo). Na doença de Crohn (DC) ocorre o contrário, ou seja, ASCA+ e P-ANCA-. O P-ANCA é determinado por imunofluorescência indireta usando neutrófilos fixados em etanol, e o ASCA através de ELISA. De forma geral, a prevalência do P-ANCA em pacientes com RCUI tem variado entre 50 e 80% e em pacientes com DC entre 10 e 30%. Controles sadios têm revelado prevalência menor que 4% e controles patológicos em torno de 8%. Alguns trabalhos mostraram ampla variação nos resultados, sugerindo além de variação genéticas, variações metodológicas de acordo com a população estudada. Foram realizadas análises no soro de 200 pacientes para pesquisa de P-ANCA e ASCA, sendo 98 com RCUI e 102 com DC. O grupo controle foi representado por 54 indivíduos sadios. Os pacientes com DII foram oriundos do ambulatório de Gastroenterologia ? Grupo de Intestino do Hospital das Clínicas Faculdade da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (HCFMUSP). A prevalência encontrada do P-ANCA na RCUI, DC e grupo controle correspondeu a 61,2%, 16,7% e 5,6% respectivamente, enquanto que a do ASCA para a DC, RCUI e grupo controle correspondeu a 52,9%, 27,6% e 5,6% respectivamente. A sensibilidade e especificidade encontrada com o padrão ASCA+/P-ANCA- para DC foi de 45,1% e 89,% respectivamente, enquanto que para o padrão P-ANCA+/ASCA- para RCUI foi de 43,9% e 91,2% respectivamente. No que diz respeito às características clínicas e demográficas, nenhuma associação com a presença dos anticorpos foi estabelecida no presente estudo, exceto quando avaliado o uso de drogas imunossupressoras e infliximab em pacientes com DC e ASCA+ , a qual se mostrou aumentada (p=0,008). Assim sendo, a determinação dos anticorpos P-ANCA e ASCA na DII possui baixa sensibilidade, mas níveis elevados de especificidade como demonstrado em outros estudos publicados. A correlação dos anticorpos P-ANCA e ASCA com características clínicas ainda permanece controversa. / The determination of serologic markers P-ANCA (perinuclear antineutrophil cytoplasmic autoantibodies) and ASCA (anti-Saccharomyces cerevisiae mannan antibodies) assists as non-invasive way on the inflammatory bowel disease (IBD) diagnosis. The most associated pattern to ulcerative colitis (UC) occurs with ASCA- (negative) and P-ANCA + (positive). In the Crohns disease (CD) is the opposite, that is, ASCA+ and P-ANCA-. Determination of P-ANCA is performed by an indirect immunofluorescence assay, using ethanol-fixed neutrophil slides and ASCA is measured by ELISA. Usually, the prevalence of P-ANCA in patients with UC has varied between 50 and 80% and in patients with CD between 10 and 30%. Healthy controls have disclosed lesser prevalence than 4% and pathological controls around 8%. Some studies had shown a wide variation in the results, suggesting both genetic and methodologic variations, according to the studied population. Serum samples were obtained from 200 patients for analysis of P-ANCA and ASCA, being 98 with UC and 102 with CD. The control group was represented by 54 healthy individuals. Patients with IBD were selected from the Department of Gastroenterology - Intestine Group of the Hospital das Clínicas of the University of São Paulo (HCFMUSP). P-ANCA prevalence found in UC, CD and control group were 61,2%, 16,7% e 5,6%, respectively, but ASCA prevalence in UC, CD and control group were 52,9%, 27,6% e 5,6%, respectively. Sensitivity and specificity achieved using ASCA+/P-ANCA- pattern for CD were 45,1% e 89,%, respectively, but P-ANCA+/ASCA- pattern for UC were 43,9% e 91,2% respectively. In this study, the current data did not support a relationship between the serological markers and clinical and demographic characteristics, except when evaluated the use of immunosuppresive drugs and infliximab in patients with CD and ASCA+, which were increased (p=0,008). Thus, the determination of antibodies P-ANCA and ASCA in the IBD gets low sensitivity, but high levels of especificity as demonstrated in other published reports. The correlation of antibodies P-ANCA and ASCA with clinical characteristics appears to be limited.
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