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Filogeografia do tubarão mako Isurus oxyrinchus utilizando marcadores moleculares do DNA mitocondrial /

Alves, Ronald Ribeiro. January 2013 (has links)
Orientador: Fausto Foresti / Coorientador: Fernando F. Mendonça / Banca: Diego Teruo Hashimoto / Banca: Paulino Martinez Portella / Resumo: Até poucas décadas atrás, a pesca de tubarões era incidental e sem efeitos significativos para as suas populações. No entanto, devido ao grande aumento no valor de suas nadadeiras na Ásia e ao declínio das populações de peixes mais tradicionais para o consumo humano, os tubarões passaram a ser alvo de pescarias em quase todo o mundo, promovendo a inclusão de diversas espécies na lista de espécies ameaçadas de extinção. Entre os tubarões mais explorados, as espécies pelágicas apresentam uma maior complexidade na avaliação e monitoramento de suas populações devido à sua distribuição em vastas áreas geográficas. Destas, o tubarão mako, Isurus oxyrinchus, com ocorrência circunglobal, está entre as principais espécies que apresentam sinais de vulnerabilidade, com tendência ao esgotamento populacional e, no entanto, avaliações que viabilizem o manejo adequado da pesca ainda são inconsistentes. Estudos relacionados à estruturação genética populacional de peixes têm contribuído substancialmente para a elucidação de questões como a variabilidade genética, distribuição geográfica, padrões de migração, estoques reprodutivos, taxonomia, sistemática e eventos históricos. Tais aspectos são especialmente relevantes para o setor pesqueiro, fornecendo subsídios para o manejo e conservação dos estoques. Considerando a urgente necessidade de controle sustentável da pesca, dificultada principalmente pela falta de informações, este estudo buscou caracterizar a estrutura genética populacional da espécie I. oxyrinchus no Oceano Atlântico, utilizando sequências da região controladora do DNA mitocondrial (D-loop). Foram analisados 144 indivíduos e a análise de 729 pares de bases nucleotídicas desta região genômica permitiu a caracterização de 27 haplótipos, sendo que 18 destes haplótipos (67%) estão compartilhados por todas as regiões amostradas. Os resultados indicam a ... / Abstract: Until a few decades ago, shark fishing was only incidental and had no significant effects on their populations. However, due to the large increase in the value of shark's fins in Asia and the decline of more traditional fish populations for human consumption, sharks became target fishing around the world, promoting the inclusion of several species in the list of endangered species. Among the most exploited sharks, the pelagic species exhibit greater complexity in the assessment and monitoring of their populations due to their distribution in broad geographical areas. From these species, the mako shark, Isurus oxyrinchus, of global occurrence, is among the main species that show vulnerability signs, with a trend to deplete population, and however, evaluations that facilitate appropriate management of fisheries are still inconsistent. Studies related to genetic structure of fish populations have contributed substantially to the elucidation of issues such as genetic variability, geographical distribution, migration patterns, reproductive stocks, taxonomy, systematics, and historical events. These aspects are especially relevant to fisheries sector, providing subsidies for the management and conservation of fish stocks. Considering the urgent need for a sustainable control of fisheries, hampered mainly by the lack of information, this study aimed to characterize the population genetic structure of the shark I. oxyrinchus in the Atlantic Ocean, using sequences of mitochondrial DNA control region (D-loop). We analyzed 144 individuals and analysis of 729 nucleotide base pairs of this genomic region allowed the characterization of 27 haplotypes, with 18 of these haplotypes (67%) being shared by all regions sampled. The results indicate the occurrence of a moderate genetic variability (π = 0.004 and h = 0.791 ± 0.029), with high population structure between the northern and southern hemispheres (FST values: ... / Mestre
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Filogeografia do tubarão mako Isurus oxyrinchus utilizando marcadores moleculares do DNA mitocondrial

Alves, Ronald Ribeiro [UNESP] 27 September 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:05Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-09-27Bitstream added on 2014-06-13T19:12:56Z : No. of bitstreams: 1 000749214.pdf: 1021607 bytes, checksum: d716daae1fd7be486189d76347e657ad (MD5) / Até poucas décadas atrás, a pesca de tubarões era incidental e sem efeitos significativos para as suas populações. No entanto, devido ao grande aumento no valor de suas nadadeiras na Ásia e ao declínio das populações de peixes mais tradicionais para o consumo humano, os tubarões passaram a ser alvo de pescarias em quase todo o mundo, promovendo a inclusão de diversas espécies na lista de espécies ameaçadas de extinção. Entre os tubarões mais explorados, as espécies pelágicas apresentam uma maior complexidade na avaliação e monitoramento de suas populações devido à sua distribuição em vastas áreas geográficas. Destas, o tubarão mako, Isurus oxyrinchus, com ocorrência circunglobal, está entre as principais espécies que apresentam sinais de vulnerabilidade, com tendência ao esgotamento populacional e, no entanto, avaliações que viabilizem o manejo adequado da pesca ainda são inconsistentes. Estudos relacionados à estruturação genética populacional de peixes têm contribuído substancialmente para a elucidação de questões como a variabilidade genética, distribuição geográfica, padrões de migração, estoques reprodutivos, taxonomia, sistemática e eventos históricos. Tais aspectos são especialmente relevantes para o setor pesqueiro, fornecendo subsídios para o manejo e conservação dos estoques. Considerando a urgente necessidade de controle sustentável da pesca, dificultada principalmente pela falta de informações, este estudo buscou caracterizar a estrutura genética populacional da espécie I. oxyrinchus no Oceano Atlântico, utilizando sequências da região controladora do DNA mitocondrial (D-loop). Foram analisados 144 indivíduos e a análise de 729 pares de bases nucleotídicas desta região genômica permitiu a caracterização de 27 haplótipos, sendo que 18 destes haplótipos (67%) estão compartilhados por todas as regiões amostradas. Os resultados indicam a... / Until a few decades ago, shark fishing was only incidental and had no significant effects on their populations. However, due to the large increase in the value of shark’s fins in Asia and the decline of more traditional fish populations for human consumption, sharks became target fishing around the world, promoting the inclusion of several species in the list of endangered species. Among the most exploited sharks, the pelagic species exhibit greater complexity in the assessment and monitoring of their populations due to their distribution in broad geographical areas. From these species, the mako shark, Isurus oxyrinchus, of global occurrence, is among the main species that show vulnerability signs, with a trend to deplete population, and however, evaluations that facilitate appropriate management of fisheries are still inconsistent. Studies related to genetic structure of fish populations have contributed substantially to the elucidation of issues such as genetic variability, geographical distribution, migration patterns, reproductive stocks, taxonomy, systematics, and historical events. These aspects are especially relevant to fisheries sector, providing subsidies for the management and conservation of fish stocks. Considering the urgent need for a sustainable control of fisheries, hampered mainly by the lack of information, this study aimed to characterize the population genetic structure of the shark I. oxyrinchus in the Atlantic Ocean, using sequences of mitochondrial DNA control region (D-loop). We analyzed 144 individuals and analysis of 729 nucleotide base pairs of this genomic region allowed the characterization of 27 haplotypes, with 18 of these haplotypes (67%) being shared by all regions sampled. The results indicate the occurrence of a moderate genetic variability (π = 0.004 and h = 0.791 ± 0.029), with high population structure between the northern and southern hemispheres (FST values: ...
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Caracterização da estrutura genética populacional do tubarão-crocodilo (Pseudocarcharias kamoharai) no Atlântico equatorial utilizando marcadores moleculares /

Ferrette, Bruno Lopes da Silva. January 2012 (has links)
Orientador: Fausto Forest / Coorientador: Rui Coelho / Banca: Alberto Ferreira de Amorim / Banca: Fernando Fernandes Mendonça / Resumo: Para o setor pesqueiro, a identificação e manutenção de estoques diferenciados são fundamentais, pela sua relação direta com a produtividade total e uso sustentável dos recursos, sendo um dos objetivos básicos para programas de controle e conservação de espécies em perigo, a conservação da variabilidade genética. Entre os tubarões mais explorados, as espécies pelágicas apresentam uma maior complexidade na avaliação e monitoramento de suas populações devido às suas distribuições em vastas áreas geográficas. Entre essas espécies, Pseudocarcharias kamoharai, popularmente conhecida como tubarão-crocodilo ou tubarão-cachorro, atinge tamanhos máximos em torno de 140 cm de comprimento total, habita profundidades máximas em torno de 600 metros e ocorre em todos os oceanos tropicais, sendo registrada no Brasil principalmente nas áreas oceânicas do Nordeste. A análise genética molecular realizada utilizando sequências da região controladora do DNA mitocondrial (D-loop) de 125 indivíduos capturados em quatro regiões distintas no Oceano Atlântico (Equatorial Oeste, Noroeste Africano, Golfo da Guiné e Sudoeste Africano) Permitiu identificar 22 haplótipos com diversidade haplotípica h=0.627 e diversidade nucleotídica π=0.00167. Estes índices são similares aos encontrados em outras espécies de tubarões pelágicos também do Atlântico e podem ser considerados dentro dos níveis médios de diversidade genética entre os tubarões. O índice de FST=0.00125 obtido nas comparações pode sugerir ausência de estruturação populacional entre os quatro grupos amostrados. Tendo em vista a contínua inclusão de espécies de tubarões na Lista Vermelha da União Internacional para a Conservação da Natureza e dos Recursos Naturais (IUCN), os resultados obtidos neste estudo podem auxiliar na gestão adequada da pesca e na conservação desta espécie no Oceano Atlântico / Abstract: For the fishing sector, the identification and delimitation of the fishing stocks constitute fundamental information due to their direct relationship to the overall productivity and sustainable utilization of the resources. This constitutes a basic objective in terms of population management and conservation of endangered species that can be represented by the conservation of the genetic variability. Among the most exploited sharks, pelagic species have a greater complexity in terms of evaluation and monitoring due to their distributions along large geographical areas. One of these species is the crocodile shark, Pseudocarcharias kamoharai, which reaches maximum sizes of around 140 cm in total length, inhabits maximum depths of around 600 meters, and occurs in all tropical oceans including in Brazil, mainly in the Northeast region. The molecular genetic analysis using sequences of the mitochondrial DNA control region (D-loop) of 125 individuals captured in four distinct regions in the Atlantic Ocean (Western Equatorial, Northwest Africa, Gulf of Guinea and Southwest Africa), allowed the identification of 22 haplotypes which revealed a haplotype diversity of h=0627 and a nucleotide diversity of π=0.00167. These indices showed to be similar to those found in other species of pelagic sharks, also from the Atlantic sites and can be considered inside of the average levels of genetic diversity among the sharks. The value of FST=0.00125 index found in the comparisons may suggest the absence of population subdivision among the four sampled regions analyzed. Given the continued inclusion of shark species in the Red List of the International Union for Conservation of Nature and Natural Resources (IUCN), the results obtained in this study may be used to help a more sustainable management of fisheries and conservation programs of this species in the Atlantic Ocean / Mestre
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Identificação e estimativa pesqueira de tubarões na costa de São Paulo (Província Argentina) utilizando marcadores genéticos

Ussami, Luis Henrique Fregadolli. January 2015 (has links)
Orientador: Fausto Foresti / Banca:Diogo Teruo Hashimoto / Banca: Renato Hajenius Ache de Freitas / Banca: Maria Rita de Cássia Barretto Neto / Banca: Vanessa Paes da Cruz / Resumo: Tubarões e raias estão atualmente entre os vertebrados mais ameaçados de extinção. Tal fato se deve principalmente à exploração pesqueira que permanece sem medidas eficientes de controle em quase todo o planeta, inclusive no Brasil. Considerando-se que cada espécie responde de forma independente às pressões ambientais e principalmente às ações humanas, é de fundamental importância para o desenvolvimento de planos de manejo adequado das suas populações e o ordenamento da exploração sustentável destes recursos que se proceda à caracterização da biodiversidade local, a avaliação das espécies mais capturadas e identificação dos táxons e populações mais suscetíveis à pesca. Contudo, especialmente para os elasmobrânquios, tais parâmetros são de difícil acesso, sobretudo devido às similaridades morfológicas entre as espécies e ainda, devido à prática pesqueira de remoção de partes dos animais como a cabeça e nadadeiras antes dos desembarques, inviabilizando a identificação da maioria das espécies. Segundo os registros de captura de elasmobrânquios elaborados pelo IBAMA nos últimos anos, apenas cerca de 20% dos indivíduos recebem alguma menção quanto à espécie, muitas vezes um nome popular que pode estar relacionado a mais de uma espécie biológica em diversos casos, sendo o restante do produto classificado apenas como cações. A utilização de ferramentas moleculares nos estudos da composição da biodiversidade tem proporcionado sua aplicação em diversas áreas, incluindo na identificação das espécies, no estudo de suas relações evolutivas e no auxílio de programas para a sua conservação. A identificação molecular com a utilização de técnicas do tipo PCR-multiplex e sequências barcode, que identificam características genéticas particulares de cada táxon estão atualmente sendo desenvolvidos e utilizados no reconhecimento das espécies, possibilitando a identificação... / Abstract: Sharks and rays are currently among the most threatened vertebrate to extinction. This is due mainly to the fact that overfishing remains without effective control measures in almost the entire planet, including Brazil. Considering that each species responds independently to environmental pressures, and mainly to human actions, it is of fundamental importance for the development of appropriate management plans and programming the sustainable exploitation of these resources, to proceed to the characterization of local biodiversity, in the assessment of the species caught, in the correct identification of taxa and the most susceptible populations to fishing activities. However, especially for elasmobranches, such parameters are difficult to access, especially due to morphological similarities between species and also because of the fishing practice of removing parts such as the head and fins before landings, making it impossible to identify the most species. According elasmobranches capture records prepared by IBAMA in recent years, only about 20% of individuals receiving some identification indication, often only a popular name that can be related to more than one biological species, with the remainder fishing product classified just as sharks. The use of molecular tools in studies of the composition of biodiversity has provided its application in various areas, including in the identification of the species, in the study of their evolutionary relationships, and in assisting programs for their conservation. The use of molecular identification techniques as the PCR-multiplex type, and barcode sequences using part of the mitochondrial gene sequence Cytochrome Oxidase subunit I that permit to identify particular genetic characteristics of each taxon, are currently being used in the species recognition allowing simultaneous identification of different samples. In the present work, the objective of the study was to identify the species occurring... / Doutor
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Caracterização da estrutura genética populacional do tubarão-crocodilo (Pseudocarcharias kamoharai) no Atlântico equatorial utilizando marcadores moleculares

Ferrette, Bruno Lopes da Silva [UNESP] 24 February 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:09Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-24Bitstream added on 2014-06-13T20:14:46Z : No. of bitstreams: 1 ferrette_bls_me_botib.pdf: 603120 bytes, checksum: f2c62ecea9610761a773e52cb38c0d94 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Para o setor pesqueiro, a identificação e manutenção de estoques diferenciados são fundamentais, pela sua relação direta com a produtividade total e uso sustentável dos recursos, sendo um dos objetivos básicos para programas de controle e conservação de espécies em perigo, a conservação da variabilidade genética. Entre os tubarões mais explorados, as espécies pelágicas apresentam uma maior complexidade na avaliação e monitoramento de suas populações devido às suas distribuições em vastas áreas geográficas. Entre essas espécies, Pseudocarcharias kamoharai, popularmente conhecida como tubarão-crocodilo ou tubarão-cachorro, atinge tamanhos máximos em torno de 140 cm de comprimento total, habita profundidades máximas em torno de 600 metros e ocorre em todos os oceanos tropicais, sendo registrada no Brasil principalmente nas áreas oceânicas do Nordeste. A análise genética molecular realizada utilizando sequências da região controladora do DNA mitocondrial (D-loop) de 125 indivíduos capturados em quatro regiões distintas no Oceano Atlântico (Equatorial Oeste, Noroeste Africano, Golfo da Guiné e Sudoeste Africano) Permitiu identificar 22 haplótipos com diversidade haplotípica h=0.627 e diversidade nucleotídica π=0.00167. Estes índices são similares aos encontrados em outras espécies de tubarões pelágicos também do Atlântico e podem ser considerados dentro dos níveis médios de diversidade genética entre os tubarões. O índice de FST=0.00125 obtido nas comparações pode sugerir ausência de estruturação populacional entre os quatro grupos amostrados. Tendo em vista a contínua inclusão de espécies de tubarões na Lista Vermelha da União Internacional para a Conservação da Natureza e dos Recursos Naturais (IUCN), os resultados obtidos neste estudo podem auxiliar na gestão adequada da pesca e na conservação desta espécie no Oceano Atlântico / For the fishing sector, the identification and delimitation of the fishing stocks constitute fundamental information due to their direct relationship to the overall productivity and sustainable utilization of the resources. This constitutes a basic objective in terms of population management and conservation of endangered species that can be represented by the conservation of the genetic variability. Among the most exploited sharks, pelagic species have a greater complexity in terms of evaluation and monitoring due to their distributions along large geographical areas. One of these species is the crocodile shark, Pseudocarcharias kamoharai, which reaches maximum sizes of around 140 cm in total length, inhabits maximum depths of around 600 meters, and occurs in all tropical oceans including in Brazil, mainly in the Northeast region. The molecular genetic analysis using sequences of the mitochondrial DNA control region (D-loop) of 125 individuals captured in four distinct regions in the Atlantic Ocean (Western Equatorial, Northwest Africa, Gulf of Guinea and Southwest Africa), allowed the identification of 22 haplotypes which revealed a haplotype diversity of h=0627 and a nucleotide diversity of π=0.00167. These indices showed to be similar to those found in other species of pelagic sharks, also from the Atlantic sites and can be considered inside of the average levels of genetic diversity among the sharks. The value of FST=0.00125 index found in the comparisons may suggest the absence of population subdivision among the four sampled regions analyzed. Given the continued inclusion of shark species in the Red List of the International Union for Conservation of Nature and Natural Resources (IUCN), the results obtained in this study may be used to help a more sustainable management of fisheries and conservation programs of this species in the Atlantic Ocean
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Identificação e estimativa pesqueira de tubarões na costa de São Paulo (Província Argentina) utilizando marcadores genéticos

Ussami, Luis Henrique Fregadolli [UNESP] 21 September 2015 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2016-09-27T13:40:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-09-21. Added 1 bitstream(s) on 2016-09-27T13:45:13Z : No. of bitstreams: 1 000869206.pdf: 1021410 bytes, checksum: f183acbdffb2ad0ddb24e51f8eabd122 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Tubarões e raias estão atualmente entre os vertebrados mais ameaçados de extinção. Tal fato se deve principalmente à exploração pesqueira que permanece sem medidas eficientes de controle em quase todo o planeta, inclusive no Brasil. Considerando-se que cada espécie responde de forma independente às pressões ambientais e principalmente às ações humanas, é de fundamental importância para o desenvolvimento de planos de manejo adequado das suas populações e o ordenamento da exploração sustentável destes recursos que se proceda à caracterização da biodiversidade local, a avaliação das espécies mais capturadas e identificação dos táxons e populações mais suscetíveis à pesca. Contudo, especialmente para os elasmobrânquios, tais parâmetros são de difícil acesso, sobretudo devido às similaridades morfológicas entre as espécies e ainda, devido à prática pesqueira de remoção de partes dos animais como a cabeça e nadadeiras antes dos desembarques, inviabilizando a identificação da maioria das espécies. Segundo os registros de captura de elasmobrânquios elaborados pelo IBAMA nos últimos anos, apenas cerca de 20% dos indivíduos recebem alguma menção quanto à espécie, muitas vezes um nome popular que pode estar relacionado a mais de uma espécie biológica em diversos casos, sendo o restante do produto classificado apenas como cações. A utilização de ferramentas moleculares nos estudos da composição da biodiversidade tem proporcionado sua aplicação em diversas áreas, incluindo na identificação das espécies, no estudo de suas relações evolutivas e no auxílio de programas para a sua conservação. A identificação molecular com a utilização de técnicas do tipo PCR-multiplex e sequências barcode, que identificam características genéticas particulares de cada táxon estão atualmente sendo desenvolvidos e utilizados no reconhecimento das espécies, possibilitando a identificação... / Sharks and rays are currently among the most threatened vertebrate to extinction. This is due mainly to the fact that overfishing remains without effective control measures in almost the entire planet, including Brazil. Considering that each species responds independently to environmental pressures, and mainly to human actions, it is of fundamental importance for the development of appropriate management plans and programming the sustainable exploitation of these resources, to proceed to the characterization of local biodiversity, in the assessment of the species caught, in the correct identification of taxa and the most susceptible populations to fishing activities. However, especially for elasmobranches, such parameters are difficult to access, especially due to morphological similarities between species and also because of the fishing practice of removing parts such as the head and fins before landings, making it impossible to identify the most species. According elasmobranches capture records prepared by IBAMA in recent years, only about 20% of individuals receiving some identification indication, often only a popular name that can be related to more than one biological species, with the remainder fishing product classified just as sharks. The use of molecular tools in studies of the composition of biodiversity has provided its application in various areas, including in the identification of the species, in the study of their evolutionary relationships, and in assisting programs for their conservation. The use of molecular identification techniques as the PCR-multiplex type, and barcode sequences using part of the mitochondrial gene sequence Cytochrome Oxidase subunit I that permit to identify particular genetic characteristics of each taxon, are currently being used in the species recognition allowing simultaneous identification of different samples. In the present work, the objective of the study was to identify the species occurring...
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A retrospective analysis of shark catches made by pelagic longliners off the east coast of South Africa and biology and life history of shortfin mako shark, Isurus oxyrinchus.

Foulis, Alan. 13 November 2013 (has links)
Oceanic pelagic shark species are under threat worldwide as fishing effort increases and they are taken as both targeted and bycatch. It is widely recognized that the life history characteristics of sharks make them inherently susceptible to overexploitation and as a result many shark-directed fisheries have collapsed. It is therefore essential that good-quality data are collected and analyzed in order to provide fisheries managers with the right information to manage these species sustainably. South Africa has a pelagic longline fishery which includes tuna-, swordfish-, and shark-directed vessels. This study analyzed logbook (1998 – 2010) and observer data (2002 – 2010) provided by the Department of Agriculture, Forestry and Fisheries in order to assess the catch composition and standardized catch-per-unit-effort (CPUE) of sharks captured as both targeted catch and bycatch. The study area consisted of four zones moving east of the 20°E meridian: the Agulhas Bank (20°E – 24°E), South Coast (25°E – 29°E), East Coast 1 (30°E – 32.8°E), and East Coast 2 (32.9°E – 36.5°E). The majority of fishing effort targeted at tuna was focused on the Agulhas Bank and consisted of foreign vessels which operated over the winter months, whereas local vessels targeted swordfish with consistent year-round effort along the upper east coast. Sharks made up 13% of total catches according to logbook data and catch composition was dominated by blue shark (Prionace glauca) and shortfin mako shark (Isurus oxyrinchus). Observer data identified a larger number of shark species than shown by logbooks, and notably, the crocodile shark (Pseudocarcharias kamoharai) made up 22.5% of shark bycatch on swordfish-directed vessels operating along the upper east coast. In addition, the observer data showed that although blue and mako shark dominated catches in the Agulhas Bank and South coast zones, carcharhinid sharks were more prevalent further east. Generalized linear models explained 54% of the variation in CPUE of shark bycatch, with year and target species being the two most important explanatory variables. The standardized CPUE index based on logbook data suggested a slightly increasing shark abundance trend between 1998 and 2010, but conversely, the index based on observer data suggested a decline between 2002 and 2010. Assuming that the observer data best reflected the actual CPUE trend (i.e. a declining trend), the increasing trend shown by logbooks over the same period most likely stems from initial under-reporting of shark capture events by skippers, followed by improved reporting in later years, thus masking the declining trend. Catch by target species revealed that swordfish vessels caught significantly more sharks per 1000 hooks than tuna vessels. The shortfin mako shark was one of the most common bycatch species, and also the primary target species of the shark-directed fishery. Generalized linear models of shortfin mako shark CPUE using the delta method produced similar trends than models of total shark bycatch; i.e. trends based on logbook data appeared stable but observer data showed a declining trend over time. Shortfin mako sharks were more abundant in the Agulhas Bank and South coast zones than along the East coast. A total of 817 shortfin mako shark samples were collected onboard a South African shark-directed pelagic longline vessel operating out of Cape Town and by the KwaZulu-Natal Sharks Board bather protection nets, set close inshore. Sharks collected inshore (from nets) were significantly larger than those collected offshore. More males than females were collected from the nets (2.3 males : 1 female), whereas the ratio for offshore samples was 1.1 : 1. Age and growth parameters were estimated from 89 sectioned vertebral samples consisting of 43 females and 46 males ranging in size from 90 cm to 299.4 cm fork length (FL). Annual band-pair deposition was assumed and growth was analyzed by fitting 3-parameter von Bertalanffy and Gompertz growth models. Parameter estimates for the Gompertz model were: K = 0.152 year¯¹ for males and 0.127 yearˉ¹ for females; L0 = 85 cm; L∞ = 295 cm for males and 315 cm for females; and longevity was 17 and 21 years for males and females respectively. Estimates for the von Bertalanffy model were: K = 0.08 yearˉ¹ for both sexes; L0 = 85 cm; L∞ = 354 cm for males and 321 cm for females; and longevity was 34 and 31 years for males and females respectively. Using these data, age and length at 50% maturity were calculated at 7 years and 199.1 cm FL for males, and 14 years and 252.8 cm for females. Litter size was in agreement with previous studies (9 to 14 pups). The gestation period was not estimated but parturition may be in late winter to spring. The stomach contents of 817 sharks showed that shortfin mako sharks are opportunistic feeders; elasmobranchs dominated in stomachs collected from sharks caught in nets near the shore (%F = 63.54%) whereas shark stomachs collected from the offshore contained mainly teleosts (70%). Length-frequency analyses revealed that large and reproductively active shortfin mako sharks were more common along the upper east coast and in the inshore environment, whereas juveniles and subadults preferred the oceanic environment, particularly over the Agulhas Bank and South Coast zones. The findings from the present study are a significant step forward towards developing a management strategy for protecting shortfin mako sharks in the South West Indian Ocean region. / Thesis (M.Sc.)-University of KwaZulu-Natal, Westville, 2013.

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