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Desenvolvimento de um novo marcador luminescente para Microcistina-LR : um estudo teórico / DEVELOPMENT OF A NEW luminescent PARAMICROCISTINA-LR: a theoretical study.Santos, Júlio Gomes dos 27 September 2010 (has links)
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / In this work we describe a theoretical study of lanthanide complexes with macrocyclic ligands. Spectroscopic properties of the cryptate [EuÌ(bipy)2py(CO2Et)2]3+.2H2O were
investigated with semiempirical methodologies such as Sparkle, INDO/S-CIS, Judd- Ofelt model as well as Malta s models implemented in LUMPAC (Luminescence Package). This computational package has turned viable the purely theoretical design of highly luminescent lanthanide complexes. We initially looked for a calculation method that better reproduced the absorption spectrum of the cryptate, finding out that AM1-p was the best candidate. This method used Sparkle/AM1 together with INDO/S-CIS. In the sequence we tested LUMPAC s efficacy using a series of trisbipyridines and
observed that the theoretical results were in good agreement to the experimental ones. Finally, we studied the cryptate EuÌ(bipy)2py(CO2Et)2]3+.2H2O and its derivatives. The theoretical intensity parameters (= 2, 4, 6) of the cryptates revealed that Eu3+ ion lies in a weakly polarizable environment. The transfer rates clearly indicated that the
energy transfer occurs predominantly from the ligand s triplet state to 5D1 and 5D0 levels belonging to Eu3+ ion. The low quantum yield values observed for all cryptates were probably due to a poor resonance between the ligand s triplet state and the emitting level from Eu3+. The most promising substituted cryptate was found to be [EuÌ3]3+, however the calculation of a cryptate conjugated with microcystin-LR did not show better results. In summary the results as a whole evidenced that the methodology employed is promising in predicting spectroscopic properties of lanthanide complexes. / Neste trabalho, realizamos um estudo teórico envolvendo complexos de lantanídeos com ligantes macrocíclicos. Investigamos as propriedades espectroscópicas do criptato
[EuÌ(bipy)2py(CO2Et)2]3+.2H2O utilizando metodologias semiempíricas, como os modelos Sparkle, INDO/S-CIS, o modelo de Judd-Ofelt e os modelos de Malta e colaboradores implementados no pacote computacional denominado LUMPAC Luminescence Package. Tal pacote tornou viável o procedimento de design puramente teórico de complexos de lantanídeos com elevada luminescência. Inicialmente buscamos a metodologia de cálculo mais adequada para o estudo, tomando como critério a reprodução do espectro de absorção do criptato, de tal forma que o método que
apresentou o melhor perfil foi o AM1-p. Este método utilizou o Sparkle/AM1 em conjunto com a metodologia INDO/S-CIS. Em seguida, testamos a eficácia do pacote computacional LUMPAC usando uma série de trisbipiridinas, verificando que os
resultados teóricos ficaram em acordo com os dados experimentais. Por fim, estudamos o criptato [EuÌ(bipy)2py(CO2Et)2]3+.2H2O e seus derivados. Os parâmetros teóricos de intensidades (= 2, 4, 6) do criptatos revelaram que o íon Eu3+ está em um ambiente pouco polarizável. As taxas de transferência indicaram claramente que a transferência
de energia ocorre predominantemente do estado tripleto do ligante para os níveis 5D1 e 5D0 do íon Eu3+. Os baixos valores observados para os rendimentos quânticos de todos
os criptatos foram devidos a uma pobre ressonância entre o estado tripleto do ligante e o nível emissor do íon Eu3+. O criptato substituído mais promissor foi o [EuÌ3]3+, contudo os cálculos do criptato conjugado com a microcistina-LR, não se mostraram melhores. Tal fato pode ser explicado considerando-se que o acréscimo no rendimento quântico do criptato é da ordem do erro do modelo. Em suma, todo o conjunto de resultados evidenciou que a metodologia empregada é promissora com relação à previsão de propriedades espectroscópicas de complexos de lantanídeos.
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Desenvolvimento de um novo marcador luminescente para Microcistina-LR : um estudo teórico / DEVELOPMENT OF A NEW luminescent PARAMICROCISTINA-LR: a theoretical study.Santos, Júlio Gomes dos 27 September 2010 (has links)
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / In this work we describe a theoretical study of lanthanide complexes with macrocyclic ligands. Spectroscopic properties of the cryptate [EuÌ(bipy)2py(CO2Et)2]3+.2H2O were
investigated with semiempirical methodologies such as Sparkle, INDO/S-CIS, Judd- Ofelt model as well as Malta s models implemented in LUMPAC (Luminescence Package). This computational package has turned viable the purely theoretical design of highly luminescent lanthanide complexes. We initially looked for a calculation method that better reproduced the absorption spectrum of the cryptate, finding out that AM1-p was the best candidate. This method used Sparkle/AM1 together with INDO/S-CIS. In the sequence we tested LUMPAC s efficacy using a series of trisbipyridines and
observed that the theoretical results were in good agreement to the experimental ones. Finally, we studied the cryptate EuÌ(bipy)2py(CO2Et)2]3+.2H2O and its derivatives. The theoretical intensity parameters (= 2, 4, 6) of the cryptates revealed that Eu3+ ion lies in a weakly polarizable environment. The transfer rates clearly indicated that the
energy transfer occurs predominantly from the ligand s triplet state to 5D1 and 5D0 levels belonging to Eu3+ ion. The low quantum yield values observed for all cryptates were probably due to a poor resonance between the ligand s triplet state and the emitting level from Eu3+. The most promising substituted cryptate was found to be [EuÌ3]3+, however the calculation of a cryptate conjugated with microcystin-LR did not show better results. In summary the results as a whole evidenced that the methodology employed is promising in predicting spectroscopic properties of lanthanide complexes. / Neste trabalho, realizamos um estudo teórico envolvendo complexos de lantanídeos com ligantes macrocíclicos. Investigamos as propriedades espectroscópicas do criptato
[EuÌ(bipy)2py(CO2Et)2]3+.2H2O utilizando metodologias semiempíricas, como os modelos Sparkle, INDO/S-CIS, o modelo de Judd-Ofelt e os modelos de Malta e colaboradores implementados no pacote computacional denominado LUMPAC Luminescence Package. Tal pacote tornou viável o procedimento de design puramente teórico de complexos de lantanídeos com elevada luminescência. Inicialmente buscamos a metodologia de cálculo mais adequada para o estudo, tomando como critério a reprodução do espectro de absorção do criptato, de tal forma que o método que
apresentou o melhor perfil foi o AM1-p. Este método utilizou o Sparkle/AM1 em conjunto com a metodologia INDO/S-CIS. Em seguida, testamos a eficácia do pacote computacional LUMPAC usando uma série de trisbipiridinas, verificando que os
resultados teóricos ficaram em acordo com os dados experimentais. Por fim, estudamos o criptato [EuÌ(bipy)2py(CO2Et)2]3+.2H2O e seus derivados. Os parâmetros teóricos de intensidades (= 2, 4, 6) do criptatos revelaram que o íon Eu3+ está em um ambiente pouco polarizável. As taxas de transferência indicaram claramente que a transferência
de energia ocorre predominantemente do estado tripleto do ligante para os níveis 5D1 e 5D0 do íon Eu3+. Os baixos valores observados para os rendimentos quânticos de todos
os criptatos foram devidos a uma pobre ressonância entre o estado tripleto do ligante e o nível emissor do íon Eu3+. O criptato substituído mais promissor foi o [EuÌ3]3+, contudo os cálculos do criptato conjugado com a microcistina-LR, não se mostraram melhores. Tal fato pode ser explicado considerando-se que o acréscimo no rendimento quântico do criptato é da ordem do erro do modelo. Em suma, todo o conjunto de resultados evidenciou que a metodologia empregada é promissora com relação à previsão de propriedades espectroscópicas de complexos de lantanídeos.
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Estudos conformacionais em compostos contendo íons lantanídeosOliveira, Maria Weruska Pereira de 13 November 2008 (has links)
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Previous issue date: 2008-11-13 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Lanthanide macrocyclic complexes, especially containing Gd(III)
ions, are largely used as contrast agents in the medical diagnostic
technique named Magnetic Resonance Imaging (MRI). Theoretical
investigation of these compounds by molecular modeling methods is an
emerging research area today.
In this work we have performed a conformational study of the
following supramolecular compounds: the macrocyclic ligands 1,4,7,10-
tetraazacyclododecane (DOTA) and 1,4,7,10-tetraazacyclododecane-
1,4,7,10-tetraacetic acid (H4DOTA) and the macrocyclic complexes
[Gd(DOTA).H2O]- and Gd(PhenHDO3A).H2O, where PhenHDO3A is (rel-10-
[(5R,6R)-5,6-dihydro-6-hydroxy-1,10-Phenanthroline-5-yl)-1,4,7,10-
tetraazacyclododecane-1,4,7-triacetic acid).
For this, we have developed and carried out a procedure that
involves: (1) the sampling of the conformation space of these compounds
through some short molecular dynamics at different temperatures and (2)
full geometry optimization in the geometries obtained in the previous
stage using semi-empirical AM1 method for the macrocyclic ligands and
Sparkle/AM1 model for the macrocyclic lanthanide complexes.
Our results revealed that the high flexibility of non-coordinated
macrocyclic ligands DOTA and H4DOTA, helped us to test the ability of our
methodology to sample different regions of conformation space of these
compounds.
For the [Gd(DOTA).H2O]- complex, we were capable to find the
same conformational isomers which were reported in published works as
well as to comprehend relevant details about the mobility of the
coordinated water molecule. Furthermore, we also were capable to
identify some intermediate local minima related to the dynamics of
rotation of the coordinated acetate groups in the studied complexes as
well as to the dynamics of ring inversion of the coordinated
tetraazadodecane moiety in the Gd(PhenHDO3A).H2O.
In conclusion, we possess now an interesting strategy to conduct the
search for conformational isomers of these compounds. This knowledge is
very important to be applied in the rational design of new molecules to act
as contrast agent in MRI. / Complexos macrocíclicos de lantanídeos, em especial com o íon
Gd(III), são cada vez mais utilizados como agentes de contrastes na
técnica médica de diagnóstico, imagem por ressonância magnética nuclear
(MRI). O estudo teórico de novos agentes de contrastes através de
modelagem molecular é uma área de pesquisa em grande expansão.
No nosso trabalho fizemos um estudo conformacional dos seguintes
compostos supramoleculares: os ligantes macrocíclicos 1,4,7,10-
tetraazaciclododecano (DOTA) e ácido 1,4,7,10-tetraazaciclododecano-
1,4,7,10-tetraacético (H4DOTA), o complexo macrocíclico
[Gd(DOTA)H2O]- e o complexo macrocíclico Gd(PhenHDO3A).H2O, onde
PhenHDO3A é (rel-10-[(5R,6R)-5,6-dihidro-6-hidroxi-1,10-fenantrolina-5-
il)-1,4,7,10-tetraazaciclododecano-1,4,7-ácido triacético).
Para isso, elaboramos e executamos um procedimento que envolve
o mapeamento ou amostragem do espaço conformacional desses
compostos através de dinâmicas moleculares curtas em diferentes
temperaturas para em seguida, essas geometrias serem usadas como
pontos de partida para otimização de geometria usando tanto o método
semi-empírico AM1 quanto o modelo Sparkle/AM1.
Como resultado, podemos citar que a elevada flexibilidade dos
ligantes macrocíclicos não coordenados DOTA e H4DOTA, serviu para
testar a capacidade da nossa metodologia de visitar regiões distintas do
espaço conformacional.
Para o complexo [Gd(DOTA)H2O]-, conseguimos encontrar os
mesmos isômeros conformacionais que já são reportados em outros
estudos, bem como revelar detalhes relativos à mobilidade da molécula de
água coordenada. Além disso, conseguimos identificar mínimos locais
intermediários que estão relacionados com a dinâmica de rotação dos
grupos acetato em ambos os complexos e a dinâmica de inversão do anel
tetraazadodecano no complexo Gd(PhenHDO3A).H2O.
A relevância desse trabalho está apoiada no fato de que agora
temos uma estratégia interessante para realizar a busca de isômeros
conformacionais desses compostos, sendo essas informações, muito
importantes quando se deseja projetar uma nova molécula para atuar
como agente de contraste em MRI.
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