Regeneration from stem and branch fragments of the moss Helodium blandowii was examined in common garden and field experiments. The treatments included one cm long terminal stem fragments and branches of one cm and half cm length with and without the terminal and their regeneration was observed in course of 3 months in the common garden experiment and 15 months in the field. Dynamics of Helodium patches was observed in course of 2 years in permanent plots of the nature reserve Ruda. Genetic stucture of all recent Czech populations of Helodium blandowii was investigated and compared with a pilot survey of populations from Scandinavia and Lithuania using the microsatellite markes developed for this study.

Regeneration from stem and branch fragments of the moss Helodium blandowii was examined in common garden and field experiments. The treatments included one cm long terminal stem fragments and branches of one cm and half cm length with and without the terminal and their regeneration was observed in course of 3 months in the common garden experiment and 15 months in the field. Dynamics of Helodium patches was observed in course of 2 years in permanent plots of the nature reserve Ruda. Genetic stucture of all recent Czech populations of Helodium blandowii was investigated and compared with a pilot survey of populations from Scandinavia and Lithuania using the microsatellite markes developed for this study.

This diploma thesis analyse economy of chosen Czech health insurance companies and the impact of a factor of demographic structure. Main part of the thesis is an analysis of economy of health insurance companies. The thesis is divided into four parts. First chapter represents theoretical base for analysis as a whole and describe health system and subjects, which take place there. Second chapter is focused on selection criteria to choose insurance companies, which are subjects to investigation and their short introduction. In the third and the central part of the work are used theoretical knowledge got from health regulation or books, especially information took from annual reports and bases institutions as ÚZIS or ČSÚ. In the final part is made evaluation of information learned and their further use.

Le denté commun, plus couramment appelé denti, Dentex dentex (Linnaeus, 1758), est un poisson marin côtier (0-200m) emblématique et patrimonial en Méditerranée. Il représente un intérêt économique important pour la pêche artisanale et récréative, en Corse en particulier. En tant que prédateur supérieur, il occupe une position clé au sommet de la pyramide trophique. Il dispose un statut de conservation en étant classé comme « Vulnérable » par l’UICN. Malgré son importance écologique et économique, les données disponibles sur cette espèce sont encore limitées. L’objectif de cette thèse vise à améliorer l’état des connaissances sur l’exploitation, la biologie et la structure de population du denti en Corse. En premier lieu, un travail de synthèse bibliographique a été effectué, qui compile toutes les informations parcellaires existantes sur la biologie, l’exploitation, et la structure de population du denti sur l’ensemble de son aire de répartition. De manière générale, il existe un manque d’information, mais à travers les axes développés, ce manuscrit fourni une vision claire de l’état des connaissances actuelles sur le denti et des lacunes qu’il reste à combler. Deuxièmement, une étude a été menée pour déterminer quels facteurs pouvaient influencer les variations spatio-temporelles des captures (CPUE) du denti par la pêche artisanale et décrire la structure démographique de la population exploitée à l’échelle de la Corse. Les CPUE ont varié dans l’espace (profondeur) et dans le temps (mois), mais ont montré une stabilité annuelle. Les résultats ont montré un pic d’exploitation (des individus grands/âgés) au mois de mai pendant la période de reproduction. Cette étude a fourni également les premières cartes à fine échelle de l’exploitation au niveau spatial du denti, avec l’identification de «hot spots», qui représentent probablement des habitats essentiels dans l’histoire de vie de cette espèce. Troisièmement, une étude a comparé l’exploitation du denti par la pêche artisanale et récréative au sein de la Réserve Naturelle des Bouches de Bonifacio. Le denti est ciblé par une grande variété d’engins, ce sont la palangre (pêche artisanale) et la traine (pêche récréative) qui présentent les taux d’exploitation les plus élevés. Au niveau spatial, les captures étaient quantitativement maximales dans les zones de protection renforcée. Les résultats indiquent que la pêche récréative contribue significativement à la mortalité par la pêche de cette espèce dans la zone d’étude (3.4 t/an soit 37 % de l’ensemble des captures). Ensuite, une comparaison de trois différentes méthodes d’estimation d’âge (écailles, otolithes entiers et sectionnés) a été effectuée pour évaluer quelle structure etait la plus fiable et précise et définir les paramètres de croissance du denti en Corse. A partir des résultats obtenus, la lecture sur écaille apparait comme fiable jusqu’à cinq ans, la lecture sur otolithe entier jusqu'à 12 ans et sur otolithe sectionné peut être employée sur toutes les tranches d'âges (âge record de 36 ans). Le taux de croissance dans l’étude est relativement élevé et semble assez rapide par rapport aux études antérieures en Méditerranée. Pour finir, le dernier chapitre avait pour but d'identifier la structure du stock de denti autour de la Corse, par une approche holistique, avec une combinaison de marqueurs : les microsatellites, l'analyse de la forme des otolithes et les communautés de parasites. L’étude a mis en lumière une structuration spatiale complexe de la population, donnant de nouvelles perspectives pour la conservation des stocks de denti en Corse. Cette thèse fourni de nouvelles connaissances sur l’exploitation, la biologie et la structure de population du denti en Corse et préconise des mesures de protection pour promouvoir une gestion durable de cette importante ressource halieutique en Corse. / The common dentex, Dentex dentex (Linnaeus, 1758), is an iconic marine coastal bony fish in the Mediterranean Sea. The common dentex, due to its large size, flesh quality, and high commercial value, is targeted by both artisanal and recreational fishing, especially in Corsica. As a top predator, it is a potential indicator species for the structure and functioning of the coastal ecosystems on which it depends. D. dentex is classified by the IUCN as «Vulnerable». Despite its economic and ecological importance, scientific data on this species in its natural environment are still very scant.The aim of this thesis is to improve the state of knowledge on fisheries, biology and population structure of D. dentex in Corsica. First, a review evaluates the current literature on D. dentex biology, ecology, stock structure, fisheries on its global geographical range. In general, there is a lack of information, but across the developed axes, this manuscript provided a clear view of the current state of knowledge on D. dentex and suggests future research directions to fill important gaps. Secondly, a study was conducted to determine which factors could influence the spatial and temporal variations in catches (CPUE) by artisanal fisheries and describe the demographic structure of the population exploited in Corsica. The CPUE varies over spatial (depth) and temporal scales (month), but show annual stability. The results exhibits a peak of exploitation during May (large/old specimens), probably related to reproductive strategies,. This study generated the first fine scale maps showing the spatial exploitation of common dentex and the identification of exploited fishing grounds clearly indicates the existence of ‘hot spots’, which probably represent essential habitats, of the life history of this species. Third, a study compared the exploitation of common dentex by artisanal and recreational fishing in the Bonifacio Strait Natural Reserve. It is targeted by a wide variety of gears; longline (artisanal fishing) and trolling (recreational fishing) have the highest rate of exploitation. Spatially, catches were quantitatively maximal in partially protected areas. The results suggest also that recreational fishing contributes significantly to total fishing mortality of the common dentex in the study area (3.4 t/year or 37 % of the total catch). Then, a comparison of three methods of age estimation (scales, whole and sectioned otoliths) was performed to evaluate which structure was the most reliable and accurate and define the growth parameters in Corsica. The scales appear suitable for estimating age between 0 and 5 years old, whole otoliths can be used up to 12 years and sectioned otoliths are the most accurate and reliable structure for all age ranges (age record of 36 years). The growth rate of the Corsican common dentex seems very high and quite fast compared to previous studies in the Mediterranean Sea. Finally, the aim of the last chapter was to identify the stock structure of the common dentex around Corsica Island, using a combination of markers that have different spatial and temporal scales of integration: microsatellite DNA markers, otolith shape analysis and parasites communities. A complex population structure around Corsican coasts has been reported, providing a new perspective on common dentex fishery stock conservation and management strategies.This thesis make a significant contribution to the knowledge of several aspects of the fisheries, biology and population structure of common dentex around Corsica Island and recommends protection measures to promote sustainable management of this important halieutic resource in Corsica.

Abstract The thesis deal is to describe disposal age and culture structure people in South Bohemia region of census 2001 to corpora map. At first deals with dilemma of GIS, cartographis means, data by age and culture strukture. The thesis deal dissect peoples structure in South Bohemia region by SLDB 2001. The thesis also contains a chapter with design leaves mapsand map printing. An the end are leaves maps with disposal GIS and commentaries to them.

Ce travail de thèse a pour objectif principal de comprendre la dynamique de l’espèce fondatrice de l’écosystème de la région de Bled Talah, ainsi que les mécanismes susceptibles de mieux comprendre ses interactions avec la végétation compagne. Des mesures dendrométriques accomplies par des essais de détermination d’âge, ont fait ressortir que le peuplement de la forêt du Bou Hedma semble naturellement suivre plutôt une certaine dynamique régressive. C’est ainsi que nos résultats démontrent plutôt la dominance des individus de grandes circonférences (des individus âgés). Les obstacles à la faible régénération naturelle de ce taxon sont, essentiellement, l’infestation des graines par les bruches, la possibilité d’un éventuel effet autoallélopathique et la dominance des interactions négatives (compétition) entre la végétation du Parc National du Bou Hedma et les jeunes plants d’Acacia. Concernant, les interactions biotiques, nos résultats ont permis d’enrichir les débats actuels sur l’importance et la direction des interactions le long des gradients de stress et de perturbation. Une dominance des interactions négatives (compétition), le long des deux gradients a été démontrée, avec une chute de l’importance de la compétition en présence d’herbivorie. Les mesures environnementales et biologiques ont permis de conclure, qu’Acacia tortilis subsp. raddiana, a un effet globalement bénéfique pour le sol, ainsi que pour la végétation naturelle environnante. Compte tenu du rôle clef de cette espèce sous les conditions contraignantes du bioclimat aride, la nécessité de minimiser le risque de la faible régénération naturelle de ce taxon est prioritaire dans les grands programmes de reboisement et de restauration des écosystèmes arides. / The main aim of this work were to understand the dynamics of the founding species of the ecosystem of the region of Bled Talah, as well as the mechanisms to understand better its interactions with the vegetation partner. Dendrometric parameters were measured for each tree then determination of age were estimated. This work improves general understanding of the factors explaining the structure of the Acacia tortilis subsp. raddiana. These species naturally seems to follow rather a certain regressive dynamics. The possible reasons for regeneration failure natural regeneration of Acacia tortilis subsp. raddiana were especially the high infestation of seeds by Bruchidius raddianae, the autoallelopathic effetcs and the dominance of the negative interactions (competition) between the vegetation of the National park of Bou Hedma and the young plantations of Acacia tree. The importance and direction of biotic interactions along environmental gradients is still a major debate in plant ecology. Through the study of biotic interactions, our results suggests the dominance of competition between nurses and target species used in this work.The results of this study confirmed the positive effect of Acacia tortilis subsp. raddiana on the understorey vegetation composition and diversity in arid ecosystems. Once, established in the dry area, this species ameliorates microclimate including soil conditions that may be suitable to the regeneration and the growth of other species. In this way, this species will provide beneficial effects to the generating seedlings in the vicinity and therfore will help rehabilitating degraded areas.

Diverses lésions ostéochondrales peuvent affecter les articulations des jeunes chevaux et réduire leurs futures performances en course. L’objectif de cette thèse est d’identifier les régions du génome, appelées locus à caractère quantitatif (QTL), associées avec des caractères mesurant l’ostéochondrose (OC) enregistrés dans le programme GENEQUIN sur une population de Trotteurs Français. Le génotypage a été réalisé à l’aide de la puce SNP Illumina BeadChip EquineSNP50, qui est dense et permet d’exploiter le déséquilibre de liaison par des analyses d’association. Ces analyses sont sujettes à certains problèmes en présence d’une structure familiale des données. Dans la première partie de la thèse, une comparaison de la puissance et de la robustesse d’un choix restreint de méthodes d’analyses est effectuée. L’originalité de ce travail réside dans la dérivation algébrique des moments des distributions des statistiques de test comparées, donnant ainsi plus de généralité à nos résultats et permettant une meilleure compréhension des différences. Les résultats peuvent notamment servir à l’optimisation du dispositif expérimental. La deuxième partie est consacrée à la cartographie des régions QTL des caractères mesurant l’OC en différents sites articulaires dans une population de 583 Trotteurs Français. Cette étude a permis de mettre en évidence plusieurs régions QTL d’effets moyens et faibles à un niveau significatif mais pas hautement significatif. Nous montrons que l’OC est un caractère polygénique et qu’aucun QTL, ayant un effet à la fois sur l’OC du jarret et l’OC du boulet, n’est détectable dans ce protocole QTL, ce qui infirme l’hypothèse simple d’une cause génétique commune de la sensibilité à cette maladie sur les différents sites anatomiques. Suite à ces travaux, l’identification des gènes candidats et des mutations causales devrait clarifier la physiopathologie moléculaire de l’OC et ainsi permettre de développer des stratégies efficaces pour l’évaluation des risques. Pendant ce temps, les marqueurs peuvent être utilisés dans un contexte de sélection assistée par marqueurs afin d’améliorer la santé et le bien-être du cheval. / Osteochondral lesions are commonly observed in young horses and may be responsible for reduced performances in racing. The purpose of the PhD thesis was to identify genome regions, called quantitative trait loci (QTL), associated with various traits measuring osteochondrosis (OC) and recorded in the GENEQUIN program in a population of French Trotters horses. Genotyping was performed using the EquineSNP50 Illumina high density chip, which allows to exploit the linkage disequilibrium with genome-wide association studies. These analyses are subject to several problems in presence of family structure. We hence first proposed a comparison of power and robustness of a limited choice of models for this type of analysis. The originality of this work lies in the algebraic derivation of the distribution moments of the test statistics compared, making the outcome of this comparison more general and allowing a better understanding of differences. The results can be used to establish an experimental design. The second part was devoted to the QTL fine mapping of traits that measure OC in different joint sites. This study highlighted several significant QTL with low and medium effects but none of them were highly significant. We showed that OC is a polygenic trait and we were not able to identify QTL affecting both OC on the hock and the fetlock, rejecting the hypothesis of a single genetic determinism of susceptibility to this desease accross anatomical sites. Further studies will now focus on the identification of candidate genes and screening for mutation in an attempt to clarify the molecular physiopathology of OC and develop efficient strategies for risk assessment. Meanwhile, markers could be used in a marker-assisted selection context to improve horse health and welfare.

Šiame bakalauro darbe nagrinėjami gyventojų struktūros ir jų ekonominės veiklos pokyčiai. Tyrimo tikslas – išnagrinėti gyventojų struktūros ir jų ūkinės veiklos pokyčius įtakojančius veiksnius bei atskleisti naujas žemo urbanizacijos lygio atokesnių vietovių darnios plėtros ir konkurencingumo didinimo galimybes. Tyrimo metodai: mokslinės literatūros ir kitų teorinių šaltinių sisteminė ir lyginamoji analizė, loginė analizė; sociologinė apklausa (anketavimas, interviu), tyrimo metu gautų duomenų matematinis ir grafinis apdorojimas ir apibendrinimas. Tryškių seniūnijos gyventojų struktūrą ir jų ekonominę veiklą bei perspektyvas tyrėme 2013 metų kovo – balandžio mėnesiais. Bakalauriniame darbe aptariami gyventojų struktūros pokyčius sukeliančių veiksnių teoriniai aspektai. Analizuojami migraciniai procesai, juos aiškinančios teorijos, jų poveikis įvairioms valstybės sritims, gyventojų struktūrai ir jų ekonominei veiklai. Taip pat apžvelgiamos migracinių procesų tendencijos ir poveikis Lietuvos valstybei. Praktinėje darbo dalyje pateikiama Tryškių seniūnijos gyventojų bei seniūnijos darbuotojų apklausos duomenų analizė, pristatoma Tryškių miestelio ekonominė ir sociokultūrinė vizija, pateikiamos išvados ir rekomendacijos. / Population‘s structure and its’ economic activity changes have been investigated in this bachelor thesis. Aim of the research – to analyze factors which cause population‘s structure and economic activity changes, also to reveal new sustainable development and competitiveness improvement opportunities for remote low urbanization level areas. Methods of investigation: systemic and comparative analysis of scientific literature and other theoretical sources; logical analysis; sociological examination (questionnaire, interview), mathematical and graphical generalization of collected data. Tryškiai local administrative unit (LAU) population’s structure, economic activity and its’ perspectives were investigated in March and April, 2013. The theoretical aspects of factors causing population’s structure changes are discussed in this bachelor thesis. Migration processes, their theories, and these processes’ impact on various state fields, and on population’s structure and its’ economic activity are analyzed. Also trends of migration processes and their impact on Lithuanian state are overviewed. T.

Pseudomonas aeruginosa est un pathogène d’origine environnementale capable de croître et de persister dans les systèmes de distribution d’eau et la plomberie. A l’hôpital, la fréquence des infections et épidémies associées aux soins dues à P. aeruginosa soulève de nombreuses questions quant à son cycle de transmission à l’homme dans l’environnement hospitalier. La situation épidémiologique du Centre Hospitalier Régional Universitaire de Montpellier a permis d’établir une collection de 730 souches de P. aeruginosa isolées durant une période de 9 ans. Cette collection est représentative des différentes niches environnementales et de deux périodes épidémiologiques marquées. Les souches cliniques impliquées dans des phénomènes épidémiques et des infections graves ont aussi été collectées. L’analyse génétique et phénétique de cette collection a pour objectif de mieux comprendre la structure, la dynamique et la persistance des populations de P. aeruginosa dans divers réservoirs environnementaux hospitaliers ainsi que les relations entre les réservoirs environnementaux et le succès épidémiologique des populations de P. aeruginosa.L’analyse intégrée des données obtenues dans les trois parties de cette étude convergent vers les résultats principaux suivants. Les réservoirs environnementaux médico-technologiques présentent une forte dynamique avec des phénomènes d’émergence clonale en relation avec les traitements réalisés sur les réseaux. A l’échelle d’un hôpital, le réservoir environnemental est directement impliqué dans les phénomènes épidémiques. La rupture du cycle homme/environnement par des barrières physiques conduit à un changement de situation épidémiologique avec une limitation de l’importance et de la fréquence des épidémies clonales. De plus, les souches les plus ubiquitaires et les plus persistantes dans l’environnement correspondent aux génotypes à fort risque épidémique local et mondial ou clones EHR (Epidemic High Risk). La structure de population de P. aeruginosa au sein de l’hôpital est similaire à celle de la population mondiale ou à celle décrite dans d’autres études : une structure épidémique avec la recombinaison qui a un effet prépondérant sur l’émergence des lignées. Le clone EHR majoritaire ST308 est plus résistant aux antibiotiques que les clones prévalants dans l’hôpital mais non impliqués dans des épidémies. Toutefois, la caractérisation de 46 souches du clone EHR majoritaire, ST308, montre une extrême variabilité au sein du génotype avec, en particulier, des comportements divers en termes de résistance aux antibiotiques. La forte capacité de formation de biofilm et la faible motilité décrites dans la littérature comme caractéristique des clones EHR ne sont pas observées dans cette étude. Notre principale hypothèse est que le succès épidémique du clone EHR ST308 dans l’hôpital est lié à sa diversité intraclonale plutôt qu’à un caractère particulier partagé par toutes les souches EHR.Ce travail apporte des arguments forts en faveur de l’implication des réservoirs environnementaux hospitaliers dans les épidémies d’infections associées aux soins dues à P. aeruginosa. Dans le but de mieux contrôler ces épidémies, les résultats de cette étude incitent à la surveillance des clones EHR de P. aeruginosa quel que soit leur profil de résistance aux antibiotiques et à mettre en place des mesures barrières entre l’environnement hydrique et le patient dès qu’un réservoir environnemental d’EHR se constitue.Mots clés : Pseudomonas aeruginosa, infections associées aux soins, épidémie, environnement, réseau d’eau, structure de population, clone à haut risque épidémique, résistance aux antibiotiques, biofilm, motilité, variabilité intraclonale, adaptation / Pseudomonas aeruginosa is an environmental pathogen that growths in water and plumbing systems. In hospital, the rate of healthcare associated infections (HAIs) and outbreaks caused by P. aeruginosa raised questions about the cycle of its transmission to human beings in the hospital environment. P. aeruginosa epidemiology at the Montpellier Academic Hospital allowed to collect 730 strains isolated over a 9-years period. This collection is representative of various environmental niches and two marked epidemiological periods. Clinical strains involved in outbreak events and serious infections were also included in the study. Genetic and phenetic analysis were performed with the aim to understand structure, dynamics and persistence of P. aeruginosa populations in various hospital reservoirs as well as the relationships between environmental reservoirs and epidemic success of P. aeruginosa.The experimental study, organized in 3 parts, produced the following major results. Medical and technological reservoirs of P. aeruginosa are highly dynamic and clonal emergence occurs in these systems, particularly in relation with networks decontamination by biocides. At the hospital scale, environmental reservoirs are directly involved in outbreak events. Physical barriers between water and patients cut the cycle of transmission from environment to human and markedly changed the epidemiology with a decrease of outbreaks in frequency and incidence. Moreover, the most ubiquitary strains that also persists in environment correspond to Epidemic High Risk (EHR) clones that succeed locally and globally. Population structure of P. aeruginosa within the hospital is similar to the worldwide population or to more local populations previously described: an epidemic structure with a background of recombinations involved in lineages emergence. The major EHR clone ST308 is more resistant to antibiotics than other prevalent clones not involved in outbreaks. However, the study of 46 strains in ST308 showed extreme within genotype variability, particularly various behaviours against antimicrobial agents. Increased ability to form biofilm and decreased motility have been described in literature as specific traits of EHR clones but it is not observed in this study. Our main hypothesis is that epidemic success of EHR clone ST308 in the hospital was linked to its diversity and versatility rather than to specific characters shared by all EHR strains.This study provides strong arguments in favour of the involvement of P. aeruginosa environmental reservoirs in HAI outbreaks. For a better control of these outbreaks, a surveillance of EHR clones of P. aeruginosa should be implemented independently to their antibiotic resistance. Moreover, barriers between environment and patient should be established as soon as an environmental reservoir of EHR clone is detected.Key words : Pseudomonas aeruginosa, Healthcare Associated Infections, outbreak, environment, water network, population structure, epidemic high risk clone, resistance to antibiotics, biofilm, motility, intraclonal variation, adaptation

In killer whales, fish- versus mammal-eating ecological differences are regarded as key ecological drivers of sociality, but the potential influence of specific target prey characteristics remains unclear. This thesis aimed to study the social patterns and dynamics of Icelandic killer whales feeding upon herring, a schooling prey that undergoes frequent changes in distribution and school size. I used a multi-disciplinary approach combining photo-identification and genetic data to understand the sociality, role of kinship and genetic differentiation within the population. Individuals sighted in summer-spawning and overwintering herring grounds during at least five separate days (N = 198) were considered associated if photographed within 20 seconds of each other. Photo-identified individuals were genotyped (N = 61) for 22 microsatellites and mitochondrial DNA control region (611 bp). The population had weak but non-random associations, fission-fusion dynamics at the individual level and seasonal patterns of preferred associations. The society was significantly structured but not hierarchically. Social clusters were highly diverse and, whilst kinship was correlated with association, it was not a prerequisite for social membership. Indeed, some cluster members had different mitochondrial haplotypes, representing separate maternal lineages. Individuals with different observed movement patterns were genetically distinct, but associated with each other. No sex-biased dispersal or inbreeding was detected. This study revealed that the Icelandic population has a multilevel society without clear hierarchical tiers or nested coherent social units, different from the well-studied salmon- (‘residents') and seal-eating populations in the Northeast Pacific. In the Icelandic population kinship drives social structure less strongly than in residents. These findings suggest effective foraging on schooling herring in seasonal grounds promotes the formation of flexible social groupings which can include non-kin. Killer whale sociality may be strongly influenced by local ecological context, such as the characteristics of the specific target prey (e.g., predictability, biomass, and density) and subsequent foraging strategies of the population.