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Analise genômica comparativa e reconstrução metabolica da Klebsiella pneumoniae Kp13 / Genomic comparative analysis and metabolic reconstruction of Klebsiella Pneumoniae kp13

Ramos, Pablo Ivan Pereira 20 August 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-04T18:57:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Pablo Ivan Pereira Ramos.pdf: 9216448 bytes, checksum: 4c970a807133990330fd4cfafe423eaf (MD5) Previous issue date: 2012-08-20 / Klebsiella pneumoniae é uma enterobactéria Gram-negativa frequentemente associada a surtos de infeções hospitalares em todo o mundo. Esta bactéria possui um amplo repertório de genes de resistência e virulência, os quais lhe permitem evadir o sistema imune do hospedeiro (atraées do polissacardeo capsular [CPS]) e resistir a antimicrobianos (pela expressão de bombas de efuxo e enzimas B-lactamases, por exemplo). Sendo assim, o conhecimento deste repertório é condição sine qua non para a elaboração de estrat égias de controle deste patógeno, e o campo da Bioinformática, através da genômica comparativa, fornece o ferramental necessário a este propósito. O sequenciamento de um isolado brasileiro de K. pneumoniae, denominado Kp13, obtido durante um surto hospitalar ocorrido no Sul do país em 2009, representou o ponto de partida deste trabalho. Objetivou-se (i) analisar, comparativamente, o genoma do isolado Kp13 com o de outras K. pneumoniae disponíveis nos bancos de dados públicos, com foco específico no repertório de genes de virulência e resistência, bem como identficar regiões de "plasticidade genômica" no cromossomo de Kp13; (ii) estudar o cluster cps (cpsKp13) para síntese do CPS do isolado Kp13; (iii) realizar a reconstrução do metabolismo de pequenas moléculas deste isolado, manualmente refinando a rede metabólica e modelando-a sob a forma de grafo; a partir da rede reconstruída, determinar suas características topológicas e identificar nós que podem ser considerados pontos de "estrangulamento" do metabolismo de Kp13 e que representam possíveis alvos para antimicrobianos. Os resultados da analise comparativa revelaram a grande plasticidade existente entre os genomas de K. pneumoniae e do isolado Kp13 especificamente. Foram identificados genes relacionados a resistência, tais como bombas de efluxo pertencentes as cinco principais famílias de transportadores e que podem estar envolvidas na resistência a uma ampla gama de antimicrobianos, corroborando o fenótipo de multirresistência apresentado por Kp13. Genes governando a expressão de enzimas responsáveis pela síntese de enterobactina e yersiniabactina, sideróforos importantes para a aquisição de ferro, foram igualmente identificados e podem contribuir para a virulência deste isolado. Onze regiões de plasticidade foram detectadas com relação a outras K. pneumoniae, muitas destas possuindo características de transferência horizontal, como a presença de transposases e elementos de fagos. A análise de cpsKp13 revelou uma estrutura singular dentre os demais loci cps previamente estudados, a exemplo de uma composição única de glicosiltransferases, e a inversão do gene wzy. Foram identificadas vias metabólicas que podem levar à síntese de diversos resíduos de monossacarídeos potencialmente presentes na composição do CPS de Kp13. A reconstrução do metabolismo de Kp13 e sua representação na forma de grafo permitiram a identificação de nós importantes e que representam potenciais alvos terapêuticos para o controle deste patógeno. O ranqueamento destes nóos com base em sua centralidade permitiu priorizar àqueles possuindo maior influência no metabolismo da bactéria. A aplicação de ferramentas de bioinformáatica ao estudo do genoma de K. pneumo- niae Kp13 permitiu identificar o seu repertório de virulência e resistência, e representa o primeiro estudo deste tipo realizado em um isolado brasileiro. O sequenciamento de bactérias obtidas em outros locais do país pode contribuir para a identificação das características em comum entre as K. pneumoniae circulantes no Brasil, e este trabalho representa um passo inicial neste sentido.
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Análise da implementação da porta Toffoli em sistemas com imperfeições / Analyzing the implementation of the Toffoli gate in systems with imperfections

Moqadam, Jalil Khatibi 30 August 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-04T18:57:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_de_Doutorad--Jalil_Khatibi_Moqadam.pdf: 1436910 bytes, checksum: b9b764cc6fff54e55232108ba8b66c73 (MD5) Previous issue date: 2013-08-30 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cientifico e Tecnologico / In this thesis, the performance of the Toffoli gate under the influence of imperfections is studied. After giving a brief introduction to quantum computing and quantum control theory, superconducting charge qubits and their couplings to the transmission line resonator are discussed. Then, the implementation of the Toffoli gate in a chain of three superconducting transmon qubits, using quantum control methods, is reviewed. Having established the gate, the noise is introduced in the interqubits interactions. The coupling constants are then no longer fixed, instead, they fluctuate around average values obeying some given probability density functions characterizing the dynamical-imperfection case. The static-imperfection case in which the values of the coupling constants are not exactly known is also considered. Finally, a more robust gate is designed by modifying the quantum optimization problem using some weighted average fidelity as the objective functional. / Neste trabalho, o desempenho da porta Toffoli sob a influência de imperfeições é estudada. Depois de dar uma breve introdução a computação quântica e teoria de controle quântico, os qubits supercondutores de tipo de carga e seus acoplamentos a um ressonador da linha de transmissão são discutidos. Em seguida, a execução da porta Toffoli numa cadeia de três qubits supercondutores de tipo transmon, utilizando métodos de controle quântico, é revisada. Tendo estabelecido a porta, o ruído e introduzido nas interações entre os qubits. As constantes de acoplamento, então, não ficam fixas, flutuam em torno de valores médios e obedecem a algumas funções de densidade de probabilidade conhecidas que caracterizam o caso da imperfeição dinâmica. O caso da imperfeição estática no qual os valores das constantes de acoplamento não são conhecidas com precisão é também considerado. Finalmente, uma porta mais robusta e projetada com uma modificação do problema de otimização quântico usando uma fidelidade media ponderada como funcional objetivo.
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Simulação do protocolo médico de punção pleural com realidade virtual / Pleural puncture medical protocol simulation ssing virtual reality

Corrêa, Ellen dos Santos 09 August 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-04T18:57:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissertacaoEllenCorrea.pdf: 9749144 bytes, checksum: 89fe6968016fd6c546c16b922bf067c5 (MD5) Previous issue date: 2012-08-09 / This work describes the fundamental elements of medical simulations. It also documents a medical training prototype that was developed. Such prototype is composed of 3d models of a surgery room, anatomical models of a patient as well as models of a medical crew. The prototype also allows one to perform actions linked to the medical training of the pleural puncture. Finally, the prototype contains an evaluation agent that verifies the performance of the users while performing the medical procedure. This work goes on to evaluate the usability of a head mounted display in a medical simulation when compared with a simpler solution that uses just a LCD display. / Este trabalho descreve os elementos fundamentais para a construção de um sistema para simulação médica e o desenvolvimento de um protótipo de um ambiente de realidade virtual para treinamento médico. O protótipo inclui modelos 3D de uma sala de cirurgia, da anatomia do paciente virtual e da equipe médica, bem como os módulos de software necessários para simular o treinamento médico no protocolo do procedimento de punção pleural. O sistema possui ainda um agente avaliador capaz de acompanhar o desempenho dos usuários nas etapas necessárias do procedimento médico. Além disso, avaliamos a usabilidade de um capacete de realidade virtual neste tipo de aplicação, através de testes comparativos com uma solução mais simples que utiliza apenas um monitor convencional como saída de vídeo.
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Algoritmos baseados em cadeias de Markov quânticas / Algorithms based on quantum Markov chains

Santos, Raqueline Azevedo Medeiros 14 March 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-04T18:57:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 thesis_final_raqueline.pdf: 1818351 bytes, checksum: 040ff54327a69213f7a1ff0da4a7fd7a (MD5) Previous issue date: 2014-03-14 / Quantum Markov chains or quantum walks have been playing an important role in the development of efficient quantum algorithms. Therefore, studying its properties, analyzing its behavior in different topologies, and seeing the impact of decoherence on these walks and its algorithms is fundamental to the development of the area. In this context, we contribute through the analysis of the following issues. For Szegedy's quantum walk, we analytically study its behavior in the cycle; we describe how to calculate the limit distribution by providing examples for the two-dimensional grid, cycle and complete graph; we study a model of decoherence inspired by percolation, where we define the decoherent quantum hitting time and we establish a intensity range of decoherence where the decoherent quantum hitting time is quadratically smaller than the classic; the detection algorithm has a quadratic gain for the same range, under the action of decoherence. For the coined quantum walk, we present simulations of the algorithm for evaluating boolean formulas, also considering a faulty oracle model. / As cadeias de Markov quânticas ou passeios quânticos tem desempenhado um papel importante no desenvolvimento de algoritmos quânticos eficientes. Dessa forma, estudar suas propriedades, analisar o seu comportamento em diferentes topologias, e ver o impacto da descoerência sob esses passeios e seus algoritmos e fundamental para o desenvolvimento da area. Nesse contexto, contribuímos com a analise das seguintes questões. Para o passeio quântico de Szegedy, estudamos analiticamente o seu comportamento no ciclo; descrevemos como calcular a distribuição limite apresentando exemplos para a malha bidimensional, grafo completo e ciclo; estudamos um modelo de descoerência inspirado em percolação, em que definimos o tempo de alcance quântico descoerente e estabelecemos um intervalo da intensidade de descoerência em que o tempo de alcance quântico descoerente e quadraticamente menor que o clássico; o algoritmo de detecção sob ação da descoerência continua com ganho quadrático para o mesmo intervalo. Para o passeio quântico com moeda, presentamos simulações do algoritmo para avaliar fórmulas booleanas, também considerando um modelo de oráculo defeituoso.
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Identificação de parâmetros em modelos ecológicos

GUERRA, Renato Borges January 1982 (has links)
Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2018-04-12T17:35:53Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_IdentificacaoParametrosModelos.pdf: 887694 bytes, checksum: bfde1ad38f06b5e3d7ff62cfbd701be1 (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2018-05-04T14:07:49Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_IdentificacaoParametrosModelos.pdf: 887694 bytes, checksum: bfde1ad38f06b5e3d7ff62cfbd701be1 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-04T14:07:49Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_IdentificacaoParametrosModelos.pdf: 887694 bytes, checksum: bfde1ad38f06b5e3d7ff62cfbd701be1 (MD5) Previous issue date: 1982 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Nos modelos de crescimento populacional aparecem parâmetros que precisam ser estimados de modo a ajustar estes modelos a dados observados. Estes modelos são expressos por sistemas de equações diferenciais não lineares as quais, geralmente, não podem ser explicitamente resolvidas, tornando assim, difícil o processo de estimação de parâmetros. Desta forma, o objetivo deste trabalho é estimar parâmetros em modelos discretos, obtidos com fundamento nos modelos anteriormente citados, e escolher a melhor técnica para isto. Sendo assim, no Capítulo I, com o propósito de motivação, é feito um estudo do modelo de crescimento populacional de duas espécies, competindo pelos mesmos recursos limitados, para mostrar a importância dos parâmetros. Em seguida o problema é formulado. No Capítulo II, devido às características próprias do modelo, o problema é abordado como um problema de estimação de parâmetros lineares. Por este motivo é feita urna descrição do método dos quadrados mínimos linear. No Capítulo III é mostrado que o problema considerado é um problema de estimação de parâmetros não lineares e em seguida é apresentado o método de Levenberg--Marquardt o qual é específico para resolver problemas deste tipo. Devido à não simplicidade do cálculo das derivadas, exigidas por este método, é mostrado também como foram obtidas estas derivadas. As dificuldades encontradas na aplicação de métodos que usam derivadas para resolver problemas do tipo considerado são citadas no Capítulo I. Assim é apresentado, neste capítulo, o método de Bremermann o qual dispensa o cálculo das derivadas e tem se mostrado, conforme o próprio autor, eficiente na resolução de problemas de estimação de parâmetros não lineares. Finalmente, no Capitulo V, são mostrados os resultados obtidos com os sistemas testes considerados e é feita a comparação entre os métodos citados.
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Fenologia foliar da floresta Amazônica de terra firme por imagens digitais RGB

Lopes, Aline Pontes 18 March 2015 (has links)
Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-01-04T18:06:08Z No. of bitstreams: 2 Dissertação_Aline Pontes Lopes.pdf: 1051137 bytes, checksum: e3b333b260d053615da964dd23970780 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-04T18:06:08Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação_Aline Pontes Lopes.pdf: 1051137 bytes, checksum: e3b333b260d053615da964dd23970780 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-03-18 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / Financiadora de Estudos e Projetos - Finep / Leaf phenology may drive seasonal variation in canopy-scale photosynthetic capacity and carbon flux in the Central Amazon. Visual monitoring of leaf flush from the forest floor is time consuming and difficult against an overcast sky. Seasonal trends of vegetation indices from orbital sensors have been challenged due to artifacts from seasonal trends in solar illumination angle. Tower-mounted RGB cameras are an attractive alternative. The Green Chromatic Coordinate (GC = green brightness divided by summed brightness of the three RGB channels) has been employed for this purpose. However, subtle seasonal change of tropical forest GC at landscape-scale may be of smaller amplitude than artifacts related to color balance, crown shadow size, illumination angle, exposure speed and sensor drift. Furthermore, gradual change in GC is affected by both leaf age and leaf amount. Nonetheless, abrupt GC change of large amplitude occurs at the individual crown scale and can be reliably attributed to massive leaf flush or leaf loss events. We analyzed a full year of daily images from an RGB camera mounted 50 m above the forest canopy at the Amazon Tall Tower site (59.0ºW, 2.1ºS), on a well-drained plateau. We minimized artifacts by maintaining the sun behind the camera, accepting only images with diffuse illumination, by giving equal weight to each tree crown and by radiometric inter-calibration of all selected images against a standard. For each of 267 individual crown areas we then prepared a greenness timeline of daily GC values. Eighty-two percent of these upper canopy crowns showed a clear episode of rapid and massive leaf flush (smoothed GC slope >0.01/month, sustained for at least 0.5 month and peaking above 75th percentile of daily GC values) and 30% showed massive rapid leaf drop (smoothed GC slope <-0.01/month, sustained for at least 0.5 month, ending below 25th percentile of daily GC values). Flushing was strongly concentrated in the five driest months (50% of all crowns) compared to the five wettest months (10% of all crowns). This contradicts the recently proposed photo-period control over humid equatorial tree phenology. Trees with both abrupt leaf drop and abrupt leaf flush reached minimum greenness 26 +/- 16 days prior to maximum greenness, indicating that leaf drop was a brief preamble to dry season leaf flush. / A fenologia foliar tem sido apontada como vetor da sazonalidade da capacidade fotossintética do dossel florestal e do fluxo de carbono na Amazônia Central. O monitoramento visual a partir do chão é demorado e difícil, sobretudo, contra um céu nublado. Mudanças sazonais nos índices de vegetação obtidos por sensores orbitais têm sido questionados devido a tendências sazonais no ângulo de iluminação solar. Câmeras RGB montadas em torres são uma atrativa opção. A coordenada cromática verde (GC = brilho no canal verde dividido pela soma do brilho dos três canais RGB) tem sido empregada para este propósito. Entretanto, sutis mudanças sazonais no GC das florestas tropicais em escala de paisagem podem ter menor amplitude do que os artefatos relacionados com o balanço de cores, tamanho da sombra das copas, ângulo de iluminação, velocidade de exposição e deriva do sensor. Além disso, mudanças graduais no GC são afetadas tanto pela idade das folhas quanto pela quantidade de folhas. Mesmo assim, mudanças abruptas e de grande amplitude no GC ocorrem em escala de copas individuais e podem ser atribuídas com confiança a eventos de massiva emissão ou perda foliar. Nós analisamos um ano de imagens diárias obtidas por uma câmera RGB instalada a 50 metros acima do dossel florestal no sítio Observatório de Torre Alta da Amazônia (59.00ºW, 2.14ºS), em um platô bem drenado. Nós minimizamos os artefatos mantendo o sol atrás da câmera, aceitando apenas imagens de iluminação difusa, dando peso igual a cada uma das copas e procedendo a intercalibração radiométrica de todas as imagens selecionadas contra uma imagem padrão. Para cada uma das 267 áreas de copas individuais, nós então preparamos uma linha temporal do verdor com valores diários de GC. Oitenta e dois por cento destas copas do dossel superior mostrou um claro episódio de rápido e massivo flush foliar (inclinação suavizada do GC > 0,01/mês, sustentada por pelo menos 15 dias, culminando acima do 75º percentil dos valores diários do GC) e 30% mostrou uma perda rápida e massiva de folhas (inclinação suavizada do GC < -0,01/mês, sustentada por pelo menos 15 dias, atingindo valores abaixo do 25º percentil dos valores diários do GC). O flush foliar foi fortemente concentrado nos cinco meses mais secos (50% de todas as copas) comparado com os cinco meses mais chuvosos (10% de todas as copas). Isto contradiz o recentemente proposto controle por fotoperíodo na fenologia foliar das árvores na região equatorial úmida. Árvores com abrupta perda e emissão de folhas atingiram o seu verdor mínimo 26 +/- 16 dias antes do verdor máximo, indicando que a perda de folhas foi um rápido preâmbulo para o flush foliar na estação seca.
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Estoques de biomassa em diferentes cenários de uso da terra ao norte de Manaus, Amazônia Central brasileira

Wandelli, Elisa Vieira 10 December 2008 (has links)
Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-01-22T17:54:05Z No. of bitstreams: 2 Tese_Elisa Vieira Wandelli.pdf: 1727678 bytes, checksum: 398967f71ab87e58525f4f04d1cafba0 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-22T17:54:05Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese_Elisa Vieira Wandelli.pdf: 1727678 bytes, checksum: 398967f71ab87e58525f4f04d1cafba0 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2008-12-10 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / The high primary productivity of secondary vegetation (capoeira) and the large extent and continued presence of this land cover in the agricultural landscape of Amazonia indicate the capacity of this vegetation to absorb substantial amounts of carbon from the atmosphere. In order to calculate these flows and stocks of carbon and to remunerate the environmental services of secondary vegetation, indirect models of biomass estimation are needed that are adapted to the range of sucessional conditions in each region. We investigated the effects of different forms of land use among rural settlers on aboveground biomass estimates and the chronological progression of biomass accumulation in abandoned pastures in small rural properties in the Tarumã Mirim settlement near the city of Manaus in Central Amazonia. We developed mathematical models using total height and diameter at breast height of all plants and indices related to the use history of the land to estimate plant biomass in 24 plots used by rural settlers. Biomass data were obtained using destructive sampling of all plants with diameter at breast height > 1 cm in secondary vegetation ranging from 1 to 15 years of age that had been used as pasture and agriculture. With these data we developed monospecífic allometric equations for 13 species and multispecífic equations for a group of 121 species of trees, for a group of 12 species of bushes and for dead plants that remain standing. We also developed indirect methodologies of estimate biomass stocks in capoeiras through less-difficult nondestructive methods. The rate and the accumulation of biomass from the 3rd to the 21st year of age of secondary vegetation established in degraded pastures were indirectly appraised using the allometric equations we developed. A continuous inventory of the degraded pastures was carried out annually in permanent plots in capoeiras with three different use intensities. Both the amount of accumulated biomass and the florístic richness in abandoned pastures are higher when the areas had been subjected to less time under grazing. The biomass stock is determined more by the intensity of previous use than by the age of the capoeira. Along course of succession the rates of biomass accumulation are not linear, there being a high degree of interannual variation, with stagnation and even biomass loss in the secondary vegetation plots during years with severe droughts. Variation of capoeira management practices by settlers with different profiles also affected the biomass accumulation. Settlers who were living in cities prior to moving to the rural area showed poor knowledge of capoeira management practices and burned the capoeira too early (< 2 years of fallow time). At this age the capoeira has not produced enough biomass to increase soil fertility and to maintain it over the long term. These urban-originated settlers do not associate the practice of fallowing with the recovery of soil fertility through natural regeneration. This study contributes to the understanding of biological and social factors that determine sucessional processes in the agricultural landscape of central Amazonia. / A alta produtividade primária e a ampla distribuição da vegetação secundária (capoeira) na paisagem agrícola da Amazônia indicam o potencial desta cobertura vegetal de absorver quantidades significantes de carbono da atmosfera. Para poder calcular estes fluxos e estoques de carbono e remunerar os serviços ambientais da vegetação secundária deve-se usar modelos indiretos de estimativa de biomassa ajustados às amplitudes de condições sucessionais de cada região. Foram investigados os efeitos de diferentes formas de uso da terra nos estoques e nas taxas de acúmulo de biomassa das capoeiras originadas de agricultura e pastagens abandonadas de propriedades rurais do Assentamento Tarumã Mirim e em áreas de pastagens degradadas abandonadas da Estação Experimental da Embrapa (AM), na Amazônia Central. Foram desenvolvidos modelos matemáticos a partir da altura total, diâmetro à altura do peito (DAP) e histórico de uso da terra em 24 capoeiras para estimar a biomassa de árvores e o estoque de biomassa de áreas de vegetações secundárias. Dados de biomassa foram obtidos por metodologia destrutiva através da pesagem de todas as plantas com DAP superior a 1 cm em capoeiras com idades de 1 a 15 anos originadas de áreas de agricultura e pastagens abandonadas. Com estes dados foram desenvolvidas equações alométricas monoespecíficas para 13 espécies e equações multiespecíficas para um conjunto de: 121 espécies arbóreas; 12 espécies arbustivas; e plantas mortas que permanecem em pé. A taxa e o acúmulo de biomassa do 3o ao 21o ano de idade de vegetações secundárias estabelecidas em pastagens degradadas foram avaliados indiretamente com as equações alométricas desenvolvidas. Medições contínuas das pastagens degradadas foram realizadas anualmente em parcelas permanentes de capoeiras com três diferentes intensidades de uso. A biomassa acumulada e a riqueza florística em pastagens abandonadas são maiores quanto menor o tempo em que a área foi submetida ao pastejo. O estoque de biomassa foi determinado mais em função da intensidade de uso do que da idade da capoeira. Ao longo da sucessão as taxas de acúmulo de biomassa não são lineares, tendo grandes variações interanuais. Nos anos em que a seca é crítica há estagnação e até perda de biomassa nas parcelas de vegetação secundária. Variações nas práticas de manejo de capoeira entre agricultores também afetam o acúmulo de biomassa. A maioria dos agricultores assentados que não têm origem agrícola não associam a prática de pousio à recuperação da fertilidade do solo através da regeneração natural. Considerando o valor irrisório por tonelada de carbono pago pelo mercado internacional e a média da extensão da área de vegetação secundária por propriedade de 0,91 ha e a duração media de pousio de 1,9 anos no Assentamento Tarumã Mirim, o que uma família rural lucraria pelo carbono acumulado pela capoeira não representaria compensação financeira suficientemente atrativa. Se o mercado passar a ter um valor diferenciado para o carbono fixado pela agricultura familiar, e considerar os plantios agroflorestais e, principalmente, o desmatamento evitado, a comercialização do carbono agregaria valor às atividades produtivas sustentáveis. Este trabalho contribui com o entendimento dos fatores ecológicos e sociais determinantes dos processos sucessionais na paisagem agrícola da Amazônia Central.
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Flush foliar na estação seca em floresta de terra firme na Amazônia central via webcam

Marostica, Suelen Jorge Felizatto 19 July 2011 (has links)
Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-02-11T15:04:28Z No. of bitstreams: 2 Dissertação_Suelen Jorge Felizatto Marostica.pdf: 1026296 bytes, checksum: 36ee71cfff46dbaa799cf8fce9696935 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-11T15:04:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação_Suelen Jorge Felizatto Marostica.pdf: 1026296 bytes, checksum: 36ee71cfff46dbaa799cf8fce9696935 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2011-07-19 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / There is an ongoing debate about the response of Amazon forests to extreme and to normal seasonal drought. Satellite observed Amazon green-up during the 2005 drought remains controversial, with green-up attributed by some to cloud/aerosol contamination. Satellite detection of dry-season green-up in years of normal rainfall is also confounded in the southern Amazon by decreasing solar zenith angle. To address these concerns by direct assessment of changes in the forest canopy, a high-resolution (1028x720p) 3-band video camera was mounted 54 m above the forest floor on an eddy covariance tower 60 km north of Manaus. Camera aim was south, perpendicular to the solar transit, with an oblique downward view. Automatic color balance was turned off. For 134 days from the middle of the dry season to mid rainy season (23 Sept, 2010 to 03 Feb, 2011) one frame was captured every 10s. From these, a single frame was chosen per day, obtained under diffuse solar illumination near local noon with minimal variation (< +-10%) in overall reflected scene brightness. Auto-exposure of the camera compensated this minor variation. Changes in greenness and woodiness were examined using three approaches: (1) visual classification of transition types for all trees that underwent marked full-crown changes during the dry season; (2) relative green channel brightness averaged over the entire frame; and (3) unstandardized Principal Component Analysis of the entire frame to remove spatial variations in illumination (PC1) and estimate area of exposed bark (threshold of PC2). Of 13 trees that underwent full-crown transitions in the first month (dry season), 11 were experiencing some stage of leaf flush . Relative brightness of the green channel over the entire frame showed that a flush of new leaves was already taking place at the beginning of the study and continued at least into October, when leaf maturation caused changes in leaf colors, limiting the usefulness of this indicator. The area of exposed bark decreased steeply during the mid-dry season leaf flush and further suggested that leafing-out continued at a slower pace into the rainy season. Due to spectral stability of exposed bark over time, this is a more reliable indicator of leaf phenology than the leaves themselves. The results of this study contribute an understanding of what controls seasonality of vegetation greenness in Amazonia and its photosynthesis response. / Existe um debate em curso sobre a resposta das florestas na Amazônia às secas extremas e às variações sazonais normais. Observações a partir de um sensor orbital de green-up na Amazônia durante a seca de 2005 permanecem controversas, com grande parte do fenômeno atribuído a contaminações por nuvens/aerossóis. Detecção por satélite do green-up no sul da Amazônia na estação seca foi atribuída ao artefato de sazonalidade no ângulo solar. Para avaliar mais diretamente as mudanças no dossel de uma floresta de terra firme da Amazônia Central, utilizou-se uma câmera de vídeo com três bandas na faixa do visível, resolução de 1028x720 pixels, fixa 54 m acima do chão da floresta em uma torre de covariância de fluxo, 60 km ao norte de Manaus. A mira da câmera foi ao sul, perpendicular ao trânsito solar, e obliqua para baixo. Foi desligada a compensação automática de cor (color-balance). Ao longo de 134 dias entre o pico da estação seca e o meio da estação chuvosa (23-set, 2010 a 03-fev, 2011), foi capturado um frame a cada 10 s. Foi selecionado ~um frame por dia, sob iluminação solar difusa, próximo ao meio-dia local e com variação < +/-10% no brilho geral refletido. A exposição automática da câmera compensou esta variação. As mudanças em greenness e madeirosidade foram medidas usando três abordagens: (1) classificação visual de tipos de transição para todas as árvores que experimentaram mudanças na copa por inteiro, durante o pico da estação seca; (2) médio, em todo o frame, do brilho relativo do canal verde; e (3) análise de componentes principais, com dados não padronizados, sobre todo o frame, para remover variações espaciais na iluminação (PC1) e estimar a área de madeira exposta (limiar do PC2). Das treze árvores que sofreram uma transição completa da copa na estação seca, onze experimentaram algum estágio de flush foliar. O brilho relativo do canal verde mostrou que este flush de folhas novas já estava acontecendo no início do estudo e continuou pelo menos até outubro, quando a maturação das folhas causou mudanças na sua coloração, limitando o uso desse indicador. A área de madeira exposta diminuiu abruptamente durante a estação seca e continuou caindo em ritmo menor no decorrer da estação chuvosa. Este indicador foi considerado mais confiável, devido a sua estabilidade espectral. Os resultados deste estudo contribuem para o entendimento da real sazonalidade de greenness da vegetação na Amazônia e sua resposta à fotossíntese.
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Terra Indígena Araçá/Roraima: continuidades e transformações envolvendo coletividades Macuxi

Bortolon, Dielci Maria Oliveira 29 July 2014 (has links)
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Evolução do ecoturismo no Lago Caracaranã em Normandia, RR, Brasil

Lima, Alexandrina Maria de Andrade 31 July 2015 (has links)
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