La maladie parodontale est la maladie infectieuse la plus répandue chez les animaux de compagnie. À partir de l'âge de deux ans, près de 80 % des chiens et 70 % des chats en sont atteints. Les bactéries contenues dans la plaque dentaire sont la cause première du développement de la maladie parodontale. De plus, la réponse immunitaire non contrôlée de l'hôte peut mener à la destruction du parodonte. Le but du projet de recherche est de tester l'efficacité de cinq produits naturels contre quatre espèces de Porphyromonas et une espèce de Fusobacterium de source animale. L'objectif est d'identifier un produit naturel qui permettrait de prévenir ou traiter la maladie parodontale et l'halitose chez le chien et le chat. Le projet a permis d'évaluer les effets antibactériens et anti-adhérence ainsi que les effets sur la production de composés sulfurés volatils des bactéries à l'étude. Ainsi, il pourrait s'avérer possible d'améliorer la santé et l'espérance de vie des animaux à l'aide d'une alternative plus facile et moins stressante que le brossage de dents. Ce projet a démontré que la plupart des produits naturels à l'étude possèdent des propriétés antibactériennes, anti-adhérence et diminuent également la production de composés sulfurés volatils. En conclusion, les résultats obtenus dans cette étude ont apporté des évidences supportant le potentiel de certains produits naturels d'être utilisés dans la prévention ou le traitement de la maladie parodontale et de l'halitose chez le chat et le chien.

Thèse ou mémoire avec insertion d'articles. / Plus d'un siècle s'est écoulé depuis le premier signalement de la furonculose, une maladie affectant les salmonidés. Au Québec, la furonculose représente environ 25 à 50 % des maladies diagnostiquées chez les salmonidés chaque année. Les options thérapeutiques contre la furonculose se limitent pour la plupart aux vaccins et aux antibiotiques. L'utilisation de vaccins chez les poissons est lourde, coûteuse et peu disponible au Québec. Les antibiotiques constituent le traitement le plus commun. L'utilisation excessive d'antibiotiques augmente le risque de développement de souches résistantes aux antibiotiques. *Aeromonas salmonicida* subsp. *salmonicida*, l'agent causal de la furonculose, a été identifié comme une source importante de gènes de résistance aux antibiotiques, et on sait maintenant que cette bactérie peut transférer ou acquérir des éléments génétiques mobiles même à partir d'autres espèces bactériennes dans les milieux aquatiques. Il est donc impératif d'introduire des traitements alternatifs plus durables. La phagothérapie a retenu l'attention en raison de ses nombreux avantages par rapport aux options thérapeutiques potentielles. L'utilisation de phages individuels, sous forme de cocktail ou même comme adjuvant aux antibiotiques, peut constituer une option thérapeutique prometteuse contre l'infection par la furonculose. Les objectifs de la présente thèse de doctorat étaient: (1) l'étude de la dynamique des cocktails de phages et des interactions bactériennes en milieu liquide; (2) l'isolement de nouveaux phages pour augmenter l'efficacité du futur cocktail qui sera utilisé dans les fermes piscicoles du Québec; (3) le développement d'une métrique fiable pour une interprétation plus facile des courbes de croissance bactérienne traitées avec des phages afin de faciliter la comparaison de plusieurs courbes prenant en compte des profils de croissance de tout type. Avant de réaliser des tests *in vivo*, il était crucial de rationaliser le processus de sélection des phages grâce à des mesures de densité optique de la croissance bactérienne influencée par les phages. Ce travail d'optimisation a confirmé qu'un cocktail de quatre phages à multiplicité d'infection (MOI) de 1 présente la plus grande efficacité lytique contre une bactérie modèle. Cependant, l'utilisation du même cocktail à une MOI identique contre des souches porteuses du Prophage 3 a conduit à un phénomène de résistance qui n'a été observé qu'en milieu liquide. Le phénomène de résistance a été confirmé en testant le même cocktail sur des souches sensibles lysogénéisées par le Prophage 3. Afin de contourner la résistance aux phages observée, et d'augmenter le potentiel lytique du futur cocktail contre la furonculose, une solution consistait à isoler de nouveaux phages en utilisant des souches résistantes comme hôte bactérien. Par conséquent, MQM1, un podophage virulent, a été isolé du mucus de poissons probablement morts à cause de la furonculose. Il a été confirmé que ce phage est dépourvu d'enzymes associées au cycle lysogène et de facteurs de virulence, ce qui indique qu'il pourrait être utilisé en phagothérapie. De plus, en plus de présenter un fort phénotype bactéricide perceptible au moins 24 heures après l'infection chez 87 % des souches porteuses de Prophage 3 trouvées dans la collection *A. salmonicida* subsp. *salmonicida*, MQM1 présentait un taux d'adsorption élevé sur l'hôte bactérien. Dans le cadre de cette thèse, une nouvelle métrique permettant de mesurer quantitativement et de manière fiable l'efficacité lytique des phages contre des hôtes bactériens a été décrite. Cette métrique vise à rationaliser les comparaisons entre les courbes de densité optique non canoniques des bactéries affectées par les phages. Dans le dernier chapitre de cette thèse, les résultats préliminaires des tests *in vivo* menés au LARSEM sont présentés. L'objectif principal de ce premier test *in vivo* était d'évaluer l'impact de la présence de phages sur la santé des poissons et d'évaluer la persistance des phages dans l'eau des poissons en l'absence d'hôte bactérien. Le phage Riv-10 a montré une plus grande persistance dans l'aquarium après 22 jours, mais en général, le titre des phages a considérablement diminué en raison de l'absence d'hôte bactérien. De plus, aucune mortalité ou retard de croissance n'ont été observés chez les poissons suite à l'ajout de phages. Au final, cette thèse de doctorat a montré que pour disposer d'une phagothérapie efficace en aquaculture, il est important d'enrichir constamment le cocktail de phages prêt à l'emploi, par une enquête perpétuelle de l'interaction phage-bactérie, et d'adapter les procédures nécessaires en conséquence. / Over a century has passed since the initial report of the disease "furunculosis" affecting brown trout. Yet, it remains a significant challenge in ensuring the sustainability of the aquaculture industry. In Quebec, furunculosis accounts for approximately 25% to 50% of diagnosed diseases in salmonids. The treatment options for furunculosis are mostly limited to vaccines and antibiotics. The use of vaccines in fish is cumbersome, expensive, and not quite being used in Quebec, and the antibiotics are the prominent treatment currently available. The excessive antibiotics utilization increases the risk of development of antibiotic resistant strains. *Aeromonas salmonicida* subsp. *salmonicida*, the causal agent of furunculosis, has been identified as a significant source of antibiotic-resistant genes, and it is now known that it could transfer/acquire mobile genetic elements both between species and within the same species in aquatic environments. Therefore, it is imperative to introduce alternative treatments that are more sustainable. Phage therapy has garnered attention due to its numerous advantages over potential treatment options. Thus, using phages individually, in a form of cocktail, or even as adjuvant to antibiotics may provide a promising treatment opportunity against furunculosis infection. The objectives of the present doctoral thesis were as follows: (1) to investigate the dynamics of phage cocktails and bacteria interaction in liquid assay; (2) to isolate new phages to increase the efficiency of the future « prêt-à-porter » phage cocktail which will be used in Quebec fish farms; (3) to develop a trustable quantitative metric for easier interpretation of phage-treated bacterial growth curves to facilitate the comparison of multiple curves taking into account growth profiles of all types. To adhere to the 3R rule (Replacement, Reduction, & Refinement) before conducting *in vivo* tests involving various combinations of phages, it was crucial to streamline the selection process through optical density measurements of bacterial growth when mixed with phages Additionally, the optical density measurements could help to better understand the dynamics of phage-bacteria interactions. A four-phage cocktail at multiplicity of infection (MOI) of 1 was confirmed to provide the highest lytic efficiency against a model bacterium. However, using the same cocktail at the same MOI against strains bearing Prophage 3 led to a resistance phenomenon which was only observed in liquid media. The resistance phenomenon was confirmed by testing the same cocktail on sensitive strains which were lysogenized by Prophage 3. In order to bypass the observed phage resistance, and to increase the lytic potential of the future phage cocktail against furunculosis, one solution was to isolate new phages by using resistant strains as the bacterial host. Consequently, MQM1, a virulent podophage, was isolated from the mucus of deceased fish suspected of having furunculosis. This phage was confirmed to lack enzymes associated with the lysogenic cycle and virulence, indicating that it may be useful in phage therapy. Additionally, apart from displaying a strong bactericidal phenotype that was noticeable at least 24 hours after infection in 87% of the Prophage 3-bearing strains found in the *Aeromonas* collection, MQM1 exhibited a high adsorption rate on the bacterial host. As part of this thesis, the development of a novel metric for quantitatively and reliably measuring the lytic efficiency of phages against bacterial hosts was introduced. This metric aims to streamline comparisons among non-canonical optical density curves of bacteria challenged with phages. In the final chapter of this thesis, the preliminary results of *in vivo* tests conducted at the LARSEM facility are presented. The primary objective of this initial *in vivo* test was to assess the impact of phages on fish health and to evaluate the persistence of phages in fish water in the absence of a bacterial host. Phage Riv-10 displayed greater persistence in the fish tank after 22 days, but in general, phage titers dramatically decreased due to the absence of a bacterial host. Also, no mortality was seen in fish as a result of phage addition. At the end, this doctoral thesis showed that to have an efficient phage therapy strategy in aquaculture, it is important to constantly enrich the ready-to-use phage cocktail, by perpetual investigation of phage-bacteria interactions, and adapt the necessary procedures accordingly.

Les acouphènes touchent une grande proportion de Canadiens. Cette condition est associée à de nombreuses comorbidités et affecte de manière significative la qualité de vie des patients qui en souffrent. Malheureusement, les mécanismes de génération et de persistance des acouphènes sont méconnus et il demeure de nombreux questionnements dans la communauté scientifique. Notamment, aucun traitement curatif n’est disponible pour l’instant. Ce mémoire fait état des différents types d’acouphènes qui peuvent se manifester ainsi que des diverses thérapies étudiées pour le traitement des acouphènes. Les grands modèles neurobiologiques prédominants dans la littérature sont aussi présentés. De plus, ce mémoire étudie la neuromodulation non invasive comme nouvelle avenue de traitement pour les acouphènes. Nous avons réalisé une méta-analyse et une étude de modélisation afin d’évaluer l’efficacité de ce traitement pour les acouphènes ainsi que les impacts sur les substrats neurobiologiques des acouphènes. Les résultats de cette étude montrent que la neuromodulation non invasive magnétique (SMTr) diminue de manière statistiquement significative les scores d’évaluation de l’acouphène, et que ces effets sont plus marqués chez les femmes. Les résultats montrent aussi que la neuromodulation du cortex auditif est l’approche qui diminue le plus les acouphènes et qu’elle génère un champ électrique plus fort dans l’insula en comparaison à d’autres régions d’intérêt. Finalement, ce mémoire discute des principales méthodes d’évaluation des acouphènes ainsi que de l’effet placébo présent lors du traitement des acouphènes. Des parallèles avec la douleur chronique sont établis, afin d’orienter la recherche sur de prochains traitements. Le futur de la neuromodulation non invasive pour le traitement des acouphènes est aussi discuté en marge de perspectives et de limites du travail. / Tinnitus impacts a large proportion of Canadians. It is linked to various comorbidities that significantly affect the quality of life of those who suffer from it. Unfortunately, generation and maintenance mechanisms are still unclear and numerous questions remain in the scientific community. Notably, no cure is available for tinnitus as of now. This dissertation reports the different types of tinnitus that can occur, besides the diverse therapies that have been reviewed for the treatment of tinnitus. The main neurobiological models of tinnitus prevailing in the literature are also presented. Furthermore, this dissertation investigates noninvasive neuromodulation as a new approach to treat tinnitus. A meta-analysis and modeling study have evaluated the efficacy of this treatment for tinnitus along with its impact on neurobiological substrates of tinnitus. The results of the study show that repetitive transcranial magnetic stimulation (rTMS) decreases statistically significantly tinnitus scores and that those effects are more marked in women. The results also show that noninvasive neuromodulation of the auditory cortex is the approach that decreases tinnitus the most and that this approach generates a stronger electric field in the insula among other regions of interest. Finally, this dissertation discusses the main methods to rate tinnitus and the placebo effect measured during tinnitus treatment. We also draw parallels with chronic pain, to orient prospective research. The future of noninvasive neuromodulation is also discussed in terms of treatment for tinnitus alongside perspectives and limits of the work.

Les études sur la prévalence des troubles anxieux auprès de patients psychotiques rapportent des taux extrêmement variables. La variabilité de ces taux pourrait être en partie expliquée les différences méthodologiques observées entre les études. À ce jour, aucune étude n'a encore examiné cette question systématiquement. L'objectif principal de cette étude était d'évaluer la prévalence des troubles anxieux chez 19 patients en début de traitement pour une psychose. À cette fin, un instrument semi-structure basé sur les critères du DSM-IV (EDDPC) fut administré. Deuxièmement, cette étude visait à : a) évaluer la relation entre le diagnostic clinique de troubles anxieux et le diagnostic de recherche, b) comparer les taux de prévalence des patients atteints de schizophrénie et des patients atteints d'un autre trouble psychotique, c) comparer les patients avec et sans comorbidité selon neuf variables cliniques et démographiques, d) évaluer la relation entre les symptômes anxieux et les symptômes positifs et négatifs de la psychose, e) déterminer le moment d'apparition des troubles anxieux par rapport à la psychose, f) évaluer l'EDDPC à partir d'un questionnaire composé de sept items. Les résultats de l'étude révèlent des taux de prévalence élevés et variables. D'autre part, des concordances entre les diagnostics cliniques et de recherche ont été observées pour le trouble obsessionnel-compulsif, l'agoraphobie, le trouble de stress post-traumatique et la phobie sociale. Les patients avec comobrbidité anxieuse ont obtenu des scores significativement moins élevés à la SOFAS et significativement plus élevés à l'Échelle Négative de la PANSS, comparativement aux patients sans comorbidité. Des corrélations significatives ont été observées entre les scores des patients à l'Échelle Psychopathologique Générale de la PANSS et ceux obtenus à l'Échelle Obsession-Compulsion de la Y-BOCS. Finalement, selon les patients, l'EDDPC possède des qualités appréciables tant dans sa structure que dans son contenu. Les études ultérieures devront tenir compte des facteurs susceptibles de faire varier les taux de prévalence dans leurs analyses afin de faciliter les comparaisons entre les études.

Le psoriasis est une maladie inflammatoire chronique qui affecte environ 2 à 3 % de la population mondiale. Il se caractérise par une hyperprolifération et un processus de différenciation anormale des kératinocytes. Bien qu'encore aucun traitement curatif n'existe à ce jour, certains peuvent améliorer les symptômes de cette maladie. Un nouvel ingrédient d'origine naturelle, le complexe de polysaccharides d'algues (CPA), composé de deux polysaccharides soit le fucane (FUC) et le galactane (GAL), a démontré des propriétés antiprolifératives et anti-inflammatoires pouvant réguler le psoriasis et ce, via la voie de signalisation Wnt. L'objectif de ce projet a été d'évaluer l'efficacité et le mécanisme d'action du CPA sur la peau psoriasique. Les expériences ont été effectuées sur des substituts cutanés sains et psoriasiques reconstruits à l'aide de la méthode d'auto-assemblage. Les substituts ont été traités à différentes concentrations de CPA (1% et 2%), de FUC (1% et 2%), de GAL (1% et 2%) et comparés au contrôle positif, soit le méthotrexate (734 µM) (MTX). Par la suite, des analyses en histologie, d'immunofluorescence et par Western Blot (Clasp2 et Wnt5a) ont été effectuées. Les marquages de différentes protéines (Ki67, kératine 14, loricrine, Clasp2 et Wnt5a) ont été réalisés. Les analyses histologiques ont permis d'observer un rétablissement des anticorps Ki67, K14 et loricrine dans les substituts psoriasiques traités. Pour les analyses en immunofluorescence et en Western Blot, le Clasp2, un marqueur de dommage des microtubules, s'est avéré surexprimé dans les substituts psoriasiques, contrairement à une diminution dans les substituts psoriasiques traités. Le marquage de la protéine Wnt5a réalisé dans les substituts psoriasiques traités a montré une diminution au niveau de la couche basale, signifiant un rétablissement de la voie de signalisation Wnt. Les analyses avec les protéines Clasp2 et Wnt5a ont montré un rétablissement de la voie de signalisation Wnt pour les substituts cutanés psoriasiques traités au CPA. / Psoriasis is a chronic inflammatory disease that affect about 2 to 3 % of the world population. The pathology is characterized by an hyperproliferation and an abnormal differentiation of keratinocyte. Although there is still no cure to this day, some can minimize the symptoms of the disease. A new natural ingredientorigin from seaweed, the complex of algae polysaccharides (CPA), mixed of two polysaccharides, fucan (FUC) and galactan (GAL), has showed anti-proliferative and anti-inflammatory properties that can regulate psoriasis through the Wnt signaling pathway. The main objective of this project was to evaluate the efficacity and the action mechanism of the complex of algae polysaccharides on psoriasis skin.The experience was performed on reconstruct healthy and psoriatic skin substitutes by the self-assembly method. The substitutes were treated with two different concentration of CPA (1% and 2%), FUC (1% and 2%), GAL (1% and 2%) and compared with the positive control, the methotrexate (734 µM) (MTX). Afterwards, histology, immunofluorescence and Western Blot (Clasp2 and Wnt5a) analyzes have been accomplished. Stanning of different proteins (Ki67, keratin 14, loricrin, Clasp2 and Wnt5a) was carried out.The histological analyzes helped to observe a recovery of the Ki67, K14 and loricrin antibody, confirming the integrity of the CPA treatment. For the immunofluorescence and Western Blot analysis, Clasp2, a marker of microtubule damage, whose expression is increased in the psoriasis and decreased in the treated psoriatic substitutes. The Wnt5a protein stanning realize on treated psoriatic skin show a decreased of expression in the stratum germinativum, implying a restoration of the Wnt signaling pathway. The analysis of Clasp2 and Wnt5a proteins showed a restoration of the Wnt signaling pathway for the treated CPA skin substitutes.

Les lombalgiques chroniques présentent un retard de l'activation du muscle transverse abdominal (TrA), une difficulté à activer volontairement le TrA et une réorganisation du cortex moteur primaire (Ml) contrôlant le TrA. L'entraînement du muscle permet de diminuer le retard du TrA et normaliser l'organisation de Ml. De plus, la neurostimulation périphérique permet de faciliter le retour sensorimoteur chez une population parétique. Notre projet combine donc la neurostimulation périphérique et un entraînement moteur spécifique pour améliorer le contrôle postural chez des lombalgiques chroniques. La combinaison de la neurostimulation au-dessus du TrA/oblique interne (IO) et de l'entraînement moteur a réussi à améliorer le contrôle posturo-moteur (délai d'activation et activation bilatérale). De plus, la neurostimulation a rétabli l'inhibition intracorticale absente chez les lombalgiques, ce qui pourrait expliquer pourquoi le groupe expérimental seulement s'est amélioré. Donc, l'utilisation de la neurostimulation comme adjuvant à la rééducation motrice semble efficace en une seule session pour améliorer les APA.

La peau est le plus grand organe du corps humain. Cette enveloppe corporelle, souvent négligée et tenue pour acquise, peut être atteinte de diverses maladies ou d'affectations cutanées. À titre d'exemple, le psoriasis est une dermatose d'évolution chronique et à caractère inflammatoire. Or, cette pathologie est beaucoup plus qu'une condition inesthétique; elle affecte la qualité de vie des patients de manière assez invalidante. En dépit des avancées scientifiques, le psoriasis demeure une dermatose incurable. Conséquemment, l'élaboration de nouveaux produits antipsoriasiques est un enjeu actuel. Inspirés par la contribution substantielle des produits naturels dans cette dermatose, une molécule en particulier a attiré notre attention : le québécol. Ce composé polyphénolique a éveillé notre curiosité scientifique en raison de ses propriétés antiprolifératives et antiinflammatoires. Toutefois, compte tenu de la très faible abondance du québécol dans la nature, cette molécule est synthétisée en laboratoire. Par le fait même, des composés apparentés à ce produit naturel sont également étudiés dans le cadre de ce projet de maîtrise. Ce mémoire présente un outil pharmacologique d'exception : le modèle de peau psoriasique autologue. Élaboré au moyen de l'ingénierie tissulaire, ce modèle reflète avec fidélité les caractéristiques de la peau psoriasique à l'état natif. En considérant son grand potentiel, il demeure le modèle par excellence pour caractériser l'activité antipsoriasique de nouvelles entités chimiques. Les travaux décrits dans ce document portent sur l'évaluation du potentiel antipsoriasique de molécules de source végétale et synthétique. Afin d'approfondir le savoir portant sur ces potentiels candidats, il est envisagé d'investiguer sur leur mécanisme d'action dans la pathologie du psoriasis. Pour ce faire, la peau lésionnelle reconstruite in vitro - un outil cutané unique et innovant - a été mise à profit. / Skin is the largest organ of the human body. Often neglected and taken for granted, this physical envelope can be affected by various diseases or skin disorders. For example, psoriasis is a chronic and inflammatory dermatosis. Yet, this pathology is much more than an unsightly condition; it affects patients' life quality in a disabling way. Despite scientific progress, psoriasis remains an incurable dermatosis. As a result, the development of new antipsoriatic products is an ongoing issue. Inspired by the substantial contribution of natural products in this dermatosis, one molecule in particular caught our attention : the quebecol. This polyphenolic compound has aroused our scientific curiosity because of its antiproliferative and anti-inflammatory properties. However, considering the very low abundance of quebecol in nature, this molecule is produced by chemical synthesis. Thereby, compounds related to this natural product are also studied as a part of this project. This work presents an exceptional pharmacological tool : the autologous psoriatic skin model. Developed using tissue engineering, this model faithfully reflects the characteristics of in vivo psoriatic skin. Considering its great potential, it remains the ultimate model for characterizing the antipsoriatic activity of new chemical entities. The work described in this paper focuses on the antipsoriatic activity evaluation of molecules of plant origin and synthetic origin. In order to deepen the knowledge of these potential candidates, the possibility of investigating their mechanism of action in the pathology of psoriasis is considered. To do so, the in vitro reconstructed lesional skin - a unique and innovative skin tool - was put to contribution.

Introduction: La maladie thromboembolique veineuse (MTEV) est très fréquente. Les anticoagulants oraux (AOD) ont démontré leur supériorité dans le traitement aigu de laMTEV. Cependant, plusieurs évidences sont encore mal établies. Ce mémoire a pour but de présenter les projets de recherche, faits dans le cadre de ma maitrise, sur le traitement et la prévention en MTEV.Méthodes: Deux méta-analyses sur le traitement à long terme, soit après les 3 à 6 premiers mois d’anticoagulation post-MTEV, seront présentées. La première étude compare les différents traitements possibles et la deuxième étude évalue l’effet des AOD sur la mortalité. Les deux méta-analyses subséquentes portent sur des patients avec cancer et avec obésité/obésité morbide, respectivement. Le dernier projet est une étude de cohorte rétrospective évaluant l’effet de l’implantation d’un protocole de prescription sur l’adhérence de la thromboprophylaxie pharmacologique chez les patients hospitalisés. Résultats: Pour le traitement à long terme, alors que la dose standard d’antagonistes de la vitamine K (AVK) et les AOD prévenaient la récidive thromboembolique et augmentaient les saignements majeurs, seuls les AOD diminuaient la mortalité de toutes causes et la mortalité attribuable à la MTEV comparativement à l’observation seule. En thromboses liées au cancer, les AOD étaient non inférieurs aux héparines de bas poids moléculaire (HBPM)concernant les récidives thromboemboliques, mais augmentaient les saignements. Chez les patients avec obésité/obésité morbide traités avec AOD comparés aux AVK/HBPM, il n’y avait aucune différence sur les récidives thromboemboliques, mais les AOD semblaient réduire les saignements majeurs. En prévention de MTEV, l’implantation d’un protocole de prescription d’une thromboprophylaxie pharmacologique semble améliorer l’adhérence à la prescription parmi les patients hospitalisés. Conclusion: Ce mémoire a démontré que les AOD étaient efficaces et sécuritaires dans le traitement à long terme, chez les patients avec cancer et ceux avec obésité. Finalement, l’effet d’un outil permettant possiblement d’améliorer la prévention de la MTEV a été démontré. / Introduction: Venous thromboembolism (VTE) is very frequent. Direct oral anticoagulants(DOAC) were superior to vitamin K antagonists (VKA) in the acute treatment of VTE.However, many evidences are still lacking. The goal of this research thesis is to present different research projects, completed during my clinical epidemiology master’s, on different aspects of treatment and prevention in VTE. Methods: Two meta-analyses evaluating extended treatment (after the first 3 to 6 months of anticoagulation) in VTE will be presented. The first study evaluated different treatments and the second study evaluated the effect of DOAC on all-cause mortality. The two subsequent meta-analyses included patients with cancer and patient with obesity/morbid obesity,respectively, representing two subpopulations for which limited data is available regarding DOACs’ efficacy and security. The last project is a retrospective cohort study evaluating the effect of the implementation of a prescription protocol on the adherence of pharmacological thromboprophylaxis in patients admitted to the hospital. Results: For the extended treatment, while standard dose VKA and DOAC prevented VTE recurrence and were associated with an increase in major bleeding, only DOAC reduced allcause mortality and VTE-associated mortality compared to observation alone. In the treatment of cancer-associated thrombosis, DOAC were non-inferior to low molecular weight heparin (LMWH) in regards of VTE recurrence, but DOAC were associated with increased bleeding. In patients with obesity and morbid obesity treated with DOAC compared to VKA/LMWH, no difference was seen in VTE recurrence, but DOAC seemed to reduce major bleeding. In VTE prevention, implementing a pharmacological thromboprophylaxis prescription protocol seemed to improve prescription adherence in patients hospitalized fora medical problem. Conclusion: This research thesis demonstrated that DOAC were efficient and safe in the extended treatment in patients with cancer and in patients with obesity. Finally, the effect of a tool possibly helping the improvement of VTE prevention has also been demonstrated.

Dans le domaine des applications multimédia, les futurs standards vont permettre de créer de nouvelles voies de communication, d'accès et de manipulation de l'information audiovisuelle qui vont bien au-delà de la simple compression à laquelle se limitaient les standards de codage précédents. Parmi les nouvelles fonctionnalités, il est espéré que l'utilisateur pourra avoir accès au contenu des images par édition et manipulation des objets présents. Néanmoins, la standardisation ne couvre que la représentation et le codage de ces objets, en laissant ouvert un large champ de développement pour ce qui concerne la probl ématique liée à leur extraction et à leur suivi lorsqu'ils évoluent au long d'une séquence vidéo. C'est précisément sur ce point que porte cette thèse. Dans un premier temps, nous avons procédé à l' étude et à la mise au point d'algorithmes de filtrage et de segmentation à caractère générique, car ces outils sont à la base de tout système d'analyse du contenu d'une image ou d'une séquence. Plus concr ètement, nous avons étudié en détail une nouvelle classe de filtres morphologiques connus sous le nom de nivellements ainsi qu'une variation des algorithmes de segmentation basée sur l'inondation contrainte d'une image gradient. Les techniques de segmentation ont pour but de produire une partition de l'image aussi proche que possible de celle faite par l' oeil humain, en vue de la reconnaissance postérieure des objets. Néanmoins, dans la plupart des cas, cette dernière tâche ne peut être faite que par interaction humaine et, pourtant, lorsqu'on veut retrouver un objet dans une large collection d'images, ou suivre son évolution au long d'une s équence, la surveillance de chacune des partitions devient impossible. S'impose alors le développement d'algorithmes de mise en correspondance capables de propager l'information dans une série d'images, en limitant l'interaction humaine à une seule étape d'initialisation. En faisant le passage des images fixes aux séquences, la partie centrale de cette thèse est consacrée à l' étude du problème de la mise en correspondance de partitions. La méthode que nous avons développée, nommée technique de Segmentation et Appariement Conjoint (SAC), peut être définie comme étant de nature hybride. Elle combine des algorithmes classiques de mise en correspondance de graphes avec de nouvelles techniques d' édition, basées sur les hiérarchies de partitions fournies par la segmentation morphologique. Cette combinaison a donné lieu à un algorithme très robuste, malgré l'instabilité typiquement associée aux processus de segmentation. La segmentation de deux images peut différer fortement si on la considère du seul point de vue d'une partition unique ; néanmoins nous avons montré qu'elle est beaucoup plus stable si on considère des hiérarchies de partitions emboîtées, dans lesquelles tous les contours présents apparaissent, chacun avec une valuation indiquant sa force. Les résultats obtenus par la technique SAC ont fait d'elle une approche très prometteuse. Souple et puissante, elle est capable de reconnaître un objet lorsqu'il réapparaît après occultation grâce à la gestion d'un graphe de mémoire. Bien que nous nous soyons int éressés tout particulièrement à la problématique du suivi, les algorithmes mis au point ont un champ d'application beaucoup plus vaste dans le domaine de l'indexation, en particulier pour la recherche d'objets dans une base de données d'images ou de séquences. Finalement, dans le cadre du projet européen M4M (MPEG f(o)ur mobiles) nous avons abordé la mise en oeuvre d'un démonstrateur de segmentation en temps réel capable de détecter, segmenter et suivre un personnage dans des séquences de vidéophonie. Dans le cadre de cette application, la contrainte du temps réel est devenue le grand d éfi à surmonter, en nous obligeant a simplifier et à optimiser nos algorithmes. L'int erêt principal en termes des nouveaux services est double : d'un côté le détourage automatique du locuteur permettrait d'adapter le codage à l'objet, économisant du débit sans perte de qualité sur les régions d'int erêt ; d'un autre côté il permettrait de faire l' édition personnalisée des séquences en changeant la composition de la scène, par exemple en introduisant un nouveau fond, ou en disposant plusieurs locuteurs dans une salle de conférence virtuelle.

Thèse de doctorat : Génie Biologique et Médical : Villeurbanne, INSA : 1997. / Titre provenant de l'écran-titre. Bibliogr. p. 220-228.