Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:09Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-02-05Bitstream added on 2014-06-13T19:13:01Z : No. of bitstreams: 1 leite_dc_me_jabo.pdf: 1227082 bytes, checksum: 7596e93ea3e5948f3529db795c099964 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A produção de açúcar por hectare constitui o foco principal dos programas de melhoramento de cana-de-açúcar e depende tanto da produção da cana colhida no campo como da concentração de açúcar (sacarose) contida no colmo. O objetivo deste trabalho foi identificar marcadores microssatélites genômicos e funcionais associados aos componentes de produção (altura, diâmetro, peso e número de colmos), produtividade e parâmetros de qualidade em cana-de-açúcar (Brix, Fibra, Pol%Cana), com base em uma progênie proveniente do cruzamento entre o clone IACSP95-3018 e a cultivar IACSP93-3046 ambos do Programa de Melhoramento Cana IAC. O mapa de ligação foi composto por 175 marcadores em dose única distribuídos em 58 grupos de ligação (GL) com cobertura de 1525 centiMorgans e distância média entre os marcadores de 8,71 centiMorgans. O comprimento dos grupos de ligação variou de 1 a 72 centiMorgans. Os 58 GL deram origem a 9 grupos de homologia. Com os marcadores em dose única foi feita uma análise de marca simples para a identificação de QTLs putativos associados as medidas fenotípicas obtidas em cana planta e cana soca. No total foram detectadas 69 (25%) associações marcador/característica fenotípica (P<0.05) das quais, 32 (46%) em cana planta, 37 (54%) cana soca e 6 (9%) em ambos os ciclos. Estas associações foram derivadas de 47 locos de microssatélites. Para os componentes de produção e produtividade foram encontradas 38 associações e duas em ambos os ciclos (planta e soca) enquanto para os parâmetros de qualidade foram detectadas 22 associações e duas em ambos os ciclos. Para os marcadores derivados de seqüências expressas, algumas associações mostraram uma relação entre a função do gene do qual o marcador foi derivado com à característica fenotípica associada. Para estas associações, apesar dos marcadores terem apresentado... / Sugar production per hectare is the main focus of sugarcane breeding programs and depends on the sugarcane production harvest in the field and the sugar content (sucrose) of the stalk juice. The objective of the present work was to identify genomic and functional microsatellites markers associated to yield components (height, diameter, weight and stalk number), productivity and quality parameters (Brix, Fibre, Pol%Cane) in a progeny derived from a cross of the elite clone IACSP95-3018 and the variety IACSP93-3046, both from the IAC Sugarcane Breeding Program. The genetic map was composed by 175 single dose markers distributed onto 58 linkage groups (LG). The map coverage was 1525 centiMorgans with an average distance between markers of 8.71 centiMorgans (cM) and length of the LG ranging from 1 to 72 cM. The 58 LG gave rise to 9 homology groups. Single marker trait association analysis was performed with the single dose markers to identify putative QTLs associated with the phenotypic measures obtained at plant cane and ratoon cane. A total of 69 (25%) maker/trait associations (P<0.05) was detected, of which, 32 (46%) at plant cane, 37 (54%) at ratoon cane and 6 (9%) at both cycles. These associations were derived from 47 microsatellite loci. For the yield components and productivity 38 associations was found and 2 at both cycles while for the quality parameters 22 associations were detected and 2 at both cycles. For the EST derived markers, some associations showed a relation between the function of de gene of which it was derived with the phenotypic trait. For such associations, although the marker effects were low, it is probable that these markers contribute to the respective phenotypic trait

Submitted by PAULA CAROLINE SILVA MOURA SILVA MOURA (paulacarol4@yahoo.com.br) on 2017-01-26T21:52:31Z No. of bitstreams: 1 Tese Paula final.pdf: 2022771 bytes, checksum: a45bbe236ae9ad03b877678876b06785 (MD5) / Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-01-30T15:11:36Z (GMT) No. of bitstreams: 1 moura_pcs_dr_bot.pdf: 2022771 bytes, checksum: a45bbe236ae9ad03b877678876b06785 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-30T15:11:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 moura_pcs_dr_bot.pdf: 2022771 bytes, checksum: a45bbe236ae9ad03b877678876b06785 (MD5) Previous issue date: 2016-10-04 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A maturação da cana-de-açúcar do ponto de vista econômico é determinada pelas análises tecnológicas realizadas a partir do caldo extraído dos colmos e os teores obtidos são comparados aos dados de literatura. Diversas variáveis podem auxiliar para estimar a maturação, no entanto, as atualmente usuais são consideradas empíricas, pouco exatas ou trabalhosas. Nota-se que o processo de maturação da cana-de-açúcar influencia na sua morfologia, fisiologia e metabolismo e a detecção ideal seria realizada pela observação de todos estes fatores, além de que, se acompanhados, poderiam auxiliar na distinção prévia do potencial produtivo de novos genótipos, sem necessariamente cultivá-los até o final do ciclo biológico. O objetivo do trabalho foi detectar a maturação da cana-de-açúcar por meio das alterações morfológicas, fisiológicas, enzimáticas e nutricionais em duas variedades de cana-de-açúcar. O experimento foi realizado na Usina da Barra - Grupo Raízen, as avaliações entre março e julho de 2015 e as variedades utilizadas foram a RB855156 (precoce) e a RB92579 (tardia). Avaliou-se a altura de plantas, diâmetro e número de colmos, comprimento e número de entrenós, número de folhas verdes, comprimento e largura da folha +3, área foliar e índice de área foliar, massa da matéria fresca e seca das folhas e colmos, índice SPAD, conteúdo de clorofilas e carotenoides, NDVI, Brix% caldo, pureza, Pol% cana, ATR, ART, teor de fibras, AR, U% e PBU, atividade da SPS, SuSy e das invertases ácidas e neutras do colmo e das folhas e o teor foliar de N, P, K, Ca, Mg, Fe, S e B. Para acompanhar e discriminar o período de maturação entre as duas variedades, os dados das análises tecnológicas foram submetidos ao teste de "t" (teste de Student, p < 0,05) entre as variedades e dentro das épocas de estudos. Para determinar quais variáveis estavam associadas à maturação das variedades, realizou-se a correlação de Pearson entre as variáveis morfológicas, fisiológicas, enzimáticas, nutricionais e as variáveis tecnológicas, para cada variedade. A maturação da variedade RB855156 foi detectada através das variáveis morfológicas largura da folha +3, área foliar, índice de área foliar, número de entrenós, as fisiológicas índice SPAD, teor de clorofila a, b, a+b, carotenóides e a atividade enzimática da SuSy no sentido quebra. A variedade RB92579 até a última avaliação, conforme o Brix e pureza do caldo, não havia iniciado o processo de maturação. No entanto, ao compararmos as variáveis fisiológicas, morfológicas e enzimáticas com os atributos tecnológicos, nota-se que as variáveis que foram selecionadas pela análise de correlação foram as mesmas da variedade RB855156, com exceção do índice SPAD e largura da folha +3.As variáveis número de entrenós, diâmetro do colmo, altura de inserção da folha +1, comprimento da folha +3, índice SPAD e número de folhas verdes podem serutilizadas para estimar, por meio de regressões múltiplas, as características tecnológicas Brix% caldo, pureza, umidade, ART, PCC e ATR durante a maturação das variedades estudadas. / The ripeness of sugarcane from the economic point of view is determined by the technological analyzes carried out from the broth extracted from the stalks and the obtained contents are compared to the literature data. Several variables may help to estimate ripeness, however, the current ones are considered empirical, not exact or laborious. The sugar cane ripeness process influences its morphology, physiology and metabolism and the ideal detection would be performed by observing all these factors, and if accompanied, could help in the previous distinction of productive potential of new genotypes, without necessarily growing them until the end of the biological cycle. The objective of this work was to detect the ripeness of sugarcane by means of morphological, physiological, enzymatic and nutritional changes in two sugarcane varieties. The experiment was carried out at the Barra Plant - Raízen Group, evaluations between March and July 2015 and the varieties used were RB855156 (early) and RB92579 (late). The height of plants, length, diameter and number of stalks, length and number of internodes, number of green leaves, length and width of leaf +3, leaf area and leaf area index, fresh and dry matter mass of leaves and stems, SPAD index, chlorophyll and carotenoid content, NDVI, Brix% broth, purity, Pol%, ATR, ART, fiber content, AR, U% and PBU, SPS activity, SuSy and acid and leaf, and leaf contents of N, P, K, Ca, Mg, Fe, S and B. To monitor and discriminate the ripeness period between the two varieties, the data of the technological analyzes were submitted to the test of "T" (Student test, p <0.05) between the varieties and within the study periods. In order to determine which variables were associated with the maturation of the varieties, the Pearson correlation was performed between the morphological, physiological, enzymatic, nutritional variables and the technological variables, for each variety. The maturation of the variety RB855156 was detected through the morphological variables leaf width +3, leaf area, leaf area index, number of internodes, physiological index SPAD, chlorophyll a, b, a + b content, carotenoids and enzymatic activity of SuSy in the sense breaks. The variety RB92579 until the last evaluation, according to the Brix and purity of the broth, had not started the maturation process. However, when comparing the physiological, morphological and enzymatic variables with the technological attributes, it is noticed that the variables that were selected by the correlation analysis were the same of the variety RB855156, except for the SPAD index and leaf width + 3. As The number of internodes, stalk diameter, leaf insertion height +1, leaf length +3, SPAD index and number of green leaves can be used to estimate, by means of multiple regressions, the technological characteristics Brix% broth, purity, Moisture, ART, PCC and ATR during maturation of the studied varieties.

Resumo: A produção de açúcar por hectare constitui o foco principal dos programas de melhoramento de cana-de-açúcar e depende tanto da produção da cana colhida no campo como da concentração de açúcar (sacarose) contida no colmo. O objetivo deste trabalho foi identificar marcadores microssatélites genômicos e funcionais associados aos componentes de produção (altura, diâmetro, peso e número de colmos), produtividade e parâmetros de qualidade em cana-de-açúcar (Brix, Fibra, Pol%Cana), com base em uma progênie proveniente do cruzamento entre o clone IACSP95-3018 e a cultivar IACSP93-3046 ambos do Programa de Melhoramento Cana IAC. O mapa de ligação foi composto por 175 marcadores em dose única distribuídos em 58 grupos de ligação (GL) com cobertura de 1525 centiMorgans e distância média entre os marcadores de 8,71 centiMorgans. O comprimento dos grupos de ligação variou de 1 a 72 centiMorgans. Os 58 GL deram origem a 9 grupos de homologia. Com os marcadores em dose única foi feita uma análise de marca simples para a identificação de QTLs putativos associados as medidas fenotípicas obtidas em cana planta e cana soca. No total foram detectadas 69 (25%) associações marcador/característica fenotípica (P<0.05) das quais, 32 (46%) em cana planta, 37 (54%) cana soca e 6 (9%) em ambos os ciclos. Estas associações foram derivadas de 47 locos de microssatélites. Para os componentes de produção e produtividade foram encontradas 38 associações e duas em ambos os ciclos (planta e soca) enquanto para os parâmetros de qualidade foram detectadas 22 associações e duas em ambos os ciclos. Para os marcadores derivados de seqüências expressas, algumas associações mostraram uma relação entre a função do gene do qual o marcador foi derivado com à característica fenotípica associada. Para estas associações, apesar dos marcadores terem apresentado... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Sugar production per hectare is the main focus of sugarcane breeding programs and depends on the sugarcane production harvest in the field and the sugar content (sucrose) of the stalk juice. The objective of the present work was to identify genomic and functional microsatellites markers associated to yield components (height, diameter, weight and stalk number), productivity and quality parameters (Brix, Fibre, Pol%Cane) in a progeny derived from a cross of the elite clone IACSP95-3018 and the variety IACSP93-3046, both from the IAC Sugarcane Breeding Program. The genetic map was composed by 175 single dose markers distributed onto 58 linkage groups (LG). The map coverage was 1525 centiMorgans with an average distance between markers of 8.71 centiMorgans (cM) and length of the LG ranging from 1 to 72 cM. The 58 LG gave rise to 9 homology groups. Single marker trait association analysis was performed with the single dose markers to identify putative QTLs associated with the phenotypic measures obtained at plant cane and ratoon cane. A total of 69 (25%) maker/trait associations (P<0.05) was detected, of which, 32 (46%) at plant cane, 37 (54%) at ratoon cane and 6 (9%) at both cycles. These associations were derived from 47 microsatellite loci. For the yield components and productivity 38 associations was found and 2 at both cycles while for the quality parameters 22 associations were detected and 2 at both cycles. For the EST derived markers, some associations showed a relation between the function of de gene of which it was derived with the phenotypic trait. For such associations, although the marker effects were low, it is probable that these markers contribute to the respective phenotypic trait / Orientador: Dilermando Perecin / Coorientadora: Luciana Rossini Pinto / Banca: Silvana Aparecida Creste Dias de Souza / Banca: Sandra Helena Unêda Trevisoli / Mestre

O presente trabalho teve como objetivo avaliar o nível e o tempo de elevação freática, nos diferentes estádios de desenvolvimento sobre as variáveis de crescimento, desenvolvimento, produtividade e parâmetros tecnológicos da cultura da cana-de-açúcar, variedade SP80-3280. O experimento foi conduzido em ambiente protegido, com uma área de 120 m2, instalado na área experimental do Departamento de Engenharia Rural da ESALQ USP, em Piracicaba, São Paulo. O delineamento experimental utilizado foi o Inteiramente Aleatorizado com [(2x2x3)+1+2], totalizando 15 tratamentos com 4 repetições. Os tratamentos foram constituídos de: (a) elevação do nível freático a 25 e 50 cm, (b) tempo de elevação do nível freático por 4, 6, 8 e12 dias, (c) estádios de desenvolvimento 3, 6 e 9 meses (d) nível freático constante de 40 e 60 cm durante todo o ciclo. O experimento foi composto por 60 tubos de concreto com 0,40 m de diâmetro interno e 1,10 m de altura, preenchidos com solo Latossolo Vermelho- Amarelo Álico. As variáveis analisadas foram: altura de planta, número de perfilhos, área foliar, comprimento e diâmetro de colmos, produtividade e parâmetros tecnológicos como: BRIX, POL, FIBRA, AR e ATR. As análises do caldo da cana-de-açúcar foram realizadas no laboratório de tecnologia de açúcar e álcool da ESALQ USP. Os resultados obtidos nas análises de crescimento como: números de perfilhos, área foliar, altura de plantas, comprimento e diâmetro de colmos, no cultivo da cana-planta não apresentaram diferenças significativas entre os tratamentos aplicados, o mesmo foi observado para a produção de colmos e porcentagem de Brix. O que mais teve influência nos demais parâmetros tecnológicos foi o tempo de aplicação dos tratamentos, exceto para a porcentagem de fibra, que foi influenciada pelo nível freático e estádio de desenvolvimento. Os níveis freáticos mantidos constantes a 60 e 40 cm de profundidade durante todo o ciclo de cultivo proporcionaram maiores rendimentos de ATR. Para cana soca as análises de crescimento como: número de perfilhos, diâmetro de colmos e altura de plantas não apresentaram diferenças significativas entre os tratamentos, já para o comprimento de colmos e área foliar ocorreram diferenças apenas no tratamento T14, com as menores médias. Para os parâmetros tecnológicos de Brix, Pol e ATR ocorreram menores concentrações quando aplicados os tratamentos no final do ciclo, entretanto diferindo-se significativamente do tratamento T15, que obteve a maior concentração ATR. O tratamento T15 foi o que obteve a menor concentração de açúcar redutor (AR) e a maior concentração foi obtida no tratamento T8, sem diferenças significativas dos demais tratamentos. A maior porcentagem de fibra foi obtida no tratamento T1, diferindo significativamente do tratamento T8, T12 e T13, com as menores porcentagens de fibra. A produção da cana-soca foi maior quando aplicado os tratamentos no final do ciclo (270 DAC), independente do tempo de duração dos tratamentos. Para o nível freático mantido a 40 cm de profundidade durante todo o ciclo de cultivo (T15), apresentou uma redução de 40% em relação à cana-planta, evidenciando uma possível redução de ciclos de cultivo. / The aim of this work was to evaluate the effect of level and time of freatic elevation on variables related to plant growth, development, productivity and technological parameters of sugarcane crop. The experiment was carried out in a 120-m2 greenhouse, set up at the research station of the Rural Engineering Department Luiz de Queiroz College of Agriculture (ESALQ), São Paulo University. The experimental design was Randomized Complete Block with [(2x2x3)+1+2], totaling 15 treatments and 4 repetitions. The treatments constituted of: (a) elevation of the water table to 25 and 50 cm, (b) time of the water table elevation for 4, 6, 8 e 12 days, (c) stages of development 3, 6 and 9 months, and (d) constant water table of 40 and 60 cm during the cycle. There were in the experiment 60 concrete tubes with 0.40 m of internal diameter and 1.10 m of high, filled with Red-Yellow Alic Latosol. The following variables were analyzed: height of plant, tillering number, leaf area, length and diameter of stalks, productivity as well as technological parameters such as: BRIX, POL, FIBRE, AR and ATR. The analyses of sugarcane juice were performed in the laboratory of sugar and ethanol technology of ESALQ. The results obtained in growth analyses such as: tillering numbers, leaf area, height of plants, length and diameter of stalks, showed that the crop growth did not present significant differences between the applied treatments. The same was observed for the production of stalks and percentage of Brix. The most influenced technological parameter was the time of application of the treatments, except for the fiber percentage that was influenced by the water table and stage of development. The constant water table of 60 and 40 cm depth during caused larger ATR incomes. Growth parameters such as: tillering number, stalk diameter and plant height, did not presented significant differences between the treatments. Significant differences were only observed in length of stalks and foliar area for the T14 treatment, which presented the lowest averages. For the technological parameters, Brix, Pol and ATR, lower concentrations were observed when the treatments were applied in the end of the cycle. T15 treatment presented the largest ATR concentration differing significantly. The T15 treatment showed the lower concentration of reducing sugar (AR) and the highest concentration was observed for the T8 treatment, with no signficant differences for the other treatments. The highest fiber percentage was observed in treatment T1, differing significantly from the treatment T8, T12 and T13, with the lower fiber percentages. The production of sugar ratoon cane was bigger when applying the treatments in the end of the cycle (270 DAC), independent of the duration of the treatments. For the water table, the 40 cm of depth during all the culture cycle (T15) presented a reduction of 40% in relation to the sugarcane-plant, evidencing a possible reduction of crop cycles.

O presente trabalho teve como objetivo avaliar o nível e o tempo de elevação freática, nos diferentes estádios de desenvolvimento sobre as variáveis de crescimento, desenvolvimento, produtividade e parâmetros tecnológicos da cultura da cana-de-açúcar, variedade SP80-3280. O experimento foi conduzido em ambiente protegido, com uma área de 120 m2, instalado na área experimental do Departamento de Engenharia Rural da ESALQ USP, em Piracicaba, São Paulo. O delineamento experimental utilizado foi o Inteiramente Aleatorizado com [(2x2x3)+1+2], totalizando 15 tratamentos com 4 repetições. Os tratamentos foram constituídos de: (a) elevação do nível freático a 25 e 50 cm, (b) tempo de elevação do nível freático por 4, 6, 8 e12 dias, (c) estádios de desenvolvimento 3, 6 e 9 meses (d) nível freático constante de 40 e 60 cm durante todo o ciclo. O experimento foi composto por 60 tubos de concreto com 0,40 m de diâmetro interno e 1,10 m de altura, preenchidos com solo Latossolo Vermelho- Amarelo Álico. As variáveis analisadas foram: altura de planta, número de perfilhos, área foliar, comprimento e diâmetro de colmos, produtividade e parâmetros tecnológicos como: BRIX, POL, FIBRA, AR e ATR. As análises do caldo da cana-de-açúcar foram realizadas no laboratório de tecnologia de açúcar e álcool da ESALQ USP. Os resultados obtidos nas análises de crescimento como: números de perfilhos, área foliar, altura de plantas, comprimento e diâmetro de colmos, no cultivo da cana-planta não apresentaram diferenças significativas entre os tratamentos aplicados, o mesmo foi observado para a produção de colmos e porcentagem de Brix. O que mais teve influência nos demais parâmetros tecnológicos foi o tempo de aplicação dos tratamentos, exceto para a porcentagem de fibra, que foi influenciada pelo nível freático e estádio de desenvolvimento. Os níveis freáticos mantidos constantes a 60 e 40 cm de profundidade durante todo o ciclo de cultivo proporcionaram maiores rendimentos de ATR. Para cana soca as análises de crescimento como: número de perfilhos, diâmetro de colmos e altura de plantas não apresentaram diferenças significativas entre os tratamentos, já para o comprimento de colmos e área foliar ocorreram diferenças apenas no tratamento T14, com as menores médias. Para os parâmetros tecnológicos de Brix, Pol e ATR ocorreram menores concentrações quando aplicados os tratamentos no final do ciclo, entretanto diferindo-se significativamente do tratamento T15, que obteve a maior concentração ATR. O tratamento T15 foi o que obteve a menor concentração de açúcar redutor (AR) e a maior concentração foi obtida no tratamento T8, sem diferenças significativas dos demais tratamentos. A maior porcentagem de fibra foi obtida no tratamento T1, diferindo significativamente do tratamento T8, T12 e T13, com as menores porcentagens de fibra. A produção da cana-soca foi maior quando aplicado os tratamentos no final do ciclo (270 DAC), independente do tempo de duração dos tratamentos. Para o nível freático mantido a 40 cm de profundidade durante todo o ciclo de cultivo (T15), apresentou uma redução de 40% em relação à cana-planta, evidenciando uma possível redução de ciclos de cultivo. / The aim of this work was to evaluate the effect of level and time of freatic elevation on variables related to plant growth, development, productivity and technological parameters of sugarcane crop. The experiment was carried out in a 120-m2 greenhouse, set up at the research station of the Rural Engineering Department Luiz de Queiroz College of Agriculture (ESALQ), São Paulo University. The experimental design was Randomized Complete Block with [(2x2x3)+1+2], totaling 15 treatments and 4 repetitions. The treatments constituted of: (a) elevation of the water table to 25 and 50 cm, (b) time of the water table elevation for 4, 6, 8 e 12 days, (c) stages of development 3, 6 and 9 months, and (d) constant water table of 40 and 60 cm during the cycle. There were in the experiment 60 concrete tubes with 0.40 m of internal diameter and 1.10 m of high, filled with Red-Yellow Alic Latosol. The following variables were analyzed: height of plant, tillering number, leaf area, length and diameter of stalks, productivity as well as technological parameters such as: BRIX, POL, FIBRE, AR and ATR. The analyses of sugarcane juice were performed in the laboratory of sugar and ethanol technology of ESALQ. The results obtained in growth analyses such as: tillering numbers, leaf area, height of plants, length and diameter of stalks, showed that the crop growth did not present significant differences between the applied treatments. The same was observed for the production of stalks and percentage of Brix. The most influenced technological parameter was the time of application of the treatments, except for the fiber percentage that was influenced by the water table and stage of development. The constant water table of 60 and 40 cm depth during caused larger ATR incomes. Growth parameters such as: tillering number, stalk diameter and plant height, did not presented significant differences between the treatments. Significant differences were only observed in length of stalks and foliar area for the T14 treatment, which presented the lowest averages. For the technological parameters, Brix, Pol and ATR, lower concentrations were observed when the treatments were applied in the end of the cycle. T15 treatment presented the largest ATR concentration differing significantly. The T15 treatment showed the lower concentration of reducing sugar (AR) and the highest concentration was observed for the T8 treatment, with no signficant differences for the other treatments. The highest fiber percentage was observed in treatment T1, differing significantly from the treatment T8, T12 and T13, with the lower fiber percentages. The production of sugar ratoon cane was bigger when applying the treatments in the end of the cycle (270 DAC), independent of the duration of the treatments. For the water table, the 40 cm of depth during all the culture cycle (T15) presented a reduction of 40% in relation to the sugarcane-plant, evidencing a possible reduction of crop cycles.

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