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Identificação genética de espécies de tubarões e monitoramento da pesca no litoral de Sâo Paulo

Silvério, Juliana [UNESP] 25 May 2010 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:12Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-05-25Bitstream added on 2014-06-13T19:18:38Z : No. of bitstreams: 1 silverio_j_me_botib.pdf: 1061094 bytes, checksum: 47640e09042bdc58ca79d674c35af4db (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Dados estatísticos do IBAMA/MMA (Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Naturais Renováveis) sobre a exploração pesqueira de elasmobrânquios no Brasil registraram no ano de 2007 a captura de 17.900 toneladas, sendo 12.578 toneladas somente de tubarões, um aumento de 11,35% em relação a 2006. Contudo, as dificuldades na identificação morfológica de muitas espécies de tubarões exploradas pela pesca, associada à prática bastante usual de remoção da cabeça e das nadadeiras dos animais, na maioria das vezes antes mesmo do desembarque, tem resultado em uma escassez global de informações sobre captura e comercialização, tornando quase impossível a avaliação de seus efeitos. De acordo com os relatórios a respeito da produção pesqueira apresentados pelo IBAMA nos últimos anos, apenas 22% de todos os tubarões capturados no Brasil recebem algum tipo de classificação, ainda assim, relacionando apenas um nome popular que em muitos casos refere-se a mais de uma espécie. Por outro lado, dados referente a identificação molecular do tipo PCR-multiplex, que identificam características genéticas particulares de cada táxon estão atualmente sendo desenvolvidos e utilizados no reconhecimento espécie-específico possibilitando, a identificação simultânea de diversas amostras. Com isso, o objetivo do presente trabalho foi avaliar a captura e comercialização de tubarões na região Norte do Litoral Paulista. Os resultados apresentados a partir da utilização da técnica da PCR-multiplex a partir do gene mitocondrial Citocromo Oxidase subunidade I em 1000 amostras coletadas em desembarques do litoral do estado de São Paulo, possibilitou, a identificação de 837 amostras. A partir desses dados foram observadas as freqüências relativas por espécie para avaliação de captura e comercialização de tubarões nos municípios de Cananéia, Santos e Ubatuba... / Statistics IBAMA/MMA (Brazilian Institute of Environment and Renewable Natural Resources) on fisheries exploitation of elasmobranchs in Brazil report in 2007 catching 17 900 tonnes, with only 12 578 tonnes of sharks, an increase of 11.35 % compared to 2006. However, difficulties in morphological identification of many shark species exploited by fisheries, coupled with the rather usual practice of removing the head and fins of the animals, most often even before the landing, has resulted in an overall shortage of information on catch and marketing, making it nearly impossible to evaluate their effects. According to the reports about the fish production presented by IBAMA in recent years, only 22% of all sharks caught in Brazil receive some type of classification, yet only linking a popular name in many cases refers to more of a species. Considering the increasing fisheries exploitation technique was used in multiplex PCR-based gene miticindrial Cytochrome oxidase subunit I in 1000 samples collected from landings of the coastal state of Sao Paulo, which enabled the identification of 837 samples were observed by the relative frequencies species for evaluation of capture and trade of sharks in the municipalities of Cananéia, Santos and Ubatuba. For the city of Santos was possible to identify five different species: P. glauca, A. vulpinus, S. Lewin, R. Lalandii and R. porosus, in Ubatuba was recorded the occurrence of four different species in the landings: P. glauca, I. oxyrinchus, R. lalandii and S. lewini and the municipality of Cananea were found three different species: R. lalandii, R. porosus and S. Lewin, product demand elasmobranch was larger in the city of Santos, which shows that this town deserves greater attention in relation to conservation and management of the most exploited species, and Multiplex-PCR technique proved feasible for identification of samples... (Complete abstract click electronic access below)
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Identificação genética de espécies de tubarões e monitoramento da pesca no litoral de Sâo Paulo /

Silvério, Juliana. January 2010 (has links)
Orientador: Fábio Porto Foresti / Banca: Cláudio de Oliveira / Banca: Daniela Ferreira / Resumo: Dados estatísticos do IBAMA/MMA (Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Naturais Renováveis) sobre a exploração pesqueira de elasmobrânquios no Brasil registraram no ano de 2007 a captura de 17.900 toneladas, sendo 12.578 toneladas somente de tubarões, um aumento de 11,35% em relação a 2006. Contudo, as dificuldades na identificação morfológica de muitas espécies de tubarões exploradas pela pesca, associada à prática bastante usual de remoção da cabeça e das nadadeiras dos animais, na maioria das vezes antes mesmo do desembarque, tem resultado em uma escassez global de informações sobre captura e comercialização, tornando quase impossível a avaliação de seus efeitos. De acordo com os relatórios a respeito da produção pesqueira apresentados pelo IBAMA nos últimos anos, apenas 22% de todos os tubarões capturados no Brasil recebem algum tipo de classificação, ainda assim, relacionando apenas um nome popular que em muitos casos refere-se a mais de uma espécie. Por outro lado, dados referente a identificação molecular do tipo PCR-multiplex, que identificam características genéticas particulares de cada táxon estão atualmente sendo desenvolvidos e utilizados no reconhecimento espécie-específico possibilitando, a identificação simultânea de diversas amostras. Com isso, o objetivo do presente trabalho foi avaliar a captura e comercialização de tubarões na região Norte do Litoral Paulista. Os resultados apresentados a partir da utilização da técnica da PCR-multiplex a partir do gene mitocondrial Citocromo Oxidase subunidade I em 1000 amostras coletadas em desembarques do litoral do estado de São Paulo, possibilitou, a identificação de 837 amostras. A partir desses dados foram observadas as freqüências relativas por espécie para avaliação de captura e comercialização de tubarões nos municípios de Cananéia, Santos e Ubatuba... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Statistics IBAMA/MMA (Brazilian Institute of Environment and Renewable Natural Resources) on fisheries exploitation of elasmobranchs in Brazil report in 2007 catching 17 900 tonnes, with only 12 578 tonnes of sharks, an increase of 11.35 % compared to 2006. However, difficulties in morphological identification of many shark species exploited by fisheries, coupled with the rather usual practice of removing the head and fins of the animals, most often even before the landing, has resulted in an overall shortage of information on catch and marketing, making it nearly impossible to evaluate their effects. According to the reports about the fish production presented by IBAMA in recent years, only 22% of all sharks caught in Brazil receive some type of classification, yet only linking a popular name in many cases refers to more of a species. Considering the increasing fisheries exploitation technique was used in multiplex PCR-based gene miticindrial Cytochrome oxidase subunit I in 1000 samples collected from landings of the coastal state of Sao Paulo, which enabled the identification of 837 samples were observed by the relative frequencies species for evaluation of capture and trade of sharks in the municipalities of Cananéia, Santos and Ubatuba. For the city of Santos was possible to identify five different species: P. glauca, A. vulpinus, S. Lewin, R. Lalandii and R. porosus, in Ubatuba was recorded the occurrence of four different species in the landings: P. glauca, I. oxyrinchus, R. lalandii and S. lewini and the municipality of Cananea were found three different species: R. lalandii, R. porosus and S. Lewin, product demand elasmobranch was larger in the city of Santos, which shows that this town deserves greater attention in relation to conservation and management of the most exploited species, and Multiplex-PCR technique proved feasible for identification of samples... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Desenvolvimento de marcadores genéticos para identificação de espécies de tubarões comercializados no Brasil /

Rocha, Marcelo Linardi Niero. January 2013 (has links)
Orientador: Fausto Foresti / Banca: Fernando Fernandes Mendonça / Banca: Diogo Teruo Hashimoto / Resumo: A pesca predatória vem ocasionando um enorme declínio de estoques e populações de inúmeras espécies marinhas. Tendo em vista a vulnerabilidade à exploração pesqueira da maioria das espécies de tubarões, associada às dificuldades de identificação morfológica devido às similaridades entre diversas espécies, agravada ainda, pela prática da pesca com a retirada de partes dos animais ainda antes dos desembarques, a geração de mecanismos alternativos de identificação de espécies são extremamente valiosos para oferecer uma ferramenta de controle e fiscalização da indústria pesqueira. No presente estudo foram desenvolvidos métodos de identificação simultânea, utilizando PCR - Multiplex para a identificação de espécies de tubarões com um importante valor econômico, sendo que as espécies analisadas foram divididas em seis grupos para serem aplicadas as técnicas de identificação. Com base na composição nucleotídica do gene mitocondrial ribossomal 16S de quatorze espécies de tubarões do Brasil, foram identificados os sítios polimórficos e desenhados primers espécie-especificos, para a utilização na identificação de espécies de tubarões espécimes desembarcados pela indústria pesqueira. A aplicação da metodologia resultou na caracterização de primers específicos que permitem a identificação particular de cada uma das espécies de tubarões Alopias superciliosus, Alopias vulpinus, Carcharhinus falciformes, Carcharhinus leucas, Carcharhinus longimanus, Carcharhinus plumbeus, Carcharhinus porosus, Carcharhinusn signatus, Galeocerdo cuvier, Isurus oxyhinchus, Isurus paucus, Prionace glauca, Rhizoprionodon lalandii e Rhizoprionodon porosus. Considera-se que a correta identificação do material desembarcado, que representaria o resultado da pesca das espécies de ocorrência na região, possa permitir o estabelecimento de estatísticas confiáveis nesta área, bem como ... / Abstract: The overfishing has caused a huge decline in stocks and populations of many marine species. Given the vulnerability to overfishing of most shark species, associated with difficulties in morphological identification due to similarities between different species, aggravated by the practice of fishing with the removal of parts of animals even before the landings, the generation of alternative mechanisms for species identification are extremely valuable to offer a tool to control and monitor the fishing industry. In this study we developed methods of simultaneous identification using PCR - Multiplex for identifying shark species with an important economic value, and the species were divided into six groups for application of identification techniques. Based on the nucleotide composition of the mitochondrial 16S ribosomal gene of fourteen species of Brazilian sharks, was identified polymorphic sites and species-specific primers designed for use in identification of species of sharks landed by the fishing industry. The application of the methodology resulted in the characterization of specific primers that allow the unique identification of each shark species Alopias superciliosus, Alopias vulpinus, Carcharhinus sickle, Carcharhinus leucas, Carcharhinus longimanus, Carcharhinus plumbeus, Carcharhinus porosus, signatus Carcharhinus, Galeocerdo cuvier, Isurus oxyhinchus, Isurus paucus, Prionace glauca, and Rhizoprionodon lalandii Rhizoprionodon porosus. It is considered that the correct identification of the material landed, which represent the result of fishing of the species occurring in the region, may permit the establishment of reliable statistics in this area, and make allowances for effective control and strict fishing, assisting in the preparation of proper plans and management of the fishery resources / Mestre
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Desenvolvimento de marcadores genéticos para identificação de espécies de tubarões comercializados no Brasil

Rocha, Marcelo Linardi Niero [UNESP] 30 August 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-08-30Bitstream added on 2014-06-13T20:35:56Z : No. of bitstreams: 1 000747716.pdf: 1078200 bytes, checksum: 97f3f112e9f85cc9db216ddfa42bed9a (MD5) / A pesca predatória vem ocasionando um enorme declínio de estoques e populações de inúmeras espécies marinhas. Tendo em vista a vulnerabilidade à exploração pesqueira da maioria das espécies de tubarões, associada às dificuldades de identificação morfológica devido às similaridades entre diversas espécies, agravada ainda, pela prática da pesca com a retirada de partes dos animais ainda antes dos desembarques, a geração de mecanismos alternativos de identificação de espécies são extremamente valiosos para oferecer uma ferramenta de controle e fiscalização da indústria pesqueira. No presente estudo foram desenvolvidos métodos de identificação simultânea, utilizando PCR – Multiplex para a identificação de espécies de tubarões com um importante valor econômico, sendo que as espécies analisadas foram divididas em seis grupos para serem aplicadas as técnicas de identificação. Com base na composição nucleotídica do gene mitocondrial ribossomal 16S de quatorze espécies de tubarões do Brasil, foram identificados os sítios polimórficos e desenhados primers espécie-especificos, para a utilização na identificação de espécies de tubarões espécimes desembarcados pela indústria pesqueira. A aplicação da metodologia resultou na caracterização de primers específicos que permitem a identificação particular de cada uma das espécies de tubarões Alopias superciliosus, Alopias vulpinus, Carcharhinus falciformes, Carcharhinus leucas, Carcharhinus longimanus, Carcharhinus plumbeus, Carcharhinus porosus, Carcharhinusn signatus, Galeocerdo cuvier, Isurus oxyhinchus, Isurus paucus, Prionace glauca, Rhizoprionodon lalandii e Rhizoprionodon porosus. Considera-se que a correta identificação do material desembarcado, que representaria o resultado da pesca das espécies de ocorrência na região, possa permitir o estabelecimento de estatísticas confiáveis nesta área, bem como... / The overfishing has caused a huge decline in stocks and populations of many marine species. Given the vulnerability to overfishing of most shark species, associated with difficulties in morphological identification due to similarities between different species, aggravated by the practice of fishing with the removal of parts of animals even before the landings, the generation of alternative mechanisms for species identification are extremely valuable to offer a tool to control and monitor the fishing industry. In this study we developed methods of simultaneous identification using PCR - Multiplex for identifying shark species with an important economic value, and the species were divided into six groups for application of identification techniques. Based on the nucleotide composition of the mitochondrial 16S ribosomal gene of fourteen species of Brazilian sharks, was identified polymorphic sites and species-specific primers designed for use in identification of species of sharks landed by the fishing industry. The application of the methodology resulted in the characterization of specific primers that allow the unique identification of each shark species Alopias superciliosus, Alopias vulpinus, Carcharhinus sickle, Carcharhinus leucas, Carcharhinus longimanus, Carcharhinus plumbeus, Carcharhinus porosus, signatus Carcharhinus, Galeocerdo cuvier, Isurus oxyhinchus, Isurus paucus, Prionace glauca, and Rhizoprionodon lalandii Rhizoprionodon porosus. It is considered that the correct identification of the material landed, which represent the result of fishing of the species occurring in the region, may permit the establishment of reliable statistics in this area, and make allowances for effective control and strict fishing, assisting in the preparation of proper plans and management of the fishery resources

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