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Proposta para implementação de uma máquina térmica quântica de um único QUBIT

Palacio, Juan Diego Acevedo January 2014 (has links)
Orientador: Prof. Dr. Roberto Menezes Serra / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Física, 2014. / A termodinâmica nos permite analisar o desempenho de máquinas térmicas que tem a capacidade de converter o calor em trabalho útil. As leis da termodinâmica (sobretudo a segunda) impõem limites em diversos processos incluindo processamento de informação em computadores clássicos. O desenvolvimento de dispositivos cada vez menores no âmbito da computação tem suscitado perguntas sobre qual seria o limite de aplicabilidade das leis da termodinâmica quando os mesmos estiverem próximos do limite quântico. Este tipo de questionamento tem vinculado diferentes disciplinas em uma nova área de pesquisa que tem sido chamada de termodinâmica quântica. A presente dissertação se insere nesse novo campo do conhecimento, especificamente estudamos a possibilidade de implementação de uma máquina térmica quântica que opera fora do equilíbrio e emprega um único "qubit" como substancia de trabalho. Para este propósito usamos as ferramentas subjacentes aos teoremas de flutuação para expressar adequadamente quantidades como trabalho e calor (que no contexto quântico são variáveis estocásticas). Descrevemos em detalhes o ciclo termodinâmico para extração de trabalho em tempo finito, cuja dinâmica é controlado por mudanças súbitas ("quenches") de um campo externo. O protocolo proposto pode ser implementado e completamente caracterizado utilizando a tecnologia atual no contexto de "Resonância Magnética Nuclear (RMN)". Finalmente, mostramos os regimes de operação da referida máquina quântica. / Thermodynamics allows us to analyze the performance of thermal machines, which has the ability to convert the heat into useful work. Among others, the laws of thermodynamics (especially the second) impose limits in various processes including information processing in classical computers. The development of increasingly smaller computing devices, has raised questions about which would limit the applicability of the laws of thermodynamics, when they are close to the quantum limit. This type of questioning has linked different disciplines into a new area of research that has been called quantum thermodynamics. This dissertation is inserted into this new field of knowledge. Specifically we study the possibility of implementing a quantum heat engine which operates out of equilibrium, and employs a single "qubit" as working substance. For this purpose we use the underlying tools of fluctuations theorems to adequately express quantities such as work and heat (which in the quantum context are stochastic variables). We describe in detail the thermodynamic cycle for work extraction in finite time, whose dynamics is controlled by "quenches", or sudden changes in an external field. The proposed protocol can be implemented and fully characterized using the current technology in the context of " Nuclear Magnetic Resonance (NMR)". Finally, we show the regimes of the machine operation
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Crescimento e caracterização de monocristais da série RNiSi3 (R = terra rara)

Giraldo, Deisy Viviana Aristizábal January 2015 (has links)
Orientador: Prof. Dr. Marcos de Abreu Ávila / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Física, 2015. / Crescemos usando o método de fluxo, com fluxo de estanho, os primeiros monocristais dos novos compostos intermetálicos RNiSi3 (R = terra rara) e realizamos suas primeiras caracterizações estruturais e magnéticas a baixas temperaturas. Os monocristais desta fase cresceram só para as terras raras pesadas, com R=Y, Gd-Tm. Os difratogramas obtidos da difração de raios X confirmam que estes compostos cristalizam no grupo espacial Cmmm e adotam uma estrutura ortorrômbica do tipo SmNiGe3. As medidas magnéticas dependentes da temperatura entre 2 K e 300 K revelam estados fundamentais antiferromagnéticos fortemente anisotrópicos, com a temperatura de Néel variando de 2.6 K até 32 K, para todos os compostos magnéticos da série. As isotermas magnéticas obtidas a baixas temperaturas para campos magnéticos de até H = 70 kOe exibem transições metamagnéticas dependentes da temperatura, do campo magnético e da orientação do cristal. Para os compostos TbNiSi3 e DyNiSi3 estas transições exibem grandes histereses, cuja complexidade se reflete nos diagramas de fase magnéticos. Com a redução do raio iônico dos lantanídeos de Gd a Tm, percebe-se uma tendência de redução da ortorrombicidade (diferença entre os parâmetros de rede a e c), acompanhada de uma mudança da orientação do eixo fácil de magnetização no plano ac, do GdNiSi3 ao HoNiSi3, para uma orientação paralelo ao eixo cristalografico b, com ErNiSi3 e TmNiSi3. / We have grown, using the flux method with tin as the flux, the first single crystals of the new intermetallic series RNiSi3 (R= rare earth), and performed the first structural and magnetic caraterization at low temperatures. Single crystals of this phase grew only for the heavy rare earths, with R=Y, Gd-Tm. X-ray diffraction confirms that these compounds crystallize in the Cmmm space group and assume a layered orthorhombic SmNiGe3-type structure. Magnetic measurements dependent on temperature between 2 K to 300 K reveal antiferromagnetic ground states with strong anisotropy and the Néel temperature ranges from 2.6 K to 32 K, for all magnetic compound of the series. Magnetic isotherms were obtained at low temperatures for applied fields up to H = 70 kOe and exhibit metamagnetic transitions dependent on temperature, magnetic field and crystal orientation. For the compounds TbNiSi3 and DyNiSi3 this transition exhibits a large hysteresis, whose complexity reflects in the magnetic phase diagrams. With the reduction of the lanthanide ionic radius from Gd to Tm, we can see a tendency of reduced orthorhombicity (difference between the lattice parameters a and c) accompanied by a change from orientation to easy magnetization axis in the ac plane for GdNiSi3 to HoNiSi3, to the orientation parallel to the b crystallographic axis, with ErNiSi3 and TmNiSi3.
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Estudo de feixes de Airy e sua geração experimental via métodos holográficos

Suarez, Rafael Antonio Bonilla January 2015 (has links)
Orientador: Prof. Dr. Marcos Roberto da Rocha Gesualdi / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Física, 2015. / Os feixes de Airy tem atraido um grande interesse em fotonica, uma vez que tem propriedades vantajosas como a propagacao nao-difrativa e aceleracao sem acao de forcas externas. Por outro lado, a holografia e uma tecnica interferometrica que permite o registro e a reconstrucao de frentes de onda de objetos e feixes opticos, pois um holograma carrega as informacoes de intensidade e fase de um objeto ou feixe eholografadof. Recentemente, o aumento da capacidade de processamento e armazenagem dos microcomputadores; o desenvolvimento de novos dispositivos optoeletronicos, como os moduladores espaciais de luz (SLMs), as cameras CCDs (Coupled Charge Device) de alta resolucao; e, novos materiais fotossensiveis (materiais eletro-opticos e fotorrefrativos, PRMs); vem possibilitando a viabilidade dos hologramas gerados por computador (CGH, Computer Generate Hologram) e a implementacao experimental de sistemas holograficos de registro e reconstrucao numericas e opticas de objetos tridimensionais e geracao de ondas e feixes opticos especiais. Neste trabalho, nos apresentamos um estudo dos feixes de Airy e suas caracteristicas nao-difrativas e de aceleracao durante sua propagacao. Numa primeira etapa, montamos um sistema experimental que permitiu o registro (construcao) numerico e a reconstrucao de hologramas de feixes de Airy usando dispositivos LC-SLM. Numa segunda etapa, montamos um sistema experimental que permitiu o registro e a reconstrucao optica de hologramas de feixes de Airy usando o metodo de holografia fotorrefrativa com cristais ....12......20 (BTO) para a geracao optica de feixes de Airy. Na messma linha, a partir da obtencao numerica dos campos, mostramos a possibilidade de criar matrizes de feixes de Airy em numa so reconstruccao holografica. Paralelamente, fizemos um analise dos resultados de reconstrucao numerica optica dos hologramas e dos resultados de reconstrucao optica destes hologramas, bem como, suas potencialidades para aplicacoes tecnologicas. / The Airy beams have attracted great interest in photonics, once it has advantageous properties as the non-diffractive propagation and acceleration without action of external forces. On the other hand, holography is an interferometric technique that allows the recording and reconstruction of wavefront objects and optical beams, due to hologram carries the intensity and phase information of an object or beam. Recently, increased processing capacity and storage microcomputers; the development of novel optoelectronic devices such as spatial light modulators (SLMs), the CCD camera (Charge Coupled Device) with high resolution; and new photosensitive materials (electro-optic and photorefractive materials, DRP); has enabled the viability of computer-generated holograms (CGH, Computer Generate Hologram) and the experimental implementation of holographic systems of numerical and optical recording-reconstruction of three-dimensional objects and generation of special optical beams. In this work, we present a study of the beam Airy their non-diffractive characteristics and acceleration during its propagation. In a first step, we developed a experimental system that allowed me the record (construction) numerical and optical reconstruction holograms of Airy beams using LC-SLM devices. In a second step, developed a experimental system that allowed me the record and the optical reconstruction Airy beam holograms using photorefractive holography method with ....12......20 (BTO) crystal for optical generation of beams Airy. Similarly, upon the obtaining numerical fields, we show the possibility to create arrays of Airy beams in a single holographic recontruccao. In parallel, we did an analysis of the results of the numerical optical reconstruction of hologrmas and the resultlts of optical reconstruction of such holograms, as well as their potential for technological applications.
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Estrutura e atividade de citocromo c modificado por peroxinitrito gerado por decomposição térmica de 1,3 morfolinosidnonimina (sin-1)

Silva, Sandra Marília de Souza January 2014 (has links)
Orientadora: Profa. Dra. Iseli Lourenço Nantes / Tese (doutorado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Biossistemas, 2014. / Citocromo c é uma proteína formada por uma única cadeia polipeptídica, e em humanos, possui 104 resíduos de aminoácidos, estando associada à membrana interna mitocondrial, sintetizada no citosol como uma apoproteina. Os principais papeis biológicos de citocromo c são, atuação na cadeia de transporte de elétrons, papel oxidante e contribuição na apoptose, quando liberado no citosol. O citocromo c esta sujeito a modificações pós-traducionais que podem estar relacionados à sinalização, como, fosforilação ou agentes pró-oxidantes como é o caso da nitração. O SIN-1 é o principio ativo da Molsidomine (SIN-10), uma droga vasodiladora, estudos demonstraram que a incubação de SIN-1 com citocromo c produz uma espécie modificada de citocromo c. O superóxido reage com o óxido nítrico produzindo peroxinitrito, podendo, portanto, mimetizar essas condições. Os objetivos do trabalho foram investigar melhor essas espécies modificadas e caracterizar sua atividade através de técnicas espectroscópicas. Nas condições estudadas no presente trabalho é possível inferir que a presença da histidina 26 é fundamental para a formação da espécie modificada. A fosforilação das tirosinas 48 e 97 podem ter contribuído para a proteção contra o estresse nitroativo. Houve o desaparecimento da banda de absorção em 695 nm, o que pode indicar que o átomo de Fe perdeu a sexta coordenação com a metionina 80. Estudos posteriores devem ser realizados com o objetivo de avaliar a atividades biológicas dessas espécies modificadas.
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Produção de nanopartículas poliméricas com tamanho controlado com potencial aplicação na liberação controlada de agentes antitumorais

Oliveira, Anderson Marques de January 2014 (has links)
Orientador: Prof. Dr. Fernando Carlos Giacomelli / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Biotecnociência, 2014. / A aplicação de nanopartículas poliméricas na área biomédica tem avançado em ritmo acelerado. Dentre os diversos polímeros e copolímero aprovados pelas agências reguladoras para a preparação de nanopartículas poliméricas visando aplicações biomédicas, o PLGA - poli(ácido láctico-co-ácido glicólico) - vem sendo um dos mais utilizados por exibir excelente biocompatibilidades e tempo de biodegradação adequado. Particularmente no campo da nanomedicina, a habilidade de se controlar a dimensão de nanopartículas é essencial. Muitas vezes estas estruturas precisam atravessar barreiras biológicas distintas para se acumularem em locais de difícil acesso tal como o interior de sítios tumorais. A capacidade das Nanopartículas Poliméricas (PNPs) de se acumularem em sítios tumorais está essencialmente vinculada ao efeito EPR (do inglês Enhanced Permeability and Retention). O efeito EPR é dependente de uma série de fatores que estão relacionados essencialmente com as características do sítio tumoral. Geralmente nanopartículas com dimensões inferior a RH 100 nm são preferencialmente acumuladas em sítios tumorais, após a administração intravenosas. Por outro lado, estas estruturas também precisam ser suficientemente grandes (2RH > 10 nm) para que não sejam excretadas rapidamente através da filtração renal. Levando-se em conta as considerações mencionadas acima, o objetivo do presente trabalho foi investigar em detalhes a influência de parâmetros físico-químicos e a sua relação com o tamanho final de PNPs produzidas por nanoprecipitação. Demonstrou-se que nanopartículas biodegradáveis de PLGA livres de surfactante e com dimensão variável entre RH 28 nm e RH 130 nm podem ser produzidas com sucesso utilizando-se o processo de nanoprecipitação. A dimensão de PNPs de PLGA poder ser controlada através do ajuste da concentração polimérica, da escolha do solvente orgânico e pelo ajuste da temperatura e da força iônica da fase aquosa. Os dados experimentais adquiridos também mostraram que a interação polímero-solvente não tem relevância substancial na dimensão final dos coloides poliméricos produzidos. Foi também evidenciado que o tamanho hidrodinâmico de PNPs pode ser precisamente e linearmente ajustado utilizando-se misturas de solventes orgânicos. Desta fora, sugerese que PNPs podem ser produzidas com tamanho sob demanda, podendo ser utilizadas em uma variada gama de aplicações terapêuticas que tem sua eficácia essencialmente dependente do tamanho.
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Análise da expressão das catepsinas K, L e S durante a diferenciação induzida de adipócitos 3T3-L1

Palma, Renata Prado January 2014 (has links)
Orientador: Prof. Dr. Marcelo Augusto Christoffolete / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Biotecnociência, 2014. / A obesidade é um problema global alarmante, sendo um fator desencadeador de outras enfermidades, como doenças cardiovasculares e diabetes do tipo II. Para que ocorra a proliferação do tecido adiposo, responsável pelo acúmulo de gordura característico da obesidade, é preciso que as células que o compreendem se diferenciem de pré-adipócitos em adipócitos maduros, passando por drásticas mudanças morfológicas, reguladas pela expressão gênica de fatores de transcrição, até que estejam prontos para estocar triglicerídeos e liberar ácidos graxos além de responder a hormônios como a insulina e glicocorticóides. A regulação da expressão de alguns desses fatores já é conhecida, porém há muito ainda para se desvendar sobre o processo de adipogênese. Sabe-se que as catepsinas K, L e S são alguns desses fatores que regulam o processo da formação do tecido adiposo. Além de estudos já relacionarem estas enzimas com a clivagem da leptina, hormônio que é responsável por sinalizar ao Sistema Nervoso Central (SNC) sobre o status energético, promovendo a saciedade e o aumento do gasto energético, este hormônio, ainda está ligado à inibição da adipogênese. Desta forma, este trabalho propõe a análise da expressão das enzimas CatK, CatL e CatS durante o processo de diferenciação de células 3T3-L1, relacionando a expressão detectada nos dias de diferenciação com fatores de transcrição envolvidos no processo e marcadores de diferenciação já reconhecidos pela literatura. / Obesity is a global problem alarming, as a trigger for other cardiovascular diseases and type II diabetes factor. For the proliferation of adipose tissue responsible for this accumulation of fat occurs it is necessary that the cells that comprise to differentiate from preadipocytes into mature adipocytes undergoing drastic morphological changes of gene expression regulated by transcription factors until they are ready to store triglycerides and free fatty acids , as well as respond to hormones such as insulin and glucocorticoids . The regulation of expression of some of these factors is already known, but there is still much to uncover about the process of adipogenesis. It is known that cathepsin K, L and S are some of the factors that regulate the process of formation of adipose tissue. In addition to studies already relate these enzymes with cleavage of leptin, a hormone that is responsible for signaling the Nervous System on the energy status, promoting satiety and increased energy expenditure, this hormone is still on the inhibition of adipogenesis. Thus, this paper proposes the analysis of the expression of CatK, CatL and CatS enzymes during the differentiation of 3T3 - L1 cells, correlating expression detected on days of differentiation with transcription factors involved in the process and differentiation markers already recognized by literature
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Análise de compostos peptideomiméticos como inibidores de calicreínas teciduais humanas

Passos, Silvia Gomes January 2015 (has links)
Orientador: Prof. Dr. Luciano Puzer / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Biossistemas, 2015.
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Produção de baculovírus recombinante para a glicoproteína E2 do arbovirus Mayaro em células de insetos

Vasconcelos, Ligia Marinho Pereira January 2016 (has links)
Orientadora: Profa. Dra. Maria Aparecida Sperança / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Biossistemas, 2016. / O arbovírus Mayaro (MAYV), pertence ao gênero Alphavirus, família Togaviridae e grupo sorológico A. Como parte do projeto de pesquisa sobre "Arboviroses Emergentes na Amazônia Ocidental", foi isolada uma estirpe de um alphavirus Mayaro a partir de um indivíduo febril de Acrelândia, Acre. O MAYV ocorre no ambiente silvestre ou rural em áreas próximas a florestas e seu ciclo de transmissão envolve a participação de primatas não humanos, aves e mosquito Haemagogus ssp. As características patogênicas do vírus MAY em humanos são pouco compreendidas e o potencial de dispersão desses vírus e a possibilidade de participação de espécies de mosquitos do gênero Aedes em seu ciclo de transmissão fazem desse vírus um importante organismo para estudos biológicos e epidemiológicos. Devido à natureza não específica dos sinais e sintomas de doenças febris agudas causadas por MAYV, o diagnóstico clínico é difícil e pode ser confundido com outras doenças febris, como: a febre da dengue, febre do chikungunya, febre amarela e a malária. Já o diagnóstico laboratorial por isolamento viral é laborioso e depende de infraestrutura e pessoal especializado, disponível em poucos laboratórios brasileiros. O diagnóstico imunoenzimático possui limitações quanto à utilização de partículas virais infecciosas e também por produzirem reações cruzadas com vírus da mesma família. Sendo assim, com o intuito de obter antígeno recombinante específico para detecção de MAYV, este projeto teve por objetivo expressar a glicoproteína E2 do vírus em células de insetos utilizando baculovírus recombinante como vetor. A glicoproteína E2 dos alphavirus tem a função de se ligar a receptores presentes na membrana plasmática da célula alvo para a entrada do vírus através de uma vesícula endossomal. Como resultado, foi obtido o baculovírus recombinante para a glicoproteína E2 de MAYV, e a mesma foi expressa pela primeira vez em células de inseto High-FiveTM. Apesar de utilizar vetor com sinal de exportação da proteína recombinante para o meio extracelular, a glicoproteína recombinante E2 de MAYV não foi exportada, permanecendo na fração celular da cultura. Análises da estrutura tridimensional da E2 homóloga de alphavirus indicaram que esta glicoproteína apresenta um domínio transmembrana, o que justifica sua permanência na bicamada fosfolípidica da célula hospedeira. / The arbovirus Mayaro (MAYV), belongs to the genus Alphavirus, family Togaviridae and serological group A. As part of the research project on "Emerging Arboviroses in the Western Amazon", a strain of Mayaro alphavirus was isolated from a febrile individual of Acrelândia, Acre. MAYV occurs in the wild or rural environment, in areas near to forests and its life cycle includes the participation of non-human primates, birds and mosquito Haemagogus ssp. The pathogenic characteristics of MAYV in humans are poorly understood and the dispersal potential of these viruses and the possibility of participation of species of Aedes mosquitos in its transmission cycle make this virus an important organism for biological and epidemiological studies. Because of the nonspecific nature of the signs and symptoms of acute febrile illness caused by MAYV, clinical diagnosis is difficult and can be confused with other infectious diseases, such as dengue fever, chikungunya fever, yellow fever and malaria. Moreover laboratory diagnosis by viral isolation is laborious and depends on infrastructure and trained personnel available in a few Brazilian laboratories. The enzyme immunoassay diagnosis has limitations on the use of infectious viral particles and also for producing cross-reactions with other virus from the same group. Thus, in order to obtain recombinant antigen for specific detection of MAYV, this project aimed to express the MAYV E2 glycoprotein in insect cells using recombinant baculovirus as vector. The E2 glycoprotein of the alphaviruses has the function of binding to receptors in the plasma membrane of the target cell for viral entry through an endosomal vesicle. The recombinant baculovirus was obtained for the MAYV E2 glycoprotein, and this protein was expressed for the first time in High- FiveTM insect cells. Despite using a vector with signal to exportation of the recombinant protein to the extracellular medium, the MAYV E2 glycoprotein was not exported, remaining in the cell fraction of the culture. Structural analyses of alphavirus E2 homologous protein indicated that the glycoprotein has a transmembrane domain, which justifies its permanence in the host cell phospholipid bilayer.
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Síntese e estudo das propriedades estruturais, morfológicas e elétricas do composto Bi25FeO39 e suas potenciais aplicações

Velez, Emersson Eduardo Espinosa January 2016 (has links)
Orientador: Prof. Dr Carlos Ivan Henao Osorio / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Física, 2016. / Neste trabalho, apresentamos novos resultados sobre segurança de protocolos de distribuição quântica de chave de duas vías (TWQKD por suas iniciáis em inglês) que utilizam estados não ortogonáis. Trabalhamos no cenário de protocolos para os quais o pós-processamento é feito com comunicação clássica de uma via e não há pre-processamento. O análise de segurança é implementado com tecnicas que permitem cubrir conjuntos de protocolos bastante amplos. Desse jeito, providenciamos uma nova prova de segurança para um protocolo TWQKD recentemente proposto [32] e pesquisamos a possibilidade de superar seu desempenho. Este protocolo é determinista, o que signica que o receptor pode decodicar os bits codicados com probabilidade igual a um. Mostramos que só há um protocolo TWQKD desse tipo (não reportado na literatura até onde sabemos) com o potencial de ter uma fração secreta maior e em consequência ser mais robusto ao ruído. Além disso, é argumentado que a fração secreta correspondente podería ser a mesma do protocolo "six-state" [9]. Por outro lado, analizamos o desempenho de protocolos TWQKD quando o ruído do canal de comunicação pode depender das polarizações especícas dos estados transmitidos. Encontramos que, para certas famílias de protocolos e uma quantidade de ruído dada, a informação potencialmente ltrada é limitada superiormente pela associada com um canal despolarizante. Adicionalmente, táis protocolos incluem opera ções de "pre-codicação" que poderíam contribuir a esta melhora no caso de ruído assimétrico. Denimos também um parâmetro para caracterizar a eciência de protocolos TWQKD, associado à fração de qubits que o receptor pode decodicar; em concordância, este parâmetro alcança o máximo valor para protocolos deterministas. Discute-se como uma alta eciência pode na prática melhorar fatores como a taxa de bits secretos e a qualidade da estimação do ruído. / We present new results concerning security of Two-Way Quantum Key Distribution (TWQKD) protocols that employ non orthogonal states (e.g. LM05 [22]). We work within the scenario where the classical post-processing is performed with one-way classical communication and there is no pre-processing. The security analysis is carried out with techniques that allow to cover quite broad sets of protocols. In this way, we give a new security proof for a recently proposed TWQKD protocol [32] and investigate the possibility of outperforming it. This protocol is deterministic, meaning that the receiver can decode the encoded bits with probability one. We show that there is only one TWQKD protocol of this kind (non reported in the literature as far as we know) with the potential to have a larger secret fraction and consequently be more robust against noise. Furthermore, it is argued that the corresponding secret fraction could be the same of the 6-State protocol [9]. On the other hand, we analyze the performance of TWQKD protocols when the noise of the communication channel may depend of the particular polarization states being transmitted. We find that, for certain families of protocols and a given amount of total noise, the potentially leaked information is upper bounded by the associated to a depolarizing channel. Moreover, such protocols include "pre-encoding" operations that could contribute to this enhancement in the asymmetric noise case. We also define a parameter to characterize the Efficiency of QKD protocols, referring to the fraction of qubits that the receiver is able to decode; accordingly, this parameter achieves the maximum value for deterministic protocols. It is discussed how a high efficiency can in practice improve factors like the secret key rate and the quality of the noise (or error) estimation.
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Sobre o posicionamento filogenético de Cycloramphus Tschudi 1838 e Zachaenus Cope 1866 (Anura: Cycloramphidae) à luz da morfologia larval

Barros, Vivian Célia de Oliveira Rocha January 2016 (has links)
Orientadora: Profª. Drª. Vanessa Kruth Verdade / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Evolução e Diversidade, 2016. / Pertencentes à família Cycloramphidae, Cycloramphus e Zachaenus são gêneros de estreita afinidade. Restritos a Mata Atlântica brasileira estão presentes em áreas de relevo acidentado, ocupando riachos com corredeira, serapilheira em áreas florestadas ou campos rupestres. Com base no tipo de larvas podem ser divididos em dois grupos: um que apresenta larvas exotróficas que se desenvolvem sobre rochas úmidas e inclui 19 espécies, e, outro, com 11 espécies, em que as larvas são endotróficas e desenvolvem-se em ambiente terrestre, sob rochas ou troncos caídos. Externamente os adultos podem ser diagnosticados pela presença de menisco na parte superior da íris e tímpanos não visíveis, mas a interpretação dada por diferentes autores a outras características de sua anatomia faz com que existam questões taxonômicas ainda pendentes no grupo, que só poderão ser respondidas através de hipóteses filogenéticas. Este trabalho testou a relação filogenética das espécies dos gêneros Cycloramphus e Zachaenus baseadas na análise comparativa de caracteres de morfologia externa e condrocrânio de seus girinos, associada a técnicas de pesagem diferencial. O resultado obtido corrobora o monofiletismo de Cycloramphidae e sugere a subdivisão da família em dois clados. Um deles que inclui as espécies de Cycloramphus e Zachaenus cujos girinos são endotróficos. Outro, que inclui as espécies de Cycloramphus com larvas exotróficas e Thoropa. O aninhamento de Zachaenus entre as espécies de Cycloramphus já foi sinalizado por estudos anteriores, mas o agrupamento de Thoropa aos demais Cycloramphus é inédito. A configuração sugere a necessidade de modificações na taxonomia, já que Cycloramphus não seria monofilético. Um dos arranjos possíveis seria a manutenção de Thoropa, restrição de Cycloramphus às espécies de Cycloramphus que apresentam girinos exotróficos, e transferência das espécies atualmente em Cycloramphus que apresentam girinos endotróficos para Zachaenus. Entretanto, em se tratando de caracteres larvais, seria conveniente testar a existência de sinal filogenético com caracteres de outras fontes e amostras maiores, incluindo larvas de outras espécies do gênero Thoropa e de grupos externos considerados mais próximos à Cycloramphidae do que aqueles utilizados. A principal consideração a ser feita diante do arranjo obtido, é se a altíssima especialização das larvas das espécies em Cycloramphidae não estaria introduzindo ruído gerando uma hipótese de relacionamento que reflete mais a ecologia do que a história evolutiva do grupo. / Cycloramphus and Zachaenus (family Cycloramphidae) are considered close related. The species in these genera are stream or ground dwellers frogs endemic to areas of sharp relief at the Atlantic forest Domain. If based on larvae morphotype, the species may be split in two groups: 19 species which tadpoles are exotrophic and semiterrestrial living on humid rocks, and 11 species which tadpoles are endotrophic and terrestrial living under rocks or fallen trunks. The adults are relatively similar, and promptly identified by the presence of an eye meniscus and hidden tympanum. However, the presence of inguinal macrogland in adult males and terrestrial reproduction has led to different interpretation and different taxonomic arrangements involving Cycloramphus, Zachaenus, and a third genus Craspedoglossa, currently under synonym of Cycloramphus. These arrangements can be tested only under phylogenetic hypothesis. We have used comparative anatomy of larvae to set 40 characters from external morphology and chondrocranium and obtain a phylogenetic hypothesis for the groups of species. Our results are congruent to the monophyly of Cycloramphidae family and suggest two clades within it: one including the Cycloramphus and Zachaenus species presenting endotrophic and terrestrial tadpoles; the other including Thoropa and the Cycloramphus presenting exotrophic semiterrestrial tadpoles. Zachaenus nested within Cycloramphus is a combination that has already raised in literature, however Thoropa as the sister group to the Cycloramphus species with exotrophic tadpoles is a novelty. This arrangement makes Cycloramphus a non monophyletic genus and requires taxonomic changes. Cycloramphus should be restricted to the species which tadpoles are exotrophic, and Zachaenus expanded to include also the Cycloramphus which tadpoles are endotrophic. We think these changes premature, though. Considering larval characters, and the very high specialization of Cycloramphidae larvae, it may be possible that the arrangement obtained is more a reflex of ecological similarity than evolution history. The taxonomic changes should be postponed until we could test the phylogenetic signal of these characters by using more than one species of Thoropa; outgroup species closer related to Cycloramphidae, as well as characters from different sources as internal oral anatomy from larvae, morphology of adults, and molecular markers.

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