Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2007. / Submitted by wesley oliveira leite (leite.wesley@yahoo.com.br) on 2009-12-10T18:55:43Z No. of bitstreams: 1 2007_EderMarques.pdf: 3507588 bytes, checksum: 041b04ae51be60c2b687d29df8c79ff6 (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2010-01-07T22:54:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2007_EderMarques.pdf: 3507588 bytes, checksum: 041b04ae51be60c2b687d29df8c79ff6 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-01-07T22:54:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2007_EderMarques.pdf: 3507588 bytes, checksum: 041b04ae51be60c2b687d29df8c79ff6 (MD5) Previous issue date: 2007 / O cultivo de uvas de mesa no Brasil tem se intensificado principalmente em áreas próximas ao Submédio do Vale do São Francisco. Essa região é responsável por 15 % da produção de uvas de mesa finas do país, correspondendo a cerca de 98 % das exportações brasileiras anuais de uva, tanto em volume quanto em valores de produção. Entretanto, muitos são os problemas fitossanitários que ocorrem nessa cultura. Dentre as doenças de etiologia bacteriana apenas o cancro bacteriano, causado por Xanthomonas campestris pv. viticola (Xcv), apresenta hoje incidência expressiva e importância econômica em videira. Embora tenha sido relatada em 1998, acredita-se que a bacteriose já estivesse presente na região desde 1996, sem ter sido detectada. Assim torna-se importante monitorar a variabilidade das populações bacterianas ao longo dos anos, o que pode ser conseguido de maneira eficiente utilizando marcadores moleculares. Outro fator a ser considerado é o uso contínuo e muitas vezes indiscriminado de compostos cúpricos na agricultura o que pode levar a ocorrência de bactérias fitopatogênicas ou saprofíticas resistentes ao cobre. Considerando a importância do cancro bacteriano para a viticultura no Brasil e buscando maior conhecimento sobre variabilidade do patógeno e seu comportamento quanto a tolerância aos cúpricos, foram objetivos deste trabalho: (1) Caracterizar a diversidade genética, através de rep-PCR, de isolados de Xcv coletados no Vale do São Francisco, entre os anos de 2003 e 2006, comparando-os aos isolados já caracterizados, coletados entre 1998 e 2001; (2) Determinar níveis de tolerância ao cobre em isolados de Xcv representativos de diferentes épocas (1998 a 2006) e áreas de coleta; (3) Detectar e caracterizar em Xcv a presença de regiões homólogas ao gene copA que confere resistência ao cobre em Xanthomonas spp. Os “fingerprints” gerados por rep-PCR, a partir do DNA purificado de Xcv coletados em diferentes anos, áreas e variedades de Vitis vinifera L. foram eficientes e reprodutíveis, constituindo-se em uma importante ferramenta no estudo da genética populacional deste patógeno. Os resultados indicaram ter ocorrido uma possível estabilização da população heterogênea observada por Trindade et al. (2005), além de permitir a observação de bandas comuns e perfis homogêneos entre os isolados que podem ser utilizados para o diagnóstico. Entretanto, não foi possível correlacionar, através dos estudos das seqüências repetitivas, a origem geográfica, a época de coleta ou a cultivar de origem dos isolados com os perfis genômicos. Nos testes de tolerância in vitro aos íons de cobre, de uma forma geral observou-se uma evolução no crescimento da tolerância ao cobre ao longo dos anos, em que isolados de Xcv foram coletados nas áreas de ocorrência do cancro bacteriano de 1998 a 2006. Os resultados do presente estudo confirmam aqueles já relatados anteriormente, de que as estirpes brasileiras apresentaram variabilidade na tolerância ao cobre e que esta tolerância ocorre naturalmente nas regiões produtoras. Araújo (2001) mostrou que essas estirpes mais tolerantes ocorrem na região de Petrolina, e no presente trabalho, demonstrou-se que também ocorrem em outras áreas como Bahia e Piauí. Amplificações com os “primers” desenhados a partir de seqüências do gene copA de X. axonopodis pv. citri e X. campestris. pv. campestris foram observadas para todos os isolados de Xcv testados. A alta homologia entre os produtos das amplificações com os “primers” copAR e copAL a partir do DNA dos isolados de Xcv com o gene cop A, confirmou a existência do gene em Xcv. A árvore filogenética gerada com alta reprodutibilidade mostrou maior distância de Xcv em relação a X. oryzae pv. oryzae e X. campestris pv. campestris e maior proximidade com X. axonopodis pv. citri. Este fato pode ser um indicativo de maior afinidade de X. campestris pv. viticola com a espécie X. axonopodis do que com X. campestris, confirmando as observações de Takita et al. (2004) em trabalho analisando a região rpf. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The production of table grapes (Vitis vinifera L.) in Brazil has increased mainly in the irrigated areas of the “Submédio” of the São Francisco valley, northeastern Brazil. This region is responsible for 15 % of the grape production of the country, corresponding to nearly 98 % of the annual exports. Among the many phytosanitary problems that affect grape production, bacterial canker is the most important bacterial disease affecting several V. vinifera cultivars in that region. The disease is caused by Xanthomonas campestris pv. viticola (Xcv). Although it was reported in 1998, it is believed that it has been present in the region since 1996, without being detected. It is important to monitor the population variability through time, which can be achieved by using molecular markers. Another relevant fact is the continuous, excessive and frequently inadequate use of copper-based fungicides that can lead to resistance in bacteria. Considering the importance of bacterial canker for grape production in Brazil and the lack of information on pathogen variability and its behavior regarding copper tolerance, the objectives of this work were: (1) to characterize the genetic diversity, using rep-PCR, among Xcv strains collected from 2003 to 2006, comparing them to a population already characterized, collected between 1998 and 2001; (2) to determine tolerance levels to copper in Xcv strains, selected to represent different collection years (1998 to 2006) and collection sites; and (3) to detect and characterize in Xcv the presence of homologous regions to the copA gene, which is involved in copper resistance in Xanthomonas spp. The fingerprints generated by rep-PCR using bacterial purified DNA from isolates collected in different years, areas and from different grape cultivars were reproducible and the results indicated lower levels of polymorphism among the isolates collected from 2003- 2006 than among the isolates previously characterized by Trindade et al. (2005). The profiles were generally very homogeneous and several common bands among isolates were detected. However, it was not possible to correlate geographic origin, collection year or cultivar with the rep-PCR genomic patterns. In vitro tests were conducted to assess tolerance to copper ions in Xcv. The results showed a general increase in copper tolerance from 1998 through 2006 and also showed variation in the minimum inhibitory concentration among the isolates. Previous studies demonstrated that this tolerance occurs naturally in the Petrolina region (Pernambuco state). Here we observed variation in tolerance also in isolates from Bahia and Piauí states. PCR- amplifications with primers (copAR and copAL) selected from the copA sequences of X. axonopodis pv. citri and X. campestris pv. campestris were observed for all Xcv isolates. After sequencing of the 925-bp PCR product, high sequence homology between Xcv sequences and those from X. axonopodis citri and X. campestris pv. campestris was observed, thus confirming the presence of the copA gene in Xcv. The phylogenetic analysis showed a closer relationship between Xcv and X. axonopodis pv. citri than with X. oryzae pv. oryzae or X. campestris pv. campestris. This suggests a closer proximity with the species X. axonopodis than with X. campestris, confirming the observations of Takita et al. (2004) when analyzing the rpf gene region.

Orientador: Edson Luiz Furtado / Coorientador: César Júnior Bueno / Banca: Marco Antinio Tecchio / Banca: Adriana Zanin Kronka / Banca: Margarida Fumiko Ito / Banca: Ivan Herman Fischer / Resumo: Phaeomoniella chlamydospora é considerado o fungo mais agressivo do complexo de patógenos, responsáveis por causar a doença de Petri em videira. Esse trabalho teve como objetivo caracterizar patologicamente, morfoculturalmente e molecularmente, uma população com 57 isolados de P. chlamydospora, oriundos de videiras de sete estados brasileiros. Todos os isolados foram molecularmente identificados como pertencentes à espécie P. chlamydospora, através da amplificação da região ITS e de partes do gene da beta tubulina (β Tubulin). Essa espécie já foi descrita ocorrendo nos estados de São Paulo, Pernambuco e Rio Grande do Sul. O presente estudo relata pela primeira vez a ocorrência deste fungo em videiras nos estados do Paraná, Santa Catarina, Minas Gerais e Mato Grosso. Posterior aos estudos moleculares, realizaram-se os seguintes ensaios: caracterização cultural dos isolados em meio de cultura BDA (batata dextrose ágar) e MEA (extrato de malte); caracterização morfológica de conídios, conidióforos e clamidósporos em meio de cultura MEA e SNA (sintético nutriente ágar); crescimento dos isolados em temperaturas de 5, 10, 15, 20, 25, 30 e 35ºC por 42 dias em meio BDA; e teste de patogenicidade em videiras 'Niágara Rosada' (incidência e agressividade). A análise de cultura identificou quatro características de colônia. Dessas, a mais comumente observada dentre os estados foi com o centro verde oliváceo com reentranças, e as bordas brancas de aspecto cremoso. A caracterização morfoló... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Phaeomoniella chlamydospora is considered the most aggressive of the pathogen complex responsible for causing a Petri disease in vines. The goal of this work was to illustrate, morphologically and molecularly, a population with 57 isolates of Phaeomoniella from vines of seven Brazilian states. All the isolates were identified as belonging to the P. chlamydosphora species through the amplification of its area and parts of beta tubulina gene (β Tubulin). This series has already been carried out in the states of São Paulo, Pernambuco and Rio Grande do Sul. This was first reported in Paraná, Santa Catarina, Minas Gerais and Mato Grosso. Later studies in the behavior of PDA (potato dextrose agar) and MEA (malt extract); morphological characterization of conidia, conidiophores and chlamydospores in the MEA and SNA culture medium (synthetic nutrient agar); growth of the substrates at temperatures of 5, 10, 15, 20, 25, 30 and 35 ° C for 42 days in PDA medium; and pathogenicity test on Niagara Rosada vines (incidence and aggressiveness). A culture analysis identified 4 colony characteristics. Among these, the most commonly included in the states was with the green olive center with reentrances, and as white edges of creamy aspect. The morphological featuring was different in growth of structures when grown in medium culture, while the greater development in MEA medium culture when the conidia and chlamydospores were evaluated; and with higher growth in medium SNA when compared to the conidiophores. The ideal temperature range for the development of the pathogen is between 20 to 25ºC, while the temperature of 5ºC. By exposing the isolates kept from 5 ° C to 25 ° C for 42 days, they presented a more significant growth compared to those grown directly at 25 ° C (fungistatic effect). All the isolates were pathogenic to the 'Niagara Rosada' vine. The isolates showed different reisolation and aggressiveness ... / Doutor

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2012. / Submitted by Elna Araújo (elna@bce.unb.br) on 2012-07-19T20:22:18Z No. of bitstreams: 1 2012_AnnaCristinadeFreitas.pdf: 2030875 bytes, checksum: 8e3c0630c707b786907b6adba46bb9c7 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-08-09T12:42:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_AnnaCristinadeFreitas.pdf: 2030875 bytes, checksum: 8e3c0630c707b786907b6adba46bb9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-08-09T12:42:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_AnnaCristinadeFreitas.pdf: 2030875 bytes, checksum: 8e3c0630c707b786907b6adba46bb9c7 (MD5) / O cancro bacteriano da videira, causado por Xanthomonas campestris pv. viticola (Xcv) Nayudu ( (Dye), foi detectado no Brasil pela primeira vez em 1998, em plantas de Vitis vinifera, variedade Red Globe, em Petrolina, Pernambuco. A doença é responsável por prejuízos ao cultivo da videira no Vale do Submédio São Francisco, apresentando incidência expressiva e importância econômica. Uma das medidas mais eficazes para conter sua disseminação para novas áreas é o uso de material de propagação livre do patógeno. Este estudo teve como objetivo geral otimizar a técnica de PCR (Reação da Polimerase em Cadeia) para detecção de Xcv em tecidos assintomáticos de videira. Foram objetivos específicos: determinar o limite mínimo de detecção por BIO-PCR aliado ao uso de meio semi-seletivo NYDAM e por Nested-PCR em frutos e folhas inoculados e assintomáticas; desenvolver um controle interno para falsos negativos e validar a BIO-PCR e a Nested-PCR em mudas de viveiros e em plantas sintomáticas e assintomáticas de áreas de produção no Vale do Submédio São Francisco. A determinação do limite mínimo de detecção de Xcv por BIO-PCR e Nested-PCR foi realizada com a inoculação de Xcv em frutos e folhas de videira nas concentrações de 102 a 108 ufc/ml. O limite mínimo de detecção por BIO-PCR em frutos e folhas foi de 102 ufc/ml. Com a Nested-PCR o limite mínimo de detecção em frutos foi de 102 ufc/ml e de 103 ufc/ml em folhas. Para o desenvolvimento do controle interno, foram incluídos iniciadores universais para o gene do 16S rRNA de bactérias (F984/1492) em reações multiplex com os iniciadores Xcv1F/Xcv3R. Amplificação dos dois fragmentos esperados ocorreu com DNA purificado de Xcv e com amostras positivas (lavados de folhas) por BIO-PCR e Nested-PCR. Contudo, em 16 amostras negativas por Nested-PCR, apenas em uma ocorreu a amplificação do fragmento correspondente ao gene de 16SrRNA. Na validação dos métodos em áreas de produção com histórico da doença, 97% das amostras coletadas com sintomas foram positivas por BIO-PCR e 69,7% positivas por Nested-PCR. Entre as amostras sem sintomas, a detecção de Xcv só foi possível por BIO-PCR (29,7 % das amostras). De 60 amostras de mudas assintomáticas coletadas em dois viveiros na região, detectou-se Xcv por BIO-PCR em três amostras (5%) de um dos viveiros. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Bacterial canker of grapevine, caused by Xanthomonas campestris pv. viticola (Xcv) Nayudu (Dye), was detected in Brazil in 1998, affecting plants of Vitis vinifera, cultivar Red Globe, in Petrolina, Pernambuco State. This disease is responsible for economic losses in vineyards in the São Francisco river valley, northeastern Brazil. One of the most effective measures to prevent its dissemination to new areas is the use of pathogen-free propagating material. The objective of the present study was to optimize the PCR (polymerase chain reaction)-based method to detect Xcv in asymptomatic grapevine tissues. The specific objectives were: to determine the minimum detection limits of BIO-PCR combined with the use of the semi-selective medium NYDAM and of Nested-PCR in inoculated and asymptomatic fruits and leaves; to develop an internal control for false negatives; and to validate the BIO-PCR and Nested-PCR methods by testing asymptomatic plants from nurseries and symptomatic and asymptomatic plants from grapevine-producing areas in the São Francisco river valley. The detection limit of BIO-PCR and Nested-PCR was performed by inoculating Xcv in grapevine fruits and leaves, at concentrations from 102 to 108 cfu/ml. The lower detection limit of BIO-PCR in fruits and leaves was 102 cfu/ml. Using Nested-PCR, the detection limit in fruits was 102 cfu/ml, and 103 cfu/ml in leaf samples. To develop the internal control for PCR, universal primers for bacterial 16S rRNA gene (F984/1492) were included in multiplex reactions with primer pair Xcv1F/Xcv3R. Amplification of the two expected fragments occurred with purified Xcv DNA and with samples (washes from leaves) tested positive by BIO-PCR and Nested-PCR. However, only one out of 16 samples tested negative by nested-PCR yielded the 16SrRNA amplicon. When validating the methods in production areas with a history of the disease, 97% of the symptomatic samples were positive by BIO-PCR and 69.7% positive by Nested-PCR. Among asymptomatic samples, detection of Xcv was possible only by BIO- PCR (29.7% of samples). Among 60 samples from asymptomatic plants collected in two nurseries in the region, Xcv was detected by BIO-PCR in three samples (5%) from one of the nurseries.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-07-29Bitstream added on 2014-06-13T18:47:14Z : No. of bitstreams: 1 munhae_cb_dr_rcla_parcial.pdf: 139035 bytes, checksum: 68a52e1407a980224c882244cda53aee (MD5) Bitstreams deleted on 2014-11-14T12:16:56Z: munhae_cb_dr_rcla_parcial.pdf,Bitstream added on 2014-11-14T12:17:44Z : No. of bitstreams: 1 000726225.pdf: 722929 bytes, checksum: ea5c238725ac34996719d990a4c7198b (MD5) / Os cultivares de uva no Brasil abrangem as regiões Sul, Sudeste, Centro-Oeste e Nordeste e apresentam poucos organismos que são considerados praga. Entretanto, cochonilhas quando presentes causam prejuízos econômicos, sendo que Eurhizococcus brasiliensis (Hemiptera: Margarodidae), a pérola-da-terra, é uma das principais. Devido ao hábito subterrâneo e a forma encapsulada, os danos ocasionados pela cochonilha tem como consequência o abandono ou declínio da cultura, especialmente nos vinhedos da região Sul do País. Algumas espécies de formigas do gênero Linepithema e Pheidole, podem estar associadas às infestações por pérola-da-terra como constatado no Estado do Rio Grande do Sul, porém não se tem informações a esse respeito no Estado de São Paulo. Da mesma maneira, não há informações em relação aos aspectos moleculares da pérola-da-terra e, assim, o objetivo do estudo foi avaliar a diversidade de formigas subterrânea em cultivares de videira, analisando a sua possível associação com a pérola-da-terra, investigando especificamente: i) a riqueza e a abundância das formigas no subsolo no Estado de São Paulo; ii) os parreirais infestados pela pérola-da-terra e a relação com os táxons de formigas mais frequentes; iii) a caracterização molecular da pérola-da-terra em diferentes regiões do Brasil, a partir de marcadores moleculares RAPD e 28S. Para tal, foram realizadas coletas nos Estados do Rio Grande do Sul, Santa Catarina, São Paulo e Pernambuco. Foram amostradas 20 espécies de formiga e não houve associação significativa entre a pérola-da-terra e a riqueza e/ou composição de espécies. Solenopsis invicta (Hymenoptera: Formicidae) foi a espécie mais frequente e abundante em todos os parreirais amostrados. A caracterização molecular da pérola-da-terra resultou na formação de dois clados a partir do... / The vineyards in Brazil occur in the South, Southeast, Central-West, and Northeast regions and have few organisms that are considered pests. However, mealybugs can cause economic losses, and Eurhizococcus brasiliensis (Hemiptera: Margarodidae), the ground pearl, is one of the main viticulture pests. Due to the ground pearl has an underground habitat and encapsulated form, the damage caused by the mealybug causes the abandonment or decline of culture, especially in the vineyards of the South region. Some species of ants (Pheidole spp. and Linepithema spp.) may be associated with infestations of ground pearl, as found in the state of Rio Grande do Sul, but there is no information in the state of São Paulo. There is no information about the molecular biology of ground pearl, and thus the aim of the study was to evaluate the diversity of subterranean ants in the vineyards to investigate their possible association with the ground pearl, specifically investigating: i) the richness and abundance of subterranean ants in the State of São Paulo, ii) the vineyards infested by ground pearl and related taxa of ants frequently, iii) the molecular characterization of ground pearl in different regions of Brazil, from RAPD and 28S molecular markers. For this, samples were collected in the States of Rio Grande do Sul, Santa Catarina, São Paulo and Pernambuco. We sampled 20 species of ants and there was no significant association between the ground pearl and the richness and/or species composition. Solenopsis invicta (Hymenoptera: Formicidae) was the most common species in all the vineyards. The molecular characterization of ground pearl resulted in two clades from the gene 28S and three groups, based on RAPD primers. According to the results we can infer the possibility of at least two groups of ground pearl in different regions sampled. However... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Odair Correa Bueno / Banca: Vanderlei Geraldo Martins / Banca: Ana Eugenia de Carvalho Campos / Banca: Luis Garrigós Leite / Banca: Maria Santina de Castro Morini / Resumo: Os cultivares de uva no Brasil abrangem as regiões Sul, Sudeste, Centro-Oeste e Nordeste e apresentam poucos organismos que são considerados praga. Entretanto, cochonilhas quando presentes causam prejuízos econômicos, sendo que Eurhizococcus brasiliensis (Hemiptera: Margarodidae), a pérola-da-terra, é uma das principais. Devido ao hábito subterrâneo e a forma encapsulada, os danos ocasionados pela cochonilha tem como consequência o abandono ou declínio da cultura, especialmente nos vinhedos da região Sul do País. Algumas espécies de formigas do gênero Linepithema e Pheidole, podem estar associadas às infestações por pérola-da-terra como constatado no Estado do Rio Grande do Sul, porém não se tem informações a esse respeito no Estado de São Paulo. Da mesma maneira, não há informações em relação aos aspectos moleculares da pérola-da-terra e, assim, o objetivo do estudo foi avaliar a diversidade de formigas subterrânea em cultivares de videira, analisando a sua possível associação com a pérola-da-terra, investigando especificamente: i) a riqueza e a abundância das formigas no subsolo no Estado de São Paulo; ii) os parreirais infestados pela pérola-da-terra e a relação com os táxons de formigas mais frequentes; iii) a caracterização molecular da pérola-da-terra em diferentes regiões do Brasil, a partir de marcadores moleculares RAPD e 28S. Para tal, foram realizadas coletas nos Estados do Rio Grande do Sul, Santa Catarina, São Paulo e Pernambuco. Foram amostradas 20 espécies de formiga e não houve associação significativa entre a pérola-da-terra e a riqueza e/ou composição de espécies. Solenopsis invicta (Hymenoptera: Formicidae) foi a espécie mais frequente e abundante em todos os parreirais amostrados. A caracterização molecular da pérola-da-terra resultou na formação de dois clados a partir do... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The vineyards in Brazil occur in the South, Southeast, Central-West, and Northeast regions and have few organisms that are considered pests. However, mealybugs can cause economic losses, and Eurhizococcus brasiliensis (Hemiptera: Margarodidae), the ground pearl, is one of the main viticulture pests. Due to the ground pearl has an underground habitat and encapsulated form, the damage caused by the mealybug causes the abandonment or decline of culture, especially in the vineyards of the South region. Some species of ants (Pheidole spp. and Linepithema spp.) may be associated with infestations of ground pearl, as found in the state of Rio Grande do Sul, but there is no information in the state of São Paulo. There is no information about the molecular biology of ground pearl, and thus the aim of the study was to evaluate the diversity of subterranean ants in the vineyards to investigate their possible association with the ground pearl, specifically investigating: i) the richness and abundance of subterranean ants in the State of São Paulo, ii) the vineyards infested by ground pearl and related taxa of ants frequently, iii) the molecular characterization of ground pearl in different regions of Brazil, from RAPD and 28S molecular markers. For this, samples were collected in the States of Rio Grande do Sul, Santa Catarina, São Paulo and Pernambuco. We sampled 20 species of ants and there was no significant association between the ground pearl and the richness and/or species composition. Solenopsis invicta (Hymenoptera: Formicidae) was the most common species in all the vineyards. The molecular characterization of ground pearl resulted in two clades from the gene 28S and three groups, based on RAPD primers. According to the results we can infer the possibility of at least two groups of ground pearl in different regions sampled. However... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Made available in DSpace on 2015-12-10T14:24:05Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-08-07. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-10T14:28:09Z : No. of bitstreams: 1 000854136.pdf: 1011225 bytes, checksum: 86250faa5770703f2f7315573c3d997f (MD5) / Este estudo teve como objetivo avaliar, em laboratório e câmara de crescimento, o efeito antifúngico de sete óleos essenciais sobre Plasmopara viticola, agente causal do míldio da videira. Foram selecionados os óleos essenciais de canela, eucalipto globulus, manjerona, melaleuca, menta piperita, orégano e tomilho branco, comparando-os com o fungicida mancozebe + metalaxil-M. Em laboratório, foram realizados experimentos avaliando-se o efeito do contato direto e dos compostos voláteis dos óleos essenciais sobre a germinação de esporos de P. viticola; e o efeito dos óleos essenciais na germinação de esporos de P. viticola, aplicados em folhas de videira, em condições de campo. Todos os óleos essenciais apresentam capacidade de inibir a germinação dos esporos de P. viticola, em graus variáveis e, também, com atividade fungistática. Todos os óleos essenciais avaliados possuem instabilidade química, pois, à medida que se aumenta o tempo de incubação ou o intervalo entre a aplicação dos produtos, a percentagem de atividade antifúngica de todos os óleos essenciais diminui. Os óleos essenciais de canela e eucalipto globulus foram os mais antifúngicos sobre P. viticola. Em câmara de crescimento foram realizados experimentos para determinar a persistência da atividade antifúngica dos óleos essenciais sobre P. viticola; determinar a resistência à chuva dos óleos essenciais e determinar o efeito curativo e/ou preventivo dos óleos essenciais sobre o míldio da videira. Todos os óleos essenciais possuem atividade antifúngica sobre P. viticola, nas concentrações a partir de 0,5%, em câmara de crescimento, quando a inoculação de esporos ocorreu de uma e seis horas após a aplicação dos produtos. No entanto, reduções na eficiência dos óleos essenciais foram observadas em plantas inoculadas após 12 e 24 horas da aplicação dos produtos. Como os mais eficientes, destacam-se os óleos essenciais de canela e... / This study aimed to evaluate, under laboratory and growth chamber conditions, the fungitoxic effect of seven essential oils on Plasmopara viticola, the grapevine downy mildew pathogen. We selected essential oils from cinnamon, Eucalyptus globulus, marjoram, melaleuca, piperita mint, oregano and white thyme, in comparison with the fungicide mancozeb + metalaxyl-M. In laboratory, the experiments were performed evaluating the effect of direct contact and volatile compounds of essential oils on the P. viticola spores germination; under field conditions, the effect of essential oils was on the P. viticola spores germination applied on vine leaves in field conditions. All essential oils had the ability to inhibit spores germination of P. viticola in varying degrees, as well as by fungistatic activity. It was noteworthy that all the essential oils have chemical instability, so as the incubation time or the interval between application increases, the antifungal activity of any essential oil decreased. Cinnamon and Eucalyptus globulus essential oils were the most fungitoxic for P. viticola. Under growth chamber conditions, experiments were conducted to determine the essential oils antifungal persistence activity on P. viticola; the resistance to rain and their curative and/or preventive effect on grapevine downy mildew. All essential oils at 0.5% concentrations have antifungal activity against P. viticola, when spores inoculation occurred one and six hours after oils application. However, reduction in essential oils efficacy was found on inoculated plants after 12 and 24 hours after the application. The most efficient essential oils were from cinnamon and white thyme, which provided higher mildew control on 24 hours, inoculated plants after products application. The preventive treatment was more effective on reducing downy mildew severity. Besides the fungicide mancozeb + metalaxyl-M fungicide, the cinnamon essential oil was the most efficient in ...

Made available in DSpace on 2016-03-07T19:20:26Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-09-10. Added 1 bitstream(s) on 2016-03-07T19:24:04Z : No. of bitstreams: 1 000859311.pdf: 1790658 bytes, checksum: f23ef190b7fbb07ce0be2ea249867f58 (MD5) / A grande exigência de tratos culturais e fitossanitários tem estimulado os viticultores a buscarem alternativas para reduzir este custo, entre as quais, o uso de programas de controle de doenças de baixo impacto ambiental. Objetivou-se neste trabalho avaliar, em laboratório e casa de vegetação, o efeito fungitóxico de extratos aquosos e hidroetanólicos de melão-de-são- caetano e pacari, óleo de nim e óleos essenciais de tomilho, canela, cânfora, melaleuca sobre Plasmopara viticola, Phakopsora euvitis, Elsinoe ampelina, Oidium tuckeri, Fusicoccum aesculi e Lasiodiplodia sp., agentes etiológicos do míldio, ferrugem, antracnose, oídio e podridão descendente da videira, respectivamente. No primeiro experimento sobre o efeito de extratos aquosos e hidroetanólicos in vitro sobre E. ampelina, houve interação significativa entre as concentrações de extrato de melão-de-são-caetano e formas de obtenção dos extratos na porcentagem de inibição do crescimento micelial (PIC) e na porcentagem de inibição da germinação de conidiósporos (PIG), sendo a PIC e a PIG do extrato aquoso, em média, menores do que aquelas observadas em presença de extrato hidroetanólico. Os extratos aquosos e hidroetanólicos de pacari não apresentaram diferenças significativas a partir da concentração de 20% na inibição do crescimento micelial (PIC) de E. ampelina. A PIG foi, em média, maior quando E. ampelina foi submetido ao extrato hidroetanólico de pacari, porém não houve diferença estatística entre as concentrações dos extratos a partir da concentração de 10%. Os extratos aquosos e hidroetanólicos de melão-de-são-caetano e pacari inibiram o crescimento micelial de Lasiodiplodia sp. Por outro lado, extratos aquosos de pacari nas concentrações 5%, 10% e 15% (v/v) estimularam o crescimento micelial de F. aesculi. A germinação de conidiósporos de O. tuckeri foi inibida por extratos aquosos e hidroetanólicos de... / The great demand for cultural and phytosanitary treatments has prompted grape growers to seek alternatives to reduce thes coste, of diseases management programs low impact. To offer an alternative for disease management the objective ef this study was to determine the effect of different concentrations of aqueous extracts and hydroethanolic extracts of Momordica charantia and Lafoensia pacari, neem oil and essential oils of Thymus vulgaris, Cinnamomum zeylanicum, Cinnamomum camphora, Melaleuca alternifolia, and neem oil against Plasmopara viticola, Phakopsora euvitis, Elsinoe ampelina, Oidium tuckeri, Fusicoccum aesculi and Lasiodiplodia sp., the etiological agents of downy mildew, rust, anthracnose, powdery mildew and down rot of the vine, respectively. In the first experiment in vitro with aqueous extracts and hydroethanolic against E. ampelina, there was a significant interaction between the concentration of M. charantia extract and ways of obtaining in the extracts percentage of inhibition of mycelial growth (PIMG) and conidia germination (PIG). The PIMG and PIG on aqueous extract were, on average, smaller than those observed in the presence of hydroethanolic extract. The aqueous and hydroethanolic extracts of L. pacari showed no differences significant at concentrations above in the 20% (v/v) inhibition of mycelial growth of E. ampelina. The PIG was higher when the E. ampelina was submitted to hydroethanolic extract of L. pacari, but there was no significant differences among the concentrations of the extracts above 10% (v/v) concentration. The aqueous and hydroethanolic extracts of M. charantia and L. pacari inhibited the mycelial growth of Lasiodiplodia sp. However, by aqueous extracts of L. pacari at 5%, 10% and 15% (v/v) stimulated the mycelial growth of F. aesculi. The conidia germination of O. tuckeri was inhibited by aqueous and hydroethanolic extracts of M. charantia and L. pacari, at levels similar to the fungicide ...

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2013. / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2015-06-02T18:39:34Z No. of bitstreams: 1 2013_LiamarMariadosAnjos_Parcial.pdf: 4370253 bytes, checksum: 1e942fbfab25e231f1108052036de9bc (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2015-06-02T20:43:14Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_LiamarMariadosAnjos_Parcial.pdf: 4370253 bytes, checksum: 1e942fbfab25e231f1108052036de9bc (MD5) / Made available in DSpace on 2015-06-02T20:43:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_LiamarMariadosAnjos_Parcial.pdf: 4370253 bytes, checksum: 1e942fbfab25e231f1108052036de9bc (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq), Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia e Embrapa Uva e Vinho. / A videira (Vitis vinifera L.) destaca-se entre as mais importantes espécies frutíferas cultivadas mundialmente. O míldio, causado pelo oomyceto Plasmopara viticola (Berk & Curtis.) Berl. & de Toni é uma das principais doenças da videira no mundo, causando sérios prejuízos à vitivinicultura. Este trabalho envolveu um conjunto de experimentos visando gerar informações para estudos genéticos do gênero Plasmopara, infectando videiras no Brasil. O Capítulo 1 teve como objetivo estudar a diversidade genética e a estrutura populacional de isolados de Plasmopara viticola que infectam vinhedos em diferentes regiões brasileiras. Para isto, 34 novos marcadores microssatélites de P. viticola foram desenvolvidos através de sequenciamento NGS (Next Generation Sequencing) seguido de montagem parcial de novo do genoma do fungo. Testes dos novos marcadores juntamente com dez controles possibilitaram a seleção de uma bateria mista de 15 marcadores que foram usados para genotipar 92 isolados de P. viticola coletados em regiões produtoras de uva no Brasil. A amostra de 92 isolados apresentou estruturação, tendo sido dividida em três subpopulações, denominadas PvG1(Fst=0,56), PvG2 (Fst=0,25) e PvG3 (Fst=0,24). Foi observado um grande efeito no uso de pequenas baterias de marcadores moleculares na análise genética de populações do patógeno, afetando a interpretação dos resultados de substruturação populacional. A classificação geográfica dos isolados apresenta associação com a classificação subpopulacional do patógeno. Os isolados oriundos dos Estados de São Paulo e Minas Gerais apresentam maior diversidade de subpopulações do que isolados de outras regiões tradicionais no cultivo de uva no Brasil, como o Rio Grande do Sul. O emprego de ferramentas moleculares como sequenciamento NGS e marcadores moleculares contribui para uma melhor compreensão das variáveis que afetam as populações de P. viticola. O Capítulo 2 teve por objetivo construir mapas genéticos para os genitores da progênie F1 do cruzamento CNPUV 733-34 x CNPUV 1103-88 e mapear regiões do genoma de videira que conferem resistência ao patógeno. O mapa do genitor feminino CNPUV 733-34 cobriu 1.104 cM do genoma de videira, com distância média entre marcadores de 6,69 cM. O mapa do genitor masculino CNPUV 1103-88 cobriu 958 cM do genoma de videira, com distância média entre marcadores de 7,48 cM. O fenótipo da interação patógeno-hospedeiro foi mensurado em bioensaios em ambiente controlado e infecção natural no campo. Três QTLs foram detectados por mapeamento de Intervalo Simples e Intervalo Composto no mapa genético do genitor feminino CNPUV 733-34. Um dos QTLs está localizado no GL 5, no intervalo entre os marcadores UDV041-UDV042 (LOD= 3,9) e explica 6% da variação fenotípica para resistência a P. viticola. Dois outros QTLs (C18-1 e C18-2), apresentam efeito moderado de resistência a P. viticola, foram detectados no GL 18, e explicam até 22,3% da variação fenotípica. O intervalo do QTL C18-1 (LOD= 7,6) é flanqueado pelos marcadores VMC7F2 e VVIN16, que estão separados por 5 cM. O intervalo do QTL C18-2 (LOD= 6,3) é flanqueado pelos marcadores VVIU04 e VVIN83, separados por 22 cM. O mapeamento genético de QTLs de resistência ao míldio utilizando diferentes fontes de resistência nos programas de melhoramento genético de videira é um passo importante para o aumento da eficiência de desenvolvimento de variedades resistentes ao patógeno. ______________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Grapevine (Vitis vinifera L.) is among the most important fruit species cultivated worldwide. Downy mildew, caused by the oomycete Plasmopara viticola (Berk & Curtis.) Berl. & de Toni, is one of the main diseases of grapevine in different grape producing regions of the world, causing serious damage to grape production. This work is based on a group of experiments aimed at generating information useful to genetic studies of the genus Plasmopara, which infect grapevine in Brazil. The objective of Chapter 1 was to study the genetic diversity and population structure of Plasmopara viticola which infect grapevine fields in different regions of Brazil. 34 new P. viticola microsatellite markers were developed by NGS (Next Generation Sequencing) followed by partial de novo assembly of the fungus genome. A mixed battery of new and ten control microsatellites was used to genotype 92 P. viticola isolates, collected in grape producing regions of Brasil. A sample of 92 isolates showed a significant population structure, with isolates clustering into three subpopulations, called PvG1 (Fst=0,56), PvG2 (Fst=0,25) e PvG3 (Fst=0,24). The effect of small batteries of molecular markers used to evaluate the genetic structure of the pathogen populations was tested and found to affect the interpretation of the results. The geographic classification of the isolates is associated with the genetic groups detected in the pathogen sample. Isolates collected in São Paulo and Minas Gerais show greater diversity of genetic groups (subpopulations) than isolates from other traditional grape growing regions of Brazil, such as Rio Grande do Sul. The use of molecular tools, such as NGS and molecular markers, contribute for a better understanding of variables affecting the populations of P. viticola. The objective of Chapter 2 was to develop genetic maps for the parental varieties of an F1 progeny derived from the cross CNPUV 733-34 x CNPUV 1103-88 and map grapevine genomic regions associated with resistance to the pathogen. The map of the female genitor CNPUV 733-34 covered 1,104 cM, with an average recombination distance between markers of 6.69 cM. The map of the male genitor CNPUV 1103-88 covered 958 cM, with an average recombination distance between markers of 7.48 cM. Host-pathogen interaction phenotype was measured by controlled bioassays using artificial inoculation, and by natural infection in the field. Genetic mapping determined the location of P. viticola resistance QTLs in grapevine. Three QTLs mapped on the female genitor genome were detected by Interval Mapping and Composite Interval Mapping procedures. One of these QTLs was located in LG 5, in the UDV041-UDV042 marker interval (LOD= 3.9), explaining 6% of the phenotypic variation for P. viticola resistance. Two additional QTLs (C18-1 e C18-2), showing a moderate effect on P. viticola resistance, were detected in LG 18, explaining up to 22.3% of the phenotypic variation. The C18-1 QTL interval (LOD= 7.6) is flanked by markers VMC7F2 and VVIN16, which are 5 cM apart. The C18-2 QTL interval (LOD= 6.3) is flanked by markers VVIU04 and VVIN83, which are 22 cM apart. Mapping downy mildew resistance QTLs using germplasm accessions derived from different sources of resistance in breeding programs is an important step towards higher efficiency in the improvement of grapevine resistance to the pathogen.

Orientador: Marcelo da Costa Ferreira / Banca: Otávio Jorge Grigoli Abi Saab / Banca: Nilza Maria Martinelli / Resumo: A produção de uva no Vale do São Francisco é uma atividade promissora devido às suas características climáticas e o empenho geral em desenvolver a agricultura da região, visando alcançar mercados internacionais. Com isto, a ocupação agrária local sofreu um crescimento abrupto, que requer o desenvolvimento de tecnologias locais para a manutenção da sustentabilidade da produção. Devido à exigências de programas que têm se preocupado com a qualidade do produto colhido, envolvendo à proteção ao ambiente, a segurança alimentar, às condições de trabalho, a saúde humana e a viabilidade econômica, a vitivinicultura necessita de amparo para atualizar conceitos técnicos de produção. A presente proposta se baseou nesta necessidade e visa avaliar a situação atual de utilização e propor possíveis aprimoramentos sobre a tecnologia de aplicação de produtos fitossanitários, visando um controle eficaz de pragas e doenças, para manter a qualidade à fruta colhida, minimizar contaminações ambientais e proteger usuários e operadores envolvidos com o tratamento fitossanitário / Abstract: Grape production in San Francisco Valley, north of Brazil, is a interesting culture for the development of this region that has got many good features to this agrarian culture, aimed an international markets. Therefore, the agricultural occupation have been growing what requires a necessary development of local technologies to maintain a sustainable production..According of that, this paper addressed the effects of the current situation of production and suggested possible improvements in the technology of applying pesticides for effective control of pests and diseases and improve the quality of fruit harvested in order to minimize environmental contamination and protect users and operators involved in the plant treatment / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:29Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-08-28Bitstream added on 2014-06-13T19:16:28Z : No. of bitstreams: 1 000739204.pdf: 41645242 bytes, checksum: 0d265664adf1acf331ffe31de6bcae7f (MD5) / A produção de uva no Vale do São Francisco é uma atividade promissora devido às suas características climáticas e o empenho geral em desenvolver a agricultura da região, visando alcançar mercados internacionais. Com isto, a ocupação agrária local sofreu um crescimento abrupto, que requer o desenvolvimento de tecnologias locais para a manutenção da sustentabilidade da produção. Devido à exigências de programas que têm se preocupado com a qualidade do produto colhido, envolvendo à proteção ao ambiente, a segurança alimentar, às condições de trabalho, a saúde humana e a viabilidade econômica, a vitivinicultura necessita de amparo para atualizar conceitos técnicos de produção. A presente proposta se baseou nesta necessidade e visa avaliar a situação atual de utilização e propor possíveis aprimoramentos sobre a tecnologia de aplicação de produtos fitossanitários, visando um controle eficaz de pragas e doenças, para manter a qualidade à fruta colhida, minimizar contaminações ambientais e proteger usuários e operadores envolvidos com o tratamento fitossanitário / Grape production in San Francisco Valley, north of Brazil, is a interesting culture for the development of this region that has got many good features to this agrarian culture, aimed an international markets. Therefore, the agricultural occupation have been growing what requires a necessary development of local technologies to maintain a sustainable production..According of that, this paper addressed the effects of the current situation of production and suggested possible improvements in the technology of applying pesticides for effective control of pests and diseases and improve the quality of fruit harvested in order to minimize environmental contamination and protect users and operators involved in the plant treatment