Com o objetivo de estudar a variação fenotípica de uma população base de Eucalyptus saligna, foram avaliados 11 carateres morfológicos em 48 árvores matrizes classificadas visualmente a campo em 3 tipos, tipo saligna (16 árvores), tipo híbrido (17 árvores) e tipo botryoides (15 árvores). Além disso, foram avaliadas suas progênies de polinização livre por 7 carateres morfológicos, na fase de muda. Também, foi estudada a variação na produção de sementes. A produção de sementes foi avaliada mediante o número de sementes por quilograma e número de sementes por fruto e relacionada com a porcentagem de aproveitamento de mudas e a porcentagem de falhas na germinação. A relação entre estas características foi estudada pela análise da regressão. Os resultados obtidos na produção de sementes indicam que matrizes: com uma alta produção de sementes por quilograma apresentam uma porcentagem maior de aproveitamento das mudas e uma menor porcentagem de falhas na germinação das sementes. As metodologias empregadas para a classificação das árvores matrizes e suas progênies foram: a técnica de componentes principais e quatro métodos de agrupamento hierárquicos aglomerativos. A análise de componentes principais utilizou-se para gerar a matriz de correlações que permitiu estudar a associação de carateres e o descarte de variáveis redundantes. Foram utilizadas quatro técnicas de agrupamento: ligação mínima, ligação completa, ligação média de grupo (UPGMA) e método de Ward; sendo as características morfológicas analisadas: o número de botões por umbela, número de frutos por infrutescência, diâmetro e comprimento dos frutos, número de valvas por fruto, porcentagem de frutos pedicelados, largura e comprimento dos pedicelos da inflorescência, largura, comprimento e forma das folhas. Como medida de dissimilaridade foi empregada a distância euclidiana média. Os dendrogramas construídos permitiram constatar o agrupamento fenotípico visual a campo baseado no aspecto das matrizes. Os resultados semelhantes nos quatro métodos de agrupamento comprovaram a existência de uma estrutura interna nos dados. Os dendrogramas agruparam os tipos saligna e híbrido num grupo, sugerindo que este último grupo mostra apenas uma pequena diferença quando é comparado com o tipo saligna pelas características de folhas e frutos. Entretanto, o tipo botryoides mostrou uma grande dispersão com características morfológicas distintas do tipo botryoides. As análises de agrupamento repetidas nas progênies de polinização livre destas matrizes mostraram uma estrutura de agrupamento mais débil que no caso anterior. Além disso, estes agrupamentos não concordaram estritamente com o agrupamento fenótipo das matrizes, indicando a possibilidade de cruzamentos das matrizes tipo saligna com árvores tipo botryoides. / The aim of this work was to study the phenotypic variation of a Eucalyptus saligna Smith base population assessed by eleven morphological characteristics, in 48 adult trees visually classified in the field, in three types, type saligna (16 trees), type hybrid (17 trees) and type botryoides (15 trees). At the nursery stage, their open-pollinated progenies were assessed by seven morphological characteristics. The variation in seed production was also studied. The seed production was evaluated by the number of seeds per kilogram, the number of seeds per fruit and the percentage of seedlings yield and the percentage of germination failures. The relationship between these characteristics was studied by the analysis of regression. Results obtained in the production of seeds showed that trees with a high seed production per kilogram had a higher seedlings yield and a lower percentage of germination failures. The method used for ordinating the adult trees and their open-pollinated progenies were: the principal component analysis and four sequential agglomerative hierarquical nonoverlapping clustering methods. The correlation matrix generated by the principal component analysis allowed to study the relationship among the variables and to discharge the redundant ones. Four clustering methods were used: single linkage, complete linkage, average linkage (UPGMA), and Ward's method, and eleven morphological characteristics were evaluated: the number of buds per inflorescence, number of fruits per infrutescence, diameter and length of the fruits, number of valves per fruit, percentage of pedicellate fruits, width and length of the inflorescence pedicels, width, length and form of the leaves. As a measure of dissimilarity, the average euclidian distance was used. The dendrograms built through the four methods agreed with the field phenotypic visual clustering based upon the appearance of the adult trees. The existence of an internai data structure was proved through the similar results achieved in the four clustering methods. The dendrograms clustered the types saligna and hybrid in a single group, suggesting that this last type shows a small difference when compared with the saligna type through leaves and fruits characteristics. Meanwhile, the botryoides type showed a great dispersion, with several trees with morphological characteristics different from E. botryoides. The clustering analysis repeated in the open-pollinated progenies of these adult trees showed a weak clustering structure when compared with the former ones. Besides, these clusterings did not agree strictly with the phenotypic clustering of the adult trees, indicating the possibility of mating between the saligna type and the botryoides type.

Submitted by Cibele Nogueira (cibelenogueira@ufgd.edu.br) on 2016-04-29T14:32:58Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) INEZPELLOSO.pdf: 512060 bytes, checksum: 1c42b14223dea49078846fe5514e7d61 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-29T14:32:58Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) INEZPELLOSO.pdf: 512060 bytes, checksum: 1c42b14223dea49078846fe5514e7d61 (MD5) Previous issue date: 2011-03-03 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The aim of this work was to evaluate emergence and fruit biometry often populations of C. adamantium from Cerrado (sensu stricto) area, in Dourados-MS. The establishment of coordinates of every population was obtained as a function of phenotypic difference showed among them, distributed in an area of 32 ha, which is a remnant area of Cerrado of Santa Madalena Farm. Collect of fruits were done in the second period of fifteen days of December, 2009, fruitful period of the specie. For biometry study, a complete randomized experimental design was used, with ten treatments, which corresponded to populations and ten replications of ten fruits, which corresponded to experimental units. Germinative behavior study of seeds was carried out in green house conditions and use randomized block design, with four replications of sixteen seeds, as experimental unit, for every population. In biometry study of fruits and in germinative behavior of seeds, it was observed the presence of groups statistically different for every evaluated characteristic. Populations of Campomanesia adamantium, in native area, showed fruits with high phenotypic variability. In green house, seedlings by seed propagation showed a small proportion of phenotypic diversity. Considering characteristics of fruits and propagatives, populations 4, 9 and 10 are outstanding as the highest potential for genetic studies and for improvement / O objetivo deste trabalho foi avaliar a emergência e biometria de frutos de dez populações de C. adamantium de uma área de Cerrado Sentido Restrito, em Dourados-MS. A marcação das coordenadas de cada população foi obtida em função das diferenças fenotípicas apresentadas entre elas, distribuídas numa área de 32 ha, que está inserida em uma área remanescente de Cerrado da Fazenda Santa Madalena. A coleta dos frutos foi realizada na segunda quinzena de dezembro de 2009, época de frutificação da espécie. Para o estudo da biometria, utilizou-se o delineamento experimental inteiramente casualizado, com dez tratamentos, correspondentes às populações e dez repetições de dez frutos, correspondentes às unidades experimentais. O estudo do comportamento germinativo das sementes foi desenvolvido em condições de casa de vegetação utilizando o delineamento blocos casualizados, com quatro repetições de dezesseis sementes, como unidade experimental, para cada população. No estudo biométrico dos frutos e no comportamento germinativo das sementes, observou-se a existência de grupos estatisticamente diferentes para cada característica avaliada. As populações de Campomanesia adamantium, em área nativa, apresentaram frutos com alta variabilidade fenotípica. Na casa de vegetação, as plântulas obtidas por propagação de sementes apresentaram uma menor proporção de diversidade fenotípica. Considerando-se as características dos frutos e propagativas, as populações 4, 9 e 10 destacam-se se como de maior potencial para estudos genéticos e de melhoramento.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-06-12T12:08:08Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Elias Emanuel Silva Mota - 2013.pdf: 4153662 bytes, checksum: e76c4d102d7d03a072c342e97b447eeb (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-06-12T12:08:39Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Elias Emanuel Silva Mota - 2013.pdf: 4153662 bytes, checksum: e76c4d102d7d03a072c342e97b447eeb (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-12T12:08:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Elias Emanuel Silva Mota - 2013.pdf: 4153662 bytes, checksum: e76c4d102d7d03a072c342e97b447eeb (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2013-03-27 / The Cerrado biome is the second largest in Brazil, occupying 23% of the national territory, has several vegetation types, and has the richest flora among the world's savannas. The baru tree, due to its wide geographic distribution, is a species with the ability to display high levels of genetic diversity, thus providing the ability to occupy different habitats. The species in question has a multitude of uses, constituting a key species for studying domestication and cultivation. This study aimed to obtain information about the patterns of phenotypic variation for some traits of fruits, seeds and seedlings of baru and to estimate the genotic variability among and within 25 natural subpopulations of Dipteryx alata Vog., based on quantitative data. Fruits were collected from plants of 25 regions in the Cerrado biome, sampling six plants per subpopulation and, at least, 25 fruits per plant. The data were submitted to descriptive analysis, analysis of variance and correlation between traits. There was significant variation for all variables at all levels evaluated; among fruits within plants, among plants within subpopulations and among subpopulations for the fruits and seed traits evaluated. There was variation among progeny within subpopulations and among subpopulations for initial and final height, number of leaves, total leaf size, number of internodes and root length of seedlings. A greater proportion of variability was observed between plants within subpopulations. Correlation analysis demonstrated significant correlations for most pairs of characters of fruit evaluated at different hierarchical levels. The heritability found for final height, fresh weight and dry weight of shoots indicates possibility of gains from selection for these characters. / O Cerrado é o segundo maior bioma do país, ocupando 23% do território nacional, apresenta uma vegetação com diversas fitofisionomias e possui a mais rica flora dentre as savanas do mundo. O barueiro devido a sua ampla distribuição geográfica é uma espécie com a possibilidade de apresentar altos níveis de diversidade genética, conferindo assim capacidade de ocupar diferentes hábitats. A espécie em questão apresenta uma multiplicidade de usos, constituindo-se em espécie chave para estudos de domesticação e cultivo. O presente trabalho objetivou obter informações sobre os padrões de variação fenotípica para algumas características de frutos, sementes e mudas de baru e estimar a variabilidade genotípica existente entre e dentro de 25 subpopulações naturais de Dipteryx alata Vog. com base em dados quantitativos, contribuindo para medidas de conservação e auxílio em futuros programas de melhoramento genético da espécie. Foram coletados frutos de plantas de barueiro de 25 regiões, em seis estados, amostrando seis matrizes por subpopulação, com coleta de, pelo menos, 25 frutos por matriz. Os dados de caracteres físicos de frutos e sementes foram submetidos à análise descritiva, análise de variância e correlação entre caracteres. Houve variação significativa para todas as variáveis avaliadas, em todos os níveis hierárquicos avaliados; entre frutos dentro de matrizes, entre matrizes dentro de subpopulações e entre subpopulações para os caracteres de frutos e sementes avaliados. Houve variação entre progênies dentro de subpopulações e entre subpopulações para altura inicial e final, número de folíolos, tamanho total da folha, número de internódios e comprimento da parte aérea das plântulas. A maior proporção da variabilidade foi observada entre matrizes dentro de subpopulações. A análise de correlação demonstrou a existência de correlações significativas para a maioria dos pares de caracteres de frutos avaliados nos diferentes níveis hierárquicos. A herdabilidade encontrada para a altura final de mudas, a massa fresca e a massa seca da parte aérea indica possibilidade de ganhos por seleção para estes caracteres.

Orientador: Luís Felipe de Toledo Ramos Pereira / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-25T14:12:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lambertini_Carolina_M.pdf: 6513639 bytes, checksum: 76f60b46e28d803521c2f06db67818b3 (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: Os anfíbios são os animais mais ameaçados do planeta, tendo como fatores mais impactantes a perda de habitat e a quitridiomicose. Esta doença em anuros é causada pelo fungo Batrachochytrium dendrobatidis (Bd), que já foi registrado em todos os continentes e no Brasil estende-se por toda a Mata Atlântica, e já foi encontrado no Cerrado e na Amazônia. Existem diversos fatores que podem influenciar a dinâmica de infecção na natureza, e como fatores intrínsecos ao Bd podemos citar a variação genotípica, morfológica, variação na virulência e taxas de crescimento. Com isso, o presente estudo teve como objetivos realizar a caracterização genotípica e fenotípica de cepas de Bd provenientes de um gradiente de elevação na Mata Atlântica, e verificar se existem associações entre o tamanho dos zoósporos e zoosporângios das cepas isoladas com dados de prevalência e intensidade de infecção e taxa de crescimento do Bd. Adicionalmente, foi analisado se as taxas de infecção aumentam conforme o aumento da elevação. Para tanto, foram isoladas e genotipadas cinco cepas de Bd. Foi realizado o diagnóstico e quantificação da doença, assim como a confecção de suas curvas de crescimento. Com base nos resultados foram desenvolvidos dois índices relacionados à variação em tamanho e dados de prevalência e intensidade de infecção. Todas as cepas isoladas pertencem à linhagem Bd-GPL2. Foi detectada variação fenotípica entre as cepas e associações entre tamanho das cepas com prevalência e intensidade de infecção, e não houve associação com as taxas de crescimento. A prevalência e intensidade de infecção não aumentaram com a altitude. Os índices de tamanho e infecção também foram associados. Com isso, a variação fenotípica pode ser considerada preditora da dinâmica de infecção do Bd na natureza. Isto poderá ser utilizado como eficiente ferramenta de baixo custo para estudos que busquem reconhecer áreas nas quais o fungo pode ser mais prevalente e apresentar maior intensidade de infecção. Estes fatores podem ser cruciais para determinar populações de anfíbios ameaçadas / Abstract: Amphibians are the most threatened animals of the world. Habitat loss and chytridiomicosys are considered the main causes for their declines. Chytridiomycosis is a disease caused in anurans by the fungus Batrachochytrium dendrobatidis (Bd), detected worldwide. In Brazil it was registered all over the Atlantic rainforest and in some localities of the Cerrado and Amazonia. Several factors influence this disease dynamics, such as intrinsic factors related to Bd: different lineages, morphology, virulence, and growth rate. Given these factors, the present study aimed to genotype and analyze Bd strain¿s size from an elevational range, and verify if these factors were correlated to Bd size, prevalence, infection load, growth rate, and elevation. We isolated and genotyped five strains, and quantified growth rates. We developed two indexes related to Bd size, prevalence, and infection load. The five strains were Bd-GPL2. We found size variation and correlations between Bd size, prevalence, and infection load, but not with growth rate. Prevalence and infection load did not increase with elevation. The size and infection indexes were correlated. The phenotypic variation can be considered as a predictor to disease dynamics on environment. It can be used in other studies as a tool to efficiently (cheap and fast) identify areas where the fungus can develop faster and be more deleterious to amphibian populations / Mestrado / Biodiversidade Animal / Mestra em Biologia Animal

We investigated the population dynamics of the giant water bug, Belostoma angustum, across highland sin the Pampas of southern Brazil. We evaluated genetic and morphological variation, as well as the demographic history of 18 populations. The overall range includes two highlands and a lowland between them, overall exceeding 400 kilometers along the longitudinal gradient. Genetic variation was assessed from mitochondrial and nuclear markers. The morphological variation was estimated using linear measurements of males and females, and from male genitalic structures using geometric morphometrics approaches. We evaluated the effect of the highland topography, drainage basins, and past climate changes on the population structure. Our results from multiple analyses of molecular variance (AMOVA) show that Belostoma angustum structures as a large panmictic population across the Pampas highlands range. Every most frequent haplotype is shared by individuals from all three sampled areas in genetic markers from the mitochondrial as well as from the nuclear locus. Differentiation among haplotypes was very low, not greater than two mutation steps. The congruent phylogeographical pattern in both markers indicate absent sex-biased migration rates. Furthermore, there was no evidence for isolation-by-distance (IBD) based on the mitochondrial data. The pairwise st was low and not significant, indicating historical gene flow among populations of the giant water bug studied throughout Pampas highlands. Our findings about the demographic history of panmictic population throughout Pampas highlands suggest it experienced recent and rapid population expansion that started in the Late Pleistocene period, approximately 15,000 years old after Last Glacial Maximum. The recent marked demographic expansion could explain the high percentage of the exclusive haplotypes and the very low mutational steps among them. We did not find morphological variation among populations of B. angustum throughout Pampas highlands reflected, except for some body dimensions. The overall phenotypic uniformity among populations becomes more likely if gene flow is hypothesized to homogenize populations. However, in the body size, specially, there was variation among populations potentially explained by phenotypic plasticity, thereby generating phenotypic diversity without genetic differentiation. Our genetic findings suggest indirectly that individuals of B. angustum are strong fliers able to overcome the topographical barriers of the sampled area. / Neste trabalho, investigamos a dinâmica populacional de uma barata d\' água, Belostoma angustum, ao longo do Pampa no sul do Brasil. Foram avaliadas a variação genética, morfológica e a história demográfica de 18 populações. A área total amostrada inclui duas serranias e uma planície entre elas, excedendo 400 quilômetros ao longo de um gradiente longitudinal. A variação genética foi avaliada a partir de marcadores mitocondriais e nucleares. A variação morfológica foi avaliada utilizando medidas lineares de machos e fêmeas, e de estruturas genitais masculinas usando abordagens de morfometria geométrica. Testamos o efeito da topografia das serranias, das bacias de drenagem e das mudanças climáticas passadas sobre a estrutura das populações. Os resultados de múltiplas análises de variância molecular (AMOVA) mostram que Belostoma angustum forma uma grande população panmítica ao longo das serranias do Pampa. Todos os haplótipos mais frequentes são compartilhados por indivíduos de todas as três grandes áreas amostradas em marcadores genéticos dos loci mitocondrial e nuclear. A diferenciação entre haplótipos foi muito baixa, não excedendo dois passos mutacionais. O padrão filogeográfico congruente em ambos os marcadores indica taxas de migração não enviesada para um dos sexos. Além disso, não encontramos evidência de isolamento por distância (IBD) com base nos dados mitocondriais. Os valores de st par a par foram baixos e não significativos, indicando fluxo gênico histórico entre as populações da barata d\'água estudada ao longo das serranias Pampianas. Os resultados sobre a história demográfica da população panmítica ao longo do planalto do Pampa sugerem que essa população experimentou uma expansão populacional recente e rápida que teve início no fim do período Pleistoceno (há aproximadamente 15.000 anos), após a última máxima glacial. A expansão demográfica recente e acentuada poderia explicar a alta porcentagem de haplótipos exclusivos e o número reduzido de passos mutacionais entre eles. Não encontramos variação morfológica entre as populações de B. angustum amostradas ao longo das serranias do Pampa, exceto em algumas dimensões corporais. A uniformidade fenotípica entre as populações torna-se mais provável na medida em que o fluxo de genes atue homogeneizando as populações. Entretanto, no caso do tamanho do corpo, especialmente, há variação entre populações potencialmente explicada por plasticidade fenotípica, gerando assim diferenciação fenotípica sem diferenciação genética. Nossos resultados genéticos sugerem indiretamente que os indivíduos de B. angustum possuem capacidade de voo suficiente para transpor as barreiras topográficas na área amostrada.

We investigated the population dynamics of the giant water bug, Belostoma angustum, across highland sin the Pampas of southern Brazil. We evaluated genetic and morphological variation, as well as the demographic history of 18 populations. The overall range includes two highlands and a lowland between them, overall exceeding 400 kilometers along the longitudinal gradient. Genetic variation was assessed from mitochondrial and nuclear markers. The morphological variation was estimated using linear measurements of males and females, and from male genitalic structures using geometric morphometrics approaches. We evaluated the effect of the highland topography, drainage basins, and past climate changes on the population structure. Our results from multiple analyses of molecular variance (AMOVA) show that Belostoma angustum structures as a large panmictic population across the Pampas highlands range. Every most frequent haplotype is shared by individuals from all three sampled areas in genetic markers from the mitochondrial as well as from the nuclear locus. Differentiation among haplotypes was very low, not greater than two mutation steps. The congruent phylogeographical pattern in both markers indicate absent sex-biased migration rates. Furthermore, there was no evidence for isolation-by-distance (IBD) based on the mitochondrial data. The pairwise st was low and not significant, indicating historical gene flow among populations of the giant water bug studied throughout Pampas highlands. Our findings about the demographic history of panmictic population throughout Pampas highlands suggest it experienced recent and rapid population expansion that started in the Late Pleistocene period, approximately 15,000 years old after Last Glacial Maximum. The recent marked demographic expansion could explain the high percentage of the exclusive haplotypes and the very low mutational steps among them. We did not find morphological variation among populations of B. angustum throughout Pampas highlands reflected, except for some body dimensions. The overall phenotypic uniformity among populations becomes more likely if gene flow is hypothesized to homogenize populations. However, in the body size, specially, there was variation among populations potentially explained by phenotypic plasticity, thereby generating phenotypic diversity without genetic differentiation. Our genetic findings suggest indirectly that individuals of B. angustum are strong fliers able to overcome the topographical barriers of the sampled area. / Neste trabalho, investigamos a dinâmica populacional de uma barata d\' água, Belostoma angustum, ao longo do Pampa no sul do Brasil. Foram avaliadas a variação genética, morfológica e a história demográfica de 18 populações. A área total amostrada inclui duas serranias e uma planície entre elas, excedendo 400 quilômetros ao longo de um gradiente longitudinal. A variação genética foi avaliada a partir de marcadores mitocondriais e nucleares. A variação morfológica foi avaliada utilizando medidas lineares de machos e fêmeas, e de estruturas genitais masculinas usando abordagens de morfometria geométrica. Testamos o efeito da topografia das serranias, das bacias de drenagem e das mudanças climáticas passadas sobre a estrutura das populações. Os resultados de múltiplas análises de variância molecular (AMOVA) mostram que Belostoma angustum forma uma grande população panmítica ao longo das serranias do Pampa. Todos os haplótipos mais frequentes são compartilhados por indivíduos de todas as três grandes áreas amostradas em marcadores genéticos dos loci mitocondrial e nuclear. A diferenciação entre haplótipos foi muito baixa, não excedendo dois passos mutacionais. O padrão filogeográfico congruente em ambos os marcadores indica taxas de migração não enviesada para um dos sexos. Além disso, não encontramos evidência de isolamento por distância (IBD) com base nos dados mitocondriais. Os valores de st par a par foram baixos e não significativos, indicando fluxo gênico histórico entre as populações da barata d\'água estudada ao longo das serranias Pampianas. Os resultados sobre a história demográfica da população panmítica ao longo do planalto do Pampa sugerem que essa população experimentou uma expansão populacional recente e rápida que teve início no fim do período Pleistoceno (há aproximadamente 15.000 anos), após a última máxima glacial. A expansão demográfica recente e acentuada poderia explicar a alta porcentagem de haplótipos exclusivos e o número reduzido de passos mutacionais entre eles. Não encontramos variação morfológica entre as populações de B. angustum amostradas ao longo das serranias do Pampa, exceto em algumas dimensões corporais. A uniformidade fenotípica entre as populações torna-se mais provável na medida em que o fluxo de genes atue homogeneizando as populações. Entretanto, no caso do tamanho do corpo, especialmente, há variação entre populações potencialmente explicada por plasticidade fenotípica, gerando assim diferenciação fenotípica sem diferenciação genética. Nossos resultados genéticos sugerem indiretamente que os indivíduos de B. angustum possuem capacidade de voo suficiente para transpor as barreiras topográficas na área amostrada.