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Caractérisation des myopathies liées aux variants homozygotes non-sens dans le gène MLIP : variabilité clinique et altérations musculairesGagné, Alexie 06 1900 (has links)
Les myopathies héréditaires sont des maladies affectant les fibres musculaires, résultant d’un variant génétique pathogénique transmis par un ou les deux parents. Le diagnostic de ces maladies est complexe en raison de la similarité de certains symptômes avec d’autres maladies neuromusculaires et de leur hétérogénéité. Malgré les progrès des connaissances sur les maladies musculaires héréditaires, de nombreux patients ne reçoivent toujours pas de diagnostic moléculaire malgré les divers tests et le dépistage génétique.
Actuellement, 13 variants dans le gène MLIP ont été rapportés chez 15 patients atteints d’une myopathie récessive. Les symptômes, les atteintes et l’âge au début de la maladie varient grandement entre ces patients. Ces variant sont suspectés d’entraîner une perte de fonction ou une altération majeure de la fonction protéique de MLIP et/ou de provoquer des dysfonctionnements dans les voies biologiques associées avec MLIP. De plus, les variants sont localisés autour de l’exon 4 contenant la séquence de localisation nucléaire et autour de l’exon 9 contenant, avec l’exon 10, un crochet AT permettant une interaction avec la chromatine.
Pour comprendre la fonction de MLIP dans le muscle et expliquer la variabilité phénotypique, trois objectifs ont été définis : 1) définir le patron d’expression des transcrits chez trois patients; 2) modéliser le variant du patient adulte Z46 par CRISPR-Cas9 dans des myoblastes humains immortalisés; 3) analyser l’impact fonctionnel et pathologique des variants des trois patients.
Le séquençage à longue lecture a révélé une architecture transcriptomique différente selon le groupe d’âge et a permis de répertorier 11 nouveaux transcrits non connus chez MLIP. De plus, les techniques de qRT-PCR et de Western Blot ont montré qu’uniquement le patient adulte Z46 présente un mécanisme compensatoire des niveaux de LMNA lors d’une diminution ou une perte de MLIP dans le noyau. Ce mécanisme serait spécifique au tissu ou au type cellulaire, car il n’est retrouvé dans les myoblastes porteurs du variant du patient. En analysant tous les résultats, la variabilité phénotypique semble être liée à la perte de la séquence de localisation nucléaire, mais aussi à l’intensité et l’efficacité de l’interaction entre MLIP et la chromatine. / Hereditary myopathies are diseases affecting muscle fibers, resulting from a pathogenic genetic variant transmitted by one or both parents. The diagnosis of these diseases is complex due to the similarity of some symptoms with other neuromuscular diseases and their heterogeneity. Despite advances in knowledge of hereditary muscle diseases, many patients still do not receive molecular diagnosis despite various tests and genetic screening.
Currently, 13 variants in the MLIP gene have been reported in 15 patients with recessive myopathy. Symptoms, conditions, and age at the beginning of the disease vary greatly between these patients. These variants are suspected to cause loss of function or major impairment of MLIP protein function and/or to cause dysfunctions in the biological pathways associated with MLIP. Moreover, the variants are located around exon 4 containing the nuclear localization sequence, and around exon 9 containing, with exon 10, an AT-hook allowing an interaction with chromatin.
To understand the function of MLIP in muscle and explain phenotypic variability, three objectives were defined: 1) to define the pattern of expression of transcripts in three patients; 2) to model the variant of adult patient Z46 by CRISPR-Cas9 in immortalized human myoblasts; 3) analyze the functional and pathological impact of the variants of the three patients.
Long-Read Sequencing revealed a different transcriptomic architecture according to the age group and identified 11 new transcripts not known in MLIP. In addition, qRT-PCR and Western Blot techniques have shown that only the adult Z46 patient has a compensatory mechanism for LMNA levels during a decrease or loss of MLIP in the nucleus. This mechanism would be specific to tissue or cell type because it is not found in myoblasts carrying the variant of the same patient. By analyzing all the results, phenotypic variability seems to be related to the loss of the nuclear localization sequence, but also to the intensity and efficiency of the interaction between MLIP and chromatin.
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