• Refine Query
  • Source
  • Publication year
  • to
  • Language
  • 12
  • Tagged with
  • 12
  • 4
  • 4
  • 4
  • 3
  • 3
  • 3
  • 3
  • 3
  • 2
  • 2
  • 2
  • 2
  • 2
  • 2
  • About
  • The Global ETD Search service is a free service for researchers to find electronic theses and dissertations. This service is provided by the Networked Digital Library of Theses and Dissertations.
    Our metadata is collected from universities around the world. If you manage a university/consortium/country archive and want to be added, details can be found on the NDLTD website.
11

Mapeamento de QTLs utilizando as abordagens Clássica e Bayesiana / Mapping QTLs: Classical and Bayesian approaches

Elisabeth Regina de Toledo 02 October 2006 (has links)
A produção de grãos e outros caracteres de importância econômica para a cultura do milho, tais como a altura da planta, o comprimento e o diâmetro da espiga, apresentam herança poligênica, o que dificulta a obtenção de informações sobre as bases genéticas envolvidas na variação desses caracteres. Associações entre marcadores e QTLs foram analisadas através dos métodos de mapeamento por intervalo composto (CIM) e mapeamento por intervalo Bayesiano (BIM). A partir de um conjunto de dados de produção de grãos, referentes à avaliação de 256 progênies de milho genotipadas para 139 marcadores moleculares codominantes, verificou-se que as metodologias apresentadas permitiram classificar marcas associadas a QTLs. Através do procedimento CIM, associações entre marcadores e QTLs foram consideradas significativas quando o valor da estatística de razão de verossimilhança (LR) ao longo do cromossomo atingiu o valor máximo dentre os que ultrapassaram o limite crítico LR = 11; 5 no intervalo considerado. Dez QTLs foram mapeados distribuídos em três cromossomos. Juntos, explicaram 19,86% da variância genética. Os tipos de interação alélica predominantes foram de dominância parcial (quatro QTLs) e dominância completa (três QTLs). O grau médio de dominância calculado foi de 1,12, indicando grau médio de dominância completa. Grande parte dos alelos favoráveis ao caráter foram provenientes da linhagem parental L0202D, que apresentou mais elevada produção de grãos. Adotando-se a abordagem Bayesiana, foram implementados métodos de amostragem através de cadeias de Markov (MCMC), para obtenção de uma amostra da distribuição a posteriori dos parâmetros de interesse, incorporando as crenças e incertezas a priori. Resumos sobre as localizações dos QTLs e seus efeitos aditivo e de dominância foram obtidos. Métodos MCMC com saltos reversíveis (RJMCMC) foram utilizados para a análise Bayesiana e Fator calculado de Bayes para estimar o número de QTLs. Através do método BIM associações entre marcadores e QTLs foram consideradas significativas em quatro cromossomos, com um total de cinco QTLs mapeados. Juntos, esses QTLs explicaram 13,06% da variância genética. A maior parte dos alelos favoráveis ao caráter também foram provenientes da linhagem parental L02-02D. / Grain yield and other important economic traits in maize, such as plant heigth, stalk length, and stalk diameter, exhibit polygenic inheritance, making dificult information achievement about the genetic bases related to the variation of these traits. The number and sites of (QTLs) loci that control grain yield in maize have been estimated. Associations between markers and QTLs were undertaken by composite interval mapping (CIM) and Bayesian interval mapping (BIM). Based on a set of grain yield data, obtained from the evaluation of 256 maize progenies genotyped for 139 codominant molecular markers, the presented methodologies allowed classification of markers associated to QTLs.Through composite interval mapping were significant when value of likelihood ratio (LR) throughout the chromosome surpassed LR = 11; 5. Significant associations between markers and QTLs were obtained in three chromosomes, ten QTLs has been mapped, which explained 19; 86% of genetic variation. Predominant genetic action for mapped QTLs was partial dominance and (four QTLs) complete dominance (tree QTLs). Average dominance amounted to 1,12 and confirmed complete dominance for grain yield. Most alleles that contributed positively in trait came from parental strain L0202D. The latter had the highest yield rate. Adopting a Bayesian approach to inference, usually implemented via Markov chain Monte Carlo (MCMC). The output of a Bayesian analysis is a posterior distribution on the parameters, fully incorporating prior beliefs and parameter uncertainty. Reversible Jump MCMC (RJMCMC) is used in this work. Bayes Factor is used to estimate the number of QTL. Through Bayesian interval, significant associations between markers and QTLs were obtained in four chromosomes and five QTLs has been mapped, which explained 13; 06% of genetic variation. Most alleles that contributed positively in trait came from parental strain L02-02D. The latter had the highest yield rate.
12

Crescimento, desempenho produtivo e reprodutivo de vacas Holandês comparadas às mestiças Holandês x Simental / Growth, productive and reproductive performance of Holstein cows compared to crossbred Holstein x Simmental cows

Knob, Deise Aline 25 June 2015 (has links)
Made available in DSpace on 2016-12-08T16:24:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGCA15MA174.pdf: 1125115 bytes, checksum: debf2ea0252ff58d406adab80ac46300 (MD5) Previous issue date: 2015-06-25 / Improvement of animal nutrition and management, together with genetic selection for milk yeld, increased the productivity of the herds, especially Holstein cows. On the other hand, characteristics related to fertility, health and longevity were disadvantaged The aim was to compare the development, milk yeld and composition, the health of the mammary gland, the body condition score (BCS), reproductive performance and longevity of crossbred Holstein x Simmental cows with Holstein cows. To obtain the data set two farms were used, one in Bom Retiro in SC and another in Carambeí in PR. For growth evaluation, weight gain of the animals were evaluated monthly. For production and udder health data from the official Dairy Herds Improvement Programs of the farm were used. BCS and body weight estimation were made on the farm with an interval between 60 and 90 days within one year. Information concerning the date of birth, parity date, date and number of inseminations, were obtained from the management software of the farms, generating information regarding the calving interval, days between calving to first service, conception rate, age at first calving. In one of the farms, calving were monitoring to quantify the calving difficulty, in the same farm, information of culling were obtained to determine the survival rate of cows. Data were analyzed by statistical package of SAS, using the MIXED and GENMOD procedures. For growth curve, production and composition of milk, (BCS) and body weight nonlinear regression was used, using the NLIN procedure of SAS and the curves of Gompertz (growth) and Wood (production and composition) were used because of having the lowest mean square. Holstein x Simmental crossbred cows produced more milk 31,8 x 30,4 kg/day (P < 0,05), with higher content of lactose and protein, with no difference for fat content. Holstein cows had higher somatic cell score (SCS) 4.49 x 2.93 (P <0.0001) compared to crossbreed cows. Holstein x Simmental crossbred cows had better BCS during lactation 3.65 x 2.94 (P <0.0001) with no difference in body weight in relation to Holstein cows. For growth of calves and heifers there was no difference between the genetic groups. Crossbred cows Holstein x Simmental had better reproductive performance than the Holstein cows, characterized by lower calving interval (381 x 445 days), higher conception rate (37.31 x 33, 64%) and shorter interval calving to first service (65.6 x 89.3 days). Crossbred cows Holstein x Simmental had higher survival rate than Holstein cows (83 x 92 In conclusion, crossbred cows Holstein x Simmental produce more milk with higher content of lactose and protein, have less ECS and greater BCS without difference for growing of heifers and body weight in adult age. Crossbred cows still have better reproductive performance and have a higher survival rate than the Holstein cows / Melhorias na nutrição e no manejo dos rebanhos bem como a seleção genética para a produção de leite aumentaram a produtividade dos animais. Em contrapartida, características relacionadas a fertilidade, sanidade e longevidade foram prejudicadas. O objetivo foi comparar o desenvolvimento, a produção e composição do leite, a sanidade da glândula mamária, o escore de condição corporal o desempenho reprodutivo e a longevidade de vacas mestiças Holandês x Simental em relação as vacas puras Holandês. Foram utilizadas duas propriedades, uma localizada no município de Bom Retiro em SC e outra em Carambeí no PR. Para avaliação de crescimento o ganho de peso dos animais foi avaliado mensalmente. Para obter dados produtivos e de sanidade de úbere foram utilizados dados do controle leiteiro oficial da propriedade. As avaliações de escore e peso vivo foram realizadas na propriedade com intervalo entre 60 e 90 dias no período de um ano, informações estas obtidas em uma das propriedades. As informações referentes a data de nascimento, data de parto, data e número de coberturas, foram obtidas junto aos software de gerenciamento de ambas as propriedades, gerando informações referentes ao intervalo entre partos (IEP), período parto primeiro serviço, taxa de concepção, idade ao primeiro parto. Em uma das propriedades foi feito o acompanhamento dos partos para quantificar a dificuldade de parto, da mesma forma, foram obtidas informações referentes ao descarte de animais para determinar a taxa de permanência no rebanho das vacas. Os dados foram analisados pelo pacote estatístico SAS, utilizando-se os procedimentos MIXED e GENMOD Para curva de crescimento, de produção e composição do leite bem como escore de condição corporal (ECC) e peso vivo foi utilizada a técnica de regressão não linear, do pacote estatístico SAS sendo que foram utilizadas as curvas de Gompertz (crescimento) e de Wood (produção e composição) por apresentarem o menor quadrado médio do erro. Vacas mestiças Holandês x Simental produziram mais leite 31,8 x 30,4 ( P < 0,05), com maior teor de lactose e proteína, sem diferença para teor de gordura. Vacas Holandês obtiveram maior escore de células somáticas (ECS) 4,49 x 2,93 (P < 0,0001) em relação as mestiças. Vacas mestiças Holandês x Simental obtiveram melhor ECC durante a lactação 3,65 x 2,94 (P < 0,0001) sem diferença para peso vivo em relação as vacas Holandês. Para crescimento de bezerras e novilhas não houve diferença entre os grupamentos genéticos. Vacas mestiças Holandês x Simental obtiveram melhor desempenho reprodutivo em relação as vacas puras, caracterizado através do menor IEP (381 x 445 dias), maior taxa de concepção (37,31 x 33, 64 %) bem como menor intervalo parto primeiro serviço (65,6 x 89,3 dias). Vacas mestiças Holandês x Simental apresentaram maior taxa de permanência no rebanho em relação as vacas puras (83 x 92 %). Conclui-se que vacas mestiças produzem mais leite, com maior teor de lactose e proteína, possuem menos ECS e maior ECC sem diferença para crescimento de novilhas e peso vivo na idade adulta. Apresentam ainda melhor desempenho reprodutivo e maior taxa de permanência no rebanho em relação as vacas puras Holandês

Page generated in 0.0413 seconds