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Microbial assemblage in grapevine's phyllosphere : who is the driver ? / Assemblage microbien dans la phyllosphère de la vigne : qui est le pilote ?

Singh, Prashant 30 November 2018 (has links)
Vitis vinifera subsp. vinifera L., les principales espèces de raisins sont cultivées pour la production de fruits et la production de vin dans le monde est un hôte naturel d'une grande variété de micro-organismes procaryotes et eucaryotes qui interagissent avec la vigne, ayant des effets bénéfiques ou phytopathogènes. Ils pourraient également jouer un rôle majeur dans le rendement des fruits, la qualité du raisin, la protection des plantes et, finalement, dans le modèle de la fermentation du raisin et la production de vin. La phyllosphère (constituée des parties aériennes de la plante) est l'un des habitats microbiens les plus répandus sur terre et est un milieu assez négligé, en particulier dans les vignes et de nombreuses questions liées à cet habitat microbien sont toujours sans réponse.Cette thèse est un effort pour répondre à une question fondamentale en écologie microbienne: quels sont les facteurs qui déterminent le microbiome dans la phyllosphère de la vigne? Les communautés microbiennes de la phyllosphère (PMCs) vivent à l'interface plante-climat et sa capacité à s'établir, prospérer et se reproduire sur la surface des feuilles ou des fruits dépend de plusieurs caractéristiques fonctionnelles microbiennes, comme la capacité de se fixer sur la cuticule et d'utiliser la foliaire. nutriments ainsi que les conditions climatiques dominantes comme la température, l'humidité de l'air et la pluie. La chimie des feuilles ou des fruits, la physiologie et la structure morphologique diffèrent selon le génotype et l'espèce puisque tous ces traits ont une base génétique, et cette variation peut mener à une combinaison différente d'assemblage de PMC parmi les génotypes de plantes. Ainsi, le premier objectif de notre travail était d'évaluer les impacts des cultivars de vigne (variétés de Vitis vinifera L) et des espèces de vigne (espèces Vitis entièrement différentes) sur l'assemblage du microbiome dans la phyllosphère à un endroit géographique particulier (pour minimiser les effets environnementaux) . Plus tard, les impacts de certains cultivars et terroirs de vigne commercialement importants (représentés par trois zones climatiques françaises) ont également été évalués et comparés. Les impacts de la saison et des organes extérieurs de la plante (feuilles et baies) sur la structuration des taxons microbiens dans la phyllosphère ont également été évalués et présentés dans ce travail. De plus, des impacts spécifiques à l'espèce sur le microbiome de la phyllosphère ont également été testés et représentés.Dans l'ensemble, notre étude a évalué et comparé les nombreuses facettes des facteurs qui peuvent influencer structure du microbiome dans la phyllosphère avec un accent particulier sur la pression de sélection relative exercée par le génotype de la vigne et son interaction avec différentes conditions climatiques (ou terroir), ce qui peut améliorer nos chances de trouver des gènes contrôlant les PMCs sur la phyllosphère. les gènes sont réellement importants dans des environnements réalistes et probablement ces gènes nous donneraient de nouvelles idées pour la sélection de nouveaux cépages sains présentant de meilleurs caractères sur leur phyllosphère. De plus, considérant que les PMC végétales jouent un rôle crucial dans la santé et la forme des plantes car elles peuvent moduler la susceptibilité foliaire aux infections, cette étude pourrait également être utile pour développer des méthodes de biocontrôle innovantes et naturelles ou phytostimulation contre les pathogènes de la vigne. de variétés résistantes innovantes. / Vitis vinifera subsp. vinifera L., the main grape species are grown for fruit and wine production over the world is a natural host of a wide variety of prokaryotic and eukaryotic microorganisms that interact with grapevine, having either beneficial or phytopathogenic effects. They could also play a major role in fruit yield, grape quality, plant protection and, ultimately, in the pattern of grape fermentation and wine production. Phyllosphere (consists of the aerial parts of the plant) is one of the most prevalent microbial habitats on earth and is quite a neglected milieu, especially in grapevines and many questions related to this microbial habitat, are still unanswered.This thesis is an effort to answer a very fundamental question in microbial ecology- what are the drivers that shape the microbiome in the grapevine's phyllosphere? The phyllosphere microbial communities (PMCs) live at the plant-climate interface and its ability to establish, thrive and reproduce on the leaf or fruit surface depends on several microbial functional traits, such as the ability to attach to the cuticle and to use the foliar nutrients as well as well as to the prevailing climatic conditions like temperature, air humidity and rain. Leaf or fruit chemistry, physiology, and morphological structure differ among plant genotype and species as all these traits have a genetic basis, and this variation may lead to a different combination of PMCs assemblage among plant genotypes. Hence, the first objective of our work was to assess the impacts of grapevine cultivars (varieties of Vitis vinifera L) and grapevine species (entirely different Vitis species) on microbiome assemblage in the phyllosphere at a particular geographic location (to minimize the environmental effects). Later on, impacts of some commercially important grapevine cultivars and terroirs (represented by three French climate zones) were also assessed and compared. Impacts of the season and exterior plant organs (leaf and berries) on microbial taxa structuring in the phyllosphere was also assessed and presented in this work. Furthermore, species-specific impacts on phyllosphere microbiome were also tested and represented.Overall our study assessed and compared the many facets of the factors that may influence themicrobiome structure in the phyllosphere with a special focus on relative selection pressure exerted by grapevine genotype and its interaction with different climatic conditions (or terroir), which may improve our chances to find genes that controls PMCs on phyllosphere, and simultaneously increase our confidence that those genes are actually important in realistic environments and probably those genes would give us new insights for breeding new and healthy grape varieties displaying better traits on their phyllosphere. Moreover, considering that the plant PMCs plays a crucial role in plant health and fitness as it can modulate leaf susceptibility to infection, this study could also be helpful to develop innovative and natural biocontrol methods or phytostimulation against grapevine pathogens or rethink breeding schemes for the creation of innovative resistant varieties.
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The role of rural women in livestock management : socio-economic evidences from diverse geographical locations of Punjab (Pakistan) / Le rôle des femmes rurales dans la gestion du bétail : preuves socio-économiques de diverses zones géographiques du Pendjab (Pakistan)

Ahmad, Tusawar Iftikhar 18 July 2013 (has links)
Dans les zones rurales du Pendjab du Pakistan, les femmes de petites familles agricoles ont un rôle énorme à jouer dans la réalisation du potentiel que le pays dispose dans le secteur de l'élevage d'animaux de se développer. L'étude présente la situation socio-économique actuelle des femmes éleveurs de bétail, l'étendue et la nature de leur participation aux activités de gestion du bétail, l'impact de la participation des femmes sur le bien-être de leurs familles, ainsi que les facteurs qui influent sur leur participation à des activités de gestion du bétail. Le type et la taille de la famille, l'âge, l'emplacement éloigné de l'intimé le village de la ville, et le niveau de développement global de la région ont eu leur impact sur les différents aspects de la situation des femmes rurales. Le niveau de participation des femmes répondant à des activités de gestion du bétail était multiple de celle du niveau de leurs maris. Les normes culturelles, division sexuelle du travail, la disponibilité de main-d'œuvre familiale et l'état physique du participant ont été trouvés plus opératoire pour déterminer la nature et le niveau de participation de la main-d'œuvre familiale dans les activités de gestion du bétail. L'amélioration du rôle des femmes dans la gestion et la production animale est essentielle pour améliorer la santé, l'éducation, le revenu et la nourriture de la famille. Les résultats illustrent la nécessité pour le ciblage géographique et l'importance d'utiliser une approche sexo-spécifique dans les programmes de développement agricole. / In rural Punjab of Pakistan, women from small farm families have a huge role to play in realizing the potential that the country has in livestock sector to flourish. The study presents the current socio-economic condition of women livestock raisers, the extent and nature of their participation in livestock management activities, the impact of women’s participation on their families’ welfare, and the factors affecting their participation in livestock management activities. The type and size of the family, respondent’s age, distant location of the village from the city, and the overall developmental status of the district had their impact on different aspects of rural women’s status. At each of the three geographical levels, women respondent’s participation level in livestock management activities was multiple of that of their husbands’ level. Cultural norms, gendered division of labor, availability of family labor, and the physical condition of the participant were found more operative in determining the nature and level of participation of the family labor in livestock management activities. Participation of the family labor, various aspects of women’s status, livestock related factors, and economic factors were the main causes identified as the factors affecting women’s participation in livestock management activities. Improving women's role in livestock management and production is essential in improving overall family’s health, education, income, and food security. The results signify the need for geographical targeting and the importance of using a gendered approach in the agricultural development programs.

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