• Refine Query
  • Source
  • Publication year
  • to
  • Language
  • 1
  • Tagged with
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • 1
  • About
  • The Global ETD Search service is a free service for researchers to find electronic theses and dissertations. This service is provided by the Networked Digital Library of Theses and Dissertations.
    Our metadata is collected from universities around the world. If you manage a university/consortium/country archive and want to be added, details can be found on the NDLTD website.
1

Análise in silico em ests de cana-de-açúcar (Saccharum officinarum) relacionados à resistência ao estresse hídrico

Sales, Janice Silva 26 July 2006 (has links)
The expressed sequenced tags (ESTs) generated by Sugarcane ESTs Project (FAPESP) provided a useful databank for the investigation of DNA sequences related to many different sugarcane agroindustrial features. When compared to DNA sequences from several plant species available at The National Center for Biotechnology Information Databank it was possible to perform a survey on various proteins produced by this plant including those related to water stress resistance. SUCEST generated approximately 43,150 clusters from where 52 best hits were obtained in this survey for putative proteins related to water stress resistance on 2,998 analyzed clusters. In silico protein identification was achieved following a modified protocol developed by SUCEST which used specific bioinformatics tools available at NCBi such as BLAST and FASTA. / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Alagoas / Etiquetas de seqüências expressas geradas pelo Projeto ESTs de cana-de-açúcar (FAPESP) forneceram um banco de dados útil para a investigação das seqüências de DNA relacionadas a muitas características agroindustriais da cana-de-açúcar. Quando comparadas às seqüências de DNA de diversas espécies de plantas disponíveis no banco de dados do Centro Nacional de Informação Biotecnológica (NCBI), foi possível avaliar várias proteínas produzidas por esta planta, incluindo aquelas relacionadas à resistência ao estresse hídrico. O SUCEST gerou aproximadamente 43.150 clusters de onde foram obtidas 52 proteínas putativas relacionadas à resistência ao estresse hídrico em 2.998 clusters analisados. A identificação de proteínas in silico teve como suporte um protocolo modificado desenvolvido pelo SUCEST, que usou ferramentas de bioinformática específicas, disponíveis no NCBI, como por exemplo BLAST e FASTA.

Page generated in 0.0258 seconds