Diss. (sammanfattning) Uppsala : Sveriges lantbruksuniv., 2007. / Härtill 4 uppsatser.

Diss. (sammanfattning) Uppsala : Sveriges lantbruksuniv., 2007. / Härtill 4 uppsatser.

Thesis (Ph. D.)--University of Hawaii at Manoa, 2003. / Includes bibliographical references.

Thesis (M.S.)--Oregon State University, 1994. / Typescript (photocopy). Includes bibliographical references (leaves 140-143). Also available on the World Wide Web.

Thesis (M.S.)--University of Wyoming, 2008. / Title from PDF title page (viewed on June 24, 2009). Includes bibliographical references (p. 93-104).

A seca é um dos principais problemas que afetam a produção do feijoeiro. A despeito da importância de caracteres fenotípicos radiculares, muitos dos esforços de melhoramento genético da cultura tem focado na seleção de cultivares com maior produção de grãos. A simbiose estabelecida entre plantas e FMA aumentam o potencial de captação de água no solo através das extensas redes formadas pelas hifas e alteram vias metabólicas vitais para a manutenção das relações hídricas da planta. O modelo de interação feijoeiro (BAT 477) colonizado por uma mistura de FMA (Glomus clarum, Acaulospora scrobiculata e Gigaspora rosea) foi submetido a um déficit hídrico de 96 h durante o pré-florescimento. O transcritoma global de raízes inoculadas e não-inoculadas, sujeitas ou não à seca, foi comparado por RNA-Seq. Um conjunto de 71 transcritos foram induzidos por FMA durante a seca. Comparando-se os tratamentos estresse e controle, 12.086 unigenes foram regulados em plantas inoculadas e 11.938 em não-inoculadas, refletindo o alto potencial de tolerância da linhagem BAT 477 e indicando que a presença de FMA produz uma regulação fina no perfil de expressão de genes regularmente envolvidos na resposta da planta ao estresse. Foram selecionados 15 fatores de transcrição e seus perfis de expressão foram caracterizados por RT-qPCR tomando-se três períodos, 48, 72 e 96 h de déficit hídrico. Plantas inoculadas ativaram a expressão destes genes mais tardiamente (após 72 h), refletindo melhorias nas condições hídricas da planta que adiam a percepção do estresse. Adicionalmente, a expressão de 23 transcritos foi avaliada em três amostras teciduais diferentes obtidas por microscopia de microdissecção a laser. Glucan 1,3 ?-Glucosidase e PIP2,3, foram detectados somente em células do córtex radicular contendo arbúsculos indicando uma possível indução tecido específica dependente da presença dos fungos. Análises complementares apontaram a regulação de 171 unigenes envolvidos na resposta das FMA ao estresse. Estes resultados validam a hipótese inicial de que a inoculação com FMA altera os perfis de expressão de genes vitais para a resposta da planta ao déficit hídrico / Drought is one of the main problems that affect common bean\'s production. Despite the importance of root fenological characters, breeding efforts for the culture have focused on the selection of cultivars for grain yield. The symbiosis stablished between AMF and plants enhances the potential of water absorption from the soil through an extensive net formed by hyphae and alters vital metabolic pathways involved in the maintenance of the water relations in plants. The interaction model common bean (BAT 477) colonized by a mixture of AMF (Glomus clarum, Acaulospora scrobiculata and Gigaspora rosea) was exposed to a water deficit regime of 96 h during pre-flowering. Global transcriptome from inoculated and non-inoculated roots, exposed or not to drought, were compared through RNA-Seq. A set of 71 transcripts was induced by AMF during drought. Comparing both stress and control treatments, 12,086 unigenes were regulated in inoculated plants, and 11,938 in non-inoculated, reflecting the great tolerance potencial of the lineage BAT 477 and indicating that the presence of AMF produces a fine tune regulation on the expression of genes regularly involved on the drought response of the plant. It was selected 15 transcription factors and their expression profiles were characterized through RT-qPCR taking 3 periods, 48, 72 and 96 h of water deficit. AM plants activated earlier (after 72 h) the expression of these genes, reflecting improvements on the water conditions of the plant that delay the stress perception. Additionally, the expression of 23 transcripts was evaluated on three different tissue samples obtained through laser microdissection microscopy. Glucan 1,3 ?-Glucosidase and PIP2,3, were detected only in cortical cells containing arbuscules, pointing to a possible tissue specific induction dependent of the presence of the fungus. Additional analysis point to the regulation of 171 unigenes involved on the response of the AMF to drought. These results corroborate the initial hypothesis that the inoculation with AMF alters the gene expression profiles of genes that are vital for water deficit response in plants

This study examined the rehabilitation potential of AM fungi with organic and inorganic fertilisers under pot and field trial conditions as well as their interaction with rhizospheric organisms and specific functional groups. In addition, the study highlighted the effects of land-use management on AM fungal populations in soil and the mycorrhizal status of some selected plants from one of the study sites. The study focussed on two sites that differ in operational activities and these included a mined area that was to be rehabilitated and a commercial farming site. A pot trial was conducted using an overburdened soil resulting from kaolin clay mining. Pots were seeded with Cynodon dactylon and treated with either Organic Tea or NPK (3:1:5) fertiliser, with or without AM fungal inoculum. The compatibility of these fertilisers with AM fungi was assessed by plant growth and percentage root colonisation. Maximum shoot height and plant biomass were observed at the 28th week with NPK (3:1:5) fertiliser supporting mycorrhizal colonisation by 80%. The result indicated the potential of AM fungi to be used in rehabilitation with minimal phosphate fertiliser. Similarly, a field trial was set-up using 17 x 17 m[superscript 2] plots in the mining site that were treated with the same organic and inorganic fertilisers as well as with AM fungal inoculum in different combinations. The interaction between AM fungi and soil microbial population was determined using culture dependent and culture independent techniques. The culture dependent technique involved the use of soil dilution and plating on general purpose and selective media. The result showed that there was no change in the total culturable bacterial number in the untreated and AM fungal treated plots, while a change in species composition was observed in the functional groups. Different functional groups identified included nitrogen fixing bacteria, pseudomonads, actinomycetes, phosphate solubilisers and the fungal counterparts. Gram-positive bacteria were observed as the predominant phenotypic type, while nitrogen fixers and actinomycetes were the predominant functional groups. Species identified from each functional group were Pseudomonas fulva, Bacillus megaterium, Streptomyces and actinomycetales bacteria. Meanwhile, fungi such as Ampelomyces, Fusarium, Penicillium, Aspergillus, Cephalosporium and Exserohilium were identified morphologically and molecularly. Furthermore, the mining site had a significantly higher bacterial number than the farming site thereby indicating the effects of land-use management on culturable bacterial numbers. The culture independent technique was carried out by cloning of the bacterial 16S rDNA and sequencing. Identified clones were Bradyrhizobium, Propionibacterium and Sporichthya. A cladogram constructed with the nucleotides sequences of identified functional species, clones and closely related nucleotide sequences from the Genbank indicated that nucleotide sequences differed in terms of the method used. The activity and establishment of the introduced AM fungal population was determined by spore enumeration, infectivity assay, percentage root colonisation and assessment of glomalin concentrations. The results indicated that the two land use types affected AM fungal populations. However, the establishment of AM fungi in the farming site was more successful than in the mining site as indicated by the higher infectivity pontential. Selected host plants, which were collected around the mine area, were observed to be mainly colonised by AM fungi and these were identified as Pentzia incana, Elytropappus rhinocerotis, Euphorbia meloformis, Selago corymbosa, Albuca canadensis and Helichrysum rosum. These plant species were able to thrive under harsh environmental conditions, thereby indicating their potential use as rehabilitation host plants. Generally, the findings of this study has provided an insight into the interaction between arbuscular mycorrhizal fungi and other soil microorganisms in two fields with differing land use management practices.

p. 1-84 / Submitted by Santiago Fabio (fabio.ssantiago@hotmail.com) on 2013-04-10T20:15:08Z No. of bitstreams: 1 Dissert LJA.pdf: 1512310 bytes, checksum: 6fb7c62570df7baff6bab4604b1b33ef (MD5) / Rejected by Alda Lima da Silva(sivalda@ufba.br), reason: Rever grafia de palavras: "atantica" ou atlântica on 2013-04-15T20:20:13Z (GMT) / Submitted by Santiago Fabio (fabio.ssantiago@hotmail.com) on 2013-04-23T20:57:30Z No. of bitstreams: 1 Dissert LJA.pdf: 1512310 bytes, checksum: 6fb7c62570df7baff6bab4604b1b33ef (MD5) / Approved for entry into archive by Alda Lima da Silva(sivalda@ufba.br) on 2013-04-25T17:46:47Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissert LJA.pdf: 1512310 bytes, checksum: 6fb7c62570df7baff6bab4604b1b33ef (MD5) / Made available in DSpace on 2013-04-25T17:46:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissert LJA.pdf: 1512310 bytes, checksum: 6fb7c62570df7baff6bab4604b1b33ef (MD5) Previous issue date: 2004 / O processo de fragmentação florestal é um dos principais agentes de desestruturação e destruição dos ambientes naturais. Por desencadear a perda de biodiversidade, a fragmentação pode afetar a produtividade e a estabilidade dos ecossistemas. Os seus efeitos têm sido avaliados para diversos grupos de organismos como, vertebrados, artrópodes e vegetais, sendo que ainda não existem trabalhos que busquem verificar a influência deste processo sobre a biologia dos FMA. Em face desta lacuna do conhecimento, o presente estudo foi desenvolvido a partir da hipótese de que o processo de fragmentação florestal, verificado na região Extremo Sul da Bahia, teria influência sobre a diversidade e a distribuição das abundâncias das comunidades de FMA daquela região. Duas categorias de paisagem foram analisadas: Floresta Contínua de Mata Original (FC) e Fragmento Florestal (FF). Foram utilizadas oito unidades amostrais, sendo quatro dispostas em FC e quatro em FF. Cada unidade amostral correspondeu a um transecto de 96m, onde foram coletadas oito amostras de solo, perfazendo um total de sessenta e quatro amostras simples. Utilizando-se 100g de solo seco, foi procedida a extração dos esporos de FMA, os quais foram montados em lâmina semi-permanente para posterior contagem e identificação. Também foram mensurados os seguintes parâmetros do solo: pH, teor de matéria orgânica, capacidade de retenção de água, condutividade, alumínio trocável, magnésio trocável, potássio trocável e fósforo. Foi recuperado um total de 77.273 esporos e constatados 35 táxons de FMA, sendo Glomus o gênero com maior número de espécies (21). O número de esporos e de espécies aqui observado foi muito mais elevado que os observados em outrosestudos realizados em ambientes de fitofisionomia semelhante. A comparação entre as categorias de paisagens indica que o grau de perturbação advindo da fragmentação florestal não foi restritivo ou prejudicial para os FMA, uma vez que as comunidades destes organismos foram mais numerosas, ricas e uniformes, do que as comunidades estabelecidas nas áreas da floresta contínua. Deste modo, o comportamento dos FMA, em resposta à fragmentação, corrobora a hipótese do distúrbio intermediário de Connell. / Salvador

PINTO, Emanuelle Sampaio Almeida. Respostas fisiológicas e bioquímicas de plantas de milho (Zea mays L.) inoculadas com fungos micorrízicos arbusculares sob estresse salino. 2011. 88 f. Dissertação (mestrado em agronomia/fitotecnia)- Universidade Federal do Ceará, Fortaleza-CE, 2011. / Submitted by Elineudson Ribeiro (elineudsonr@gmail.com) on 2016-03-18T19:12:08Z No. of bitstreams: 1 2016_dis_esapinto.pdf: 1040562 bytes, checksum: a9649c70781b909a31c6835067f0c1e0 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa (jairo@ufc.br) on 2016-04-26T21:04:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_dis_esapinto.pdf: 1040562 bytes, checksum: a9649c70781b909a31c6835067f0c1e0 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-26T21:04:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_dis_esapinto.pdf: 1040562 bytes, checksum: a9649c70781b909a31c6835067f0c1e0 (MD5) Previous issue date: 2016 / Many studies have shown that inoculation with arbuscular mycorrhizal fungi improved plant growth under salt stress. Considering that the salinity is a serious problem that directly affects the productivity of plants, the aim of this study was to evaluate the effects of inoculation of AMF in maize plants under salt stress in the presence or absence of phosphorus. The experiment was run in a greenhouse of the Department of Biochemist and Molecular Biology of the Federal University of the Ceará (Campus of the Pici, Fortaleza - Ceará), with four replicates per treatment. The experimental design was completely randomized in factorial arrangement 2 (inoculated and not inoculated plants) x 3 (levels of salinity 0.5, 4.0 and 8.0 dS m-1) x 2 (presence or absence of phosphorus), total of 48 experimental units. During the experiment measurements were made of net photosynthesis, transpiration rate, stomatal conductance and SPAD index. At 40 days after sowing the plants, they were collected, and determined leaf area, shoot dry matter (after drying the material under glass), the relative water content, the osmotic potential, microbiological variables (dependency and mycorrhizal colonization), mineral levels (N, P, K+, Ca2+, Mg2+, Na+, and Cl-) and organic solutes (soluble carbohydrates, N-aminosolubles, proline and soluble protein). The mycorrhizal fungi did not provide an increase in the growth of corn plants, but elevated levels of salinity reduced leaf area and shoot dry matter of plants. Generally, the salinity reduced the photosynthesis, stomatal conductance and transpiration in all treatments. The relative water content was not influenced by any of the factors studied. The SPAD index and relative water content were not influenced by any of the factors studied. The osmotic potential was significantly reduced in treatments with 4.0 and 8.0 dS m-1 salinity compared with the level of 0.5 dS m-1. Mycorrhizal colonization decreased with increasing levels of saline. The levels of glomalin were not influenced by the presence of P and not by increasing levels of salinity. The mycorrhizal fungi did not cause increases in levels of inorganic solutes. The presence of P promoted maize cultivation in non-inoculated plants, increased levels of phosphorus in the leaves and stems, at all levels of salinity. Increased salinity levels decreased the levels of N and Mg2+, but promoted increased levels of Na+ and Cl- in corn plants. The water-soluble carbohydrate showed no significant differences for any of the factors. In general, the levels of N-aminosolubles and proline increased with increasing salinity. Since the levels of soluble proteins showed different responses according to the factors. These results suggest that the mycorrhizal fungi did not minimize the effects of salinity in maize plants (hybrid AG 1051), at least under the conditions employed here. / Muitos estudos têm demonstrado que a inoculação de plantas com fungos micorrízicos arbusculares (FMA) melhora o crescimento das plantas sob estresse salino. Tendo em vista que a salinidade é um problema sério e que afeta de forma direta a produtividade das plantas, o objetivo deste trabalho foi avaliar os efeitos da inoculação dos FMA em plantas de milho sob estresse salino, na presença ou ausência de fósforo. O experimento foi conduzido na casa de vegetação do Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular da Universidade Federal do Ceará (Campus do Pici, Fortaleza - Ceará), com quatro repetições. O delineamento experimental foi o inteiramente casualizado, em arranjo fatorial 2 (plantas inoculadas e não inoculadas) x 3 (níveis de salinidade 0,5; 4,0 e 8,0 dS m-1) x 2 (presença ou ausência de fósforo), totalizando 48 unidades experimentais. Durante a condução do experimento foram realizadas medições da fotossíntese líquida, da taxa de transpiração, da condutância estomática e do índice SPAD. Aos 40 dias após a semeadura das plantas, as mesmas foram coletadas, sendo determinados a área foliar, a matéria seca da parte aérea (após secagem do material em estufa), o teor relativo de água, o potencial osmótico, as variáveis microbiológicas (dependência e colonização micorrízica), os teores de alguns elementos minerais (N, P, K+, Ca2+, Mg2+, Na+ e Cl-) e solutos orgânicos (carboidratos solúveis, N-aminossolúveis, proteína solúvel e prolina). A associação micorrízica não proporcionou incremento no crescimento das plantas de milho, porém os aumentos nos níveis de salinidade reduziram a área foliar e a matéria seca da parte aérea das plantas. De maneira geral, a salinidade reduziu a fotossíntese, a condutância estomática e a transpiração em todos os tratamentos. O índice SPAD e o teor relativo de água não foram influenciados por nenhum dos fatores estudados. O potencial osmótico foi significativamente reduzido nos tratamentos com 4,0 e 8,0 dS m-1 de CE em comparação com o nível de 0,5 dS m-1. A colonização micorrízica decresceu com o incremento dos níveis salinos. Os teores de glomalina não foram influenciados pela presença de P e nem pelos níveis crescentes de salinidade. A associação micorrízica não acarretou incrementos nos teores de solutos inorgânicos. A presença de P no cultivo do milho promoveu, nas plantas não inoculadas, aumento nos teores de fósforo nas folhas e nos colmos, em todos os níveis de salinidade. O aumento dos níveis de salinidade reduziu os teores de N e Mg2+, porém promoveram o aumento nos teores de Na+ e Cl- nas plantas de milho. Os teores de carboidratos solúveis não apresentaram diferenças significativas para nenhum dos fatores analisados. De modo geral, os teores de N-aminossolúveis e de prolina aumentaram com o incremento da salinidade. Já os teores de proteínas solúveis apresentaram respostas diferenciadas de acordo com os fatores analisados. Esses resultados sugerem que a associação micorrízica não minimizou os efeitos da salinidade nas plantas de milho (híbrido AG 1051), pelo menos nas condições aqui empregadas.

Submitted by Claudia Rocha (claudia.rocha@udesc.br) on 2018-03-06T15:24:22Z No. of bitstreams: 1 PGCS16MA139.pdf: 1337909 bytes, checksum: ef910e602df5926b0cb8296178289f55 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-06T15:24:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGCS16MA139.pdf: 1337909 bytes, checksum: ef910e602df5926b0cb8296178289f55 (MD5) Previous issue date: 2016-02-16 / Capes / Promop / The arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) have broad occurrence, ecological relevance for health and development of plants and edaphoclimatic factors variation sensitivity. These characteristics makes of AMF key group on environmental risk assessment of pollutants in the soil. The aims of this study was: (1) Selecting isolate AMF originated from tropical and subtropical soils, determining suitable incubation conditions to ecotoxicological tests with spores; (2) validating ISO/TS 10832:2009 protocol, basing on germination sensitivity to metals and pesticides and (3) determining if germ tube size (GT) and total length of hyphae (HP), parameters of pre-symbiotic growth, could be used as sensitive indicators of AMF isolates. In Experiment one, was evaluated spore germination of ten isolates of AMF: Acaulospora colombiana SCT115A, A. koskei SCT049C and SCT048A, A. morrowiae SCT400B, SCT056A and SCT063A, Claroideoglomus etunicatum SCT101A, Gigaspora albida SCT200A, Gi. margarita SCT077A and Rizhophagus clarus SCT720A in sand without contaminants. Five were chosen for Experiment two, where germination was evaluated in different times (14 and 28 days), temperatures (24 and 28°C) and substrates uncontaminated (sand, OECD soil (OECD nº 207, 1984) and Tropical Artificial Soil (TAS). In Experiment three, germination, GT and HP parameters of Gi.albida andGi. margarita were evaluated in two substrates (sand and TAS) with two contaminants (heavy metal cadmium and pesticide 18 19 chlorpyrifos). Gi.albida SCT200A, Gi. Margarita SCT077A and R. clarus RJ102A had high germination rate (>75%). Results showed that 14th days (according with ISO protocol) and 28 °C incubations increase germination of the isolates. Sand had huge variation, been inappropriate as control substrate, while TAS was viable and efficient, improving test performance. When exposed to contaminants, GT and HP parameters of Gi. albida SCT200A and Gi. margarita SCT077A had insensitive and variable behavior for doses tested. To both species germination,sensitive to contaminants was low (IC50 >20 mg kg-1 of Cd and IC50 >20 mg a.i. kg-1 of Chlorpyrifos). Additional tests with different doses, as well as other isolates could improving a sensitivity curve of species to contaminants / Os fungos micorrízicos arbusculares (FMAs) tem ampla ocorrência, relevância ecológica para a saúde e desenvolvimento das plantas e sensibilidade a variações nos fatores edafoclimáticos. Estas características tornam os FMAs em um grupo chave na análise de risco de contaminantes do solo. Os objetivos deste estudo foram: (1) selecionar isolados de FMAs originários de solos tropicais e subtropicais em condições adequadas de incubação para ensaios ecotoxicológicos com esporos; (2) validar o Protocolo ISO/TS 10832: 2009, baseando-se na sensibilidade de germinação à metais e agrotóxicos e (3) determinar se o tamanho do tubo germinativo (TG) e comprimento total de hifas (HF), parâmetros de crescimento pré-simbiótico, podem ser utilizados como indicadores de sensibilidade dos isolados de FMAs. No experimento um, avaliou-se a germinação de esporos de dez isolados de FMA: Acaulospora colombiana SCT115A, A. koskei SCT049C e SCT048A, A. morrowiae SCT400B, SCT056A e SCT063A, Claroideoglomus etunicatum SCT101A, Gigaspora albida SCT200A, Gi. margarita SCT077A e Rizhophagus clarus SCT720A, em areia sem contaminantes. Destes, cinco foram escolhidos para o experimento dois, onde a germinação foi avaliada em diferentes tempos (14 e 28 dias), temperaturas (24 e 28ºC) e substratos não contaminados (areia, solo OCDE (OECD nº 207, 1984) e Solo Artificial Tropical (SAT). No experimento três, os parâmetros germinação, TG e HF de Gi. albida e Gi. 14 15 margarita foram avaliados em dois substratos (areia e SAT) com dois contaminantes (cádmio e clorpirifós). Gi. albida SCT200A, Gi. margarita SCT077A e R. clarus RJ102A tiveram altas taxa de germinação ( >75% ). Resultados mostraram que 14 dias (de acordo com o protocolo ISO) e 28ºC de incubação aumentam a germinação dos isolados. A areia teve alta variação e considerada inapropriada como substrato controle, enquanto SAT foi viável e eficiente, melhorando o desempenho dos testes. Quando expostos aos contaminantes, os parâmetros TG e HF de Gi. albida SCT200A e Gi. margarita SCT077A se mostraram pouco sensíveis e com comportamento variável para as doses de contaminantes testadas. Para a germinação, ambas a espécies mostraram pouca sensibilidade aos contaminantes (CI50>20 mg kg-1 de Cd e CI50>20 mg i.a. kg-1 de clorpirifós). Ensaios adicionais com diferentes doses, bem como com outros isolados são indicados para poder melhorar a curva de sensibilidade das espécies aos contaminantes