El objetivo de este trabajo de título es proponer una metodología de levantamiento de DW para información de retail, enfocada a la realidad de las empresas del área en Chile. Además, se desarrollará un conjunto básico, pero suficiente, de herramientas que soporten su funcionamiento, dando repetibilidad y agilidad a los levantamientos mencionados, garantizando altos niveles de confianza en la calidad de los datos.

É realizado um estudo da dinâmica de vigas segmentadas aplicáveis em microscopia de força atômica (AFM), utilizando os modelos de Euler-Bernoulli e de Timoshenko e uma metodologia introduzida na literatura para vigas segmentadas do tipo Euler-Bernoulli e de vigas uniformes do tipo Timoshenko com uso da resposta impulso distribuída e de respostas fundamentais concentradas. Um estudo da análise modal é realizado com modelos de vigas que incluem materiais piezoelétricos de uso em microscopia de força atômica. São assumidas condições de compatibilidade referentes ao deslocamento, rotação, momento fletor e cisalhamento nos pontos de descontinuidade. É observado que as frequências e os modos de vibração da viga segmentada são sensívieis às descontinuidades nos materiais e na geometria. Na obtenção de respostas forçadas, o método de Galerkin é utilizado para aproximar a resposta impulso distribuída com o uso de autofunções que satisfazem a propriedade dos modos normais. Apresentam-se resultados referentes a vigas bi e trissegmentadas, considerando parâmetros numéricos de teste e usados para vigas em AFM com materiais piezoelétricos. Os resultados modais obtidos neste trabalho são próximos daqueles encontrados na literatura. Vibrações forçadas foram obtidas considerando forçantes do tipo harmônico no tempo e com amplitude espacial dos tipos constante, concentrado e pulso. / This work studies the dynamics of multispan beams used in atomic force microscopy (AFM), considering the models of Euler-Bernoulli and Timoshenko, and applying the methodology introduced in the literature for Euler-Bernoulli segmented beams and uniform Timoshenko beams with the use of distributed impulse responses and concentrated fundamental responses. A study of modal analysis is performed with models of segmented beams, including piezoelectric materials of use in atomic force microscopy. We considered compatibility conditions with respect to the displacement, slope, flexure moment and shear at the points of discontinuity. It is observed that the frequencies and vibrating modes of the segmented beam are sensitive to material and geometric discontinuities. For obtaining forced responses, the Galerkin method is used to approximate the distributed impulse response with eigenfunctions that satisfy the normal mode property. We present results for the bi and tri segmented beams considering numerical testing and those employed for beams in AFM with piezoelectric materials. The modal results obtained in this work are close to those found in the literature. Forced responses were obtained by considering harmonic excitations with spatial amplitude for constant, localized and pulse types.

Made available in DSpace on 2012-09-05T18:24:05Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) 46.pdf: 2736972 bytes, checksum: 328fe11ce91221543844d8a6444d9db0 (MD5) Previous issue date: 1999 / Foram apresentadas as áreas do município onde houve domínio do mercado e domínio secundário do atendimento dos pacientes com fratura de colo de fêmur, mostrando ser um instrumento útil para auxílio ao planejamento e organizaçao do sistema de atençao à saúde. Observa ainda que a configuraçao dos mercados hospitalares variou segundo sua localizaçao, tipo de hospital, natureza jurídica e condiçao social da clientela, indicando que diferentes mercados exercem práticas de qualidade diferenciadas, onde pacientes em piores condiçoes sociais apresentam menor chance de receber tratamento recomendado no caso de fratura de colo de fêmur. Testa um modelo de decisao médica sobre o tipo de parto, a partir de informaçoes sobre a gestante, o médico e o hospital onde foi realizada a internaçao. Com base em dados do SIH-SUS e SINASC, sobre os partos ocorridos no município do Rio de Janeiro, em 1996, e utilizando regressao hierárquica, observou-se que houve maior chance de realizaçao de partos operatórios quanto maior era a idade da mae. Hospitais onde a maioria das maes possuíam maior escolaridade apresentaram maiores chances de realizaçao de partos cirúrgicos, assim como, foi fator protetor realizar partos em hospitais públicos, nao considerando os hospitais universitários, onde se espera que esteja grande parte da clientela de maior risco. Entretanto, ser maternidade, apresentar maior volume de partos e maior taxa de ocupaçao nao foram fatores que se mostraram estatísticamente significativos na explicaçao de maior ocorrência de partos cirúrgicos. Ao contrário do que se tem sido observado na literatura, médico contratado foi fator protetor para chances de cesárea. Os estudos apontam a variabilidade no padrao de uso de serviços de saúde entre áreas, mercados hospitalares e tipos de hospitais, com indicaçao de que estas variaçoes podem estar associadas, entre outros fatores, a diferença na condiçao social tanto de indivíduos, quanto do padrao de vida da área de residência dos pacientes ou mesmo da área de localizaçao do hospital, produzindo impacto negativo na eqüidade do sistema de saúde.

Made available in DSpace on 2016-03-04T14:01:27Z (GMT). No. of bitstreams: 2 rafael_cuadrat_ioc_dout_2014.pdf: 4008307 bytes, checksum: f638f1e7b8458c6f20d884b710ddaf75 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2016-02-23 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Os ambientes marinhos cobrem cerca de 70% da superfície do planeta. Esses habitats apresentam uma grande variabilidade de temperatura, pressão e salinidade, abrigando uma vasta biodiversidade microbiana, pertencentes aos 3 domínios da vida (Archaea, Bacteria e Eukarya). Estes microrganismos representam até 98% da produção primária destes ambientes representando grande potencial para exploração e descoberta de novos compostos naturais de interesse para a indústria farmacêutica e da biotecnologia. Entretanto, apenas cerca de 1% dos microrganismos podem ser cultivados com as técnicas atuais utilizando-se meios de cultura em laboratório. Com objetivo de contornar esta limitação, estudos de metagenômica vem sendo conduzidos para analisar amostras de diferentes ambientes, incluindo ambientes aquáticos como rios, lagos e regiões costeiras ou de oceano aberto. No presente estudo, foram avaliados a diversidade taxonômica e o potencial metabólico de uma amostra (fracionada em duas por filtração, nomeadas: amostra E \2013 retida na membrana de 0,8 \03BCm e amostra P \2013 retida na membrana de 0,22 \03BCm) coletada na Praia dos Anjos (Arraial do Cabo \2013 RJ), um ambiente de grande interesse por ser afetado pelo fenômeno da ressurgência, além de sofrer impacto antrópico (turismo e pesca). Foram também triados genes do metabolismo secundário (PKS e NRPS) de microrganismos através de pirosequenciamento do DNA total da comunidade Um total de 651.083 e 542.647 sequências de nucleotídeos (reads) foram obtidas das amostras P e E, respectivamente. As sequências obtidas foram analisadas através de similaridade com bancos de sequências públicas (Genbank) utilizando o pacote BLAST e o programa MEGAN para classificação taxonômica baseada no algoritmo do Último Ancestral Comum (LCA). O filo mais abundante nas duas amostras foi Proteobacteria, seguido por Bacteroidetes e Cyanobacteria (este último principalmente na amostra E). Membros do clado Roseobacter (principalmente gêneros Roseobacter e Ruegeria) foram encontrados em alta abundância nas duas amostras, porém a dominância é maior na amostra P (representando até 29% dos gêneros identificados). Através de modelos HMM (do inglês \201CHidden Markov Models\201D), foram triadas sequências de domínios conservados ceto-acil sintase - KS e domínio de condensação \2013 C, de enzimas PKS e NRPS, respectivamente. Um total de 84 sequências de KS e 46 sequências de domínio C foram encontradas nas duas amostras, mostrando o potencial deste ambiente para a descoberta de novos compostos de interesse para a indústria Adicionalmente, a abundância e diversidade de bactérias aeróbias fotossintetizantes anoxigênicas (AAP) no metagenoma de Arraial do Cabo e em metagenomas públicos do projeto GOS foi investigada através de uma metodologia in silico utilizando perfis de modelos ocultos de markov (pHMM) para triar os genes do núcleo de reação da fotossíntese anoxigênica (pufM e pufL), além do gene bchX, e através destes estimar a abundância e diversidade de AAPs em metagenomas. A amostra de maior abundância em AAPs foi a amostra P de Arraial do Cabo, com aproximadamente 23,88% do total de células presentes na amostra. Das 10 amostras do GOS mais abundantes em AAPs, 8 (80%) foram obtidas de regiões próximas a linha do equador. Foi possível classificar as sequências de pufM em filogrupos, mostrando alta abundância do filogrupo G (clado das Roseobacter) em Arraial do Cabo. Este filogrupo se mostrou o mais cosmopolita, presente em 11 das 12 (91,66%) amostras analisadas. Os resultados nos permitiram concluir que o ambiente estudado foi afetado pelo fenômeno da ressurgência, e a amostra foi coletada após o bloom do fictoplanton / The marine environments cover ~70% of the Earth's surface. These habitats present great variability of temperature, pressure and salinity, harboring a wide range of microorganisms from the three domains of life (Archaea, Bacteria and Eukarya) which are responsible for ~98% of the marine primary production. This huge biodiversity represents a great potent ial, as its exploration allows us to discover new enzymes for industrial use. However, only ~1% of the environmental microorganism can be cultivated using culture - dependent approaches. To overcome this limitation, metagenomics studies have been conducted u sing samples for different environments, including aquatic ones like costal seawater, deep seawater, open ocean waters and freshwater from rivers and lagoons. In this work, we explore the taxonomic diversity and the metabolic potential (to find new natural compounds produced by PKS and NRPS enzymes) of the Praia dos Anjos (Angel's Beach), in Arraial do Cabo, Rio de Janeiro, Brazil by pyrosequencing its metagenome. The sample was fractionated by filtration in 2 membranes to separate the eukaryotic (sample E) from prokaryotic communities (sample P). A total of 651,083 and 542,647 reads were obtained for samples P and E, respectively. The obtained sequences were analyzed by similarity using the BLAST package and the MEGAN program, applying the Last Common Ancest ral (LCA) algorithm. The MG - RAST pipeline was used to annotate the genes from the community. The most abundant bacterial phylum present in both samples was Proteobacteria, followed by Bacteroidetes and Cyanobacteria (mainly on sample E). Members of the Ros eobacter clade ( Roseobacter and Ruegeria genus) was abundant in both samples, but in larger abundance on sample P (up to 29% of identified genus) . The keto - acyl synthase (KS) domains from PKSs and condensation domain (C) from NRPS were screened using pHMMs approach. A total of 84 KS sequences and 46 C sequences were obtained from both samples, showing the potential of this environment for the discover y of new compounds. The aerobic anoxygenic phototrophs bacteria (AAP) are photoheterotrophic microorganisms that play important roles on biogeochemical cycles. In oceans, this group is wide ly distributed, however, its abundance and relevance in carbon fixation is poorly understood. In the present work, with the aim to estimate the abundance and diversity of AAPs in the metagenome from Arraial do Cabo, an in silico approach using Hiden Markov Models profiles (pHMM) was developed to screen core genes of anoxygenic photosynthesis ( pufM and pufL ), in addition to chlorophyllide reductase subunit X gene (bchX). The met agenomes from Global Ocean Sample Expedition (GOS) was also screened with comparative purposes. The most abundant sample was sample P from Arraial do Cabo, with ~23.88% of total cells in the sample . The 10 most abundant samples from GOS, in addition to the 2 samples from Arraial do Cabo, were selected to assembl y , ORF extraction and phylogenetic analysis of pufM genes. From the 10 GOS samples, 80% were collected in sites close to the Equador. It w as possible to classify the most of sequences in phylogroups, showing a high abundance of phylogroup G ( Roseobacter clade) in Arraial do Cabo samples. This phylogroup was the most ubiquitous, present on 11 from 12 ( 91.66%) assembled samples.

Neste trabalho, a docagem e a dinâmica molecular foram utilizadas para investigar a interação entre oligonucleotídeos e duas bases de Tröger: uma base simétrica - contendo duas proflavinas – e uma base assimétrica – contendo uma proflavina e uma fenantrolina. Nas docagens que utilizaram DNA canônico com gap como receptor, os resultados reproduziram corretamente a estereosseletividade da interação, que favorece os isômeros levorrotatórios em relação aos dextrorrotatórios, e apontou para os modos de interação sugeridos pela literatura: ligação ao sulco menor para a Tröger simétrica e intercalação com ligação ao sulco menor (modo misto) para a Tröger assimétrica. Para as simulações, foram escolhidos quatro complexos contendo os enantiômeros levorrotatórios das bases de Tröger e oligonucleotídeos com e sem gap. Embora os complexos representassem pontos de partida diferentes, houve convergência entre aqueles que continham o mesmo oligonucleotídeo como receptor. Os complexos com DNA com gap (complexos de intercalação) convergiram para um modo misto de interação, com intercalação de uma proflavina, enquanto os complexos com DNA sem gap (complexos de ligação ao sulco menor) convergiram para um modo de interação novo, em que as bases de Tröger se ligam ao sulco menor unicamente através da ponte diazocina, com os substituintes projetados para fora. Os complexos de intercalação apresentaram tempos de residência altos (20 ns) e diminuíram o ângulo de torção da dupla hélice na região do gap, levando os ângulos x e y da cadeia principal para uma região não-canônica, associada à forma A do DNA. Já nos complexos de ligação ao sulco menor, houve mudança tanto do modo como do sítio de interação e, embora tenham ocorrido eventuais curvaturas no DNA, não houve alterações significativas nos ângulos da cadeia principal, de modo que a estrutura global do DNA se manteve dentro da região considerada B-canônica. Dessa forma, os resultados sugerem que a intercalação (com adicionais contatos no sulco menor) seja o modo preferencial de interação dessas bases de Tröger com o DNA. O modo de ligação ao sulco menor, por depender quase que exclusivamente da ponte diazocina, seria independente da quiralidade e, portanto, não seria capaz de explicar enantiosselevidade das bases de Tröger. / In this work, molecular docking and molecular dynamics simulations were applied to investigate the interaction between DNA oligomers and two Tröger bases: a symmetric Tröger base derived from proflavine and a mixed Tröger base containing proflavine and phenanthroline. The dockings that used canonical DNA with an artificial intercalation gap as receptor correctly reproduced the stronger DNA binding affinity of the levorotatory isomers when compared to the dextrorotatory ones. Moreover, the results pointed out to the binding modes suggested, yet not established, by experimental data: minor groove binding for symmetric Tröger base and intercalation with additional minor groove binding for the asymmetric one. For the simulations, four complexes were selected, containing the (-)-isomers of the Tröger bases and DNA oligomers with or without intercalation gap. Interestingly, the systems containing the same DNA as receptor converged to similar binding modes: those containing DNA with gap (intercalation complexes) resulted in a mixed binding – with one proflavine intercalated and the other moiety occupying the minor groove – while those containing DNA without gap (minor groove complexes) lead to a new binding mode, in which the Tröger bases interact with the minor groove mainly through the diazocin bridge. In the intercalation complexes, the ligands presented long residence times (20 ns) and also unwound the double helix in the region of the intercalation gap, leading some backbone angles (x and y) to assume non-canonical values typical of the A form of DNA. In minor groove complexes, the ligands displayed enhanced mobility – changing both the binding mode and the binding site – and, although they promoted some bending of the double helix, the main chain torsion angles of DNA remained in the B-canonical region. Altogether, these results suggest that intercalation of proflavine (with additional contacts in the minor groove) might be the stronger DNA binding mode for these Tröger bases. Since the minor groove binding depends almost exclusively of the diazocin bridge, it appears to perform independently of the ligand chirality and, therefore, could not explain the enantioselectivity of the interaction.

La estructura y el funcionamiento de las organizaciones educacionales se han visto afectadas por la constante búsqueda de la excelencia académica. Una reestructuración del personal, cambios en el organigrama, nuevas mallas curriculares, incorporación de herramientas de apoyo son medidas adoptadas con el fin de lograr el objetivo de la excelencia académica. Últimamente se ha venido desarrollando un nuevo y cada vez más importante factor competitivo: generar, difundir y poner a disposición de todo el conocimiento en una organización. El conocimiento ya no es un recurso más de la organización, sino que, con motivo de la evolución de la sociedad industrial a la sociedad de la información o sociedad del conocimiento, se ha convertido en uno de los principales factores de producción. Es por esto la creciente necesidad de generar herramientas tecnológicas que permitan administrar y gestionar de la mejor manera este conocimiento, el Departamento de la Ciencias de la Computación de la Facultad de Ciencias Físicas y Matemáticas de la Universidad de Chile, no esta ajeno a esta necesidad de administrar la información y conocimiento. En particular la información y conocimiento que requiere administrar el Departamento, es la de la producción investigativa de los académicos y el uso de fondos de incentivos a esta producción. Para lograr este objetivo esta memoria tiene como objetivo principal la de generar una herramienta Web que permita automatizar la gestión de las publicaciones del Departamento y la administración de los fondos de incentivo asociados, esta actividad involucra tanto a los académicos como a personal administrativo del Departamento, como área de investigación, contabilidad y dirección. Esta herramienta tiene como finalidad entregar una visión completa del estado de las publicaciones, para cada uno de los involucrados: Académicos, publicación aceptadas y acreditadas en el Departamento, estado de fondos de incentivos y puntaje Coordinador de Investigación, vista completa de la producción investigativa de los académicos, y administración de los fondos de incentivo. Contabilidad, gestión del uso de los fondos de incentivos Dirección, visión completa y global de la producción investigativa de los académicos y gestión de los fondos de incentivo.

É realizado um estudo da dinâmica de vigas segmentadas aplicáveis em microscopia de força atômica (AFM), utilizando os modelos de Euler-Bernoulli e de Timoshenko e uma metodologia introduzida na literatura para vigas segmentadas do tipo Euler-Bernoulli e de vigas uniformes do tipo Timoshenko com uso da resposta impulso distribuída e de respostas fundamentais concentradas. Um estudo da análise modal é realizado com modelos de vigas que incluem materiais piezoelétricos de uso em microscopia de força atômica. São assumidas condições de compatibilidade referentes ao deslocamento, rotação, momento fletor e cisalhamento nos pontos de descontinuidade. É observado que as frequências e os modos de vibração da viga segmentada são sensívieis às descontinuidades nos materiais e na geometria. Na obtenção de respostas forçadas, o método de Galerkin é utilizado para aproximar a resposta impulso distribuída com o uso de autofunções que satisfazem a propriedade dos modos normais. Apresentam-se resultados referentes a vigas bi e trissegmentadas, considerando parâmetros numéricos de teste e usados para vigas em AFM com materiais piezoelétricos. Os resultados modais obtidos neste trabalho são próximos daqueles encontrados na literatura. Vibrações forçadas foram obtidas considerando forçantes do tipo harmônico no tempo e com amplitude espacial dos tipos constante, concentrado e pulso. / This work studies the dynamics of multispan beams used in atomic force microscopy (AFM), considering the models of Euler-Bernoulli and Timoshenko, and applying the methodology introduced in the literature for Euler-Bernoulli segmented beams and uniform Timoshenko beams with the use of distributed impulse responses and concentrated fundamental responses. A study of modal analysis is performed with models of segmented beams, including piezoelectric materials of use in atomic force microscopy. We considered compatibility conditions with respect to the displacement, slope, flexure moment and shear at the points of discontinuity. It is observed that the frequencies and vibrating modes of the segmented beam are sensitive to material and geometric discontinuities. For obtaining forced responses, the Galerkin method is used to approximate the distributed impulse response with eigenfunctions that satisfy the normal mode property. We present results for the bi and tri segmented beams considering numerical testing and those employed for beams in AFM with piezoelectric materials. The modal results obtained in this work are close to those found in the literature. Forced responses were obtained by considering harmonic excitations with spatial amplitude for constant, localized and pulse types.

É realizado um estudo da dinâmica de vigas segmentadas aplicáveis em microscopia de força atômica (AFM), utilizando os modelos de Euler-Bernoulli e de Timoshenko e uma metodologia introduzida na literatura para vigas segmentadas do tipo Euler-Bernoulli e de vigas uniformes do tipo Timoshenko com uso da resposta impulso distribuída e de respostas fundamentais concentradas. Um estudo da análise modal é realizado com modelos de vigas que incluem materiais piezoelétricos de uso em microscopia de força atômica. São assumidas condições de compatibilidade referentes ao deslocamento, rotação, momento fletor e cisalhamento nos pontos de descontinuidade. É observado que as frequências e os modos de vibração da viga segmentada são sensívieis às descontinuidades nos materiais e na geometria. Na obtenção de respostas forçadas, o método de Galerkin é utilizado para aproximar a resposta impulso distribuída com o uso de autofunções que satisfazem a propriedade dos modos normais. Apresentam-se resultados referentes a vigas bi e trissegmentadas, considerando parâmetros numéricos de teste e usados para vigas em AFM com materiais piezoelétricos. Os resultados modais obtidos neste trabalho são próximos daqueles encontrados na literatura. Vibrações forçadas foram obtidas considerando forçantes do tipo harmônico no tempo e com amplitude espacial dos tipos constante, concentrado e pulso. / This work studies the dynamics of multispan beams used in atomic force microscopy (AFM), considering the models of Euler-Bernoulli and Timoshenko, and applying the methodology introduced in the literature for Euler-Bernoulli segmented beams and uniform Timoshenko beams with the use of distributed impulse responses and concentrated fundamental responses. A study of modal analysis is performed with models of segmented beams, including piezoelectric materials of use in atomic force microscopy. We considered compatibility conditions with respect to the displacement, slope, flexure moment and shear at the points of discontinuity. It is observed that the frequencies and vibrating modes of the segmented beam are sensitive to material and geometric discontinuities. For obtaining forced responses, the Galerkin method is used to approximate the distributed impulse response with eigenfunctions that satisfy the normal mode property. We present results for the bi and tri segmented beams considering numerical testing and those employed for beams in AFM with piezoelectric materials. The modal results obtained in this work are close to those found in the literature. Forced responses were obtained by considering harmonic excitations with spatial amplitude for constant, localized and pulse types.

Neste trabalho, a docagem e a dinâmica molecular foram utilizadas para investigar a interação entre oligonucleotídeos e duas bases de Tröger: uma base simétrica - contendo duas proflavinas – e uma base assimétrica – contendo uma proflavina e uma fenantrolina. Nas docagens que utilizaram DNA canônico com gap como receptor, os resultados reproduziram corretamente a estereosseletividade da interação, que favorece os isômeros levorrotatórios em relação aos dextrorrotatórios, e apontou para os modos de interação sugeridos pela literatura: ligação ao sulco menor para a Tröger simétrica e intercalação com ligação ao sulco menor (modo misto) para a Tröger assimétrica. Para as simulações, foram escolhidos quatro complexos contendo os enantiômeros levorrotatórios das bases de Tröger e oligonucleotídeos com e sem gap. Embora os complexos representassem pontos de partida diferentes, houve convergência entre aqueles que continham o mesmo oligonucleotídeo como receptor. Os complexos com DNA com gap (complexos de intercalação) convergiram para um modo misto de interação, com intercalação de uma proflavina, enquanto os complexos com DNA sem gap (complexos de ligação ao sulco menor) convergiram para um modo de interação novo, em que as bases de Tröger se ligam ao sulco menor unicamente através da ponte diazocina, com os substituintes projetados para fora. Os complexos de intercalação apresentaram tempos de residência altos (20 ns) e diminuíram o ângulo de torção da dupla hélice na região do gap, levando os ângulos x e y da cadeia principal para uma região não-canônica, associada à forma A do DNA. Já nos complexos de ligação ao sulco menor, houve mudança tanto do modo como do sítio de interação e, embora tenham ocorrido eventuais curvaturas no DNA, não houve alterações significativas nos ângulos da cadeia principal, de modo que a estrutura global do DNA se manteve dentro da região considerada B-canônica. Dessa forma, os resultados sugerem que a intercalação (com adicionais contatos no sulco menor) seja o modo preferencial de interação dessas bases de Tröger com o DNA. O modo de ligação ao sulco menor, por depender quase que exclusivamente da ponte diazocina, seria independente da quiralidade e, portanto, não seria capaz de explicar enantiosselevidade das bases de Tröger. / In this work, molecular docking and molecular dynamics simulations were applied to investigate the interaction between DNA oligomers and two Tröger bases: a symmetric Tröger base derived from proflavine and a mixed Tröger base containing proflavine and phenanthroline. The dockings that used canonical DNA with an artificial intercalation gap as receptor correctly reproduced the stronger DNA binding affinity of the levorotatory isomers when compared to the dextrorotatory ones. Moreover, the results pointed out to the binding modes suggested, yet not established, by experimental data: minor groove binding for symmetric Tröger base and intercalation with additional minor groove binding for the asymmetric one. For the simulations, four complexes were selected, containing the (-)-isomers of the Tröger bases and DNA oligomers with or without intercalation gap. Interestingly, the systems containing the same DNA as receptor converged to similar binding modes: those containing DNA with gap (intercalation complexes) resulted in a mixed binding – with one proflavine intercalated and the other moiety occupying the minor groove – while those containing DNA without gap (minor groove complexes) lead to a new binding mode, in which the Tröger bases interact with the minor groove mainly through the diazocin bridge. In the intercalation complexes, the ligands presented long residence times (20 ns) and also unwound the double helix in the region of the intercalation gap, leading some backbone angles (x and y) to assume non-canonical values typical of the A form of DNA. In minor groove complexes, the ligands displayed enhanced mobility – changing both the binding mode and the binding site – and, although they promoted some bending of the double helix, the main chain torsion angles of DNA remained in the B-canonical region. Altogether, these results suggest that intercalation of proflavine (with additional contacts in the minor groove) might be the stronger DNA binding mode for these Tröger bases. Since the minor groove binding depends almost exclusively of the diazocin bridge, it appears to perform independently of the ligand chirality and, therefore, could not explain the enantioselectivity of the interaction.

Made available in DSpace on 2014-06-12T16:31:01Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo5080_1.pdf: 5199617 bytes, checksum: 6c2aa5e9ed246f93d6b8907610b73f69 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2007 / O Modelo Numérico de Elevação (MNE) pode ser conceituado como qualquer representação numérica de uma superfície física do terreno. Um fato a ser observado diz respeito as possíveis fontes de Erros do MNE, uma vez que esses têm relação direta com a qualidade da superfície a ser estimada. Essas fontes podem ter a seguinte classificação: (i) Erros devidos à idade do dado, a densidade e a distribuição da amostra; (ii) Erros de medição da amostra coletada; (iii) Erros de interpolação, de classificação, de generalização e de truncamento. Sobre essa última fonte, observa-se que qualquer que seja o interpolador empregado, sempre existirá incerteza no ponto estimado. Sendo assim, julga-se pertinente criar procedimentos de avaliação de modelos de interpolação objetivando selecionar os melhores adaptados ao relevo topográfico de uma determinada região