Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2017-05-04T17:58:44Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Cyndi Heleinne Pires - 2017.pdf: 2063752 bytes, checksum: 2036ddcd50484f9d6ad492b261d8b7c6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-05-05T12:52:04Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Cyndi Heleinne Pires - 2017.pdf: 2063752 bytes, checksum: 2036ddcd50484f9d6ad492b261d8b7c6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-05T12:52:04Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Cyndi Heleinne Pires - 2017.pdf: 2063752 bytes, checksum: 2036ddcd50484f9d6ad492b261d8b7c6 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-03-10 / Gram-negative bacilli (BGN) comprise species that are sources of community-acquired infections and infections associated with health care. They are easily spread among humans and have the ability to acquire and share genetic material by horizontal gene transfer. The objective of the study was to determine the prevalence of BGN isolated from the environment and patients of an ICU of a university hospital in the city of Goiânia-GO, to determine the susceptibility profile of the isolates, and their genetic similarity. The collections were performed in patients and environments of the Medical ICU of a university hospital in the city of Goiânia-GO, between December 2012 and June 2014. After collection, the swabs were packed in heart brain infusion broth. Isolation was performed on MacConkey agar and species identification was performed by multiplex PCR. Diffusion disc tests were performed to determine the antimicrobial susceptibility profile and phenotypic tests for the detection of resistance phenotypes. Next, monoplex PCR was performed to detect 15 genes encoding beta-lactam resistance. The PFGE of P. mirabilis, E. coli and A. baumannii isolates were also performed to verify the genetic similarity between the circulating strains. A total of 526 swabs were collected, of which 134 were patients and 392 were environment. The prevalence of BGN found was 55.3% (291/526), and of these, 219 (75.2%) were identified among the species H. alvei (36.8%), A. baumannii (26.8 %), P. mirabilis (7.6%), P. aeruginosa (2.4%) and E. coli (1.7%). Among the bacteria identified, 51 (23.3%) were resistant to beta-lactams, of which 8 (15.7%) were ESBL-producing. Of the 24 (10.9%) isolates resistant to carbapenems, 10 (41.6%) were carbapenemase producers. The most prevalent beta-lactam resistance genes in the environment samples were blaSHV and blaIMT, both with 39.3%, and blaSME (35.7%). In patients the most prevalent genes were blaSHV (43.5%), blaOXA (39.1%) and blaIMG (34.8%). The dendrograms resulting from the macrorrest profiles show an outbreak of contamination / colonization by a dominant clone of A. baumannii in the ICU in the year 2013 and in 2014 the appearance of different enterobacteria in detriment of A. baumanni revealing the predominance between species in different years. The results suggest that the prevalence of BGN, mainly of enterobacteria, is high in health institutions, mainly in ICUs. The hospital environment can be a potential source of contamination and infection to patients and health professionals, as well as acting as reservoir of resistance genes, deserving greater attention and development of educational and hygienic-sanitary measures to control the patient-environment interface. / Os bacilos Gram negativos (BGN) compreendem espécies que são fontes de infecções comunitárias e infecções associadas à assistência à saúde. São de fácil propagação entre os seres humanos e possuem capacidade de adquirir e compartilhar material genético por transferência horizontal de genes. O objetivo do estudo foi determinar a prevalência de BGN isolados de ambiente e pacientes de uma UTI de um hospital universitário do município de Goiânia-GO, determinar o perfil de suscetibilidade dos isolados, e a similaridade genética dos mesmos. As coletas foram realizadas em pacientes e ambientes da UTI Médica de um hospital universitário do município de Goiânia-GO, entre dezembro de 2012 e junho de 2014. Após a coleta, os swabs foram acondicionados em caldo infusão de cérebro coração. O isolamento foi realizado em ágar Mac Conkey e a identificação das espécies foi realizada por PCR multiplex. Foram realizados testes de disco difusão para determinação do perfil de suscetibilidade aos antimicrobianos e testes fenotípicos para detecção de fenótipos de resistência. Em seguida, foi realizado PCR monoplex para detecção de 15 genes que codificam resistência aos betalactâmicos. Também foi realizado o PFGE dos isolados de P. mirabilis, E. coli e A. baumannii para verificar a similaridade genética entre as cepas circulantes. Foram coletados um total de 526 swabs, sendo 134 de pacientes e 392 de ambiente. A prevalência de BGN encontrada foi de 55,3% (291/526), e, destes, 219 (75,2%) foram identificados como H. alvei (36,8%), A. baumannii (26,8%), P. mirabilis (7,5%), P. aeruginosa (2,4%) e E. coli (1,7%). Dentre as bactérias identificadas, 51 (23,3%) foram resistentes aos betalactâmicos, sendo 8 (15,7%) produtoras de ESBL. Dos 24 (10,9%) isolados resistentes aos carbapenêmicos, 10 (41,6%) foram produtores de carbapenemase. Os genes de resistência aos betalactâmicos mais prevalentes nas amostras de ambiente foram blaSHV e blaGIM, ambos com 39,3%, e blaSME (35,7%). Em pacientes, os genes mais prevalentes foram blaSHV (43,5%), blaOXA (39,1%) e blaGIM (34,8%). Os dendrogramas resultantes dos perfis de macrorrestrição mostram um surto de contaminação/colonização por um clone dominante de A. baumannii na UTI, no ano de 2013 e, em 2014, o surgimento de diferentes enterobactérias em detrimento do A. baumanni revelando a predominância entre espécies nos diferentes anos do estudo. Os resultados encontrados sugerem que a prevalência de BGN, sobretudo de enterobactérias, é elevada em instituições de saúde, principalmente em UTIs. O ambiente hospitalar pode ser fonte potencial de contaminação e infecção aos pacientes e aos profissionais de saúde, além de atuar como reservatório de genes de resistência, merecendo maior atenção e desenvolvimento de medidas educacionais e higiênico-sanitárias para o controle da interface paciente-ambiente.

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:30:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao ana beatriz.pdf: 103876 bytes, checksum: dca149fa61a0329de409ef0e4cba735a (MD5) Previous issue date: 2007-10-11 / Introduction: the nasopharynx (NP) constitutes the primary ecological reservoir or source of dissemination of microorganisms as Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Staphylococcus aureus and Gram-negative bacilli (GNB). Several studies demonstrated that asymptomatic nasopharyngeal (NP) carriage of pathogens is prevalent in young infants and precedes the development of invasive disease. Children in day-care centers act as an important vector for horizontal spread of the respiratory pathogens and GNB within the community. The infants are susceptible to condition of carrier and take a fundamental role in the epidemiology of respiratory infections. The nasopharyngeal flora becomes established during the first year of life and is densely colonized by a broad variety of microorganisms, commensal bacteria as well as potential pathogens that may cause infections. Epidemiologic studies demonstrate that many factors influence nasopharyngeal carriage rates: age, gender, season, acute respiratory illness, exposure to other children, socio-economic status, family size, warm-climate countries, passive smoking exposure, antibiotic therapy are risk factors of colonization of the NP by BGN. Objective: this study aimed to determinate the prevalence and susceptibility pattern of BGN isolated from NP of children less than five years old attending day-care centers at municipality of Goiânia. Methods: the investigation was conducted in the municipality of Goiânia as part of an ongoing prospective surveillance of Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Staphylococcus aureus in children of 62 day-care centers. The surveillance was carried out from August to December, 2005 and was collected 1192 samples. The nasopharyngeal specimens were collected with a transwab, extrathin and flexible, placed in Stuart transport medium tubes and transported to the Laboratory of Bacteriology of the Federal University of Goias-Institute of Tropical Pathology and Public Health to processing. The isolates were identified by colony morphology, Gram staining technique and according to standardized tests. Susceptibility tests were performed by the disk diffusion method. Results: a total of 106 (8,9%) Gram-negative bacilli were isolated and 13 species were identified. The species more prevalent were twenty-six (24,5%) Enterobacter aerogenes, seventeen (16,0%) K. pneumoniae, eleven (10,4%) E. coli, eight (7,5%) E. agglomerans and five (4,7%) Pseudomonas sp. It was observed that forty-three (57,3%) GNB were resistant to ampicillin; twenty (26,7%) to trimethoprim-sulfametoxazole; eighteen (24,0%) showed resistance to amoxicillin-clavulanic acid and nine (12,0%) presented resistance to tetracycline. The production of extended-spectrum beta-lactamase was not detected. Conclusion: in this study was demonstrated that young children attending in daycare centers at municipality of Goiania might be GNB carrier and therefore have a fundamental role in the dissemination of microorganisms involved in community-acquired infections. It is necessary that more studies be developed to establish strategies more effectives to minimize the problem of the nasopharyngeal colonization and communityacquired infections due to importance and seriousness that both represent in the public health. / Introdução: a nasofaringe (NF) constitui o reservatório ecológico primário ou fonte de disseminação de microrganismos como Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Staphylococcus aureus e bastonetes Gram-negativos (BGN). Vários estudos demonstraram que colonização nasofaríngea assintomática é prevalente em crianças e precede o desenvolvimento de doença invasiva. Crianças que freqüentam creches atuam como um importante vetor para disseminação horizontal de patógenos respiratórios e BGN dentro da comunidade. As crianças são suscetíveis à condição de portador e assumem um papel fundamental na epidemiologia de infecções respiratórias. A microbiota da nasofaringe é formada durante os primeiros anos de vida e é densamente colonizada por uma variedade de microrganismos, bactérias comensais assim como patógenos que podem causar infecções. Estudos epidemiológicos demonstram que muitos fatores influenciam o padrão de colonização da NF por BGN: idade, sexo, estação do ano, infecções respiratórias, contato com outras crianças, condição sócio-econômica, tamanho das famílias, países tropicais, exposição passiva a fumantes e antibioticoterapia. Objetivo: este estudo objetivou determinar a prevalência e padrão de suscetibilidade de BGN isolados da nasofaringe de crianças menores de 5 anos de idade que freqüentam creches no município de Goiânia. Métodos: a investigação é parte de um sistema de vigilância ativa, prospectiva e populacional de Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Staphylococcus aureus em crianças de 62 creches. O estudo foi realizado no período de agosto a dezembro de 2005 e foram coletadas 1192 amostras. As coletas de espécimes da nasofaringe foram realizadas com um transwab, extrafino e flexível, inoculado no meio modificado para trasporte de Stuart e enviado ao Laboratório de Bacteriologia da Universidade Federal de Goiás-Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública para processamento. Os isolados foram identificados pela morfologia da colônia, coloração de Gram e testes bioquímicos padronizados. O peril de suscetibilidade foi determinado pelo método de disco difusão. Resultados: um total de 106 (8,9%) BGN foram isolados da nasofaringe de crianças e 13 espécies foram identificadas. As espécies mais freqüentes: foram vinte e seis (24,5%) Enterobacter aerogenes, dezessete (16,0%) K. pneumoniae, onze (10,4%) E. coli, oito (7.5%) E. agglomerans, cinco (4,7%) Pseudomonas sp. Observou-se que quarenta e três (57,3%) BGN apresentaram resistência a ampicilina; vinte (26,7%) foram resistentes a sulfametoxazol-trimetoprim; dezoito (24,0%) mostraram resistência a amoxacilina-ácido clavulânico e nove (12,0%) apresentaram resistência a tetraciclina. Conclusão: no presente estudo observou-se que crianças que freqüentam creches no município de Goiânia podem ser portadores de BGN e, portanto, assumem um papel fundamental na disseminação de microrganismos envolvidos em infecções comunitárias. É necessário que mais estudos sejam desenvolvidos para estabelecer estratégias mais eficazes para minimizar o problema da colonização nasofaríngea e de infecções adquiridas da comunidade devido à importância e seriedade que ambas representam no cenário da saúde pública.

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