A diet study of swordfish, Xiphias gladius, was conducted in the Straits of Florida from April 2007 to December 2008. The stomachs of 131 swordfish were analyzed. Thirteen species of teleosts, three species of cephalopods, and one species of crustacean were observed in the diet. Cephalopods dominated the swordfish diet by weight (73.38%), number (69.90%), and occurrence (80.91%) and ranked highest in importance in the diet when calculating the index of relative importance (IRI). Teleosts followed by weight (25.16%), number (26.34%), occurrence (68.18%), and IRI (3,510.97). The prey species with the greatest dietary importance was Illex sp followed by unidentifiable ommastrephids. Stomach fullness index (SFI) was calculated ranging from 0 (empty stomachs) to 3.57. Additionally, correlations for juvenile male swordfish length and prey length (r²=0.647) as well as female adult swordfish weight and prey weight (r²=-0.327) were found to be significant. Overall feeding seasonality showed that swordfish primarily fed on teleosts (58%) in the spring, cephalopods (70%) in the summer, and cephalopods (75%) in the winter. When considered individually, female, male, and adult swordfish followed this pattern; however juveniles did not follow the overall feeding trend according to season. They fed regularly on cephalopods during spring (57%) and summer (61%) consuming the highest abundance of cephalopods during the winter (85%). Overall, swordfish appeared to be opportunistic feeders altering its food choices when abundance of prey may have changed or when food items were present.

This work is focused on systematic research of cephalopod jaws from the Late Cretaceous. Samples of 147 newly recorded nautiloid rhyncholites from the Bohemian Cretacoeus Basin and one new ammonite rhyncholite from Řepov village were systematically analyzed. The new collection of lower ammonite jaws (aptychi) consists of 32 specimens. Nautiloid rhyncholites from localities Turkaňk, Úpohlavy, and Dreisen were determined as Nautilorhynchus simplex. Conchorhynchs from locality Vinary u Vysokého Mýta belong to the species Conchorhynchus cretaceous, which is associated with the commonmost species Eutrephoceras sublaevigatum. Ammonite rhyncholite is left in the open nomenclature due to its uncertain systematic position and it is not assigned to any ammonite species. Records of aptychi from the locality of Úpohlavy and Pecínov represent mainly species of heteromorphic ammonites - baculitids (Baculites, Sciponoceras). The total diversity of species from both localities reaches 20 ammonite species. The two jaw morphotypes (2 species of aptychi) are reported from the Bohemian Cretaceous Basin for the first time herein. Of the high importance, it is a record of ammonite Prionocyclus germari from Úpohlavy with associated lower jaws in situ within the body chamber. Aptychus of this taxon has never been...

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This PhD thesis addresses several aspects of the biology and ecology of the squid Doryteuthis plei in the coast of São Paulo, SE Brazil, at both the population and individual levels. On the population structure of the exploited stock, it includes the patterns of reproductive activity, size-at-maturity, and biometrics of reproductive organs associated with squid size, as well as feeding habits and ontogenetic, sexual, and spatial-temporal shifts. Generalized Additive Models for Location, Scale, and Shape (GAMLSS) were used to identify such population patterns and spatial and temporal factors based on the particular small-scale fishery that targets the species around the São Sebastião Island. At the individual level, the study focused on behavioural traits in two periods of the life-cycle: (1) the reproductive phase, where the body patterns were described, generating a comprehensive ethogram for the species, and (2) the paralarval phase, where the development of swimming and predatory behaviours was detailed. Size-at-maturity was found to be 151-175 mm of mantle length (ML) for females, and 187-190 mm ML for males, that also showed the co-occurrence of two distinct maturation groups (Chapter 1). A significant peak of females gonad weight occurs in February and March especially in the island\'s South and Southeastern areas, and of males in March. An ethogram analysis showed 19 chromatic, 5 locomotor, and 12 postural components and behavioural sequences for the species, including agonistic, courtship, and mating behaviour (Chapter 2). Light chromatic components (clear and iridophore splotches) showed a longer duration than dark chromatic components, especially those associated with calm behaviour, more frequent in females. Males appeared more dedicated to disputes over resources and used fast miscellaneous visual signalling. In respect to feeding habits (Chapter 3), prey composition differed among sexes, size, maturity, and spatio-temporal pattern. Females do not stop feeding during sexual maturation and the amount of food increases with size. Cephalopods were significant preys for mature females, as well as fish and crustaceans to the largest females, while pelagic polychaetes were dominant prey for largest males. Observations and filming of D. plei paralarvae (Chapter 4) show a complex predatory behaviour on live preys, with different hunting types differing in speed and position. Aggressive intra-specific behaviour was found in the absence of prey when paralarvae show both a pursuit strategy and a rapid backward escape after attack. These findings contribute to better understand the population biology and behavior of the species and also in the future definition and guidance of fisheries management plans. / A presente tese aborda diferentes aspectos da biologia e ecologia da lula Doryteuthis plei na costa de São Paulo, SE do Brasil, tanto em nível individual quanto populacional. Com relação à estrutura populacional do estoque explorado, foram analisados padrões da atividade reprodutiva, tamanho de primeira maturação, morfometria dos órgãos reprodutivos associados às fases de desenvolvimento e também hábitos alimentares e mudanças ontogenéticas, sexuais e espaço-temporais. Modelos aditivos generalizados para localização, escala e forma (Generalized Additive Models for Location, Scale, and Shape - GAMLSS) foram utilizados com intuito de identificar padrões populacionais, espaciais e temporais baseados em desembarques da pesca de pequena escala em torno da Ilha de São Sebastiao. Em nível individual, o estudo abordou padrões comportamentais em 2 diferentes períodos do ciclo de vida: (1) fase de reprodução, onde padrões corporais foram descritos, tendo como resultado um abrangente etograma (2) fase paralarval, onde o desenvolvimento de comportamento natatório e predatório foram detalhados. O tamanho de primeira maturação foi estimado entre 151 e 175 mm de comprimento do manto (ML) para as fêmeas e entre 187 e 190 mm ML para os machos, também foi identificada a co-ocorrência de 2 grupos de maturação para os machos. (Capitulo 1). Um pico significativo com relação ao peso das gônadas foi identificado entre os meses de Fevereiro e Março para as fêmeas e em Março para os machos, especialmente nas áreas Sul e Sudeste da ilha. Uma análise dos comportamentos reprodutivos e dos padrões corporais, resultando em um amplo etograma, revelou 19 componentes cromáticos, 5 locomotores e 12 posturais, como também, sequências comportamentais para a espécie, incluindo comportamentos agonístico, de corte e acasalamento (Capitulo 2). Componentes cromáticos claros (manchas claras e irridóforos) apresentaram maior duração do que os componentes cromáticos escuros, particularmente aqueles relacionados ao comportamento calmo, mais frequente nas fêmeas. Machos aparentemente foram mais propensos a disputas por recursos usando sinalizações visuais rápidas e variadas. Em relação aos hábitos alimentares (Capítulo 3), a composição de presas diferiu entre sexos, tamanhos, maturidade e padrões espaço-temporais. As fêmeas não deixaram de se alimentar durante a maturação e foi observada uma relação positiva entre a quantidade de alimentos e o tamanho dos indivíduos. Pequenos cefalópodes, assim como peixes e crustáceos foram às presas mais significativas entre as fêmeas maduras, enquanto que para os machos foram os poliquetas. Através de observações e filmagens de paralarvas de D. plei (Capitulo 4), identificou-se um comportamento predatório complexo sobre presas vivas, com diferentes tipos de caça que diferem em velocidade e posição. Comportamentos agressivos entre indivíduos da mesma espécie (estratégias de ataque e fuga) foram identificados quando na ausência de presas. Estes achados contribuem para melhor compreender a biologia populacional, comportamento da espécie, e também na futura definição e orientação nos planos do manejo pesqueiro.

This PhD thesis addresses several aspects of the biology and ecology of the squid Doryteuthis plei in the coast of São Paulo, SE Brazil, at both the population and individual levels. On the population structure of the exploited stock, it includes the patterns of reproductive activity, size-at-maturity, and biometrics of reproductive organs associated with squid size, as well as feeding habits and ontogenetic, sexual, and spatial-temporal shifts. Generalized Additive Models for Location, Scale, and Shape (GAMLSS) were used to identify such population patterns and spatial and temporal factors based on the particular small-scale fishery that targets the species around the São Sebastião Island. At the individual level, the study focused on behavioural traits in two periods of the life-cycle: (1) the reproductive phase, where the body patterns were described, generating a comprehensive ethogram for the species, and (2) the paralarval phase, where the development of swimming and predatory behaviours was detailed. Size-at-maturity was found to be 151-175 mm of mantle length (ML) for females, and 187-190 mm ML for males, that also showed the co-occurrence of two distinct maturation groups (Chapter 1). A significant peak of females gonad weight occurs in February and March especially in the island\'s South and Southeastern areas, and of males in March. An ethogram analysis showed 19 chromatic, 5 locomotor, and 12 postural components and behavioural sequences for the species, including agonistic, courtship, and mating behaviour (Chapter 2). Light chromatic components (clear and iridophore splotches) showed a longer duration than dark chromatic components, especially those associated with calm behaviour, more frequent in females. Males appeared more dedicated to disputes over resources and used fast miscellaneous visual signalling. In respect to feeding habits (Chapter 3), prey composition differed among sexes, size, maturity, and spatio-temporal pattern. Females do not stop feeding during sexual maturation and the amount of food increases with size. Cephalopods were significant preys for mature females, as well as fish and crustaceans to the largest females, while pelagic polychaetes were dominant prey for largest males. Observations and filming of D. plei paralarvae (Chapter 4) show a complex predatory behaviour on live preys, with different hunting types differing in speed and position. Aggressive intra-specific behaviour was found in the absence of prey when paralarvae show both a pursuit strategy and a rapid backward escape after attack. These findings contribute to better understand the population biology and behavior of the species and also in the future definition and guidance of fisheries management plans. / A presente tese aborda diferentes aspectos da biologia e ecologia da lula Doryteuthis plei na costa de São Paulo, SE do Brasil, tanto em nível individual quanto populacional. Com relação à estrutura populacional do estoque explorado, foram analisados padrões da atividade reprodutiva, tamanho de primeira maturação, morfometria dos órgãos reprodutivos associados às fases de desenvolvimento e também hábitos alimentares e mudanças ontogenéticas, sexuais e espaço-temporais. Modelos aditivos generalizados para localização, escala e forma (Generalized Additive Models for Location, Scale, and Shape - GAMLSS) foram utilizados com intuito de identificar padrões populacionais, espaciais e temporais baseados em desembarques da pesca de pequena escala em torno da Ilha de São Sebastiao. Em nível individual, o estudo abordou padrões comportamentais em 2 diferentes períodos do ciclo de vida: (1) fase de reprodução, onde padrões corporais foram descritos, tendo como resultado um abrangente etograma (2) fase paralarval, onde o desenvolvimento de comportamento natatório e predatório foram detalhados. O tamanho de primeira maturação foi estimado entre 151 e 175 mm de comprimento do manto (ML) para as fêmeas e entre 187 e 190 mm ML para os machos, também foi identificada a co-ocorrência de 2 grupos de maturação para os machos. (Capitulo 1). Um pico significativo com relação ao peso das gônadas foi identificado entre os meses de Fevereiro e Março para as fêmeas e em Março para os machos, especialmente nas áreas Sul e Sudeste da ilha. Uma análise dos comportamentos reprodutivos e dos padrões corporais, resultando em um amplo etograma, revelou 19 componentes cromáticos, 5 locomotores e 12 posturais, como também, sequências comportamentais para a espécie, incluindo comportamentos agonístico, de corte e acasalamento (Capitulo 2). Componentes cromáticos claros (manchas claras e irridóforos) apresentaram maior duração do que os componentes cromáticos escuros, particularmente aqueles relacionados ao comportamento calmo, mais frequente nas fêmeas. Machos aparentemente foram mais propensos a disputas por recursos usando sinalizações visuais rápidas e variadas. Em relação aos hábitos alimentares (Capítulo 3), a composição de presas diferiu entre sexos, tamanhos, maturidade e padrões espaço-temporais. As fêmeas não deixaram de se alimentar durante a maturação e foi observada uma relação positiva entre a quantidade de alimentos e o tamanho dos indivíduos. Pequenos cefalópodes, assim como peixes e crustáceos foram às presas mais significativas entre as fêmeas maduras, enquanto que para os machos foram os poliquetas. Através de observações e filmagens de paralarvas de D. plei (Capitulo 4), identificou-se um comportamento predatório complexo sobre presas vivas, com diferentes tipos de caça que diferem em velocidade e posição. Comportamentos agressivos entre indivíduos da mesma espécie (estratégias de ataque e fuga) foram identificados quando na ausência de presas. Estes achados contribuem para melhor compreender a biologia populacional, comportamento da espécie, e também na futura definição e orientação nos planos do manejo pesqueiro.

Orientadores: Pedro Eduardo de Felicio, Jana Pickova / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-04T20:04:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LapaGuimaraes_Judite_D.pdf: 14813702 bytes, checksum: ceaf92aa9f32ece3f3b4c5ef620aa4ee (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: Em função da alta perecibilidade do pescado, a avaliação do frescor e qualidade deste alimento deve ser precisa e baseada em métodos consolidados. Bases nitrogenadas voláteis (BNV), trimetilamina (TMA), aminas biogênicas, nucleotídeos, uréia e triptofano livre têm sido propostos como índices de frescor para pescado e podem ser efetivos ou não dependendo da espécie de pescado, microbiota contaminante e condições de armazenamento. A quantificação dos teores de aminas biogênicas é também importante devido ao seu potencial tóxico. Os objetivos deste estudo foram avaliar a utilidade das aminas biogênicas, BNV, TMA, triptofano livre e uréia como índices de qualidade e frescor em peixes e moluscos cefalópodes, desenvolver e avaliar sistemas de solventes para separação de aminas biogênicas por cromatografia de camada delgada e avaliar o efeito do tempo e temperatura de derivatização sobre a conversão das aminas biogênicas em seus derivados dansilados. Derivados dansilados de agmatina (AGM), putrescina (PUT), triptamina (TRY), cadaverina (CAD), histamina (HIS), espermidina (SPD), espermina (SPM), tiramina (TYR) e feniletilamina (PHE) foram separados utilizando-se o sistema de solventes clorofórmio: éter dietílico: trietilamina (6:4:1 - v/v) seguido de clorofórmio: trietilamina (6:1 ¿ v/v). A melhor condição para derivatização das aminas biogênicas com cloreto de dansila foi 1h a 40oC. AGM permaneceu no local de aplicação (RF=0,0), o que indica que a metodologia deve ser utilizada com cautela para a determinação desta amina. As percentagens de recuperação de TRY, SPM, SPD e TYR foram baixas, indicando que a metodologia para extração destas aminas deve ser aperfeiçoada. BNV e TMA foram consideradas índices de frescor inadequados para bacalhau (Gadus morhua) e hadoque (Melanogrammus aeglefinus). O padrão de produção mais acentuado a partir da segunda semana de armazenamento, caracterizou as aminas voláteis e as aminas biogênicas CAD e PUT como índices de deterioração para bacalhau e hadoque. Uréia se mostrou inadequada como índice de qualidade para as duas espécies de pescado estudadas. Modelos de regressão linear e quadrática indicaram um aumento progressivo dos teores de AGM em lula (Illex coindetii), de uréia em sépia (Sepia officinalis), e de BNV e triptofano livre nas duas espécies de cefalópodes desde o início do armazenamento. BNV e triptofano livre foram considerados bons índices de frescor para I. coindetii e S. officinalis, pois seus teores aumentaram significativamente (p<0,05) desde o início do armazenamento. AGM e uréia foram consideradas índices de deterioração para I. coindetii e S. officinalis, respectivamente. Os teores de TMA (% NNP) aumentaram significativamente (p<0,05) durante a primeira semana de armazenamento em I. coindetii o que sugere sua utilidade como índice de frescor para lula. Para S. officinalis TMA é mais adequada como índice de deterioração / Abstract: Fish and shellfish muscle is highly susceptible to spoilage during storage. Because quality quickly decreases during storage reliable chemical indices for quality and freshness evaluation are greatly needed. Total volatile bases-nitrogen (TVB-N), trimethylamine (TMA), biogenic amines, nucleotides, urea and free tryptophan have been suggested as freshness indices for fish and shellfish. Such indices are useful depending on the species, microbial flora and storage conditions. Biogenic amines levels are also cause of concernment due to their toxicological effects. The objectives of this study were to evaluate the usefulness of biogenic amines, TVB-N, TMA, free tryptophan and urea as freshness and quality indices for fish and cephalopods; to develop and evaluate solvent systems for biogenic amines separation by thin-layer chromatography; and to evaluate the effects of time and temperature of derivatisation on the conversion of biogenic amines to their dansyl derivatives. Dansyl derivatives of agmatine (AGM), putrescine (PUT), tryptamine (TRY), cadaverine (CAD), histamine (HIS), spermidine (SPD), spermine (SPM), tiramine (TYR) and phenylethylamine (PHE) were separated using the solvent system chloroform: diethyl ether: triethylamine (6:4:1 ¿ v/v), followed by chloroform: triethylamine (6:1 ¿ v/v). The best dansylation condition was 1h at 40oC. AGM remained at the start position, indicating the determination of AGM by this method should be considered with caution. The percentages of recovery of TRY, SPM, SPD and TYR were low, indicating that the extraction methodology must be improved. TVB-N and TMA were considered inappropriate as freshness indices for cod (Gadus morhua) and haddock (Melanogrammus aeglefinus). CAD and PUT showed the greatest increases during the storage, but their levels did not increase significantly (p<0.05) during the first week. Volatile amines and biogenic amines were characterized as spoilage indices for G. morhua and M. aeglefinus due to the intense increasing of their amounts from the second week of storage. Urea was not useful as a quality index for cod and haddock. Linear and quadratic models indicated progressive increasing of AGM levels in squid (Illex coindetii), urea in cuttlefish (Sepia officinalis) and also increasing of TVB-N and free tryptophan in both cephalopods, since the beginning of the storage. TVB-N and free tryptophan were considered good freshness indices for both cephalopod species, because their levels significantly increased (p<0.05) during the first week of storage. AGM and urea were useful as spoilage indices for I. coindetii and S. officinalis, respectively. It was observed a significant increase of TMA (% of NNP) during the first week of storage in I. coindetii indicating the TMA usefulness as freshness index for squid. For S. officinalis TMA was a good spoilage index / Doutorado / Doutor em Tecnologia de Alimentos