Thesis (M.S.)--Oregon State University, 2010. / Printout. Includes bibliographical references (leaves 90-108). Also available on the World Wide Web.

Thesis (Ph. D.)--University of Washington, 1999. / Vita. Includes bibliographical references (p. 144-156).

A phylogenetic study of eleven cetaceans was undertaken using Restriction Endonuclease Maps (RSM) of mitochondrial DNA (mtDNA). One species from the suborder mysticeti (baleen whales) was sampled, and of the ten odontocetes (toothed whales) sampled two were from the family Ziphiidae (beaked whales) and eight were from the family Delphinidae (dolphins) (each representing a different genus). The primarily opportunistically obtained (i.e. from strandings or accidental death in commercial trawl nets) heart tissue generally yielded high quantities of mtDNA which is needed for double digest fragment analysis. The mtDNA extracted from the sampled taxa was cleaved with fifteen different six-base Restriction Enzymes (RE's). Using the three-way method of analysis and aided by the computer program Resolve (Ver. 2.7) (Harley, unpublished), RSM's were constructed. Distance (Neighbor-Joining and Fitsch-Margoliash) and cladistic (Maximum Parsimony and Bootstrap) methods were used to infer phylogenies. The baleen whale was used as an outgroup for the cladistic analysis. Both the distance and both the cladistic methods produced the same single topology, which is concordant with morphologically based classifications. The two differences (within the Delphinidae), viz. Grampus' most basally rooted position and Cephalorhynchus' grouping with the Delphininae are of taxa whose groupings are unresolved in the morphologically based classifications. Using Brown et al's (1979) molecular clock, very recent divergence times at the generic, family and suborder levels were obtained, when compared to fossil based estimates. Using the odontoceti/mysticeti split the base substitution rate of cetacean mtDNA was estimated to be much slower than that of terrestrial mammals (0,3% compared to 1,0% Myr⁻¹). A similarly slow rate was calculated for cetacean nuclear DNA (nDNA) (0,09% Myr⁻¹) (Schlotterer et al, 1991). It remains an unresolved issue as to whether the base substitution rate of cetacean DNA is slower than terrestrial mammals or whether the fossil evidence needs to be reinterpreted. The time of the mysticeti/odontoceti split is palaeontologically uncertain and the suggested monophyletic status of the extant suborders has been questioned, thus making the calculation of cetacean base substitution rate risky. Equally, the incomplete fossil record can lend itself to misinterpretation.

It was hypothesized that there may be microanatomic specializations in the urogenital slit and mammary region of cetaceans. There may be an integumentary-linked mechanism in these animals similar to that which causes the milk let-down response in terrestrial mammals. This hypothesis was tested on tissue samples from fourteen animals collected in a standardized array of fourteen samples from the urogenital area, and one each from the ventral aspect of the flipper and the mid-dorsal body wall for comparison. Using standard histological and ultrastructural procedures, including both transmission and scanning electron microscopy, tissues from nine species were investigated. These included the bottlenose dolphin (Tursiops truncatus), striped dolphin (Stenella coeruleoalba), harbor porpoise (Phocoena phocoena), pygmy sperm whale (Kogia breviceps), short and long finned pilot whales (Globicephala macrorhynchus and malaena respectively), beluga whale (Delphinapterus leucas), humpback whale (Megaptera novaeangliae), and fin whale (Balaenoptera physalus). Measurements were taken of the height of the epidermis, the thickness of the epidermal stratum externum, and the height and number of dermal papillae. Co1lagen bundles of the reticular dermis were measured and ranked by diameter. Nervous structures were quantitatively evaluated by type and location. No differences were found in the epithelial, connective, or nervous tissue of the skin in this region that would imply an increased sensitivity in this area. However, an observed unique organization of the connective tissue may imply a functional difference in the skin of the urogenital region unrelated to the milk let-down phenomenon. Possible alternative mechanisms for the initiation of milk let-down in cetaceans are discussed, including myoepithelial cell contraction caused by urogenital bumping by calves, vocalization by calvest and tacto/acoustic stimulation of the urogenital area by the calf. Epidermal thickness and papillary height varied among animals of different cetacean species, although there seemed to be a structural 'formula' applicable to the skin of all cetaceans that would permit efficient turnover of the epidermis. The significance of integumentary lipids is discussed. Deviations in cellular and subcellular structures of cetacean skin from those described in previous reports are mentioned, and a previously undescribed location for nerves in dermal papillae was revealed. / Master of Science

Submitted by JOSIANE SANTOS DE OLIVEIRA (josianeso) on 2017-12-06T13:59:20Z No. of bitstreams: 1 Tainã Coelho Quevedo_.pdf: 1779262 bytes, checksum: 1c805c11de74d708f12d1e1a98e63886 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-06T13:59:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tainã Coelho Quevedo_.pdf: 1779262 bytes, checksum: 1c805c11de74d708f12d1e1a98e63886 (MD5) Previous issue date: 2017-08-21 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / PROSUP - Programa de Suporte à Pós-Gradução de Instituições de Ensino Particulares / Os cachalotes, Physeter macrocephalus Linnaeus, 1758, são amplamente distribuídos por todos os oceanos do mundo. Todavia, os machos e fêmeas têm diferenças marcadas em seu padrão de distribuição. Globalmente, estudos genéticos, ecológicos e de comportamento vocal comparando populações sugerem a existência de uma forte estrutura social matrilinear com alta filopatria das fêmeas nas regiões tropicais, sendo o fluxo gênico mediado pelos machos. As populações do oceano Atlântico Sul Ocidental (ASO) ainda são tidas como as menos pesquisadas e conhecidas. A fim de identificar possíveis unidades de manejo da espécie na região, o presente estudo apresentou a primeira análise da diversidade genética e a avaliação da potencial estruturação das populações de cachalotes ao longo do ASO, utilizando sequências da região controladora do DNA mitocondrial (DNAmt) de 565 pb obtidas de amostras coletadas na região. Além disso, objetivou-se também estabelecer as relações filogeográficas entre estas populações do ASO e as do resto do mundo. Para a realização deste estudo foram analisadas 58 amostras de cachalotes de três áreas geográficas na costa brasileira (nordeste =15, sudeste =3, sul = 36) e uma da costa argentina (n = 4), e comparadas com 1.577 sequências de outros oceanos, disponíveis publicamente no GenBank (Atlântico = 362, Índico = 159 e Pacífico = 1.056). Além disso, o sexo de 39 espécimes foi determinado molecularmente, a fim de se testar a existência de mais de uma população de cachalotes no ASO, a partir da detecção de fêmeas em áreas além do nordeste brasileiro. A análise das sequências do DNAmt revelou a existência de quatro grupos genéticos e sete haplótipos no ASO. As diversidades haplotípica (Hd) e nucleotídica (π) observadas para a espécie como um todo no ASO foram Hd = 0,6824 e π = 0,002296, respectivamente. Os testes de neutralidade seletiva não sugeriram mudanças significativas no tamanho efetivo e nem expansão populacional recente da espécie no ASO. Os resultados das análises de variância molecular (AMOVA) revelaram que entre 9,14% (ΦST) e 12,31% (FST) da variação genética observada deve-se a diferenças entre as populações. Contudo, essa diferenciação geográfica só foi significativa entre as populações do nordeste e sudeste-sul do Brasil, as quais possuíam altos índices de fixação entre si (nordeste e sudeste-sul do Brasil: FST = 0,1089; ΦST = 0,1378; nordeste do Brasil e Argentina: FST = -0,1076; ΦST = -0,0512; sudeste-sul do Brasil e Argentina: FST = 0,0742; ΦST = 0,1206; P<0,00001). A população do nordeste do Brasil apresentou a diversidade genética mais baixa do estudo (Hd = 0,5128 e π = 0,001796), quando comparada com as populações do sudeste-sul (Hd = 0,6659 e π = 0,002482), e Argentina (Hd = 0,8333 e π = 0,002043). A costa sudeste-sul do Brasil apresentou três haplótipos exclusivos num total de sete, enquanto a costa da Argentina apresentou um haplótipo particular. Apenas a região sudeste-sul apresentou um grupo genético exclusivo, sugerindo que a distribuição da variação genética é melhor compreendida com a existência de três grupos ao longo do ASO (nordeste, sudeste-sul e Argentina), os quais seriam considerados diferentes unidades de manejo. Em relação a comparação mundial entres as populações de cachalotes, foram recuperados 39 haplótipos e quatro grupos genéticos, sendo que apenas o oceano Pacífico apresentou um grupo genético exclusivo. A AMOVA revelou que entre 8,89% (FST) e 16,39% (ΦST) da variação genética observada deve-se a diferenças entre as populações do mundo. A AMOVA indicou que há diferenciação geográfica entre o ASO e os demais oceanos, os quais possuíam altos índices de fixação entre si (ASO e Atlântico Norte: FST = 0,1837; ΦST = 0,3142; Atlântico Sul Ocidental e Índico: FST = 0,0898; ΦST = 0,1661; Atlântico Sul Ocidental e Pacífico: FST = 0,1140; ΦST = 0,0757; P<0,00001). A amostra unificada do oceano ASO não apresentou haplótipos exclusivos. Entretanto, os indivíduos da região sudeste-sul do Brasil compartilharam seis dos seus sete haplótipos com a população do oceano Pacífico. Dos 39 cachalotes com sexo determinado molecularmente nove eram machos e 30 fêmeas, tendo sido encontradas 18 fêmeas na região sul, fora da região tropical, sugerindo que há pelo menos mais de uma população reprodutiva no ASO. Estes resultados, aliados as diferenças de variabilidade genética e ao pouco compartilhamento de haplótipos entre as populações estudadas, sugere que os cachalotes do sudeste-sul do Brasil seriam uma unidade de manejo, potencialmente isolada em termos reprodutivos das demais. Contudo, o DNAmt é um marcador matrilinear e apresenta exclusivamente a história evolutiva das fêmeas. Desta forma, a continuidade destes estudos, incluindo novas amostras e marcadores nucleares, será fundamental para a identificação de reais unidades de manejo da espécie no ASO e principalmente em águas brasileiras. / Sperm whales, Physeter macrocephalus Linnaeus, 1758, are widely distributed throughout the world's oceans. However, males and females have marked differences in their distribution pattern. Worldwide studies on genetics, ecology and vocal behavior comparing populations suggested the existence of a strong matrilineal social structure with female high philopatry in tropical regions, and gene flow mediated by males. The populations of the southwestern Atlantic Ocean (SWA) are still considered the least known and studied. In order to identify possible management units of the species in the SWA, the present study presented the first analysis of the genetic diversity and the evaluation of the potential structuring of the sperm whale populations along the SWA, using sequences from the mitochondrial DNA control region (mtDNA) of 565 bp obtained from samples collected in the region. In addition, it was also aimed to establish the phylogeographic relationships among these SWA populations and those of the rest of the world. Fifty-eight sperm whales from three geographic areas on the Brazilian coast (northeast = 15, southeast = 3, south = 36) and one from the coast of Argentina (n = 4) were analyzed and compared with 1577 sequences from other oceans and available in GenBank (Atlantic = 362, Indian = 159 and Pacific = 1056). In addition, the sex of 39 specimens was molecularly determined in order find females outside of the northeastern coast of Brazil, which would confirm the existence of more than one sperm whale population in the SWA. The analysis of mtDNA sequences revealed the existence of four genetic groups and seven haplotypes in SWA. The haplotype (Hd) and nucleotide (π) diversities observed for the species as a whole in SWA were Hd = 0.6824 e π = 0.002296, respectively. The selective neutrality tests did not suggest significant changes in the effective population size or recent population expansion for the species in SWA. The results of the molecular analysis of variance (AMOVA) revealed that between 9.14% (ΦST) and 12.31% (FST) of the genetic diversity variation observed are due to differences between populations. However, this geographical differentiation was only significant between the populations of northeast and southeast-south Brazil, which had the highest fixation index between them (northeast and southeast-south Brazil: FST = 0.1089, ΦST = 0.1378; northeast Brazil and Argentina: FST = - 0.1076; ΦST = - 0.0512; southeast-south of Brazil and Argentina: FST=0.0742; ΦST=0.1206; P<0.00001). The population of northeastern Brazil had the lowest genetic diversity of the study (Hd = 0.5128 and π = 0.001796), when compared to the southeast-south populations (Hd = 0.6659 and π = 0.002482), and Argentina (Hd = 0.8333 and π = 0.002043). The southeast-south coast of Brazil presented three exclusive haplotypes in a total of seven, while the coast of Argentina presented a particular haplotype. Only the samples from the southeast-south region of Brazil presented an exclusive genetic group, suggesting that the distribution of the genetic variation is better understand with the existence of three groups of sperm whales along the SWA (northeast of Brazil, southeast-south of Brazil and Argentina), which could be considered as different management units. Regarding the worldwide genetic structure of sperm whales, 39 haplotypes and four genetic groups were recovered, and only the Pacific Ocean presented an exclusive genetic group. AMOVA revealed that between 8.89% (FST) and 16.39% (ΦST) of the observed genetic variation was due to differences among the populations of the world. AMOVA indicated that there is a geographical differentiation between the SWA and the other oceans, which had high indexes of fixation between them (SWA and North Atlantic: FST = 0.1837, ΦST = 0.3142, SWA and Indian Ocean: FST = 0.0898; ΦST = 0.1661; SWA and Pacific: FST = 0.11140; ΦST = 0.0757; P<0.00001). The unified sample of the SWA did not present exclusive haplotypes. However, individuals from the southeast-south of Brazil only shared six of seven haplotypes with the population of the Pacific Ocean. From 39 sperm whales with sex molecularly determined, nine were males and 30 females, 18 females were found in the southern region, outside the tropical region, suggesting that there are at least more than one reproductive population in WSA. These results, together with the differences in genetic variability and the lack of sharing of haplotypes among the studied populations, suggest that sperm whales from southeast-south of Brazil would be a management unit, potentially isolated, in reproductive terms, from the others. However, mtDNA is a matrilineal marker and exclusively presents the evolutionary history of females. In this context, the continuity of these studies, including new samples and nuclear markers, will be fundamental for the identification of real units of management of the species in the SWA and particularly in Brazilian waters.

Para se compreender o papel ecológico dos cetáceos são necessários maiores conhecimentos sobre suas ocorrências e distribuições. A distribuição potencial das espécies pode ser determinada a partir das áreas geográficas de ocorrência dos seus nichos. Estes podem ser definidos com o uso de variáveis ambientais, o que se demonstra uma vantagem por serem estáticas e não serem dinamicamente afetadas pelas atividades biológicas. O presente estudo tem como objetivo determinar a ocorrência e distribuição dos cetáceos ao largo da costa sudeste do Brasil com base em dados de avistagens, bem como delimitar os nichos fundamentais e a sobreposição das áreas de distribuição potencial das espécies avaliadas. Os dados de avistagem foram obtidos por meio de cruzeiros oceanográficos realizados entre 2012 e 2015. Os modelos ecológicos de nicho foram elaborados com o uso das variáveis ambientais disponibilizadas pelo MARSPEC e com o uso do software NicheA. Foram avistadas doze espécies com a realização dos cruzeiros, sendo as seis mais frequentes utilizadas para a determinação das áreas de distribuição potencial. Apesar de apresentarem diferenças quanto às preferências ambientais, a maioria das espécies de cetáceos amostrada apresentou sobreposição parcial de nicho e da área de distribuição potencial. / It is deemed important to understand cetacean occurrence and distribution to comprehend their ecological roles. The geographical occurrence of species\' niche can be used to evaluate their potential distribution. The niche can be defined using environmental variables. Those variables are considered static and are not affected by biological activities. The present study goal is to access the occurrence and distribution of cetaceans along the southeastern Brazilian coast, as well as to define the fundamental niche of the species and the overlap between their potential distribution areas. Sighting data were obtained through oceanographic surveys conducted between 2012 and 2015. The environmental variables available on MARSPEC and the software NicheA were used for the ecological niche modeling. A total of twelve cetacean species were identified during the cruises. The potential distribution areas of the six commonest species were defined. Even though the species presented different environmental preferences, most of them had partial overlap between niches and potential distribution areas.

O presente estudo foi baseado na ocorrência, análises morfométricas, craniométricas e conteúdo estomacal de cetáceos odontocetes encontrados mortos em praias do sul do Estado de São Paulo (Ilha Comprida e Marujá) e norte do Estado do Paraná (Deserta), no período de abril de 1986 à abril de 1988. Para a espécie mais abundante estimou-se também a idade dos indivíduos pelo número de anéis na camada de dentina. Encontrou-se 100 animais compreendidos em 7 gêneros e 7 espécies pertencentes a 3 famílias. Para a região são caracterizadas pela primeira vez, Delphinus delphis (n=13), Stenella frontalis (n=3) , Kogia breviceps (n=1) e Globicephala macrorhynchus (n=1). Destas, para o litoral e São Paulo são novas S. frontalis e G. macrorhynchus, sendo esta última também descrita pela primeira vez para águas ocidentais do Atlântico Sul. Para o litoral do Estado do Paraná são todas ocorrências novas, com exceção de Sotalia fluviatilis. Esta última foi a espécie mais abundante (n=58) , seguida por Pontoporia blainvillei (n=21). Também foi encontrada a espécie Tursiops gephyreus (n=2) além de 1 delfinídeo não identificado. A ocorrência total dessas espécies seguiu um padrão pouco definido ao longo do ano, ocorrendo em maior número nos meses de inverno e verão. Para a espécie mais abundante, S. fluviatilis alguns dos parâmetros de crescimento foram estimados baseando-se em equações que descrevem relações interespecíficas desses parâmetros. Animais com 6 ou mais anéis foram classificados como maduros fisicamente. Construiu-se uma curva de crescimento a mão livre para a espécie, baseando-se em alguns dos dados fornecidos pelas equações e dados obtidos dos próprios exemplares como número de anéis dos dentes e comprimentos dos corpos; o método de von Bertalanffy para ajuste da curva de crescimento não mostrou-se satisfatório para todas as fases do crescimento da espécie. Ainda para essa espécie analisou-se 5 componentes funcionais do crânio dos exemplares encontrados, obtendo-se 6 anéis para a estabilização do crescimento desses componentes, com excessão do aparato alimentar que atingiu o patamar com 8 anéis. A análise da dieta alimentar dessa espécie mostrou a ocorrência de espécies de peixes demersais pelágicas de superfície comuns na região costeira, sendo a família Sciaenidae a mais abundante. Bicos de lulas pertencentes a 2 ou 3 espécies também foram encontrados em 100% dos estômagos analisados. Encontrou-se em um Estômago camarões pertencentes à espécie Penaeus brasiliensis. Parasitas estomacais pertencentes à família Anisakidae foram encontrados em 28,6% dos estômagos, além de mesma frequência para isópodos parasitas de brânquias de peixes. A maioria dos animais encontrados. Possivelmente foram mortos em redes de pesca na região costeira adjacente às praias estudadas. / The occurrence, morphometric and craniometric data and stomach contents of odontoceti cetaceans found in the south coast of São Paulo State and north coast of Paraná State (Ilha Comprida, Marujá and Deserta beaches) from April, 1986 to April, 1988 were analysed in this study. For the most abundant species we estimated the individual age by reading growth layers in the dentine. We found 100 animaIs belonging to 7 genera, 7 species and 3 famiIies. The first records for this region were: Delphinus delphis (n=13), Stenella frontalis (n=3). Kogia breviceps (n=1), and Globicephala macrorhynchus (n=1). The first ones for the coast of São Paulo State were: S. frontalis and G. macrorhynchus. This Iast species was also first described for the southwestern Atlantic. AlI of the species were new records for the coasts of Paraná State except S. fluviatilis. This Iast one was the most abundant species (n=58), followed by Pontoporia blainvillei (n=21). We also encountered Tursiops gephyreus (n=2) and an unidentified delfinid. There was little seasonal pattern in the total occurrence of the animals with a small increase in their abundance during the winter and summer seasons. For the most abundant species, Sotalis fluviatilis, we estimated some growth parameters using published equations which describe the interspecific relationships of these parameters. Physical maturity was considered in animals with for more dental layers. A growth curve was drawn by eye, using data obtained the from some of the above equations and data obtained from individuaIs analysed in this study, such as dental layers and total length; a growth curve by von Bertalanffy\'s method did not fit well. The species plateau development of 5 skull functional components for this showed 6 dental layers for the attainment of adult plateau except for the feeding apparatus which stops growing at 8 dental layers. The diet of S. fluviatilis consisted mainly of demersal and superficial pelagic common fishes found in the Brazilian southeastern coast. The Sciaenidae family was the most abundant. Beaks of squids belonging to 2 or 3 especies were found in all stomach contents analysed; we also encountered shrimps in one stomach content. Stomach parasites belonging to the Anisakidae family were found in 28,6% of the stomachs with the same frequency of fish gill parasite isopods. Most of the cetaceans were probably captured accidentally with gillnets in adjacent waters of the studied beaches.

O presente estudo foi baseado na ocorrência, análises morfométricas, craniométricas e conteúdo estomacal de cetáceos odontocetes encontrados mortos em praias do sul do Estado de São Paulo (Ilha Comprida e Marujá) e norte do Estado do Paraná (Deserta), no período de abril de 1986 à abril de 1988. Para a espécie mais abundante estimou-se também a idade dos indivíduos pelo número de anéis na camada de dentina. Encontrou-se 100 animais compreendidos em 7 gêneros e 7 espécies pertencentes a 3 famílias. Para a região são caracterizadas pela primeira vez, Delphinus delphis (n=13), Stenella frontalis (n=3) , Kogia breviceps (n=1) e Globicephala macrorhynchus (n=1). Destas, para o litoral e São Paulo são novas S. frontalis e G. macrorhynchus, sendo esta última também descrita pela primeira vez para águas ocidentais do Atlântico Sul. Para o litoral do Estado do Paraná são todas ocorrências novas, com exceção de Sotalia fluviatilis. Esta última foi a espécie mais abundante (n=58) , seguida por Pontoporia blainvillei (n=21). Também foi encontrada a espécie Tursiops gephyreus (n=2) além de 1 delfinídeo não identificado. A ocorrência total dessas espécies seguiu um padrão pouco definido ao longo do ano, ocorrendo em maior número nos meses de inverno e verão. Para a espécie mais abundante, S. fluviatilis alguns dos parâmetros de crescimento foram estimados baseando-se em equações que descrevem relações interespecíficas desses parâmetros. Animais com 6 ou mais anéis foram classificados como maduros fisicamente. Construiu-se uma curva de crescimento a mão livre para a espécie, baseando-se em alguns dos dados fornecidos pelas equações e dados obtidos dos próprios exemplares como número de anéis dos dentes e comprimentos dos corpos; o método de von Bertalanffy para ajuste da curva de crescimento não mostrou-se satisfatório para todas as fases do crescimento da espécie. Ainda para essa espécie analisou-se 5 componentes funcionais do crânio dos exemplares encontrados, obtendo-se 6 anéis para a estabilização do crescimento desses componentes, com excessão do aparato alimentar que atingiu o patamar com 8 anéis. A análise da dieta alimentar dessa espécie mostrou a ocorrência de espécies de peixes demersais pelágicas de superfície comuns na região costeira, sendo a família Sciaenidae a mais abundante. Bicos de lulas pertencentes a 2 ou 3 espécies também foram encontrados em 100% dos estômagos analisados. Encontrou-se em um Estômago camarões pertencentes à espécie Penaeus brasiliensis. Parasitas estomacais pertencentes à família Anisakidae foram encontrados em 28,6% dos estômagos, além de mesma frequência para isópodos parasitas de brânquias de peixes. A maioria dos animais encontrados. Possivelmente foram mortos em redes de pesca na região costeira adjacente às praias estudadas. / The occurrence, morphometric and craniometric data and stomach contents of odontoceti cetaceans found in the south coast of São Paulo State and north coast of Paraná State (Ilha Comprida, Marujá and Deserta beaches) from April, 1986 to April, 1988 were analysed in this study. For the most abundant species we estimated the individual age by reading growth layers in the dentine. We found 100 animaIs belonging to 7 genera, 7 species and 3 famiIies. The first records for this region were: Delphinus delphis (n=13), Stenella frontalis (n=3). Kogia breviceps (n=1), and Globicephala macrorhynchus (n=1). The first ones for the coast of São Paulo State were: S. frontalis and G. macrorhynchus. This Iast species was also first described for the southwestern Atlantic. AlI of the species were new records for the coasts of Paraná State except S. fluviatilis. This Iast one was the most abundant species (n=58), followed by Pontoporia blainvillei (n=21). We also encountered Tursiops gephyreus (n=2) and an unidentified delfinid. There was little seasonal pattern in the total occurrence of the animals with a small increase in their abundance during the winter and summer seasons. For the most abundant species, Sotalis fluviatilis, we estimated some growth parameters using published equations which describe the interspecific relationships of these parameters. Physical maturity was considered in animals with for more dental layers. A growth curve was drawn by eye, using data obtained the from some of the above equations and data obtained from individuaIs analysed in this study, such as dental layers and total length; a growth curve by von Bertalanffy\'s method did not fit well. The species plateau development of 5 skull functional components for this showed 6 dental layers for the attainment of adult plateau except for the feeding apparatus which stops growing at 8 dental layers. The diet of S. fluviatilis consisted mainly of demersal and superficial pelagic common fishes found in the Brazilian southeastern coast. The Sciaenidae family was the most abundant. Beaks of squids belonging to 2 or 3 especies were found in all stomach contents analysed; we also encountered shrimps in one stomach content. Stomach parasites belonging to the Anisakidae family were found in 28,6% of the stomachs with the same frequency of fish gill parasite isopods. Most of the cetaceans were probably captured accidentally with gillnets in adjacent waters of the studied beaches.

Para se compreender o papel ecológico dos cetáceos são necessários maiores conhecimentos sobre suas ocorrências e distribuições. A distribuição potencial das espécies pode ser determinada a partir das áreas geográficas de ocorrência dos seus nichos. Estes podem ser definidos com o uso de variáveis ambientais, o que se demonstra uma vantagem por serem estáticas e não serem dinamicamente afetadas pelas atividades biológicas. O presente estudo tem como objetivo determinar a ocorrência e distribuição dos cetáceos ao largo da costa sudeste do Brasil com base em dados de avistagens, bem como delimitar os nichos fundamentais e a sobreposição das áreas de distribuição potencial das espécies avaliadas. Os dados de avistagem foram obtidos por meio de cruzeiros oceanográficos realizados entre 2012 e 2015. Os modelos ecológicos de nicho foram elaborados com o uso das variáveis ambientais disponibilizadas pelo MARSPEC e com o uso do software NicheA. Foram avistadas doze espécies com a realização dos cruzeiros, sendo as seis mais frequentes utilizadas para a determinação das áreas de distribuição potencial. Apesar de apresentarem diferenças quanto às preferências ambientais, a maioria das espécies de cetáceos amostrada apresentou sobreposição parcial de nicho e da área de distribuição potencial. / It is deemed important to understand cetacean occurrence and distribution to comprehend their ecological roles. The geographical occurrence of species\' niche can be used to evaluate their potential distribution. The niche can be defined using environmental variables. Those variables are considered static and are not affected by biological activities. The present study goal is to access the occurrence and distribution of cetaceans along the southeastern Brazilian coast, as well as to define the fundamental niche of the species and the overlap between their potential distribution areas. Sighting data were obtained through oceanographic surveys conducted between 2012 and 2015. The environmental variables available on MARSPEC and the software NicheA were used for the ecological niche modeling. A total of twelve cetacean species were identified during the cruises. The potential distribution areas of the six commonest species were defined. Even though the species presented different environmental preferences, most of them had partial overlap between niches and potential distribution areas.

Cetacean species face serious challenges worldwide due to the increasing noise pollution brought to their environment by human activities such as seismic exploration. Regulation of these activities is vaguely defined and uncoordinated. Visual observations and passive listening devices, aimed at preventing conflicts between human wealth and cetaceans’ health have some fundamental limitations and may consequently fail their mitigation purposes. Active sonar technology could be the optimal solution to implement mitigation of such human activities. In my thesis, the proper sonar unit was used to test the feasibility to detect cetaceans in situ. Omnidirectional sonars could be the optimal solution to monitor the presence of cetaceans in the proximity of potential danger areas. To use this class of sonar in a quantitative manner, the first step was to develop a calibration method. This thesis links in situ measurements of target strength (TS) with variation trends linked to the behavior, morphology and physiology of cetacean. The butterfly effect of a cetacean’s body was described for a fin whale insonified from different angles. A relationship between whale respiration and TS energy peaks was tested through a simple prediction model which seems very promising for further implementation. The effect of lung compression on cetacean TS due to increasing depth was tested through a basic mathematical model. The model fit the in situ TS measurements. TS measurements at depth of a humpback whale, when post-processed, correspond to TS measurements recorded at the surface. Sonar technology is clearly capable of detecting whale foot prints around an operating vessel. Sonar frequency response shows that frequencies between 18 and 38 kHz should be employed. This work has established a baseline and raised new questions so that active sonar can be developed and employed in the best interest for the whales involved in potentially harmful conflicts with man.