Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2015-12-23T15:12:46Z No. of bitstreams: 2 Dissertação_Louzamira Feitosa Biváqua de Araújo.pdf: 26787136 bytes, checksum: 30d6cbaa7d973ec3723520d2839df5ac (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-23T15:12:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação_Louzamira Feitosa Biváqua de Araújo.pdf: 26787136 bytes, checksum: 30d6cbaa7d973ec3723520d2839df5ac (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-07-22 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The tucuxi (Sotalia fluviatilis) is the only species of the Delphinidae family to live exclusively in freshwater environments and is widely distributed throughout the Amazon basin. Delphinidae use sound signals as their main resource in social interactions. Identifying how tucuxi use these communication signals in different environments and different regions throughout their distribution, helps us understand the patterns in habitat use of the species, as well as variation levels of their population. The main goal of this study is to examine the variations of physical parameters in S. fluviatilis whistling behavior in different types of water and in different regions of their distribution. Variations between water types were tested using recordings conducted at two river junctions: black and white water rivers in Manaus – Amazonas and clear and white water rivers in Santarém – Pará. To verify population variation, recordings were conducted at four geographically distant regions (Beruri, Manacapuru and Manaus – in the state of Amazonas; and Santarém – in the state of Pará). Ten acoustic parameters of the fundamental frequency of whistles were extracted for analysis: initial, final, minimum, maximum, ½, ¼, and ¾ frequencies, delta frequency, signal duration, and number of inflection points. PERMANOVA was used as test and post hoc. The post hoc was performed using exclusion and re-inclusion of acoustic variables. Whistles had significantly higher frequencies in blackwater than in whitewater. Whistles emitted in clearwater were higher pitched than those in whitewater, but depended on specific acoustic parameters to produce significant differences. In the geographic variation analysis, the population of Santarém was significantly different from the other regions. Manaus and Beruri demonstrated significant differences; however, Manaus and Manacapuru, as well as Manacapuru and Beruri, did not demonstrate significant differences. In this study we observed that tucuxi adapt their signals to optimize social communication and avoid sound degradation depending on the environment. The variations between populations can be a result of genetic or environmental factors. / O tucuxi (Sotalia fluviatilis) é a única espécie fluvial da família Delphinidae e está amplamente distribuída na bacia Amazônica. As interações sociais dentro da família Delphinidae tem como base o uso de sinais sonoros. Identificar como os tucuxis utilizam os sinais de comunicação entre os diferentes ambientes e entre diferentes regiões ao longo de sua área de distribuição, possibilita entender os padrões de uso de habitat pela espécie e os níveis de variações de suas populações. Este estudo teve como objetivo verificar as variações nos parâmetros físicos dos assobios de tucuxi em diferentes tipos de água e em diferentes regiões de sua área de distribuição. Para verificar as variações entre tipos de água, as gravações foram realizadas em duas confluências de rios: de água preta com água branca, em Manaus – Amazonas e de água clara com branca, em Santarém – Pará. Para verificação de variação populacional, foram feitas gravações em quatro regiões distantes geograficamente (Beruri, Manacapuru e Manaus – no estado do Amazonas e em Santarém – Pará). Para as análises, foram extraídos dez parâmetros acústicos da frequência fundamental dos assobios: Frequências inicial, final, mínima, máxima, ½, ¼ e ¾, variação da frequência, duração do sinal e número de pontos de inflexão. A PERMANOVA foi utilizada como teste e pós-teste. O pós-teste foi realizado por meio de exclusão e reinclusão de variáveis acústicas. Os assobios tiveram frequências significativamente mais elevadas na água preta que na água branca. Os assobios emitidos na água clara foram mais agudos que os da água branca, mas dependeram de parâmetros acústicos específicos para apresentarem diferenças significativas. Na verificação de variação geográfica, a população de Santarém foi significativamente diferente das outras regiões. Manaus e Beruri apresentaram diferenças significativas, no entanto, Manaus e Manacapuru, assim como, Manacapuru e Beruri, não apresentaram diferenças significativas. Neste trabalho foi observado que os tucuxis ajustam seus sinais para otimizar a comunicação social e evitar degradação da informação dependendo do meio. Já as variações entre as populações podem ser resultado de fatores genéticos ou ambientais.

Memoria para optar al Título Profesional de Médico Veterinario / Los estudios basados en la comparación de la morfología ósea para la determinación taxonómica han sido ampliamente utilizados, tanto para hacer distinciones a nivel de género como de especie (Becker y Cartajena, 2002), pero el uso del hueso periótico como carácter taxonómico de los Odontoceti, no está aún basado en una sistemática estándar, lo que en términos generales se traduce en un análisis taxonómico a veces subjetivo. Debido a esta compleja forma de “escuchar” que adquieren los Cetáceos al ingresar a un nuevo ambiente marino, cambian además de su anatomía, la forma de captación aérea de sonidos, a una audición adaptada a la recepción y transmisión de sonidos bajo el agua. Los huesos timpánico-periótico, se encuentran casi completamente desconectados del cráneo, unidos sólo mediante ligamentos, es esta pérdida de unión lo que lleva a que estos huesos sean encontrados en su mayoría, aislados de su esqueleto original. Este trabajo intentó por un lado, caracterizar morfológicamente al hueso periótico de especies de Odontoceti registradas en Chile y evaluar por otro, nuevas técnicas de identificación taxonómica basados en la descripción morfométrica del hueso periótico, para conseguir métodos más estandarizados de identificación taxonómica. Este estudio se realizó con 9 restos óseos de perióticos no identificados, 7 de estos pertenecientes a la colección del Museo de Historia Natural (M.N.H.N.) de Santiago, (4 fósiles, 3 actuales), además de 2 huesos perióticos encontrados por particulares que correspondían al mismo animal (KEVa, KEVb). Se trabajó en asociación con el Departamento de Paleontología de mamíferos marinos del M.N.H.N. Para esto se actualizó la lista de especies de Cetáceos registrados en Chile, considerando informes de avistamientos, varamientos, registros de restos óseos actuales y fósiles, mediante revisión bibliográfica. Posteriormente, se recopiló la información morfológica y métrica encontrada, de huesos perióticos por género y especie. Basado en el método de comparación morfológica, se identificaron los 9 huesos perióticos en sus respectivos géneros. La identificación a nivel de especie no fue posible debido a la similitud morfológica que presenta el hueso periótico dentro de especies del mismo género. La identificación morfométrica, se basó en el análisis de variables (medidas) aplicando el método de componentes principales (ACP). Los resultados del análisis morfométrico muestran que las variables más determinantes en la distribución y agrupamiento de las muestras fueron: A: Largo estándar del periótico, desde la punta del proceso anterior al posterior y del fin del proceso posterior, medido sobre la línea paralela del borde cerebral, B: Grosor del Proceso Superior, a nivel de la apertura timpánica superior, C: Ancho del periótico a través de la porción coclear y el proceso superior, a nivel de la apertura timpánica superior. Estas variables se utilizaron en un nuevo análisis ACP y con estos resultados se realizó un dendrograma. Mediante el método de remuestreo con reemplazo (Bootstrap), se determinó la significancia estadística. De un total de 46 muestras, 16 muestras fueron asociadas correctamente (34.78%), dentro de las cuales sólo una de las muestras desconocidas fue correctamente agrupada con significancia estadística (P < 0.05). Esto muestra una incongruencia en los resultados para la identificación de muestras mediante estos dos métodos, concluyendo, que la morfometría del hueso periótico no entrega datos fiables para una identificación taxonómica.

Os golfinhos-comuns do gênero Delphinus Linnaeus, 1758 encontram-se amplamente distribuídos em águas tropicais, subtropicais e temperadas de todo o mundo. Atualmente são reconhecidas duas espécies de golfinhos-comuns, Delphinus delphis Linnaeus, 1758 (golfinho-comum-de-rostro-curto) e Delphinus capensis Gray, 1828 (golfinho-comum-de-rostro-longo), além de uma terceira forma considerada como subespécie, Delphinus capensis tropicalis (van Bree, 1971). Com o objetivo de avaliar a existência das duas espécies e revisar a distribuição do gênero para o litoral brasileiro, foram avaliados 163 registros provenientes de encalhes, capturas acidentais e avistagens. Ao total, 104 crânios foram analisados morfometricamente e comparados quanto ao dimorfismo sexual, ao habitat e a maturidade. Além disso, foram realizadas comparações morfométricas entre os golfinhos-comuns do Atlântico Sul ocidental e os golfinhos-comuns do Pacífico Norte oriental. Os resultados sugerem a existência de dois grupos no litoral brasileiro, um de hábitos costeiros e outro de hábitos oceânicos, porém as diferenças não são suficientes para a separação em duas espécies distintas como proposto para o Pacífico Norte oriental. Dessa forma, no litoral brasileiro parece ocorrer apenas uma espécie de golfinho-comum (Delphinus delphis) que apresenta grande plasticidade fenotípica e distribui-se desde o litoral oriental, no Estado do Rio de Janeiro (22°S) até a divisa com o Uruguai no litoral sul, no Estado do Rio Grande do Sul. / The common dolphins of the genus Delphinus Linnaeus, 1758 are distributed worldwide in tropical, subtropical and temperate waters. Two species are currently recognized Delphinus delphis Linnaeus, 1758 (short-beaked common dolphin) and Delphinus capensis Gray, 1828 (long-beaked common dolphin), and a third morphotype is described as a subspecies Delphinus capensis tropicalis (van Bree, 1971). In order to evaluate the existence of these two species and review the distribution in Brazilian waters, we evaluated 163 records (strandings, incidental catches, and sightings). One hundred and four skulls were analyzed and compared between sexual dimorphism, habitat and maturity. Moreover, Brazilian common dolphins were compared with common dolphins from eastern North Pacific. The results suggest that there are two groups of common dolphins in Brazilian waters, one of them inhabiting shallow waters and another from deeper waters. However, the differences are not enough to propose the existence of two species in Brazilian waters like in the eastern North Pacific. In this manner, Brazilian common dolphins seem to be a single species (Delphinus delphis) presenting a wide phenotipical variation, and is distributed from Rio de Janeiro State (22°S) to the southern boundary with Uruguayan waters, in Rio Grande do Sul State.

Os golfinhos-comuns do gênero Delphinus Linnaeus, 1758 encontram-se amplamente distribuídos em águas tropicais, subtropicais e temperadas de todo o mundo. Atualmente são reconhecidas duas espécies de golfinhos-comuns, Delphinus delphis Linnaeus, 1758 (golfinho-comum-de-rostro-curto) e Delphinus capensis Gray, 1828 (golfinho-comum-de-rostro-longo), além de uma terceira forma considerada como subespécie, Delphinus capensis tropicalis (van Bree, 1971). Com o objetivo de avaliar a existência das duas espécies e revisar a distribuição do gênero para o litoral brasileiro, foram avaliados 163 registros provenientes de encalhes, capturas acidentais e avistagens. Ao total, 104 crânios foram analisados morfometricamente e comparados quanto ao dimorfismo sexual, ao habitat e a maturidade. Além disso, foram realizadas comparações morfométricas entre os golfinhos-comuns do Atlântico Sul ocidental e os golfinhos-comuns do Pacífico Norte oriental. Os resultados sugerem a existência de dois grupos no litoral brasileiro, um de hábitos costeiros e outro de hábitos oceânicos, porém as diferenças não são suficientes para a separação em duas espécies distintas como proposto para o Pacífico Norte oriental. Dessa forma, no litoral brasileiro parece ocorrer apenas uma espécie de golfinho-comum (Delphinus delphis) que apresenta grande plasticidade fenotípica e distribui-se desde o litoral oriental, no Estado do Rio de Janeiro (22°S) até a divisa com o Uruguai no litoral sul, no Estado do Rio Grande do Sul. / The common dolphins of the genus Delphinus Linnaeus, 1758 are distributed worldwide in tropical, subtropical and temperate waters. Two species are currently recognized Delphinus delphis Linnaeus, 1758 (short-beaked common dolphin) and Delphinus capensis Gray, 1828 (long-beaked common dolphin), and a third morphotype is described as a subspecies Delphinus capensis tropicalis (van Bree, 1971). In order to evaluate the existence of these two species and review the distribution in Brazilian waters, we evaluated 163 records (strandings, incidental catches, and sightings). One hundred and four skulls were analyzed and compared between sexual dimorphism, habitat and maturity. Moreover, Brazilian common dolphins were compared with common dolphins from eastern North Pacific. The results suggest that there are two groups of common dolphins in Brazilian waters, one of them inhabiting shallow waters and another from deeper waters. However, the differences are not enough to propose the existence of two species in Brazilian waters like in the eastern North Pacific. In this manner, Brazilian common dolphins seem to be a single species (Delphinus delphis) presenting a wide phenotipical variation, and is distributed from Rio de Janeiro State (22°S) to the southern boundary with Uruguayan waters, in Rio Grande do Sul State.

Os golfinhos-comuns do gênero Delphinus Linnaeus, 1758 encontram-se amplamente distribuídos em águas tropicais, subtropicais e temperadas de todo o mundo. Atualmente são reconhecidas duas espécies de golfinhos-comuns, Delphinus delphis Linnaeus, 1758 (golfinho-comum-de-rostro-curto) e Delphinus capensis Gray, 1828 (golfinho-comum-de-rostro-longo), além de uma terceira forma considerada como subespécie, Delphinus capensis tropicalis (van Bree, 1971). Com o objetivo de avaliar a existência das duas espécies e revisar a distribuição do gênero para o litoral brasileiro, foram avaliados 163 registros provenientes de encalhes, capturas acidentais e avistagens. Ao total, 104 crânios foram analisados morfometricamente e comparados quanto ao dimorfismo sexual, ao habitat e a maturidade. Além disso, foram realizadas comparações morfométricas entre os golfinhos-comuns do Atlântico Sul ocidental e os golfinhos-comuns do Pacífico Norte oriental. Os resultados sugerem a existência de dois grupos no litoral brasileiro, um de hábitos costeiros e outro de hábitos oceânicos, porém as diferenças não são suficientes para a separação em duas espécies distintas como proposto para o Pacífico Norte oriental. Dessa forma, no litoral brasileiro parece ocorrer apenas uma espécie de golfinho-comum (Delphinus delphis) que apresenta grande plasticidade fenotípica e distribui-se desde o litoral oriental, no Estado do Rio de Janeiro (22°S) até a divisa com o Uruguai no litoral sul, no Estado do Rio Grande do Sul. / The common dolphins of the genus Delphinus Linnaeus, 1758 are distributed worldwide in tropical, subtropical and temperate waters. Two species are currently recognized Delphinus delphis Linnaeus, 1758 (short-beaked common dolphin) and Delphinus capensis Gray, 1828 (long-beaked common dolphin), and a third morphotype is described as a subspecies Delphinus capensis tropicalis (van Bree, 1971). In order to evaluate the existence of these two species and review the distribution in Brazilian waters, we evaluated 163 records (strandings, incidental catches, and sightings). One hundred and four skulls were analyzed and compared between sexual dimorphism, habitat and maturity. Moreover, Brazilian common dolphins were compared with common dolphins from eastern North Pacific. The results suggest that there are two groups of common dolphins in Brazilian waters, one of them inhabiting shallow waters and another from deeper waters. However, the differences are not enough to propose the existence of two species in Brazilian waters like in the eastern North Pacific. In this manner, Brazilian common dolphins seem to be a single species (Delphinus delphis) presenting a wide phenotipical variation, and is distributed from Rio de Janeiro State (22°S) to the southern boundary with Uruguayan waters, in Rio Grande do Sul State.

Submitted by JOSIANE SANTOS DE OLIVEIRA (josianeso) on 2017-12-06T13:59:20Z No. of bitstreams: 1 Tainã Coelho Quevedo_.pdf: 1779262 bytes, checksum: 1c805c11de74d708f12d1e1a98e63886 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-06T13:59:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tainã Coelho Quevedo_.pdf: 1779262 bytes, checksum: 1c805c11de74d708f12d1e1a98e63886 (MD5) Previous issue date: 2017-08-21 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / PROSUP - Programa de Suporte à Pós-Gradução de Instituições de Ensino Particulares / Os cachalotes, Physeter macrocephalus Linnaeus, 1758, são amplamente distribuídos por todos os oceanos do mundo. Todavia, os machos e fêmeas têm diferenças marcadas em seu padrão de distribuição. Globalmente, estudos genéticos, ecológicos e de comportamento vocal comparando populações sugerem a existência de uma forte estrutura social matrilinear com alta filopatria das fêmeas nas regiões tropicais, sendo o fluxo gênico mediado pelos machos. As populações do oceano Atlântico Sul Ocidental (ASO) ainda são tidas como as menos pesquisadas e conhecidas. A fim de identificar possíveis unidades de manejo da espécie na região, o presente estudo apresentou a primeira análise da diversidade genética e a avaliação da potencial estruturação das populações de cachalotes ao longo do ASO, utilizando sequências da região controladora do DNA mitocondrial (DNAmt) de 565 pb obtidas de amostras coletadas na região. Além disso, objetivou-se também estabelecer as relações filogeográficas entre estas populações do ASO e as do resto do mundo. Para a realização deste estudo foram analisadas 58 amostras de cachalotes de três áreas geográficas na costa brasileira (nordeste =15, sudeste =3, sul = 36) e uma da costa argentina (n = 4), e comparadas com 1.577 sequências de outros oceanos, disponíveis publicamente no GenBank (Atlântico = 362, Índico = 159 e Pacífico = 1.056). Além disso, o sexo de 39 espécimes foi determinado molecularmente, a fim de se testar a existência de mais de uma população de cachalotes no ASO, a partir da detecção de fêmeas em áreas além do nordeste brasileiro. A análise das sequências do DNAmt revelou a existência de quatro grupos genéticos e sete haplótipos no ASO. As diversidades haplotípica (Hd) e nucleotídica (π) observadas para a espécie como um todo no ASO foram Hd = 0,6824 e π = 0,002296, respectivamente. Os testes de neutralidade seletiva não sugeriram mudanças significativas no tamanho efetivo e nem expansão populacional recente da espécie no ASO. Os resultados das análises de variância molecular (AMOVA) revelaram que entre 9,14% (ΦST) e 12,31% (FST) da variação genética observada deve-se a diferenças entre as populações. Contudo, essa diferenciação geográfica só foi significativa entre as populações do nordeste e sudeste-sul do Brasil, as quais possuíam altos índices de fixação entre si (nordeste e sudeste-sul do Brasil: FST = 0,1089; ΦST = 0,1378; nordeste do Brasil e Argentina: FST = -0,1076; ΦST = -0,0512; sudeste-sul do Brasil e Argentina: FST = 0,0742; ΦST = 0,1206; P<0,00001). A população do nordeste do Brasil apresentou a diversidade genética mais baixa do estudo (Hd = 0,5128 e π = 0,001796), quando comparada com as populações do sudeste-sul (Hd = 0,6659 e π = 0,002482), e Argentina (Hd = 0,8333 e π = 0,002043). A costa sudeste-sul do Brasil apresentou três haplótipos exclusivos num total de sete, enquanto a costa da Argentina apresentou um haplótipo particular. Apenas a região sudeste-sul apresentou um grupo genético exclusivo, sugerindo que a distribuição da variação genética é melhor compreendida com a existência de três grupos ao longo do ASO (nordeste, sudeste-sul e Argentina), os quais seriam considerados diferentes unidades de manejo. Em relação a comparação mundial entres as populações de cachalotes, foram recuperados 39 haplótipos e quatro grupos genéticos, sendo que apenas o oceano Pacífico apresentou um grupo genético exclusivo. A AMOVA revelou que entre 8,89% (FST) e 16,39% (ΦST) da variação genética observada deve-se a diferenças entre as populações do mundo. A AMOVA indicou que há diferenciação geográfica entre o ASO e os demais oceanos, os quais possuíam altos índices de fixação entre si (ASO e Atlântico Norte: FST = 0,1837; ΦST = 0,3142; Atlântico Sul Ocidental e Índico: FST = 0,0898; ΦST = 0,1661; Atlântico Sul Ocidental e Pacífico: FST = 0,1140; ΦST = 0,0757; P<0,00001). A amostra unificada do oceano ASO não apresentou haplótipos exclusivos. Entretanto, os indivíduos da região sudeste-sul do Brasil compartilharam seis dos seus sete haplótipos com a população do oceano Pacífico. Dos 39 cachalotes com sexo determinado molecularmente nove eram machos e 30 fêmeas, tendo sido encontradas 18 fêmeas na região sul, fora da região tropical, sugerindo que há pelo menos mais de uma população reprodutiva no ASO. Estes resultados, aliados as diferenças de variabilidade genética e ao pouco compartilhamento de haplótipos entre as populações estudadas, sugere que os cachalotes do sudeste-sul do Brasil seriam uma unidade de manejo, potencialmente isolada em termos reprodutivos das demais. Contudo, o DNAmt é um marcador matrilinear e apresenta exclusivamente a história evolutiva das fêmeas. Desta forma, a continuidade destes estudos, incluindo novas amostras e marcadores nucleares, será fundamental para a identificação de reais unidades de manejo da espécie no ASO e principalmente em águas brasileiras. / Sperm whales, Physeter macrocephalus Linnaeus, 1758, are widely distributed throughout the world's oceans. However, males and females have marked differences in their distribution pattern. Worldwide studies on genetics, ecology and vocal behavior comparing populations suggested the existence of a strong matrilineal social structure with female high philopatry in tropical regions, and gene flow mediated by males. The populations of the southwestern Atlantic Ocean (SWA) are still considered the least known and studied. In order to identify possible management units of the species in the SWA, the present study presented the first analysis of the genetic diversity and the evaluation of the potential structuring of the sperm whale populations along the SWA, using sequences from the mitochondrial DNA control region (mtDNA) of 565 bp obtained from samples collected in the region. In addition, it was also aimed to establish the phylogeographic relationships among these SWA populations and those of the rest of the world. Fifty-eight sperm whales from three geographic areas on the Brazilian coast (northeast = 15, southeast = 3, south = 36) and one from the coast of Argentina (n = 4) were analyzed and compared with 1577 sequences from other oceans and available in GenBank (Atlantic = 362, Indian = 159 and Pacific = 1056). In addition, the sex of 39 specimens was molecularly determined in order find females outside of the northeastern coast of Brazil, which would confirm the existence of more than one sperm whale population in the SWA. The analysis of mtDNA sequences revealed the existence of four genetic groups and seven haplotypes in SWA. The haplotype (Hd) and nucleotide (π) diversities observed for the species as a whole in SWA were Hd = 0.6824 e π = 0.002296, respectively. The selective neutrality tests did not suggest significant changes in the effective population size or recent population expansion for the species in SWA. The results of the molecular analysis of variance (AMOVA) revealed that between 9.14% (ΦST) and 12.31% (FST) of the genetic diversity variation observed are due to differences between populations. However, this geographical differentiation was only significant between the populations of northeast and southeast-south Brazil, which had the highest fixation index between them (northeast and southeast-south Brazil: FST = 0.1089, ΦST = 0.1378; northeast Brazil and Argentina: FST = - 0.1076; ΦST = - 0.0512; southeast-south of Brazil and Argentina: FST=0.0742; ΦST=0.1206; P<0.00001). The population of northeastern Brazil had the lowest genetic diversity of the study (Hd = 0.5128 and π = 0.001796), when compared to the southeast-south populations (Hd = 0.6659 and π = 0.002482), and Argentina (Hd = 0.8333 and π = 0.002043). The southeast-south coast of Brazil presented three exclusive haplotypes in a total of seven, while the coast of Argentina presented a particular haplotype. Only the samples from the southeast-south region of Brazil presented an exclusive genetic group, suggesting that the distribution of the genetic variation is better understand with the existence of three groups of sperm whales along the SWA (northeast of Brazil, southeast-south of Brazil and Argentina), which could be considered as different management units. Regarding the worldwide genetic structure of sperm whales, 39 haplotypes and four genetic groups were recovered, and only the Pacific Ocean presented an exclusive genetic group. AMOVA revealed that between 8.89% (FST) and 16.39% (ΦST) of the observed genetic variation was due to differences among the populations of the world. AMOVA indicated that there is a geographical differentiation between the SWA and the other oceans, which had high indexes of fixation between them (SWA and North Atlantic: FST = 0.1837, ΦST = 0.3142, SWA and Indian Ocean: FST = 0.0898; ΦST = 0.1661; SWA and Pacific: FST = 0.11140; ΦST = 0.0757; P<0.00001). The unified sample of the SWA did not present exclusive haplotypes. However, individuals from the southeast-south of Brazil only shared six of seven haplotypes with the population of the Pacific Ocean. From 39 sperm whales with sex molecularly determined, nine were males and 30 females, 18 females were found in the southern region, outside the tropical region, suggesting that there are at least more than one reproductive population in WSA. These results, together with the differences in genetic variability and the lack of sharing of haplotypes among the studied populations, suggest that sperm whales from southeast-south of Brazil would be a management unit, potentially isolated, in reproductive terms, from the others. However, mtDNA is a matrilineal marker and exclusively presents the evolutionary history of females. In this context, the continuity of these studies, including new samples and nuclear markers, will be fundamental for the identification of real units of management of the species in the SWA and particularly in Brazilian waters.

Orientador: Carolina Pacheco Bertozzi / Abstract: The Franciscana dolphin (Pontoporia blanvillei) is a small odontocete impacted by anthropic activities (bycatch, habitat degradation). The hormonal measurement in biological matrices (feces, urine, blubber, milk, saliva, blow) has been increasingly used in aquatic mammals for certain reproductive parameters. The present study validated the method of extraction and measurement of testosterone and progesterone in blubber kept in two different temperatures (-20°C and -196°C), besides correlating the hormone concentration with gender, sexual maturity, age, stage of development, body length and occurrence of pregnancy. The carcasses were collected from stranded and bycatch dolphins of the coast of São Paulo. Blubber samples were collected and frozen at -20°C (n=101) and -196°C (liquid nitrogen) (n=28). The extraction was performed with a method described in literature and the hormonal analyses were done by enzyme immunoassay for the two hormones. An analysis was performed on two units of hormone concentration (ng/g and ng/mg). The inter-assay coefficient of variation was 6.89% for progesterone and 1.67% for testosterone, the intra-assay coefficient of variation was 7.82% for progesterone and 3.29% for testosterone. The progesterone assay presented parallelism F1.5= 0.87, p= 0.45 and testosterone presented F1.5= 3.79, p= 0.11. The mean extraction efficiency was 66% for progesterone and 70% for testosterone. The method of extraction and hormonal analysis was feasible for Pontoporia ... (Complete abstract click electronic access below) / Resumo: A toninha (Pontoporia blanvillei) é um pequeno odontoceto impactado pelas atividades antrópicas (capturas acidentais, degradação de habitat). A dosagem hormonal em diferentes matrizes (fezes, urina, tecido adiposo, leite, saliva, borrifo) tem sido cada vez mais utilizada em mamíferos aquáticos para determinar parâmetros reprodutivos. O objetivo deste estudo foi validar o método de extração e mensuração de testosterona e progesterona em camada de gordura subcutânea de carcaças de toninha armazenadas em duas temperaturas (-20°C e -196ºC), além de correlacionar as dosagens com parâmetros de sexo, maturidade gonadal, idade, estágio de desenvolvimento, comprimento total e ocorrência de prenhez. As amostras foram colhidas de carcaças provenientes de encalhe e captura acidental do litoral de São Paulo. Foram colhidos fragmentos de gordura, armazenados em freezer a -20°C (n=101) e em nitrogênio líquido (-196ºC) (n=28). A extração hormonal foi realizada com modificações a partir do método descrito em literatura e a dosagem foi feita por enzimaimunoensaio para os dois hormônios. Os resultados das análises estatísticas foram expressos em duas unidades de concentração de hormônio (ng/g e ng/mg). O coeficiente de variação inter-ensaio foi de 6,89% para progesterona e 1,67% para testosterona, o coeficiente de variação intra-ensaio foi de 7,82% para progesterona e 3,29% para testosterona. Os resultados do paralelismo para o ensaio de progesterona foi F1,5 =0,87 e p=0,45 e para testosterona ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre

Au cours d'une histoire évolutive singulière, les systèmes sensoriels des cétacés se sont adaptés à la vie en milieu aquatique. Aujourd’hui, alors que la littérature scientifique regorge de travaux sur leurs capacités acoustiques exceptionnelles, l’utilisation des sens chimiques par ces mammifères marins demeure encore largement méconnue. En effet, malgré quelques rares observations suggérant qu’ils pourraient détecter les composés sécrétés par leurs proies et leurs congénères, les arguments anatomiques et génétiques sont plutôt en faveur d’une régression voire d’une disparition de leurs capacités chémoréceptrices. Les cétacés auraient-ils perdu l’usage de ce canal sensoriel pourtant fondamental pour l’alimentation, la navigation et la reproduction chez les autres grands prédateurs marins ? L’objet principal de ma thèse était donc de déterminer si ces animaux sont capables de percevoir et d’utiliser les indices chimiques présents dans leur environnement en me basant principalement sur une approche comportementale. J’ai ainsi étudié les réactions des cétacés à dents (Odontocètes) et à fanons (Mysticètes) face à différents stimuli solubles ou volatiles, liés directement ou indirectement à leur alimentation. Après avoir mis en évidence, dans des conditions contrôlées, que le grand dauphin discrimine des extraits solubles de ses proies, j’ai développé un protocole permettant de mesurer la réponse des animaux (déplacements et comportements de surface) à des stimuli chimiques, dans leur milieu naturel. Des expériences en Méditerranée occidentale ont révélé que les grands dauphins et les globicéphales (Odontocètes) réagissent au sulfure de diméthyle (DMS), une molécule volatile émise dans les zones de forte productivité primaire. J’ai ensuite mesuré, chez la baleine à bosse (mysticète), la réaction au DMS et à des extraits de proies (krill) dans ses zones de reproduction (Océan Indien) et de nourrissage (Atlantique Nord et Antarctique). Les animaux exposés ont réagi par une augmentation de la fréquence respiratoire et, dans le cas de l’extrait de krill uniquement, par une attraction vers la source du signal (chemotaxis). Nos résultats comportementaux ayant mis en évidence une chémoréception fonctionnelle chez les cétacés, j’ai tenté dans un second temps d’identifier ses bases anatomiques et chimiques. J’ai ainsi initié l’exploration des muqueuses orales et nasales par des techniques d’immunohistochimie, ainsi que l’analyse chimique de leurs sécrétions (urines et fèces) à la recherche de potentielles phéromones. Cette approche innovante et multidisciplinaire a permis de dévoiler l’implication des signaux chimiques dans l’écologie des cétacés. Au-delà de leur aspect fondamental, ces résultats pourraient trouver des applications concrètes pour la gestion et la conservation de ces espèces emblématiques et menacées. / During the course of a unique evolutionary process, the sensory systems of cetaceans (whales, dolphins and porpoises) have secondarily adapted to life in an aquatic environment. While the extraordinary acoustic capacities of these animals have been widely studied, surprisingly little is known about their chemosensory abilities. The results of some sparse behavioural studies suggest that cetaceans can detect molecules secreted by, for example, a prey or congener. In contrast, anatomical and genetic investigations have concluded that cetacean chemosenses are greatly reduced or even absent. This poses the question; have cetaceans truly lost the use of the sensory channels that play a major role in the feeding, orientation and reproduction behaviours of other marine predators? The main objective of this thesis was, therefore, to establish whether these animals are capable of perceiving biologically-relevant chemical cues and exhibiting a behavioural response. For this project, I studied the reactions of both toothed (Odontoceti) and baleen (Mysticeti) whales to various soluble or volatile food-related stimuli. I first worked with captive bottlenose dolphins (Tursiops truncatus) and showed they could discriminate soluble extracts of their piscine prey. I then developed a novel protocol to measure the responses (surface behaviour and movements) of cetaceans to chemical cues in their natural habitat. Using this protocol, experiments performed in the western Mediterranean Sea revealed that both bottlenose dolphins and pilot whales (Globicephala melas) react to dimethyl sulfate (DMS), a volatile molecule found in areas of high primary productivity. Using the same protocol, I subsequently measured the reactions of a mysticete species, the humpback whale (Megaptera novaeangliae) to DMS and to krill extract (their natural prey) in three different locations: in their reproduction zone in the Indian Ocean, and in their feeding grounds in the North Atlantic and Antarctic Ocean. I found that the humpback whales reacted with an increased respiratory rate to both stimuli and that the krill extract also attracted them (chemotaxis). As the results of the behavioural studies suggested the presence of functional chemical senses, I initiated two further studies; (1) a neuroanatomical and immunohistochemical exploration of tissues in the oral and nasal pathways, in order to identify potential chemosensory receptor cells in four species of odontocete, and (2) a chemical analysis of odontocete secretions (urine or feces) in search for potential semiochemicals. Overall, this innovative and multidisciplinary research project revealed that chemical signals are potentially very important in the behavioral ecology of cetaceans. Moreover, these results contribute not only to our fundamental knowledge of the sensory biology of these animals, but they could also have important practical implementations in the conservation of these iconic and threatened species.

Marine mammal mass strandings have been documented for centuries, even going as far back as Aristotle. For just as long, the causes of these mass strandings have been questioned. With every species of cetacean known to have stranded, it is important to find trends to understand and prevent these strandings from occurring. With a heightened awareness of this issue, leading to the creation of marine mammal stranding networks throughout the United States in the 1990s, a more comprehensive approach to data collection has helped with the study. Issues such as seasonality, weather, topography, and disease have all been observed as a potential cause of these events. This study attempted to look at the Atlantic Coast of the United States, and its documented mass strandings from 1997-2011. Stranding data taken from the Northeast and Southeast US Marine Mammal stranding network database provided a basis for the study of these mass strandings. Many of the possible causes of these strandings, including seasonality, location, and species were studied. There was some correlation found between seasons and stranding, meaning there are certain times of the year when a cetacean pod may be more likely to strand.

Menopause, the cessation of female reproduction well before death, is a puzzling phenomenon, because evolutionary theory suggests there should be no selection for survival when reproduction has ended. Nevertheless, menopause does exist in a limited number of species, and besides humans it has predominately evolved among toothed whales (Odontoceti). The aim of this thesis is to review both adaptive and non-adaptive theories. Of the latter, the most prominent proposes that menopause is a product of a physiological trade-offs between reproductive benefits early in life and negative late-life reproduction. Among the adaptive theories the grandmother hypothesis is the most acknowledged. This theory is based on inclusive fitness benefits gained from increasing the reproductive success of kin at an advanced age, when prospects of successfully raising additional offspring is reduced. Alternatively, the mother hypothesis suggests that increased investment in already produced offspring at late life explains menopause. There are support for both the care of mothers and grandmothers, but whether this is enough to compensate for repressed reproduction is debated. The reproductive conflict hypothesis provides a complementary explanation, and suggests that inter-generational conflict between either in-laws or kin selects the older female to shift investment into the younger female’s offspring due to asymmetries in how older and younger females are related to one another’s offspring. The evolution of menopause is a complex issue, containing many factors, kinship dynamics among the most important. Theories apply unequally to various species and populations, meaning an integrated approach is necessary for decrypting the evolution of menopause.