Orientador: Cesar Martins / Resumo: Os cromossomos B ocorrem em cerca de 2.828 espécies de diferentes táxons, sendo basicamente heterocromáticos e compostos de DNAs repetitivos. Recentemente, análises genômicas em larga escala estão sendo utilizadas para elucidar questões acerca dos cromossomos supranumerários. Os peixes ciclídeos recebem grande interesse científico, uma vez que muitas espécies passaram por um rápido e extenso processo de radiação adaptativa. Em algumas espécies do grupo, como Astatotilapia latifasciata, foi descrita a presença de cromossomos B. Neste trabalho foi caracterizado o perfil de expressão proteico em tecidos específicos na A. latifasciata e realizada análise funcional da presença do cromossomo B nesta espécie de teleósteo, elucidando a influência que este pode acarretar em vias metabólicas específicas. Além disso, esses dados foram integrados com os resultados de RNA-Seq dessa espécie, e construídas sub redes de co-expressão e interação proteína-proteína. Também foi calculada a entropia de Shannon, a qual não apresentou diversidade na expressão dos transcritos em cada biblioteca comparada. Além disso, foi analisada a expressão diferencial de RNAm em cada tecido em relação a presença do cromossomo B e ao sexo. Dentre os transcritos diferencialmente expressos, a análise de enriquecimento funcional apresentou processos relacionados ao ciclo celular, resposta imune e resposta ao estresse. Na maioria dos casos analisados entre a expressão de proteínas, os transcritos up regulated e as sub... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The B chromosomes occur in about 2,828 species of different taxa, being heterochromatic and composed of repetitive DNA.Recently, large-scale genomic analyzes are being used to elucidate questions about supernumerary chromosomes.Cichlid fish are of great scientific interest, since many species have gone through a rapid and extensive process of adaptive radiation.In some species of the group, such as Astatotilapia latifasciata, the presence of B chromosomes was described.In this work, we characterize the profile of protein expression in specific tissues in A. latifasciata and performed a functional analysis of the presence of the B chromosome in this species of teleost, elucidating the influence that it can cause in specific metabolic pathways.In addition, we integrate these data with the RNA-Seq results of this species, and construct sub-networks of co-expression and protein-protein interaction.The Shannon entropy was also calculated, which did not show diversity in the expression of the transcripts in each library. In addition, differential expression analysis was performed on each tissue separately and the relationship between the presence of B chromosome and sex chromosome was analyzed. Among the differentially expressed transcripts, functional enrichment analysis presented processes related to the cell cycle, immune response and stress response. In relation to abundance of proteins, the up regulated transcripts and the sub-networks we identified genes like the Aurora kinas... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-02-16Bitstream added on 2014-06-13T20:10:11Z : No. of bitstreams: 1 teresa_fb_me_sjrp.pdf: 340541 bytes, checksum: 0fb6e58b4c117f539a096cfa4573d092 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O comportamento reprodutivo dos ciclídeos envolve diferentes sistemas de acasalamento e cuidado parental. No entanto, as espécies neotropicais são pouco conhecidas em relação às africanas. A maior parte dos ciclídeos neotropicais exibe cuidado biparental com predomínio da monogamia (diferentemente dos ciclídeos africanos cujo cuidado intrabucal uniparental prevalece). Laetacara sp. é uma nova espécie de ciclídeo sul-americano encontrada em abundância em riachos bastante degradados. A ocupação desses ambientes pode ser favorecida pelas estratégias reprodutivas da espécie. Assim, neste estudo descrevemos o comportamento reprodutivo de Laetacara sp. para explorarmos sua importância na determinação do sucesso dessa espécie em ambientes degradados. Inicialmente, descrevemos as fases e as unidades do comportamento reprodutivo (Capítulo 1). Em seguida, quantificamos a cooperação entre machos e fêmeas ao longo do ciclo reprodutivo (Capítulo 2). O comportamento reprodutivo de Laetacara sp. é iniciado com a defesa territorial pelo macho e envolve a formação do casal, construção de ninho, acasalamento e cuidado biparental dos ovos e larvas no substrato. O cuidado parental foi dividido em Manutenção (ventilação e limpeza dos ovos e larvas) e Defesa (interações agressivas contra intrusos nas fases estacionárias e livre natante). Na fase pré-acasalamento, os machos investiram mais em defesa territorial, enquanto as fêmeas investiram mais em construção de ninhos. Na fase ovo/larva, as fêmeas permaneceram mais tempo próximas à prole do que os machos, sem diferir na fase seguinte. Porém, os pais permaneceram por mais tempo junto à prole natante, indicando que nessa fase os filhotes são mais vulneráveis. O comportamento reprodutivo de Laetacara sp. parece ser uma das adaptações para a sobrevivência em ambientes aquáticos degradados... / The reproductive behaviour of cichlid fishes attracts many researchers because it is expressed through different types of mating systems and parental care. However, neotropical species are still little studied, in comparison to African species. Most Neotropical cichlids are monogamous and biparental care prevails (contrary to African cichlids where mouth brooding and uniparental care are the rule). Laetacara sp. is a new South American cichlid mainly found in degraded streams. Species occupation of such environments may be facilited by reproductive strategies. Thus, the aim of this study was to describe the reproductive behaviour of Laetacara sp. to evaluate its daptative value for living successfully in degraded environments. In a first step, the phases and units of reproductive behaviour were described (Chapter 1). In a second step, cooperation between males and females during reproductive cycle was quantified (Chapter 2). Reproductive behaviour of Laetacara sp. started with territorial defense by males and involved pair bonding, nest building, mating and biparental care of eggs and wrigglers on the substrate. Parental care was divided into Nurturance (fanning and cleaning eggs and wrigglers) and Defense (aggressive contests against intruders in the brood stationary and free-swimming phases). In the pre-spawning stage, males invest more in territory defense while females invest more in nest building. In the egg/larva phase, females remains close to the brood more than males, but time spent near the brood was similar for both parents in the free-swimming phase and higher than in the previous phase, which indicates higher vulnerability of the fry. Reproductive behaviour of Laetacara sp. should be one of several adaptations that enhances the chance of surviving in aquatic degraded environments. This occurs, in part because this species can to build nests in sandy ...(Complete abstract click electronic access below)