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Uma aplicaÃÃo para a LPRSamy Soares Passos de SÃ 02 October 2008 (has links)
Conselho Nacional de Desenvolvimento CientÃfico e TecnolÃgico / Sistemas automatizados de apoio à decisÃo lidam com a representaÃÃo de conhecimento atravÃs de sistemas formais que permitam cÃlculo de inferÃncias, e atravÃs deste, a possibilidade de tirar conclusÃes de uma base de conhecimento. LÃgicas nÃo-monotÃnicas vÃm sendo discutidas como soluÃÃo para contornar os limites de expressividade da lÃgica clÃssica quanto à representaÃÃo de bases de conhecimento. A LPR (Logic of Plausible Reasoning) à uma proposta recente, que sugere uma estrutura de regra nÃo monotÃnica atravÃs do conceito de generalizaÃÃo e um cÃlculo de extensÃes prÃprio como soluÃÃo capaz de lidar com alguns dos principais problemas e limites expressivos dos formalismos que a antecederam. O presente trabalho à um dos primeiros a explorar o poder expressivo e potencial para a utilizaÃÃo dessa tÃcnica como ferramenta de modelagem de bases de conhecimento para sistemas de apoio à decisÃo. Introduzimos as regras de um jogo enquanto sistema formal adequado à anÃlise e ilustramos o funcionamento do raciocÃnio modelado pela LPR sobre o conhecimento corrente em vÃrios momentos do mesmo, permitindo modelar aspectos do pensamento tais como a formulaÃÃo de conjecturas, avaliaÃÃo de cenÃrios e mudanÃa de idÃia em decorrÃncia de novas descobertas. Apresentamos, ainda, um programa PROLOG que implementa o modelo descrito com regras LPR como instrumento de corretude do mesmo, utilizando uma tÃcnica de divisÃo do programa para formular na linguagem regras baseadas em quantificadores e equivalÃncia de variÃveis.
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A Strategy for Detection Systems and Intrusion Prevention Based on Free Software / Uma EstratÃgia para Sistemas de DetecÃÃo e PrevenÃÃo de IntrusÃo Baseada em Software LivreDaniel MourÃo Martins 30 November 2012 (has links)
nÃo hà / Due to the constant increase of the use of information systems and the potential impact
that these intrusions can cause in all spheres of society a Intrusion Detection and Prevention
System (IDPS) has become a necessity for network ans services security from various world organizations.
These systems usually depends of prior knowledge of the patterns of attacks in order to
detect them. This work presents an strategy to scenarios with computational and financial resources
limited, using only opensource software for intrusion detection. This proposal is the creation
of one flexible and scalable IDPS, with software integration, implementation of alerts correlation
rules and a signatures generator module for Snort, that can increase its efficiency enabling it to
produce knowledge for preventing the recurrence of some intrusion attacks not constant in original
database, thus minimizing the detection problem for these attacks. To validate this proposal, a testing
scenario was implemented with three server machines, one with the solution manager module
and one with Snort. The results confirmed that this strategy meets the proposed requisites in a
satisfactorily way being an important contribution to researchs about the theme. / Devido ao aumento constante da utilizaÃÃo dos sistemas de informaÃÃo em todas as esferas da sociedade e o potencial impacto que intrusÃes a esses sistemas podem causar, um Sistema de DetecÃÃo e PrevenÃÃo de IntrusÃo (IDPS) tornou-se uma necessidade para seguranÃa da infraestrutura de rede e serviÃos das mais diversas organizaÃÃes. Normalmente, esses sistemas dependem de conhecimento prÃvio dos padrÃes dos ataques para poder detectÃ-los. Este trabalho apresenta uma estratÃgia adequada, utilizando exclusivamente software livre, para a detecÃÃo de intrusÃes em cenÃrios com escassez de recursos computacionais e financeiros. Esta proposta consiste na criaÃÃo de um IDPS flexÃvel e escalÃvel que, com a integraÃÃo de sistemas, implementaÃÃo de regras de correlaÃÃo de alertas e um mÃdulo gerador de assinaturas para o Snort, pode-se aumentar a sua eficÃcia habilitando-o a produzir conhecimento para a prevenÃÃo da repetiÃÃo de ataques intrusivos nÃo constantes de sua base de dados original. Assim, minimiza-se a problemÃtica de detecÃÃo desses ataques. Para validar essa proposta, implementou-se um cenÃrio de testes com trÃs mÃquinas servidoras, uma com o mÃdulo gerenciador da soluÃÃo e outra com o Snort. Os resultados obtidos confirmaram que a estratÃgia atende aos quesitos propostos de maneira satisfatÃria sendo uma importante contribuiÃÃo para as pesquisas sobre o tema.
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Biota-Rio: Um banco de dados para a biodiversidade do Estado do Rio de Janeiro / BIOTA-RIO: A Database of Biodiversity in the State of Rio de JaneiroNunes, Vinicius Schmitz Pereira 27 May 2008 (has links)
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Previous issue date: 2008-05-27 / Coordenacao de Aperfeicoamento de Pessoal de Nivel Superior / The use of information technology in biodiversity related databases is increasing due to the open access to a large sum of data. Access to this information may be regarded as crucial to different areas of knowledge. The present work aims at the development of a open access computational system on biodiversity of the State of Rio de Janeiro. The Biota-Rio system focuses on the animal species, vertebrates and invertebrates, which were originally described for the State of Rio de Janeiro. In this sense, key information such as original descriptions, type localities, habitats and other are directly available on the system. Biota-Rio is a system in which the user may freely access the information via web that was implemented using the PERL language. The MySQL was the selected DBMS in the implementation of the database in which the informations are deposited. To date, surveys have been made of references to thirty-six species of mammals using the Zoological Record database. / O uso da tecnologia da informação na implementação de bases de dados com informações sobre a biodiversidade, vem ganhando uma grande importância. Isso se deve a grande necessidade de se promover um acesso livre a dados e informações sobre as espécies. O acesso a essas informações é considerado como fundamental para o desenvolvimento de diferentes áreas do conhecimento. A presente dissertação teve como objetivo o desenvolvimento de um sistema computacional para acesso a informações sobre a biodiversidade do Estado do Rio de Janeiro. O sistema Biota-Rio deverá conter informações sobre as espécies de animais, vertebrados e invertebrados, que foram descritas para o Estado do Rio de Janeiro. Informações como descrições originais, localidades-tipo, ambiente e outras informações estarão disponíveis no sistema. Biota-Rio é um sistema de acesso livre via web, que foi implementado utilizando a linguagem de programação PERL. O MySQL foi o SGBD utilizado na implementação do banco de dados onde estarão depositadas as informações sobre as espécies. Até o momento, foram feitos levantamentos das referências para trinta e seis espécies de mamíferos utilizando a base de dados Zoological Record.
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Acompanhamento de múltiplos alvos em trajetórias tridimensionais / Tracking multiple targets in three-dimensional trajectoriesAgner Júnior, Jair 17 March 2016 (has links)
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Previous issue date: 2016-03-17 / Unavailable / Neste trabalho foi desenvolvido um algoritmo para acompanhamento de múltiplos alvos em trajetórias tridimensionais. Esse tipo de algoritmo é cada vez mais utilizado em sistemas de navegação e vigilância civis e militares, permitindo o rastreamento de ameaças ou de alvos em tempo real. Sabe-se também que os modelos bidimensionais, de aviões civis em sistemas de controle de tráfego aéreo, mostram-se insuficientes para o tratamento de manobras tridimensionais, devido as consideráveis variações de altitude, presentes no acompanhamento de alvos militares. Entretanto, acompanhar uma grande quantidade de alvos é um processo complexo, o qual exige algoritmos de associação capazes de lidar com um grande volume de dados, com o elevado custo computacional, bem como com o uso de técnicas de filtragem lineares e não-lineares. O trabalho abrange modelos de dinâmica de voo que descrevem a evolução do estado de um alvo em trajetórias tridimensionais, tratado como objeto pontual, abordando o problema da incerteza do seu movimento. Para a estimativa da posição do alvo foi utilizado um estimador de Múltiplos Modelos, formado por bancos de filtros de Kalman com o auxílio das medidas efetuadas por um sensor. Dessa forma, foram adotados como estimadores de estado o Filtro de Kalman padrão e o Filtro de Kalman Estendido com integração através do filtro de sistemas híbridos de Múltiplos Modelos Interagentes (IMM). Com o objetivo de avaliar as metodologias de acompanhamento, foi desenvolvido, utilizando o software MATLAB, um gerador artificial de trajetórias, o qual atuou como ferramenta de simulação, permitindo avaliar diferentes métricas de desempenho. O mesmo possibilitou a geração de diversas trajetórias para alvos de modo a cobrir diversos tipos de manobras que podem ocorrer na realidade. Para o tratamento dos múltiplos alvos foi realizada a implementação paralela e para aceleradores (GPU). Além disso, o modelo desenvolvido permite contornar as limitações dos modelos bidimensionais, fornecendo um modelo dinâmico com nível de detalhamento capaz de representar bem essas manobras. Apesar desse detalhamento, a sua complexidade ainda viabiliza a implementação do filtro em sistemas reais, cuja necessidade de solução em tempo real é imprescindível. Para isso também utilizou-se de GPUs como ferramenta para a obtenção dessa solução no tempo adequado.
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Um mecanismo para realçar a conectividade de roteamento geográfico na transmissão multimídia em VANTs / A mechanism to enhance connectivity of geographic routing in the multimedia streaming in UAV networksCOSTA, Rodrigo Medeiros 16 June 2014 (has links)
Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-09-30T16:57:02Z
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Previous issue date: 2014 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / As redes de Veículos Aéreos Não Tripulados (VANTs) têm potencializado o uso
de aplicações multimídia devido ao seu elevado grau de mobilidade e versatilidade. Esse
crescimento ocorre pela facilidade de acesso e utilização dos VANTs quadricópteros em
diversas aplicações civis. As aplicações civis têm como característica principal o uso de
dados multimídia, como vídeos, por oferecerem uma perspectiva visual mais detalhada
do ambiente. A transmissão desse tipo de dado nas redes VANTs por meio de protocolos
geográ cos melhora a taxa de entrega de dados. Entretanto, ela ainda não é su ciente para
prover qualidade de experiência (QoE). Isso ocorre devido ao elevado grau de mobilidade
dos quadricópteros que ocasiona quebras de enlace durante a transmissão multimídia. Por
consequência, ela prejudica a conectividade e induz a altas perdas de pacotes e atrasos.
Então, este trabalho propõe um mecanismo, chamado RCRV, com base em técnicas de
predição de mobilidade em termos de posicionamento e da estimativa do tempo de enlace
para realçar a tomada de decisão de roteamento em protocolos geográ cos. Além disso,
ele utiliza critérios que consideram os comportamentos de mobilidade dos VANTs. Assim,
o RCRV possibilita o prolongamento da conectividade nas redes VANTs. O RCRV é
um mecanismo que complementa as estratégias de roteamento dos protocolos geográ cos.
Desse modo, adicionou-se o RCRV ao protocolo GPSR a m de avaliar os ganhos e
benefícios do mecanismo em um protocolo de roteamento geográ co. Simulações foram
realizadas com diferentes velocidades e números de VANTs. Os resultados mostraram
que o RCRV aumenta a conectividade da transmissão, melhorando a entrega do conteúdo
multimídia e a qualidade do vídeo observado pelo usuário. / Networks of Unmanned Aerial Vehicles (UAVs) have enhanced the use of multimedia
applications due to their high degree of mobility and versatility. This increase
occurs due the accessibility and use of UAVs quadricopters in several civilian applications.
Civilian applications have as main characteristic the use of multimedia data such
as videos, because they o er a more detailed visual perspective of the environment. The
transmission of such data in UAV networks by geographic protocols improves the rate of
data delivery. However, it is not su cient to provide quality of experience (QoE). This
is because the high degree of mobility of the quadricopters, which leads to link breaks
during multimedia transmission. Consequently, it impairs connectivity and induces high
packet losses and delays. Therefore, this paper proposes a mechanism called RCRV, based
on techniques for predicting mobility in terms of positioning and link estimation time to
enhance the decision making process in geographic routing protocols. Furthermore, it
employs criteria that consider the behavior of mobility of UAVs. Thus, RCRV enables
the extension of connectivity in UAV networks. The RCRV is a mechanism that complements
the strategies of geographic routing protocols. In this way, added the RCRV
to the GPSR protocol to evaluate the gains and bene ts of him in a geographic routing
protocol. Simulations were performed with di erent speeds and numbers of UAVs. The
results showed that the RCRV increases the connectivity in the multimedia transmission,
improving the delivery of multimedia content and video quality observed by the user.
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Implementação de um sistema de algoritmos de programação não-linearRibeiro, Clóvis Augusto 12 1900 (has links)
Submitted by Algacilda Conceição (algacilda@sibi.ufrj.br) on 2018-04-05T15:57:04Z
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Previous issue date: 1973-12 / COPPETEC / Universidade Federal de Ouro Preto / Este trabalho resulta da implementação, em computador, de uma série de algoritmos destinados a resolver problemas vinculados e desvinculados da área de Programação Linear. Os métodos são apresentados de forma resumida e, em seguida, são expostos os algoritmos correspondentes. O trabalho é de cunho essencialmente prático e não houve, por este motivo, intenção de estabelecer desenvolvimentos teóricos inéditos, a menos de uma pequena ênfase sobre manipulação de precisões utilizadas pelos algoritmos. O sistema foi organizado de modo a oferecer facilidades de operação aos usuários que dele fizerem uso. / This work is the result of the computer implementation of a set of nonlinear programming algorithms destined to solve constrained or unconstrained problems. The methods are concisely discussed after which the corresponding algorithms are presented. As the algorithms are approached from an essentially practical point of view, no original theoretical developments are pursued with the possible exception of some emphasis on the precision manipulations made by the algorithms. The system has been organized in order to provide to the user a good easiness in operation.
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Smart Panking : uma aplicação para estacionamento em cidades inteligentesSantos, Samila Ruane Barbosa, Passos, Silvio Rodrigo Lima 10 October 2017 (has links)
The world is experiencing two major transformations: the number of people living in urban areas surpassing the number of people in rural areas and a technological revolution changing the lives of billions of people. With more people living in cities, the problems they face are intensified and the response to these problems increasingly involves the use of a lot of technology, from which emerges the concept of Smart City. In order to deal with one of the most critical problems of cities, urban mobility, this work seeks to understand its causes and what interventions could be undertaken. One of the most prominent problems that impacts the urban mobility is the high number of vehicles circulating in cities and one of the challenges is to manage this fleet of vehicles in order to reduce congestion, facilitating mobility and consequently reducing the amount of exhaust gases in the atmosphere. Since one of the causes of this problem is the time spent by drivers looking for parking spaces, one solution is to minimize it. For this purpose a Systematic Literature Review of primary studies that were inserted in this context was carried out and through a Product Research in the Market, followed by the application of a questionnaire to stakeholders, relevant characteristics were extracted for the development of a solution for this scenario. Therefore, the objective of this work was to create a tool that intelligently optimizes the process of supply and demand of parking spots, considering the growing number of vehicles and the limited space of cities as a contribution to the development of Smart Cities. / O mundo está vivenciando duas grandes transformações: o número de pessoas vivendo em zonas urbanas ultrapassando o número de pessoas em zonas rurais e uma revolução tecnológica mudando a vida de bilhões de pessoas. Com mais pessoas vivendo nas cidades, os problemas que elas enfrentam são intensificados e a resposta a esses problemas envolve cada vez mais o emprego de muita tecnologia, de onde emerge o conceito de Cidade Inteligente. Com o intuito de lidar com um dos problemas mais crucias das cidades, a mobilidade urbana, este trabalho procurou levantar as suas causas e quais intervenções poderiam ser realizadas. Um dos problemas mais proeminentes que gera impacto na mobilidade urbana é o crescimento da quantidade de veículos circulando nas cidades e um dos desafios é gerenciar esta frota de veículos buscando diminuir o congestionamento, facilitando a mobilidade e consequentemente reduzindo a quantidade de gases expelidos na atmosfera. Uma vez que uma das causas deste problema é o tempo gasto pelos motoristas na procura por vagas para estacionar, uma solução é minimizar esta causa. Para este fim foi realizada uma Revisão Sistemática dos estudos primários que estão inseridos neste contexto e por meio de uma Pesquisa de Produtos no Mercado, seguido da aplicação de um questionário para stakeholders foram extraídas características relevantes para o desenvolvimento de uma solução para este cenário. Sendo assim o objetivo deste trabalho foi criar uma ferramenta que otimiza de forma inteligente o processo de oferta e procura de vagas de estacionamento, tendo em vista o número crescente de veículos e o espaço limitado das cidades como contribuição para o desenvolvimento das Cidades Inteligentes. / São Cristóvão
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Utilização de ambientes virtuais tridimensionais colaborativos em visualização de informaçãoSOUZA JÚNIOR, Rosevaldo Dias de 14 January 2005 (has links)
Submitted by camilla martins (camillasmmartins@gmail.com) on 2016-12-14T13:26:55Z
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Previous issue date: 2005-01-14 / Atualmente graças ao exponencial processo evolutivo dos equipamentos de
hardware, principalmente os relacionados ao armazenamento de dados, é possível
armazenar enormes quantidades de dados, de todos os tipos possíveis, em uma base
centralizada e/ou distribuída. Há alguns anos atrás pouco se sabia o que fazer com tamanha
quantidade de dados armazenados, nos dias atuais já se sabe que a organização que melhor
dominar as informações provenientes do meio é que mais chance terá de ser bem sucedida.
Baseado nas premissas citadas é necessário que os responsáveis pela tomada de
decisão utilizem ferramentas de visualização de informação para auxiliar no processo
decisório, fazendo com que o mesmo se torne mais confiável, rápido, intuitivo e preciso.
A visualização de informação utiliza técnicas de apresentação de dados com o
objetivo de torná-los mais perceptíveis e intuitivos para o usuário, entretanto quando há a
necessidade de apresentar grandes quantidades de dados, a visualização fica prejudicada
por vários motivos. Para solucionar este problema de visualização, a utilização da
Realidade Virtual (RV) se torna bastante útil devido à possibilidade que esta interface
proporciona tal como interação e navegabilidade, características que tornam a visualização
mais produtiva e interessante. Contudo, normalmente a tomada de decisão não é feita por
uma única pessoa, e as ferramentas em sua grande maioria são monousuárias, prejudicando
a tomada de decisão, principalmente se as pessoas estiverem distantes umas das outras.
Com um ambiente colaborativo de visualização de dados, é possível discutir sobre a mesma
visão de dados diminuindo o tempo e equívocos desnecessários para a tomada de decisão.
Este trabalho tem por objetivo projetar e implementar uma ferramenta de
visualização de informação em um ambiente virtual tridimensional colaborativo para
auxiliar o usuário na tomada de decisão descentralizada. Para tanto, foi utilizado no
desenvolvimento desta ferramenta característica das áreas de Banco de Dados, Visualização
de Informação e Ambientes Virtuais Colaborativos. / Now thanks to the exponential evolutionary process of the hardware equipments,
mainly the related to storage of data, it is possible to store enormous amounts of data, of all
possible types, in a centralized base and/or distributed. There are some a little years ago
was known what to do with such amount of stored data, in the days you act is known
already that the organization that best to dominate the coming information of the is half that
more chance will have to be well happened. Based on the mentioned premises is necessary that the responsible for the take of decision use tools of information visualization to aid in the ruling process, doing with that the same if turns more reliable, fast, intuitive and accurate. The information visualization uses techniques of data presentation with the objective of turning them more perceptible and intuitive for the user, however when there is need to present great amounts of data, the visualization is prejudiced for several reasons. To resolve this visualization problem, the use of the Virtual Reality (VR) if it turns essential due to the possibility that this interface provides just as interaction and navigability, characteristics that turn the most productive and interesting visualization. However, usually the ruling of decision is not made by a single person, and the tools in his great majority are mono-users, harming the ruling decision, mainly if the people are distant some of the other ones. With a collaborative environment of data visualization, it is possible to discuss on the same vision of data decreasing the time and unnecessary misunderstandings to the ruling decision. This work has for aim project and implementation a tool of information visualization in an environment three-dimensional virtual collaborative to aid the user in the ruling decentralized decision. Therefore it was used in the development of this characteristic tool of the areas of Database, Information Visualization and Collaborative Virtual Environments.
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Proposta de um modelo para acompanhamento da aprendizagem significativa por mapas conceituaisSilva, Vagner da 07 August 2018 (has links)
Submitted by Marta Toyoda (1144061@mackenzie.br) on 2018-09-17T21:26:09Z
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Previous issue date: 2018-08-07 / Fundo Mackenzie de Pesquisa / The assessment methods used in the modality of courses and in virtual learning or distance
learning environments tend to provide insufficient or incomplete information about the
development of learning. Among instruments used in evaluations there are questions
of multiple choice, forum, projects and chats, often focusing only on the summative
evaluation, of classification feature; consequently, providing incomplete data regarding the
learning. Many of these environments make it difficult through the offered tools to develop
assessments capable of presenting as accurate information as possible about the knowledge
constructed by the student. Providing students with activities that can be assessed by
process-based instruments, such as the conceptual organization, tend to strengthen the
teaching/learning process. These activities should complement assessment tools based on
multiple-choice, test, or project questions. This work presents a model that allows following
the learning through the use of individual and collaborative conceptual maps, providing
indexes and using measures to follow learning evolution. In this model, the conceptual
maps are assessments qualitatively and, among others, the results are used to inform
students’ conceptual organization index and to define groups division for collaborative
conceptual map development. In addition, the model provides information for students and
teachers regarding the development of learning, so, they will be able to make individual or
joint decisions to achieve the proposed learning objective. / Os métodos de avaliações usados, na modalidade de Cursos presenciais e em Ambientes Virtuais
de Aprendizagem ou ensino a distância tendem a fornecer informações insuficientes ou
incompletas sobre o desenvolvimento da aprendizagem. Dentre os instrumentos usados nas
avaliações, estão questões de múltipla escolha, fórum, projetos e chat, muitas vezes focando
apenas a Avaliação Somativa, de caráter classificatório e, consequentemente, fornecendo
dados incompletos a respeito da aprendizagem. Muitos desses ambientes dificultam, pelas
ferramentas oferecidas, o desenvolvimento de avaliações capazes de apresentar informações
o mais precisas possíveis sobre o conhecimento construído pelo aluno. Proporcionar aos
alunos atividades que possam ser avaliadas por instrumentos baseados no processo, como a
organização conceitual, tende a fortalecer o processo ensino/aprendizagem. Essas atividades,
devem complementar os instrumentos de avaliações baseados em questões de múltipla
escolha, teste ou projetos. Este trabalho apresenta um modelo que permite acompanhar
a aprendizagem pelo uso de Mapas Conceituais Individuais e Colaborativos, fornecendo
índices e utilizando medidas para acompanhamento da evolução da aprendizagem. Nesse
modelo, os Mapas Conceituais são avaliados qualitativamente e os resultados são usados
para, dentre outros, informar o índice de organização conceitual do aluno e definir a
divisão dos grupos para desenvolvimento do Mapa Conceitual Colaborativo. Além disso, o
modelo fornece informações para alunos e professores a respeito do desenvolvimento da
aprendizagem; assim, eles terão condições de tomar decisões individuais ou em conjunto
para alcançar o objetivo de aprendizagem proposto.
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Identificação de RNAs não-codificantes em vibrios marinhos / Identification of Non-Coding RNAS in Marine VibriosSilveira, Ana Cristina Gomes 01 June 2010 (has links)
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Previous issue date: 2010-07-22 / Coordenacao de Aperfeicoamento de Pessoal de Nivel Superior / The discovery of the non-coding RNA (ncRNA) has been primarily focused on the genomes of eukaryotes and pathogenic bacteria. In vibrios, all that is known up to now regarding ncRNAs involves V. cholerae N16961 e V. campbellii ATCC BAA-1116. In this study, ncRNA candidate genes were identified in the genomes of V. campbellii ATCC BAA-1116, V. alginolyticus 40B, V. communis 1DA3 e V. mimicus VM573. V. alginolyticus 40B and V. campbellii ATCC BAA-1116 are abundant in brazilian corals, whereas V. mimicus VM573 is a toxic strain (carrying the Vibrio pathogenicity island) atypical to this species. In order to identify the ncRNAs in silico, the tools Infernal and Rfam database were used. Perl programs were developed in the present work. The Infernal tool and the Rfam database are based on the Covariance Model (CM), a special case of Stochastic Context Free Grammars (SCFG). Up to 38 ncRNAs were identified per species. They were classified into seven classes according to their regulatory function and/or structural (1. riboswitches, 2. modulators of protein activity, 3. RNA's antisensus of trans action, 4. RNA's antisensus of cis action, 5. ribonucleoproteins, 6. regulation by transcription termination and 7. unknown classification). The most abundant group was the riboswitch, whereas the less abundant group was the ribonucleoprotein. This work demonstrated that the ncRNAs show a great diversity in functional classes, possibly associated with the regulation of different cellular processes in vibrios, including regulation of pathogenicity. / A descoberta de RNA não-codificante (ncRNA) tem focado principalmente nos genomas de eucariontes e de bactérias patogênicas. Em vibrios, o que se conhece até o momento sobre ncRNAs envolve V. cholerae N16961 e V. campbellii ATCC BAA-1116. Neste estudo, são identificados genes candidatos de ncRNAs no genoma de V. campbellii ATCC BAA-1116, V. alginolyticus 40B, V. communis 1DA3 e V. mimicus VM573. V. alginolyticus 40B e V. campbellii ATCC BAA-1116 são abundantes em corais brasileiros, enquanto que V. mimicus VM573 é uma linhagem toxigênica (CT e TCP positiva) atípica desta espécie. Para identificar os ncRNAs através de análise in silico foram utilizadas ferramentas já disponíveis (Infernal e a base de dados Rfam) e programas em Perl desenvolvidos no presente trabalho. A ferramenta Infernal e a base de dados Rfam são baseados em modelo de covariância (CM), um caso especial de gramáticas estocásticas livres de contexto (SCFG). Foram identificados até 38 ncRNAs por espécie, os quais foram classificados em sete classes de acordo com sua função regulatória e /ou estrutural (riboswitches, moduladores da atividade de proteínas, RNAs antisenso de ação trans, RNAs antisenso de ação cis, ribonucleoproteinas, regulação por término de transcrição e classificação desconhecida). O grupo mais abundante foi o riboswitch, enquanto que o grupo menos abundante foi o ribonucleoproteina. Este trabalho demonstrou que os ncRNAs apresentam uma ampla diversidade de classes funcionais, estando possivelmente associados com a regulação de diferentes processos celulares em vibrio, incluindo a regulação da patogenicidade.
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