Atualmente, existe um grande número de ferramentas para montagem de fragmentos de DNA disponíveis. Neste trabalho apresentamos um estudo comparativo das ferramentas CAP2, FAKtory, TIGR e PHRAP. Para realizarmos este estudo, primeiramente executamos esses sistemas de montagem sobre 12 casos de testes distintos. Após isso, tomamos os resultados obtidos por cada um deles e os comparamos com as seqüências de onde os fragmentos foram originalmente obtidos. Os testes utilizados avaliam a eficiências dos programas com relação a três problemas associados ao processo de montagem (erros no sequenciamento, fragmentos quimeras e regiões repetidas) e pudemos ver que nenhum dos sistemas é claramente superior aos demais no tratamento de todos eles. Cada ferramenta de montagem parece tratar de melhor forma um problema em especial.Além de avaliarmos os resultados, realizamos também um estudo. / Noways, several peckages for DNA fragment assembly are aviable. In this wok we present a comparative study of the preformances of the programs CAP2, FAKtory, TIGR e PHrap. To get to our objetives, we firt ran each of these programs on twelve intances. After this,we compared the outputs with the sequences from wich the fragments were originally obtained. In this comparison,we took into consideration three problems related to fragments assembly (sequencing errors, chimeric fragments and repeats regions). We conclude that no one of the packages we tested is more efficient than the others when considering all the problems cited above. If we consider a particular problem, the we observed different performances among the programs. Even more, we compare the packages with respect to theirs to CPU times.

Problemas com a escrita podem afetar o desempenho de profissionais de maneira marcante, principalmente no caso de cientistas e acadêmicos que precisam escrever com proficiência e desembaraço não somente na língua materna, mas principalmente em inglês. Durante os últimos anos, ferramentas de suporte à escrita, algumas com enfoque em textos científicos, como o AMADEUS e o SciPo foram desenvolvidas e têm auxiliado pesquisadores na divulgação de suas pesquisas. Entretanto, a criação dessas ferramentas é baseada em córpus, sendo muito custosa, pois implica em selecionar textos bem escritos, além de segmentá-los de acordo com sua estrutura esquemática. Nesse mestrado estudamos, avaliamos e implementamos métodos de detecção automática da estrutura esquemática e de avaliação automática da qualidade de escrita de resumos científicos em inglês. Investigamos o uso de tais métodos para possibilitar o desenvolvimento de dois tipos de ferramentas: de detecção de bons resumos e de crítica. Nossa abordagem é baseada em córpus e em aprendizado de máquina supervisionado. Desenvolvemos um detector automático da estrutura esquemática, que chamamos de AZEA, com taxa de acerto de 80,4% eKappa de 0,73, superiores ao estado da arte (acerto de 73%, Kappa de 0,65). Experimentamos várias combinações de algoritmos, atributos e diferentes seções de um artigo científicos. Utilizamos o AZEA na implementação de duas dimensões de uma rubrica para o gênero científico, composta de 7 dimensões, e construímos e disponibilizamos uma ferramenta de crítica da estrutura de um resumo. Um detector de erros de uso de artigo também foi desenvolvido, com precisão é de 83,7% (Kappa de 0,63) para a tarefa de decidir entre omitir ou não um artigo, com enfoque no feedback ao usuário e como parte da implementação da dimensão de erros gramaticais da rubrica. Na tarefa de detectar bons resumos, utilizamos métodos usados com sucesso na avaliação automática da qualidade de escrita de redações com as implementações da rubrica e realizamos experimentos iniciais, ainda com resultados fracos, próximos à baseline. Embora não tenhamos construído um bom avaliador automático da qualidade de escrita, acreditamos que este trabalho indica direções para atingir esta meta, e forneça algumas das ferramentas necessárias / Poor writing may have serious implications for a professional\'s career. This is even more serious in the case of scientists and academics whose job requires fluency and proficiency in their mother tongue as well as in English. This is why a number of writing tools have been developed in order to assist researchers to promote their work. Here, we are particularly interested in tools, such as AMADEUS and SciPo, which focus on scientific writing. AMADEUS and SciPo are corpus-based tools and hence they rely on corpus compilation which is by no means an easy task. In addition to the dificult task of selecting well-written texts, it also requires segmenting these texts according to their schematic structure. The present dissertation aims to investigate, evaluate and implement some methods to automatically detect the schematic structure of English abstracts and to automatically evaluate their quality. These methods have been examined with a view to enabling the development of two types of tools, namely: detection of well-written abstracts and a critique tool. For automatically detecting schematic structures, we have developed a tool, named AZEA, which adopts a corpus-based, supervised machine learning approach. AZEA reaches 80.4% accuracy and Kappa of 0.73, which is above the highest rates reported in the literature so far (73% accuracy and Kappa of 0.65). We have tested a number of different combinations of algorithms, features and different paper sections. AZEA has been used to implement two out of seven dimensions of a rubric for analyzing scientific papers. A critique tool for evaluating the structure of abstracts has also been developed and made available. In addition, our work also includes the development of a classifier for identifying errors related to English article usage. This classifier reaches 83.7% accuracy (Kappa de 0.63) in the task of deciding whether or not a given English noun phrase requires an article. If implemented in the dimension of grammatical errors of the above mentioned rubric, it can be used to give users feedback on their errors. As regards the task of detecting well-written abstracts, we have resorted to methods which have been successfully adopted to evaluate quality of essays and some preliminary tests have been carried out. However, our results are not yet satisfactory since they are not much above the baseline. Despite this drawback, we believe this study proves relevant since in addition to offering some of the necessary tools, it provides some fundamental guidelines towards the automatic evaluation of the quality of texts

Problemas com a escrita podem afetar o desempenho de profissionais de maneira marcante, principalmente no caso de cientistas e acadêmicos que precisam escrever com proficiência e desembaraço não somente na língua materna, mas principalmente em inglês. Durante os últimos anos, ferramentas de suporte à escrita, algumas com enfoque em textos científicos, como o AMADEUS e o SciPo foram desenvolvidas e têm auxiliado pesquisadores na divulgação de suas pesquisas. Entretanto, a criação dessas ferramentas é baseada em córpus, sendo muito custosa, pois implica em selecionar textos bem escritos, além de segmentá-los de acordo com sua estrutura esquemática. Nesse mestrado estudamos, avaliamos e implementamos métodos de detecção automática da estrutura esquemática e de avaliação automática da qualidade de escrita de resumos científicos em inglês. Investigamos o uso de tais métodos para possibilitar o desenvolvimento de dois tipos de ferramentas: de detecção de bons resumos e de crítica. Nossa abordagem é baseada em córpus e em aprendizado de máquina supervisionado. Desenvolvemos um detector automático da estrutura esquemática, que chamamos de AZEA, com taxa de acerto de 80,4% eKappa de 0,73, superiores ao estado da arte (acerto de 73%, Kappa de 0,65). Experimentamos várias combinações de algoritmos, atributos e diferentes seções de um artigo científicos. Utilizamos o AZEA na implementação de duas dimensões de uma rubrica para o gênero científico, composta de 7 dimensões, e construímos e disponibilizamos uma ferramenta de crítica da estrutura de um resumo. Um detector de erros de uso de artigo também foi desenvolvido, com precisão é de 83,7% (Kappa de 0,63) para a tarefa de decidir entre omitir ou não um artigo, com enfoque no feedback ao usuário e como parte da implementação da dimensão de erros gramaticais da rubrica. Na tarefa de detectar bons resumos, utilizamos métodos usados com sucesso na avaliação automática da qualidade de escrita de redações com as implementações da rubrica e realizamos experimentos iniciais, ainda com resultados fracos, próximos à baseline. Embora não tenhamos construído um bom avaliador automático da qualidade de escrita, acreditamos que este trabalho indica direções para atingir esta meta, e forneça algumas das ferramentas necessárias / Poor writing may have serious implications for a professional\'s career. This is even more serious in the case of scientists and academics whose job requires fluency and proficiency in their mother tongue as well as in English. This is why a number of writing tools have been developed in order to assist researchers to promote their work. Here, we are particularly interested in tools, such as AMADEUS and SciPo, which focus on scientific writing. AMADEUS and SciPo are corpus-based tools and hence they rely on corpus compilation which is by no means an easy task. In addition to the dificult task of selecting well-written texts, it also requires segmenting these texts according to their schematic structure. The present dissertation aims to investigate, evaluate and implement some methods to automatically detect the schematic structure of English abstracts and to automatically evaluate their quality. These methods have been examined with a view to enabling the development of two types of tools, namely: detection of well-written abstracts and a critique tool. For automatically detecting schematic structures, we have developed a tool, named AZEA, which adopts a corpus-based, supervised machine learning approach. AZEA reaches 80.4% accuracy and Kappa of 0.73, which is above the highest rates reported in the literature so far (73% accuracy and Kappa of 0.65). We have tested a number of different combinations of algorithms, features and different paper sections. AZEA has been used to implement two out of seven dimensions of a rubric for analyzing scientific papers. A critique tool for evaluating the structure of abstracts has also been developed and made available. In addition, our work also includes the development of a classifier for identifying errors related to English article usage. This classifier reaches 83.7% accuracy (Kappa de 0.63) in the task of deciding whether or not a given English noun phrase requires an article. If implemented in the dimension of grammatical errors of the above mentioned rubric, it can be used to give users feedback on their errors. As regards the task of detecting well-written abstracts, we have resorted to methods which have been successfully adopted to evaluate quality of essays and some preliminary tests have been carried out. However, our results are not yet satisfactory since they are not much above the baseline. Despite this drawback, we believe this study proves relevant since in addition to offering some of the necessary tools, it provides some fundamental guidelines towards the automatic evaluation of the quality of texts

La presente tesis analiza los flujos de potencia y corrientes de corto circuito con ayuda del programa computacional ETAP versión 7.5, como objetivo es demostrar la influencia de la ampliación de nuevas cargas en la operación del sistema eléctrico de distribución de mina Marcapunta Norte exterior 10 kV y mina subterránea 4.16 kV – Sociedad Minera el Brocal S.A.A.; mediante el reforzamiento y cambio de configuración del sistema eléctrico

Tese de mestrado integrado. Engenharia Mecânica. Faculdade de Engenharia. Universidade do Porto. 2008

Tese de mestrado integrado. Engenharia Civil (especialização em Hidráulica). Faculdade de Engenharia. Universidade do Porto. 2008

Magíster en Tecnologías de la información / El presente trabajo se trata de la incorporaron de prácticas ágiles en una compañía proveedora de soluciones de software. Esta compañía se llama Telefónica MAking Solutions (TMAS), la cual es encargada de ser un colaborador en los negocios de Telefónica en Latinoamérica. Hay requerimientos que llegan desde los clientes, de menor magnitud para la compañía que resultan ineficientes si se abordan por el actual proceso de desarrollo. El equipo de Soporte Mejoras, que es donde se desarrolla este trabajo, es un equipo del área de Soporte encargado de realizar Gestión de Problemas. Ha estado incorporando prácticas ágiles en su trabajo, lo que ha hecho que áreas encargadas de la Gestión de los Clientes, vean a este equipo como posible apoyo para implementar los requerimientos medianos y pequeños, ya que las estimaciones resultan más acordes al tamaño de la solicitud, y hace que los clientes acepten estas implementaciones. Por lo tanto, el objetivo de este trabajo es incorporar prácticas ágiles de las metodologías XP y Scrum al proceso de desarrollo de la compañía y evaluar si estas logran un efecto positivo o negativo. Por lo que el alcance del trabajo es establecer un proceso de desarrollo utilizando prácticas ágiles acorde a la realidad de la compañía, el cual sirva como soporte de las actividades del equipo. La principal medida del resultado del trabajo es la Tasa de Rechazo, que es el porcentaje de rechazo por errores de las entregas que se liberan al cliente, la medición se realizó semestral. La compañía definió que un porcentaje semestral mayor al 20% se considera que las soluciones entregadas al cliente son de mala calidad. El primer semestre donde se aplico el trabajo se tuvo un resultado de 26,2% de rechazo y el ultimo semestre en donde se aplico la medición para este trabajo fue de un 8,3 % lo cual mejoro la calidad de los entregables. Los primeros cálculos el resultado fue de mala calidad, según lo que definió la compañía que una Tasa de Rechazo mayor a 15% es considerado un servicio de mala calidad, lo cual fue mejorando con el tiempo.

Submitted by Gabriela Carolina Martínez Morillo (gabrielacarolinam@gmail.com) on 2018-02-05T17:23:52Z No. of bitstreams: 1 Dissertaçao Gabriela C. M. Morillo.pdf: 8290773 bytes, checksum: bc0329ca8d6a63d8dc92c197f8b0946f (MD5) / Approved for entry into archive by Vanessa Reis (vanessa.jamile@ufba.br) on 2018-02-06T10:24:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertaçao Gabriela C. M. Morillo.pdf: 8290773 bytes, checksum: bc0329ca8d6a63d8dc92c197f8b0946f (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-06T10:24:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertaçao Gabriela C. M. Morillo.pdf: 8290773 bytes, checksum: bc0329ca8d6a63d8dc92c197f8b0946f (MD5) / CAPES / Esta dissertação tem como objetivo estudar o Método dos Elementos Discretos (DEM) também conhecido como Método das Partículas, para a sua aplicação na mecânica dos solo, específicamente para o cálculo das tensões em materiais granulares sem coesão. Inicialmente são apresentados aspectos teóricos da mecânica dos solos e as propriedades físicas de alguns tipos de materiais granulares, a serem utilizadas na aplicação dos exemplos numéricos. Posteriormente, é apresentada a formulação do Método das Partículas correspondendo às equações de movimiento e das forças atuantes em cada partícula. Para isto, são definidos a segunda lei de Newton, a lei de Forcas-Deslocamentos, o modelo de contato de Hertz e alguns conceitos da mecânica das partículas. Descreve-se também o processo de integração no tempo e o algoritmo de solução numérica apresentado por T. I. Zohdi. Adicionalmente, é descrito um novo processo de otimização para a deteção de contato, diminuindo sensivelmente o custo computacional e, consequentemente o tempo de análise. Finalmente, são apresentados nesta pesquisa alguns exemplos básicos da física, necessários para a validação da formulação e a posterior aplicação do método na mecânica dos solos. Os resultados obtidos com o programa desenvolvido nesta pesquisa são comparados com os resultados da mecânica dos solos, mediante a utilização do programa de simulação numérica GeoStudio. Para a representação gráfica dos resultados, utilizou-se do programa de interfase gráfica GiD. / This work has as objective to study the Discrete Element Method (DEM), also known as the Particle Method, for its aplication in the soil mechanics, specifically to calculate the tension acting on granular materials without cohesion. At first, theoretical aspects of soil mechanics and the physical properties of some types of granular materials are presented, the material properties are used afterwards on the numerical examples. Following this, the Particle Method formulation is descrived, corresponding to the force and movement equations acting on each particle. For that, Newton’s second law, the Force-Displacement law, Hertz’s contact law and some concepts from particle mechanics are defined. In this work, the integration over time process and the numerical solution algorithm presented by T. I. Zohdi are also described. Aditionally, a new optimization process for contact detection is described, one on which diminishes computational costs and therefore analysis time significantly. Finally, some basic physics examples necessary for the formulation validation and application in ground mechanics are presented in this research. The results obtained with the software developed on this research are then compared with the soil mechanics results, which are simulated using the GeoStudio software. For the result’s graphical presentation, the GiD application was utilized.

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Atualmente, existe um grande número de ferramentas para montagem de fragmentos de DNA disponíveis. Neste trabalho apresentamos um estudo comparativo das ferramentas CAP2, FAKtory, TIGR e PHRAP. Para realizarmos este estudo, primeiramente executamos esses sistemas de montagem sobre 12 casos de testes distintos. Após isso, tomamos os resultados obtidos por cada um deles e os comparamos com as seqüências de onde os fragmentos foram originalmente obtidos. Os testes utilizados avaliam a eficiências dos programas com relação a três problemas associados ao processo de montagem (erros no sequenciamento, fragmentos quimeras e regiões repetidas) e pudemos ver que nenhum dos sistemas é claramente superior aos demais no tratamento de todos eles. Cada ferramenta de montagem parece tratar de melhor forma um problema em especial.Além de avaliarmos os resultados, realizamos também um estudo. / Noways, several peckages for DNA fragment assembly are aviable. In this wok we present a comparative study of the preformances of the programs CAP2, FAKtory, TIGR e PHrap. To get to our objetives, we firt ran each of these programs on twelve intances. After this,we compared the outputs with the sequences from wich the fragments were originally obtained. In this comparison,we took into consideration three problems related to fragments assembly (sequencing errors, chimeric fragments and repeats regions). We conclude that no one of the packages we tested is more efficient than the others when considering all the problems cited above. If we consider a particular problem, the we observed different performances among the programs. Even more, we compare the packages with respect to theirs to CPU times.