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Re-engenharia do software SCMS para uma linguagem orientada a objetos (JAVA) para uso em construções de phantoms segmentados / Reengineering the SCMS software for object-oriented language (JAVA) to use in creating phantoms segmented

POSSANI, RAFAEL G. 09 October 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2014-10-09T12:32:58Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2014-10-09T14:06:11Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Dissertação (Mestrado) / IPEN/D / Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP
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Dosimetria em tomografia computadorizada e avaliação do perfil de dose empregando dosímetro fricke gel e a técnica de imageamento por ressonância magnética / Dosimetry for computed tomography and evaluation the dose profile using fricke gel dosimetry and magnetic ressonance imaging

CAPELETI, FELIPE F. 10 November 2014 (has links)
Submitted by Claudinei Pracidelli (cpracide@ipen.br) on 2014-11-10T10:43:39Z No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2014-11-10T10:43:39Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Dissertação (Mestrado em Tecnologia Nuclear) / IPEN/D / Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP
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Avaliação das reações adversas agudas após administração endovenosa de contraste iodado iônico e não-iônico em hospital oncológico /

Cremonini, Camila do Carmo Rodrigues. January 2010 (has links)
Orientador: Euclides Timótio da Rocha / Banca: Fabiano Rubião Lucchesi / Banca: Jorge Elias Junior / Resumo: Avaliar a ocorrência e a gravidade das reações adversas agudas (RAA) com o uso do meio de contraste iodado iônico e não-iônico nos pacientes submetidos ao exame de tomografia computadorizada (TC) em hospital nacional terciário oncológico e avaliar neoplasia como possível risco para RAA. Secundariamente, avaliar o impacto do uso seletivo do meio de contraste iodado nos custos. Pacientes submetidos à TC com contraste iodado entre outubro de 2007 e agosto de 2008 foram avaliados quanto à ocorrência e à gravidade das reações adversas agudas aos meios de contrastes iônicos e nãoiônicos. As reações foram categorizadas em leve, moderada ou grave de acordo com o tipo dos sinais e sintomas e classificadas como agudas pelo tempo de ocorrência, desde o momento da injeção até 30 minutos após. Os testes do quiquadrado e exato de Fisher foram utilizados para análise estatística da ocorrência de RAA em relação às variáveis de gênero e idade. O estudo foi aprovado pelo Comitê de Ética local e o Termo de Consentimento Livre Esclarecido foi obtido. Houve 78 RAA ao contraste iodado iônico e 11 ao não-iônico, com uma ocorrência global de 3,3% (78/2.339) e 0,5% (11/2.216), respectivamente. A maioria das reações foi classificada como leve em ambos os grupos, representando 91% (71) no grupo iônico e 81,8% (9) no grupo não-iônico. As demais reações foram do tipo moderada não havendo nenhuma reação grave. Em relação ao início das RAA, 71% e 73% (iônico e não-iônico) ocorreram nos primeiros 5 minutos. A freqüência de RAA no grupo em que recebeu contraste iônico foi maior no sexo feminino (p < 0,001). No grupo não-iônico não houve diferença estatisticamente significativa entre os sexos (p = 1,0). Não houve associação entre a presença de reação aguda e as faixas... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: To evaluate the occurrence and severity of acute adverse reactions (AAR) to iodinated ionic and non-ionic contrast media in patients undergoing computerized tomography (CT) at a national tertiary cancer hospital and to evaluate neoplasm as a possible risk for AAR. Secondly, to assess the impact of selective use of iodinated contrast agent costs. Patients who underwent contrast-enhanced CT between October 2007 and August 2008 were evaluated for the presence and severity of acute adverse reactions to ionic and non-ionic contrast media. The reactions were categorized as mild, moderate or severe according to the type of signs and symptoms and classified as acute by the time of occurrence, from the time of the injection up to 30 minutes afterwards. The chi-square and Fisher's exact were used for statistical analysis of the occurrence of AAR for the variables of gender and age. The study was approved by the local Ethics Committee and informed consent was obtained. There were 78 AAR to ionic iodinated contrast and 11 to non-ionic, with an overall occurrence of 3.3% (78/2339) and 0.5% (11/2216), respectively. Most reactions were classified as mild in both groups, representing 91% (71) in the ionic group and 81.8% (9) in the non-ionic group. All other reactions were moderate and there were no severe reactions. Regarding onset of AAR, 71% and 73% (ionic and non-ionic group) occurred in the first five minutes. The occurrence of AAR in the group who received ionic contrast was higher in females (p <0.001). As for the non-ionic group, there was no significant statistical difference between genders (p = 1.0). There was no association between the presence of acute reaction and the age groups of the population in the ionic contrast group. For the non-ionic group, no statistical analysis was performed as the sample was deemed reduced. Among... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Estudo da prevalência da posição vestíbulo-lingual do canal mandibular por meio da tomografia computadorizada helicoidal / Prevalency study of the vestibulo-lingual position from the mandibular canal by helical computerized tomography

Cláudio Tizzani Coppedé 23 September 2008 (has links)
O trajeto do canal da mandíbula é oblíquo com sentido póstero-anterior, apresenta-se próximo da cortical óssea alveolar medial, até atingir a face mesial do primeiro molar inferior, a partir desta região aproxima-se da lâmina óssea alveolar lateral até alcançar o forame mentual. Radiograficamente, o canal da mandíbula se apresenta, como uma linha radiolúcida delimitada por duas linhas radiopacas. Existem diversos métodos de exames radiográficos que possibilitem a avaliação do complexo maxilo-mandibular. Estudos mostram que a Tomografia Computadorizada (TC) foi considerado o melhor método para a avaliação do trajeto no sentido vestíbulo-lingual do canal da mandíbula. Foi proposto analisar a morfologia no sentido vestíbulo-lingual das variações do trajeto do canal da mandíbula em imagens de TC utilizando o software Dental Slice®. Com a ferramenta mensuração deste software , avaliou-se 100 TC bilateralmente, criando-se três retas. Uma horizontal (vestíbulo-lingual), dividindo o canal ao meio, e duas retas verticais, tangenciando a face externa lingual e vestibular da cortical do canal. Para análise dos dados utilizou os testes de normalidade, teste de hipótese (teste t e ANOVA) e teste de aderência Anderson Darling. Concluiu-se que existe uma tendência da presença de pouca variabilidade, entre os lados direito e esquerdo; a porção do canal mais próxima ao forame mentual apresenta-se vestibularizado, e na região posterior lingualizado; há necessidade da avaliação topográfica do canal da mandíbula por meio da Tomografia Computadorizada. / The course of the mandibles canal is oblique with posterior-anterior direction, it comes close to the medial cortical alveolar bony, until reaching the mesial face of the first inferior molar, starting from this area, it approaches of the lateral cortical alveolar bony until reaching the forame mentual. Radiographically, the manbible´s canal comes, as a radiolucent line defined by two radiopaque lines. Several methods of exams radiographyc that facilitate the evaluation of the complex maxilo-mandibular. Studies show that the Computerized Tomography (TC) is the best method for consider the evaluation of the course in the vestibule-lingual direction of the mandibles canal. It was intended to analyze the morphology in the vestibule-lingual direction of the variations of the course the mandibles canal in images of TC using the Dental Slice® software. With the mensuration tool of this software, 100 TC was evaluated bilaterally, being created three straight line. A horizontal one (vestibule-lingual), dividing the canal in the middle, and two vertical straight line, being tangent to the lingual external face and vestibular of the canals cortical. For analysis of the data it used the normality tests, hypothesis test (tests t and ANOVA) and test of adherence Anderson Darling. It conclude that a tendency exists the presence of little variability, among the sides right and left. The canal close to the forame mentual presents vestibular direction, and in the posterior area on lingual direction. And Confirm the need of the use of TC in the topographical evaluation of the mandibles canal.
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Avaliacao da radiomarcacao da enexina A5 com tecnecio-99m: influencia do metodo de marcacao nas propriedades fisico-quimicas e biologicas do composto / Evaluation of radiolabeling of annexing A5 with technetium-99m: influence of the labeling methods on physico-chemical and biological properties of the compounds

SANTOS, JOSEFINA da S. 09 October 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2014-10-09T12:27:01Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2014-10-09T13:58:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Anexina A5 (ANXA5) é uma proteína intracelular humana de 36kDa com alta afinidade pela fosfatidilserina que é seletivamente externalizada na superfície de células apoptóticas. A apoptose apresenta um papel importante na fisiologia normal e em numerosos estados patológicos. A aplicação clínica da ANXA5 em imagem da apoptose tem sido desenvolvida em oncologia, transplante de órgãos e doenças cardiovasculares. Várias estratégias para radiomarcação da proteína têm sido descritas, incluindo marcação direta, derivatização com quelante bifuncional (BFC), produção de proteína mutante ou peptídeos análogos. Muitas técnicas de marcação com 99mTc têm sido descritas utilizando diferentes núcleos, tais como [Tc=O]+3, [99mTc]HYNIC, [TcºN]+2 e [Tc(CO3)]+1. Neste estudo, avaliamos a influência do núcleo de 99mTc no comportamento biológico e propriedades físico-químicas da anexina radiomarcada. A radiomarcação utilizando o núcleo [TcºN]+2 foi realizada em duas etapas incluindo a reação do 99mTcO4 - com SDH na presença de SnCl2 e PDTA para obter o intermediário 99mTcN-SDH, seguida da adição de ANXA5. Os resultados obtidos não estão em acordo com a literatura, apesar da alta eficiência na produção do intermediário. O núcleo [Tc=O]+3 foi produzido usando a etilenodicisteina 7 (EC) como BFC. Para derivatização empregou-se o TSTU para obter o éster succinato correspondente. Diferentes razões de ANXA5:EC foram estudadas e todas as condições de marcação resultaram em alta pureza radioquímica, porém diferenças foram observadas na lipofilicidade, estabilidade, distribuição biológica e afinidade por células apoptóticas. A ANXA5-HYNIC também produziu a proteína radiomarcada com alta pureza radioquímica. A estabilidade das ANXA5 radiomarcadas foi avaliada após incubação à temperatura ambiente, a 28°C e em incubação em soro humano a 37°C. A análise destes resultados demonstrou que a ANXA5- EC-99mTc (razão 10-2) foi o composto mais estável em todas as condições estudadas. O ensaio de coeficiente de partição demonstrou que os compostos do EC apresentam uma menor lipossolubilidade em relação a ANXA5-HYNIC-99mTc. A atividade biológica das anexinas radiomarcadas foi avaliada em células PC-3 com apoptose radioinduzida demonstrando que a ANXA5-EC-99mTc (razão 10-2) foi a proteína com maior porcentagem de ligação específica. A biodistribuição in vivo das anexinas radiomarcadas demonstrou uma alta captação na região abdominal, especialmente para a ANXA5-HYNIC-99mTc. Os resultados indicam que ANXA5-EC-99mTc (razão 10-2) pode ser uma alternativa atrativa para o uso da ANXA5-HYNIC-99mTc em imagem de receptores de fosfatidilserina. / Tese (Doutoramento) / IPEN/T / Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP
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Re-engenharia do software SCMS para uma linguagem orientada a objetos (JAVA) para uso em construções de phantoms segmentados / Reengineering the SCMS software for object-oriented language (JAVA) to use in creating phantoms segmented

POSSANI, RAFAEL G. 09 October 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2014-10-09T12:32:58Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2014-10-09T14:06:11Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Metodologias recentes de planejamento dependem fortemente de imagens de tomografia computadorizada e a tendência é que os procedimentos de dosimetria interna na terapia usando medicina nuclear também sejam baseados em imagens, tais como, imagens de ressonância magnética (RM) e tomografia computadorizada (TC), que extraem informações anatômicas e histológicas, bem como, imagens funcionais ou mapas de atividades, provenientes de PET e SPECT. Estas informações, associadas a um software de transporte de radiação, são utilizadas para estimar a dose interna em pacientes submetidos a tratamento em medicina nuclear. Este trabalho visa a re-engenharia do SCMS, que é um software de interface entre o código MCNP e as imagens médicas, que carregam as informações do paciente em tratamento. Em outras palavras, as informações necessárias contidas nas imagens são interpretadas e apresentadas em um formato específico para o código MCNP, que executa a simulação do transporte de radiação. Portanto, o usuário não precisa compreender o complexo processo de introdução de parâmetros do MCNP, pois o SCMS é responsável por construir automaticamente dados anatômicos do paciente, bem como, os dados da fonte radioativa. O SCMS foi originalmente desenvolvido em Fortran-77 e neste trabalho, ele foi reescrito em uma linguagem orientada a objetos (JAVA). Novas funcionalidades e opções de dados também foram incorporadas ao software. Assim, o novo software tem uma série de melhorias, tais como interface gráfica intuitiva e um menu para a seleção do espectro de energia correspondente a um radioisótopo específico, armazenado em um banco de dados XML. A nova versão também trabalha com uma maior quantidade de materiais e o usuário pode especificar uma região de interesse na tomografia computadorizada para o cálculo da dose absorvida. / Dissertação (Mestrado) / IPEN/D / Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP
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Dosimetria em tomografia computadorizada e avaliação do perfil de dose empregando dosímetro fricke gel e a técnica de imageamento por ressonância magnética / Dosimetry for computed tomography and evaluation the dose profile using fricke gel dosimetry and magnetic ressonance imaging

CAPELETI, FELIPE F. 10 November 2014 (has links)
Submitted by Claudinei Pracidelli (cpracide@ipen.br) on 2014-11-10T10:43:39Z No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2014-11-10T10:43:39Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Neste trabalho foi desenvolvido um novo método para a determinação das doses absorvidas nos exames de tomografia computadorizada, utilizando a dosimetria com Fricke gel desenvolvido no IPEN. Foram determinadas as doses absorvidas por diferentes metodologias de análise, como a espectrometria de absorção óptica, câmaras de ionização e imageamento por ressonância magnética. Foram realizados testes de limite mínimo de sensibilidade da solução de Fricke gel, repetitividade de sinal da solução de Fricke gel e dos equipamentos de tomografia computadorizada, sensibilidade de detecção, entre outros. Foram utilizados diferentes equipamentos de tomografia computadorizada com múltiplos detectores. A solução Fricke gel apresentou repetitividade melhor que &plusmn; 5,5% utilizando a técnica de espectrofotometria de absorção óptica e os equipamentos de tomografia computadorizada apresentaram repetitividade melhor que &plusmn; 0,2%. Foi desenvolvido um objeto simulador de crânio preenchido com a solução Fricke gel para a determinação da colimação total do equipamento e a distribuição de dose utilizando a técnica de imageamento tridimensional por ressonância magnética. A solução Fricke gel apresenta um preparo fácil e relativamente rápido, porém é necessária atenção para não haver contaminação e perder a solução. Com os resultados obtidos foi confirmada a aplicação deste tipo de dosimetria para os equipamentos de tomografia computadorizada. / Dissertação (Mestrado em Tecnologia Nuclear) / IPEN/D / Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN-CNEN/SP
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Algoritmos incrementais com aplicações em tomografia computadorizada / Incremental algorithms with applications to computerized tomography

Helou Neto, Elias Salomão 13 August 2018 (has links)
Orientador: Alvaro Rodolfo De Pierro / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica / Made available in DSpace on 2018-08-13T11:27:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 HelouNeto_EliasSalomao_D.pdf: 7993687 bytes, checksum: 12333395c593dd0cbddf79352f61c458 (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: O problema de viabilidade convexa é um campo fértil de pesquisa que deu origem a uma grande quantidade de algoritmos iterativos, tais como pocs, art, Cimmino e uma miríade de variantes. O motivo para tal interesse é o amplo leque de aplicabilidade que algoritmos gerais para a solução de problemas desse tipo podem alcançar. Dentre tais aplicações encontra-se a reconstrução de imagens em tomografia, caso que geralmente apresenta uma estrutura especial de esparsidade e tamanhos gigantescos. Também bastante estudados por seu interesse prático e teórico são problemas envolvendo a minimização irrestrita de funções convexas. Aqui, novamente, a variada gama de aplicações torna impossível mencionar uma lista minimamente abrangente. Dentre essas a tomografia é, outra vez, um exemplo de grande destaque. No presente trabalho desenvolvemos uma ponte que permite o uso de uma variedade de métodos para viabilidade em conjunto com algoritmos de otimização para obter a solução de problemas de otimização convexa com restrições. Uma teoria geral de convergência é apresentada e os resultados teóricos são especializados em métodos apropriados para problemas de grande porte. Tais métodos são testados em experimentos numéricos envolvendo reconstrução de imagens tomográficas. Esses testes utilizam-se da teoria de amostragem compressiva desenvolvida recentemente, através da qual conseguimos obter resultados sem par na reconstrução de imagens tomográficas a partir de uma amostragem angular altamente esparsa da transformada de Radon. Imagens obtidas a partir de dados simulados são recuperadas perfeitamente com menos de 1/20 das amostras classicamente necessárias. Testes com dados reais mostram que o tempo de uma leitura spect pode ser reduzido a até 1/3 do tempo normalmente utilizado, sem grande prejuízo para as reconstruções. / Abstract: The convex feasibility problem is a research field which has originated a large variety of iterative algorithms, such as pocs, art, Cimmino and a myriad of variants. The reason for such interest is the wide array of applicability that general algorithms for this kind of problem may reach. Among such applications there is tomographic image reconstruction, instance that generally presents a special sparsity structure and huge sizes. Also widely studied because its practical and theoretical interests are problems involving unconstrained minimization of convex functions. Here, again, the huge array of applications makes it impossible to mention even a minimal list. Among these, once more, tomography is a major example. In the present work we have developed a bridge that allows the use of a variety of methods for feasibility in conjunction with optimization algorithms in order to obtain the solution for convex optimization problems with restrictions. A general convergence theory is presented and the theoretical results are specialized into methods useful for large scale problems. These methods are tested in experiments involving tomographic image reconstruction. Such tests make use of the recently developed compressive sensing theory, through which we have been able to obtain unmatched results in tomographic image reconstruction from highly sparse angular sampling from the Radon transform. Images obtained from simulated data are perfectly reconstructed using less than 1/20 from the classically needed. Tests with real data show that the time of a spect scan can be reduced to 1/3 of the usual, without too much image deterioration. / Doutorado / Matematica Aplicada / Doutor em Matemática Aplicada
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Morphometric Analysis of the Talus on the Cohort of Healthy and Arthritic Patient Population:

Arvaneh, Tia 28 June 2017 (has links)
Prevalence of osteoarthritis (OA) is less common in the ankle compared to other joints; however, deformation brought on by degeneration causes pain, loss of function, and overall decreased quality of life. Current surgical interventions for end-stage ankle OA are not as reliable as surgical treatments for other joints. Ankle arthroplasty currently has high failure rates, and there are lack of substantial data from long-term outcome studies. By understanding the morphometric changes that occur during the different stages of OA, we are able to identify early signs of the disease with the intention to apply treatment earlier in order to preclude the need for end-stage surgical intervention. The goals of this study are to assess morphometric parameters of the talus as it relates to the progression of OA and to evaluate the effect of gender and anatomical side. A retrospective study was performed where data from sixty-eight CT scans were obtained from two study groups, one with OA and one without. The subjects were segmented, standardized, and normalized in order to study several 3D parameters of the talus, including height, radius of curvature, and volume. Results showed that talar morphometry is influenced by gender and that geometric changes are a function of OA progression. The lateral radii of subjects with OA was significantly larger than those of normal ankles (p<0.0001), and there is evidence of inherent changes between KL grades (p=0.0003). Identifying morphometric changes of the talus at each stage of OA can inherently contribute to better understanding the degenerative process. Assessing specific characteristics at earlier stages of the diseases may help clinicians to diagnose more accurately and to better provide treatment.
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Image-Based 3D Morphometric Analysis of the Clavicle Intramedullary (IM) Canal

Aira, Jazmine 23 March 2016 (has links)
Midshaft clavicle fractures are very common. Current treatment of choice involves internal fixation with superior or anterior clavicle plating, however their clinical success and patient satisfaction are slowly decreasing. The design of intramedullary (IM) devices is on the rise, but data describing the IM canal parameters is lacking. The aim of this study is to quantify morphometry of the clavicle and its IM canal, and to evaluate the effect of gender and anatomical side. This study used 3-dimensional (3D) image-based models with novel and automated methods of standardization, normalization and bone cross-section evaluation. The data obtained in this thesis presents IM canal and clavicle radius and center deviation parameterized as a function of clavicle length, in addition, its radius of curvature and true length. Results showed that right-sided clavicles tended to be shorter and thicker than left-sided, but only males showed a statistically significant difference in size compared to females (p<.0001). The smallest IM canal and clavicle radii were seen at different clavicle lengths (54% and 49%), suggesting that the narrowest region of IM canal cannot be appreciated based on external visualization of the clavicle alone. The narrowing of the IM canal is of special interest because this a potential limiting region for IM device design. Furthermore, the location and value of maximum lateral curvature displacement is different in the IM canal, implying there exists an eccentricity of the IM canal center with respect to the clavicle center.

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