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Estudo das correlações em líquidos clássicos / Study of the correlations in classical liquids

José Pedro Rino 16 December 1983 (has links)
Neste trabalho estudamos três diferentes sistemas de fluidos clássicos. No primeiro, esferas de poliestireno adsorvidas em água, o potencial de interação é do tipo dipolar (1/r3). As funções de correlação radial e fator de estrutura estático bem como a energia de correlação e energia livre de Helmholtz foram obtidas na aproximação das equações integral HNC. 0s resultados obtidos estão em excelente concordância com os resultados \"exatos\" de dinâmica Molecular. No segundo sistema, elétrons em superfície de hélio líquido adsorvido em um substrato, generalizamos o trabalho de Studart e Hipólito bem como o de Monarkha ao considerarmos qualquer tipo de substrato e qualquer espessura do filme de hélio. Utilizando a aproximação de Campo Auto Consistente obtivemos o fator de estrutura estático, energia de correlação e relação de dispersão. As correlações de curto alcance, responsáveis pela correção do campo local, corrigem de maneira sensível os resultados da aproximação das fases aleatórias (RPA) . No terceiro, um sistema de esferas duras carregadas, utilizamos a aproximação de Campo Auto Consistente e obtivemos o fator de estrutura estático, função de correlação de pares, equação de estado e energia de correlação. Obtivemos, pela primeira vez, a relação de dispersão deste plasma de uma componente generalizado. Este sistema é particularmente interessante pois em primeira aproximação descreve eletrólitos e sais fundidos. / We have studied in this work three different classic fluid systems. The first one, formed by polystyrene spheres adsorbed on water, can be described by a dipolar (1/r3) interaction. Theradial correlation function and static structure factor as well the correlation energy and Helmholtz free energy were obtained in the framework of the Hypernetted Chain (HNC) Integral Approximation. Our results were in excell entagreement with the \"exact\" results from Molecular Dynamics techniques. The second system consists of electrons trapped on the liquid helium films wetting a solid substrate . In this case, we have generalized the works of Studart and Hipolito, and Monarkha, by analysing the influence of the film thickness and different kinds of substrates. By using the Self-Consistent Field Approximation (SCFA), we have evaluated the static structure factor, correlation energy and plasma dispersion relation . The local field correction, responsible by the short-range correlation , modifies drastically the results from the Random-Phase Approximation (RPA). In the third system, a charged hard sphere fluid , we have determined, by using SCFA, some properties of this many-body system such as the static structure factor, pair correlation function, the equation of state and correlation energy. For the first time , we have calculated the plasma dispersion relation of this generalized one-component plasma. This system is very interesting because, in a first approximation, it can describe eletrolytes and molten salts.
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Estudo das correlações em líquidos clássicos / Study of the correlations in classical liquids

Rino, José Pedro 16 December 1983 (has links)
Neste trabalho estudamos três diferentes sistemas de fluidos clássicos. No primeiro, esferas de poliestireno adsorvidas em água, o potencial de interação é do tipo dipolar (1/r3). As funções de correlação radial e fator de estrutura estático bem como a energia de correlação e energia livre de Helmholtz foram obtidas na aproximação das equações integral HNC. 0s resultados obtidos estão em excelente concordância com os resultados \"exatos\" de dinâmica Molecular. No segundo sistema, elétrons em superfície de hélio líquido adsorvido em um substrato, generalizamos o trabalho de Studart e Hipólito bem como o de Monarkha ao considerarmos qualquer tipo de substrato e qualquer espessura do filme de hélio. Utilizando a aproximação de Campo Auto Consistente obtivemos o fator de estrutura estático, energia de correlação e relação de dispersão. As correlações de curto alcance, responsáveis pela correção do campo local, corrigem de maneira sensível os resultados da aproximação das fases aleatórias (RPA) . No terceiro, um sistema de esferas duras carregadas, utilizamos a aproximação de Campo Auto Consistente e obtivemos o fator de estrutura estático, função de correlação de pares, equação de estado e energia de correlação. Obtivemos, pela primeira vez, a relação de dispersão deste plasma de uma componente generalizado. Este sistema é particularmente interessante pois em primeira aproximação descreve eletrólitos e sais fundidos. / We have studied in this work three different classic fluid systems. The first one, formed by polystyrene spheres adsorbed on water, can be described by a dipolar (1/r3) interaction. Theradial correlation function and static structure factor as well the correlation energy and Helmholtz free energy were obtained in the framework of the Hypernetted Chain (HNC) Integral Approximation. Our results were in excell entagreement with the \"exact\" results from Molecular Dynamics techniques. The second system consists of electrons trapped on the liquid helium films wetting a solid substrate . In this case, we have generalized the works of Studart and Hipolito, and Monarkha, by analysing the influence of the film thickness and different kinds of substrates. By using the Self-Consistent Field Approximation (SCFA), we have evaluated the static structure factor, correlation energy and plasma dispersion relation . The local field correction, responsible by the short-range correlation , modifies drastically the results from the Random-Phase Approximation (RPA). In the third system, a charged hard sphere fluid , we have determined, by using SCFA, some properties of this many-body system such as the static structure factor, pair correlation function, the equation of state and correlation energy. For the first time , we have calculated the plasma dispersion relation of this generalized one-component plasma. This system is very interesting because, in a first approximation, it can describe eletrolytes and molten salts.
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Análise estrutural do colágeno do tipo I - correlação estrutura : atividade biológica / Structural analysis of type I collagen : structure activities relationships

Goissis, Ana Paula Abdalla 02 March 2007 (has links)
Além das funções mecânicas, sabe-se que o colágeno do tipo I é um dos componentes mais ativos na modulação das atividades biológicas que ocorrem na matriz extracelular (MEC) tais como a adesão celular, a coagulação e a mineralização do osso. Estes eventos ocorrem nos limites do período D, que é provavelmente o domínio funcional que mais prevalece em relação à transferência da informação extracelular para o interior da célula. O objetivo deste trabalho foi estudar as correlações existentes entre as atividades biológicas da MEC e as características estruturais do colágeno do tipo I, principalmente em relação à distribuição topográfica dos aminoácidos (aa) ácidos, básicos e hidrofóbicos. A metodologia empregada foi baseada em informações já existentes sobre a estrutura colágeno do tipo I e suas atividades relacionadas com a MEC. Os resultados mostraram que aa ácidos, básicos e hidrofóbicos formam duas regiões distintas. Em uma delas, aa ácidos e básicos se alojam em áreas delimitadas por aa hidrofóbicos; na outra, aa básicos, ácidos e hidrofóbicos formam aglomerados localizados principalmente nas proximidades dos limites Overlap:Gap. Exceto para os eventos de natureza estrutural são as regiões do colágeno do tipo I mais envolvidas na modulação das atividades da MEC, com a interface Overlap:Gap funcionando como um divisor do controle destas atividades. Enquanto 83,2% das atividades de adesão estão localizadas na zona do Overlap, 93,3% das atividades de natureza estruturais ocorrem a partir da zona limite Overlap:Gap e em direção à zona Gap. Embora nenhuma correlação possa ter sido estabelecida para a resultante de carga, sugere-se que a participação do colágeno do tipo I nas atividades da MEC, possa estar associada a diferenças de interações dos ligantes (carga, massa molecular e hidrofobicidade) com gradientes eletrostático e hidrofóbico existentes ao longo do período D. / Besides mechanical function, it is known today that type I collagen plays a major role in the modulation of many of the activities occurring in the extra-cellular matrix (ECM) such as cell adhesion, coagulation cascade and mineral deposition during bone formation. All these events occur by interaction of cells and ligands within the D-period of collagen microfibrill assembly, which is perhaps the most prevalent module of ECM information in the body. The purpose of this work was the study of correlations between the biological activities of ECM and the structural features of collagen associated with the distribution of acidic, basic and hydrophobic amino acids (aa) within the D period. The methodology used was based on existing information with respect to the structure of type I collagen and its function with respect to ECM activities. The results showed that acidic, basic and hydrophobic aa are found in two major distinct regions: one in which acidic and basic aa are located in areas defined by hydrophobic aa barriers; the other in which acidic, basic and hydrophobic aa forming clusters located preferentially in the boundaries of the Overlap:Gap zones. Except for the structural event, these clusters are the major sites for the interaction involving cell adhesion. The results also suggest that the Overlap:Gap interface function as a borderline for collagen interactions with ECM since 83,2% of the activities related to cell adhesion are located in the Overlap region while 93,3% of the activities of structural nature are enclosed within the limiting zone of Overlap:Gap to the direction of the Gap zone. Although no correlation could be established for net charge along the D period it is suggested that type I collagen participation in the activities of the ECM may also be associated to differences in ligand interactions (charge, molecular mass and hydrophobicity) with the electrostatic and the hydrophobic gradients that exists within the D period.
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Análise estrutural do colágeno do tipo I - correlação estrutura : atividade biológica / Structural analysis of type I collagen : structure activities relationships

Ana Paula Abdalla Goissis 02 March 2007 (has links)
Além das funções mecânicas, sabe-se que o colágeno do tipo I é um dos componentes mais ativos na modulação das atividades biológicas que ocorrem na matriz extracelular (MEC) tais como a adesão celular, a coagulação e a mineralização do osso. Estes eventos ocorrem nos limites do período D, que é provavelmente o domínio funcional que mais prevalece em relação à transferência da informação extracelular para o interior da célula. O objetivo deste trabalho foi estudar as correlações existentes entre as atividades biológicas da MEC e as características estruturais do colágeno do tipo I, principalmente em relação à distribuição topográfica dos aminoácidos (aa) ácidos, básicos e hidrofóbicos. A metodologia empregada foi baseada em informações já existentes sobre a estrutura colágeno do tipo I e suas atividades relacionadas com a MEC. Os resultados mostraram que aa ácidos, básicos e hidrofóbicos formam duas regiões distintas. Em uma delas, aa ácidos e básicos se alojam em áreas delimitadas por aa hidrofóbicos; na outra, aa básicos, ácidos e hidrofóbicos formam aglomerados localizados principalmente nas proximidades dos limites Overlap:Gap. Exceto para os eventos de natureza estrutural são as regiões do colágeno do tipo I mais envolvidas na modulação das atividades da MEC, com a interface Overlap:Gap funcionando como um divisor do controle destas atividades. Enquanto 83,2% das atividades de adesão estão localizadas na zona do Overlap, 93,3% das atividades de natureza estruturais ocorrem a partir da zona limite Overlap:Gap e em direção à zona Gap. Embora nenhuma correlação possa ter sido estabelecida para a resultante de carga, sugere-se que a participação do colágeno do tipo I nas atividades da MEC, possa estar associada a diferenças de interações dos ligantes (carga, massa molecular e hidrofobicidade) com gradientes eletrostático e hidrofóbico existentes ao longo do período D. / Besides mechanical function, it is known today that type I collagen plays a major role in the modulation of many of the activities occurring in the extra-cellular matrix (ECM) such as cell adhesion, coagulation cascade and mineral deposition during bone formation. All these events occur by interaction of cells and ligands within the D-period of collagen microfibrill assembly, which is perhaps the most prevalent module of ECM information in the body. The purpose of this work was the study of correlations between the biological activities of ECM and the structural features of collagen associated with the distribution of acidic, basic and hydrophobic amino acids (aa) within the D period. The methodology used was based on existing information with respect to the structure of type I collagen and its function with respect to ECM activities. The results showed that acidic, basic and hydrophobic aa are found in two major distinct regions: one in which acidic and basic aa are located in areas defined by hydrophobic aa barriers; the other in which acidic, basic and hydrophobic aa forming clusters located preferentially in the boundaries of the Overlap:Gap zones. Except for the structural event, these clusters are the major sites for the interaction involving cell adhesion. The results also suggest that the Overlap:Gap interface function as a borderline for collagen interactions with ECM since 83,2% of the activities related to cell adhesion are located in the Overlap region while 93,3% of the activities of structural nature are enclosed within the limiting zone of Overlap:Gap to the direction of the Gap zone. Although no correlation could be established for net charge along the D period it is suggested that type I collagen participation in the activities of the ECM may also be associated to differences in ligand interactions (charge, molecular mass and hydrophobicity) with the electrostatic and the hydrophobic gradients that exists within the D period.

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