Made available in DSpace on 2016-03-07T19:21:12Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-09-24. Added 1 bitstream(s) on 2016-03-07T19:25:13Z : No. of bitstreams: 1 000854529.pdf: 5405260 bytes, checksum: f6abe18b4e8c7bab484b7a3c27f852c6 (MD5) / A técnica de difração de raios X por policristais (DRXP) é excelente para obter informações sobre o estado sólido cristalino em insumos farmacêuticos ativos (princípios ativos) e inativos (excipientes). Tendo em vista que estes insumos podem apresentar o fenômeno do polimorfismo, esta técnica é eficiente para a diferenciação entre as diferentes formas polimórficas. Além do problema de polimorfismo, também podem ocorrer mudanças na cristalinidade, dimensões e forma dos cristalitos (características físicas), as quais devem ser mantidas com as mesmas características das que foram usadas durante o desenvolvimento e registro do medicamento, pois esses fatores podem alterar a biodisponibilidade do fármaco. Para a análise adequada destes insumos sólidos, alguns métodos fazendo uso dos dados de DRXP são recomendados: o método de Rietveld (MR), método de Le Bail (MLB), método de Pawley (MP) e o método de PONKCS (Partial Or No Known Crystal Structure) que é baseado no MR. O MR pode ser adequadamente aplicado na caracterização e quantificação das formas cristalinas presentes em materiais policristalinos, embora ele seja limitado aos casos onde a estrutura cristalina seja conhecida. Porém, para muitos insumos a literatura ainda dispõe de pouca informação cristalográfica e para os casos em que a estrutura cristalina não seja conhecida ou seja parcialmente conhecida, o método PONKCS pode ser aplicado, conforme mostrado no caso do excipiente lactose monoidratada presente no anti-hipertensivo hidroclorotiazida, tendo sido encontrado de 70,0% lactose e 29,9% de hidroclorotiazida e do estearato de magnésio, presente em 1,4% em massa no comprimido de atenolol. Os métodos de Le Bail e de Pawley são utilizados para a decomposição do padrão e para identificação dos picos em fases com estruturas parcialmente conhecidas, porém não podem ser utilizados para a quantificação... / The x-ray powder diffraction (XPPD) is an excellent technique to obtain information about the crystal solid state on active pharmaceuticals ingredients (active ingredient) and inactive (excipients). Knowing that these ingredients can exhibit the phenomenon of polymorphism, this technique is efficient to differentiate among polymorphic forms. Beyond the problem of polymorphism, also, can occur changes in the crystallinity, dimensions and crystallites forms (physical characteristics), that must be maintained as the same characteristics that were used during the development and registration of medicament, because this factors can affect the farmaco bioavailability. To adequate analysis of these solids ingredients, some methods using DRXP data are recommended: Rietveld method (RM), Le Bail method (MLB), Pawley Method (PM) and the PONKCS method (Partial Or No Known Crystal Structure) which is based on RM. The RM can be adequately applied on characterization and quantification of crystal forms in polycrystalline materials, although the crystalline structure is necessary in this method. However, for many of these ingredients, there are few crystallographic information about, and for the cases that the crystal structure are unknown or partially known, the PONKCS method can be applied. As showed in the case of the excipient α-lactose monohydrate, present in the antihypertensive hydrochlorothiazide, and quantified 70.03wt% of lactose and 29.97wt% of hydrochlorothiazide, and in the case of the magnesium stearate, quantified in 1.4wt% on atenolol tablet. The PONKCS and Le Bail methods are used for profile fitting, and for identification of peaks in partially known crystal phases, but not used for quantification. The LBM and PM were used for profile fitting in the cases that the PONKCS method were applied, and in atenolol tests. The present work aimed identify and characterize excipients and pharmacos...

Orientador: Carlos de Oliveira Paiva Santos / Co-orientador: Selma Guiterrez Antonio / Banca: Marisa Veiga Capela / Banca: Hernane da Silva Barud / Banca: Fernando Luis Fertonani / Banca: Flávio Machado de Souza Carvalho / Resumo: A técnica de difração de raios X por policristais (DRXP) é excelente para obter informações sobre o estado sólido cristalino em insumos farmacêuticos ativos (princípios ativos) e inativos (excipientes). Tendo em vista que estes insumos podem apresentar o fenômeno do polimorfismo, esta técnica é eficiente para a diferenciação entre as diferentes formas polimórficas. Além do problema de polimorfismo, também podem ocorrer mudanças na cristalinidade, dimensões e forma dos cristalitos (características físicas), as quais devem ser mantidas com as mesmas características das que foram usadas durante o desenvolvimento e registro do medicamento, pois esses fatores podem alterar a biodisponibilidade do fármaco. Para a análise adequada destes insumos sólidos, alguns métodos fazendo uso dos dados de DRXP são recomendados: o método de Rietveld (MR), método de Le Bail (MLB), método de Pawley (MP) e o método de PONKCS (Partial Or No Known Crystal Structure) que é baseado no MR. O MR pode ser adequadamente aplicado na caracterização e quantificação das formas cristalinas presentes em materiais policristalinos, embora ele seja limitado aos casos onde a estrutura cristalina seja conhecida. Porém, para muitos insumos a literatura ainda dispõe de pouca informação cristalográfica e para os casos em que a estrutura cristalina não seja conhecida ou seja parcialmente conhecida, o método PONKCS pode ser aplicado, conforme mostrado no caso do excipiente lactose monoidratada presente no anti-hipertensivo hidroclorotiazida, tendo sido encontrado de 70,0% lactose e 29,9% de hidroclorotiazida e do estearato de magnésio, presente em 1,4% em massa no comprimido de atenolol. Os métodos de Le Bail e de Pawley são utilizados para a decomposição do padrão e para identificação dos picos em fases com estruturas parcialmente conhecidas, porém não podem ser utilizados para a quantificação... / Abstract: The x-ray powder diffraction (XPPD) is an excellent technique to obtain information about the crystal solid state on active pharmaceuticals ingredients (active ingredient) and inactive (excipients). Knowing that these ingredients can exhibit the phenomenon of polymorphism, this technique is efficient to differentiate among polymorphic forms. Beyond the problem of polymorphism, also, can occur changes in the crystallinity, dimensions and crystallites forms (physical characteristics), that must be maintained as the same characteristics that were used during the development and registration of medicament, because this factors can affect the farmaco bioavailability. To adequate analysis of these solids ingredients, some methods using DRXP data are recommended: Rietveld method (RM), Le Bail method (MLB), Pawley Method (PM) and the PONKCS method (Partial Or No Known Crystal Structure) which is based on RM. The RM can be adequately applied on characterization and quantification of crystal forms in polycrystalline materials, although the crystalline structure is necessary in this method. However, for many of these ingredients, there are few crystallographic information about, and for the cases that the crystal structure are unknown or partially known, the PONKCS method can be applied. As showed in the case of the excipient α-lactose monohydrate, present in the antihypertensive hydrochlorothiazide, and quantified 70.03wt% of lactose and 29.97wt% of hydrochlorothiazide, and in the case of the magnesium stearate, quantified in 1.4wt% on atenolol tablet. The PONKCS and Le Bail methods are used for profile fitting, and for identification of peaks in partially known crystal phases, but not used for quantification. The LBM and PM were used for profile fitting in the cases that the PONKCS method were applied, and in atenolol tests. The present work aimed identify and characterize excipients and pharmacos... / Doutor

Não disponível. / Not available.

Este trabalho apresenta o refinamento das estruturas cristalinas do quartzo, do coríndon e de um material sintético, análogo ao mineral criptomelana, utilizando o método de Rietveld. Com o quartzo e coríndon, testou-se a aplicabilidade do método e seus procedimentos instrumentais, teóricos, computacionais e os efeitos intrínsecos de preparação de amostras. A partir disto, estabeleceu-se um esquema de trabalho para a realização dos refinamentos. Os dados cristalográficos obtidos para estes minerais concordaram com os apresentados na literatura. Algumas discrepâncias nas intensidades dos picos não puderam ser minimizadas devido a problemas instrumentais, por problemas específicos do difratômetro disponível e, ainda, pela impossibilidade de se tratar os parâmetros térmicos. Para a criptomelana, grupo espacial I4/m, obtiveram-se: parâmetros da cela unitária \'A IND.0\'=9,82(1) e \'C IND.0\'=2.555(4)\'ANGSTROM\'; coordenadas atômicas Mn x = 0,3493(5) y = 0,1687(5); 0[1]x = 0,157(1) y = 0,201(2); 0[2] x = 0,534(2) y = 0,160(2) e o fator de ocupação do potássio M = 0,06(2). Os índices de critério para avaliação do refinamento obtidos foram \'R IND.WP\'= 18,50; \'R IND.P\'= 13,77; S = 0,56; \'D IND.W\'-d=0,42; \'R IND.B\'= 8,50. De modo geral, os dados foram concordantes com uma estrutura de inomanganato, constituída por quatro cadeias duplas de octaedros de [Mn\'O IND. 6\'] formando um túnel onde de aloja potássio, cujo fator de ocupação (M) está de acordo com as suas coordenadas atômicas e com a composição química da criptomelana estudada. / This research presents the Rietveld refinement of the crystal structure of quartz, corundum and a synthetic analogue of cryptomelane. Quartz and corundum were used in order to test the applicability of the method, its instrumental, theoretical and software procedures, as well as the intrinsic effects off sample preparation, and to establish a satisfactory work procedure. A sequence of work was estabished. Crystallographic data obtained for the minerals agreed with those presented in the literature. Some discrepancies on the peak intensities could not be minimized due to instrumental problems, specific problems of the available diffractometer and impossibility to deal with the thermal parameters. For cryptomelane, spatial group l4/m, the folliwing data were obtained: cell parameters \'A IND. 0\' 9,82(1) and \'C IND. 0\' = 2,555(4)\' ANGSTROM\'; atomic coordinates Mn x= 0,3493 (5), y = 0, 1687(5); O[1] x= 0,157(1), y=0,201(2); O[2] x= 0,534O(2), y= 0,160(2) and occupation factor of potassium M = 0,06(2). The indices de confidence for evalution of the refinement obtained were \'R IND. WP\' = 18,50; \'R IND. P\' = 13,77; S= 0,56; \'D IND. W\'-d = 0,42; \'R IND. B\' = 8,50. The data agreed with a structure of inomanganate formed by four double chains of [Mn\'O IND. 6\'] octahedra, creating a tunnel, where potassium is found. The occupation factor of potassium is in agreement with its atomic coordinates and the chemical composition of the studied cryptomelane.

É bem conhecida a técnica de Taylor e Sinclair (1945), para a extrapolação das dimensões da cela unitária, reduzindo ao mínimo os erros acidentais e sistemáticos. Entretanto, aqueles que trabalham com o referido método gráfico, conhecem a dificuldade em fixar a reta de extrapolação, principalmente quanto a sua inclinação. O método analítico de Cohen (1935, 1936) em bora reduzindo os erros sistemáticos e acidentais, possui as desvantagens de atribuir pesos iguais a medidas correspondentes aos diversos valores de \'teta\'. Por outro lado, o mesmo método é sempre laborioso, exigindo operações em computadores eletrônicos, principalmente para cristais de baixa simetria. O método gráfico analítico resolve com vantagem os inconvenientes das duas técnicas supramencionadas, ou seja, a arbitrariedade na fixação da reta no caso do método gráfico e o volume de cálculo e não atribuição de pesos no método analítico. O presente trabalho desenvolve a aplicação do método gráfico-analítico a cristais monométricos, dimétricos e rômbicos, registrando desvios relativos entre os limites 0,1 e 0,001%, considerados satisfatórios. / Not available.

Orientador: Iris Concepcion Linares de Torriani / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Fisica Gleb Wataghin / Made available in DSpace on 2018-09-27T18:30:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Santos_DeniseRibeirodos_M.pdf: 1895377 bytes, checksum: 6a4dbc0fd4b0ba660c304372792426ad (MD5) Previous issue date: 1992 / Resumo: É bem sabido que a forma de linha de difração de raios-x está relacionada com a cristalinidade do material, e que podemos estimar o tamanho médio dos grãos cristalinos (L) em várias direções na rede analisando o pico de raios-x correspondente. Um efeito equivalente ocorre no espectro de espalhamento Raman de um semicondutor microcristalino, conforme pode ser observado em publicações de vários grupos experimentais e teóricos nos últimos anos. Com base na teoria proposta por Richter e outros [Ri1] para o espectro Raman devido a fônons semi-confinados no volume de pequenos grãos esféricos, obtemos uma expressão analítica para a forma de linha Raman de germânio microcristalino. Utilizando uma subrotina de ajuste de curvas baseada no método de mínimos quadrados, ajustamos a expressão obtida aos dados experimentais de vários filmes de mc-Ge, obtendo como resultado do ajuste o diâmetro médio dos grãos. Considerando que estes obedecem uma distribuição gaussiana de tamanhos, determinamos também a largura aL dessa distribuição para cada amostra, conseguindo uma concordância muito boa entre a expressão teórica e os dados experimentais. Comparando os valores encontrados com os resultados obtidos pela técnica usual de raios-x, concluímos que o novo método de cálculo de L é viável, sendo que os resultados têm uma boa concordância com L medido por raios-x nos casos em que se pode dizer que a aproximação de grãos esféricos é válida / Abstract: It is well known that the X-ray diffraction line shape is related to the crystallinity of the sample material. The average size of the crystallites (L) in certain lattice directions can be evaluated from the broadening of the corresponding X-ray line. A similar effect is observed in the Raman spectrum of micro-crystalline semiconductors. This subject has been discussed and applied in sever al publications of experimental and theoretical groups during the last few years. Based on the theory proposed by Richter et at [Ri1] for the Raman spectrum due to partially confined fonons in the volume of small spherical grains we can obtain an analytical expression for the Raman line of micro-crystalline Ge. Using a curve fitting sub-routine based on the least squares method we proceeded to fit the experimental data obtained from several mc-Ge samples with the proposed analytical expression. The average crystallite size was obtained directly from the fitting parameters. Assuming a Gaussian size distribution we determined the corresponding aL parameters for each sample, getting to a very good agreement between the experimental data and the theoretical calculation. Making a comparison of the values obtained using this analysis of the Raman line and the usual X-ray diffraction technique, we were able to conclude that both techniques will give similar results for the crystallite measurement only in those cases in which the approximation of "spherical" grains is valid / Mestrado / Física / Mestre em Física

É bem conhecida a técnica de Taylor e Sinclair (1945), para a extrapolação das dimensões da cela unitária, reduzindo ao mínimo os erros acidentais e sistemáticos. Entretanto, aqueles que trabalham com o referido método gráfico, conhecem a dificuldade em fixar a reta de extrapolação, principalmente quanto a sua inclinação. O método analítico de Cohen (1935, 1936) em bora reduzindo os erros sistemáticos e acidentais, possui as desvantagens de atribuir pesos iguais a medidas correspondentes aos diversos valores de \'teta\'. Por outro lado, o mesmo método é sempre laborioso, exigindo operações em computadores eletrônicos, principalmente para cristais de baixa simetria. O método gráfico analítico resolve com vantagem os inconvenientes das duas técnicas supramencionadas, ou seja, a arbitrariedade na fixação da reta no caso do método gráfico e o volume de cálculo e não atribuição de pesos no método analítico. O presente trabalho desenvolve a aplicação do método gráfico-analítico a cristais monométricos, dimétricos e rômbicos, registrando desvios relativos entre os limites 0,1 e 0,001%, considerados satisfatórios. / Not available.

Este trabalho apresenta o refinamento das estruturas cristalinas do quartzo, do coríndon e de um material sintético, análogo ao mineral criptomelana, utilizando o método de Rietveld. Com o quartzo e coríndon, testou-se a aplicabilidade do método e seus procedimentos instrumentais, teóricos, computacionais e os efeitos intrínsecos de preparação de amostras. A partir disto, estabeleceu-se um esquema de trabalho para a realização dos refinamentos. Os dados cristalográficos obtidos para estes minerais concordaram com os apresentados na literatura. Algumas discrepâncias nas intensidades dos picos não puderam ser minimizadas devido a problemas instrumentais, por problemas específicos do difratômetro disponível e, ainda, pela impossibilidade de se tratar os parâmetros térmicos. Para a criptomelana, grupo espacial I4/m, obtiveram-se: parâmetros da cela unitária \'A IND.0\'=9,82(1) e \'C IND.0\'=2.555(4)\'ANGSTROM\'; coordenadas atômicas Mn x = 0,3493(5) y = 0,1687(5); 0[1]x = 0,157(1) y = 0,201(2); 0[2] x = 0,534(2) y = 0,160(2) e o fator de ocupação do potássio M = 0,06(2). Os índices de critério para avaliação do refinamento obtidos foram \'R IND.WP\'= 18,50; \'R IND.P\'= 13,77; S = 0,56; \'D IND.W\'-d=0,42; \'R IND.B\'= 8,50. De modo geral, os dados foram concordantes com uma estrutura de inomanganato, constituída por quatro cadeias duplas de octaedros de [Mn\'O IND. 6\'] formando um túnel onde de aloja potássio, cujo fator de ocupação (M) está de acordo com as suas coordenadas atômicas e com a composição química da criptomelana estudada. / This research presents the Rietveld refinement of the crystal structure of quartz, corundum and a synthetic analogue of cryptomelane. Quartz and corundum were used in order to test the applicability of the method, its instrumental, theoretical and software procedures, as well as the intrinsic effects off sample preparation, and to establish a satisfactory work procedure. A sequence of work was estabished. Crystallographic data obtained for the minerals agreed with those presented in the literature. Some discrepancies on the peak intensities could not be minimized due to instrumental problems, specific problems of the available diffractometer and impossibility to deal with the thermal parameters. For cryptomelane, spatial group l4/m, the folliwing data were obtained: cell parameters \'A IND. 0\' 9,82(1) and \'C IND. 0\' = 2,555(4)\' ANGSTROM\'; atomic coordinates Mn x= 0,3493 (5), y = 0, 1687(5); O[1] x= 0,157(1), y=0,201(2); O[2] x= 0,534O(2), y= 0,160(2) and occupation factor of potassium M = 0,06(2). The indices de confidence for evalution of the refinement obtained were \'R IND. WP\' = 18,50; \'R IND. P\' = 13,77; S= 0,56; \'D IND. W\'-d = 0,42; \'R IND. B\' = 8,50. The data agreed with a structure of inomanganate formed by four double chains of [Mn\'O IND. 6\'] octahedra, creating a tunnel, where potassium is found. The occupation factor of potassium is in agreement with its atomic coordinates and the chemical composition of the studied cryptomelane.

Não disponível. / Not available.

SILVA FILHO, José Caetano da. Bases moleculares do processamento pós-traducional na estrutura tridimensional de uma lectina de sementes de Dioclea grandiflora. 2017. 87 f. Tese (Doutorado em Biotecnologia de Recursos Naturais)-Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2017. / Submitted by Coordenação PPGBiotec (ppgbiotec@ufc.br) on 2017-11-23T12:23:38Z No. of bitstreams: 1 2017_tese_jcsilvafilho.pdf: 17964867 bytes, checksum: d75846b7da62c6847d18ddc239c81a4f (MD5) / Approved for entry into archive by Anderson Silva Pereira (anderson.pereiraaa@gmail.com) on 2017-12-04T21:05:56Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_tese_jcsilvafilho.pdf: 17964867 bytes, checksum: d75846b7da62c6847d18ddc239c81a4f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-04T21:05:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_tese_jcsilvafilho.pdf: 17964867 bytes, checksum: d75846b7da62c6847d18ddc239c81a4f (MD5) Previous issue date: 2017 / Lectins, specially the ones from plants, are widely studied and characterized by present great biotechnological potential such as antidepressant, antitumoral and anti- and pro-inflammatory activities. These properties take into account the mature form of the lectin, which is synthesized as an inactive glycoprotein precursor that is post-translationally modified by deglycosylation, proteolytic breakdown and polypeptide chain inversion. Deglycosylation makes the precursor able to bind carbohydrates. The deglycosylated precursor from Dioclea grandiflora lectin (pDGL) do not solely binds to monosaccharides, presenting hemagglutinating activity, but also presents higher affinity to mannose in relation to its mature counterpart. Although the post-translational processing is well understood, the structural basis for this different affinity pattern is less clear. In this way, the present work aimed to elucidate the crystallographic structure of pDGL in complex to mannose to identify the structural characteristics that determine its greater affinity to this hexose. Recombinant pDGL was cocrystallized with mannose and crystals were submitted to X-ray diffraction and the resulting data were computationally analyzed. In silico studies were carried out to compare the interaction pattern of mannose and more complex carbohydrates between pDGL and their mature form. The crystallographic structure of pDGL presented as a tetramer, conserving all structural characteristics of its mature counterpart, including the presence of non-repetitive secondary structures that fold the Carbohydrate Recognition Domain (CRD). However, pDGL seems unable to form stable tetramers, once it lacks two important interdimeric contacts orchestrated by histidine residues His22 and His194. Mannose bound at all four polypeptide chains being stabilized by several interactions, including a CH—π ligation. In silico analyses showed that pDGL, in relation to its mature form, binds with higher affinity to mannose and the trimannoside 3,6-di-O-(ɑ-D-manopyranosyl)-ɑ-D-mannopiyranose due its CRD presents lower depthness. Together, these results show that post-translational processing (i) allows the formation of stable tetramers and (ii) produces subtle changes in the disposal of CRD residues that decreases the affinity of the mature protein for carbohydrate molecules. / Lectinas, em especial aquelas de origem vegetal, são amplamente estudadas e caracterizadas por apresentarem atividades antidepressivas, antitumorais e anti- e pró-inflamatórias. Todas essas atividades levam em consideração a forma madura da lectina, a qual, nas representantes da subtribo Diocleinae, é sintetizada como uma glicoproteína precursora inativa que sofre modificações pós-traducionais que incluem deglicosilação, clivagem proteolítica e inversão da cadeia polipeptídica. A deglicosilação torna o precursor capaz de se ligar a carboidratos. O precursor deglicosilado da lectina de Dioclea grandiflora (pDGL) não só se liga a monossacarídeos, apresentando atividade hemaglutinante, como tem maior afinidade por manose em relação à sua contra-parte madura. Apesar do processamento pós-traducional ser bem conhecido, as bases moleculares desse mecanismo na estrutura tridimensional de lectinas bem como sua influência sobre a afinidade a carboidratos ainda não estão muito claras. Assim, o presente trabalho teve como objetivo identificar as características estruturais de uma lectina não processada e os fatores que influenciam sua interação com carboidratos, comparando-os com sua contra-parte madura. Para isso, a pDGL recombinante foi cocristalizada com manose e os cristais obtidos foram difratados e seus dados resultantes tratados computacionalmente. Análises in silico foram realizadas para se comparar as características estruturais da pDGL e de sua forma madura, bem como seus modos de interação com a manose e o trimanosídeo 3,6-di-O-(ɑ-D-manopiranosil)-ɑ-D-manopiranose. A estrutura cristalográfica da pDGL apresentou-se como um tetrâmero, mantendo todas as características estruturais de sua contra-parte madura, incluindo a presença de estruturas secundárias não-repetitivas que moldam o domínio de reconhecimento a carboidrato (CRD). Entretanto, diferente desta, a pDGL parece não ser capaz de formar arranjos tetraméricos estáveis, já que faltam duas importantes interações interdiméricas envolvendo os resíduos His22 e His194. A manose se ligou nas quatro cadeias do modelo cristalográfico sendo estabilizada por diversas interações. As análises in silico mostraram que a pDGL, em relação à sua forma madura, se liga com maior afinidade à manose e ao trimanosídeo devido seu CRD possuir menor profundidade. Em conjunto, esses dados sugerem que o processamento póstraducional permite a formação de tetrâmeros estáveis e gera sutis mudanças na disposição dos resíduos do CRD que fazem a proteína madura ter menor afinidade a carboidratos.