Les sites de fixation des facteurs de transcription ou éléments régulateurs sont impliqués dans la régulation de l'expression des gènes. Une meilleure connaissance de l'architecture des promoteurs est aujourd'hui accessible via l'annotation des génomes et les données transcriptomiques. Certains éléments régulateurs sont conservés à une position préférentielle dans les promoteurs. Chez A. thaliana, nous avons mis au point une approche pour caractériser de tels motifs. Ce travail a permis de proposer une cartographie des promoteurs en identifiant 5105 motifs caractérisés par une sur-représentation locale dans les promoteurs proximaux. L'étude du promoteur central où est observée la boîte TATA, élément régulateur conservé entre eucaryotes, a été approfondie. Une liste de 15 variants fonctionnels de la boîte TATA a été identifiée, ainsi qu'une nouvelle classe d'éléments régulateurs qui sont caractérisés par des mêmes contraintes topologiques que la boîte TATA : les motifs-TC. Ils sont conservés chez A. thaliana et le riz, Oryza sativa, mais absents chez les mammifères. Les 18% de gènes d'A. thaliana contenant un motif-TC ont tendance à être exprimés dans des conditions expérimentales spécifiques. Ces éléments pourraient participer à la régulation de l'expression des gènes. L'étude de l'élément initiateur YR chez A. thaliana a mis en évidence une extension de ces 4 dinucléotides dans l'UTR 5'. Des associations entre ces éléments régulateurs peuvent montrer une collaboration fonctionnelle. La recherche de caractéristiques fonctionnelles communes aux gènes possédant une même organisation d'éléments régulateurs pourra permettre de contribuer à l'annotation fonctionnelle de ces éléments.

Thèses (M.A.)--Université de Sherbrooke (Canada), 1998. / Titre de l'écran-titre (visionné le 20 juin 2006). Publié aussi en version papier.

J’ai amorcé ce projet doctoral avec le désir de questionner et renouveler la pratique par laquelle j’accueillais les jeunes familles qui demandaient l’initiation chrétienne. Pour atteindre cet objectif, j’ai centré mes recherches sur la pratique du discernement des parents. J’ai choisi de mener cette recherche en donnant la parole aux parents qui demandent l’initiation, car ils sont les principaux acteurs du phénomène, de là le choix de l’analyse phénoménologique comme méthode d’analyse qualitative. Cette analyse a pu me mener à une description du phénomène et à ses principaux constituants. Des témoignages des participants, j’ai choisi de faire ressortir l’expérience de relecture d’un élément de salut dans un contexte de transmission difficile. C’est cette expérience qui a été corrélée avec celle du peuple juif (Exode 14-15), celle de Corneille (Actes 10) et celle de la Samaritaine (Jean 4, 1-42). Afin de faire parler ces textes, j’ai choisi la narratologie, car cette approche du récit me semblait bien répondre à la phénoménologie, utilisée comme méthode d’analyse qualitative, qui porte attention aux récits des participants. Cette expérience a aussi bénéficié de l’éclairage du témoignage écrit de Marie de l’Incarnation (Lettres XL et XLI). Pour bien établir le contexte dans lequel prend place le témoignage des parents, je mettrai en valeur les écrits d’É-Martin Meunier, sociologue des religions. Ce cheminement m’a mené à proposer quatre balises pour renouveler les pratiques d’accueil des parents qui demandent l’initiation chrétienne de leurs enfants. Accueillir, en évitant tout préjugé et en respectant le discernement des parents qui les a menés à faire la demande de l’initiation chrétienne. Favoriser une rencontre personnelle en revoyant le temps et les lieux de nos pratiques et en outillant les intervenants pastoraux par le dialogue pastoral, l’accompagnement spirituel ou l’écoute active. Révéler plutôt qu’enseigner, en s’habilitant à témoigner en reconnaissant l’action de Dieu dans sa vie, permettant ainsi de lire son action dans le récit de vie des parents demandant l’initiation chrétienne que l’on aura pris soin d’écouter. Travailler à construire une communauté catéchisante, pour cela développer des propositions à tous les âges de la vie et intégrer l’initiation chrétienne au coeur du vécu communautaire. / I began this doctoral project with the desire to question and to renew the practice by which I welcomed the young families which asked for the first communion and for the confirmation. To reach this goal, I centered my searches on the practice of the discernment of the parents. I chose to lead this research by handing over to the parents who ask for the initiation, because they are the main actors of the phenomenon, from there the choice of the phenomenological analysis as qualitative method of analysis. This analysis was able to lead us to a description of the phenomenon and to its main constituents. Testimonies of the participants, I chose to highlight the experience of review of an element of salute in a context of difficult transmission. It is this experience which was correlated to that of the Jewish people (Exodus 14-15), that of the Crow (Acts 10) and that of the Samaritan (Jean 4, 1-42). To make these texts speak, I chose the narratology, because this approach of the narrative seemed to me good to answer the phenomenology, used as qualitative method of analysis, which pays attention on the narratives of the participants. This experience(experiment) also benefited from the lighting of the testimony written by Marie de l' Incarnation (Lettres XL and XLI). To establish the context in which takes place the testimony of the parents, I shall emphasize the papers of É-Martin Meunier, sociologist of the religions. This progress led me to propose four beacons to renew the ways pastoral ministers welcome the parents asking Christian initiation for their children. Welcome, by avoiding any prejudice and by respecting the discernment of the parents which led them to make the request of the Christian initiation. Favor a personal meeting by revising the time and the places of our practices and by equipping the pastoral ministers by the pastoral dialogue, the spiritual accompaniment or the active listening. Reveal rather than teach, by authorizing to testify by recognizing God's share in its life, so allowing to read its action in the narrative of life of the parents asking for the Christian initiation that I shall have taken care of listening to. Work on a friendly community, for it develop proposals at all the ages of the life and integrate Christian initiation at the heart of the community real-life experience.

La première partie de ce mémoire consiste en un recueil de poèmes d'inspiration surréaliste où se déroule une quête tumultueuse dans l'imaginaire, dans la nature et dans l'écriture elle-même. La seconde partie du mémoire est une réflexion sur la création. Se basant sur ce que l'écriture serait une expérience s'inscrivant dans le vécu, nous verrons comment elle peut être l'occasion d'une transfiguration de l'Être, en ce sens similaire aux rites de passage des peuples primitifs tels que décrits par Mircea Eliade. Dans cet esprit, nous serons amenés à étudier le roman Le cornet acoustique de Leonora Carrington, lequel contient une initiation mystique qui nous semble être une image de l'expérience de son créateur. Le tout est agrémenté par une réflexion sur notre propre création, à savoir comment celle-ci comporte aussi un passage.

Ce travail concerne le phénomène "lave torrentielle" en recherchant les conditions de l'initiation et en en étudiant les mécanismes dans plusieurs bassins torrentiels des Alpes françaises. L'occurrence des laves torrentielles résulte de la conjonction de multiples facteurs de prédisposition,en rapport avec la climatologie, la géologie, la géomorphologie et l'hydrogéologie, le facteur déclenchant étant le plus souvent l'eau apportée par de violents orages. L'étude de nombreux dépôts de laves torrentielles de provenance variée a permis de déterminer l' existence de deux familles de laves torrentielles, les laves granulaires et les laves cohésives, dont la distinction est basée sur plusieurs critères granulométriques définis sur le sol écrêté à 20 mm. Les caractéristiques granulométriques et géotechniques des matériaux prélevés dans les zones d'initiation sont semblables à celles des dépôts de laves torrentielles, ce qui signifie que le tri granulométrique entre les zones sources et les zones de dépôts est très faible. Les mécanismes d'initiation ont alors été identifiés et décrits en tenant compte du contexte environnemental. lis sont multiples et nous en avons établi une typologie. La connaissance de ces mécanismes et l'identification de critères géotechniques propres aux matériaux des zones d'initiation des laves torrentielles a servi de base à l'élaboration de cartes " d'aptitude à l'initiation des laves torrentielles ". En fonction des mécanismes d'initiation et des volumes disponibles dans ces zones d'initiation potentielle, nous avons défini différents scénarios d'événements "laves torrentielles " , tenant compte des dégâts susceptibles d'être causés sur les cônes de déjection.

Thèses (M.A.)--Université de Sherbrooke (Canada), 2006. / In ProQuest dissertations and theses. Titre de l'écran-titre (visionné le 16 oct. 2007). Publié aussi en version papier.

Les migrants, en particulier ceux originaires d'Afrique sub-Saharienne, représentent une part importante des personnes infectées par le VIH en France. Bien que le dépistage et la prise en charge soient de plus en plus précoces en France, un sur-risque de diagnostic tardif et d'initiation retardée du traitement est rapporté chez les migrants, particulièrement chez les hommes, par rapport aux autres personnes infectées par le VIH. Les objectifs de ce travail de thèse étaient d'étudier le délai d'initiation du traitement antirétroviral puissant en dehors de l'urgence thérapeutique (CD4>200/µL et pas de statut clinique définissant le SIDA) et d'évaluer l'efficacité biologique et clinique après initiation du traitement, selon l'origine géographique, le sexe et le groupe de transmission à VIH. Pour ce faire, les données issues de la base de données hospitalière française sur l'infection à VIH (FHDH ANRS CO4) ont été utilisées. Par rapport aux hommes nés en France ayant des rapports sexuels avec des hommes (HSH non migrants), seuls les hommes migrants originaires d'Afrique sub-Saharienne et des Antilles non Françaises avec des CD4>350/µL à l'entrée dans le soin ont une probabilité plus faible de démarrer le traitement ARV. Les délais nécessaires à l'obtention d'une couverture de santé une fois entré dans le soin ne suffisent pas à expliquer cette différence. Après initiation du traitement antirétroviral, quel que soit le stade d'avancement de la maladie et malgré la prise en compte des caractéristiques démographiques, biologiques, cliniques et thérapeutiques à l'initiation du traitement, comparé aux HSH non migrants, les migrants ont une probabilité plus faible de remonter leurs CD4. En revanche, les hommes hétérosexuels quelle que soit leur origine géographique, ont une probabilité plus élevée de moins bonne réponse virologique et d’avoir un premier évènement clinique. Un rôle majeur du niveau de CD4, du statut clinique et de l’âge à l’initiation du traitement est observé. Ces différences pourraient également être influencées par des facteurs socio-économiques, des facteurs de risques comportementaux ou le mode de vie, pour lesquels nous n’avons pas d’information dans la FHDH. Les évènements ne définissant pas le SIDA sont responsables d’une grande morbidité, avec la survenue de beaucoup d’évènements infectieux notamment. Cependant une fois entrés dans le soin et traités, hormis pour les risques d’infections ne définissant pas le SIDA plus élevés chez les migrants hétérosexuels par rapport aux non migrants hétérosexuels, il n’y a pas de différence de risque de comorbidités entre migrants et non migrants chez les hommes hétérosexuels et chez les femmes hétérosexuelles. / Migrants, mainly from sub-Saharan Africa (SSA), represent an important part of people living with HIV in France. Despite early screening and access to care have both increased in France, an excess risk of late diagnosis and delayed treatment initiation is reported among migrants, particularly in men, compared with other HIV-infected individuals. The objectives of this thesis were to study time between entry into care and combined antiretroviral therapy (cART) initiation, excluding late access to care, and to evaluate biological and clinical outcome after cART initiation, according to geographic origin, sex and transmission group. Data from the French Hospital Database on HIV (FHDH ANRS CO4) were used. Compared with French native men who have sex with men (MSM), only men originating from SSA and non-French West Indies with CD4>350/µL at entry into care are more likely to begin cART later. Administrative delays in obtaining healthcare coverage do not appear to be the only one responsible. After cART initiation, whatever the CD4 cell count at cART initiation, and after taking into account demographic, immunovirological, clinical and therapeutic characteristics at cART initiation, compared with French native MSM, migrants have a lower likelihood of CD4 cell recovery. However, heterosexual men, whatever the geographic origin, are more likely to have worse virological and clinical outcomes. Older age, a lower CD4 cell count and pre-existing AIDS status at cART initiation had the biggest impact on outcomes of cART but socio-economic level, and lifestyle or behavioral risk factors which are not available in the FHDH could also influence outcomes of cART. Non-AIDS defining events are responsible for a higher morbidity, with a higher incidence of severe infections. After entry into care and cART initiation, except for the risk of non-AIDS infections in heterosexual migrants than in heterosexual nonmigrants, there is no difference of comorbidities between migrants and non migrants among heterosexual men and heterosexual women.

Thèse en cotutelle: Université Laval, Québec, Canada, Philosophiae Doctor (Ph. D.) et Université Lumière Lyon II, Lyon, France, doctorat. / Dans la perspective d’une anthropologie ontologique, la thèse vise à mieux comprendre les continuités et les transformations au sein des rites de passage chez les Inuit du Nunavik, depuis leur conversion au christianisme jusqu’au contexte actuel. Les rites de la grossesse, de l’accouchement, et de la naissance, y sont décrits en détail, tout comme le processus de dénomination de l’enfant, puis les rites de la première fois. Cette ethnographie mobilise une démarche comparative régionale, et s’appuie sur plusieurs collaborations avec des institutions du Nunavik. Les séquences de ces rites de passage sont dès lors analysées à la fois comme des temps forts de la construction de la personne, et comme des témoins de la résilience manifestée par la culture inuit. Au cœur de la socialisation de l’enfant, ces rites apparaissent en effet avoir contribué à transmettre certains principes culturels grâce auxquels différents éléments de la cosmologie chrétienne ont pu être adaptés et incorporés. Ces rites auraient alors participé de l’actualisation de la cosmologie inuit au XXe siècle, et en particulier de la réorganisation des relations que les humains entretiennent avec différents êtres non-humains. En transmettant jusqu’à aujourd’hui les principes ontologiques fondant ces relations, après y avoir intégré plusieurs éléments de la tradition chrétienne, ces rites suggèrent de considérer l’importance du rôle socialisateur des êtres non-humains – fœtus, défunts, animaux, esprits – dans l’éducation enfantine, et appellent une réflexion sur l’extension de la notion de personne aux êtres non-humains.

Le baptême des petits enfants a été pratiqué de manière unanime et généralisée pendant des siècles, mais il fait aujourd'hui l'objet de sérieuses remises en question, en lien avec les autres composantes de l'initiation chrétienne. Ce mémoire cherche à faire la lumière sur la problématique théologique soulevée par une telle remise en question. On y décrit d'abord l'initiation chrétienne dans son ensemble, d'un point de vue diachronique (premier chapitre) et synchronique (deuxième chapitre). Puis, trois dimensions fondamentales du baptême sont explorées: geste de croyant, geste d'Église et célébration (chapitres trois à cinq). La remise en question du baptême des petits enfants est ensuite analysée dans le détail pour l'ensemble de l'Église (chapitre six) et pour le Québec (Chapitre sept). Enfin, la conclusion formule une proposition de cadre théorique d'un questionnement renouvelé.

L'Église de Québec est aujourd'hui confrontée à une désaffection qui l'oblige à reconsidérer son mode de transmission de l'expérience chrétienne. L'Église était principalement habilitée à transmettre la foi par l'enseignement. Il nous apparaît qu'elle doit maintenant envisager de prendre en charge non seulement l'initiation sacramentelle, mais la totalité de l'initiation chrétienne afin de pallier au désengagement ou à l'inaptitude relative de la presque totalité des institutions sociales contemporaines (famille, école, etc.). Nous proposons le catéchuménat comme voie d'avenir de transmission de la foi dont l'essentiel est l'expérience pascale. Nous nous appuyons sur le fait que le catéchuménat est étroitement associé au transmettre chrétien dans des contextes de pluralisme; ensuite parce qu'il est fondé sur l'anthropologie de l'initiation et qu'il correspond à la pédagogie de la révélation de Dieu. Pour toutes ces considérations, le catéchuménat nous apparaît comme l'une des voies d'avenir pour l'Église de Québec à la recherche de nouvelles perspectives pour accompagner l'homme d'aujourd'hui dans sa rencontre de Dieu.