The tumour necrosis factor (TNF) superfamily is a group of cytokines that orchestrate a variety of functions, both in the development of the architecture of immune organs and of the immune response. The mammalian TNF superfamily consists of 19 ligands and 29 receptors, whereas in the chicken only 10 ligands and 15 receptors are present. Chickens do not develop lymph nodes, possibly due to the absence of the lymphotoxin genes (TNF superfamily members) in their genome. New members of the chicken TNF superfamily have recently been identified in the genome, namely chicken receptor activator of NF-κB ligand (chRANKL), its signalling receptor, chRANK, and its decoy receptor, osteoprotegerin (chOPG). In mammals, RANKL and RANK are transmembrane proteins expressed on the surface of Th1 cells and mature dendritic cells (DC), respectively. OPG is expressed as a soluble protein from osteoblasts and DC, regulating the interaction between RANKL and RANK. To investigate the bioactivity of this triad of molecules, the extracellular soluble domains of chRANKL and chRANK and full-length chOPG were identified and cDNAs cloned. ChRANKL, chRANK and chOPG mRNA are ubiquitously expressed across non-lymphoid and lymphoid tissues and immune cells in the chicken. Similar to mammals, chRANK and chOPG mRNA expression levels are upregulated in mature bone marrow-derived DC (BMDC). ChRANKL transcription is regulated by Ca2+-mobilisation and is further enhanced by the activation of the protein kinase C pathway, as seen in mammals. The biological activities of chRANKL, chRANK and chOPG were investigated by the production of recombinant soluble fusion proteins. The extracellular, TNF-homology, domain of chRANKL (schRANKL) was sub-cloned into a modified pCI-neo vector expressing an in-frame isoleucine zipper to encourage trimer formation. FLAG-tagged schRANKL produced in COS-7 cells predominantly forms homotrimers and chOPG is expressed as homodimers, both signatures of their mammalian TNF superfamily orthologues. SchRANKL enhances the mRNA expression levels of pro-inflammatory cytokines in mature BMDC and BM-derived macrophages (BMDM). Pre-incubation with soluble chRANK-Fc or chOPG-Fc blocked the schRANKL-mediated increase in pro-inflammatory cytokine mRNA expression levels in BMDC. Expression of surface markers on BMDC and BMDM were not affected by schRANKL treatment. SchRANKL enhances the survival rates of BMDC and BMDM and can drive osteoclast differentiation from monocyte/macrophage progenitor cells. The chRANKL signalling receptor, chRANK, does not contain an intracellular catalytic domain but requires the binding of intracellular TNF receptor-associated factors (TRAF) to initiate signalling. TRAFs are a family of seven proteins (TRAF1-7) grouped due to their highly conserved RING domains, zinc finger domains, TRAF-N and TRAF-C domains. ChRANK possesses four of the five TRAF peptide-binding motifs found in mammalian RANK. The "missing" chRANK TRAF peptide-binding motif is TRAF6-specific, a vital protein for RANKL-mediated osteoclastogenesis. All seven members of the mammalian TRAF family are present in the chicken genome. To investigate the conservation of RANK-specific TRAF signalling proteins, chicken TRAF2 (chTRAF2), chTRAF5, chTRAF6 and a newly found member, chTRAF7, were identified and their cDNAs cloned. ChTRAF5, chTRAF6 and chTRAF7 had mRNA expression patterns, in non-lymphoid and lymphoid tissues and in a number of immune cells, similar to their orthologues in mammals. Interestingly, chTRAF2 has two variants, the full-length chTRAF2 and a novel isoform (chTRAF2S) lacking exon 4. ChTRAF2S lacks a portion of zinger finger one, all of zinc finger two and a portion of zinc finger three, producing a protein with a hybrid of zinc fingers 1 and 3 and intact zinc fingers 4 and 5. RT-PCR analyses indicated differential expression of both of the chTRAF2 isoforms in a number of non-lymphoid and lymphoid tissues, splenocyte subsets and in a kinetic study of ConA-stimulated splenocytes. ChTRAF2S is biologically active compared to chTRAF2, inducing higher levels of NF-κB activation. Co-transfections indicate that chTRAF2 may regulate chTRAF2S bioactivity as no synergistic effect was identified when cells were transfected with both isoforms. Knowledge gained from this study will help work to further dissect the interactions between chRANKL-expressing T cells and chRANK-expressing DC to drive Th1 immune responses and to understand how the chicken mounts an effective immune response while expressing a minimal essential repertoire of the TNF superfamily.

Le transfert de prions des aliments dans la muqueuse et leur passage de la muqueuse vers le système nerveux constituent des chaînons manquants dans la compréhension de la pathogenèse des ESST. Ces événements cruciaux se déroulent à des stades très précoces de linfection et restent sans signes cliniques. Lexplication de ces phénomènes permettrait de mieux appréhender les mécanismes infectieux et de mettre en place des traitements. élucidation Ce travail repose sur des observations largement étayées : - lors dune infection orale par des prions, les plaques de Peyer, spécialisées dans léchantillonnage et le traitement déléments transitant dans liléon, sont des zones privilégiées de passage dagents infectieux de la lumière vers la muqueuse intestinale. - lagent responsable des maladies à prions est retenu et répliqué par des cellules du système immunitaire comme les cellules folliculaires dendritiques. Laccumulation de prions est en effet mise en évidence dans les organes lymphoïdes secondaires dorganismes infectés. - en cas dinfection par voie orale par des prions, le processus de neuroinvasion débute dans le système nerveux périphérique et se propage vers le système nerveux central par les fibres sympathiques et parasympathiques. Ces différentes observations sont à la base de notre hypothèse de travail : les cellules dendritiques capteraient les prions au niveau de la lumière des plaques de Peyer, migreraient dans les tissus lymphoïdes drainants et les transmettraient aux cellules folliculaires dendritiques et/ou aux fibres nerveuses périphériques. En véhiculant les prions, elles seraient à la base à la fois de la lymphoinvasion et de la neuroinvasion. Pour vérifier notre hypothèse nous avons investigué plusieurs pistes : létude comparative du phénotype et la localisation des cellules dendritiques des plaques de Peyer chez les souris saines et les souris infectées par les prions. la localisation des zones de contact entre cellules dendritiques et des fibres nerveuses au sein des organes lymphoïdes secondaires de souris infectées versus saines. lélaboration et létude dun modèle in vitro murin de transmission de prions des cellules dendritiques aux cellules nerveuses périphériques. Le phénotype et la localisation des cellules dendritiques des plaques de Peyer durant la phase préclinique dinduction orale dune ESST ont été analysés selon plusieurs paramètres. Les résultats seront décrits et discutés dans le chapitre 1. Lépithélium associé aux follicules lymphoïdes des plaques de Peyer est une zone de transcytose déléments qui transitent dans le tractus intestinal. On y distingue des entérocytes, des cellules M et des cellules dendritiques. Une attention particulière a été portée aux cellules dendritiques localisées dans lépithélium à différents temps durant une infection par des prions. Une analyse quantitative et phénotypique de cette population particulière de cellules a été réalisée dans la perspective de classer cette population parmi les sous-populations de cellules dendritiques connues. Lexpression membranaire de la protéine prion cellulaire et la détection de la forme totale (PrPc + PrPsc) à la surface de ces cellules dendritiques des plaques de Peyer a été examinée. Les zones de contacts entre DC et FDC, lieux possibles de dissémination des prions au sein des organes lymphoïdes, ont été étudiées de façon quantitative. En vue de connaître les sites potentiels de neuroinvasion, nous avons établi dans le chapitre 2 une topographie des fibres nerveuses au sein des plaques de Peyer, des ganglions mésentériques et de la rate. Nous avons comparé les observations faites sur des souris saines, des souris infectées avec prions et des souris transgéniques. Ensuite, nous avons tenté de mettre en évidence des contacts entre les cellules dendritiques et les fibres nerveuses. La localisation des connexions neuro-immunes dans les organes lymphoïdes a particulièrement retenu notre attention. Les connexions entre cellules dendritiques et les fibres nerveuses décrites dans le chapitre 2 fournissent des informations de localisation. Elles permettent donc denvisager des sites potentiels de neuroinvasion mais elles ne renseignent pas sur la transmission des prions dun type cellulaire à lautre. En particulier la dissémination de lagent pathologique des DC aux neurones périphériques. Le chapitre 3 détaille nos travaux consacrés à lélaboration dun modèle in vitro reproduisant des interfaces entre des DC et des cellules nerveuses. Dans un premier temps, nous avons évalué la validité du modèle par rapport à la situation in vivo. Dans un second temps, les cellules dendritiques infectées par les prions ont été cultivées au contact de neurones issus des ganglions de la racine dorsale, ceux-là mêmes qui sont infectés in vivo, pour étudier la transmission des prions des DC aux neurones du système nerveux périphérique.

Currently, in most situations, the autologous immune system is unable to eradicate the residual leukemic burden persisting after chemo-radiotherapy, but a balance can be established between leukemic and immune cells leading to a clinical remission for several months or years. If this balance is broken, a clinical relapse can occur. The high incidence of relapses in human cancers demonstrates the frequent inefficacy of the immune system to control these residual cells. In this context, allogeneic hematopoietic stem cell transplantation (HSCT) has been proven to be the most effective way to reinforce the immune reaction against leukemia, graft-versus-leukemia (GVL) effect and, so, achieve a definitive eradication of the residual disease in a significant proportion of patients. Indeed, the whole concept of HSCT evolved from an organ transplant concept (to replace a defective ill organ with a new healthy one) to the concept of creating an extraordinary immunotherapeutic platform in which the donor immune system contributes to the eradication of the residual leukemic cells. Thus, the past and present issues remain those of finding the best immunomodulatory modalities to achieve a full engraftment, a powerful GVL effect and no or moderate graft-versus-host disease (GVHD). Different ways to reach this goal, such as post transplant cytokine modulation, specific or global cellular depletion of the graft and post transplant global or specific donor immune cell add-backs, are still extensively studied. Nevertheless, the persistent high relapse rate (RR) observed in leukemia patients after HSCT remains the most important cause of death before transplant-related toxicities. Moreover, since only about 40 to 70% (depending on the ethnic context) of patients with high-risk hematological malignancies, eligible for allogeneic HSCT, have a fully HLA-matched sibling or matched unrelated donor (MUD), a great deal of effort has been invested to make the use of an alternative haploidentical sibling donor feasible. The advantage of this procedure is the immediate availability of a donor for almost all patients. The aim of the work described in this thesis has been to implement a strategy to transplant a patient using a HLA haploidentical donor. The strategy is to try to improve DFS that could be applied both in the autologous or allogeneic context: first, by using nonspecific immune manipulation post transplant and then, by developing specific strategies directed against leukemia antigens. Particularly in the allogeneic situation, the aim was to increase the GVL effect without inducing or aggravating the deleterious GVHD. The first part of this thesis described our own clinical results, consisting of three consecutive phase I/II studies, in which we tried to determine the feasibility of giving prophylactic donor lymphocyte infusions (DLI) post transplant and the effect of replacing granulocyte colony-stimulating factor (G-CSF), typically used to speed up neutrophil recovery, with granulocyte macrophage colony-stimulating factor (GM-CSF), which is known for its immunomodulatory properties. The slow immune reconstitution in haploidentical transplant is chiefly responsible for the high incidence of early lethal viral and fungal infections, and most probably for early relapses; therefore, we sought to accelerate and strengthen the post transplant immune reconstitution without increasing the GVHD rate. Thus, we have studied the impact of post transplant growth factor administration and of unselected DLI in haploidentical transplant. We have also implemented, in our center, anti-cytomegalovirus (CMV) specific T cell generation and infusion to improve anti-CMV immune reconstitution. Since then, our results have been pooled in a multi-center analysis performed by the European Bone Marrow Transplantation group (EBMT) allowing us to compare our results with those of the entire group. We have also participated in the design of an ongoing study aimed at selectively depleting the graft from alloreactive T cells, and improving post transplant T cell add-backs. In our attempts to generate and expand ex vivo lymphocytes (directed against pathogens (CMV) and leukemia-associated antigens, Wilms' tumor gene 1 (WT1) and to use them in vivo, we found inconsistent results (in the case of WT1) using classical clinical grade dendritic cells (DC) generated and matured in bags, as was the case for the majority of the teams worldwide. This led us to question the full functionality of these DC and we undertook a thorough comparative analysis of DC generated and differentiated in bags and in plates (typical for most pre-clinical studies). This analysis showed us that one cannot transpose pre-clinical studies (using culture plates) directly to clinical protocols (generally using clinical grade culture bags) and that DC generated in bags are functionally deficient. We learned that, if we want to use a DC vaccine to improve the GVL effect in haploidentical transplant, we will have to be careful about the technique by which they are generated. To improve immunotherapeutic approaches, the understanding of the mechanisms underlying tumor tolerance and how to manipulate them is critical in the development of new effective immunotherapeutic clinical trials. This is why we currently focus on how to obtain effective in vivo anti-leukemia immune reactions using an ex-vivo manipulated product to trigger the immunotherapeutic response. More specifically, we are analyzing the impact of regulatory T cell (Tregs) depletion and function for an adequate anti-leukemic immune response. This pre-clinical work aims at improving the outcome of leukemia patients who have relapsed and been put back into second remission and at decreasing the RR after HSCT, especially in the field of haploidentical transplantation. In conclusion, haploidentical transplantation has become a valuable tool. The results are at least similar to those obtained using MUD when performed in the same group of patients. Specific immunomodulation post transplant can affect events such as GVHD and GVL, but clinically we are still at the level of nonspecific manipulations. It is our hope that ongoing pre-clinical work will enable us to perform specific anti-pathogen and anti-leukemia immune manipulation that will favorably influence the patient outcome. / Dans la majorité des situations, le système immunitaire autologue est incapable d’éradiquer les cellules leucémiques résiduelles qui échappent à la radiothérapie et à la chimiothérapie, cependant un équilibre peut s’établir entre les cellules leucémiques et immunitaires aboutissant à une rémission pouvant durer plusieurs mois ou années. Si cet équilibre se rompt, une rechute clinique peut se déclarer. Dans ce contexte, il est prouvé que la greffe allogénique de cellules souches hématopoïétiques est le moyen le plus efficace de renforcer les réactions immunitaires contre la leucémie par la réaction du greffon contre la leucémie et ainsi d’obtenir une éradication définitive de la maladie résiduelle chez un nombre significatif de patients. En effet, le concept global de l’allogreffe de cellules souches hématopoïétiques a évolué du concept de transplantation d’organe (remplacement d’un organe malade par un nouvel organe sain) vers celui de créer une extraordinaire plateforme d’immunothérapie à travers laquelle le système immunitaire du donneur contribue à l’éradication des cellules leucémiques persistantes. Donc, la problématique reste celle de trouver les meilleures modalités d’immunomodulation pour achever une prise du greffon, un effet anti-leucémique puissant du greffon, et l’absence ou un minimum d’effet du greffon contre l’hôte. Différentes stratégies existent pour atteindre cet objectif, comme l’utilisation de cytokines pour moduler la reconstitution immunitaire, des déplétions cellulaires globales ou spécifiques du greffon et l’infusion de cellules immunes «globales» ou spécifiques du donneur après greffe. Ces stratégies sont encore largement à l’étude. Néanmoins, la persistance d’un taux de rechute élevé observé chez les patients leucémiques, après allogreffe reste la cause principale de décès, avant celle liée à la toxicité de la greffe. De plus, étant donné que seulement environ 40 à 70% (dépendant de l’origine ethnique) des patients avec une hémopathie à haut risque, éligibles pour une greffe allogénique, ont un donneur familial ou non familial complètement HLA compatible, des efforts importants ont été développés pour rendre faisable l’utilisation de donneurs familiaux alternatifs, haploidentiques. L’avantage de cette approche est l’accès immédiat à un donneur pour quasiment tous les patients. Le but du travail décrit dans cette thèse a été l’implémentation d’une stratégie d’allogreffe utilisant un donneur haploidentique. Le travail vise également à développer de façon plus large des stratégies qui peuvent améliorer le taux de survie sans rechute, non seulement dans le contexte des greffes haploidentiques, mais également dans le cadre des greffes allogéniques en général, ainsi que dans les situations autologues : premièrement, par la manipulation immunitaire non spécifique après greffe et ensuite par le développement de stratégies spécifiques dirigées contre des antigènes leucémiques. En particulier dans la situation allogénique, le but a été d’augmenter l’effet du greffon contre la leucémie sans induire ou aggraver l’effet délétère du greffon contre l’hôte. La première partie de la thèse décrit les résultats cliniques de notre propre protocole de greffe haploidentique, qui a consisté en trois études consécutives de phase I/II. Dans ces études, nous avons voulu déterminer la faisabilité de réaliser des infusions prophylactiques de lymphocytes du donneur après transplantation, et l’impact du remplacement du « granulocyte colony-stimulating factor » (G-CSF), largement utilisé pour permettre une récupération en polynucléaires neutrophiles plus rapide, par du « granulocyte-macrophage colony-stimulating factor » (GM-CSF), lequel est connu pour ses propriétés immunomodulatrices différentes. La reconstitution immunitaire très lente après greffe haploidentique est majoritairement responsable de l’incidence élevée de décès par infections virales et fungiques précoces, et très probablement des rechutes précoces. C’est pourquoi nous avons cherché à accélérer et à renforcer la reconstitution immunitaire post-greffe sans augmenter la fréquence de réaction du greffon contre l’hôte. Nous avons donc étudié l’impact de l’administration de facteurs de croissance et l’infusion de lymphocytes non sélectionnés du donneur en post greffe haploidentique. Nous avons également implémenté dans notre centre, la génération et l’infusion de lymphocytes T spécifiques anti-cytomégalovirus (CMV) afin d’améliorer la reconstitution immunitaire anti-CMV. D’autre part, nos résultats ont été regroupés dans une étude multicentrique menée par le groupe européen de transplantation de moelle osseuse (EBMT), ce qui nous a permis de comparer nos résultats avec ceux de l’entièreté du groupe. Nous avons parallèlement participé à la conception d’une étude actuellement en cours ayant pour but d’améliorer la reconstitution immunitaire après greffe par la déplétion sélective du greffon en lymphocytes T alloréactifs et par l’infusion après greffe de lymphocytes T du donneur également sélectivement déplétés en lymphocytes T alloréactifs. Afin d’optimaliser l’effet anti-leucémique du système immunitaire, nous avons débuté un protocole de vaccination par cellules dendritiques (DCs). Ces cellules dendritiques étaient chargées en lysat de blastes leucémiques dans le cas de patients présentant au diagnostic une leucémie aigue surexprimant l’oncogène 1 de la tumeur de Wilms (WT1). Néanmoins dans nos travaux de génération et d’expansion ex-vivo de lymphocytes T spécifiques de l’antigène WT1, utilisant les DCs de grade clinique, générées et maturées en poches, nous avons rencontré des résultats inconsistants, comme c’était le cas dans la majorité des protocoles cliniques internationaux de vaccination. Nous nous sommes alors posé la question de la fonctionnalité globale de ces cellules et nous avons entrepris une analyse comparative poussée des DCs générées et différenciées en poches ou en plaques. Les DCs générées en plaques sont celles utilisées dans la plupart des travaux précliniques. Cette analyse nous a montré que l’on ne pouvait pas directement transposer les résultats précliniques basés sur des DCs générées en plaques dans des protocoles cliniques basés sur des DCs générées en poches, car ces dernières présentent des déficits fonctionnels importants. Nous avons appris que si l’on voulait utiliser un vaccin à base de cellules dendritiques pour améliorer l’effet du greffon contre la leucémie dans les greffes allogéniques, nous devions être très attentifs quant au protocole utilisé pour la génération de ces vaccins cellulaires. Pour améliorer les approches immunothérapeutiques, la connaissance des mécanismes qui établissent la tolérance tumorale et des façons de manipuler ceux-ci, est critique dans le développement de nouveaux protocoles efficaces. C’est pourquoi nous nous concentrons actuellement sur les conditions nécessaires à l’obtention in vivo d’une réaction immune anti-leucémique efficace lors de l’utilisation d’un produit cellulaire manipulé ex vivo. Plus spécifiquement, nous analysons l’impact de la déplétion en lymphocytes T régulateurs (Tregs) sur la réponse anti-leucémique. Ce travail préclinique a pour but d’améliorer le devenir de patients leucémiques qui ont rechutés et ont été mis en seconde rémission, ainsi que de diminuer le taux de rechute après allogreffe, spécifiquement après greffe haploidentique. En conclusion, la transplantation haploidentique est actuellement un outil précieux pour de nombreux patients. Les résultats sont au minimum similaires à ceux qui sont obtenus par les greffes non-familiales HLA identiques lorsqu’elles sont pratiquées dans les mêmes groupes de patients. L’immunomodulation spécifique après greffe peut affecter des événements comme la réaction du greffon contre l’hôte et la réaction du greffon contre la leucémie, mais en pratique clinique nous en sommes encore au niveau de la manipulation aspécifique. Nous espérons que les travaux précliniques actuels vont nous permettre d’appliquer des stratégies spécifiques et d’obtenir une manipulation immune anti-leucémique qui aura une influence favorable significative sur le devenir des patients.

Dendritic or branching structures are commonly seen in natural phenomena such as lightning, cracking and vegetal growth. They are also often used for artistic or decorative purposes, ranging from ornamentation to decorative ceramics. Existing procedural methods for modeling these structures remain very limited in terms of control and flexibility. As a result, these objects tend to be modeled individually, which is a painstaking and costly process.<p>We present a new procedural method for modeling dendritic structures based on a path planning approach. Our method includes the implementation of a partial non-scalar distance metric that gives us effective and flexible control handles over the evolving dendritic structure. These control handles are demonstrated by guiding the growth of dendritic structures using input images, allowing us to create a form of stylistic dendritic halftoning and to embed hidden images in dendritic trees to create pareidolia effects. These applications demonstrate the vast diversity of structures that can easily be modeled by our process a flexibility that existing methods definitely lack. We also demonstrate the application of the partial non-scalar distance metric to the context of texture synthesis from example, and show how it holds promise for many other contexts.

Respiratory syncytial virus (RSV) is the primary viral pathogen responsible for lower respiratory tract disease in neonates and young children worldwide. By the age of two, virtually all children have been infected with RSV, and approximately 40% of them develop lower respiratory tract infections. In addition to acute morbidity, an association between RSV infection in early childhood and later development of recurrent wheezing and airway hyperresponsiveness (AHR) has been repeatedly demonstrated.<p>In this work we established a method for propagating pneumonia virus of mice (PVM) in a baby hamster kidney-21 (BHK-21) cell line. We also modified the standard plaque assay method and established a reliable and, most importantly, reproducible way to quantitate PVM. In our work we used PVM strain 15 to successfully establish an in vivo animal model for RSV disease in Balb/c and C57/Bl mice. Different susceptibility/resistance patterns to a pathogen exist for different mouse strains. In the case of Balb/c and C57/Bl mice, these patterns are well characterized for several pathogens including Leishmania major and adenovirus type 1. Our comparative study demonstrated clear differences in susceptibility to PVM strain 15 infection between Balb/c and C57/Bl mice; Balb/c mice being more susceptible.<p> In peripheral sites, dendritic cells (DCs) serve as sentinel cells that take up and process antigens. Numerous studies revealed that certain pathogens stimulate changes in DC phenotypic characteristics and thus contribute to functional alterations that lead to inappropriate T cell activation and disease augmentation. To examine effects of PVM on DCs, we infected bone marrow dendritic cells (BM-DCs) derived from both mouse strains with PVM, and evaluated their phenotypic and functional characteristics 24 hours post infection. Under these experimental conditions, PVM infected BM-DCs did not show a significant increase in the expression of costimulatory and major histocompatibility complex class II (MHC II) molecules compared to uninfected controls. Furthermore, there were no changes in the ability of PVM-infected DCs to take up soluble antigen. The production of IL-12p70, the pivotal cytokine in the development of a Th1-type response, by the PVM-infected BM-DCs was not significantly different from uninfected cells. In addition, there was no significant impact of PVM infection on the ability of DCs to induce naïve T cell proliferation.

Dendritic or branching structures are commonly seen in natural phenomena such as lightning, cracking and vegetal growth. They are also often used for artistic or decorative purposes, ranging from ornamentation to decorative ceramics. Existing procedural methods for modeling these structures remain very limited in terms of control and flexibility. As a result, these objects tend to be modeled individually, which is a painstaking and costly process.<p>We present a new procedural method for modeling dendritic structures based on a path planning approach. Our method includes the implementation of a partial non-scalar distance metric that gives us effective and flexible control handles over the evolving dendritic structure. These control handles are demonstrated by guiding the growth of dendritic structures using input images, allowing us to create a form of stylistic dendritic halftoning and to embed hidden images in dendritic trees to create pareidolia effects. These applications demonstrate the vast diversity of structures that can easily be modeled by our process a flexibility that existing methods definitely lack. We also demonstrate the application of the partial non-scalar distance metric to the context of texture synthesis from example, and show how it holds promise for many other contexts.

Respiratory syncytial virus (RSV) is the primary viral pathogen responsible for lower respiratory tract disease in neonates and young children worldwide. By the age of two, virtually all children have been infected with RSV, and approximately 40% of them develop lower respiratory tract infections. In addition to acute morbidity, an association between RSV infection in early childhood and later development of recurrent wheezing and airway hyperresponsiveness (AHR) has been repeatedly demonstrated.<p>In this work we established a method for propagating pneumonia virus of mice (PVM) in a baby hamster kidney-21 (BHK-21) cell line. We also modified the standard plaque assay method and established a reliable and, most importantly, reproducible way to quantitate PVM. In our work we used PVM strain 15 to successfully establish an in vivo animal model for RSV disease in Balb/c and C57/Bl mice. Different susceptibility/resistance patterns to a pathogen exist for different mouse strains. In the case of Balb/c and C57/Bl mice, these patterns are well characterized for several pathogens including Leishmania major and adenovirus type 1. Our comparative study demonstrated clear differences in susceptibility to PVM strain 15 infection between Balb/c and C57/Bl mice; Balb/c mice being more susceptible.<p> In peripheral sites, dendritic cells (DCs) serve as sentinel cells that take up and process antigens. Numerous studies revealed that certain pathogens stimulate changes in DC phenotypic characteristics and thus contribute to functional alterations that lead to inappropriate T cell activation and disease augmentation. To examine effects of PVM on DCs, we infected bone marrow dendritic cells (BM-DCs) derived from both mouse strains with PVM, and evaluated their phenotypic and functional characteristics 24 hours post infection. Under these experimental conditions, PVM infected BM-DCs did not show a significant increase in the expression of costimulatory and major histocompatibility complex class II (MHC II) molecules compared to uninfected controls. Furthermore, there were no changes in the ability of PVM-infected DCs to take up soluble antigen. The production of IL-12p70, the pivotal cytokine in the development of a Th1-type response, by the PVM-infected BM-DCs was not significantly different from uninfected cells. In addition, there was no significant impact of PVM infection on the ability of DCs to induce naïve T cell proliferation.

Thesis (Ph. D.)--University of Hong Kong, 2009. / Includes bibliographical references (leaves 228-261). Also available in print.

Thesis (Ph. D.)--University of Hong Kong, 2009. / Includes bibliographical references (p. 202-219). Also available in print.

Thesis (M.S.)--Northern Michigan University, 2009. / Includes bibliographical references (leaves 54-65).