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Caractérisation d'EFHC1, une protéine mutées dans l'épilepsie myoclonique juvénile

de Nijs, Laurence 01 March 2010 (has links)
Lépilepsie myoclonique juvénile (EMJ) est un syndrome épileptique très répandu qui appartient aux épilepsies idiopathiques généralisées. Il se caractérise par des secousses myocloniques et des crises tonico-cloniques débutant pendant ladolescence, entre 12 et 18 ans. Son étiologie est génétique et impliquerait linteraction de plusieurs gènes. Des études de liaisons géniques ont permis lindentification, dans un gène localisé en 6p12, de cinq mutations faux-sens co-ségrégées avec le phénotype de EMJ. Ce gène code une nouvelle protéine, dénommée EFHC1, comportant un motif EF-hand, domaine potentiel de liaison au calcium et trois domaines DM10, de fonction inconnue. L'objectif de notre travail consiste à étudier les propriétés biochimiques et fonctionnelles d'EFHC1. Nous avons dabord étudié la localisation subcellulaire dEFHC1 dans différentes lignées cellulaires (HEK-293, HeLa et COS-7) au moyen de deux approches complèmentaires. Dune part nous avons surexprimé la protéine couplée à lEGFP, un marqueur fluorescent permettant se visualisation et dautre part, nous avons étudié la localisation de la protéine endogène au moyen dun anticorps spécifique. Dans les cellules en mitose, EFHC1 montre clairement une association avec le fuseau mitotique, spécialement au niveau des pôles et du corpuscule de Fleming pendant la cytokinèse. EFHC1 co-localise également avec le centrosome dans les cellules en interphase et en mitose. Dans le but de déterminer la région d'EFHC1 impliquée dans lassociation au fuseau mitotique, nous avons effectué des analyses au moyen de différentes formes tronquées de la protéine couplées à lEGFP. Les résultats indiquent que lextrémité N-terminale d'EFHC1, contenant les 45 premiers acides aminés de la protéine est cruciale pour ladressage au fuseau mitotique. Nous avons démontré, au moyen dexpériences dimmunoprécipitations et de co-sédimentation de microtubules, une association directe dEFHC1 avec lα-tubuline, composant des microtubules. Cette interaction est médiée par un nouveau domaine dassociation aux microtubules situé au niveau de lextrémité N-terminale de la protéine, entre les acides aminés 1 et 45. Dautre part, nous avons mis en évidence un rôle important dEFHC1 dans la régulation de la division cellulaire. En effet, la surexpression dune forme tronquée dEFHC1 ne contenant que les 45 premiers acides aminés de la protéine, agissant comme un dominant-négatif, ainsi que linhibition dexpression dEFHC1 par expression de shRNAs induit de façon significative des fuseaux mitotiques anormaux (fuseaux unipolaires, anomalies de condensation des chromosomes au niveau de la plaque équatoriale pendant la métaphase). De plus, nous avons observé que les cellules invalidées en EFHC1 présentaient un défaut de progression mitotique résultant du blocage des cellules en prométaphase anormale, conduisant à une augmentation significative de lindex mitotique (% de cellules en mitose) et à de lapoptose. Enfin, nous avons démontré un rôle dEFHC1 dans la corticogenèse cérébrale. En effet, linvalidation dEFHC1 (shRNAs et dominants-négatifs) dans le néocortex de rat en développement au moyen des techniques délectroporations ex vivo et in utero conduit à un défaut de migration neuronale radiaire. Nous avons montré que celui-ci résultait dune diminution de sortie de cycle cellulaire des cellules progénitrices neuronales conduisant à une accumulation de celles-ci, dune altération de larchitecture des prolongements de la glie radiaire, dune augmentation de la mort cellulaire par apoptose et dun défaut de locomotion des neurones post-mitotiques.
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Paysage dans laction, paysage en action(s). Développement territorial et processus de construction de projets locaux de paysage en Wallonie (Belgique). / Landscape within the action, landscape in action(s). Territorial development and the processes of landscape project design on a local scale in Wallonia (Belgium).

Droeven, Emilie 21 September 2010 (has links)
Linstitutionnalisation du paysage comme enjeu du développement territorial appelle de nouvelles pistes daction et de recherche. Partant de lhypothèse que la démarche de projet de paysage peut répondre favorablement aux nouveaux enjeux en la matière, la recherche constitue une analyse des processus de construction de projets locaux de paysage menés récemment en Wallonie (Belgique). Lobjectif de la recherche est danalyser comment se construit laction locale en matière de gestion des paysages, en élaborant un cadre de caractérisation et dinterprétation apte à rendre compte des processus observés. Le parti de la recherche est dinterroger laction paysagère « en train de se faire », dans sa mise en uvre concrète. À travers une approche inductive, holistique, transdisciplinaire et qualitative, elle se base sur lanalyse de neuf cas détude (Parcs naturels, Groupes daction locale, Contrats de rivière) disponibles en Wallonie. Elle mobilise, comme modes dinvestigation, lanalyse documentaire, lenquête par entretien dacteurs (chargés de mission) et lobservation participante au cur de laction. Quatre dimensions sont ainsi explorées, chacune amenant la chercheure à définir des critères de caractérisation et des catégories spécifiques : les contextes institutionnels démergence et délaboration des projets (acteurs impliqués et instruments daction publique mobilisés), les actions menées au nom du paysage et les représentations sous-jacentes à laction. Ce faisant, la recherche relativise les contributions et montre les limites de la démarche de projet quant à la prise en charge des nouveaux défis en matière de paysage. En guise de conclusion, elle recadre les apports de la problématique paysagère au développement territorial et esquisse des perspectives daction et de recherche encore à assumer pour que la question paysagère soit progressivement prise en charge Summary The European Landscape Convention acknowledges landscape as a key element of territorial development, management and planning. At the same time there has been a rising public concern about landscape evolution and a strong social demand for high quality landscape. In scientific and institutional spheres, as well as within civil society, this has resulted in a growing interest for the everyday landscape and an enlargement of landscape concerns to larger spaces. Consequently a diversification of actors, with an interest in the definition and implementation of the landscape policies, has taken place. These evolutions in landscape concerns require land management and planning, thus permitting new action and research perspectives. Considering that landscape projects can favourably respond to these evolutions, this research, conducted with the support of the Standing Conference on Territorial Development of the Walloon Region, investigates the processes of landscape project design on a local scale in Wallonia (Belgium). The aim of the research is to analyze how action is being carried out in the context of landscape use. In order to do so, it develops a framework for characterizing and interpreting these observed processes. The specificity of the research is to examine the practical implementation of on-going landscape action. Based on the empirical analysis of nine case studies, taking place in Wallonia (Nature Parks, Local Action Groups, River Contracts), the research takes the form of an inductive, holistic, transdisciplinary and qualitative approach. The methods of investigation are a literature review, a stakeholder interview (project coordinator) and participant observation. The research emphasizes four dimensions of the landscape projects: rising and conception conditions (through actors and instruments of public action analysis), implemented actions and underlying social representations. Each enables the researcher to define characterization criteria and specific categories. In doing so, the research relates project contributions and limits assuming new landscape management challenges. In conclusion, it reframes the contribution of the landscape issue to regional development and outlines prospects for further action and research.
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Definition of the DasR regulon in Streptomyces coelicolor, a reservoir for the discovery of new genes essential for the induction of morphological differenciation and secondary metabolites production/ Définition du régulon DasR chez Streptomyces coelicolor, un réservoir pour la découverte de nouveaux gènes essentiels à l'induction de la différenciation morphologique et la production de métabolites secondaires

Colson, Séverine 24 May 2011 (has links)
Ce travail vise à comprendre les mécanismes dinduction du développement chez les Streptomyces. Chez ce genre bactérien, le facteur de transcription DasR a été identifié comme le premier régulateur global à la charnière entre le métabolisme primaire et le métabolisme secondaire, capable de percevoir l'état nutritionnel de l'environnement et d'adapter en conséquence la réponse des différents processus associés au développement (Rigali et al., 2006 et Rigali et al., 2008). La première ambition de cette thèse de doctorat a été d'évaluer l'ampleur du régulon DasR chez S. coelicolor afin d'obtenir une liste - exhaustive et appuyée par des critère de fiabilité - des gènes ciblés par ce régulateur global. L'hypothèse à la base de ce travail de prédiction était qu'au sein du régulon DasR se trouvaient peut-être des gènes de fonction encore inconnue mais essentiels au développement. Comprendre le rôle de ces protéines pouvait déboucher sur l'élucidation de nouvelles voies d'induction du développement et donc peut-être de nouvelles voies à exploiter pour induire le réveil des gènes cryptiques. La première démarche visant à répondre à ce premier objectif nous a amené à constater les lacunes des programmes web de prédiction des régulons existant, notamment le manque de flexibilité au niveau des critères de recherche et au niveau de l'exploitation des résultats obtenus, ainsi que l'absence de moyen permettant d'estimer la fiabilité de la prédiction. C'est pourquoi, dans un premier temps, nous nous sommes lancés le défi de créer un nouvel outil de prédiction des régulons procaryotiques qui répondrait davantage aux attentes des biologistes. Ce programme, nommé PREDetector (Prokaryotic Regulatory Elements Detector), a été réalisé en collaboration avec le Professeur Louis Wehenkel (Department of Electrical Engineering and Computer Science, Université de Liège) (Hiard et al., 2007). Les caractéristiques et les possibilités offertes par PREDetector sont expliquées et illustrées dans le premier chapitre des résultats. Le second chapitre des résultats - ainsi que l'annexe de cette thèse - sont quant à eux dédiés à l'exploitation de ce programme et la caractérisation de l'ensemble des cibles de DasR prédites chez S. coelicolor. Ensuite, et toujours motivé par un souci de présenter un travail fiable pour d'ultérieures investigations, une comparaison des régulons DasR prédits chez différents streptomycètes et autres actinomycètes (prédictions et démarches détaillées dans l'annexe de thèse), vient appuyer notre définition du noyau dur du régulon DasR - conservon DasR - déduit pour l'organisme modèle S. coelicolor. Enfin, nous passons à l'étape d'utilisation de ces données bioinformatiques avec l'étude de gènes/protéines dont l'expression est dépendante de DasR dans le but de peut-être établir de nouvelles connexions entre le métabolisme primaire et le développement chez la souche modèle S. coelicolor. De manière intéressante, le régulon DasR de S. coelicolor comprend plusieurs gènes codant pour des systèmes de transport ABC de sucre. A l'instar du PTSGlcNAc, ces transporteurs situés à l'interface cellule/environnement peuvent aussi être les senseurs de molécules cruciales pour l'induction du développement. Après le PTSGlcNAc, nous nous sommes donc concentrés sur l'étude du premier transporteur ABC de sucre régulé par DasR - en termes de fiabilité des prédictions et de conservation inter-espèces/-genres -, c'est-à-dire, le système DasABC. Dans le troisième chapitre des résultats nous démontrerons ainsi que DasA est une protéine impliquée dans le processus de différenciation morphologique de S. coelicolor (Colson et al., 2008).
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Design, synthesis and biological evaluation of novel coumarinic derivatives as potential anticancer drugs Conception, synthèse et évaluation biologique de dérivés coumariniques en tant qu'agents anticancéreux potentiels

Hemmer, Marc 17 November 2010 (has links)
3-bromophenyl 6-acetoxymethyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-carboxylate (IK9) was recently reported to be a potent inhibitor of cancer cell invasion and angiogenesis. It markedly reduced in vitro invasion of human HT1080 fibrosarcoma cells through collagen-coated porous membranes (Boyden chamber assay) and in vivo tumour growth in athymic nude mice. It was furthermore able to decrease angiogenesis ex vivo in a rat aortic ring assay and in vivo in a choroidal neovascularisation mice model. It nevertheless presents some water solubility and stability problems, which should be taken into account for further investigations. In the first part of the project, we synthesized original IK9 derivatives, modulated at the 3- and 6-positions, by introducing functional groups able to improve water solubility and metabolic stability. Their anti-invasive potency was screened in the Boyden chamber assay and the generated results highlighted some structure-activity relationships. A second part of the project was devoted to the elucidation of the actually unknown mechanism of action of IK9. Anti-invasive or anti-proliferative effects against endothelial cells, main actors of the angiogenic process, were not emphasised. We showed that IK9 acts likely not as an inhibitor of receptor tyrosine kinases (EGFR, PDGFR and VEGFR). The compound generates a weak decrease of mRNA coding for metalloproteinases (MMPs) 2 and 9, and on the other hand a substantial diminution of MMP 2 and 9 secretions by HT1080 fibrosarcoma cells. In conclusion, the consideration of anti-invasive properties together with the worked out solubility and stability profiles highlights several series, notably 6-hydroxycoumarins, 6-hydroxymethylcoumarins and coumarin-3-sulfonamides, whose interest as potential successors to IK9 is undeniable. Le 6-acétoxyméthyl-2-oxo-2H-1-benzopyrane-3-carboxylate de 3-bromophényle (IK9) est un dérivé coumarinique décrit comme inhibiteur puissant de linvasion tumorale et de langiogenèse. Il inhibe linvasion des cellules HT1080 de fibrosarcome humain in vitro à travers une membrane poreuse recouverte dune couche de collagène (test en « chambres de Boyden ») et la croissance tumorale in vivo chez des souris athymiques nues. Il est par ailleurs capable de bloquer langiogenèse, à la fois dans un modèle ex vivo danneaux daorte de rats et dans un modèle in vivo de néovascularisation choroïdale chez la souris. Il présente pour autant une problématique dhydrosolubilité et de stabilité, dont il faudra tenir compte lors dinvestigations futures. Dans une première partie du projet, nous avons synthétisé des dérivés originaux de lIK9, modulés en position 3 et 6 du noyau coumarinique, en introduisant des fonctions susceptibles daugmenter lhydrosolubilité et la stabilité métabolique des molécules obtenues. Leur pouvoir anti-invasif a été évalué dans le test en « chambres de Boyden », ce qui nous a permis de mettre en évidence différentes relations structure-activité. Une deuxième partie du projet fut consacrée à létude du mécanisme daction de lIK9, qui est non identifié jusquà présent. Un effet anti-invasif ou anti-prolifératif envers les cellules endothéliales, actrices principales du processus dangiogenèse, na pu être observé. LIK9 nagit vraisemblablement pas en tant quinhibiteur de plusieurs récepteurs de type tyrosine kinase (EGFR, PDGFR et VEGFR). Le composé engendre une légère baisse de lexpression de lARNm codant pour les métalloprotéases matricielles (MMPs) 2 et 9 mais par contre entraîne une diminution substantielle de la sécrétion des MMPs 2 et 9 par les cellules HT1080 de fibrosarcome humain. En conclusion, la prise en compte simultanée de lactivité anti-invasive, de lhydrosolubilité et de la stabilité met en avant plusieurs séries de dérivés, notamment des 6-hydroxycoumarines, des 6-hydroxyméthylcoumarines et des coumarine-3-sulfonamides, dont lintérêt en tant que successeurs potentiels de lIK9 est indéniable.

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