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Estudo da ocorrência de infecção por Cryptosporidium spp (Apicomplexa: Cryptospordiidae) entre crianças do município de Taubaté- SP e caracterização genotípica de isolados clínicos do parasito / The occurrence of infection by Cryptosporidium spp (Apicomplexa: Cryptosporidiidae) in children living in city of Taubaté-SP and genotypic characterization of the parasite isolates

Ana Julia Urias dos Santos Araujo 30 March 2004 (has links)
Objetivou-se, com o presente estudo, verificar a ocorrência de Cryptosporidium spp entre crianças do município de Taubaté-SP e realizar a genotipagem de isolados clínicos do parasito. Foram selecionadas 13 creches municipais, que atendiam crianças de 4 a 72 meses de idade, realizando-se implantação de um programa para busca ativa de casos de diarréia, com acompanhamento da população durante o ano de 2002. Para se conhecer o perfil coproparasitológico, realizou-se estudo transversal em quatro das 13 creches selecionadas. Foram examinadas 483 amostras fecais processadas pelo método de concentração em formalina-acetato de etila e, para a visualização de oocistos, esfregaços fecais foram corados pelo método de Kinyoun. No estudo prospectivo, Cryptosporidium spp foi encontrado em 11,1 % (3/27) das amostras, não se evidenciando outras espécies parasitárias. No estudo transversal, foram detectados oocistos em 0,2% (1/456) das amostras e a freqüência para outras espécies parasitárias foi de 30,5% (139/456). No estudo de genotipagem, foram analisadas 14 amostras de humanos, uma de bovino e uma de cão. Dentre os isolados de humanos, quatro eram de crianças de Taubaté-SP, cinco de crianças de uma favela de São Paulo-SP e cinco de pacientes HIV positivos, de Sorocaba-SP. O DNA extraído a partir das amostras fecais foi submetido a Nested-PCR, amplificando-se um segmento de 553pb de um gene que codifica proteína de parede de Cryptosporidium (COWP). Os produtos amplificados foram submetidos a processo de digestão enzimática (RPLP-PCR), e os perfis obtidos por eletroforese evidenciaram três espécies: Cryptosporidium hominis em oito amostras, Cryptosporidium parvum em quatro e Cryptosporidium meleagridis em duas. Dos isolados de Taubaté, dois foram correspondentes a C. hominis e dois a C. parvum. As amostras de bovino e de cão foram positivas para C. parvum. O genótipo dos isolados de Taubaté, humanos e de animais, foram confirmados por análise da sequência do fragmento de 553pb do gene COWP, comparando-se com as sequências disponíveis no GenBank. / The aims of this study were to investigate the occurrence of infection by Cryptosporidium spp in children living in Taubaté, São Paulo, Brazil, and to realize the molecular characterization of the parasite isolates. Thirteen day-care centers were selected and 4-72 months old children were involved in prospective study to detect diarrhea, during the 2002 year. In four of these day-care centers, a transversal study was performed in the beginning of the study to know the prevalence of intestinal parasites of children\'s community. A total of 483 stool samples were examined by the modified formalin-etil acetate concentration method, and the acid-fast Kinyoun stain was used to visualize oocysts. In the prospective study Cryptosporidium spp were detect in 11.1 % (3/27) of stool samples and no other parasites were found. In the transversal study oocysts were detected in 0.2% (1/456) of the samples and the frequency of infection by other parasites was 30.5% (139/456). In the genotyping study, 14 stool samples from humans and one sample from bovine and another from dog were analyzed. Among the human isolates, four were from children of Taubaté, five were from children living in a slum of São Paulo city and the other five from HIV-positive patients of Sorocaba, São Paulo. The animal samples were collected in Taubaté region. A DNA fragment of 553 pb of the Cryptosporidium oocyst wall protein (COWP) gene was amplified from stool samples by Nested-PCR, and Restriction Fragment Length Polymorphism analysis identified three species: Cryptosporidium hominis in eight samples, Cryptosporidium parvum in four samples and Cryptosporidium meleagridis in two samples. Among samples from Taubaté, two were positive for C. hominis and two for C. parvum. The bovine and dog samples were positive for C. parvum. The findings trom Taubaté were confirmed by sequence analysis of the 553bp amplicons and comparison of the COWP gene available in the GenBank.
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Detecção e caracterização molecular de norovírus associados a casos de doença diarréica aguda infantil

Barletta, Vívian Honorato 24 February 2011 (has links)
Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2017-06-21T13:51:59Z No. of bitstreams: 1 vivianhonoratobarletta.pdf: 2632443 bytes, checksum: c92921b16b55178bf7a44b922bd843ef (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2017-08-07T19:10:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 vivianhonoratobarletta.pdf: 2632443 bytes, checksum: c92921b16b55178bf7a44b922bd843ef (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-07T19:10:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 vivianhonoratobarletta.pdf: 2632443 bytes, checksum: c92921b16b55178bf7a44b922bd843ef (MD5) Previous issue date: 2011-02-24 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os norovírus (NoV) são importantes agentes etiológicos, responsáveis por surtos e casos esporádicos de doença diarréica aguda, que acometem indivíduos de todas as idades. A partícula viral não apresenta envelope e o material genético é constituído por uma molécula de RNA de fita simples, de polaridade positiva. Pertencem à família Caliciviridae, gênero Norovirus e estão classificados em cinco genogrupos (GI–V), sendo que os NoV humanos estão agrupados nos genogrupos I, II e IV e destes, os NoV do genogrupo II e genótipo 4 (GII.4) são os mais comumente encontrados, em todo o mundo. Apesar da associação destes vírus com a doença diarréica aguda estar bem documentada na literatura mundial, no Brasil, os trabalhos são escassos e restritos aos grandes centros e adjacências. Assim, considerando-se o pouco conhecimento sobre os norovírus e a inexistência de dados epidemiológicos na cidade de Juiz de Fora, MG, foi realizado o presente estudo, cujos objetivos foram a detecção e caracterização molecular de amostras de NoV, associadas a casos esporádicos de doença diarréica aguda infantil, bem como a avaliação da influência de fatores climáticos e demográficos na ocorrência destas infecções. De janeiro de 2008 a dezembro de 2009, 218 espécimes fecais foram analisados para a presença de NoV, por RT-PCR convencional, todos obtidos de crianças de 0 a 12 anos de idade, proveniente de atendimentos ambulatoriais (89,45%) e hospitalizados (10,55%). Foram detectadas 20 (9,17%) amostras positivas e observou-se uma tendência de sazonalidade das infecções no período da estação seca, no ano de 2008, fato que não se repetiu em 2009. A maioria das amostras positivas foi detectada em crianças na faixa de 0 a 36 meses e não houve correlação, estatisticamente significante, entre a ocorrência das infecções e o sexo. Das 20 amostras detectadas, 19 foram caracterizadas como NoV GII e 1 como NoV GI. O sequenciamento parcial do genoma e a análise filogenética das amostras selecionadas, revelou a presença de NoV dos genótipos GII.4 e GII.6, que cocircularam nos dois anos do estudo. As amostras NoV GII.4, detectadas em Juiz de Fora, apresentaram maior similaridade de nucleotídeos e de aminoácidos com aquelas que circularam no estado do Rio de Janeiro nos anos de 2006, 2007 e 2008. A análise filogenética das amostras NoV GII.6 detectadas em Juiz de Fora, associada à alta similaridade das sequências de nucleotídeos e aminoácidos, mostrou que estas foram mais proximamente relacionadas com a amostra NoV GII.6 (GU132461/2007), detectada no estado do Rio de Janeiro em 2007, fatos que, aliados à proximidade geográfica de ambas as cidades, sugerem uma possível linhagem comum entre as mesmas. Este levantamento epidemiológico permitiu constatar a presença e circulação de NoV na população infantil de Juiz de Fora, MG, demonstrando sua importante participação como agente etiológico das diarreias agudas, também nesta comunidade / Noroviruses (NoV) are important etiological agents responsible for outbreaks and sporadic cases of acute diarrhea in individuals of all ages. The viral particles are nonenveloped with and the genome is composed of a positive single-stranded RNA. Norovirus belongs to the Caliciviridae family, Norovirus genus and are classified into five genogroups (GI-V), with GI, GII and GIV being found in human and among them, the NoV GII genotype 4 (GII.4) are the most commonly found worldwide. In Brazil, norovirus surveys are realized mainly in research institutes, carried out in the biggest centers and surroundings. Thus, considering the little knowledge about these viruses and the lack of epidemiological data on this viral infection in the Juiz de Fora city, MG state, it was performed this study, which aimed to detect and characterize the NoV samples, associated with sporadic cases of acute infantile diarrhea, as well as asses the influence of climatic and demographic factors in the occurrence of these infections. Between January 2008 to December 2009, 218 fecal specimens were analyzed for the presence of NoV by conventional RT-PCR, all obtained from children 0-12 years of age, from outpatient (89.45%) and inpatients (10.55%). We detected 20 (9.17%) positive samples and there was a tendency for seasonal infections during the dry season in 2008, a fact which was not repeated in 2009. The biggest number of positive samples were detected in children aged 0 to 24 months and there was no statistically significant correlation between the occurrence of infections and sex. Of the 20 samples detected, 19 were characterized as NoV GII and 1 as NoV GI. The partial genome sequencing and phylogenetic analysis of selected samples revealed the presence of NoV genotypes GII.4 and GII.6, which co-circulated in the two years of study. Samples NoV GII.4 detected in Juiz de Fora, showed greater similarity of nucleotides and aminoacids with those that circulated in the state of Rio de Janeiro during 2006, 2007 and 2008. Phylogenetic analysis of the samples GII.6 NoV, detected in Juiz de Fora, associated with the high similarity of nucleotide and amino acid sequences showed that they were most closely related to the sample GII.6 NoV (GU132461/2007) detected in the state of Rio de Janeiro in 2007. This fact associated with the geographical proximity of both cities, suggesting a possible common lineage between them. This epidemiological survey revealed the presence and circulation of NoV in the infantile population of Juiz de Fora, MG, demonstrating its important role as an etiologic agent of acute diarrhea, also in this community.

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