Spelling suggestions: "subject:"digestible"" "subject:"digestibility""
1 |
Identification and functional analysis of intestinal stem cell genes in homeostasis and cancerBarriga de Vicente, Francisco Martín,1983- 28 November 2013 (has links)
The first chapter of this thesis describes the study of intestinal stem cells (ISCs) and
their relationship to colon cancer. We describe the transcriptional landscape of
intestinal epithelial populations through the use of the surface marker EphB2 which
allowed us to build an ISC-specific gene signature. Elevated levels of this signature
characterize CRC patients with high risk of disease relapse after therapy. Furthermore,
our studies led us to discover that colon cancers are organized according to a
hierarchical structure similar to that present in the normal colonic epithelium. EphB2-
high cells retain an ISC-like phenotype and behave as cancer stem cells (CSCs).
The second chapter of this thesis focuses on the description of the function of Mex3a, a
novel ISC-specific gene. We generated genetic mouse models to disrupt Mex3a
function in vivo. We show that this RNA binding protein is required for embryonic
development, but dispensable in adult intestines. By generating a Mex3a reporter
mouse we have been able to identify intestinal cells that resemble label-retaining cells.
This mouse strain has also allowed us to purify stem/progenitor cells from other
tissues. We demonstrate that Mex3a is a translational activator that interacts with the
protein HuR. Our data suggest that Mex3a may be involved in the response of stem
cells to stress. / El primer capítulo de esta tesis describe el estudio de células madre intestinales
(CMIs) y su relación con el cáncer de colon. Describimos los perfiles de expresión
génica de las distintas poblaciones intestinales utilizando la expresión del receptor
EphB2. Esto nos permitió describir la firma genética de las CMIs. Observamos que los
tumores de colon con altos niveles de expresión de la firma genética de CMI tienen
mayor probabilidad de recaer después de terapia. Además de estas observaciones,
describimos que los tumores de colon se organizan con una estructura similar a la del
colon normal. Finalmente observamos que las células tumorales con altos niveles de
EphB2 retienen una identidad de célula madre intestinal y se comportan como células
madre tumorales.
El segundo capítulo de esta tesis se centra en el estudio del gen Mex3a, el cual es un
nuevo gen específico de células madre intestinal. Generamos ratones modificados
genéticamente para eliminar la función de Mex3a in vivo. Observamos que este gen es
esencial para el desarrollo embrionario, pero que es dispensable para la homeostasis
del intestino adulto de ratón. También generamos un ratón reportero de Mex3a que
nos permitió purificar una población de células intestinales que se asemejan a “células
retenedoras de marcaje”. Además, con este ratón reportero pudimos purificar células
madre de otros tejidos. Demostramos que Mex3a es un activador traduccional que
interacciona con la proteína HuR. Nuestros datos sugieren que Mex3a podría estar
involucrado en como las células madre responden a estrés.
|
2 |
Paper de Snail1 en el pàncrees adultLoubat Casanovas, Jordina, 1982- 12 June 2015 (has links)
No description available.
|
3 |
WNT signaling, hypoxia and GATA6 : their role in colorectal cancer, stem cells and disease progressionWhissell, Gavin, 1978- 03 December 2013 (has links)
The recent discovery that intestinal adenomas are built on a stem cell hierarchy has raised great interest in understanding the signals that maintain tumor stem cells. We unveiled the existence of a transcriptional circuit dedicated to prevent the expansion of adenoma stem cells during the onset of CRC. This circuit was found to be controlled by the transcription factor GATA6, which directly activated the expression of the WNT pathway component LGR5 and repressed BMP levels in adenomas. As a result of this mechanism, two cell compartments were established in adenomas: a BMP positive zone that comprises differentiated tumor cells and a BMP negative niche that hosts adenoma stem cells. Genetic deletion of Gata6 elevated BMP levels in tumors, which in turn inhibited adenoma stem cell self-renewal and intestinal tumorigenesis. These findings represent a key contribution to understand the mechanisms that regulate the tumor stem cell hierarchy and reveal for first time the existence of a niche that protects AdSCs from BMP signals.
In subsequent studies, we further explore the role of GATA factors in EMT both in Drosophila and mammalian models. During the formation of the Drosophila endoderm relatively static epithelial cells have to convert to highly migratory cells to form a large part of the intestinal tract. We showed that the Drosophila GATA factor Srp is necessary to induce EMT, which resulted in relocalization of E-cadherin protein without altering its expression. Mammalian GATA4 and GATA6 also induced an EMT when ectopically expressed in culture. GATA factor Srp and GATA6 both transcriptionally inhibited Crumbs orthologues, delocalized E-cadherin and activated mesenchymal genes. This work has uncovered a novel evolutionarily conserved alternative route to EMT that is Snail independent. This discovery could have important clinical implications in pathogenesis, namely in cancer progression.
Further studies aimed to characterize WNT signaling during CRC progression. WNT signaling is required for the maintenance of colorectal cancer stem cells (CRC-SCs) but paradoxically low levels of WNT genes associate with a higher risk of disease relapse. We identified a core expression program driven by beta-catenin/TCF in CRC-SCs, which was shown to be a strict indicator of the dependency on WNT signaling for growth. We showed that during disease progression, a subset of WNT genes is downregulated as a consequence of tumor hypoxia. This response characterized a group of patients displaying very high risk of cancer recurrence after therapy. Hypoxia-induced genes were prominently expressed at invasion fronts coinciding with lower expression of the WNT program. Therefore, hypoxia refines the WNT program in CRC-SCs during the acquisition of a malignant phenotype. This finding has important implications in CRC progression, as it explains how some CRC-SC genes (like EPHB2) are shut down during the progression of the disease and directly challenges recent high impact work in the field that points to methylation as the mechanism responsible for the refinement of WNT signaling. Moreover it identifies hypoxia as a culprit in this invasive cell phenotype. These findings may have important clinical implications in treatment of CRC. / El reciente descubrimiento de que los adenomas intestinales mantienen una jerarquía similar a la del epitelio intestinal normal, ha despertado gran interés por entender las señales que especifican y mantienen a las células madre tumorales. En este trabajo, damos a conocer la existencia de un circuito transcripcional dedicado a prevenir la expansión de células madre de adenoma durante el inicio del cáncer colorectal (CCR). Este circuito está controlado por el factor de transcripción GATA6, el cual activa directamente el componente de la vía de señalización WNT LGR5, y reprime los niveles de BMP en adenomas. Como resultado de este mecanismo, se establecen dos compartimentos celulares en los adenomas: una zona BMP positiva que contiene células tumorales diferenciadas y un nicho BMP negativo que aloja células madre de adenoma. La deleción genética de Gata6 eleva los niveles de BMP en tumores, lo que a su vez inhibe la auto-renovación de células madre de adenoma y la tumorigénesis intestinal. Estos hallazgos representan una contribución fundamental para comprender los mecanismos que regulan la jerarquía de las células madre tumorales y revelan por primera vez la existencia de un nicho que protege a las células madre de adenoma de señales BMP.
En estudios posteriores, continuamos explorando el rol de los factores GATA en la transición epitelio-mesénquima tanto en modelos de Drosophila como de mamífero. Durante el desarrollo del endodermo en Drosophila, células epiteliales relativamente estáticas se convierten en células migratorias para formar una gran parte del tracto intestinal a través del proceso de transición epitelio-mesénquima. Hemos demostrado que el factor GATA -en Drosophila denominado Srp- es necesario para inducir una transición epitelio-mesénquima que da lugar a la relocalización de la proteína E-cadherina sin alterar su expresión. Los factores GATA4 y GATA6 de mamífero también inducen transición epitelio-mesénquima cuando son expresados de forma ectópica en cultivos celulares. Tanto el factor GATA Srp como GATA6 inhiben la transcripción de ortólogos de Crumbs, deslocalizan la E-cadherina y activan genes mesenquimales. Nuestro trabajo ha dado a conocer una nueva ruta alternativa para la transición epitelio-mesénquima que se encuentra conservada evolutivamente y que es independiente de Snail. Este descubrimiento podría tener importantes implicaciones clínicas en patogenia, y más específicamente en la progresión del cáncer.
Un tercer aspecto del trabajo presentado se centra en la caracterización de la vía de señalización WNT durante la progresión del CCR. La señalización WNT es necesaria para el mantenimiento de las células madre de cáncer colorectal (CM-CCR), aunque paradójicamente, bajos niveles de genes WNT se asocian con un mayor riesgo de recaída de la enfermedad. Hemos identificado un programa básico de expresión impulsado por beta-catenina/TCF en CM-CCR, que se ha demostrado ser un indicador estricto de la dependencia de señalización WNT para el crecimiento. Hemos demostrado que durante la progresión de la enfermedad, se suprime la expresión de un subconjunto de genes WNT como consecuencia de hipoxia tumoral. Esta respuesta caracteriza a un grupo de pacientes con un muy alto riesgo de reincidencia del cáncer después de la terapia. Los genes inducidos por hipoxia se expresan de manera prominente en frentes de invasión coincidiendo con una menor actividad de la vía del programa WNT. Por lo tanto, la hipoxia refina el programa WNT en CM-CCR durante la adquisición de un fenotipo maligno. Este hallazgo tiene implicaciones importantes para la progresión del CCR, porque explica cómo algunos genes de CM-CCR (como receptores EPHB2) se apagan durante la progresión de la enfermedad y directamente desafía trabajos de alto impacto recientemente reportados en el área, que apuestan por la metilación como mecanismo responsable del refinamiento del programa WNT. Por otra parte, identifica a la hipoxia como un culpable de este fenotipo de células invasivas. Estos hallazgos podrían tener importantes implicaciones clínicas en el tratamiento del cáncer colorectal.
|
4 |
Efficacy of adjunctive Er,Cr:YSGG laser application following scaling and root planing in periodontally diseased patientsRuiz Magaz, Vanessa 13 July 2015 (has links)
Scientific rationale for study
The literature about lasers in the field of periodontology is contradictory. The present study aimed at evaluating benefits of Er, Cr: YSGG laser irradiation following deep scaling compared to scaling alone in a randomized controlled clinical trial based on an appropriate sample size.
Principal Findings
The present study demonstrated that laser irradiation combined with conventional Sc/RP did not improve the clinical outcomes regarding probing pocket depth reduction and attachment level gain compared to Sc/RP alone.
Practical implications
Taken into account that lasers are expensive devices and no superior results can be expected by using them, their recommendation for clinical application is still questionable. / Justificació de l´estudi
La literatura sobre l´ús de làser en el camp de la periodòncia és contradictori. Aquest estudi té com objectiu evaluar els beneficits de la irradiació amb làser d´Er,Cr:YSGG després de realitzar un raspat de les arrels comparat amb el raspat sense aplicar làser en un estudi clínic randomitzat amb un tamany mostral adequat.
Resultats principals
Aquest estudi ha demostrat que la irradiació de láser Er,Cr:YSGG combinada amb el tractament convencional de raspat I allisat radicular no millora les variables clíniques en la disminució de la profunditat de bossa i del augment del nivell d´inserció clínica.
Implicacions pràctiques
Tenint en compte que els aparells de làsers son costosos i que els resultats obtinguts no son superiors al tractament convencional, la recomanació d´aplicació clínica és a data d´avui encara qüestionable.
|
5 |
Expression and role of cyclin O in colorectal cancerKünnemann, Kathi, 1982- 13 September 2013 (has links)
Cyclin O, a novel identified Cdk1 and Cdk2-binding cyclin, has been demonstrated to
be required for apoptosis induced by intrinsic apoptotic stimuli. Because proteins
implicated in apoptosis are often deregulated in cancer, we aimed to study the
expression and role of Cyclin O in Colorectal carcinomas. We demonstrate that Cyclin
O is overexpressed in CRC already during early stages of tumour development. Cyclin
O expression correlated with a better prognosis of the CRC patients. Furthermore, we
could show that loss of one Cyclin O allele leads to a higher adenoma count in a
mouse model of CRC, the APCmin/+ mouse, suggesting that Cyclin O has tumour
suppressor functions. Addtionally, we observed Cyclin O expression in the
histologically normal APCmin/+ mouse- and in human peritumoral- intestinal epithelium.
Accordingly, we hypothesise that Cyclin O could act as an early indicator of epithelial
cell transformation to CRC. / La Ciclina O, una ciclina que ha estat identificada recentment i que s'uneix amb Cdk1 i
Cdk2, s'ha demostrat ser necessària per a l'apoptosis induïda per estímuls intrinsecs.
Donat que les proteïnes implicades en apoptosis solen estar desregulades en el
càncer, nosaltres hem volgut estudiar l'expressió i la implicació de la Ciclina O en
carcinomes colorectals (CRC). Hem demostrat que la Ciclina O es sobreexpressa en
estadis prematurs de CRC. L'expressió de la Ciclina O correlaciona amb una millor
pronòstic en pacients amb CRC. A més, hem demostrat que la pèrdua d'un al·lel de la
Ciclina O comporta l'aparició d'un major nombre d'adenomes en un model de ratolí de
CRC, els ratolin s APCmin/+. Això ens indica que la Ciclina O funciona com un gen
supressor de tumors. També hem observat expressió de la Ciclina O en teixits no
tumorals de l'epitel·li intestinal dels ratolins APCmin/+ i en teixit peritumorals de pacients
amb CRC. Amb aquestes observacions hem arribat a formular la hipòtesi de que la
Ciclina O podria ser útil com a indicador precoç de la transformació de cèl·lula
epitel·lial a tumoral en los pacientes de CRC.
|
6 |
Cellular processing bodies and the hepatitis C virus life cycle : characterization of their dynamic interplayPérez Vilaró, Gemma, 1985- 16 November 2012 (has links)
Els cossos de processament (cossos-P) són grànuls discrets i dinàmics que contenen mRNAs represos en la traducció així com proteïnes involucrades en la degradació dels mRNAs i de la maquinària dels miRNAs. Alguns components dels cossos-P, com els repressors de la traducció PatL1, LSm1 i DDX6, promouen la traducció i la replicació del virus de la hepatitis C (VHC) i d’altres virus RNA de polaritat positiva [RNA(+)]. A més a més, un genome wide screening en llevat va determinar que l’exonucleasa Xrn1, que també es localitza als cossos-P, pot afectar la taxa de recombinació d’un virus RNA(+) de plantes Així doncs, els components dels cossos-P estan estretament relacionats amb els cicles vitals dels virus RNA(+).
En l’estudi que aquí es presenta hem explorat la relació del VHC amb els cossos-P, demostrant que la infecció pel VHC promou canvis en la composició dels cossos-P a través de l’alteració de la localització d’aquells components que són necessaris per a la replicació viral. A més a més, hem demostrat que els components dels cossos-P però no els grànuls per se són necessaris per a la replicació del VHC. Addicionalment, hem posat a punt un sistema de detecció de recombinació en cultiu cel•lular basat en replicons del VHC que permet analitzar successos de recombinació i caracteritzar la possible participació dels components dels cossos-P en aquest mecanisme d’evolució. Amb aquest sistema s’han establert les primeres estimacions en la freqüència de recombinació del VHC indicant que la recombinació en aquest virus no és gaire comú. A més a més, la reducció del nivell d’expressió de Xrn1 no va alterar la taxa de recombinació del VHC indicant que la utilització de l’exonucleasa no és una característica general en la recombinació dels virus RNA(+). En conjunt, aquests resultats incrementen el nostre coneixement sobre els aspectes bàsics de la biologia del VHC així com de l’estreta relació que aquest virus estableix amb l’hoste.
|
7 |
Evaluación del ajuste marginal de coronas de zirconio fabricadas con dos sistemas CAD-CAM en preparaciones con dos diferentes diseños de línea de terminaciónEuan Salazar, Raul Iram 16 January 2015 (has links)
El propósito de esta investigación es evaluar la capacidad del sellado marginal de
restauraciones de zirconio fabricadas a partir de impresiones digitales y de modelos de
yeso obtenidos con poliéter como material de impresión en preparaciones con dos
diseños de línea de terminación diferentes, hombro redondeado de 90º y chaflán de 45º;
así como la influencia de los ciclos de cocción de la cerámica de recubrimiento, el
glaseado y el cementado en el sellado marginal.
|
8 |
Identification and characterization of an oncogenic form of IKKα in colorectal cancerMargalef González, Pol, 1985- 17 February 2014 (has links)
L’IKKα
nuclear
regula
la
transcripció
gènica
i
ha
estat
relacionada
amb
la
progressió
del
càncer
i
la
metàstasis,
tot
i
que
la
connexió
mecanística
no
s’entén
massa
bé.
Hem
observat
que
les
cèl·∙lules
tumorals
tenen
una
forma
d’IKKα
activada
(p45-‐IKKα)
al
nucli.
Aquesta
p45-‐IKKα
activada
i
nuclear
forma
un
complex
amb
IKKα
no
activada
i
NEMO
que
media
la
fosforilació
d’SMRT
i
d’histona
H3.
La
formació
de
p45-‐IKKα
és
necessària
per
tal
de
prevenir
l’apoptosis
de
les
cèl·∙lules
de
càncer
colorectal
i
per
tal
de
mantenir
el
creixement
tumoral.
També
hem
observat
que
KRAS
a
través
de
BRAF
indueix
l’activació
de
p45-‐IKKα
mediada
per
TAK1,
amb
un
mínim
efecte
sobre
NF-‐κB.
Mecanísticament,
BRAF
promou
la
ubiquitinació
de
NEMO
i
l’associació
de
la
forma
activada
de
TAK1
al
complex
de
p45-‐IKKα.
També
hem
desmostrat
que
p45-‐IKKα
és
necessària
per
la
transformació
cel·∙lular
mediada
per
KRAS/BRAF
i
que
inhibidors
de
la
funció
endosomal
suprimeixen
l’activitat
de
TAK1
i
de
p45-‐IKKα.
Treient
partit
d’un
model
ortotòpic
xenògraft
humà
hem
demostrat
l’eficàcia
d’aquestes
drogues
en
prevenir
la
capacitat
metastàtica
de
cèl·∙lules
primàries
de
càncer
colorectal
d’un
pacient
amb
resistència
adquirida
al
tractament
quimioteràpic
estàndard / Nuclear
IKKα
regulate
gene
transcription
and
it
has
been
linked
to
cancer
progression
and
metastasis,
although
the
mechanistic
connection
remains
poorly
understood.
We
have
found
that
nucleus
of
tumor
cells
contains
an
active
IKKα
isoform
of
45kD
(p45-‐IKKα).
Active
nuclear
p45-‐
IKKα
forms
a
complex
with
non-‐active
IKKα
and
NEMO
that
mediates
phosphorylation
of
SMRT
and
Histone
H3.
Generation
of
p45-‐IKKα
is
required
to
prevent
apoptosis
of
CRC
cells
and
to
sustain
tumor
growth.
We
have
observed
that
KRAS
through
BRAF
induces
TAK1-‐mediated
activation
of
p45-‐IKKα,
with
minor
impact
on
NF-‐κB.
Mechanistically,
BRAF
promotes
NEMO
ubiquitination
and
association
of
active
TAK1
to
the
p45-‐IKKα
complex.
We
also
demonstrate
that
p45-‐IKKα
is
required
for
KRAS/BRAF-‐mediated
cell
transformation
and
inhibitors
of
the
endosomal
function
abolished
TAK1
and
p45-‐IKKα
activities.
Using
a
human
orthotopic
xenograft
model
we
demonstrate
the
efficacy
of
these
drugs
in
preventing
the
metastatic
capacity
of
primary
CRC
cells
from
a
patient
with
acquired
resistance
to
standard
chemotherapy.
|
9 |
A 810 nm Diode Laser following Modified Widman Flap SurgerySanz Moliner, Javier Daniel 06 July 2012 (has links)
The purpose of this study was to clinically compare the use of a 810 nm diode laser (DL) following modified Widman flap (test sites) to that of modified Widman flap (MWF) alone (control sites). Thirteen patients with periodontal pockets in two different quadrants with at least one tooth exhibiting a pocket depth of >7 millimeters and attachment levels of >7mm were selected. One side was randomly selected to receive MWF and the other to receive a diode laser following MWF. The DL was used to de-epithelialize the inner part of the periodontal flap and photo-biostimulate the surgical area. Probing depth (PD), clinical attachment levels (CAL), plaque index (PI), and gingival index (GI) were evaluated at baseline, 6 weeks and 5 months. Pain scale assessment (PS), pain medication consumption (PM), tissue edema (TE), and tissue color (TC) were evaluated one week following surgery. Treatment differences were analyzed using McNemar’s test, paired t-tests or a Wilcoxon Signed Rank Test. No statistical differences of CAL gain, PD, GI and PI reduction between laser sites and control sites were seen. Statistically significant differences were seen for TE (p=0.041), PM (p<0.001) and PS (p<0.001) favoring test sites. TC did not show a statistically significant difference (p=0.9766). Patients rated the first surgical treatment performed as more painful than the second (p<0.002). The use of a 810 nm diode laser following modified Widman flap provided additional benefits in terms of less edema and post operative pain.
|
10 |
Signalling pathways activated by inflammatory cytokines can regulate genes involved in gastric carcinogenesisCobler Moncunill, Lara, 1985- 09 September 2013 (has links)
The infection of gastric mucosa by Helicobacter pylori is a key step in the initiation and evolution to gastric adenocarcinomas. Prolonged infection promotes the infiltration of inflammatory cells and subsequent increased presence of pro-inflammatory cytokines. During the sequence of gastric pre-neoplasic lesions decrease the expression of gastric-specific genes whereas appears the ectopic expression of intestinal-specific genes. We describe that in gastric pre-neoplasic lesions and adenocarcinomas decrease the expression of the gastric transcription factor SOX2, whereas high expression of the intestinal transcription factor CDX2 is detected. Moreover, the pro-inflammatory cytokine IL-6, through SHP-2/ERK/MAPK and JAK/STAT pathways, contributes to the regulation of CDX2 expression in gastric cancer cells. And, NF-κB pathway, induced by IL-1β and TNF-α, has a role in the down-regulation of the gastric marker TFF1 in human stomach explants and gastric cancer cells. In conclusion, signalling pathways induced by pro-inflammatory cytokines can contribute to the down-regulation of gastric genes and the up-regulation of intestinal genes. / La infecció de la mucosa gàstrica per Helicobacter pylori és un factor clau en la iniciació i desenvolupament d’adenocarcinomes gàstrics. Durant una infecció prolongada augmenta la presència de citoquines pro-inflamatòries. En la seqüència de lesions pre-neoplàsiques gàstriques disminueix l’expressió de gens gàstrics i apareix l’expressió de gens intestinals. En aquest treball hem descrit que en lesions pre-neoplàsiques i adenocarcinomes gàstrics disminueix l’expressió del factor de transcripció gàstric SOX2, a la vegada que es detecta l’expressió ectòpica del factor de transcripció intestinal CDX2. A més, la citoquina pro-inflamatòria IL-6, a través de les vies SHP-2/ERK/MAPK i JAK/STAT, contribueix a la regulació de l’expressió de CDX2 en cèl•lules de cancer gàstric. La via d’NF-κB, induïda per IL-1β i TNF-α, contribueix a la disminució del marcador gàstric TFF1 en explants gàstrics humans i línies cèl•lulars gàstriques. En conclusió, les vies de senyalització induïdes per citoquines pro-inflamatòries poden ajudar a la disminució de l’expressió de gens gàstrics i a l’increment de l’expressió de gens intestinals.
|
Page generated in 0.063 seconds