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Computer simulations : Orientation of Lysozyme in vacuum under the influence of an electric fieldAbrikossov, Alexei January 2011 (has links)
The possibility to orient a protein in space using an external electrical field was studied bymeans of molecular dynamics simulations. To model the possible conditions of an electrospray ionization (ESI) the protein Lysozyme in vacuum was considered under the influence ofdifferent field strengths. The simulations showed three distinct patterns: (1) the protein wasdenaturated when exposed to too strong electrical fields, above 1.5 V/nm; (2) the proteinoriented without being denaturated at field strengths between 0.5 V/nm and 1.5 V/nm (3) theprotein did not orient and did not denaturate if the strength of the field became to low, below0.5 V/nm. Our simulations show that the orientation of the protein in the fields correspondingto the second pattern takes place within time intervals from about 100 ps at 1.5 V/nm to about1 ns at 0.5 V/nm. We therefore predict, that there exists a window of field strengths, which issuitable for orientation of proteins in experimental studies without affecting their structure.The orientation of proteins potentially increases the amount of information that can beobtained from experiments such as single particle imaging. This study will therefore bebeneficial for the development of such modern techniques.
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A Study of the Dayside High-Lattitude Ionospheric Electrodynamics During Extended Solar MinimumJenniges, Janelle V. 01 May 2015 (has links)
The high-latitude electric eld fall-o region connects convection in the polar cap to the region where ring currents modify the penetration electric field equatorward of the polar cap boundary. This region is often overlooked because it falls between the limits of low latitude and high-latitude ionospheric models. However, penetrating electric fields cause large changes in ion composition; and therefore, correctly modeling the electric fields and plasma drift in this region aids in correctly specifying the ionosphere. Many ionospheric models use the Kp index as a physical driver, and so the latitude dependence of the plasma drift in the fall-o region was investigated as a function of Kp using Defense Meteorological Satellite Program ion drift data from the 2007{2010 solar minimum. Both the dusk and dawn sectors were analyzed and t to analytical functions describing the fall-o with decreasing latitude. The latitude dependencies were found to dier in the dusk and dawn sectors with a factor of two increase in the expansion of the duskside polar cap radius and auroral region over the dawnside. Additionally, the low-Kp polar cap radius was found to be five degrees smaller than the radius currently used in simple ionospheric models.
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Projeto e construcao de uma estrutura aceleradora de eletrons de onda continuaTAKAHASHI, JIRO 09 October 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2014-10-09T12:42:40Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2014-10-09T14:01:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1
05030.pdf: 6618082 bytes, checksum: b37bbbe1087da50e0aecf20762c5f711 (MD5) / Tese (Doutoramento) / IPEN/T / Instituto de Pesquisas Energeticas e Nucleares - IPEN/CNEN-SP
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Dinâmica quântica de uma partícula neutra em campos elétricos externos.AZEVEDO, Frankbelson dos Santos. 16 October 2018 (has links)
Submitted by Emanuel Varela Cardoso (emanuel.varela@ufcg.edu.br) on 2018-10-16T16:53:51Z
No. of bitstreams: 1
FRANKBELSON DOS SANTOS AZEVEDO – DISSERTAÇÃO (PPGFísica) 2015.pdf: 1064778 bytes, checksum: c929ffea2d7e7c51359bf2dfc237fbf9 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-16T16:53:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1
FRANKBELSON DOS SANTOS AZEVEDO – DISSERTAÇÃO (PPGFísica) 2015.pdf: 1064778 bytes, checksum: c929ffea2d7e7c51359bf2dfc237fbf9 (MD5)
Previous issue date: 2015-09-24 / Capes / Este trabalho tem por objetivo estudar a dinâmica quântica planar de partículas
neutras de spin-1/2 na presença de campos elétricos. A priori uma partícula com
carga nula não devia interagir com campos eletromagnéticos, mas ao admitir partículas
possuindo momento de dipolo magnético, vemos que a interação é possível. Tal estudo
acontece através da equação de Dirac com acoplamento não mínimo, onde o termo de
interação leva em conta o momento de dipolo magnético, spin da partícula e campo eletromagnético. A partir dessa equação, derivamos e resolvemos duas equações diferenciais de primeira ordem, mostrando que as soluções estão atreladas ao spin. As soluções para o efeito Aharonov-Casher é discutida em detalhes pela primeira vez neste trabalho. Também derivamos uma equação diferencial de segunda ordem, a partir da qual obtivemos o níveis de energia para uma partícula movimentando-se em um caminho circular de raio constante. Além disso, usando o método de extensão auto-adjunta, encontramos funções de onda de estados ligados e níveis de energia para o espaço completo, incluindo a região r = 0. Os níveis de energia obtidos são análogos aos níveis de Landau, e mostram uma dependência com o parâmetro projeção de spin. Por fim, tomamos o limite não relativístico para o espaço completo. / This work aims to study the planar quantum dynamics of neutral particles of spin-
1/2 in the presence of electric fields. A priori a particle with null charge should not interact
with electromagnetic fields, but to admit particles having magnetic dipole moment, we
see that the interaction is possible. Such study happen through the Dirac equation with
non-minimal coupling, where the interaction term takes into account the magnetic dipole
moment, spin of the particle and electromagnetic field. From this equation, we derive
and solve two differential equations of first order, showing that the solutions is linked
to spin. The solutions to the Aharonov-Casher effect is discussed in detail for the first
time in this study. We also derive a differential equation of second order, from which we
obtained the energy levels for a particle moving in a constant radius circular path. In
addition, using the self-adjoint extension method, we find wave functions of bound states
and energy levels to the full space, including the region r = 0. The Energy levels obtained
are analogous to Landau levels, and show a dependence on the spin projection parameter. Finally, we take the non-relativistic limit for the full space.
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Modélisation de l'interaction champ électrique-particules diélectriques entre effets électromécaniques et aspects électrocinétiques : application aux cellules biologiquesOgbi, Abdellah 09 February 2016 (has links)
Dans ce travail, nous nous intéressons à l’interaction champ électrique-particule diélectrique dans les phénomènes diélectrophorétiques, aussi bien d’un point de vue théorique que numérique. L’application à long terme concerne l’électro- manipulation des cellules biologiques. La compréhension de ces phénomènes nécessite une modélisation complète des mécanismes de polarisation qui régissent l’interaction champ-particule, et met en oeuvre des modèles électromécanique et électroci- nétique. Après avoir introduit les différents phénomènes et notions nécessaires, nous abordons la modélisation de la polarisation à l’aide de la théorie du potentiel et proposons une approche pour déterminer numériquement les coefficients de polarisation identifiés. Nous montrons que, si le développement multipolaire peut se réduire au premier ordre pour le cas d’une particule sphérique plongée dans un champ uniforme, les ordres supérieurs sont nécessaires pour les particules non sphériques. Nous montrons également comment un processus d’homogénéisation permet d’étudier les configurations de particules multicouches avec cette approche. Dans le cadre de l’étude électromécanique des phénomènes diélectrophorétiques, nous mettons ensuite en œuvre cette approche multipolaire. Deux applications traitées numériquement sont présentées. Nous y montrons la pertinence de cette approche pour calculer la force et le couple exercés sur une particule dans des situations où le champ appliqué présente de fortes non-uniformités, l’approche dipolaire classique se révélant beaucoup moins performante dans ce cas. La particule et son milieu de suspension étant en réalité deux milieux en contact mais non-indépendants, des phénomènes électrocinétiques se produisent à l’interface. Ces effets interfaciaux sont abordés en vue de les prendre en compte dans le phénomène d’électrorotation d’une cellule biologique. Nous modélisons le problème complet d’une particule sphérique chargée plongée dans un milieu de suspension et soumise à un champ tournant en prenant en compte les effets électroosmotiques. La résolution par éléments finis de ce problème couplé montre la pertinence de l’approche développée, notamment pour les basses fréquences. / In this work, we investigate about the interaction between electrical fields and dielectric particles in the dielectrophoretic phenomena, in theorical and numerical ways. The long-term application are related to electromanipulation and caracterisation of biological cells. Understanding these phenomena requires a complete modeling of polarization mechanisms governing the field-particle interaction and implements electromechanical and electrokinetic models. After introducing the necessary concepts and phenomena, we address polarization modeling using potential theory and suggest an approach for a numerical determination of polarization coefficients. We show that if the multipolar expansion can be reduced to the first order for the case of a spherical particle immersed in a uniform field, the higher orders are needed for nonspherical particles. We show also how a homogenization process allows the study of multilayered particles configurations using this approach. As part of the electromechanical study of dielectrophoretic phenomena, we implement the multipolar approach for two applications numerically treated. We show the relevance of this approach to calculate the force and torque exerted on a particle in situations where the applied field has strong non-uniformities, where the classical dipole approach turn out to be much less efficient. The particle and the suspending medium are in reality two media in contact but not independent as some electrokinetic phenomena occur at the interface. These interfacial effects are addressed in order to be taken into account in the electrorotation phenomenon of a biological cell. The model dealing with the whole problem of a charged spherical particle immersed in a suspension medium and subjected to a rotating field and taking into account the electroosmotic effects is treated. The resolution of the corresponding coupled problem using the finite element method shows the relevance of this approach.
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Dynamik der Photo-Lumineszenz-Unterbrechung von Halbleiter-Nanokristallen in elektrischen FeldernKrasselt, Cornelius 09 July 2015 (has links) (PDF)
Diese Arbeit untersucht die Photo-Lumineszenz (PL)-Unterbrechung (Blinken) einzelner in Polymer-Nanopartikeln eingebetteter CdSe/CdS Halbleiter-Nanokristalle (Quantenpunkte) im Einfluss elektrischer Gleich- und Wechselfelder mittels Weitfeld-Mikroskopie. Hierbei emittieren die einzelnen Quantenpunkte trotz kontinuierlicher Anregung mit einer zwischen hellen An- und dunklen Aus-Zuständen variierenden PL-Intensität.
Die Ergebnisse zeigen, dass die Dynamik dieses Blinkens durch Wechselfelder stark beeinflusst wird und von deren Feldstärke, teilweise auch deren Feldfrequenz abhängt. Für zunehmende Feldstärken lässt sich ein schnellerer Wechsel zwischen An- und Aus-Zuständen (erhöhte Blinkfrequenz) beobachten, der von einer reduzierten Häufigkeit langer An- und Aus-Ereignisse begleitet wird. Der Verlauf der An-Zeit-Verteilungen bei kleinen Zeiten wird zunehmend (monoton) flacher, während die Verteilungen der Aus-Zeiten zunächst ebenfalls einem analogen Trend folgen, ab einer bestimmten und von der Feldfrequenz abhängenden Feldstärke jedoch wieder steiler verlaufen. Ein solcher Monotonie-Wechsel in der Blinkdynamik im Fall einer gleichbleibenden Variation einer äußeren Bedingung wurde bei Halbleiter-Nanokristallen so erstmalig beobachtet.
Für Gleichfelder zeigen sich hingegen nahezu keine Auswirkungen. Lediglich die An-Zeit-Verteilungen sowie die Blinkfrequenz im Fall hoher Feldstärken werden modifiziert.
Die Ergebnisse werden im Kontext verschiedener aktueller Modelle zur PL-Unterbrechung wie dem trapping-Modell, dem self-trapping-Mechanismus oder dem Modell multipler Rekombinationszentren diskutiert und diese entsprechend erweitert. Dabei stehen die dielektrischen Eigenschaften und die Relaxationsdynamik der lokalen Quantenpunkt-Umgebung im Mittelpunkt, deren Reaktion auf die externen Felder durch eine zeitabhängige Ausrichtung permanenter Dipole beschrieben werden kann.
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Dynamik der Photo-Lumineszenz-Unterbrechung von Halbleiter-Nanokristallen in elektrischen FeldernKrasselt, Cornelius 02 July 2015 (has links)
Diese Arbeit untersucht die Photo-Lumineszenz (PL)-Unterbrechung (Blinken) einzelner in Polymer-Nanopartikeln eingebetteter CdSe/CdS Halbleiter-Nanokristalle (Quantenpunkte) im Einfluss elektrischer Gleich- und Wechselfelder mittels Weitfeld-Mikroskopie. Hierbei emittieren die einzelnen Quantenpunkte trotz kontinuierlicher Anregung mit einer zwischen hellen An- und dunklen Aus-Zuständen variierenden PL-Intensität.
Die Ergebnisse zeigen, dass die Dynamik dieses Blinkens durch Wechselfelder stark beeinflusst wird und von deren Feldstärke, teilweise auch deren Feldfrequenz abhängt. Für zunehmende Feldstärken lässt sich ein schnellerer Wechsel zwischen An- und Aus-Zuständen (erhöhte Blinkfrequenz) beobachten, der von einer reduzierten Häufigkeit langer An- und Aus-Ereignisse begleitet wird. Der Verlauf der An-Zeit-Verteilungen bei kleinen Zeiten wird zunehmend (monoton) flacher, während die Verteilungen der Aus-Zeiten zunächst ebenfalls einem analogen Trend folgen, ab einer bestimmten und von der Feldfrequenz abhängenden Feldstärke jedoch wieder steiler verlaufen. Ein solcher Monotonie-Wechsel in der Blinkdynamik im Fall einer gleichbleibenden Variation einer äußeren Bedingung wurde bei Halbleiter-Nanokristallen so erstmalig beobachtet.
Für Gleichfelder zeigen sich hingegen nahezu keine Auswirkungen. Lediglich die An-Zeit-Verteilungen sowie die Blinkfrequenz im Fall hoher Feldstärken werden modifiziert.
Die Ergebnisse werden im Kontext verschiedener aktueller Modelle zur PL-Unterbrechung wie dem trapping-Modell, dem self-trapping-Mechanismus oder dem Modell multipler Rekombinationszentren diskutiert und diese entsprechend erweitert. Dabei stehen die dielektrischen Eigenschaften und die Relaxationsdynamik der lokalen Quantenpunkt-Umgebung im Mittelpunkt, deren Reaktion auf die externen Felder durch eine zeitabhängige Ausrichtung permanenter Dipole beschrieben werden kann.
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