Title: Study of jet fragmentation and inclusive jet production in heavy-ion colli- sions with the ATLAS experiment Author: Mgr. Radim Slovák Institute: Institute of Particle and Nuclear Physics Supervisor: Mgr. Martin Spousta, Ph.D., Institute of Particle and Nuclear Physics, Charles University Abstract: This thesis presents two measurements - measurement of the jet frag- mentation functions and inclusive jet production in heavy-ion collisions. The frag- mentation functions are measured in Pb+Pb and pp collisions with the ATLAS detector at the LHC. The distributions are measured as a function of jet trans- verse momentum and rapidity. The analysis utilises an integrated luminosity of 0.14 nb−1 of Pb+Pb data and 4.0 pb−1 of pp data collected in 2011 and 2013, respectively, at the same centre-of-mass energy of 2.76 TeV. Modest but signif- icant centrality-dependent modifications of fragmentation functions in Pb+Pb collisions with respect to those in pp collisions are seen. Measurements of the yield and nuclear modification factor, RAA, for inclusive jets are performed us- ing 25 pb−1 of pp data at √ s = 5.02 TeV and 0.49 nb−1 of Pb+Pb data at √ sNN = 5.02 TeV. The jets are measured over the transverse momentum range of 100-1000 GeV in six rapidity intervals covering |y| < 2.8. The magnitude of the RAA...

The thesis describes the study of the rare charged kaon decay K00 e4 on the NA62 experiment at CERN. This decay is interesting from the chiral perturbation theory point of view. In this work the data from 2007 recorded on NA62 ex- perimental setup were analyzed. The measurement of branching ratio for this process normalized to K00 3π decay has been performed. Also the form factor measurement has been done and the cusp singularity has been observed. 1

This diploma thesis is a part of a project aiming to develop and study specific inhibitors of FOXO3 transcriptional activity. FOXO3 belongs together with FOXO1, FOXO4 and FOXO6 to FOXO subfamily of forkhead family transcription factors. FOXO transcription factors are evolutionary conserved proteins playing important roles in numerous cellular processes, such as apoptosis, cell cycle regulation and metabolism. Due to their ability to induce apoptosis and to block the cell cycle they are considered tumor suppresors. However, it has been shown that increased activity of FOXO proteins is connected with many kinds of cancer. In such cases FOXO proteins function to maintain cell homeostasis. They promote tumor resistance against chemotherapy as well as they speed up its growth. The aim of this project is to develop specific inhibitors able to bind to FOXO3 DNA-binding domain (DBD, residues 156-269) and to block its interaction with target DNA. Development of specific inhibitors of FOXO3 transcriptional programme requires knowledge of solution structure of all FOXO DBDs and detailed insight into their interaction with target DNA. So far crystal structures of complexes of FOXO1, FOXO3 and FOXO4 with target DNA and solution NMR structures of apo DBDs of FOXO3 and FOXO4 have been solved. One of the goals of...

Ziel der Konferenz war die Darstellung exemplarischer Beispiele einer Thematisierung des Nationalen durch Musik. Dabei war sowohl an eine bewusste Gestaltung national verstandener Kompositionselemente durch entsprechend gesinnte Komponisten in ihren Werken gedacht als auch an eine Darstellung gesellschaftlicher Situationen und Strömungen, in denen Musik als identitätsstiftende Größe national wirksam geworden ist. Das verbindende Element beider Aspekte kann die soziokulturelle Komponente darstellen: Verschiedene musikalische Gattungen waren in unterschiedlicher Weise in nationale Bedeutung involviert und bildeten zudem in ihrem aufführungspraktischen Zusammenhang (Zuhörer, Ort, Ausführende) einen Kristallisationspunkt gesellschaftlicher Gruppenbildung. Betrachtet man etwa die in dieser Beziehung besonders wichtigen Gattungen der Oper, der Konzertmusik und der Chormusik, so lässt sich sowohl eine stark gemischte, also gesellschaftlich breit gestreute Teilnahme (aktiv und passiv) konstatieren als auch eine Ausdifferenzierung nach sozialer, konfessioneller und auch nationaler Identität. Die Darstellung exemplarischer historischer Situationen nach diesen Gesichtspunkten war für die Thematik der Konferenz grundlegend.

(ENGLISH) The bacterial cell needs to regulate its gene expression in response to changing environmental conditions. RNA polymerase (RNAP) is the pivotal enzyme of this process and its activity is controlled by a number of auxiliary factors. Here I focus on RNAP-associating factors involved in regulation of transcription in G+ bacteria:  factors, initiating nucleoside triphosphates (iNTPs), HelD, δ and small RNA Ms1. The main emphasis is on σ factors from Bacillus subtilis. σ factors allow RNAP to specifically recognize promoter DNA. In my first project I set up in vitro transcription systems with purified alternative σ factors, σB , σD , σH , σI from B. subtilis. Using these systems, I studied the effect of initiating NTP concentration ([iNTP]) on transcription initiation. I showed that promoters of alternative  factors are often regulated by [iNTP]. In the next project I comprehensively characterized one of the least explored alternative  factors from B. subtilis, I . I identified ~130 genes affected by I , though only 16 of them were directly affected. Moreover, I discovered that I is involved in iron metabolism. Finally, I showed that I binding requires not only the conserved -35 and -10 hexamers, but also extended -35 and -10 elements located in the spacer region. In collaboration with...

Objectives: Ductal carcinoma in situ (DCIS) is a non-invasive lesion of an increasing clinical importance. Individual risk assessment is essential for an optimal treatment. Our objective was to identify clinical and molecular characteristics of a subgroup of DCIS with an unfavorable prognosis. Methods: In a population study, we analyzed women with DCIS diagnosed within one mammography screening unit. In the experimental part of this work, we conducted a comparative analysis of five biological markers in normal tissue, DCIS and invasive breast cancer by means of gene expression analysis and analysis of loss of heterozygosity (LOH). Results: We demonstrated a high proportion of pure (no invasive component) DCIS (14.41%) of all breast lesions described as malignant. In our sample, we saw a homogeneous distribution of risk factors without noting a clear pattern identifying high-risk subtypes. We noted significant differences in clinical management of tumors with similar characteristics, which demonstrates the present state of limited use of clinical predictors. In the laboratory experiment, we showed differences in loss of heterozygosity (LOH) between DCIS and invasive breast cancer for BRCA1 (8.69% vs. 44.74%) and BRCA2 (9.52% vs. 45.0%). In contrast, we did not find any differences for p53 (31.82%...

Das aktuelle Interesse für das überschriebene Thema wird von einem Teil der heutigen Musikwissenschaft mehr oder weniger ausdrücklich als ein 'Neubeginn' empfunden und artikuliert. Zeitlich könnte man diese Erscheinung in das letzte Jahrzehnt des 20. Jahrhunderts versetzen; der Ort, an dem sie sich entzündet, über den sie sich hauptsächlich entfaltet und von dem aus sie auf die 'früheren' Zentren zurückwirkt, ist ein (nach Osten und Norden) erweiterter europäischer, außereuropäischer und speziell amerikanischer, und die Sprache in der dabei vorwiegend kommuniziert wird ist die englische; den Diskurs charakterisiert eine gewisse Zurückhaltung sowohl dem aufgefundenen Forschungsstand wie den überlieferten Interpretationsmodellen und Traditionen gegenüber und eine mehr oder weniger ausgeprägte Zuwendung zu den neuen Strategien der Musikwissenschaft als Kulturwissenschaft, für welche die Frage nach dem Verhältnis zwischen Musik und Identität, auch der nationalen, zentral ist.

Die kompositorische Rezeption des Zweiten Weltkriegs und der Widerstandsbewegung in Slowenien ist ein Thema mit unterschiedlichen Aspekten. Es gibt zwar verschiedene Analysen, aber im Großen und Ganzen ist der Gegenstand noch nicht hinreichend untersucht worden. Schon während des Krieges reektierten verschiedene Kompositionen Kriegsereignisse und Gräueltaten, besonders aber unmittelbar nach dem Krieg, als viele persönliche Aussagen unmittelbarer Zeugen des Geschehens entstanden. Viele von ihnen wollten das slowenische Selbstbewusstsein stärken, manche sollten zugleich Mahnung an nachfolgende Generationen sein. So hatte diese Musik eine besondere Funktion zu erfüllen, sie ist eine 'bedeutende' Musik, wie Constantin Floros es genannt hat. Sie ist nicht nur Form, Struktur und Klangspiel sondern viel mehr. Sie transportiert seelische und geistige Erfahrungen, persönlich Erlebtes und Gefühltes, Autobiographisches.

Mein Beitrag ist dem Musikwissenschaftler János Kárpáti gewidmet. Erstens, weil in Budapest eben in diesen Tagen eine Konferenz zu Ehren seines 70. Geburtstages abgehalten wird und ich von Herzen bedaure, nicht auch dort anwesend zu sein, um ihm mit einem Vortrag meine Reverenz erweisen zu können. Zweitens, weil Herr Kárpát während der Erarbeitung meines Textes in der ungarischen Fachpresse eine hervorragende Studie über Béla Bartók und die Möglichkeit einer Donautaler musikalischen Integration veröffentlicht hat, in der er etliche von meinen Gedanken besser ausgedrückt hat, als ich sie hätte ausdrücken können. Dadurch wurde ich angespornt, den ursprünglichen Gedankengang meines Beitrages wesentlich zu verändern. Ich danke ihm für diesen Ansporn.

Die vor einigen Jahren (1997) durchgeführte Umfrage der Fachzeitschrift Slovenská hudba ('Slowakische Musik') zu den aktuellen Problemen der slowakischen Musikkultur unter den veränderten politischen Bedingungen nach dem Jahr 1989 bzw. nach der Entstehung der selbstständigen Slowakischen Republik 1993 enthielt auch eine für das Thema der hiesigen Konferenz interessante Frage: 'Was bedeutet Ihrer Meinung nach der Begrff Slowakische Musik, slowakische Nationale Musik? Was alles umfasst sie? Hat sie auch eine historische Dimension? Oder hat sie nur eine historische Dimension?'. Die Umfrage kann zwar wegen ihrer geringen Resonanz - sie wurde nur von 20 der insgesamt ungefähr 150 angesprochenen Komponisten, Interpreten und Musikwissenschaftler beantwortet - nicht als repräsentativ gelten; trotzdem ist sie für die Erforschung der Meinung der breiteren Fachöffentlichkeit nicht ohne Bedeutung.