Orientadores: Cristiano Monteiro de Barros Codeiro, Marcos Antonio Ruggieri Franco / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Física Gleb Wataghin / Made available in DSpace on 2018-08-20T13:14:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ValenzuelaEspinel_YovannyAlexander_M.pdf: 51370027 bytes, checksum: 2f925ea5d4b6a8642e1244ad21e8e82b (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: Foram realizados estudos sobre o controle de propriedades ópticas, por meio de pressão, e sensibilidade à pressão com fibras de cristal fotônico (PCF). No primeiro caso foi demonstrado por meio de simulações, uma nova forma para obter e sintonizar com pressão hidrostática externa o estado monomodo e única polarização em fibras PCF de polimetilmetacritalo (PMMA). Em relação à sensibilidade à pressão hidrostática, o comportamento espectral do coeficiente de sensibilidade de varias fibras PCF em sílica, Cs = (?? / ?P) (onde ?? é a variação num mínimo do espectro de transmissão de uma fibra PCF que acontece quando a pressão hidrostática externa muda em LlP), é calculado teoricamente e corroborado experimentalmente. Com a finalidade de estudar teoricamente o coeficiente Cs, a birrefringência de grupo e a sensibilidade da birrefringência modal de fase à pressão são simuladas para as fibras. Expressões analíticas do coeficiente Cs na aproximação de primeira e segunda ordem são calculadas. Nas duas aproximações é confirmado um aumento do Cs para comprimentos de onda no visível devido à birrefringência de grupo. Para baixas pressões, tal comportamento é corroborado experimentalmente. Segundo a literatura apresentada até agora a possibilidade de otimizar o coeficiente Cs, fazendo uso da birrefringência de grupo no visível e ao mesmo tempo incorporando geometrias com uma alta anisotropia geométrica para aumentar a sensibilidade da birrefringência modal de fase à pressão, não tem sido explorada. Na aproximação de segunda ordem do coeficiente Cs são incorporadas as mudanças do comprimento de onda e da pressão e são comparadas com a aproximação de primeira ordem. Cálculos analíticos foram feitos e apresentados nos Apêndices B e C. As equações do efeito fotoelástico, determinantes para realizar as simulações com o software (COMSOL 3.5a), são apresentadas no Apêndice B, relações que descrevem o coeficiente Cs de fibras PCF são apresentadas no (Apêndice C) / Abstract: Abstract Studies about both the active control of optical properties by means of external hydrostatic pressure and pressure sensitivity in photonic crystal fibers (PCFs) were made. In the first case, a new form to obtain and tune, by using pressure, the single-mode single-polarization state in microstructured polymer optical fibers (mPOFs) is demonstrated by simulations. In relation to pressure sensitivity, the spectral behavior of the sensitivity coefficient of some PCFs in silica, Cs = (?? / ?P) (where ?? é is the change in a minimum of the transmission spectrum for a PCF as a consequence of the change in the external hydrostatic pressure 11P that is applied on the fiber), is calculated and corroborated experimentally. In order to investigate the coefficient Cs, the group birefringence and the sensitivity of phase modal birefringence to pressure are calculated in the fibers. Analytical expressions for the coefficient Cs in the first and second order approximation are calculated. In these two approximations an increase of the coefficient Cs is confirmed to wavelengths in the visible. To low pressures this behavior is corroborated experimentally. At the best of our knowledge, the possibility to optimize the coefficient (Cs) by using the group birefringence and geometries with high geometric anisotropy to enhancing the sensitivity of phase modal birefringence to pressure has not been investigated. In the coefficient Cs with the second order approximation are incorporated the changes of the wavelength and pressure and are compared with the first approximation. On the other hand, analytic calculates are realized in the Appendixes B and C. The equations related to the photoelastic effect were calculates (Appendix B). Finally, the relations that describing the behavior of pressure sensitivity also were calculates (Appendix C) / Mestrado / Física / Mestra em Física

O escoamento hidrodinâmico é descrito por meio das equações da continuidade e da quantidade de movimento em conjunto com as condições iniciais e de contorno. Neste trabalho de pesquisa, o escoamento não permanente na saída de um canal retangular curto de declividade nula, resultante da abertura rápida de uma comporta foi experimentalmente investigado. Para determinar o coeficiente de pressão e o comprimento do trecho a montante da comporta com distribuição de pressão não hidrostática, usou-se um modelo unidimensional, descrito pelas equações de Saint Venant, para representar o fenômeno. Utilizou-se o método de Lax-Wendroff para obter as curvas características do fenômeno e compará-las com os resultados obtidos experimentalmente. Várias comparações foram feitas possibilitando a avaliação de valores para os parâmetros que definem a região com distribuição de pressão não hidrostática. Os resultados calculados para os valores de parâmetros constantes, estão de acordo com os resultados experimentais. Os resultados experimentais ajustam-se melhor quando os valores dos parâmetros variam no decorrer do tempo. / The hydrodynamic flow is described by means of the equations of the continuity and momentum together with the initial conditions, the boundary conditions. In this research work, the unsteady flow at the exit of a short rectangular channel of zero slope, resulting from the fast opening of a floodgate was investigated experimentally. For determining the pressure coefficient and the length of the upstream reach of the floodgate with non-hydrostatic pressure distribution, a one-dimensional model described by Saint Venant equations is used to represent the phenomenon. The Lax-Wendroff method was used to obtain the curves characteristics of the phenomenon and to compare them with the results obtained experimentally. Several comparisons were made to facilitate the evaluation of values for the parameters that define the region with non-hydrostatic pressure distribution. The results calculated for the values of constant parameters are in agreement with the experimental results. The experimental results are better adjusted when the values of the parameters vary in elapsing of the time.

Muitas das proteínas de valor biomédico relevante são encontradas em baixas concentrações em suas fontes nativas. O alto nível de expressão de proteínas recombinantes em E. coli, muitas vezes gera o acúmulo de proteínas como agregados insolúveis no citoplasma e/ou periplasma da bactéria, denominados de corpos de inclusão (CI). A alta pressão tem sido amplamente utilizada no estudo da conformação das proteínas,ela modula as interações proteína-proteína e proteína-solvente através de mudanças no volume das mesmas, promovendo a entrada de água nas cavidades não expostas da molécula e promovendo hidratação e solubilização dos agregados. O presente trabalho teve como objetivo a renaturação de proteínas recombinantes expressas como CI em Escherichia coli usando alta pressão hidrostática como condição branda de dissociação dos agregados. As tiorredoxinas TsnC e TrxA, a proteína YbbN e a proteína comigratória com bacterioferritina (Bcp), todas de Xylella fastidiosa, foram estudadas neste trabalho. As condições de renaturação foram otimizadas, utilizando-se diferentes proporções do par redox, concentrações de GdnHCl, presença de aditivos e esquemas de descompressão. Para a quantificação e análise da eficácia do processo de renaturação das proteínas sob pressão foram utilizadas as técnicas de microscopia eletrônica de varredura dos CI e de SDS-PAGE, e ensaios de atividade enzimática das proteínas. A TsnC foi renaturada em Tris HCl 50 mM com proporção de 10GSH:1GSSG em concentração final de 10 mM, 0,75 M GdnHCl, na presença de 0,5 M de Triton-X e a pressão utilizada foi de 2,4 kbar por 1 hora e 30 minutos seguida de descompressão direta e incubação por 16 horas em pressão atmosférica. O rendimento final de obtenção de TsnC solúvel foi altíssimo, de até 89,9%. A renaturação de proteína YbbN, nunca antes descrita, foi obtida em tampão de renaturação Tris HCl 50 mM, na presença de 0,5 M de L-Arginina e a pressão utilizada foi de 2,4 kbar por 1 hora e 30 minutos seguida de descompressão direta e incubação por 16 horas em pressão atmosférica. A proteína YbbN, que apresentou atividade de tioredoxina, foi renaturada com rendimento de até 98% a partir da proteína insolúvel nos CI. Foi possível a solubilização da tiorredoxina TrxA e Bcp sob alta pressão hidrostática em tampão de renaturação Tris HCl 50 mM, utilizando diferentes proporções do par redox na concentração final de 10 mM e 1,5 M de GdnHCl, porém não foi possível obter a atividade biológicas destas proteínas. Mostramos também que a L-Arginina apresenta efeito auxiliar na solubilização dos CI induzida pela alta pressão, e ao mesmo tempo se mostrou altamente protetora contra a inativação da atividade da YbbN promovida pela incubação em altas temperaturas, o que sugere que a presença deste aminoácido pode ter alta aplicabilidade juntamente com a aplicação de altas pressões para elevar os rendimentos de renaturação de proteínas recombinantes a partir de CI. / Many of the relevant proteins are found in low concentrations in their native sources. The high level expression of recombinant heterologous proteins in Escherichia coli often causes their accumulation as insoluble aggregates in the cytoplasm or periplasm of bacteria in a mainly inactive form, known as inclusion bodies (IB). The high pressure has been widely used to study the conformational states of proteins. It modulates the protein-protein and protein-solvent interactions by changing the volume of the system, promoting the entrance of water into the cavities unexposed to water, exposing hydrophobic regions and promoting solubilization of the aggregates. The present study aimed to refold recombinant proteins expressed in E. coli as IB using high hydrostatic pressure as a mild condition for IB dissociation. The thioredoxins TsnC, TrxA and Ybbn and the protein comigratory with bacterioferritin (Bcp) of Xylella fastidiosa were studied in this work. The conditions for refolding were optimized for proportions of the redox pair, GdnHCl concentration, presence of additives and schemes for decompression. To analyze the effectiveness of the process of refolding under pressure we have used, scanning electron microscopy of the IB and SDS-PAGE and enzymatic activity assays for quantification and analysis of the solubilized proteins. The TsnC was renatured in 50 mM TrisHCl at a ratio of 10GSH: 1GSSG in 10 mM final concentration, 0.75 M GdnHCl in the presence of 0.5M Trito X-100 and application of 2.4 kbar for 1.5 hours, followed by direct decompression and incubation for 16 h at atmospheric pressure. The final yield of soluble and biological active TsnC was very high, up to 89,9%. The refolding of protein YbbN was obtained by application of 2.4 kbar for 1.5 h to an IB suspension in buffer 50 mM Tris HCl, in the presence of 0.5 M L-arginine, followed by direct decompression and incubation for 16 h at atmospheric pressure. We also show that L-arginine had a highly protective effect on the inactivation of biological activity of YbbN promoted by incubation at high temperatures.The final yield of refolded YbbN, that present thioredoxin activity, was also very high: 98%. TrxA and Bcp thioredoxins were solubilized at 2.4 kbar and step decompression. However, these proteins did not present biological activity. We also show that L-arginine has an auxiliary effect on the solubilization of IB induced by high pressure, while its presence proved highly protective against inactivation of the enzymatic activity promoted by incubation at high temperatures. These results suggest that the presence of this amino acid can have high applicability to increase the yield of refolding of recombinant proteins from the IC at high pressure.

Muitas das proteínas de valor biomédico relevante são encontradas em baixas concentrações em suas fontes nativas. O alto nível de expressão de proteínas recombinantes em E. coli, muitas vezes gera o acúmulo de proteínas como agregados insolúveis no citoplasma e/ou periplasma da bactéria, denominados de corpos de inclusão (CI). A alta pressão tem sido amplamente utilizada no estudo da conformação das proteínas,ela modula as interações proteína-proteína e proteína-solvente através de mudanças no volume das mesmas, promovendo a entrada de água nas cavidades não expostas da molécula e promovendo hidratação e solubilização dos agregados. O presente trabalho teve como objetivo a renaturação de proteínas recombinantes expressas como CI em Escherichia coli usando alta pressão hidrostática como condição branda de dissociação dos agregados. As tiorredoxinas TsnC e TrxA, a proteína YbbN e a proteína comigratória com bacterioferritina (Bcp), todas de Xylella fastidiosa, foram estudadas neste trabalho. As condições de renaturação foram otimizadas, utilizando-se diferentes proporções do par redox, concentrações de GdnHCl, presença de aditivos e esquemas de descompressão. Para a quantificação e análise da eficácia do processo de renaturação das proteínas sob pressão foram utilizadas as técnicas de microscopia eletrônica de varredura dos CI e de SDS-PAGE, e ensaios de atividade enzimática das proteínas. A TsnC foi renaturada em Tris HCl 50 mM com proporção de 10GSH:1GSSG em concentração final de 10 mM, 0,75 M GdnHCl, na presença de 0,5 M de Triton-X e a pressão utilizada foi de 2,4 kbar por 1 hora e 30 minutos seguida de descompressão direta e incubação por 16 horas em pressão atmosférica. O rendimento final de obtenção de TsnC solúvel foi altíssimo, de até 89,9%. A renaturação de proteína YbbN, nunca antes descrita, foi obtida em tampão de renaturação Tris HCl 50 mM, na presença de 0,5 M de L-Arginina e a pressão utilizada foi de 2,4 kbar por 1 hora e 30 minutos seguida de descompressão direta e incubação por 16 horas em pressão atmosférica. A proteína YbbN, que apresentou atividade de tioredoxina, foi renaturada com rendimento de até 98% a partir da proteína insolúvel nos CI. Foi possível a solubilização da tiorredoxina TrxA e Bcp sob alta pressão hidrostática em tampão de renaturação Tris HCl 50 mM, utilizando diferentes proporções do par redox na concentração final de 10 mM e 1,5 M de GdnHCl, porém não foi possível obter a atividade biológicas destas proteínas. Mostramos também que a L-Arginina apresenta efeito auxiliar na solubilização dos CI induzida pela alta pressão, e ao mesmo tempo se mostrou altamente protetora contra a inativação da atividade da YbbN promovida pela incubação em altas temperaturas, o que sugere que a presença deste aminoácido pode ter alta aplicabilidade juntamente com a aplicação de altas pressões para elevar os rendimentos de renaturação de proteínas recombinantes a partir de CI. / Many of the relevant proteins are found in low concentrations in their native sources. The high level expression of recombinant heterologous proteins in Escherichia coli often causes their accumulation as insoluble aggregates in the cytoplasm or periplasm of bacteria in a mainly inactive form, known as inclusion bodies (IB). The high pressure has been widely used to study the conformational states of proteins. It modulates the protein-protein and protein-solvent interactions by changing the volume of the system, promoting the entrance of water into the cavities unexposed to water, exposing hydrophobic regions and promoting solubilization of the aggregates. The present study aimed to refold recombinant proteins expressed in E. coli as IB using high hydrostatic pressure as a mild condition for IB dissociation. The thioredoxins TsnC, TrxA and Ybbn and the protein comigratory with bacterioferritin (Bcp) of Xylella fastidiosa were studied in this work. The conditions for refolding were optimized for proportions of the redox pair, GdnHCl concentration, presence of additives and schemes for decompression. To analyze the effectiveness of the process of refolding under pressure we have used, scanning electron microscopy of the IB and SDS-PAGE and enzymatic activity assays for quantification and analysis of the solubilized proteins. The TsnC was renatured in 50 mM TrisHCl at a ratio of 10GSH: 1GSSG in 10 mM final concentration, 0.75 M GdnHCl in the presence of 0.5M Trito X-100 and application of 2.4 kbar for 1.5 hours, followed by direct decompression and incubation for 16 h at atmospheric pressure. The final yield of soluble and biological active TsnC was very high, up to 89,9%. The refolding of protein YbbN was obtained by application of 2.4 kbar for 1.5 h to an IB suspension in buffer 50 mM Tris HCl, in the presence of 0.5 M L-arginine, followed by direct decompression and incubation for 16 h at atmospheric pressure. We also show that L-arginine had a highly protective effect on the inactivation of biological activity of YbbN promoted by incubation at high temperatures.The final yield of refolded YbbN, that present thioredoxin activity, was also very high: 98%. TrxA and Bcp thioredoxins were solubilized at 2.4 kbar and step decompression. However, these proteins did not present biological activity. We also show that L-arginine has an auxiliary effect on the solubilization of IB induced by high pressure, while its presence proved highly protective against inactivation of the enzymatic activity promoted by incubation at high temperatures. These results suggest that the presence of this amino acid can have high applicability to increase the yield of refolding of recombinant proteins from the IC at high pressure.

Submitted by Rosivalda Pereira (mrs.pereira@ufma.br) on 2017-05-09T19:00:17Z No. of bitstreams: 1 RilleandsSoares.pdf: 3170256 bytes, checksum: 735ff5b185572666283ce8413340aa71 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-09T19:00:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RilleandsSoares.pdf: 3170256 bytes, checksum: 735ff5b185572666283ce8413340aa71 (MD5) Previous issue date: 2017-04-18 / In this work nitrate L-Alanine crystals (LAN) were prepared by slow evaporation technique at room temperature and characterization by X-ray diffraction and Raman scattering at room temperature and high pressures in the amino acid salt crystals LAN. The crystals grew after six months of rest. The growth solution was acidic with pH 1.0. With the XRD pattern of the material and the Rietveld analysis, it was found that at room temperature LAN crystallizes in orthorhombic space group (P212121) with four molecules per unit cell. The refinement of the quality parameters were satisfactory, with Rp = 5.52%, 7.73% and S = 1.4. The results of Raman scattering with hydrostatic pressure variation between 0 GPa and 7.4 GPa, show that the LAN crystal undergoes a phase transition between 3.5 and 4.1 GPa, as suggested by the changes in the vibrational modes, both In the low wave number as in the internal mode regions. The correlation between the configuration of hydrogen bonding at ambient pressure and the occurrence of phase transition with pressure variation was proposed. After decompression at ambient pressure, the original spectra were recovered indicating that the phase transitions are reversible. / Este trabalho descreve o preparo dos cristais de nitrato de L-Alanina (NLA) pela técnica de evaporação lenta do solvente à temperatura ambiente e realizadas medidas de caracterização por difração de raios X e espalhamento Raman à temperatura ambiente e a altas pressões em cristais do sal de aminoácido de NLA. Os cristais cresceram após seis meses de repouso. A solução de crescimento era ácida com pH 1,0. Com o difratograma do material e a análise pelo método Rietveld, constatou-se que à temperatura ambiente o NLA cristaliza-se numa estrutura ortorrômbica (P212121) com quatro moléculas por célula unitária. Os parâmetros de qualidade do refinamento foram satisfatórios, com Rp = 5,52 %, Rwp = 7,73 % e S = 1,4. Os resultados de espalhamento Raman com variação da pressão hidrostática entre 0 GPa e 7,4 GPa, sugerem que o cristal de NLA, sofre uma transição de fase entre 3,5 e 4,1 GPa, evidenciando pelas mudanças nos modos vibracionais, tanto no número de onda baixo como nas regiões de modos internos. Foi proposta a correlação entre as ligações de hidrogênio à pressão ambiente e a ocorrência de transição de fase com variação de pressão. Após a descompressão à pressão ambiente, os espectros originais foram recuperados indicando que as transições de fase são reversíveis.

HOLANDA, Rocicler Oliveira. Propriedades Vibracionais da L-glutamina sob altas pressões e sob altas temperaturas. 2010. 111 f. Dissertação (Mestrado em Física) - Programa de Pós-Graduação em Física, Departamento de Física, Centro de Ciências, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2010. / Submitted by Edvander Pires (edvanderpires@gmail.com) on 2014-10-31T20:09:36Z No. of bitstreams: 1 2010_dis_roholanda.pdf: 1963652 bytes, checksum: b1d0b8f88faf6a82caf2e15bc7df0c81 (MD5) / Approved for entry into archive by Edvander Pires(edvanderpires@gmail.com) on 2014-10-31T21:07:50Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_dis_roholanda.pdf: 1963652 bytes, checksum: b1d0b8f88faf6a82caf2e15bc7df0c81 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-10-31T21:07:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_dis_roholanda.pdf: 1963652 bytes, checksum: b1d0b8f88faf6a82caf2e15bc7df0c81 (MD5) Previous issue date: 2010 / In this work, crystals of l-glutamine (C5H10N2O3) were subjected to analysis by Raman spectroscopy. Initially there was a identification attempt of all Raman bands and a second step we obtained the spectra of material ranging from the thermodynamic parameters of hydrostatic pressure and temperature. The spectral region for the experiments as a function of hydrostatic pressure was between 40 cm-1 and 3550 cm-1 and the variation of pressure between 0 GPa and 5.8 GPa. The results show that the crystal of l-glutamine undergoes a transition reversible structural phase around 3.0 GPa. Measures in function of temperature were made at two different biases in the spectral region between 30 cm-1 and 3600 cm-1 and in the temperature range between 20 °C and 140 °C. The results as a function of temperature does not provide evidence that the crystal of l-glutamine undergoes a transition phase or conformational changes in their molecules in the unit cell. / Neste trabalho, cristais de l-glutamina (C5H10N2O3) foram submetidos à análises através da técnica de espectroscopia Raman. Inicialmente realizou-se uma identificação tentativa de todas as bandas Raman e em uma segunda etapa obteve-se os espectros do material variando os parâmetros termodinâmicos de pressão hidrostática e temperatura. A região espectral para os experimentos realizados em função da pressão hidrostática esteve entre 40 cm-1 e 3550 cm-1 e a variação da pressão entre 0 GPa e 5,8 GPa. Os resultados mostram que o cristal de l-glutamina sofre uma transição de fase estrutural reversível em torno de aproximadamente 3,0 GPa. As medidas em função da temperatura foram realizadas em duas polarizações distintas na região espectral entre 30 cm-1 e 3600 cm-1 e no intervalo de temperatura entre 20°C e 140°C. Os resultados obtidos em função da temperatura não apresentam indícios de que o cristal de l-glutamina sofra uma tansição de fase ou mudanças conformacionais em suas moléculas na célula unitária.

Orientador: Edson A. Capello Sousa / Banca: Paulo Cezar Razuk / Banca: Marcio Antonio Bazani / Resumo: Objetivou-se analisar estruturalmente um fermentador de 32 [m] de altura com colunas metálicas de sustentação, submetido ao carregamento de vento estático segundo o procedimento descrito pela norma NBR 6123 (1988), pressão hidrostática e pressão interna dos gases. Duas situações distintas foram consideradas para um melhor entendimento da análise: a primeira, sendo o fermentador vazio submetido aos esforços de vento; a segunda, o fermentador em operação submetido ao carregamento hidrostático e a pressão interna dos gases. Para se obter as tensões nos itens que compõem o fermentador (teto, costado, viga de transição, colunas e fundo cônico) e reações nas bases, foi utilizado o Método dos Elementos Finitos ou MEF. Para isso, foi elaborado um modelo geométrico bem próximo ao real, com os detalhes de chapas internas e externas. Determinou-se a espessura das chapas do costado pela norma NBR 7821 (1983) e verificou-se tensões, e possíveis pontos de falha já ocorridos no setor sucroalcooleiro. Apresenta-se também três problemas analisados pelo MEF que confrontados com os resultados analíticos, permitiu a constatação da validade dos resultados obtidos numericamente o ganho de confiança no uso da ferramenta. O MEF é uma ferramenta auxiliar em casos em que não é possível a utilização de cálculos tradidionais (analíticos) / Abstract: The objective was to structurally analyze a 32 meter height Fermenter, with columns, submitted to static wind load according to the procedure described by the NBR 6123 (1988) norm, hydrostatic pressure and internal pressure of the gases. Two different situations have been considered for a better analyze comprehension: the first one with the empty Fermenter submitted to wind efforts; the second with the operating fermenter submitted to the hydrostatic load and the internal pressure of the gases. In order to obtain the stresses on the items that make up the fermenter (heads, shell, beam transition, columns and conic bottom) and bases reactions the Finite Element Method or FEM has been used. For this we have developed a geometric model very close to reality, with the details of internal and external plates. It was determined by the thickness of the side shell plating by the NBR 7821 (1983) and there were tensions, and possible points of failure that have already occurred in the alcohol sector. It was also presented three issues addressed by comparing FEM with analytical results, which allowed the verification of the validity of the results obtained numerically and gain of confidence in using the tool. The MEF is an auxiliary tool in cases where it is not possible to use traditional calculations (analytical) / Mestre

The present study had as objective to analyze the accuracy of different indicators of the nutritional status of adults of both sexes, having as reference method the hydrostatic weighing (HW). A total of 280 subjects (210 men and 70 women), aged between 17 and 48 years old, were investigated. The results of body fat percentage (%BF) obtained through the University of Navarra-Body Adiposity Estimator (CUN- BAE), body adiposity index (BAI), skinfold estimation equations (E-DC) and bioelectrical impedance (BIA). We also analyzed the results of the body mass index (BMI), new body mass index (BMI2.5), body fat mass index BFMI and the body mass index adjusted by the fat mass (BMIfat), all of them using HW as the reference method. The results indicated that no significant differences were observed between the %BF measures of the E-DC and BIA indicators and the HW for the male group; however, for the female group, despite the analyzes indicating agreement, the %BF values presented statistically different from those obtained with the reference method. The BAI presented an acceptable estimation error when evaluating the female group and the CUN-BAE presented a tendency to overestimate the values of %BF, in both sexes. On the other hand, the BFMI presented the highest agreement value, but classified as discrete (k=0.21). The other indexes presented small agreement with the results of the reference method (k <0.20). It is possible to conclude that, in a general way, the E-DC and BIA indicators were the ones that presented the best results, with the E-DC being more efficient to evaluate the male subjects. In addition, none of the indexes investigated showed good accuracy in assessing the nutritional status of adults, although they showed results of correlation with the reference method, did not reach the minimum criterion of agreement. / O presente estudo teve como objetivo analisar a acurácia de diferentes indicadores do estado nutricional de adultos, de ambos os sexos, tendo como método de referência a pesagem hidrostática (PH). Foram investigados 280 sujeitos (210 homens e 70 mulheres), com idade entre 17 e 48 anos, dos quais se analisou os resultados de percentual de gordura corporal (%GC) obtidos através do Clínica Universidad de Navarra-Body Adiposity Estimator (CUN-BAE), do índice de adiposidade corporal (IAC), das equações de estimativa a partir de dobras cutâneas (E-DC) e da impedância bioelétrica (IB). Também foram analisados os resultados do Índice de Massa Corporal (IMC), do novo Índice de Massa Corporal (IMC2,5), do Índice de Massa Gorda (IMG) e do Índice de Massa Corporal ajustado pela Massa Gorda (IMCgordura), todas as análises tendo como método de referência a PH. Os resultados indicaram que não foram observadas diferenças significativas entre as medidas de %GC dos indicadores E-DC e IB e a PH para o grupo masculino, no entanto, para o grupo feminino, apesar das análises indicarem concordância, os valores de %GC apresentaram-se estatisticamente diferentes dos obtidos com o método de referência. O IAC apresentou erro de estimativa aceitável ao avaliar o grupo feminino e o CUN-BAE apresentou tendência de superestimar os valores de %GC, em ambos os sexos. Por outro lado o índice IMG apresentou o maior valor de concordância, porém classificado como discreto (k = 0,21). Já os demais índices apresentaram concordância pequena com os resultados do método de referência (k<0,20). É possível concluir que, de uma forma geral, os indicadores E-DC e IB foram os que apresentaram os melhores resultados, sendo que o E-DC se mostra mais eficiente para avaliar indivíduos do sexo masculino. Além disso, nenhum dos índices investigados apresentou boa acurácia para avaliar o estado nutricional de adultos, pois apesar de mostrarem resultados de correlação com o método de referência, não atingem o critério mínimo de concordância.

Orientador: Carlos Francisco Sampaio Bonafe / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-10T21:45:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bispo_JoseAiltonConceicao_D.pdf: 6481701 bytes, checksum: eac9f13bfaae7f2d8718ad2773ff3e57 (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: Sistemas reacionais em fase líquida compreendem boa parte dos processos físicoquímicos que são estudados para fins de pesquisa e aplicação industrial. Estes estudos são conduzidos em geral de forma a se obter parâmetros de caracterização que tornem possível a padronização e otimização de processos, sejam eles de aplicação químico industrial ou biotecnológica. Em meio a esta necessidade de compreensão de diversos processos físicoquímicos, um ponto que chama a atenção de muitos grupos de pesquisa é a necessidade de aperfeiçoamento dos sistemas de caracterização e modelagem destes processos de forma a tornálos mais informativos e eficientes, tanto no que diz respeito à sua capacidade de caracterização quanto à sua capacidade de previsão. Neste contexto, a maior parte dos sistemas estudados têm como base a metodologia de caracterização desenvolvida por Gibbs-Duhem a aprtir do comportamento de gases ideais. Desvios no comportamento pressão volume são, nestes casos, corrigidos através do parâmetro definido como atividade. Assim, a estrutura de base desenvolvida por Gibbs-Duhem para gases ideais é mantida, deixando praticamente inalterada a relação que expressa a variação do potencial químico. No presente estudo observou-se que este tipo de abordagem e caracterização não produz resultados satisfatórios para o processo de dissociação por pressão de grandes agregados protéicos, e em alguns casos gerou dificuldades matemáticas que impediram a sua implementação em processos bastante comuns. A solução encontrada e o objetivo desta tese foram então o de conduzir uma nova abordagem para a caracterização destes sistemas que envolvem a dissociação por pressão de macromoléculas a partir de equações mais flexíveis para as mudanças de volume que as dos g ases ideais utilizadas por Gibbs-Duhen. O resultado desta nova abordagem foram relações com grande potencial de informação, de fácil aplicação e com uma alta capacidade de previsão / Abstract: The reaction processes involving macromolecules in liquid phase represent a significant part of the studies aiming industrial and technological applications.These studies are in general performed aiming access the parameters of characterization that allows the optimiz ation of chemical and biotechnological processes. In this view, the needing of understand distinct physicochemical processes represent a point that deserves the attention of many laboratories due to the needing of improvement modeling systems that furnish more efficient and precise information about the protein behavior under solution. Although the most of the studies performed aiming to reach this goal are based on the processes of characterization developed by Gibbs-Duhen, deviations on the pressure/volume furnished by the ideal gas equation are usually observed and corrected by means of the activity coefficient. Thus, the structural basis of the Gibbs-Duhem approach is maintained in despite of more complexes systems sho ws a nonlinearbehavior that produces in some cases significant deviations. In the present studie s we observed that the processes of pressure dissociation/denaturation of macromolecules leads to significant errors in respect to the experimental data. In this case the correction of these approach by means of the activity coefficient was not possible since the characterization equations became very complex. The goal of the present work was than to find a new description for these complex systems that allows to determine the properties of system and a precise thermodynamic modeling of these kind of processes / Doutorado / Bioquimica / Doutor em Biologia Funcional e Molecular

Made available in DSpace on 2016-08-18T18:19:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mauro Bogea Pereira.pdf: 2672209 bytes, checksum: 6ffa34d37be7c980ea311a6504843760 (MD5) Previous issue date: 2011-04-28 / FUNDAÇÃO SOUSÂNDRADE DE APOIO AO DESENVOLVIMENTO DA UFMA / In this work the electronic and structural properties of the hetero-nanotube bundles, composed of a CNT (6,0) encapsulated in a BNNT (14,0) (CNT (6,0)@BNNT (14,0)) and a BNNT (6,0) encapsulated in a CNT (14,0) (BNNT(6,0)@CNT (14,0)), under hydrostatic pressure. For this, we applied density functional theory and generalized gradient approximation to the exchange and correlation term, as implemented in SIESTA code. We observed that structural changes occur when pressure is applied. For the CNT(6,0)@BNNT(14,0) these changes begin when the pressure is close to 1,0 GPa for the outer tube, while for the inner tube the changes are observed around 10,0 GPa. In the case of BNNT(6,0)@CNT(14,0) the structure begins to be modified when the applied pressure is close to 3,0 GPa. The analysis of the band structure shown that the metallic character of the CNT(6,0)@BNNT(14,0) and the semiconductor character of the BNNT(6,0)@CNT(14,0) did not change when the pressure is applied. / Neste trabalho foram estudadas as propriedades eletrônicas e estruturais de bundles de hetero-nanotubos, compostos por um CNT (6,0) encapsulado em um BNNT (14,0) (CNT(6,0)@BNNT(14,0)) e por um BNNT (6,0) encapsulado em um CNT (14,0) (BNNT(6,0)@CNT(14,0)), submetidos a pressão hidrostática. Para tanto, fizemos uso da teoria do funcional da densidade e da aproximação do gradiente generalizado para tratar o termo de troca e correlação, implementados no programa computacional SIESTA. Observou-se que ocorrem alterações estruturais nos bundles a medida que a pressão é aplicada. Para o CNT(6,0)@BNNT(14,0) estas alterações têm início a pressões próximas de 1,0 GPa para o tubo externo, enquanto que para o tubo interno as alterações só começam a ser observadas próximo de 10,0 GPa. No caso do BNNT(6,0)@CNT(14,0) a estrutura só começa a ser modificada quando o pressão aplicada é próxima de 3,0 GPa. A análise da estrutura de bandas de energia das duas estruturas mostrou que o caráter eletrônico, metálico para os CNT(6,0)@BNNT(14,0) e semicondutor para os BNNT(6,0)@CNT(14,0), mantêm-se estáveis mesmo para os maiores valores de pressão aplicados.