Made available in DSpace on 2012-05-07T14:50:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) 000007.pdf: 3708904 bytes, checksum: 1145cd13e82227a985ac1c3cc2ec2ecb (MD5) Previous issue date: 2009 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde / Os estafilococos coagulase-negativa (ECN) são considerados patógenos potencialmente causadores de infecções no homem, principalmente aquelas relacionadas ao uso de dispositivos médicos. O tratamento destas infecções tem se tornado cada vez mais um desafio para a saúde pública, uma vez que os ECN têm apresentado resistência a múltiplas drogas antimicrobianas. Os desinfetantes de superfícies, como os compostos quaternários de amônio, amplamente usados em ambiente hospitalar, muitas vezes também se tornam ineficientes contra estes patógenos hospitalares o que pode ser evidenciado pelo surgimento de cepas resistentes ou mesmo apresentando susceptibilidade reduzida a estes compostos. Neste estudo, tivemos como objetivos identificar isolados clínicos de ECN oriundos de um hospital público do Rio de Janeiro utilizando-se sistemas automatizados e semi-automatizados de identificação, verificar a susceptibilidade destes isolados clínicos às drogas antimicrobianas fenotipicamente ou genotipicamente e avaliar a susceptibilidade a um desinfetante à base de compostos quaternários de amônio. Como a espécie Staphylococcus epidermidis foi prevalente entre os 63 isolados clínicos estudados, sua diversidade genética foi analisada por PFGE. Apenas um dos isolados clínicos não foi identificado pelos métodos adotados. Dentre os isolados, 69,8por cento apresentaram resistência a mais de seis drogas, representando uma séria preocupação. O método automatizado Vitek detectou uma alta taxa de resistência à oxacilina, que estava associada à resistência intermediária à vancomicina em um isolado clínico. A resistência à oxacilina foi examinada também pelos testes de triagem em ágar contendo oxacilina e de difusão em disco contendo cefoxitina. Comparando estes dois métodos à detecção do gene mecA, considerada como padrão-ouro para indicar isolados meticilina-resistentes, o último mostrou melhor acurácia para revelar a expressão da PBP2a. [...]

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:01Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-10-23Bitstream added on 2014-06-13T19:49:34Z : No. of bitstreams: 1 calsolari_rao_me_botfm.pdf: 821723 bytes, checksum: 3a4c79807386500660831486c076c8ca (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Fundação para o Desenvolvimento da UNESP (FUNDUNESP) / The Staphylococcus spp. are often found in the hospital ambient, being associated with a large infection variety. Several factors of virulence are responsible for the Staphylococcus pathology, and the enter toxin originated from Staphylococcus and the TTST -1 (toxin of toxic shock syndrome) are accentuated among them. In this study, ninety Staphylococcus aureus patterns and ninety negative-coagulation of Staphylococcus patterns, isolated from different clinical materials, were examined by the PCR technique for the gene's research which encode the toxins originated from Staphylococcus A (sea), B (seb), C (sec-1 ), D (sed) and TTST -1 (tst). The patterns that appeared positives for the presence of one or more genes were tested by the production capacity of the respective toxins by the RT -PCR technique. In relation to ECN species, the S. epidermidis was isolated to a large frequency, corresponding to 71, 1% of the total of ECN examined patterns, as well as S. warneri (6, 7%), S. haemolyticus (5, 6%), S. hominis (5, 6%), S.lugdunensis (5, 6%)J S. simulans (3, 3%), S. saprophyticus (1, 1 % ) and S. Xylosus (1, 1 %). The results revealed a total of 108 toxicological patterns, corresponding to 59 (54, 6%) S. aureus patterns and 49 (45, 4%) ECN patterns with one or more toxicological genes. Among the ECN studied species, only the S. simulans type didn't present genes that encode toxins originated from Staphylococcus. TheS.aureus showed toxicological genes for ali the classes of examined toxins, while the ECN presented genes to the A (sea), B (seb) C (sec-1) and TSST -1 (tst) toxins. The sec-1 gene was the most found as well in S.aureus patterns as in ECN, while the seb gene was the most frequent in S. aureus. The detection of the toxin production by the RT -PCR technique revealed43 positive patterns, corresponding to 37 (86, 0% ) S.aureus patterns producers of EEA, EEB, EEC, EED, and/or TSST -1 and six (14, 0%) ECN patterns producers of EEA and EEC.

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Orientador: Maria de Lourdes Ribeiro de Souza da Cunha / Banca: Maria de Lourdes Ribeiro de Souza da Cunha / Banca: Carlos Alberto Magalhães Lopes / Banca: Elisa Yoko Hirooka / Resumo: Não disponível. / Abstract: The Staphylococcus spp. are often found in the hospital ambient, being associated with a large infection variety. Several factors of virulence are responsible for the Staphylococcus pathology, and the enter toxin originated from Staphylococcus and the TTST -1 (toxin of toxic shock syndrome) are accentuated among them. In this study, ninety Staphylococcus aureus patterns and ninety negative-coagulation of Staphylococcus patterns, isolated from different clinical materials, were examined by the PCR technique for the gene's research which encode the toxins originated from Staphylococcus A (sea), B (seb), C (sec-1 ), D (sed) and TTST -1 (tst). The patterns that appeared positives for the presence of one or more genes were tested by the production capacity of the respective toxins by the RT -PCR technique. In relation to ECN species, the S. epidermidis was isolated to a large frequency, corresponding to 71, 1% of the total of ECN examined patterns, as well as S. warneri (6, 7%), S. haemolyticus (5, 6%), S. hominis (5, 6%), S.lugdunensis (5, 6%)J S. simulans (3, 3%), S. saprophyticus (1, 1 % ) and S. Xylosus (1, 1 %). The results revealed a total of 108 toxicological patterns, corresponding to 59 (54, 6%) S. aureus patterns and 49 (45, 4%) ECN patterns with one or more toxicological genes. Among the ECN studied species, only the S. simulans type didn't present genes that encode toxins originated from Staphylococcus. TheS.aureus showed toxicological genes for ali the classes of examined toxins, while the ECN presented genes to the A (sea), B (seb) C (sec-1) and TSST -1 (tst) toxins. The sec-1 gene was the most found as well in S.aureus patterns as in ECN, while the seb gene was the most frequent in S. aureus. The detection of the toxin production by the RT -PCR technique revealed43 positive patterns, corresponding to 37 (86, 0% ) S.aureus patterns producers of EEA, EEB, EEC, EED, and/or TSST -1 and six (14, 0%) ECN patterns producers of EEA and EEC. / Mestre

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Submitted by Anderson Silva (avargas@icict.fiocruz.br) on 2012-12-03T17:48:36Z No. of bitstreams: 1 frederico_m_r_silva_ioc_bcm_0032_2005.pdf: 983631 bytes, checksum: c53725cd06ca616bc0df79ce5088aa9f (MD5) / Made available in DSpace on 2012-12-03T17:48:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 frederico_m_r_silva_ioc_bcm_0032_2005.pdf: 983631 bytes, checksum: c53725cd06ca616bc0df79ce5088aa9f (MD5) Previous issue date: 2005 / Universidade Estácio de Sá. Campus Arcos da Lapa. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / No Brasil, apenas uma cepa disseminada, o clone epidêmico brasileiro (BEC) de MRSA, foi amplamente caracterizada, apresentando o cassete estafilocócico de resistência à meticilina (SCCmec) IIIA de 67 Kb e multirresistência antibiótica. Entretanto, novos clones de MRSA não-multirresistentes com alta virulência têm sido descritos em infecções comunitárias e hospitalares em vários países. Estes clones abrigam SCCmec curtos, com cerca de 24 Kb, portanto mais eficiente na transferência, replicação e tradução. Este estudo objetiva descrever o background genético dos clones de S. aureus envolvidos em infecções no Rio de Janeiro/RJ. Foram coletadas 139 amostras de S. aureus (54 MRSA), isoladas de pacientes de sete hospitais e de um laboratório de patologia clínica. As amostras foram submetidas a análises moleculares por diversos métodos. Com a análise por Multilocus Restriction Fragment Typing (MLRFT), caracterização do tipo de SCCmec e a presença de genes para leucocidina Panton-Valentine (PVL), juntamente com o perfil de resistência antimicrobiana, definiu-se 37 cepas representativas que foram posteriormente submetidos ao sequenciamento por Multilocus Sequence Typing (MLST) e caracterizados por Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE). A combinação de todas as abordagens permitiu o agrupamento dos isolados em 22 grupos clonais. O genótipo prevalente correspondeu à cepa nosocomial MRSA/BEC e foi caracterizada pelo RTF-BAAACAC / Sequence Type (ST) 239/SCCmec IIIA / Pulsotipo A / PVL negativo / multirresistência antibiótica. Outros 5 grupos clonais apresentaram cepas de MSSA e MRSA não-MDR com SCCmecs curtos. Quinze RFTs apresentaram somente cepas de MSSA com grande diversidade genotípica entre si, sendo 27,4% dessas PVL-positivas. Algumas cepas MRSA não-MDR PVL-positivas foram agrupadas em dois genótipos: RFT-AAAAAAA (ST-1) e RFT–BBBBBAB (ST-30), com SCCmec IVa e IV, respectivamente. Essas são características de clones comunitários disseminados pelo mundo, porém foram encontradas em MRSA hospitalares. De forma interessante, amostras pertencentes ao ST-30 foram identificadas como de origem hospitalar. Entretanto, um isolado foi derivado de infecção comunitária, demonstrando compartilhamento de cepas entre comunidade e hospital. A presença de SCCmecs curtos em cepas MRSA não-MDR direciona à possível emergência de novos clones resistentes. Os perfis heterogêneos de MRSA encontrados no Brasil reforçam a dinâmica da estrutura genética populacional deste patógeno e a importância de procedimentos de tipagem molecular para definir as relações entre isolados nosocomiais e comunitários. / In Brazil, a solely strain has been found disseminated, the Brazilian Epidemic Clone (BEC) of MRSA, was detected, characterized by the presence of a 67Kb staphylococcal chromosomal cassette of methicillin resistance (SCCmec) IIIA and antibiotic multiresistance. However, new non-multiresistant highly virulent MRSA strains have been described in community and nosocomial infections in several countries. These clones harbor a smaller SCCmec of around 24Kb and therefore more efficient in transferring, replication and translation. This study aim to describe the genetic background of S. aureus clones associated to infections in Rio de Janeiro/RJ. One hundred and thirty nine S. aureus samples were collected (54 MRSA isolates) from patients from seven hospitals and from a clinical pathology laboratory. These samples were submitted to molecular analyses by several methods. Multilocus Restriction Fragment Typing (MLRFT), SCCmec typing and the presence of the Panton-Valentine Leucocidin (PVL) genes, in association with the antimicrobial resistance profile, defined 37 representative isolates that were further submitted to DNA sequencing by Multilocus Sequence Typing (MLST) and also characterized by Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE). The combination of all approaches allowed the clustering of the isolates into 22 clonal groups. The most prevalent genotype corresponded to MRSA/BEC nosocomial strain and was characterized as RFT-BAAACAC, Sequence Type (ST) 239, SCCmec IIIA, Pulsotype A, PVL-negative and antibiotic multiresistance. The other 5 clonal groups presented MSSA and non-MDR MRSA strains with smaller SCCmecs. Fifteen RFTs presented only MSSA strains with large genotypic diversity being 27,4% of the MSSA samples PVL-positives. Some PVL-positive non-MDR MRSA strains were clustered into two genotypes: RFT-AAAAAAA (ST-1) and RFT–BBBBBAB (ST-30), with SCCmec IVa and IV, respectively. These are characteristics of community isolates worldwide disseminated, however they are found in nosocomial MRSA strains. Notably, in this study, samples characterized as ST-30 was identified, in its majority, from hospital origin. However, an isolate was derived from community infection, depicting sharing among community and hospital settings. The presence of shorter SCCmecs in non-MDR MRSA strains leads to the posible emergence of new resistant clones. The heterogeneous MRSA profiles found in Brazil reinforce the dynamics of the genetic population structure of this pathogen and the importance of molecular typing procedures to define the relationship among nosocomial and community strains.

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:30:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MariusaPrimo.pdf: 431740 bytes, checksum: bdd6113b5d8763a89f69f559f1db2a7c (MD5) Previous issue date: 2006-03-31 / Objective: To determine the excess length of stay extra costs and mortality attributable to nosocomial S aureus bloodstream infection at a teaching hospital in Goiânia-Goiás Methods: Pairwise-matched (1:1) case-control study All patients older than 13 years admitted at the University Hospital of UFG between 2000 and 2001 were eligible Cases were defined as patients with a nosocomial S aureus bacteremia and controls were patients without bacteremia matched by gender age (+7 years) primary diagnosis and underlying diseases using the International Classification of Disease codes (CID-10) yielding 84 matched case-control pairs Data were collected from medical records and from the Brazilian National Hospital Information System (SIH/SUS) Descriptive and analytic statistics were performed. Wilcoxon rank sum test was performed to compare length of stay and costs between the cases and controls Mortality among cases and controls was compared using McNemar s test (EpiInfo 6.0 and SPSS/PC 13.0) The study protocol was approved by the Ethical Committee. Results: Cases and controls were similar regarding age and gender with a slight male predominance McCabe severity of illness scores revealed that approximately 40.0% of all patients had fatal or rapidly fatal illness without difference among cases and controls The mean length of total hospital stay for cases was 48.3 days versus a mean for controls of 16.2 days (p< .01) yielding an excess of hospital stay of 32.1 days Forty-eight of the 84 cases died representing a crude mortality rate of 57.1% For controls the crude mortality rate was 11.9% The attributable mortality rate was estimated to be 45.2% Cases had a 7.3 fold higher risk for death than controls (OR= 7.3; IC95% 3.1-21.1) Overall costs of hospitalization (SIS/SUS) reached R$ 290.434 for cases versus R$ 94.982 for controls (p< .01) Antimicrobial therapy cost was 6.7 fold higher for cases compared to controls Conclusion: Nosocomial bloodstream infection caused by S aureus was associated with significant increases in length of hospitalization attributable mortality and economic burden at a teaching hospital Measures to minimize the risk of nosocomial bloodstream infection are essential / Objetivo: estimar o excesso do tempo de permanência o excesso de custos e a mortalidade atribuída à infecção hospitalar da corrente sangüínea (ICS) por S aureus em pacientes internados em um hospital universitário na cidade de Goiânia-Goiás Metodologia: estudo caso-controle pareado (1:1) Todos os pacientes maiores de 13 anos admitidos no Hospital das Clinicas da UFG entre 2000 a 2001 foram considerados elegíveis Casos foram os pacientes com ICS por S. aureus e controles os pacientes sem ICS pareados por sexo idade (+7 anos) agravo que motivou a internação e doença de base (Classificação Internacional de Doenças-(ID10) resultando em 84 pares Fonte de dados: prontuários clínicos e Sistema de Informação de Internação Hospitalar do Sistema Único de Saúde (SIH/SUS) Para análise dos dados utilizou-se estatística descritiva e analítica O teste de ilcoxon rank sum foi utilizado para comparar o tempo de internação e os custos para casos e controles Para comparar a mortalidade de casos e controles utilizou-se o teste de McNemar (EpiInfo 6.0 e SPSS/PC 13.0) O protocolo do estudo foi aprovado pelo Comitê de Ética em Pesquisa Médica Humana e Animal do HC/UFG Resultados: Casos e controles eram similares em relação à idade e sexo com discreto predomínio de homens De acordo com a classificação proposta por McCabe aproximadamente 40,0% dos pacientes tinham doença de base considerada como fatal ou rapidamente fatal sem diferença significante entre casos e controles Casos permaneceram em média 48,3 dias internados enquanto que os controles 16,2 dias (p< 0,01), resultando em uma média de 32,1 dias de excesso do tempo de internação A taxa mortalidade bruta foi 57,1% (48/84) e de 11,9% para casos e controles respectivamente A mortalidade atribuída à ICS por S. aureus foi de 45,2% Casos tiveram 7,3 vezes (OR= 7,3; IC95% 3,1-21,1) mais chance de morrer quando comparados com os seus controles O custo total (SIS/SUS) da hospitalização para os casos foi de R$ 290.434,00 enquanto que para os controles foi de R$ 94.982,00 (p<0,01) Casos tiveram um gasto com antimicrobianos 6,7 vezes maior que os controles Conclusão: essa pesquisa evidenciou um excesso no tempo de hospitalização aumento dos custos e uma elevada mortalidade atribuída à ICS por S. aureus em pacientes internados em um hospital universitário Medidas para minimizar o risco de infecção nosocomial da corrente sanguínea são essenciais